Filters
total: 994
-
Catalog
- Publications 817 available results
- Journals 12 available results
- Conferences 1 available results
- People 30 available results
- Inventions 11 available results
- Projects 12 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 4 available results
- e-Learning Courses 28 available results
- Open Research Data 78 available results
Search results for: oddzialywania fizykochemiczne z dna
-
Investigation of Microbes in the Stratosphere – Stardust Project
PublicationThe stratospheric microbiota has been investigated many times using the methods of classical microbiology. In this research a few modern methods, including NGS sequencing and multiple displacement amplification of DNA, were in use. The analysis of metagenome helped to determine the content of various species of bacteria in the sample collected in the stratosphere by a hydrogen-filled balloon holding...
-
Conserved motifs of MutL proteins
PublicationtThe MutL protein is best known for its function in DNA mismatch repair (MMR). However, there isevidence to suggest that MutL is not only the linker connecting the functions of MutS and MutH in MMR,but that it also participates in other repair systems, such as Very Short Patch (VSP), Base Excision (BER)and Nucleotide Excision Repair (NER). This study set out to identify the most highly conserved aminoacid sequence motifs in MutL...
-
Antitumor 1-nitroacridine derivative C-1748, induces apoptosis, necrosis or senescence in human colon carcinoma HCT8 and HT29 cells.
PublicationC-1748 jest związkiem oddziaływującym z DNA i potencjalnym związkiem przeciwnowotworowym szczególnie wobec nowotworów prostaty i jelita grubego przeszczepialnych na myszach.W pracy badano odpowiedź komórek nowotworowych HCT8 i HT29 na działanie pochodnej C-1748, w stężeniach biologicznie istotnych (EC90). Analiza cyklu komórkowego linii HCT8 pokazała, że związek powoduje wzrost frakcji sub-G1, świadczący o apoptozie tych komórek...
-
Synthesis, physicochemical and theoretical studies on new rhodium and ruthenium dimers. Relationship between structure and cytotoxic activity
PublicationTwo dimeric compounds of the general formulae (Et3NH)2[Rh2(μ2-L)4Cl2] (1) (where L = thiophene-2-carboxylate) and [((η6-p-cymene)Ru)2(μ-Cl)3]PF6 (2) have been synthesized using a new method. The unique anionic complex 1 (space group P bca) has octahedral coordination in which the equatorial positions are occupied by the oxygen atoms of four thiophene-2-carboxylates in a paddle wheel fashion. In complex 2 (space group ), each Ru(II)...
-
Justyna Kucińska-Lipka dr hab. inż.
People -
Badania progu podwodnego na dnie piaszczystym w numerycznym kanale falowym
PublicationPodstawy modelowania wzajemnego oddziaływania falowania, przepuszczalnego progu podwodnego i piaszczystego dna z wykorzystaniem numerycznego kanału falowego CADMAS-SURF, rozbudowanego o równania przepływu Darcy z rozszerzeniem Brinkmanna-Frochheimera (DARCY-SURF).Zastosowanie modelu skonczonej cieczy lepkiej ze swobodna powierzchnia w obszarze falowania i progu.
-
ALLYING SYSTEM THINKING AND SET OF EXPERIENCE KNOWLEDGE STRUCTURE
PublicationThe approach of system thinking is completely different from traditional forms of analysis. Even the ancient meaning of word analysis is “a breaking up”. Set of Experience Knowledge Structure is an atomic record of decision event that can be grouped together and form some form of decision DNA of an organization. The question that this paper is trying to answer in how those concepts can be merged.
-
Implementing decisional trust: a first approach for smart reliable systems
PublicationIn this article, we introduce the necessary elements that must be integrated in order to achieve a decisional technology that is trustworthy. Thus, we refer to such technology as decisional trust. For us, decisional trust can be achieved through the use of elements such as the decisional DNA, reflexive ontologies, and security models; and therefore, we present in this article a framework that was used for the implementation of...
-
Barbara Becker prof. dr hab. inż.
