Filtry
wszystkich: 317
wybranych: 181
Wyniki wyszukiwania dla: MICROBIOLOGY
-
A Novel Cryptic Clostridial Peptide That Kills Bacteria by a Cell Membrane Permeabilization Mechanism
PublikacjaThis work reports detailed characteristics of the antimicrobial peptide Intestinalin (P30), which is derived from the LysC enzyme of Clostridium intestinale strain URNW. The peptide shows a broader antibacterial spectrum than the parental enzyme, showing potent antimicrobial activity against clinical strains of Gram-positive staphylococci and Gram-negative pathogens and causing between 3.04 ± 0.12 log kill for Pseudomonas aeruginosa...
-
Divulging the anti-acetylcholinesterase activity of Colletotrichum lentis strain KU1 extract as sustainable AChE active site inhibitors
PublikacjaAlzheimer’s disease (AD), also called senile dementia is a neurodegenerative disease seen commonly in the elderly and is characterised by the formation of β-amyloid plaques and neurofbrillary tangles (NFT). Though a complete understanding of the disease is lacking, recent studies showed the role of the enzyme acetylcholinesterase (AChE) in pathogenesis. Finding new lead compounds from natural sources has always been a quest for...
-
Postbiotics in oncology: science or science fiction?
PublikacjaThe gut microbiome has been increasingly understood to play a critical role in carcinogenesis and cancer disease progression. The most recent research advancements have shown that different tools of microbiota manipulation contribute to gut microbiome–immune–oncology axis modulation, offering exciting opportunities for targeted interventions aimed at improving the efficacy of established anti-cancer therapy. Postbiotics are a new...
-
Insights in microbiotechnology: 2022.Editorial
PublikacjaThis Research Topic serves as an invaluable resource for readers interested in staying updated with the latest progress and developments in the field of microbiotechnology. It spotlights the innovative research conducted by up-and-coming experts in the field, specifically emphasizing the transforming abilities of microorganisms that greatly influence the scientific community. The advent of multi-omic technologies has revolutionized microbiotechnology,...
-
Transport deficiency is the molecular basis of Candida albicans resistance to antifungal oligopeptides
Publikacja(FMDP), an inhibitor of glucosamine-6-phosphate synthase, exhibited growth inhibitory activity against Candida albicans, with minimal inhibitory concentration values in the 0.05–50 mg/L range. Uptake by the peptide permeases was found to be the main factor limiting an anticandidal activity of these compounds. Di- and tripeptide containing FMDP (F2 and F3) were transported by Ptr2p/Ptr22p peptide transporters (PTR) and FMDP-containing...
-
A new assay for the simultaneous identification and differentiation of Klebsiella oxytoca strains.
PublikacjaKlebsiella oxytoca is the second most frequently identified species of Klebsiella isolated from hospitalized patients. Klebsiella spp. is difficult to identify using conventional methods and is often misclassified in clinical microbiology laboratories. K. oxytoca is responsible for an increasing number of multi-resistant infections in hospitals because of insufficient detection and identification. In this study, we propose a new...
-
Diversity of fecal coliforms and their antimicrobial resistance patterns in wastewater treatment model plant.
PublikacjaThe occurrence of resistance patterns among wastewater fecal coliforms was determined in the study. Susceptibility of the isolates was tested against 19 antimicrobial agents: aminoglycosides, aztreonam, carbapenems, cephalosporines, b-lactam/b-lactamase inhibitors, penicillines, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole, and fluoroquinolones. Additionally the removal of resistant isolates was evaluated in the laboratory-scale...
-
Air trapping problem during infiltration on the large areas
PublikacjaThe process of flow modeling in unsaturated porous medium is often found in many fields of sciences: geology, fluid mechanics, thermodynamics, microbiology or chemistry. Problem is relatively complicated due to complexity of the system which contains three phases: water, air and soil skeleton. The flow of water in such a medium can be described using two-phase (2PH) flow formulation, which accounts the inflow of air and water phases,...
