Filters
total: 329
-
Catalog
- Publications 205 available results
- Journals 1 available results
- Publishing Houses 2 available results
- People 25 available results
- Projects 20 available results
- Research Teams 3 available results
- e-Learning Courses 56 available results
- Events 4 available results
- Open Research Data 13 available results
Search results for: DESKRYPTORY MOLEKULARNE
-
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie
Publishing Houses -
Comparative molecular dynamics simulations of amphotericin B-cholesterol/ergosterol membrane channels
PublicationBadania polegały na przeprowadzeniu porównawczej dynamiki molekularnej dla dwóch typów kanałów amfoterycyny B. Obie symulacje różniły się rodzajem sterolu (cholesterol lub ergosterol). Na podstawie wyników przeprowadzonych prac ustalono jakie elementy strukturalne badanych kanałów mogą być odpowiedzialne za selektywne działanie amfoterycyny B.
-
Glucosamine-6-phosphate synthase - the multi-facets enzyme
PublicationAmidotransferaza L-glutamina: D-frukozo-6-fosforan, nazywana zwyczajowo syntazą glukozamino-6-fosforanu, jako jedyny enzym należący do grupy amidotransferaz, nie wykazuje aktywności amoniakozależnej. Enzym ten, katalizujący pierwszy wyjątkowy etap w szlaku metabolicznym prowadzącym do ostatecznego wytworzenia 5´difosfourydyno-N-acetylo-D-glukozaminy (UDG-GlcNAc) stanowi ważny punkt kontroli metabolicznej biosyntezy makromolekuł...
-
Anna Toruńska-Sitarz
PeopleAnna Toruńska-Sitarz, Msc in Oceanography, PhD in Earth Sciences. She is a cyanobacteriologist and academic teacher, working in the Division of Marine Biotechnology, University of Gdańsk. Her main scientific interests concern antibacterial compounds from marine organisms, regulation of cyanometabolites production in cyanobacteria and cyanobacterial molecular diversity. Further information
-
Raman investigation of hybrid polymer thin films
PublicationPrzestawiono problemy diagnostyki ramanowskiej transparentnych struktur cienkowarstwowych wykonanych metodą zol-żel z polimerów hybrydowych. Analizowano możliwości badania struktury molekularnej i grubości, a także określania jakości wykonania struktur falowodowych. Przedstawiono wyniki badań wykonanych mikroskopem ramanowskim dla polimerowych struktur cienkowarstwowych osadzonych na podłożach szklanych i krzemowych.
-
Monosaccharides as internal probes for the determination of the absolute configuration of 2-butanol
PublicationD-dlukoza, D-mannoza i L-ramnoza zostały poddane reakcji z mieszaniną racemiczną 2-butanolu. Otrzymane w ten sposób glikozydy były analizowane za pomocą spektroskopii NMR, z wykorzystaniem eksperymentów COSY i NOESY. Analiza konformacyjna wiązania glikozydowego (dokonana w oparciu o modelowanie molekularne i heteronuklearne stałe sprzężenia) wraz z analizą sprzężeń dipolowych obserwowanych w widmie NOESY umożliwiła określenie konfiguracji...
-
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublicationZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
Silanethiolates - synthesis, properties and structures.
PublicationW pracy wskazano podstawowe drogi syntezy oraz podano zwięzłą charakterystykę silanotiolanów - w większości związków kompleksowych posiadających jako główny ligand grupę silanotiolanową, na ogół (t-BuO)3SiS. Przy pomocy odpowiednio dobranych przykładów zilustrowano właściwości tych związków - wskazano ciekawsze elementy struktury molekularnej oraz specyficzne cechy spektralne.
-
ANALIZA PARAMETRÓW SYGNAŁU MOWY W KONTEKŚCIE ICH PRZYDATNOŚCI W AUTOMATYCZNEJ OCENIE JAKOŚCI EKSPRESJI ŚPIEWU
PublicationPraca dotyczy podejścia do parametryzacji w przypadku klasyfikacji emocji w śpiewie oraz porównania z klasyfikacją emocji w mowie. Do tego celu wykorzystano bazę mowy i śpiewu nacechowanego emocjonalnie RAVDESS (Ryerson Audio-Visual Database of Emotional Speech and Song), zawierającą nagrania profesjonalnych aktorów prezentujących sześć różnych emocji. Następnie obliczono współczynniki mel-cepstralne (MFCC) oraz wybrane deskryptory...
