Filtry
wszystkich: 1608
-
Katalog
- Publikacje 1462 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 33 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 24 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 5 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 1 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 81 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: PROTEIN-LIGAND INTERACTIONS
-
CAVER Analyst 1.0: graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures
Publikacja -
The Escherichia coli RNA polymerase alpha subunit and transcriptional activation by bacteriophage lambda CII protein.
Publikacja -
Mitogen activated protein kinase 4 (MPK4) influences growth in Populus tremula L.×tremuloides
Publikacja -
Rapeseed Meal Waste Biomass as Single-Cell Protein Substrate for Nutritionally-Enhanced Feed Component
Publikacja -
E2/E3‐independent ubiquitin‐like protein conjugation by Urm1 is directly coupled to cysteine persulfidation
Publikacja -
UNRES server for physics-based coarse-grained simulations and prediction of protein structure, dynamics and thermodynamics
Publikacja -
Comparison of Antioxidant Activity of Protein Isolates Derived from Selected Dry-Cured Meat Products
Publikacja -
Karaś P., Kochanowicz K., Pitek M., Domański P., Obuchowski I., Tomiczek B., Liberek K.: Evolution towards simplicity in bacterial small heat shock protein system// eLife -, (2023), s.1-21
PublikacjaEvolution can tinker with multi-protein machines and replace them with simpler single-protein systems performing equivalent functions in an equally efficient manner. It is unclear how, on a molecular level, such simplification can arise. With ancestral reconstruction and biochemical analysis, we have traced the evolution of bacterial small heat shock proteins (sHsp), which help to refold proteins from aggregates using either...
-
Perceived neighborhood disorder and quality of life: The role of the human-place bond, social interactions, and out-group blaming.
PublikacjaFour studies were carried out to examine how neighborhood disorder, human-place bonds, relationships among neighbors, and urban quality of life are related and what role blaming nonresidents plays in these relationships. In the first study, local identity was a significant mediator of the relationship between neighborhood disorder and quality of life. In the second study, we found that participants exposed to vignettes describing...
-
Tipping point in plant–fungal interactions under severe drought causes abrupt rise in peatland ecosystem respiration
Publikacja -
Ionic liquids: predictions of physicochemical properties with experimental and/or DFT-calculated LFER parameters to understand molecular interactions in solution
PublikacjaPublikacja zawiera modele pozwalające na przewidywanie współczynnika podziału oktanol-woda (log P), rozpuszczalności w wodzie oraz krytycznego stężenia micelizacji (CMC) cieczy jonowych oraz współczynników aktywności anionowej i hydrofobowości w wodzie i w mieszaninie oktanolu z wodą. Modele oparte są na liniowych zależnościach energii swobodnej (LFER) i wykorzystują parametry zmierzone i/lub wyliczone na podstawie funkcjonalnej...
-
Exactly solvable model of two trapped quantum particles interacting via finite-range soft-core interactions
Publikacja -
An Influence of the Aromatic Side Chains Conformations in Positions 2 and 3 of Vasopressin Analogs on Interactions with Vasopressin and Oxytocin Receptors
Publikacja -
Cumulant-based expressions for the multibody terms for the correlation between local and electrostatic interactions in the united-residue force field
Publikacja -
Pharmacokinetics and pharmacodynamics of propofol and fentanyl in patients undergoing abdominal aortic surgery - a study of pharmacodynamic drug-drug interactions
Publikacja -
Interactions of vasopressin and oxytocin receptors with vasopressin analogues substituted in position 2 with 3,3′-diphenylalanine - a molecular docking study
Publikacja -
Self-assembly and interactions of short antimicrobial cationic lipopeptides with membrane lipids: ITC, FTIR and molecular dynamics studies
Publikacja -
Current View on Green Tea Catechins Formulations, Their Interactions with Selected Drugs, and Prospective Applications for Various Health Conditions
Publikacja -
Dipole-driven dynamics for near-threshold electron/positron interactions with pyrimidinic DNA bases: a path to compound formations
PublikacjaCalculations are reported for electron and positron scattering from isolated cytosine and thymine, where the two pyrimidinic single-ring DNA bases, in the gas-phase at energies near the elastic threshold, they reveal the special features of the dipole-driven scattering states. All molecules examined exhibit, in fact, supercritical (>1.67 D) permanent dipoles which can therefore also support, below threshold, excited bound compound...