People -
Experience Visualizaton
PublicationSet of Experience Knowledge Structure (SOEKS) has proved its capability of storing substantial part of experience at a particular decision point. The management of SOEKS record is also proposed in many papers for example referring to concepts of Decisional DNA knowledge representation, that is a collection of a number of SOEKS. The aim of this paper is to focus on visualization and practical aspects of presenting gathered knowledge...
-
Diagnostic PCR tests for Microsporum audouinii, M. canis and Trichophyton infections
PublicationSince traditional diagnosis of dermatophyte infections is slow, we present a rapid new pcr test for detection of trichophyton spp., microsporum canis and m. audouinii infections. the performance of the test was evaluated with: 58 dermatophyte isolates; 10 yeast, mould and human dna control samples; 25 routine specimens from patients suspected of having dermatophytosis; 10 hair specimens from guinea pigs experimentally infected...
-
3d imaging software tools for multibeam sonar data
PublicationArtykuł porusza problem trójwymiarowej wizualizacji dna morskiego na podstawie danych pochodzących z systemu wielowiązkowego. W prezentowanym systemie wykorzystano trzy technologie programistyczne do wytwarzania grafiki 3D (C++ OpenGL, Java 3D, Java OpenGL). W artykule przedstawiono problemy, na które natknięto się podczas tworzenia systemu coraz omówiono sposoby ich rozwiązywania.
-
Ruthenium(II) and Iridium(III) Complexes as Tested Materials for New Anticancer Agents
PublicationThe oncological use of cisplatin is hindered by its severe side eects and a very important resistance problem. To overcome these problems, scientists have attempted to design new generation transition-metal anticancer complexes. In this study, we present new complexes, ruthenium(II) [(6-p-cymene)RuCl(py2CO)]PF6 (1), iridium(III) [(5-Cp)IrCl(py2CO)]PF6 (2), and NH4[IrCl4(py2CO)]H2O (3), based on di-2-pyridylketone (py2CO). The prepared...
-
KatedrA Chemii Fizycznej
Research Teams1.Termodynamika i struktura roztworów, oddziaływania międzycząsteczkowe w roztworach - badania termodynamiczne, spektroskopowe i teoretyczne. 2. Fizykochemiczne podstawy analizy środowiskowej.
-
Projekt i budowa dwupłaszczowych zbiorników stalowych dużej pojemności
PublicationOmówiono problemy związane z wykonaniem projektu oraz wynikłe podczas budowy dwóch zbiorników o pojemności 75000 m3 każdy. Zbiorniki na ropę naftową zaprojektowane były przez Politechnikę Gdańską i wybudowane w Mozyrze na Białorusi. Zbiorniki mają podwójne dna i podwójne płaszcze aby chronić środowisko naturalne przed awaryjnymi wyciekami ropy naftowej.
-
Specific detection of Alternaria alternata by PCR and real-time PCR
PublicationFungi of Alternaria genus are cosmopolitan organisms, which spores can be found in the air, soil, water, clothing and food. They commonly occur as saprotrophs on the plant remains, contributing to the decomposition of organic matter. Additionally, they are components of the normal human and animal skin flora. Alternaria spp. are also known human allergens, causing hay fever and allergic reactions that can lead to the development...
-
Wave-induced pore pressure oscillations in sandy seabed sediments
PublicationPracę poświęcono zagadnieniu wywoływania cyklicznych oscylacji ciśnieniacieczy porowej w piaszczystym gruncie dna morskiego w wyniku oddziaływania progresywnego falowania powierzchniowego. Dokonano szerokiego przeglądu i analizy istniejących teorii ciśnień cieczy porowej z punktu widzenia skom- plikowania opisu matematycznego zachowania się ośrodka wodno-gruntowego. Wyprowadzono dwuwymiarowe rozwiązanie analityczne i...
-
PCR and real-time PCR assays to detect fungi of Alternaria alternata species
PublicationFungi of the Alternaria genus are mostly associated with allergic diseases. However, with a growing number of immunocompromised patients, these fungi, with A. alternata being the most prevalent one, are increasingly recognized as etiological agents of infections (phaeohyphomycoses) in humans. Nowadays, identification of Alternaria spp. requires their pure culture and is solely based on morphological criteria. Clinically, Alternaria...
-
Novel fused pyran derivatives induce apoptosis and target cell cycle progression in anticancer efficacy against multiple cell lines.