-
Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń dermatofitowych
PublicationGrzyby należące do rodzajów Microsporum, Trichophyton i Epidermophyton są główną przyczyną powierzchownych zakażeń grzybiczych. Klasyczna identyfikacja gatunkowa czynnika etiologicznego tych grzybic oparta na obserwacjach mikro- i makroskopowych możliwa jest dopiero po uzyskaniu czystej hodowli dermatofitów. W związku z powolnym tempem wzrostu jest ona możliwa po dwóch, trzech tygodniach po pobrania próbki. Molekularne metody diagnostyczne...
-
Radosław Szmytkowski prof. dr hab.
People -
Wykrywanie nieruchomego bagażu w obrazach z kamer monitoringu portu lotniczego
PublicationW referacie opisano nowy algorytm wykrywania nieruchomego bagażu w obrazach z kamer monitoringu wizyjnego. Obiekty ruchome są wykrywane w obrazie i analizowane pod kątem zmienności pikseli. Obiekty zidentyfikowane jako nieruchome są analizowane przez klasyfikator, który wykrywa bagaż na podstawie deskryptorów kształtu. Dodatkowo eliminowane są fałszywe obiekty, powstające na etapie odejmowania tła. Zadaniem algorytmu jest uzyskanie...
-
Molecular modelling of amphotericin B-ergosterol primary complex in water
PublicationBadano właściwości pierwotnego kompleksu amfoterycyny B z ergosterolem przy pomocy symulacji dynamiki molekularnej. Otrzymane w wyniku naszych symulacji rezultaty słabo odpowiadają postulowanym przez innych autorów modelom kompleksu antybiotyk-sterol. Z drugiej strony uzyskane geometrie nie są sprzeczne z wynikami eksperymentów biofizycznych dotyczących powstawania kompleksów w wodzie i w środowisku wodno-alkoholowym.
-
SEMINARIUM DYPLOMOWE
e-Learning CoursesSeminarium dyplomowe dla kierunku Biotechnologia, specjalność Biotechnologia molekularna.
-
Computer study of the lead-germanium alloy formation in over-reduced lead-germanate glass
PublicationPraca poświęcona jest badaniom dynamiczno-molekularnym struktury zredukowanego szkła ołowiowo-germanianowego o składzie 1Pb 1Ge 1GeO2. Analizie poddano strukturę matrycy szkła, GeO2 i osadzonej w niej fazy metalicznej, którą formują neutralne atomy Pb i Ge.
-
Zespół Fizyki Materii Molekularnej
Research TeamsGłówną tematyką badań Zespołu Fizyki Materii Molekularnej jest wyjaśnianie struktury i własności fizycznych układów molekularnych oraz hybrydowych (materiał organiczny / materiał nieorganiczny)
-
Weekend Muzeów online na Politechnice Gdańskiej
EventsZapraszamy do udziału w Weekendzie Muzeów – wykładach online, podejmujących aktualne zagadnienia zdrowotne. Transmisja na żywo na kanale YouTube Politechnika Otwarta, z możliwością zadawania pytań prelegentom w komentarz
-
Synthesis and structural characterization of novel 2-benzimidazolylthioureas: adducts of natural isothiocyanatesand 2-amino-1-methylbenzimidazole
PublicationNa drodze syntezy chemicznej uzyskano addukty naturalnych izotiocyjanianów - alilu, benzylu i fenyloetylu i 2-amino-1-metylobenzoimidazolu. W następstwie optymalizacji warunków reakcji, poszczególne 2-benzimidazolilotiomoczniki otrzymano produkty z umiarkowanymi wydajnościami. Strukturę molekularną i krystaliczną produktów scharakteryzowano przy użyciu metod spektroskopowych i X-ray. Analiza uzyskanych widm pozwoliła stwierdzić,...
