Filters
total: 4716
filtered: 3771
-
Catalog
- Publications 3771 available results
- Journals 163 available results
- Conferences 24 available results
- People 87 available results
- Projects 22 available results
- Research Teams 8 available results
- e-Learning Courses 130 available results
- Events 7 available results
- Open Research Data 504 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: NEURON DYNAMICS
-
Ionic transport in silica xerogels investigated by dynamic current voltagecharacteristics.
PublicationPodano wstępne rezultaty badania transportu ujemnych jonów w kserożelach Si02 w warunkach wysokiego gradientu temperatury w próbce, wywołanego jej ekstremalnie niską przewodnością cieplną. Uzyskane charakterystyki pozostają w zgodzie z przewidywaniami teoretycznymi. Na ich podstawie określono znak jonów, ich ruchliwość i energię aktywacji.
-
DYNAMIC POSITIONING CAPABILITY ASSESSMENT BASED ON OPTIMAL THRUST ALLOCATION
PublicationThe article presents an efficient method of optimal thrust allocation over the actuators in a dynamically positioned ship, according to the DNV-ST-0111 standard, Level 1. The optimisation task is approximated to a convex problem with linear constraints and mathematically formulated as quadratic programming. The case study is being used to illustrate the use of the proposed approach in assessing the DP capability of a rescue ship....
-
Ship Dynamic Positioning Based on Nonlinear Model Predictive Control
PublicationThe presented work explores the simulation test results of using nonlinear model predictive control algorithm for ship dynamic positioning. In the optimization task, a goal function with a penalty was proposed with a variable prediction step. The results of the proposed control algorithm were compared with backstepping and PID. The effect of estimation accuracy on the control quality with the implemented algorithms was investigated....
-
Understanding homogenous nucleation: the recent phenomenological and molecular dynamic approaches
PublicationPraca przedstawia dwa podejścia do problemu homogenicznej nukleacji. Pierwsze jest podejściem fenomenologicznym. Nukleacja jest tu rozumiana jako wzrost kropel krytycznych, które po przejściu określonego wymiaru, warunku równowagi termodynamicznej, mają tendencje do wzrostu. W tym podejściu problem wzrostu kropel oraz problem populacji kropel jest określany poprzez parametry makroskopowe. Przedstawiono nowe rozwiązania uzyskane...
-
Evaluation of pitting corrosion by means of dynamic electrochemical impedance spectroscopy.
PublicationPrzeprowadzono badania stali stopowej 304L metodą dynamicznej elektrochemicznej spektroskopii impedancyjnej w warunkach liniowo zmieniającego się potencjału. Określono ogólny schemat układu elektrycznego dla elektrody ulegającej korozji. Przeprowadzone badania pozwalają na jednoczesne badanie zachowania się stali stopowej w stanie pasywnym, podczas stanu przejściowego (metastabilne tworzenie się i repasywacja wżerów) oraz w stanie...
-
The dynamic analysisi of cracked Thimoshenko beam by the spectral element method.
PublicationW pracy przedstawiono model belli Timoshenko z pęknięciem poprzecznym oparty o metodę elementów spektralnych. Przedstawiono wyniki propagacji fali sprężystej i jej interakcję z pęknięciem.
-
Application of the dynamic EIS to investigation of transport within organic coatings
PublicationW pracy przedstawiono wyniki badań nad gwałtownym niszczeniem organicznych powłok ochronnych. Zastosowano technikę Dynamicznej Elektrochemicznej Spektroskopii Impedancyjnej (DEIS). Przez 60 sekund powłoka poliwinylowa poddawana była działaniu chlorku metylenu. W tym czasie rejestrowano chwilowe widma impedancyjne, co pozwoliło na prześledzenie dynamiki procesu degradacji powłoki. Potwierdzono przydatność techniki DEIS w badaniu...