PublicationNitrogen-based heterocycles such as pyrazole, imidazole, 1,2,4-triazole, benzimidazole, and benzotriazole substituted fused pyran derivatives (6a–e, 8a–e, 10a–e, 12a–e,&14a–e) have been synthesized and tested for their in vitro anticancer efficacies against MCF7, A549, and HCT116 cancer cell lines. Among the compounds, 6e, 14b, and 8c were identified as the most potent against MCF7, A549, and HCT116, with IC50 values of 12.46 2.72...
-
Agnieszka Potęga dr inż.
People -
A novel approach to bottom scattering using a narrow acoustic beam.
PublicationPrzedstawiono model opisujący w prosty sposób rozpraszanie sygnału akustycznego na dnie morskim jako filtr liniowy z odpowiedzią impulsową o zmieniającej się w czasie chwilowej dominującej częstotliwości. Przedyskutowano pasujący do tego modelu przypadek zbioru punktowych rozpraszaczy równomiernie rozmieszczonych na powierzchni dna, w tym wpływ takich parametrów jak głębokość oraz odległość pomiędzy rozpraszaczami.
-
Application of SSB-like protein from Thermus aquaticus in multiplex PCR of human Y-STR markers identification
PublicationW tej publikacji prezentujemy zastosowanie białka SSB-podobnego Thermus aquaticus (TaqSSB) w reakcji multiplex PCR w celu identyfikacji markerów ludzkiego Y-STR. Wykorzystanie termostabilnego białka TaqSSB chroni lub redukuje tworzenie przez startery struktur dimerycznych, które powodują hamowanie hybrydyzacji starterów do badanego DNA i redukują ilość starterów dostępnych w reakcji PCR.
-
Polimerowe ciecze jonowe - sorbenty nowej generacji w SPME
PublicationSposób przygotowywania próbek do analizy jest kluczowym etapem każdej procedury analitycznej. Od momentu wprowadzenia, technika mikroekstrakcji do fazy stacjonarnej (SPME), z uwagi na mnogość jej zalet cechuje duża popularność. W ostatnim czasie jej popularność rośnie, z uwagi na opracowywanie nowych sorbentów, które pozwoliłyby na rozszerzenie możliwości stosowania tej techniki. W artykule przedstawione są innowacyjne sorbenty...
-
Oporność wielolekowa grzybów
PublicationOporność grzybów patogennych na naturalne oraz syntetyczne chemoterapeutyki staje się coraz większym wyzwaniem współczesnej terapii. W klinikach pojawiają się z narastającą częstotliwością patogenne drożdżaki i grzyby filamentujące, oporne na większośćstosowanych leków. Spośród wielu typów oporności grzybów najgroźniejszym wydaje się oporność wielolekowa. Wśród mechanizmów, które leżą u podstaw tej oporności, za najważniejszy należy...
-
Obróbka lignocelulozy - pierwszy etap zielonej energii, chemii wraz z wodorem
PublicationLignoceluloza jest podstawowym budulcem ścian komórkowych roślin; jest materiałem szeroko dostępnym i bardzo złożonym. Powszechna dostępność lignocelulozy jak i wysoka zawartość węglowodanów sprawia, że jest obiecującym materiałem do wykorzystania w ciemnej fermentacji, w zielonej chemii i energii. Podstawowym problemem lignocelulozy jest jej złożoność (składa się głównie z ligniny, celulozy, hemicelulozy)....
-
Nowe substancje psychoaktywne - nowe wyzwania analityczne
PublicationNowe substancje psychoaktywne stanowią poważny problem ekonomiczno-społeczny i zdrowotny ze względu na swoje właściwości psychoaktywne oraz uzależniające. Niejednokrotnie zdarza się, że właściwości fizykochemiczne oraz wpływ na organizm człowieka związków z grupy NPS nie są zbadane zanim trafią do nielegalnego obrotu. Wśród substancji należących do NPS wyróżnia się takie grupy chemiczne jak: syntetyczne kannabinoidy, katynony,...
-
Hanna Staroszczyk dr hab. inż.