-
Human serum interactions with phenolic and aroma substances of Kaffir(Citrus hystrix) and Key lime (Citrus aurantifolia) juices
PublikacjaTo understand the therapeutic application of polyphenols extracted from Kaffir (PolKaf) and Key (PolKey) limesdifferent analytical methods were applied. Based on quantitative analysis by two dimensional gas chromato-graphy (GC×GC) and time of flight mass spectrometry (TOFMS) it can be observed that the biggest differencesin the contents of selected terpenes of Kaffir and Key limes occur in chemical compounds such as limonene, citraland...
-
Effects of different external carbon sources and electron acceptors on interactions between denitrification and phosphorus removal in BNR processes
PublikacjaThe effects of two different external carbon sources (acetate, ethanol) and electron acceptors (dissolved oxygen, nitrate and nitrite) were investigated under aerobic and anoxic conditions with non-acclimated process biomass from a full-scale biological nutrient removal activated sludge system. When acetate was added as an external carbon source, phosphate release was observed even in the presence of electron acceptors. The release...
-
A mobile loop order–disorder transition modulates the speed of chaperonin cycling
PublikacjaMolecular machines order and disorder polypeptides as they form and dissolve large intermolecular interfaces, but the biological significance of coupled ordering and binding has been established in few, if any, macromolecular systems. The ordering and binding of GroES co-chaperonin mobile loops accompany an ATP-dependent conformational change in the GroEL chaperonin that promotes client protein folding. Following ATP hydrolysis,...
-
Analysis of the Link between the Redox State and Enzymatic Activity of the HtrA (DegP) Protein from Escherichia coli
Publikacja -
t-SNE Highlights Phylogenetic and Temporal Patterns of SARS-CoV-2 Spike and Nucleocapsid Protein Evolution
Publikacja -
Gene and Protein Accumulation Changes Evoked in Porcine Aorta in Response to Feeding with Two Various Fructan Sources
Publikacja -
Least Squares Estimators of Peptide Species Concentrations Based on Gaussian Mixture Decompositions of Protein Mass Spectra
Publikacja -
Influence of one‐night CPAP therapy on the changes of HIF‐1α protein in OSA patients: A pilot study
Publikacja -
The cell surface protein Ag43 facilitates phage infection of Escherichia coli in the presence of bile salts and carbohydrates
Publikacja -
MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 4 impacts leaf development, temperature, and stomatal movement in hybrid aspen
Publikacja -
Hyperosmolarity adversely impacts recombinant protein synthesis by Yarrowia lipolytica—molecular background revealed by quantitative proteomics
Publikacja -
Electrochemical Synthesis of Polysaccharide-Protein Complexes. Part 1: Preliminary Studies on Apple Pectin-Albumin Complexes
Publikacja -
The Role of Matrix Gla Protein (MGP) Expression in Paclitaxel and Topotecan Resistant Ovarian Cancer Cell Lines
Publikacja -
The Influence of the Parameters of a Gold Nanoparticle Deposition Method on Titanium Dioxide Nanotubes, Their Electrochemical Response, and Protein Adsorption
Publikacja -
Protein oligomerization is the biochemical process highly up-regulated in porcine oocytes before in vitro maturation (IVM)
Publikacja -
Real-time proliferation of porcine cumulus cells is related to the protein levels and cellular distribution of Cdk4 and Cx43
Publikacja -
Improved Consensus-Fragment Selection in Template-Assisted Prediction of Protein Structures with the UNRES Force Field in CASP13
Publikacja -
Structure determination of UL49.5 transmembrane protein from bovine herpesvirus 1 by NMR spectroscopy and molecular dynamics
Publikacja -
Evaluation of the scale-consistent UNRES force field in template-free prediction of protein structures in the CASP13 experiment
Publikacja -
GRA1 protein vaccine confers better immune response compared to codon-optimized GRA1 DNA vaccine
PublikacjaW publikacji oszacowano immunogenność i właściwości protekcyjne szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na białku rekombinantowym GRA1 oraz dwóch rodzajach szczepionek DNA (plazmidu zawierającego gen kodujący białko GRA1 dzikiego typu oraz modyfikowanego genu kodującego białko GRA1). Uzyskane wyniki sugerują lepsze właściowści immunoprotekcyjne rekombinantowego białka antygenowego niż szczepionek DNA.
