Filters
total: 19783
-
Catalog
- Publications 12784 available results
- Journals 119 available results
- Conferences 1 available results
- Publishing Houses 7 available results
- People 800 available results
- Inventions 113 available results
- Projects 424 available results
- Laboratories 20 available results
- Research Teams 50 available results
- Research Equipment 11 available results
- e-Learning Courses 3182 available results
- Events 645 available results
- Open Research Data 1627 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: sekwencjonowanie dna
-
DNA methylation analysis of benign and atypical meningiomas: correlation between RUNX3 methylation and WHO grade
Publication -
The Degree of Global DNA Hypomethylation in Peripheral Blood Correlates with That in Matched Tumor Tissues in Several Neoplasia
Publication -
Prolonged Quercetin Administration Diminishes the Etoposide-Induced DNA Damage in Bone Marrow Cells of Rats
Publication -
Buserelin Acetate Reduces Mortality and DNA Defragmentation of Bovine Sperm Cells Exposed to Oxidative Stress
Publication -
Influence of addition of cobalamin to the extender on the post-thaw motility, viability, and DNA integrity of bovine ejaculate
Publication -
Serial depletion of Baltic herring since the Viking Age revealed by ancient DNA and population genomics
Publication -
On the Trail of the Oldest Domestic Cat in Poland. An Insight from Morphometry, Ancient DNA and Radiocarbon Dating
Publication -
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublicationMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
Increased resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA in proximity to metallic silver particles.
PublicationZbadano wpływ nanocząstek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donor (pochodna kumaryny) i akceptor (Cy3) umieszczono na przeciwległych końcach DNA o strukturze podwójnej helisy i o 23 parach bazowych. W nieobecności cząstek srebra wydajność przekazywania energii w tym układzie wynosiła ok. 9%, zaś po umieszczeniu go między kwarcowymi płytkami pokrytymi filmem wysepek...
-
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublicationOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
-
Revista da universidade de Aveiro. Letras
Journals -
Contemporanea-Revista de Sociologia da UFSCar
Journals -
REVER-Revista de Estudos da Religiao
Journals -
Revista de Direito da Faculdade Guanambi
Journals -
"istota zamieszkiwania: refleksje wpasowane [bio]morficznie. DWA PARKI | DWA ŚWIATY"
PublicationMyśląc o zamieszkiwaniu poruszam się w nurcie filozofii przyrody. Park Schopenhauera jest punktem odniesienia dla uwolnienia refleksji dotykającej ludzkich schronień. Domy, ich postaci kompletne są celem procesu, którego etapem jest tworzenie rzeźb zaprezentowanych w otwartej przestrzeni przyrodniczo-kulturowej. W Oliwie, pośród drzew, wzdłuż Potoku Oliwskiego umieszczony został cykl rzeźb zatytułowanych „istota zamieszkiwania:...
-
Mechanism of reaction of RNA-dependent RNA polymerase from SARS-CoV-2
PublicationWe combine molecular dynamics, statistical mechanics, and hybrid quantum mechanics/molecular mechanics simulations to describe mechanistically the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). Our study analyzes the binding mode of both natural triphosphate substrates as well as remdesivir triphosphate (the active form of drug), which is bound preferentially over ATP by RdRp while...
-
Będąc dla Boga - być dla innych. O Johnie Henrym Newmanie
Publication -
Cycling performances of the V2O5 nanostructures as cathode material in Na-ion batteries
Open Research DataThe DataSet contains the next one hundred galvanostatic charge/discharge curves of the V2O5 nanostructures with different morphology obtained by the sol-gel method. The battery tests of the samples were performed using the Atlas-Sollich 0961 (Atlas-Sollich, Poland) with C/5 current densities in the voltage range between 2.0 V and 4.0 V vs. Li/Li+. Here...
-
Bypass kolejowy dla wiaduktu łukowego i kratownicowego w ciągu modernizowanej linii kolejowej E59 na odcinku Wronki – Dobiegniew
PublicationW artykule przedstawiono realizacje bypassu kolejowego, zlokalizowanego nieopodal miejscowości Krzyż Wielkopolski w ciągu linii kolejowej E59 na skrzyżowaniu z linią kolejową 203. Wariantowa analiza kilku zaproponowanych rozwiązań wykazała, ze wykonstruowanie bypassu na czas prowadzenia prac modernizacyjnych pozwoli na utrzymanie ciągłości ruchu kolejowego, nie stworzy nadmiernych problemów podróżnym, a jednocześnie pozwoli na...
