Filters
total: 3498
-
Catalog
- Publications 2767 available results
- Journals 18 available results
- Publishing Houses 1 available results
- People 62 available results
- Inventions 6 available results
- Projects 9 available results
- Laboratories 2 available results
- Research Teams 3 available results
- e-Learning Courses 187 available results
- Events 17 available results
- Open Research Data 426 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: peptide profile
-
The immunological properties, cytotoxic effect and antimicrobial activities of novel analogues of edeine antibiotics
PublicationOpisano syntezę kilku nowych analogów edein a i d z zastosowaniem klasycznych metod syntezy peptydów w roztworze oraz przedstawiono wyniki badań cytotoksycznych na kilku liniach komórek ludzkich oraz wyniki badań mikrobiologicznych w stosunku do bakterii gramododatnich i gramoujemnych. Opisano również wyniki badań immunologicznych na modelu myszy.
-
Synthesis of anthraquinone-tuftsin analogues as potential topoisomerase inhibitors
PublicationZaprezentowano syntezę nowych analogów antrachinonów z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny oraz wstępne badania biologiczne (aktywność cytotoksyczną na wybranych liniach nowotworowych oraz zdolność hamowania topoizomerazy I).
-
Oligopeptide antifungals are exceptionally active against multidrug-resistant yeast
PublicationPermeazy peptydowe w komórkach drożdżowych są zdolne do transportu do wnętrza komórek oligopeptydów, zawierających w swojej strukturze niebiałkowe aminokwasy o właściwościach przeciwgrzybowych. Wśród szerokiego wachlarza tego rodzaju związków przebadanych pod względem aktywności biologicznej na wielolekoopornych komórkach drożdżowych, zaobserwowano liczna grupę, wykazującą zwiększoną aktywność względem komórek eksprymujących transportery...
-
Structure-activity relationship studies on the antimicrobial activity of novel edeine a and d analogues
PublicationOpisano syntezę 4 nowych analogów peptydowego antybiotyku, edeiny a i d z wykorzystaniem klasycznej syntezy w roztworze. Stosowano metodę estrów aktywnych oraz metodę azydową do tworzenia wiązań peptydowych. Zbadano także aktywność przeciwgrzybową i przeciwbakteryjną opisanych połączeń.
-
Synthesis of conjugates of Combretastatin A-4 with tuftsin derivatives as potential anticancer agents
PublicationZaprezentowano syntezę nowych koniugatów Combretastatyny A-4 z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny, jako potencjalnych związków przeciwnowotworowych.
-
Synthesis, activity on NK-3 tachykinin receptor and conformational solution studies of scyliorhinin II analogs modified at position 16
Publication -
Conformational studies of vasopressin and mesotocin using NMR spectroscopy and molecular modelling methods. Part II: studies in the SDS micelle
Publication -
Vasopressin V2 receptor/bioligand interactions
Publication -
Conformation-activity relationships ofcyclo-constrained µ/δ opioid agonists derived from theN-terminal tetrapeptide segment of dermorphin/deltorphin
Publication -
Solution conformational study of Scyliorhinin I analogues with conformational constraints by two-dimensional NMR and theoretical conformational analysis
Publication -
Computer modeling of the solution conformation of cyclic enkephalins
Publication -
Molecular Simulations of Rhodopsin Tetrameter
Publication -
Deltorphin analogs restricted via a urea bridge: structure and opioid activity
Publication -
Conformational studies of neurohypophyseal hormones analogues with glycoconjugates by NMR spectroscopy
Publication -
Synthesis, biological activity and conformational analysis of head-to-tail cyclic analogues of LL37 and histatin 5
Publication -
Solution conformations of bradykinin antagonists modified with CαCα cyclized nonaromatic residues
Publication -
Interactions of vasopressin and oxytocin receptors with vasopressin analogues substituted in position 2 with 3,3′-diphenylalanine - a molecular docking study
