Filters
total: 290
filtered: 258
Search results for: bioaktywne peptydy
-
Synthesis of conjugates of muramyl dipeptide and nor-muramyl dipeptide with retro-tuftsin (Arg-Pro-Lys-ThrOMe) as potential immunostimulants.
PublicationOpisano syntezę nowych koniugatów muramylodipeptydu i nor-muramylo-dipeptydu z estrem metylowym tuftsyny o odwróconej sekwencji (Arg-Pro-Lys-Thr-OMe)jako potencjalnych immunostymulantów. Synteza tych połączeń została przeprowadzona zgodnie z zasadami chemii peptydów.
-
Butyrylcholinesterase signal sequence self-aggregates and enhances amyloid fibril formation in vitro
PublicationAlzheimer’s disease (AD) pathogenesis has been attributed to extracellular aggregates of amyloid β (Aβ) plaques and neurofibrillary tangles in the human brain. It has been reported that butyrylcholinesterase (BChE) also accumulates in the brain Aβ plaques in AD. We have previously found that the BChE substitution in 5′UTR caused an in-frame N-terminal extension of 41 amino acids of the BChE signal peptide. The resultant variant...
-
Structural properties of hydration shell around various conformations of simple polypeptides
PublicationIn this paper we investigate structural properties of water within the solvation shell around the peptide core created by a well-defined conformation of polypeptide chain. The following secondary structures are investigated: linear (straight chain), and three helices PII (polyproline-like), 310, and α. We propose using the two-particle contribution to entropy as a rational measure of the water structural ordering within the solvation...
-
The immunological properties, cytotoxic effect and antimicrobial activities of novel analogues of edeine antibiotics
PublicationOpisano syntezę kilku nowych analogów edein a i d z zastosowaniem klasycznych metod syntezy peptydów w roztworze oraz przedstawiono wyniki badań cytotoksycznych na kilku liniach komórek ludzkich oraz wyniki badań mikrobiologicznych w stosunku do bakterii gramododatnich i gramoujemnych. Opisano również wyniki badań immunologicznych na modelu myszy.
-
Fragmentomic analysis of biopeptides in silico released from milk proteins
PublicationThe fragmentomic-assisted method was employed to predict the biological potential of peptides derived from milk proteins hydrolyzed by papain and bromelain. Firstly, protein sequences were acquired from the BIOPEP-UWM database and then hydrolyzed by the above enzymes using a BIOPEP-UWM tool called “Enzyme(s) action”. The released peptides were defined as parent peptides and further analyzed for the presence of shorter peptidic...
-
Solid Phase Synthesis and Biological Activity of Tuftsin Conjugates
PublicationNew tuftsin/retro-tuftsin conjugates were designed and synthesized using a classical fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) solid phase procedure. All the peptide conjugates were divided into three series: 1,4-dihydroxyanthraquinone (type A), 1-nitroacridine (type B), and 4-carboxyacridone (type C) derivatives. In type A conjugates, the N-terminal group of the peptide chain is directly connected to the anthraquinone ring at C1 (Scheme...
-
N-acylpeptides with glucosamine-6-phosphate synthase inhibitors - synthesisand antifungal activity
PublicationOpracowano syntezę kilku peptydów (di i tripeptydów) zawierających inhibitory syntazy glukozamino-6-fosforanu oraz przeprowadzono je w N-acylopochodne (acetylowe, heksanoilowe, dekanoilowe) oraz zbadano ich aktywność przeciwgrzybową w stosunku do szczepów Candida albicans z opornością wielolekową. Stwierdzono, że N-acylopeptydy wykazują aktywność przeciwgrzybową oraz określono wartości MIC.
-
Niebiałkowe związki azotowe
PublicationNiebiałkowe związki azotowe (NPN - non protein nitrogen) są grupą składników wchodzących w skład produktów żywnościowych ważną nie tylko z punktu widzenia producentów żywności, ale także dla specjalistów do spraw żywienia. Do grupy tej należą przede wszystkim wolne aminokwasy i krótkie peptydy, aminy, kwasy nukleinowe i nukleotydy oraz inne mało cząsteczkowe składniki zawierające azot (glikozydy cyjanogenne, alkaloidy, tiazole,...
-
Strategia analizy niecelowanej w metabolomice i lipidomice. Cz. 1. Aspekty praktyczne
PublicationStrategia analizy niecelowanej jest powszechnie wykorzystywana do analizy różnego rodzaju próbek biologicznych, takich jak tkanki czy płyny ustrojowe, w celu otrzymania „odcisku palca” oraz określenia różnic w składzie jakościowym oraz ilościowym pomiędzy badanymi próbkami. Wskazanie różnic w zawartości różnych biocząsteczek (peptydy, metabolity, lipidy) pozwala na uzyskanie informacji na temat powiązania składu biochemicznego...