PeopleAbsolwentka Wydziału Inżynierii i Technologii Chemicznej Politechniki Krakowskiej, od 2007 roku pracuje w Katedrze Chemii, Technologii i Biotechnologii Żywności Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej. Pracowała w Politechnice Krakowskiej, Akademii Rolniczej w Krakowie, Institute of Food Research w Norwich, Academia Sinica w Tajpej oraz University of Arkansas w Fayetteville. W 2013 roku uzyskała stopień doktora habilitowanego...
-
TspGWI, a thermophilic class-IIS restriction endonuclease from Thermus sp.,recognizes novel asymmetric sequence 5´-ACGGA(N11/9)-3
PublicationA novel prototype class-IIS restriction endonuclease, TspGWI, was isolated from the thermophilic bacterium Thermus sp. GW. The recognition sequence and cleavage positions have been established: TspGWI recognizes the non-palindromic 5-bp sequence 5′-ACGGA-3′ and cleaves the DNA 11 and 9 nt downstream in the top and bottom strand, respectively. In addition, an accompanying endonuclease, TspGWII, an isoschizomer of Pst I, was found...
-
Analysis and characterization of coordination compounds by resonance Raman spectroscopy
PublicationResonance Raman spectroscopy has become a powerful tool to study excited-state geometries, excited-state charge distributions and photoinduced reaction dynamics in coordination compounds. Due to their rich photophysical properties coordination compounds are utilized for a variety of applications ranging from DNA sensing to photocatalysis. This review features recent applications of various resonance Raman scattering techniques...
-
H2O˙+ and OH+ reactivity versus furan: experimental low energy absolute cross sections for modeling radiation damage
PublicationRadiotherapy is one of the most widespread and efficient strategies to fight malignant tumors. Despite its broad application, the mechanisms of radiation-DNA interaction are still under investigation. Theoretical models to predict the effects of a particular delivered dose are still in their infancy due to the difficulty of simulating a real cell environment, as well as the inclusion of a large variety of secondary processes. This...
-
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganisms Based on the Use of a Class IIS Restriction Enzyme and Ligation Mediated PCR
PublicationThis study details and examines a novel Ligation-Mediated - Polymerase Chain Reaction (LM-PCR) method. Named the LM-PCR/Shifter, it relies on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base, 5' overhangs, this being the Shifter, and the ligation of appropriate oligonucleotide adapters. A sequence of 4-base, 5' overhangs of the adapter and a 4-base sequence of the 3' end of the primer(s)...
-
From tryptophan to novel mitochondria-disruptive agent, synthesis and biological evaluation of 1,2,3,6-tetrasubstituted carbazoles
PublicationMitochondrial targeting plays an important role in anticancer therapy. The Mn(III)-promoted cyclization of 5- (1H-indol-3-yl)-3-oxopentanoic acid allow to obtain novel substituted carbazole derivatives that can act as mitochondria-disruptive agents. The starting materials used for the synthesis of these new aminocarbazoles are oxopentanoate derivatives of tryptophan. The scope and limitation of this method of synthesis are determined...
-
EASY ACCESS TOOL FOR SMALL INTERFERING RNA (siRNA) DATA
PublicationFor many decades it was an accepted dogma of molecular genetics that the expression of genes is a “one-way-road” leading only in one direction from DNA to RNA to proteins. Recent discoveries in modern molecular genetics have challenged this dogma showing that specific RNA molecules play a central role in controlling the activity of genes by changing the structure of DNA sequences, targeting other RNAs for degradation or blocking...
-
Palindromic carbazole derivatives: unveiling their antiproliferative effect via topoisomerase II catalytic inhibition and apoptosis induction
PublicationHuman DNA topoisomerases are essential for crucial cellular processes, including DNA replication, transcription, chromatin condensation, and maintenance of its structure. One of the significant strategies employed in cancer treatment involves the inhibition of a specific type of topoisomerase, known as topoisomerase II (Topo II). Carbazole derivatives, recognised for their varied biological activities, have recently become a significant...