-
Appraisement of modifications in dynamic routing protocols to support the IPng Protocol
PublicationW pracy, biorąc pod uwagę dynamiczny proces migracji sieci IPv4 do nowej wersji protokołu IP, przedstawiono konieczność realizacji w Internecie nowych protokołów routingu dynamicznego lub adaptacji już istniejących do nowego protokołu IPng. W artykule przedstawiono sposoby dostosowania protokołów routingu dynamicznego RIP, OSPF, BGP do nowego protokołu IP. Oceniono wpływ w/w dostosowywania na zbieżność i skalowalność protokołów...
-
Validation of dynamic electrochemical impedance spectrograms using autocorrelation function
PublicationValidation of impedance data is essential for checking the reliability of experimental data. Kramers – Kronig transformation is used to verify data obtained from classical Electrochemical Impedance Spectroscopy (EIS) measurements. Data obtained from Dynamic Electrochemical Impedance Spectroscopy (DEIS) could be validated in the same way, but in this case, there is no information about internal consistency between every single spectrum...
-
Application of time-frequency methods for analysis of dynamic silo flow
PublicationW artykule przedstawiono możliwość stosowania metod czasowo-częstotliwościowych w analizie dynamicznego przepływu materiału sypkiego w silosie. W pracy omówiono wyniki FT (Fourier Transform), STFT (Short Time Fourier Transform) oraz WT (Wavelet Transform)
-
Dynamic hand-written signature verification using a matched filter
PublicationW pracy zaproponowano nowe podejście do weryfikacji dynamicznego podpisu odręcznego. Podpis jest traktowany jako sygnał telekomunikacyjny, który można wykryć i zwerfikować za pomocą odbiornika optymalnego z filtrem dopasowanym. Wymaga to uprzedniej unifikacji i normalizacji parametrów biernych podpisu aktualnego, jak również podpisów zgromadzonych w bazie, celem ułatwienia podejmowania decyzji. Normalizację długości podpisu uzyskano...
-
Experimental study and numerical simulation of the dynamic penetration into dry clay
PublicationTests of dry clay were carried out in a uniaxial stress state using the experimental setup which implements the split Hopkinson pressure bar method. Based on the results of these experiments, the compressive strength of clay was determined as an important element of S.S. Grigoryan’s model of the soil medium. In addition, the parameters of this model are determined from the results of experiments using the modified Kolsky method...
-
Optical excitation methods in active dynamic thermography in medical diagnostics.
PublicationArtykuł zawiera opis metod pobudzania cieplnego badanych obszarów ciała ludzkiego w technice aktywnej termografii dynamicznej. Jako źródła pobudzenia cieplnego mogą być stosowane lampy podczerwieni, lampy halogenowe dużej mocy, a także lasery. W artykule opisano również algorytmy obliczeń obrazów parametrycznych.
-
On fatigue safety of metallic elements under static and dynamic loads.
PublicationGłównym celem monografii było wyznaczenie współczynników bezpieczeństwa i kryteriów projektowych z uwzględnieniem wpływu obciążeń statycznych oraz naprężeń średnich i resztowych na wytrzymałość zmęczeniową przy obciążeniach okresowych i/lub stochastycznych. Uzyskano to za pomocą wyznaczonych naprężeń równoważnych i równania Soderberga. Otrzymano kryteria w postaci zamkniętej i zgodnej z wzorem Milesa na trwałość zmęczeniową oraz...
-
Computational modelling of concrete behavior under static and dynamic conditions
PublicationW artykule zaproponowano wyniki obliczeń MES dla betonu podczas dynamicznego obciążenia. Przyjęto model sprężysto-plastyczno-lepki z nielokalnym osłabieniem. Obliczenia MES dla elementów betonowych pod obciążeniem dynamicznym o różnej prędkości obciążenia porównano bezpośrednio z doświadczeniami.
-
A Reference Point Approach to Bi-Objective Dynamic Portfolio Optimization
Publication -
Adsorption dynamics of chlorinated hydrocarbons from multi-component aqueous solution onto activated carbon
Publication -
UNRES server for physics-based coarse-grained simulations and prediction of protein structure, dynamics and thermodynamics
Publication -
Combining Computational Fluid Dynamics with a Biokinetic Model for Predicting Ammonia and Phosphate Behavior in Aeration Tanks
PublicationThe aim of this study was to use computational fluid dynamics for predicting the behavior of reactive pollutants (ammonia and phosphate) in the aerobic zone of the bioreactor located at the Wschod wastewater treatment plant in Gdansk, Poland. The one-dimensional advection-dispersion equation was combined with simple biokinetic models incorporating the Monod-type expressions as source terms for the two pollutants. The problem was...