-
Synthesis and structure analysis of ferrocene‐containing pseudopeptides
Publication -
Synthesis and transport studies of model dipeptides with modified n-terminal amino groups into e. coli k12 mutant strains
Publicationotrzymano na drodze syntezy chemicznej kilka modelowych dipeptydów zawierających n-terminalna guanidynę oraz betainę. zbadano transport tych peptydów do komorek e. coli k12, posiadających zróżnicowane systemy transportowe. wyniki badań potwierdziły brak transportu do komórek bakteryjnych z wykorzystaniem permeaz peptydowych. dodatnio naładowana i silnie polarna grupa aminowa uniemożliwia efektywny transport tych związków do komórek...
-
Chemia a zdrowa żywność : Dodatki i zanieczyszczenia żywności : problemy i wyzwania
PublicationPodstawowe składniki pożywienia to: tłuszcze, węglowodany, białka, składniki mineralne, w tym makroelementy i mikroelementy, witaminy oraz składniki bioaktywne. Niebezpiecznymi składnikami żywności mogą być: dodatki do żywności w trakcie procesu produkcji, substancje powstające w trakcie obróbki, organiczne i nieorganiczne zanieczyszczenia oraz substancje występujące w sposób naturalny, np. alkaloidy grzybowe. Stosowanie dodatków...
-
Cyanobacterial toxins in fresh and brackish waters of Pomorskie Province (Northern Poland)
PublicationPraca dotyczy oznaczania toksyn należących do grupy hepatotoksycznych peptydów cyklicznych oraz neurotoksycznych alkaloidów. Są one odpowiedzialne za uszkodzenia ryb i ptaków, które powstają w wyniku zakwitu glonów. Badano zakwity w wodach słodkich Pomorza. Oznaczano hepatoksyny, mikrocysty oraz nodularynę. Opracowano w tym celu warunki analityczne przy zastosowaniu techniki HPLC-DAD. Do identyfikacji anatoksyny-A użyto techniki...
-
Glutamine analogues containing a keto function - novel inhibitors of fungal glucosamine-6-phosphate synthase
PublicationW publikacji przedstawiono syntezę nowych pochodnych kwasu (S)-2,3-diaminopropanowego, zawierających reszty kwasów z funkcją ketonową. Dla otrzymanych związków zbadano właściwości inhibicyjne w stosunku do grzybowej syntazy glukozamino-6-fosforanu, ustalono właściwości lipofilowe otrzymanych związków a także aktywność przeciwgrzybową. Dla kilku wybranych pochodnych otrzymano ich dipeptydy, zbadano także ich aktywność przeciwgrzybową...
-
A study on the protection of methionine and the reduction of methionine sulfoxide in methionine-containing analogues of the growth-modeling factor Gly-His-Lys
PublicationThe protection of methionine and the reduction of methionine sulfoxide in methionine-containing analogues of Gly-His-Lys are described. The peptides were synthesized by a solid-phase method using the standard Fmoc procedure. Simultaneous deprotection of the peptide side chain and liberation from the resin were achieved using an appropriate TFA cocktail. The TFA cocktail was selected to minimize oxidation of the methionine residue....
-
Amides as models to study the hydration of proteins and peptides — spectroscopic and theoretical approach on hydration in various temperatures
PublicationInteractions with water are one of the key factors which determine protein stability and activity in aqueous solutions. However, the protein hydration is still insufficiently understood. N-methylacetamide (NMA) is regarded as a minimal part of the peptide backbone and the relative simplicity of its structure makes it a good model for studies on protein–water interactions. In this paper, the influence of NMA and N,N-dimethylacetamide...
-
Cząsteczki mikroRNA - nowy biologicznie aktywny składnik mleka kobiecego
PublicationCząsteczki mikroRNA są krótkimi, niekodującymi oligonukleotydami odpowiadającymi za potranskrypcyjną regulację ekspresji genów. W wyniku ich aktywności kontrolowanych jest wiele procesów komórkowych oraz szlaków sygnalizacyjnych. Od 2010 roku wiadomo, że wchodzą one w skład mleka kobiecego, które obecnie uznaje się za jedno z najbogatszych pokarmowych źródeł mikroRNA. Funkcje tych cząsteczek w organizmie karmionego mlekiem matki...