-
Modelowanie wymiany wody w zbiornikach hodowlanych przy użyciu zmodyfikowanego modelu tłokowego na przykładzie basenów hodowlanych dla fok
PublicationNiniejszy artykuł opisuje sposób prostego modelowania wymiany wody w basenach hodowlanych fokarium Stacji Morskiej Instytutu Oceanografii Uniwersytetu Gdańskiego. W celu rozpoznania warunków wymiany wody oraz udziału stref zastoiskowych w basenach posłużono się dwiema uzupełniającymi się metodami. Były to badania traserowe z wykorzystaniem znacznika fluororescencyjnego oraz komputerowe obliczenia rozkładu linii prądu z użyciem...
-
Wykorzystanie związków powierzchniowo czynnych na etapie przygotowania próbek do analizy jako zielona alternatywa dla konwencjonalnych technik ekstrakcyjnych
PublicationZwiązki powierzchniowo czynne stanowią doskonałą alternatywę dla rutynowo stosowanych, zazwyczaj żmudnych i czasochłonnych, technik przygotowania próbek, do przeprowadzenia których nierzadko wykorzystuje się duże ilości odczynników chemicznych.
-
Metoda określania zapotrzebowania na energię elektryczną w typowych stanach eksploatacji statków towarowych dla potrzeb wstępnego doboru elektrowni
PublicationPrzedstawiono metodę określania zapotrzebowania na energię elektryczną w typowych stanach eksploatacji statków towarowych, celem doboru wielkości i ilości źródeł energii elektrycznej. Metoda pozwala na określanie zapotrzebowania na energię wytypowanych grup odbiorników przy znajomości ich mocy zainstalowanych oraz współczynników wykorzystania.
-
Badania symulacyjne wpływu modulacji prądu na przebieg mocy chwilowej pobieranej przez silnik indukcyjny dla celów diagnostyki łożysk
PublicationW referacie przedstawiono wyniki badań symulacyjnych wpływu modulacji prądu na prze-bieg mocy chwilowej pobieranej przez silnik indukcyjny. Na prostym modelu zmiennej w czasie indukcyjności, zasymulowanym w PSpice, wyjaśniono uproszczony model zjawisk bę-dących źródłem modulacji prądu i mocy chwilowej. Następnie zaprezentowano wyniki symu-lacji uzyskanych za pomocą przygotowanego w LabVIEW programu dla celów określenia wpływu kąta...
-
Wiley Interdisciplinary Reviews-RNA
Journals -
MAG. Magazyn dla Praktyków
Journals -
Analiza oddziaływania planowanej inwestycji – wieży radiokomunikacyjnej dla systemów telefonii komórkowej i Internetu szerokopasmowego – na pracę obiektów radiokomunikacyjnych na terenie Portu Lotniczego Olsztyn Mazury w Szymanach
PublicationCelem niniejszego opracowania jest analiza (matematyczna) oddziaływania planowanej inwestycji w postaci wieży radiokomunikacyjnej dla systemów telefonii komórkowej i Internetu szerokopasmowego na pracę obiektów radiokomunikacyjnych na terenie Portu Lotniczego Olsztyn-Mazury w Szymanach.
-
Analysis of the influence of polystyrene microplastics and their derivatives on the DNA of human colon epithelial cells HT29 with the comet assay
PublicationWe have been using plastic for almost a century and nowadays a lot of them circulates as pollutants in the environment and still defragmenting to micro and nanoscale. The exposition through the food chain and its precise impact on human health is still not clear. In our study, we tested real food packaging after contact with food products and real thermoinsulation and environmental samples of polystyrene in different model liquids,...
-
The interactions of monomeric acridines and unsymmetrical bisacridines (UAs) with DNA duplexes: an insight provided by NMR and MD studies
PublicationMembers of a novel class of anticancer compounds, exhibiting high antitumor activity, i.e. the unsymmetrical bisacridines (UAs), consist of two heteroaromatic ring systems. One of the ring systems is an imidazoacridinone moiety, with the skeleton identical to the structural base of Symadex. The second one is a 1-nitroacridine moiety, hence it may be regarded as Nitracrine’s structural basis. These monoacridine units are connected...