-
Molecular dynamics simulation of human neurohypophyseal hormone receptors complexed with oxytocin—modeling of an activated state
Publication -
Orientational Order and Dynamics of Nematic Multipodes Based on Carbosilazane Cores Using Optical and Dielectric Spectroscopy
Publication -
Editorial: smart modeling support for managing complexities and dynamics of knowledge-based systems-part 1
Publication -
Band structure, Born effective charges, and lattice dynamics of CuInS2 from ab initio calculations
Publication -
Formation of Protein Networks between Mucins: Molecular Dynamics Study Based on the Interaction Energy of the System
PublicationMolecular dynamics simulations have been performed for a model aqueous solution of mucin. As mucin is a central part of lubricin, a key component of synovial fluid, we investigate its ability to form cross-linked networks. Such network formation could be of major importance for the viscoelastic properties of the soft-matter system and crucial for understanding the lubrication mechanism in articular cartilage. Thus,the inter- and...
-
Pre‐exascale HPC approaches for molecular dynamics simulations. Covid‐19 research: A use case
PublicationExascale computing has been a dream for ages and is close to becoming a reality that will impact how molecular simulations are being performed, as well as the quantity and quality of the information derived for them. We review how the biomolecular simulations field is anticipating these new architectures, making emphasis on recent work from groups in the BioExcel Center of Excellence for High Performance Computing. We exemplified...
-
Solvent Exchange around Aqueous Zn(II) from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations
PublicationHydrated zinc(II) cations, due to their importance in biological systems, are the subject of ongoing research concerning their hydration shell structure and dynamics. Here, ab initio molecular dynamics (AIMD) simulations are used to study solvent exchange events around aqueous Zn2+, for which observation in detail is possible owing to the considerable length of the generated trajectory. While the hexacoordinated Zn(H2O)62+ is the...
-
Improvements and new functionalities of UNRES server for coarse-grained modeling of protein structure, dynamics, and interactions
PublicationIn this paper we report the improvements and extensions of the UNRES server (https://unres-server.chem.ug.edu.pl) for physics-based simulations with the coarse-grained UNRES model of polypeptide chains. The improvements include the replacement of the old code with the recently optimized one and adding the recent scale-consistent variant of the UNRES force field, which performs better in the modeling of proteins with the β and the...
-
The importance of the shape of the protein–water interface of a kinesin motor domain for dynamics of the surface atoms of the protein
PublicationA single kinesin motor domain immersed in water has been investigated using molecular dynamics. It has been found that local properties of water in the solvation shell change along with the nature of the neighboring protein surface. However, a detailed analysis leads to the conclusion that the geometrical features of hydrogen bonds and overall structure of kinesin hydration water are not very different from bulk water. The local...
-
The importance of the shape of the protein-water interface of a kinesin motor domain for dynamics of the surface atoms of the protein
PublicationSingle kinesin motor domain immersed in water has been investigated using molecular dynamics. It has been found that local properties of water in solvation shell change along with the nature of neighboring protein surface. However, a detailed analysis leads to the conclusion that the geometrical features of hydrogen bonds and overall structure of kinesin hydration water is not very different from bulk water. The local values of...
-
Theoretical Investigation of the Electron-Transfer Dynamics and Photodegradation Pathways in a Hydrogen-Evolving Ruthenium-Palladium Photocatalyst
PublicationTime-dependent density functional theory calcula- tions combinedwith the Marcus theory of electron transfer (ET) were app lied on the molecular photocatalys t [(tbbpy) 2 Ru(tpph z)PdC l 2 ] 2 + in order to elucidate thelight-in- duced relaxation pathways populated upon excitation in the longer wavelength range of its absorption spectrum. The computational resultsshow that after the initial excitation, metal (Ru) to ligand (tpphz)chargetransfer...