Publication -
Conformational studies of highly potent 1-aminocyclohexane-1-carboxylic acid substituted V2 vasopressin agonists
Publication -
Effect of head-to-tail cyclization on conformation of histatin-5
Publication -
Conformational studies of vasopressin and mesotocin using NMR spectroscopy and molecular modelling methods. Part I: studies in water
Publication -
Molecular Modeling of the Neurohypophyseal Receptor/Atosiban Complexes
Publication -
Theoretical conformational analysis of six arginine vasopressin analogs with the l -naphthylalanine in position 3
Publication -
Molecular Dynamics Study of the Internal Water Molecules in Vasopressin and Oxytocin Receptors
Publication -
Molecular dynamics simulation of human neurohypophyseal hormone receptors complexed with oxytocin—modeling of an activated state
Publication -
Analysis of interactions responsible for vasopressin binding to human neurohypophyseal hormone receptors—molecular dynamics study of the activated receptor–vasopressin–Gα systems
Publication -
Low-Molecular-Weight Aldehyde Inhibitors of Cathepsin G
Publication -
Design of serine proteinase inhibitors by combinatorial chemistry using trypsin inhibitor SFTI‐1 as a starting structure
Publication -
Designing of Substrates and Inhibitors of Bovine α-Chymotrypsin with Synthetic Phenylalanine Analogues in Position P1
Publication -
Introduction of Pro and Its Analogues in the Conserved P1 Position of Trypsin Inhibitor SFTI-1 Retains Its Inhibitory Activity
PublicationA number of monocyclic SFTI-1 analogues modified in the conserved inhibitor P1 position by Pro, its L-hydroxyproline (Hyp) derivative as well as mimetics with different ring size were synthesized by the solid-phase method. Replacement of Ser6 by Pro, Hyp, and a four-member ring, L-azetidine-2-carboxylic acid (Aze), retained trypsin or chymotrypsin inhibitory activity. The determined association equilibrium constants of these analogues...
-
Analogues of trypsin inhibitor SFTI-1 modified in the conserved P1′ position by synthetic or non-proteinogenic amino acids retain their inhibitory activity
PublicationA series of linear and monocyclic (with a disulfide bridge only) analogues of trypsin inhibitor SFTI-1 modified in the P-1 and/or P-1' positions were synthesized by the solid-phase method. In the substrate specificity P-1 position, Phe or N-benzylglycine (Nphe) were introduced, whereas the conserved Ser6 in Bownam-Birk (BBI) inhibitors was replaced by Hse (L-homoserine), Nhse [N-(2-hydroxyethyl)glycine], Sar, and Ala. Kinetic studies...
-
In vitro evaluation of novel lipopeptides with potential therapeutic application
PublicationThe synthesis of derivatives of Gly-His-Lys was elaborated followed by their antimicrobial activity investigation.
-
Antifungal dipeptides incorporating an inhibitor of homoserine dehydrogenase
PublicationThe antifungal activity of 5‐hydroxy‐4‐oxo‐L‐norvaline (HONV), exhibited under conditions mimicking human serum, may be improved upon incorporation of this amino acid into a dipeptide structure. Several HONV‐containing dipeptides inhibited growth of human pathogenic yeasts of the Candida genus in the RPMI‐1640 medium, with minimal inhibitory concentration values in the 32 to 64 μg mL−1 range. This activity was not affected by multidrug...
-
Reverse vaccinology-based prediction of a multi-epitope SARS-CoV-2 vaccine and its tailoring to new coronavirus variants
PublicationThe genome feature of SARS-CoV-2 leads the virus to mutate and creates new variants of concern. Tackling viral mutations is also an important challenge for the development of a new vaccine. Accordingly, in the present study, we undertook to identify B- and T-cell epitopes with immunogenic potential for eliciting responses to SARS-CoV-2, using computational approaches and its tailoring to coronavirus variants. A total of 47 novel...