-
Modyfikacja cementu kostnego w celu uzyskania długotrwałej ochrony antybakteryjnej
PublicationNiniejsza rozprawa doktorska stanowi przewodnik po jednotematycznym cyklu publikacji, dotyczącym modyfikacji akrylowego cementu kostnego celem uzyskania długotrwałej i efektywnej ochrony antybakteryjnej. W ramach niego przeprowadzono badania eksperymentalne polegające na opracowaniu technologii wytwarzania modyfikowanego cementu kostnego oraz procedury medycznej jego stosowania. Cement kostny był modyfikowany przez zastosowanie...
-
Whole-genome sequencing and antimicrobial potential of bacteria isolated from Polish honey
PublicationThe aim of this study was the whole-genome analysis and assessment of the antimicrobial potential of bacterial isolates from honey harvested in one geographical location—the north of Poland. In total, 132 strains were derived from three honey samples, and the antimicrobial activity of CFAM (cell-free after-culture medium) was used as a criterion for strain selection and detailed genomic investigation. Two of the tested isolates...
-
Reverse vaccinology-based prediction of a multi-epitope SARS-CoV-2 vaccine and its tailoring to new coronavirus variants
PublicationThe genome feature of SARS-CoV-2 leads the virus to mutate and creates new variants of concern. Tackling viral mutations is also an important challenge for the development of a new vaccine. Accordingly, in the present study, we undertook to identify B- and T-cell epitopes with immunogenic potential for eliciting responses to SARS-CoV-2, using computational approaches and its tailoring to coronavirus variants. A total of 47 novel...
-
Transport deficiency is the molecular basis of Candida albicans resistance to antifungal oligopeptides
Publication(FMDP), an inhibitor of glucosamine-6-phosphate synthase, exhibited growth inhibitory activity against Candida albicans, with minimal inhibitory concentration values in the 0.05–50 mg/L range. Uptake by the peptide permeases was found to be the main factor limiting an anticandidal activity of these compounds. Di- and tripeptide containing FMDP (F2 and F3) were transported by Ptr2p/Ptr22p peptide transporters (PTR) and FMDP-containing...
-
Lipopeptides - synthesis and their properties
PublicationZaprezentowano syntezę nowych pochodnych tripeptydu Gly-Hyp-Lys o potencjalnie lepszych właściwościach lipofilowych. Modyfikacje polegały na acylowaniu N-końca glicyny kwasami tłuszczowymi (np. palmitynowym i stearynowym). Syntezę lipopeptydów zawierających fragment Gly-X-Y (gdzie: X= Met,Hyp,Hyp-Met,Gly-Hyp; Y=Lys,D-Lys) przeprowadzono na fazie stałej z zastosowaniem procedury Fmoc. Do wydłużanie łańcucha peptydowego zastosowano...
-
Biological activity of conjugates of muramyl dipeptides with batracylin derivatives
PublicationZaprezentowano immunomodulacyjne właściwości nowych koniugatów batracyliny (BAT) z pochodnymi muramylodipeptydów wobec subpopulacji leukocytów krwi obwodowej hodowanych w obecności komórek linii nowotworowych. Leukocyty izolowane były z krwi obwodowej uzyskanej od zdrowych ochotników. Zbadane koniugaty MDP lub nor-MDP z batracyliną wykazały silniejsze własności hamujące proliferację komórek wybranych linii nowotworowych (K562,...
-
Synthesis of conjugates of muramyl dipeptide and nor-muramyl dipeptide derivatives with adenosine as potential immunosuppressant
PublicationZaprezentowano syntezę koniugatów adenozyny z pochodnymi muramylo- i nor-muramylodipeptydów zawierających w części peptydowej D-aminokwasy (D-Ala, D-Val, D-Ser, D-Pro, D-2-ABA). Jako substrat zastosowano rybozyd 6-chloropuryny, który łączono poprzez 1,2-diaminoetan z odpowiednimi pochodnymi MDP lub nor-MDP w obecności EDCI i HOBt. Struktury otrzymanych związków zostały potwierdzone widmami 1H i 13C NMR (500 MHz), widmami MS oraz...
-
Therapy-Related Changes in the Serum Proteome Patterns of Early Stage Breast Cancer Patients with Different Outcomes
Publication -
Oligopeptide antifungals are exceptionally active against multidrug-resistant yeast
PublicationPermeazy peptydowe w komórkach drożdżowych są zdolne do transportu do wnętrza komórek oligopeptydów, zawierających w swojej strukturze niebiałkowe aminokwasy o właściwościach przeciwgrzybowych. Wśród szerokiego wachlarza tego rodzaju związków przebadanych pod względem aktywności biologicznej na wielolekoopornych komórkach drożdżowych, zaobserwowano liczna grupę, wykazującą zwiększoną aktywność względem komórek eksprymujących transportery...