-
Anion–water interactions of weakly hydrated anions: molecular dynamics simulations of aqueous NaBF4 and NaPF6
PublicationIn aqueous ionic solutions, both the structure and the dynamics of water are altered dramatically with respect to the pure solvent. The emergence of novel experimental techniques makes these changes accessible to detailed investigations. At the same time, computational studies deliver unique possibilities for the interpretation of the experimental data at the molecular level. Here, using molecular dynamics simulations, we demonstrate...
-
Aerodynamic shape optimization by variable-fidelity computational fluid dynamics models: a review of recent progress
PublicationA brief review of some recent variable-fidelity aerodynamic shape optimization methods is presented.We discuss three techniques that—by exploiting information embedded in low-fidelity computationalfluid dynamics (CFD) models—are able to yield a satisfactory design at a low computational cost, usu-ally corresponding to a few evaluations of the original, high-fidelity CFD model to be optimized. Thespecific techniques considered here...
-
Molecular Dynamics to Predict Cryo-EM: Capturing Transitions and Short-Lived Conformational States of Biomolecules
PublicationSingle-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) has revolutionized the field of the structural biology, providing an access to the atomic resolution structures of large biomolecular complexes in their near-native environment. Today’s cryo-EM maps can frequently reach the atomic-level resolution, while often containing a range of resolutions, with conformationally variable regions obtained at 6 Å or worse. Low resolution...
-
Encapsulation of an anticancer drug Isatin inside a host nano-vehicle SWCNT: a molecular dynamics simulation
PublicationThe use of carbon nanotubes as anticancer drug delivery cargo systems is a promising modality as they are able to perforate cellular membranes and transport the carried therapeutic molecules into the cellular components. Our work describes the encapsulation process of a common anticancer drug, Isatin (1H-indole-2,3-dione) as a guest molecule, in a capped single-walled carbon nanotube (SWCNT) host with chirality of (10,10). The...
-
Computational Fluid Dynamics Simulation of Gas–Liquid Multiphase Flow in T-junction for CO2 Separation
PublicationThe article presents the results of a computational fluid dynamics (CFD) analysis of gas-liquid multiphase flow. The simulation was conducted using CFD code and the Euler–Euler approach. The presented study relates to the non–reactive, steady-state, turbulent flow of water and carbon dioxide mixture in a 3D pipe. Separation phenomenon between phases is observed. The solution was obtained using a mixture model. Different values...
-
On dynamics of flexible branched shell structures undergoing large overall motion using finite elements
PublicationZaprezentowano autorski algorytm do analizy dynamicznej powłok sprężystych oparty na niejawnym schemacie Newmarka. Rozważania dotyczą całkowania po czasie dynamicznych równań ruchu sformułowanych w ramach nieliniowej sześcioparametrowej teorii powłok. Opracowanie zawiera pewne elementy analizy statycznej, poprzedzającej badania dynamiczne. Przykłady numeryczne prezentują zastosowanie algorytmu stanowią podstawową część pracy.
-
Molecular dynamics simulation and MM-PBSA analysis of Oxytricha nova TEBP ternary complex with ssDNA
PublicationPraca dotyczy badań metodami chemii obliczeniowej właściwości elektrostatycznych i termodynamicznych kompleksu telomerowego białka TEBP pochodzącego z organizmu Oxytricha z jednoniciowym telomerowym DNA (ssDNA).
-
Free volume in physical absorption of carbon dioxide in ionic liquids: Molecular dynamics supported modeling
PublicationUnderstanding the mechanisms underlying the carbon dioxide (CO2) absorption in ionic liquids (ILs) is the key to their efficient utilization in industrial flue gas treatment. One of the parameters considered substantially important in the process is the Free Volume. In this study, the Fractional Free Volume (FFV) of 73 ILs was calculated using Molecular Dynamics (MD). A quantitative Structure-Property Relationship (QSPR) study...
-
Silica In Silico: A Molecular Dynamics Characterization of the Early Stages of Protein Embedding for Atom Probe Tomography
PublicationA novel procedure for the application of atom probe tomography (APT) to the structural analysis of biological systems, has been recently proposed, whereby the specimen is embedded by a silica matrix and ablated by a pulsed laser source. Such a technique, requires that the silica primer be properly inert and bio-compatible, keeping the native structural features of the system at hand, while condensing into an amorphous, glass-like...