-
Thermodynamics aspects of interactions between acridine derivatives and DNA
PublicationDNA is a molecular target for many anticancer and antiviral drugs. Therefore, a clear understanding of the interaction of small molecules with DNA is important in the rational design of ligands that can bind to DNA with high affinity and selectivity. There are several methods to investigate interactions between drug and DNA. Some of them measure changing into DNA structures, such as lengthening and untwisting of helix of DNA. Other...
-
Improving Clairvoyant: reduction algorithm resilient to imbalanced process arrival patterns
PublicationThe Clairvoyant algorithm proposed in “A novel MPI reduction algorithm resilient to imbalances in process arrival times” was analyzed, commented and improved. The comments concern handling certain edge cases in the original pseudocode and description, i.e., adding another state of a process, improved cache friendliness more precise complexity estimations and some other issues improving the robustness of the algorithm implementation....
-
KASKADA - multimedia processing platform architecture
PublicationPrzedstawiono architekturę platformy KASKADA (skrót od: Kontekstowa Analiza Strumieni Danych z Kamer do Aplikacji Definiujących Alarmy), będącą częścią projektu MAYDAY EURO 2012. Opisano nowy wielowarstwowy model przetwarzania strumieni multimedialnych. Zaproponowano następujące warstwy: usług - prostych i złożonych, zadań obliczeniowych i procesów. Przedstawiono przykładowy scenariusz wraz ze szczegółami jego wykonania, jak również...
-
The task graph assignment for KASKADA platform
PublicationArtykuł opisuje model obliczeniowy wykorzystany w platformie KASKADA. Opiera się on na dwóch podstawowych elementach: węzłach klastra obliczeniowego oraz grafie zadań. Przeanalizowane zostały algorytmy przydzielania węzłów obliczeniowych dla zadań w zależności od kryteriów: minimalizacja fragmentacji klastra i minimalizacja opóźnienia przetwarzania danych. Zostały przedstawione wyniki symulacji opisanych algorytmów oraz ich...
-
Real-Time Multimedia Stream data Processing in a Supercomputer Environment
PublicationRozdział opisuje doświadczenia uzyskane przez autorów podczas pracy w projekcie MAYDAY EURO 2012. Przedstawiono główny cel projektu - stworzenie systemu umożliwiającego rozwijanie i równolegle wykonywanie usług multimedialnych w środowisku klastra obliczeniowego dużej mocy. opisano tematykę przetwarzania dużej liczby strumieni multimedialnych na komputerach dużej mocy. Następnie zaprezentowano możliwości platformy KASKADA: tworzenie...
-
Dobór usług WWW w środowisku SOA
PublicationPrzedstawiono nowy sposób doboru usług poprzez heurystyczną ocenęprzydatności ich atrybutów. Zaprezentowano algorytm doboru oraz siećneuronową jako sposób oceny wyboru pojedynczej usługi. Propozycjęzilustrowano na przykładzie usługi wysyłania wiadomości.
-
Podstawowe metody integracji aplikacji trójwarstwowych
PublicationW niniejszym rozdziale przedstawiono klasyfikację metod integracji aplikacji trójwarstwowych. Opisano modele i sposoby rozwiązań dla każdej z typowych warstw: bazy danych, pośredniej i GUI oraz przykłady konkretnego ich wykorzystania wraz z diagramami sekwencji. Przeprowadzono analizę jakościową dla każdego z opisanych modeli, zaproponowano metryki dla parametrów jakościowych: modyfikowalności, spójności danych i wydajności wraz...
-
Przetwarzanie strumieni multimedialnych z użyciem klastra obliczeniowego
PublicationZaprezentowano docelową funkcjonalność platformy KASKADA oraz sposób konstrukcji kolejnych warstw. Przedstwiono metodę opisu zadań oraz metodę implementacji zadań uzytkowych (framework), których głównym celem jest analiza strumieni multimedialnych dla identyfikacji charakterystycznych obiektów (np. twarzy) oraz niebezpiecznych zdarzeń 9np. bójka0. Zaprezentowano również strategie wykonania tych zadań na komputerze klastrowym w...