-
Structure-activity relationship studies on the antimicrobial activity of novel edeine a and d analogues
PublicationOpisano syntezę 4 nowych analogów peptydowego antybiotyku, edeiny a i d z wykorzystaniem klasycznej syntezy w roztworze. Stosowano metodę estrów aktywnych oraz metodę azydową do tworzenia wiązań peptydowych. Zbadano także aktywność przeciwgrzybową i przeciwbakteryjną opisanych połączeń.
-
Synthesis of analogues of anthraquinones linked to tuftsin or retro-tuftsin residues as potential topoisomerase inhibitors
PublicationZsyntetyzowano 10 nowych analogów antrachinonów z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny jako potencjalne inhibitory topoizomerazy. Substratem wyjściowym były zsyntetyzowane 1,4-, 1,5- i 1,8-bis(tosyloksy)-9,10-antrachinony oraz odpowiednio chronione pochodne tuftsyny i retro-tuftsyny, które otrzymano metodą mieszanych bezwodników z zastosowaniem chloromrówczanu izobutylu i NMM. Reakcje prowadzone były w acetonitrylu pod azotem w...
-
Synthesis of anthraquinone-tuftsin analogues as potential topoisomerase inhibitors
PublicationZaprezentowano syntezę nowych analogów antrachinonów z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny oraz wstępne badania biologiczne (aktywność cytotoksyczną na wybranych liniach nowotworowych oraz zdolność hamowania topoizomerazy I).
-
Synthesis of conjugates of Combretastatin A-4 with tuftsin derivatives as potential anticancer agents
PublicationZaprezentowano syntezę nowych koniugatów Combretastatyny A-4 z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny, jako potencjalnych związków przeciwnowotworowych.
-
Novel analogues of bradykinin conformationally restricted in the C-terminal part of the molecule
Publication -
Analogues of Trypsin Inhibitor SFTI-1 with Disulfide Bridge Substituted by Various Length of Carbonyl Bridges
Publication -
Low-Molecular-Weight Aldehyde Inhibitors of Cathepsin G
Publication -
Pegylated Fluorescent Peptides as Substrates of Proteolytic Enzymes
Publication -
Design of serine proteinase inhibitors by combinatorial chemistry using trypsin inhibitor SFTI‐1 as a starting structure
Publication -
Designing of Substrates and Inhibitors of Bovine α-Chymotrypsin with Synthetic Phenylalanine Analogues in Position P1
Publication -
Chemical modification of natural immunomodulators tuftsin and muramyl dipeptide significantly influence their biological activity
Publication...
-
Conjugates of tuftsin and muramyl dipeptide as stimulators of monocyte-derived dendritic cells
PublicationOstatnio coraz częściej bada się związki oddziałujące na komórki dendrytyczne. Muramylodipeptyd i jego analogi przyspieszają dojrzewanie i aktywację komórek dendrytycznych. Do naszych badań otrzymaliśmy komórki dendrytyczne na drodze ekspansji z monocytów krwi obwodowej. Właściwa suplementacja hodowli monocytów czynnikami wzrostowymi - GM-CSF i IL-4, pozwoliła na uzyskanie niedojrzałych komórek dendrytycznych, które stymulowano...
-
Molecular dynamics study of amyloid formation of two Abl-SH3 domain peptides
Publication -
Synthesis, activity on NK-3 tachykinin receptor and conformational solution studies of scyliorhinin II analogs modified at position 16
Publication -
Conformational studies of vasopressin and mesotocin using NMR spectroscopy and molecular modelling methods. Part II: studies in the SDS micelle
Publication -
Vasopressin V2 receptor/bioligand interactions
Publication -
Conformation-activity relationships ofcyclo-constrained µ/δ opioid agonists derived from theN-terminal tetrapeptide segment of dermorphin/deltorphin
Publication -
Solution conformational study of Scyliorhinin I analogues with conformational constraints by two-dimensional NMR and theoretical conformational analysis
Publication -
Computer modeling of the solution conformation of cyclic enkephalins
Publication -
Molecular Simulations of Rhodopsin Tetrameter
Publication -
Deltorphin analogs restricted via a urea bridge: structure and opioid activity
Publication -
Conformational studies of neurohypophyseal hormones analogues with glycoconjugates by NMR spectroscopy
Publication -
Synthesis, biological activity and conformational analysis of head-to-tail cyclic analogues of LL37 and histatin 5
Publication -
Solution conformations of bradykinin antagonists modified with CαCα cyclized nonaromatic residues
Publication