-
Application of organic materials in electronics
PublicationRozwój urządzeń elektronicznych na bazie materiałów organicznych przestawia jedno z najbardziej spektakularnych osiągnięć nauki w XXI wieku. Do produkcji zostały wdrożone urządzenia zbudowane na cienkich warstwach organicznych, i poczynione zostały pierwsze kroki w kierunku rozwoju elektroniki molekularnej. Celem publikacji jest dostarczenie podstawowych informacji dotyczących urządzeń elektronicznych zbudowanych na bazie cienkich...
-
Structure recognition in MD-simulated materials: a case study of boroxyl rings in borate glasses
PublicationZanalizowano statystyczne właściwości geometryczne losowo deformowanej jednostki strukturalnej AC_3, gdzie trzy kationyC znajdują się w wierzchołkach trójkąta równobocznego, a anionA - w jego środku. W szczególności opisano rozkłady kątów AAA,ACA i CAA oraz dwóch estymatorów kształtu w funkcji amplitudydeformacji trójkąta. Wyniki analizy stochastycznej zastosowanodo ilościowej oceny stopnia nieuporządkowania w szkle B_2O_3,symulowanym...
-
Processing of musical data employing rough sets and artificial neural networks
PublicationArtykuł opisuje założenia systemu automatycznej identyfikacji muzyki i dźwięków muzycznych. Dokonano przeglądu standardu MPEG-7, ze szczególnym naciskiem na parametry opisowe dźwięku. Przedyskutowano problemy analizy danych audio, związane z zastosowaniami wykorzystującymi MPEG-7. W oparciu o eksperymenty przedstawiono efektywność deskryptorów niskiego poziomu w automatycznym rozpoznawaniu dźwięków instrumentów muzycznych. Przedyskutowano...
-
Processing of musical data employing rough sets and artificial neural networks
PublicationArtykuł opisuje założenia systemu automatycznej identyfikacji muzyki i dźwięków muzycznych. Dokonano przeglądu standardu MPEG-7, ze szczególnym naciskiem na parametry opisowe dźwięku. Przedyskutowano problemy analizy danych audio, związane z zastosowaniami wykorzystującymi MPEG-7. W oparciu o eksperymenty przedstawiono efektywność deskryptorów niskiego poziomu w automatycznym rozpoznawaniu dźwięków instrumentów muzycznych. Przedyskutowano...
-
The reactions occuring on the implant as a result of contact with human tissue
PublicationObecnosc implantu w ciele czlowieka powoduje liczne, czesto nieprzewidywalne skutki. Powodem takiej sytuacji jest duza roznorodnosc interakcji materialu medycznego z kontaktujaca sie z nim tkanka. Stwierdzenie to dotyczy glownie oddzialywan i skutkow zachodzacych na poziomie molekularnym w poszczegolnych komorkach kontaktujacej sie tkanki.
-
On the possibility of using liquid or lipid - polymer membrane systems as taste sensors
PublicationMembrany ciekłe z anionowym surfaktanetem mogą być użyte do rozpoznawania molekularnego substancji smakowych ale nie mogą stanowić podstawy sensora smaku głównie z powodu chaotycznych zachowań. Przeciwnie membrany polimerowo-lipidowe mogą być zastosowane w sensorze smaku do badania jakości pewnych napojów handlowych.
-
Chemical kinetic approach to the mechanism of coupled transport of Cu(II) Ions through bulk liquid membranes
PublicationW celu lepszego zrozumienia transportu jonów miedzi przez ciekłe membrany zaproponowano schemat kinetyczny na poziomie molekularnym oparty o dwie nastepujące po sobie reakcje odwracalne. Zasegurowano uzywając membrany ciekłej o wysokiej polarności i polaryzowalności oraz szybkiego mieszania mozna zwiekszyć wydajnośc transportu.
-
Diagnostyka molekularna w medycynie 2022
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studenta z nowoczesnymi, molekularnymi metodami stosowanymi w diagnostyce medycznej.
-
Elektronika molekularna WFTiMS 2022 - Nowy
e-Learning Courseskier Fizyka techniczna i Nanotechnologia
-
Diagnostyka molekularna w medycynie 2023
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studenta z nowoczesnymi, molekularnymi metodami stosowanymi w diagnostyce medycznej oraz nabycie umiejętności posługiwania się programami do obróbki danych z poziomu DNA.