-
Task Allocation and Scalability Evaluation for Real-Time Multimedia Processing in a Cluster Envirinment
PublicationAn allocation algorithm for stream processing tasks is proposed (Modified best Fit Descendent, MBFD). A comparison with another solution (BFD) is provided. Tests of the algorithms in an HPC environment are descrobed and the results are presented. A proper scalability metric is proposed and used for the evaluation of the allocation algorithm.
-
Performance and Power-Aware Modeling of MPI Applications for Cluster Computing
PublicationThe paper presents modeling of performance and power consumption when running parallel applications on modern cluster-based systems. The model includes basic so-called blocks representing either computations or communication. The latter includes both point-to-point and collective communication. Real measurements were performed using MPI applications and routines run on three different clusters with both Infiniband and Gigabit Ethernet...
-
Processing of Satellite Data in the Cloud
PublicationThe dynamic development of digital technologies, especially those dedicated to devices generating large data streams, such as all kinds of measurement equipment (temperature and humidity sensors, cameras, radio-telescopes and satellites – Internet of Things) enables more in-depth analysis of the surrounding reality, including better understanding of various natural phenomenon, starting from atomic level reactions, through macroscopic...
-
Understanding the early-stage release of volatile organic compounds from rapeseed oil during deep-frying of tubers by targeted and omics-inspired approaches using PTR-MS and gas chromatography
PublicationDuring deep-frying, a plethora of volatile products is emitted with the fumes. These compounds could act as oil quality indicators and change the indoor air composition leading to health risks for occupants. The presented experiments focus on deep-frying of different tubers in rapeseed oil at different frying temperatures. Here, two scenarios for real-time monitoring of volatile organic compounds (VOCs) using proton transfer reaction...
-
Shaping the competence of future spatial policymakers for small- and medium-sized towns
PublicationIn this article, the authors aim to present issues addressed within the framework of the architecture and spatial development courses offered by the Faculty of Architecture at Gdańsk University of Technology (FA-GUT), Gdańsk, Poland. These issues concern competence in the education of future spatial planners and their readiness to deal with the development challenges facing small- and medium-sized towns. Within the article, the...
-
The Importance of Demand and Environment for Defining and Establishing the Role of Data Stewards
PublicationData stewardship is now a central part of FAIR research data management. Although various types of positions called data stewards have been created at academic institutions over the last years, no demand-oriented, formal model of data stewardship and the associated roles exist so far. This workshop report presents the outcomes of the panel discussion “The Importance of Demand and Environment for Defining Data Stewardship” held...
-
The Effect of Sterols on Amphotericin B Self-Aggregation in a Lipid Bilayer as Revealed by Free Energy Simulations
PublicationAmphotericin B (AmB) is an effective but toxic antifungal drug, known to increase the permeability of the cell membrane, presumably by assembling into transmembrane pores in a sterol-dependent manner. The aggregation of AmB molecules in a phospholipid bilayer is, thus, crucial for the drug’s activity. To provide an insight into the molecular nature of this process, here, we report an atomistic molecular dynamics simulation study...
-
WPŁYW PARAMETRÓW PROCESU SBM NA DYSTRYBUCJĘ TWORZYWA W BUTELKACH PET – PRZEGLĄD LITERATURY
PublicationZ mechanicznego punktu widzenia profil grubości butelek PET jest uwarunkowany mechaniczno-cieplną odpowiedzią tworzywa rozdmuchiwanej preformy na zadane parametry procesu SBM. Z mikroskopowego punktu widzenia na mechaniczne i termiczne właściwości butelek CSD z PET największy wpływ mają procesy orientowania i krystalizowania tworzywa. Z technologicznego punkty widzenia profil grubości butelek PET po procesie produkcji metodą SBM...
-
Areas of updraft air motion from WRF model simulations.
Open Research DataPresented dataset is a part of numerical modelling study focusing on the analysis of sea ice floes size distribution (FSD) influence on the horizontal and vertical structure of convection in the atmosphere. The total area and spatial arrangement of the updrafts indicates that the FSD affects the total moisture content and the values of area averaged...