-
Novel application of terminal restriction fragments length polymorphism method (t-RFLP) for identification of six clinically important Candida sp.
PublikacjaTerminal restriction fragments length polymorphism method (t-RFLP) is a modified classical RFLP method. The main difference is based on carrying out PCR using a fluorescently labeled primer or primers. The result of such modification is that after digestion of amplicons only terminal fragments of PCR product (containing fluorescent dye) are visualized. T-RFLP method has found application in environmental microbiology and epidemiology....
-
Pretreatment of Lignocellulosic Materials as Substrates for Fermentation Processes
PublikacjaLignocellulosic biomass is an abundant and renewable resource that potentially contains large amounts of energy. It is an interesting alternative for fossil fuels, allowing the production of biofuels and other organic compounds. In this paper, a review devoted to the processing of lignocellulosic materials as substrates for fermentation processes is presented. The review focuses on physical, chemical, physicochemical, enzymatic,...
-
Mycobacterium tuberculosis Complex and Mycobacterial Heat Shock Proteins in Lymph Node Tissue from Patients with Pulmonary Sarcoidosis
Publikacja -
Distribution of invasive Cylindrospermopsis raciborskii in the East-Central Europe is driven by climatic and local environmental variables
Publikacja -
Microbial acetylcholinesterase inhibitors for Alzheimer’s therapy: recent trends on extraction, detection, irradiation-assisted production improvement and nano-structured drug delivery
Publikacja -
Biosynthesis of zinc oxide nanoparticles with antimicrobial, anticancer, antioxidant and photocatalytic activities by the endophytic Alternaria tenuissima
Publikacja -
Production of paclitaxel with anticancer activity by two local fungal endophytes, Aspergillus fumigatus and Alternaria tenuissima
Publikacja -
Agro‐industrial wastes for production of paclitaxel by irradiated Aspergillus fumigatus under solid‐state fermentation
Publikacja -
Strain improvement and immobilization technique for enhanced production of the anticancer drug paclitaxel by Aspergillus fumigatus and Alternaria tenuissima
Publikacja -
A novel source of the cardiac glycoside digoxin from the endophytic fungus Epicoccum nigrum : isolation, characterization, production enhancement by gamma irradiation mutagenesis and anticancer activity evaluation
Publikacja -
Bacterial and Fungal Endophytic Microbiomes of Salicornia europaea
Publikacja -
Tideless estuaries in brackish seas as possible freshwater‐marine transition zones for bacteria: the case study of the Vistula river estuary
Publikacja -
Generating amplicon reads for microbial community assessment with next‐generation sequencing
Publikacja -
Microbial Diversity in Deep-Subsurface Hot Brines of Northwest Poland: from Community Structure to Isolate Characteristics
Publikacja -
Characterization of bacterial structures in two-stage moving-bed biofilm reactor (MBBR) during nitrification of the landfill leachate
Publikacja -
The development and evaluation of cross-priming amplification for the detection of avian reovirus
Publikacja -
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
PublikacjaBadano przydatność techniki PCR MP w efektywnym typowaniu szczepów w badaniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych. Technika oparta jest na użyciu niskiej temperatury denaturacji podczas LM PCR. Badaniu zostały poddane izolaty Escherichia coli pochodzące od pacjentów Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że technika jest szybka, o wysokim potencjale różnicującym i bardzo dobrej powtarzalności i może być zastosowana w badaniach...
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublikacjaTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Going to extremes – a metagenomic journey into the dark matter of life
Publikacja -
Prevalence of Closely Related Candida albicans Species among Patients with Vulvovaginal Candidiasis in Southern Poland Based on the hwp1 Gene Amplification
Publikacja -
Hyperosmolarity adversely impacts recombinant protein synthesis by Yarrowia lipolytica—molecular background revealed by quantitative proteomics
Publikacja -
Identification and molecular modeling of a novel lipase from an Antarctic soil metagenomic library.
PublikacjaIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichia coli using pUC19 vector and environmental DNA directly isolated from Antarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. The screening on agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one clone with lipolytic activity (Lip1) out of 11,000 E. coli clones. This clone harbored a plasmid, pLip1, which has an insert of 4722 bp that has been...
-
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
PublikacjaOpracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali...
-
Purification and biochemical characteristic of a cold-active recombinant esterase from Pseudoalteromonas sp. 643A under denaturing conditions.
PublikacjaIn this paper production of a cold-active esterase EstA from the Antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A in E. coli expression system was described. The purification and biochemical characteristic of EstA were performed in the presence of urea and then compared with results obtained for the esterase with no addition of urea and isolated from the native source. In both cases the cold-active enzyme displayed similar properties....
-
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
PublikacjaInfekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...
-
Antifungal activity of thionated analogues of nva-fmdp and lys-nva-fmdp
Publikacjaotrzymano dwa peptydy w których wiązanie amidowe łączące aminokwasy zamieniono na tioamidowe w wyniku kilkunastoetapowej syntezy chemicznej. do reakcji tionowania zastosowano odczynnik lawessona. otrzymane związki poddano badaniom aktywności z wykorzystaniem pięciu szczepów candida , w tym szczepów opornych na flukonazol. stwierdzono, ze obecniość wiązania tioamidowego znacznie obniża aktywność przeciwgrzybową testowanych związków...
-
Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale
PublikacjaW celu identyfikacji źródła infekcji spowodowanych przez dermatofity, jak i drogi ich transmisji, istnieje potrzeba szukania nowych metod, które pozwolą na głębokie zróżnicowanie genetyczne szczepów w obrębie rodzaju. W pracy po raz pierwszy pokazano zastosowanie techniki PCR MP opartej o adaptory oligonukleotydowe i różnice w temperaturze topnienia fragmentów restrykcyjnych DNA w reakcji PCR do wewnątrzgatunkowego typowania dermatofitów....
-
Genetic features of clinical Pseudomonas aeruginosa strains
PublikacjaW grupie 62 izolatów klinicznych sprawdzono obecność 6 wybranych czynnikow wirulencji. We wcześniejszych badaniach z wykorzystaniem techniki ERIC - PCR wykazano, że w analizowanej grupie 49 (79%) to szczepy, o dużum podobieństwie genetycznym (ponad 62%), każdy z pozostałych 13 izolatów zaliczono do osobnego genotypu, o zdecydownie niższym stopniu pokrewieństwa. W przypadku wszystkich 49 szczepów z pierwszej grupy stwierdzono obecność...
-
PCR Melting Profile method for genotyping analysis of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from Hematological Unit patients
PublikacjaW ostatnich latach znacząco wzrasta liczba szczepów Enterococcus opornych na wankomycynę. Stwarzają one problemy medyczne u pacjentów skolonizowanych czy zainfekowanych tymi drobnoustrojami. W przedstawionych badaniach, określiliśmy genetyczne podobieństwo pomiędzy izolatami E. faecium VRE, pozyskiwanymi w okresie od kwietnia 2003 do kwietnia 2005 od pojedynczych pacjentów oddziału Hematologicznego Specjalistycznego Publicznego...
-
Immobilized preparation of cold-adapted and halotolerant Antarctic β-galactosidase as a highly stable catalyst in lactose hydrolysis
PublikacjaZimnolubna rekombinowana beta-galaktozydaza antarktycznej morskiej bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b została immobilizowana na chitozanie za pomocą aldehydu glutarowego. Preparat immobilizowanego enzymu w przeciwieństwie do preparatu enzymu w buforze reakcyjnym nie był inhibowany przez glukozę. Immobilizacja enzymu wpłynęła na podwyższenie o 10°C optymalnej temperatury aktywności względem jego nieimmobilizowanego odpowiednika...