-
Implementing fuzzy logic to generate user profile in decisional DNA television: the concept and initial case study
PublicationIn the paper the concept and case study of a novel approach that generates a television user's profile utilizing principles of fuzzy logic is presented.
-
Effects of Salvia officinalis and Thymus vulgaris on oxidant-induced DNA damage and antioxidant status in HepG2 cells
PublicationSalvia officinalis (SO) and Thymus vulgaris (TV) are medicinal plants well known for their curative powers. However, the molecular mechanisms responsible for these abilities of sage and thyme have not been fully understood yet. In this study we investigated the composition and the quantitative estimation of plant extracts, the protective effects of plant extracts against hydrogen peroxide- and 2,3-dimethoxy-1,4 naphthoquinone-induced...
-
Photoinduced electron transfer in 5-bromouracil labeled DNA. A contrathermodynamic mechanism revisited by electron transfer theories
PublicationThe understanding of the 5-bromouracil (BrU) based photosensitization mechanism of DNA damage is of large interest due to the potential applications in photodynamic therapy. Photoinduced electron transfer (ET) in BrU labeled duplexes comprising the 50 -GBrU or 50 -ABrU sequence showed that a much lower reactivity was found for the 50 -GBrU pattern. Since the ionization potential of G is lower than that of A, this sequence selectivity...
-
Liver Cirrhosis in Chronic Hepatitis B Patients Is Associated with Genetic Variations in DNA Repair Pathway Genes
Publication -
Catalytic Mechanism of Non-Target DNA Cleavage in CRISPR-Cas9 Revealed by Ab Initio Molecular Dynamics
PublicationCRISPR-Cas9 is a cutting-edge genome editing technology, which uses the endonuclease Cas9 to introduce mutations at desired sites of the genome. This revolutionary tool is promising to treat a myriad of human genetic diseases. Nevertheless, the molecular basis of DNA cleavage, which is a fundamental step for genome editing, has not been established. Here, quantum–classical molecular dynamics (MD) and free energy methods are used...
-
Increased concentration of Taq DNA polymerase as a solution for GC-rich templates from clinical and environmental samples
PublicationDNA polymerase is an enzyme which plays crucial role in replication and DNA repair. It found application in PCR (polymerase chain reaction) where catalyses process of in vitro DNA synthesis. To meet the demands posed by mod- ern diagnostic, molecular biology or genetic engineering it is necessary to improve DNA polymerases to obtain new or better features useful in these fields. So far implemented modifications in majority are...
-
Virtual engineering process (VEP): a knowledge representation approach for building bio-inspired distributed manufacturing DNA
PublicationThe objective of this research is to provide a user-friendly and effective way of representing engineering processes for distributed manufacturing systems so that they can develop, accumulate and share knowledge. The basic defini-tion and principle of the approach is introduced first and then the prototype version of the system is developed and demonstrated with case studies, which verify the feasibility of the proposed approach....
-
Comet assay-based methods for measuring DNA repair in vitro; estimates of inter- and intra-individual variation.
PublicationZdolność do naprawy uszkodzeń DNA jest jednym z najważniejszych wyznaczników podatności na choroby nowotworowe. Dlatego też użytecznym staje się możliwość pomiaru stopnia naprawy DNA w próbkach materiału badawczego pobranego od ochotników. Celem pracy było, po pierwsze, opracowanie w warunkach in vitro prostej metody (z wykorzystaniem techniki testu kometowego), w której naprawa DNA odbywa się poprzez wycinanie nukleotydów (NER)....
-
Targeted DNA oxidation by LSD1–SMAD2/3 primes TGF-β1/ EMT genes for activation or repression
Publication -
DNA strand breaks induced by nuclear hijacking of neuronal NOS as an anti-cancer effect of 2-methoxyestradiol
Publication -
Functional Interfaces, Biological Pathways, and Regulations of Interferon-Related DNA Damage Resistance Signature (IRDS) Genes
Publication -
Identification and characterization of single-stranded DNA-binding protein from the facultative psychrophilic bacteria Pseudoalteromonas haloplanktis
PublicationSingle-stranded DNA-binding protein (SSB) plays an important role in DNA metabolism such as DNAreplication, repair, and recombination, and is essential for cell survival. This study reports on the ssb-likegene cloning, gene expression and characterization of a single-stranded DNA-binding protein of Pseudoal-teromonas haloplanktis (PhaSSB) and is the first report of such a protein from psychrophilic microorganism.PhaSSB possesses...
