Filters
total: 1132
filtered: 623
-
Catalog
Chosen catalog filters
Search results for: trf
-
The structurally similar TRFH domain of TRF1 and TRF2 dimers shows distinct behaviour towards TIN2
PublicationThe telomere repeat binding-factor 1 and 2 (TRF1 and TRF2) proteins of the shelterin complex bind to duplex telomeric DNA as homodimers, and the homodimerization is mediated by their TRFH (TRF-homology) domains. We performed molecular dynamic (MD) simulations of the dimer forms of TRF1TRFH and TRF2TRFH in the presence/absence of the TIN2TBM (TIN2, TRF-interacting nuclear protein 2, TBM, TRF-binding motif) peptide. The MD results...
-
TRF1 and TRF2: pioneering targets in telomere-based cancer therapy
PublicationThis article presents an in-depth exploration of the roles of Telomere Repeat-binding Factors 1 and 2 (TRF1 and TRF2), and the shelterin complex, in the context of cancer biology. It emphasizes their emerging significance as potential biomarkers and targets for therapeutic intervention. Central to the shelterin complex, TRF1 and TRF2 are crucial in maintaining telomere integrity and genomic stability, their dysregulation often...
-
Molecular basis and quantitative assessment of TRF1 and TRF2 protein interactions with TIN2 and Apollo peptides
PublicationShelterin is a six-protein complex (TRF1, TRF2, POT1, RAP1, TIN2, and TPP1) that also functions in smaller subsets in regulation and protection of human telomeres. Two closely related proteins, TRF1 and TRF2, make high-affinity contact directly with double-stranded telomeric DNA and serve as a molecular platform. Protein TIN2 binds to TRF1 and TRF2 dimer-forming domains, whereas Apollo makes interaction only with TRF2. To elucidate...
-
Molecular basis of TRF proteins and their interactions with peptides
Publication -
Molecular Recognition in Complexes of TRF Proteins with Telomeric DNA
PublicationTelomeres are specialized nucleoprotein assemblies that protect the ends of linear chromosomes. In humans and many other species, telomeres consist of tandem TTAGGG repeats bound by a protein complex known as shelterin that remodels telomeric DNA into a protective loop structure and regulates telomere homeostasis. Shelterin recognizes telomeric repeats through its two major components known as Telomere Repeat-Binding Factors, TRF1...
-
Evaluation and cellular responses of modulators of TRF1/TRF2 protein’s function as potential anticancer drugs interfering with telomeric shelterin’s function
PublicationA number of proteins that interact with telomeres have been identified in human cells, indicating the high plasticity of human nucleoprotein complex organization. The most important complex is the "shelterin" complex, which consists of six proteins: TRF1, TRF2, TIN2, POT1, TPP1. The TRF1 and TRF2 directly bind to telomeric double-stranded DNA and the TIN2 protein. The TIN2 protein also binds to the TPP1 protein, stabilizing the...
-
Synthesis and structure of Dicyclohexylammonium Tri-tert-pentoxysilanethiolate and 5-aminopentylammonium Tri-tert-pentoxysilanethiolate
PublicationTri-tert-pentoksysilanotiol reaguje z dicykloheksyloaminą i 1,5-diaminopentanem dając odpowiednie sole amoniowe. Sole te scharakteryzowano poprzez analizę elementarną, widma IR i NMR oraz metodą rentgenowskiej analizy strukturalnej. Są to pierwsze pochodne tri-tert-pentoksysilanotiolu, dla których wyznaczono strukturę krystaliczną.
-
Molecular Characterisation of Uterine Endometrial Proteins during Early Stages of Pregnancy in Pigs by MALDI TOF/TOF
Publication -
Triaquabis(tri-tert-butoxysilanethiolato)barium
PublicationReakcja metalicznego baru z tri-tert-butoksysilanotiolem w obecności śladów wody daje [Ba(C12H27O3SSi)2(H2O)3]. Atom baru koordynowany jest przez dwie reszty silanotiolanowe w sposób chelatujący (jako O,S-ligandy) oraz przez atomy tlenu z trzech cząsteczek wody, tworząc międzycząsteczkową sieć wiązań wodorowych typu O--H...O i O--H...S.