-
Five-hour diagnosis of dermatophyte nail infections with specific detection of Trichophyton rubrum
PublikacjaW publikacji przedstawiono szybką dwuetapową metodę oczyszczania DNA oraz opartą na technice multiplex PCR metodę wykrywania grzybów z rodzaju dermatofitów oraz gatunku Trichophyton rubrum z hodowli grzybów oraz bezpośrednio ze zmienionych chorobowo paznokci. Testy stu osiemnastu próbek z użyciem zaprojektowanej reakcji multiplex PCR i dwóch kolejnych (jedna wykrywająca grzyby z rodzaju dermatofitów, druga wykrywająca gatunek T....
-
The influence of soluble microbial products on microbial community composition: hypothesis of microbial community succession
PublikacjaRozpuszczalne produkty mikrobiologiczne (SMP) są związkami organicznymi wytwarzanymi podczas rozkładu substratów przez mikroorganizmy osadu czynnego. Zbadano mikroskopowo zmiany składu zespołów mikrobiologicznych (organizmów jedno- i wielokomórkowych) pod wpływem obniżonego lub zwiększonego poziomu SMP. Wysoka zawartość SMP w znacznym stopniu zmieniła skład zespołów mikrobiologicznych, od orzęsków osiadłych (12-175 µm), do...
-
Enzymatic degradation and transport of endothiopeptides into Escherichia coli K12 mutant strains
PublikacjaZbadano transport trzech otrzymanych na drodze syntezy ditiopeptydów do komórek Escherichia coli K12. Ponadto zbadano szybkość hydrolizy tych związków. Wszystkie peptydy są transportowane przez permeazy, natomiast są bardziej oporne na hydrolizę enzymatyczną w stosunku do naturalnych peptydów.
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublikacjaW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
A comparative evaluation of PCR ribotyping and ERIC PCR for determining the diversity of clinical Pseudomonas aeruginosa isolates
PublikacjaW pracy porównano dwie metody stosowane do badania różnorodności genetycznej drobnoustrojów. Modelem do badań była grupa 62 klinicznych izolatów bakterii P. aeruginosa. Zdecydowanie wyższy potencjał różnicujący stwierdzono w przypadku metody ERIC PCR, której zastosowanie pozwoliło na wyodrębnienie 36 różnych genotypów. W przypadku rybotypowania wyróżniono tylko 9 genotypów.
-
An MTA-phosphorylase gene discovered in the metagenomic library derived from Antarctic top soil during screening for lipolytic active clones confers strong pink fluorescence in the presence of rhodamine B.
PublikacjaIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichiacoli using the pUC19 vector and environmental DNA directly isolated fromAntarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. Unexpectedly, the screeningon agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one unusual pinkfluorescent clone (PINKuv) out of 85 000 clones. This clone harbored a plasmid,pPINKuv, which has an insert of 8317 bp that...
-
Effect of lysozyme or nisin on survival of some bacteria treated with high pressure at subzero temperature
PublikacjaCelem pracy było określenie wrażliwości gramujemnych i gramdodatnich bakterii na działanie ciśnienia 193MPa w temp. -20°C w obecności lizozymu lub nizyny. Stwierdzono, że połączone działanie ciśnienia i badanych substancji przeciwdrobnoustrojowych na zawiesiny bakterii Escherichia coli i Staphylococcus aureus powodowało większy stopień inaktywacji komórek niż suma efektów wywieranych przez pojedyncze czynniki.
-
Comparative genomics and functional analysis of a highly adhesive dairy Lactobacillus paracasei subsp. paracasei IBB3423 strain
Publikacja -
ClaR—a novel key regulator of cellobiose and lactose metabolism in Lactococcus lactis IL1403
Publikacja -
Alternative Lactose Catabolic Pathway in Lactococcus lactis IL1403
Publikacja -
Novel Highly Thermostable Endolysin from Thermus scotoductus MAT2119 Bacteriophage Ph2119 with Amino Acid Sequence Similarity to Eukaryotic Peptidoglycan Recognition Proteins
Publikacja -
Adhesion of the genome-sequenced Lactococcus lactis subsp. cremoris IBB477 strain is mediated by specific molecular determinants
Publikacja