-
Szczepionki DNA i antygeny rekombinantowe w prewencji zarażeń Toxoplasma gondii - aktualny stan badań
PublicationToksoplazmoza wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest jedną z najbardziej rozpowszechnionych odzwierzęcych chorób na świecie o bardzo dużym znaczeniu medycznym. Stanowi ponadto bardzo poważny problem weterynaryjny, ponieważ jest główną przyczyną strat reprodukcyjnych w hodowli zwierząt (głównie owiec). Z tego względu bardzo ważne są prace dotyczące konstrukcji i opracowania nowych, skutecznych i tanich...
-
Quantification of Radiation-Induced Single-Strand Breaks in Plasmid DNA using a TUNEL/ELISA-Based Assay
PublicationWprowadzono nową metodę służącą do oznaczania in vitro pojedynczych pęknięć nici DNA powstałych pod wpływem naświetlań. Porównano wyniki otrzymane z nowej metody z modelem teoretycznym. Porównano wyniki z szeroko używaną metodą elektroforezy żelowej. Pokazano, że poziom pojedynczych pęknięć powstających w niciach DNA pod wpływem promieniowania VUV jest wyższy niż zakładany na podstawie wyników otrzymywanych metodami standardowymi.
-
GRA1 protein vaccine confers better immune response compared to codon-optimized GRA1 DNA vaccine
PublicationW publikacji oszacowano immunogenność i właściwości protekcyjne szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na białku rekombinantowym GRA1 oraz dwóch rodzajach szczepionek DNA (plazmidu zawierającego gen kodujący białko GRA1 dzikiego typu oraz modyfikowanego genu kodującego białko GRA1). Uzyskane wyniki sugerują lepsze właściowści immunoprotekcyjne rekombinantowego białka antygenowego niż szczepionek DNA.
-
Novel single-stranded DNA-binding proteins from extreme psychrophilic bacterium Psychromonas ingrahamii 37
PublicationWe report the identification and characterization of the single-stranded DNA binding protein (SSB) from extreme psychrophilic bacterium Psychromonas ingrahamii 37 (PinSSB) that grows expotentially at -12°C and may well grow at even lower temperatures. PinSSB is one of the largest known bacterial SSB protein consisting 222 amino acid residues with a calculated molecular mass of 25.1 kDa. The analysis by gel filtration chromatography...
-
Characterization of exceptionally thermostable single-stranded DNA-binding proteins from Thermotoga maritima and Thermotoga neapolitana
PublicationBACKGROUND: In recent years, there has been an increasing interest in SSBs because they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods.RESULTS: We report the characterization of single-stranded DNA binding proteins (SSBs) from the thermophilic bacteria Thermotoga maritima (TmaSSB) and Thermotoga neapolitana (TneSSB). They are the smallest known bacterial SSB proteins, consisting of 141 and 142 amino...
-
Comparison of antioxidant enzyme activities and DNA damage in chickpea (Cicer arietinum L.) genotypes exposed to vanadium
Publication -
Genetic response to metabolic fluctuations: correlation between central carbon metabolism and DNA replication in Escherichia coli
Publication -
The Protective Effect of Dabigatran and Rivaroxaban on DNA Oxidative Changes in a Model of Vascular Endothelial Damage with Oxidized Cholesterol
Publication -
The protective effect of dabigatran and rivaroxaban on DNA oxidative changes in a model of vascular endothelial damage with oxidized cholesterol
Publication -
Wczesne modele opisujące uszkodzenia nici DNA pod wpływem działania czynników chemicznych oraz promieniowania
PublicationOd wielu lat kwantyfikacja uszkodzeń DNA, wywołanych przez różne rodzaje promieniowania korpuskularno-falowego, jak i związków chemicznych, jest przedmiotem szerokich badań teoretycznych i eksperymentalnych. Badania te, mając na celu szczegółowe i dogłębne poznanie mechanizmów powstawania uszkodzeń wspomagają jednocześnie rozwój nowoczesnych terapii nowotworowych. Wstępne pomiary wykazały, że wiele z tych czynników może prowadzić...