-
A concept of software extension of 3D low-PRF radar systems to 4D semi-medium-PRF radar systems
PublicationWe present a concept of software modification of three-dimensional (3D) radar systems, designed to work in the low pulse repetition frequency mode, that equips them with the ability to estimate the radial velocity and to properly measure the range of targets that are detected outside the radar’s instrumented range. Despite the fact that the proposed modifications are designed so as to require only minor changes in software, they...
-
Potassium Tri-tert-butoxysilanethiolates: Synthesis, Properties, and Crystal and Molecular Structures of [(tBuO)3SiSK]6[THF]2·2THF, {[(tBuO)3SiS]2K2}n, and [(tBuO)3SiSK]4[H2O]4·C6H6
PublicationW reakcji tri-tert-butoksysilanotiolu z potasem otrzymano trzy nowe związki:[(tBuO)3SiSK]6[THF]2·2THF, {[(tBuO)3SiS]2K2}n, i[(tBuO)3SiSK]4[H2O]4·C6H6. Stanowią one dogodne substraty w syntezach kompleksów silanotiolanowych metali przejściowych. Charakteryzują się one również różnorodnością tworzonych układów. Rentgenowska analiza strukturalna wykazała, iż tworzą one trzy typy makrocząsteczkowych układów, w których...
-
Otrzymywanie oraz zbadanie właściwości tri-tert-butoksysilanotiolanów i tri-tert-butoksysilanolanów chromu(II) i chromu(III)"
PublicationW badaniach nad chemią związków wywodzących się z kwasu ortokrzemowego niezwykle użyteczne okazały się ligandy tri-tert-butoksysilanotiolanowe - SSi(OtBu)3 oraz tri-tert-butoksysilanolanowe - OSi(OtBu)3. Nadrzędnym celem pracy było otrzymanie tri-tert-butoksysilanotiolanowych i tri-tert-butoksysilanolanowych kompleksów chromu i określenie ich struktury za pomocą rentgenowskiej analizy strukturalnej. W wyniku przeprowadzonych badań...
-
Thermogravimetry of heteroleptic zinc tri-tert-butoxysilanethiolates: synthesis and crystal structure of bis(tri-tert-butoxysilanethiolato)(pyridine) zinc(II)
Publication -
Key Role of CRF in the Skin Stress Response System
Publication -
ITS in Tri-City Agglomeration - implementation of TRISTAR system
PublicationW referacie przedstawiono główne elementy systemu TRISTAR oraz główne problemy, z którymi spotkali się autorzy koncepcji systemu podczas przygotowywania koncepcji szczegółowej. W referacie przedstawiono ponadto efekty wdrożenia projektu pilotażowego. Projekt pilotażowy został uruchomiony w Gdyni w ubiegłym roku.
-
GRUNTOWE MATERIAŁY KOMPOZYTOWE TORF – POPIÓŁ LOTNY – WAPNO
Publication -
Gaussian mixture decomposition in the analysis of MALDI-TOF spectra
Publication -
Poloxamer: A versatile tri-block copolymer for biomedical applications
PublicationPoloxamers, also called Pluronic, belong to a unique class of synthetic tri-block copolymers containing central hydrophobic chains of poly(propylene oxide) sandwiched between two hydrophilic chains of poly(ethylene oxide). Some chemical characteristics of poloxamers such as temperature-dependent self-assembly and thermo-reversible behavior along with biocompatibility and physiochemical properties make poloxamer-based biomaterials...
-
Examination pf pesticide residues in air in Tri-city
PublicationCelem prowadzonych badań jest uzyskanie informacji o poziomie zanieczyszczeń powietrza atmosferycznego przez anality z grupy pestycydów (zarówno tych wycofanych jak i współcześnie stosowanych) na terenie Aglomeracji Trójmiejskiej i Tczewa z wykorzystaniem dozymetrów pasywnych z krążkami z pianki poliuretanowej na etapie pobierania próbek.