-
Serum Cholesteryl Ester Transfer Protein (CETP) and Sortilin (SORT) in Patients with Psoriasis with Relation to Systemic Treatment
Publikacja -
Liver fatty acid-binding protein might be a predictive marker of clinical response to systemic treatment in psoriasis
Publikacja -
Nanostructured polyethersulfone membranes for dye and protein separation: Exploring antifouling role of holmium (III) molybdate nanosheets
Publikacja -
Taq DNA polymerase fused with DNA binding protein with increased resistance to inhibitors from clinical samples
PublikacjaNowadays PCR method is commonly used in molecular diagnostic. However, in many cases PCR is limited, by the presence of inhibitory substances in biological, soil or food samples Efficiency and fidelity of amplification is strongly connected with DNA polymerase and reaction conditions. To meet the requirements of modern diagnostic methods it is essential to seeking for new DNA polymerases with better properties useful in these field....
-
Large-scale DFT calculations in implicit solvent-A case study on the T4 lysozyme L99A/M102Q protein
PublikacjaW ostatnich latach zaproponowano szereg modeli typu implicit solvent, ktore bazują na bezpośrednim rozwiązaniu niejednorodnego równania Poissona w przestrzeni rzeczywistej. Modele te charakteryzują się elegancją, ponieważ wnęka, w której umieszczona jest molekuła substancji rozpuszczanej zdefiniowana jest bezpośrednio w funkcji gęstości elektronowej, a rozkład ładunku jest w sposób samouzgodniony polaryzowany dzięki reakcji dielektryka,...
-
Characterization of the interactions between human high-molecular-mass kininogen and cell wall proteins of pathogenic yeasts, Candida tropicalis
Publikacja -
Potent antidiuretic agonists, deamino-vasopressin and desmopressin, and theirinversoanalogs: NMR structure and interactions with micellar and liposomic models of cell membrane
Publikacja -
Aryl-perfluoroaryl stacking interactions: hydrogen bonding and steric effects in controlling the structure of supramolecular assemblies of N,N'-diaryloxalamides
PublikacjaOtrzymano kilka struktur supramolekularnych N,N'-diarylooksamidów z silnymi donorami protonów tj. pentafluorofenolem (pfp) i kwasem pentafluorobenzoesowym (pfba), w celu zilustrowania roli współdziałania wiązań wodorowych i oddziaływań pi-elektronowych w tworzeniu uporządkowanych faz stałych. Wprowadzenie do struktury oksamidów objętościowych podstawników arylowych utrudniało tworzenie występujących pomiędzy cząsteczkami oksamidów...
-
Co-crystals of iodopentafluorobenzene with nitrogen donors: 2-D molecular assemblies through halogen bonding and aryl-perfluoroaryl interactions
PublikacjaWspółkrystalizacja pentafluorojodobenzenu z metylowymi pochodnymi pirydyny prowadzi do powstania heterodimerów stabilizowanych wiązaniem halogenowym C-I...N, które organizują się w dwuwymiarowe struktury typu brick-wall, utrzymywane oddziaływaniami pi-pi pomiędzy jednostkami arylowymi i perfluoroarylowymi.
-
Interactions between amphotericin B 3-(N',N'-dimethylamino)propyl amide and cellular membrane components in Langmuir monolayers
PublikacjaPublikacja zawiera charakterystykę monowarstw Langmuir'a tworzonych przez pochodną amfoterycyny B tj.amid 3-(N',N'-dimetyloamino)propylowy (AMA) oraz wyniki badań nad jej oddziaływaniem z cholesterolem, ergosterolem i fosfolipidami. Znaleziono, iż stan jonowy cząsteczki pochodnej AMA, a także jej wielkość mają znaczący wpływ na właściwości biologiczne związku.
-
Interplay of hydrogen bonding and aromatic ring interactions in supramolecular complexes of phenazine with N,N'-bis(2-pyridyl)aryldiamines
PublikacjaOtrzymano pięć krystalicznych kompleksów fenazyny z N,N'-bis(2-pirydylo)arylodiaminami i N'N'-difenylo-1,4-diamino-benzenem o różnej stechiometrii. Badania struktur tych kompleksów za pomocą metod rentgenograficznych wykazały, że powiązane wiązaniami wodorowymi typu NH...N cząsteczki fenazyny i arylodiamin układają się w stosy, które stabilizowane są poprzez oddziaływaniami typu π-π płaszczyzna-krawędź pierścieni aromatycznych....