-
Indukcja apoptozy w komórkach białaczek ludzkich molt4 i hl60 przez acyloksytriazoloakrydony - nową grupe związków o właściwościach przeciwnowotworowych
PublicationWykazazno, że acyloksytriazoloakrydony, podobnie jak badane wcześniej triazoloakrydony, indukują apoptozę w komórkach białaczek ludzkich MOLT4 i HL60 w stężeniach biologicznie istotnych, odpowiadających wartościom EC90 i EC80. Zjawisko apotozy zbadano w oparciu o zmiany morfologiczne w komórkach (ciałka apoptotyczne), międzynukleosomalną fragmentację DNA, zmiany w budowie błony cytoplazmatycznej, spadek mitochondrialnego potencjału...
-
Electron ionization and low energy electron attachment to molecules of biological interest
PublicationEthylenediaminetetraacetic acid (EDTA) and 2-amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediol (TRIS) were investigated by electron impact ionization and low energy electron attachment. Both compounds are components of biological buffers and often are used as DNA stabilizers in irradiation studies. hus it is of a great importance to understand their potential interactions with radiation. Our results revealed that at least one of them, EDTA, may...
-
Induction of G2/M phase arrest and apoptosis of human leukemia cells by potent antitumor triazoloacridinone C-1305
PublicationWykazaliśmy, że pochodna triazoloakrydonu C-1305 w stężeniach biologicznie istotnych indukuje blok cyklu komórkowego w fazie G2/M i apoptozę w komórkach białaczek ludzkich MOLT4 i HL60. Zjawisko apoptozy zostało określone na podstawie charakterystycznych zmian morfologicznych jak i biochemicznych tj. fragmentacji DNA, aktywacji kaspazy 3, cięcia PARP, spadku potencjału mitochondrialnego i ATP oraz eksternalizacji fosfatydyloseryny.
-
Electron ionization and low energy electron attachment to molecules of biological interest
PublicationEthylenediaminetetraacetic acid (EDTA) and 2-amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediol (TRIS) were investigated by electron impact ionization and low energy electron attachment. Both compounds are components of biological buffers and often are used as DNA stabilizers in irradiation studies. hus it is of a great importance to understand their potential interactions with radiation. Our results revealed that at least one of them, EDTA, may...
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069389211]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069383311]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069389741]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069382641]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069386301]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069385851]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069389141]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Squamous cell carcinoma, keratinizing, NOS - Unknown, 62 - Tissue image [3300730069386931]
Open Research DataThis is the histopathological image of FLOOR OF MOUTH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Cardinal regenerative features of the MRL mouse
PublicationIn this review, we discuss recent studies relating to major features of adult MRL mouse biology that contribute to the regenerative responses seen. These include an increased inflammatory cell profile, a unique glycolytic metabolic state typically found during embryogenesis, and a cell cycle phenotype of DNA damage and G2/M arrest. These traits have been found in other mammalian and non-mammalian regenerative systems. How these...
-
Seafloor backscattering: numerical simulation vs. filter theory approach.
PublicationPrzedstawiono model opisujący rozpraszanie sygnału akustycznego na nierównomiernej, regularnie sfalowanej powierzchni dna morskiego jako filtr liniowy z odpowiedzią impulsową o zmieniającej się w czasie chwilowej dominującej częstotliwości. Porównano przewidywania modelu z wynikami otrzymanymi w wyniku złożonych obliczeniowo symulacji numerycznych opartych na fizycznym modelu zjawiska wykorzystującym aproksymację Kirchhoffa. Wstępnie...
-
Analysis of a gene expression model
PublicationWe study a mathematical model of gene transcription and protein synthesis with negative feedback. We consider a system of equations taking into account the number of active binding sites, the way in which dimers bind to DNA and time delay in translation process. For a simplified model that consist of three ordinary differential equations with time delay we derive conditions for stability of the positive steady state and for the...
-
Diagnostic Accuracy of Liquid Biopsy in Endometrial Cancer
PublicationBackground: Liquid biopsy is a minimally invasive collection of a patient body fluid sample. In oncology, they offer several advantages compared to traditional tissue biopsies. However, the potential of this method in endometrial cancer (EC) remains poorly explored. We studied the utility of tumor educated platelets (TEPs) and circulating tumor DNA (ctDNA) for preoperative EC diagnosis, including histology determination. Methods:...