-
TNF‐α polymorphisms affect persistence and progression of HBV infection
Publication -
BADANIE ŚCIŚLIWOŚCI MATERIAŁÓW KOMPOZYTOWYCH TORF – POPIÓŁ LOTNY – WAPNO
Publication -
Cobalt(II) tri-tert-butoxysilanethiolates with bidentate spacer ligands
PublicationOtrzymano szereg nowych tri-tert-butoksysilanotiolanów Co(II) z dwudonorowymi N,N'-ligandami takimi jak pirazyna, chinoksalina i 4,4'-bipy. W przypadku pirazyny i chinoksaliny otrzymane kompleksy są bimetaliczne, w których atomy metali połączone są odpowiednią aminą. Użyty do syntezy 4,4'-bipy pozwolił na otrzymanie dwóch odmian polimorficznych kompleksu {[Co{SSi(tBuO)3}2]2(μ-4,4'bipy)}, a także polimeru koordynacyjnego o wzorze...
-
Metropolitan dimension of Tri-City: Development of the new harbor structures
PublicationThis article deals with the phenomenon of urban waterfront transformation. The special focus is on the Tri-City area in Poland. Both the transformation of port structures and redevelopment of the post-harbor areas are presented.
-
Diamminebis(tri-tert-butoxysilanethiolato)cadmium(II) acetonitrile solvate
Publication -
(3,5-Dimethylpyridine)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato)zinc(II)
PublicationMetodą rentgenowskiej analizy strukturalnej oznaczono strukturę kompleksu 3,5-dimetylopirydyny z Bis(tri-tert-butoksysilanotiolanem)cynku. Atom cynku wykazuje koordynację zniekształconej bipiramidy trygonalnej. Sieć krystaliczna jest stabilizwana tylko poprzez oddziaływania van der Waalsa.
-
Diamminebis(tri-tert-butoxysilanetiolato)cadmium(II) acetonitrile solvate
PublicationTytułowy związek jest cząsteczkowym, mieszanym kompleksem kadmu, zawierającym jako ligandy reszty tiolanowe i amoniak. Kadm w kompleksie jest koordynowany tetraedrycznie przez 2 atomy siarki i dwa atomy azotu. Wszystkie atomy wodoru koordynowanych cząsteczek amoniaku oraz jeden z atomów wodoru grupy metylowej acetonitrylu tworzą wiązania wodorowe, które łączą sąsiadujące cząsteczki kompleksu w łańcuchy.
-
(3,5-Dimethylpyridine)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato)cadmium(II)
PublicationTytułowy związek jest molekularnym, heteroleptycznym tiolanem kadmu zawierającym jako dodatkowy ligand 3,5-dimetylopirydynę. Jon kadmu(II) znajduje się w centrum bipiramidy o podstawie trójkątnej, utworzonej przez 5 atomów - 2 atomy siarki, 2 atomy tlenu i jeden atom azotu. Między cząsteczkami kompleksu upakowanymi w krysztale nie ma oddziaływań innych niż oddziaływania van der Waalsa.
-
Selected Problems of Transport in Port Towns – Tri-City as an Example
PublicationPort towns are strategic places from the point of view of transport systems. They form integration junctions for various transport branches , apart from the traditional - road and railway ones , also for water( sea) transport which is active there. Moreover, air transport comes also into consideration , whose efficient functioning must be connected with good accessibility, that concerns sea transport as well. Efficient and...
-
Two isomorphous ZnII/CoIIcomplexes with tri-tert-butoxysilanethiol and histamine, and (4-hydroxymethyl-1H-imidazole-κN)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)zinc(II)
Publication -
Bis(tetrahydrofuran-κO)tris(tri-tert-butoxysiloxy)chromium(III)
PublicationOtrzymano kompleksowy silanolan chromu: bis(tetrahydrofuran)tris(tri-tert-butoksysiloksy)chrom(III) i wyznaczono strukturę rentgenowską tego związku. Wielościan koordynacyjny atomu chromu ma kształt bipiramidy trygonalnej, w której cząsteczki tetrahydrofuranu zajmują pozycje osiowe.