-
Mechanical Properties of Twisted Carbon Nanotube Bundles with Carbon Linkers from Molecular Dynamics Simulations
PublicationThe manufacturing of high-modulus, high-strength fibers is of paramount importance for real-world, high-end applications. In this respect, carbon nanotubes represent the ideal candidates for realizing such fibers. However, their remarkable mechanical performance is difficult to bring up to the macroscale, due to the low load transfer within the fiber. A strategy to increase such load transfer is the introduction of chemical linkers...
-
Early stages of condensation from the gaseous phase in a H2O-N2 system: a molecular dynamics study.
PublicationW pracy przedstawiono wyniki symulacji wczesnych etapów kondensacji z fazy gazowej w układzie xH2O (1-x)N2. Przeanalizowano całkowitą liczbę klastrów, średni rozmiar klastra i rozmiar klastra maksymalnego w funkcji czasu.
-
Degradation of a nano-cutting tool: an MD simulation
PublicationW pracy przedstawiono wyniki symulacji wielokrotnego oddziaływania realistycznie ukształtowanego ostrza tnącego z modelowym, nieskończenie twardym ziarnem, przy zastosowaniu metody dynamiki molekularnej. Ostrze składało się z kilkuset tysięcy atomów metalu fcc, traktowanego za pomocą potencjału Suttona-Chena, przesuwane było ze stałą prędkością 20 m/s. Obserwowane deformacje plastyczne pojawiające się na skutek kontaktu ostrza...
-
Pose-Invariant Face Detection by Replacing Deep Neurons with Capsules for Thermal Imagery in Telemedicine
PublicationAbstract— The aim of this work was to examine the potential of thermal imaging as a cost-effective tool for convenient, non- intrusive remote monitoring of elderly people in different possible head orientations, without imposing specific behavior on users, e.g. looking toward the camera. Illumination and pose invariant head tracking is important for many medical applications as it can provide information, e.g. about vital signs, sensory...
-
An adaptive neuro-fuzzy model of a re-heat two-stage adsorption chiller
Publication -
Connection matrix theory for discrete dynamical systems
PublicationIn [C] and [F1] the connection matrix theory for Morse decomposition is developedin the case of continuous dynamical systems. Our purpose is to study the case of discrete timedynamical systems.
-
Connection matrix theory for discrete dynamical systems
Publication -
Dynamika piły tarczowej i wrzeciona przecinarki
PublicationOpisano metodykę określania właściwości dynamicznych układu wrzecionowego pilarki tarczowej w sposób eksperymentalny. Opisana metoda pozwala wykazać, że w określonych przypadkach o zachowaniu piły decydującą rolę może odgrywać wrzeciono pilarki i sposób jego napędu.
-
Zatrudnienie i bezrobocie a dynamika wzrostu gospodarczego
PublicationW pierwszej części artykułu przedstawiono koncepcję teoretyczną opisującaą związki pomiędzy dynamiką wzrostu produktu krajowego a stopą wzrostu zatrudnienia i stopą bezrobocia w warunkach zmian nakładów kapitałowych i postępu technicznego. W następnej kolejności przedstawiono model teoretyczny opisujący te związki i sformułowano założenia leżące u jego podstaw. W końcowej części artykułu, na podstawie informacji kwartalnych z lat...
-
Dynamical properties of ordered Fe–Pt alloys
Publication -
Wybrane elementy nieliniowej dynamiki struktur kratowych
PublicationW pracy jest dyskutowany problem nieliniowej dynamiki struktur kratowych. Zastosowano stacjonarny opis Lagrange'a (ang. Total Lagrange), pokazano silne i słabe sformułowanie dla pręta kratowego, jego aplikację do MES. W zakresie całkowania równań ruchu przedstawiono metodę Newmarka i metodę-a dla problemów liniowych i nieliniowych. Załączony przykład numeryczny ilustruje cechy przedstawionych metod.