-
Zastosowania elektroniki molekularnej 2022/23
e-Learning CoursesKurs przeznaczony jest dla studentów studiów stacjonarnych II stopnia kierunku Fizyka Techniczna. Tematyka kursu obejmuje zagadnienia związane z fizycznymi podstawami działania elementów elektronicznych zbudowanych na bazie materiałów molekularnych oraz technologią ich wytwarzania.
-
Podstawy elektroniki molekularnej FT 2023
e-Learning CoursesPrzedmiot dla kierunku Fizyka Techniczna semestr VI
-
Zastosowania elektroniki molekularnej 2023/24
e-Learning CoursesKurs przeznaczony jest dla studentów studiów stacjonarnych II stopnia kierunku Fizyka Techniczna. Tematyka kursu obejmuje zagadnienia związane z fizycznymi podstawami działania elementów elektronicznych zbudowanych na bazie materiałów molekularnych oraz technologią ich wytwarzania.
-
Podstawy elektroniki molekularnej FT 2024
e-Learning CoursesPrzedmiot dla kierunku Fizyka Techniczna semestr VI
-
Long-working-distance Raman system for monitoring of uPA ECR CVD process of thin diamond/DLC layers growth
PublicationW artykule przedstawiono konstrucję systemu optoelektronicznego do monitoringu ramanowskiego in-situ procesu μPA ECR CVD (ang.: Microwave Plasma Assisted Electron Cyclotron Resonance Chemical Vapour Deposition), stosowanego do osadzania cienkich warstw diamentowych i diamentopodobnych DLC. System ma budowę modułową i wyposażony jest w dedykowane sondy optyczne. Przedstawiono wyniki pomiarów testowych, potwierdzjące, że system posiada...
-
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.
PublicationStruktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...
-
Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase
PublicationCentra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...
-
Barbara Becker prof. dr hab. inż.
People -
Tranzystory organiczne
PublicationW artykule przedstawiono budowę, zasady działania i niektóre podstawowe charakterystyki organicznych tranzystorów polowych w oparciu o przegląd najnowszych publikacji naukowych dotyczących tematu. Omówiono tranzystory cienkowarstwowe TFT i typu SIT wykonane uproszczoną technologią z elastycznych i częściowo uporządkowanych materiałów organicznych. Zwrócono uwagę na koncepcję tranzystora molekularnego.
-
Early stage of critical clusters growth in phenomenological and Molecular Dynamic simulation models.
PublicationOpisano proces kondensacji pary wodnej w ujĘciu fenomenologicznymi dynamiczno-molekularnym. Wczesne fazy wzrostu klastra opisano w ramach klasycznej teorii Hertza-Knudsena. Obszernie przedstawiono wyniki symulacji dynamiczno-molekularnych zjawiska kondensacji pary wodnej z jednorodnej fazy gazowej (przebieg powstawania małych klastrów H2O i szybkość wzrostu klastrów ponadkrytycznych).
-
Algorytmy analizy porównawczej dla potrzeb systemów wyszukiwania obrazów medycznych.**2002, 134 s. bibliogr. 198 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /13.12.2002/ WETI PG. Promotor: prof. dr hab. inż. A. Nowakowski, prof. zw. PG.
PublicationPodstawowym celem projektu było opracowanie, implementacja i weryfikacja e-fektywnych algorytmów analizy porównawczej dla potrzeb wyszukiwania i inter-pretacji danych wielomedialnych obrazów medycznych i ich sekwencji czaso-wych. W wyniku realizacji projektu opracowano: system gromadzenia i prezen-tacji danych zgodnie z normą DICOM, metodę dwuetapowej segmentacji obrazówstosując filtrację histogramu oraz łączenie serii...