-
Heteroleptic tri-tert-butoxysilanethiolate complexes of manganese(II) - thermal studies
PublicationThe thermal behavior of Mn(II) silanethiolate series [Mn(SR)2L(MeOH)n], where R=SSi(OBut)3, L=heterocyclic nitrogen base and n=0, 1 or 2 has been comparatively investigated using differential scanning calorimetry (DSC), thermogravimetry (TG) and TG-infrared spectoscopy (IR) techniques. The TG curves indicate the differences in the thermal decomposition due to presence of distinct N-donor ligands and labile MeOH molecules coordinated...
-
Analyze of Maldi-TOF Proteomic Spectra with Usage of Mixture of Gaussian Distributions
Publication -
Wpływ nierównomierności grubości próbek na prądy TOF oraz TSC
PublicationZbadano wpływ nierównomierności grubości próbek na przebiegi natężenia prądu, rejestrowane metodami czasu przelotu oraz termicznie stymulowanych prądów. Wyniki analityczne porównano z rezultatami symulacji prądów metodą Monte Carlo.
-
Modified Peptide Molecules As Potential Modulators of Shelterin Protein Functions; TRF1
PublicationIn this work, we present studies on relatively new and still not well-explored potential anticancer targets which are shelterin proteins, in particular the TRF1 protein can be blocked by in silico designed "peptidomimetic" molecules. TRF1 interacts directly with the TIN2 protein, and this protein-protein interaction is crucial for the proper functioning of telomere, which could be blocked by our novel modified peptide molecules....
-
Perspectives of Telematics Implementation in Tri-City Transport Systems Management and Planning
PublicationIn 2010 the City of Gdynia applied for match funding the project ''Implementation of the Integrated Traffic Management System TRISTAR in Tri-City" under the Operational Programme Infrastructure and Environment. This year the project has been placed on a list approved by the Ministry of Infrastructure. Tri-City proceeds with a tender for the implementation of the system. The project will be implemented in key elements are included...
-
System numerycznej prognozy pogody oparty na pakiecie WRF EMS
PublicationW artykule przedstawiono zagadnienia dotyczące wykorzystania systemów numerycznego prognozowania pogody przy pomocy oprogramowania wchodzącego w skład pakietu WRF EMS (ang. Weather Research and Forecast Environmental Modeling System). Artykuł opisuje podstawowe równania modelujące procesy w atmosferze oraz architekturę systemu numerycznego prognozowania pogody WRF EMS. Przedstawiono także architekturę prototypu systemu informacji...
-
Probabilistic Analysis of Structure Models using Target Random Sampling (TRS)
PublicationThe work presents testing methods of sensitivity and reliability of mechanical or structural systems. All computations concerned the case of Zigler column, a simple model of a compressed column involving two random variables only. A conclusion was drawn that the standard Monte Carlo method, its reduction variants and the response surface method allow to assess the sensitivity of structural response to the variation of random structural...
-
Two isomorphic ZnII/CoII complexes with tri-tert-butoxysilanethiol and histamine, and (4-hydroxymethyl-1H-imidazole-κN)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)zinc(II)
PublicationOtrzymano dwa izomorficzne kompleksy cynku(II) i kobaltu(II) z tri-tert-butoksysilanotiolem i histaminą oraz kompleks cynku(II) z tri-tert-butoksysilanotiolem i 4(5)-hydroksymetyloimidazolem. Scharakteryzowano strukturę otrzymanych kompleksów w ciele stałym.
-
Tetrakis(m2-methanol-k2O:O)bis(methanol-kO)-(m2-tri-tert-butoxysilane-thiolato-k3S:O,S)-bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-k2O,S)-tetrasodium(i)
PublicationZwiązek [Na4(C12H27O3SSi)4(CH4O)6] jest rozpatrywany jako addukt trzech jonów - dwujądrowego kationu [Na2(MeOH)6]2+ oraz dwóch anionów [Na{SSi(OtBu)3}2] - utworzony dzięki istnieniu krótkich kontaktów pomiędzy tymi jonami.Obecność mostków siarczkowych i tlenkowych oraz wiązań wodorowych O-H...O and O-H...S, sprawia, że w rezultacie wszystkie atomy Na w czterojądrowym kompleksie są pięciokoordynacyjne.
-
XRF analysis of heavy metals contents in oak wood (Quercur robur L.)
Publication -
The role of TGF superfamily gene expression in the regulation of folliculogenesis and oogenesis in mammals: a review
Publication -
DFT and NBO theoretical study of protonation of tri-tert-butoxysilanethiol and its anion
PublicationWykonano obliczenia kwantowo-chemiczne metodą DFT dla tri-tert-butoksysilanotiolu oraz jego protonowanych i deprotonowanych form, zarówno na atomie tlenu jak i siarki. Przeanalizowano bilans energetyczny dla protonowania anionu w próżni i w fazie wodnej (stosując model IPCM). Zaobserwowano skrócenie wiązania Si-S w wyniku protonowania na atomie tlenu. Zmiany długości wiązań Si-O i Si-S zostały zinterpretowane w oparciu o analizę...
-
Tetrahydrofuran-kO bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-k2O,S)chromium(II)
PublicationTytułowy związek jest pierwszym silanotiolanowym kompleksem chromu(II). Atom chromu jest koordynowany przez 0,S-chelatujący tri-tert-butoksysilanotiolanowy ligand oraz dodatkowy ligand - czasteczkę tetrahydrofuranu. Geometrię ligandów wokół atomu chromu można opisać jako piramidę o podstawie kwadratu, z czasteczką tetrahydrofuranu w pozycji wierzchołkowej. Związek ten posiada dwukrotną oś symetrii.
-
Cadmium tri-tert-butoxysilanethiolates. Structural and spectroscopic models of metal sites in proteins.
PublicationW publikacji opisano syntezy i struktury dla dwóch heteroleptycznych kompleksów kadmu z rdzeniem CdS2NO2 i CdS2N2. Bis(tri-tert-butoksysilanotiolato)(1-metyloimidazol)kadmu(II) oraz bis(tri-tert-butoksysilanotiolato)bis(1-metyloimidazol)kadmu(II) współistnieją w roztworze chloroformu przy różnych stężeniach Bis(tri-tert-butoksysilanotiolanu) kadmu(II) i 1 metyloimidazolu. Rotzwór ten został scharakteryzowany za pomocą analizy spektralnej...
-
Comparison of Algorithms for Profile-Based Alignment of Low Resolution MALDI-ToF Spectra
Publication -
GIUSEPPE VOLPI. IL GRANDE MEDIATORE TRA ISTITUZIONI, POLITICA ED ECONOMIA
PublicationGiuseppe Volpi di Misurata represented a mediation point between different interests both in the economic field and in the complex national – but also regional and local – political balance that long underpinned the fascist regime. This article intends to revisit this figure between the 1920s and the Second World War. The attempt will be made to identify, through an approach that will be chronological and thematic, the passages...
-
Simulations of the Derecho Event in Poland of 11th August 2017 Using WRF Model
PublicationThis series contains datasets related to the forecasting of a severe weather event, a derecho, in Poland on 11 August 2017. The simulations were conducted using the Weather Research and Forecasting (WRF) model version 4.2.1 with different initial and boundary conditions of the pressure and model levels derived from 5 global models: Global Forecast System (GFS), Global Data Assimilation System (GDAS), European Centre for Medium-Range...
-
Cadmium tri-tert-butoxysilanethiolates: Structural and spectroscopic models of metal sites in proteins
Publication -
(1H-Pyrazole-κN)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)cadmium
Publication -
Heteroleptic cobalt(II)tri-tert-butoxysilanethiolates in search of new biomimetic complexes
PublicationW ramach prowadzonych badań mających na celu syntezę układów mimikujących centra aktywne wybranych metaloprotein zostały otrzymane dwa nowe heterlopetyczne tri-tert-butoksysilanotiolany kobaltu(II) w reakcji bimetalicznego kompleksu kobaltu(II) zawierającego już reszty silanotiolanowe z pochodnymi pirydyny: 3,5-dimetylopirydyny i dibenzyloaminy. Otrzymane związki zostały scharakteryzowane strukturalnie za pomocą analizy rentgenostrukturalnej,...