-
Organiczne baterie słoneczne ze zdyspergowanym złączem na bazie polimerów półprzewodnikowych o wąskiej przerwie energetycznej
PublicationPrzeprowadzono badania nad zwiększeniem wydajności prądowej organicznych baterii słonecznych ze złączem objętościowym, zbudowanych z syntetycznych polimerów półprzewodnikowych, posiadających rozległe wiązania π-sprzężone i charakteryzujących się długofalową granicą absorpcji optycznej. Przeanalizowano wpływ domieszek typu n i zmiany materiału katody na molekularny proces transferu nośników ładunku w złączu. Przeprowadzono pomiary...
-
Maria Jolanta Milewska prof. dr hab. inż.
PeopleMaria Jolanta Milewska, po ukończeniu Technikum Chemiczno-Mechanicznego w Wąbrzeźnie (specjalizacja: przetwórstwo tworzyw sztucznych) kontynuowała naukę na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej. W 1979 r. zdobywa tytuł mgr inżyniera na kierunku Chemia, o specjalizacji Lekka Synteza Organiczna. Studium Doktoranckie PG ukończyła w 1984 r. W 1983 r została zatrudniona na macierzystym wydziale w Katedrze Chemii Organicznej, początkowo...
-
Wykorzystanie detektora SIFT do georeferencjonowania zobrazowań satelitarnych z sensora AVHRR
PublicationW pracy zaproponowano autonomiczny algorytm georeferencjonownania obrazów satelitarnych bazujący na niezależnym od skali deskryptorze SIFT (ang. Scale-Invariant Feature Transform). Algorytm ma charakter kilkuetapowy, wykorzystujący detekcję punktów kontrolnych, dopasowanie ich do referencyjnej bazy punktów oraz wyznaczenie parametrów reprojekcji. W pracy dokonano także porównania dokładności zaproponowanego algorytmu w zależności...
-
Toward Mechanosynthesis of Diamondoid Structures: VI. Quantum-Chemical Molecular Dynamics Comparison of Conditions for the STM Tip Driven Mechanosynthesis on Hydrogenated Si(111), Si(110) and Si(100) Surfaces.
Publicationmożliwość prototypowania przejściowych generacji nano-urządzeń otrzymanych drogą pozycjonowanej mechanosyntezy za pomocą stm wyposażonego w ostrze typu swcnt są analizowane metodą kwantowo-chemicznej dynamiki molekularnej. proponowana strategia syntezy polega na insercji atomów si oraz cząsteczek sih2 we wiązania si-h na uwodornionej powierzchni si(111), si(110) oraz si(100) kryształu krzemu. rezultaty modelowania sugerują, że...
-
Pre-clinical evaluation of 1-nitroacridine derived chemotherapeutic agent that has preferential cytotoxic activity towards prostate cancer
PublicationPraca zawiera wyniki badań przedklinicznych pochodnej 1-nitroakrydyny C-1748 wobec komórek ludzkiego raka prostaty CaP in vitro, jak i przeszczepialnego na zwierzęta. W oparciu o fosforylację histonu H2AX jako markera podwójnych cięć DNA wykazano, że C-1748 jest bardziej aktywny w komórkach CaP niż HL60. Zidentyfikowano poza tym receptor androgenny (AR) jako cel molekularny badanego związku. W doświadczeniach na zwierzętach stwierdzono...
-
Typing of Candida isolates from patients with invasive infection and concomitant colonization
PublicationWe investigated the relationship between colonizing and invasive isolates from patients with candidaemia. Molecular typing was performed using random amplification of polymorphic DNA (RAPD) and multilocus sequence typing (MLST). We found MLST to be sufficient for typing Candida isolates, and that surveillance cultures are helpful in predicting concomitant invasive isolates, but not necessarily the pathogen involved in subsequent...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublicationW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
Fizyka molekularna dla IBM 2022/23
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z podstawowymi zagadnieniami fizyki oraz biofizyki molekularnej. Kurs przeznaczony jest dla studentów studiów II stopnia kierunku Inżynieria Biomedyczna.
-
Diagnostyka biochemiczna i molekularna chorób tarczycy
e-Learning Courses -
Fotofizyka i podstawy spektroskopii molekularnej 2023
e-Learning CoursesKurs wspierający zajęcia z przedmiotu "Fotofizyka i podstawy spektroskopii molekularnej", który realizowany jest ze studentami I stopnia kierunku Nanotechnologia, sem. 7.