Filters
total: 497
filtered: 330
-
Catalog
Chosen catalog filters
Search results for: ECOLI
-
Phenethyl Isothiocyanate Inhibits Shiga Toxin Production in Enterohemorrhagic Escherichia coli by Stringent Response Induction
Publication -
Characterization of immobilized Escherichia coli cells transformed by β-galactosidase gene from Pyrococcus woesei
PublicationThermostable β-galactosidase from Escherichia coli transformant containing theenzyme gene from Pyrococcus woesei was immobilized on alginate gel.The benefits of using whole bacterial cells not only exclude expensive, laborious proteinisolation and purification but also stabilize enzymes by cytosol components. Increase inproductivity of enzyme can be achieved by cells permeabilization. To increase permeability ofcytoplasmic membrane...
-
High prevalence of Escherichia coli belonging to the B2+D phylogenetic group in inflammatory bowel disease
PublicationBACKGROUND: It is not clear which species of bacteria may be involved in inflammatory bowel disease (IBD). One way of determining which bacteria might be likely candidates is to use culture-independent methods to identify microorganisms that are present in diseased tissues but not in controls. AIMS: (1) To assess the diversity of microbial communities of biopsy tissue using culture-independent methods; (2) to culture the bacteria...
-
Identification of Substrates of Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl Cis/Trans Isomerases and Their Collective Essentiality in Escherichia Coli
PublicationProtein folding often requires molecular chaperones and folding catalysts, such as peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs). The Escherichia coli cytoplasm contains six well-known PPIs, although a requirement of their PPIase activity, the identity of their substrates and relative enzymatic contribution is unknown. Thus, strains lacking all periplasmic and one of the cytoplasmic PPIs were constructed. Measurement of their PPIase...
-
Role of the disulfide bond in stabilizing and folding of the fimbrial protein DraE from uropathogenic Escherichia coli
PublicationDr fimbriae are homopolymeric adhesive organelles of uropathogenic Escherichia coli composed of DraE subunits, responsible for the attachment to host cells. These structures are characterized by enormously high stability resulting from the structural properties of an Ig-like fold of DraE. One feature of DraE and other fimbrial subunits that makes them peculiar among Ig-like domain-containing proteins is a conserved disulfide bond...
-
Phylogenetic relationship and antimicrobial resistance in Escherichia coli isolated from the Reda River and the Oliwski Stream, Northern Poland = Lekooporność i przynależność filogenetyczna szczepów Escherichia Coli izolowanych z rzeki Redy i Potoku Oliwskiego
PublicationThe high abundance of fecal bacteria in surface water is usually related to poor agricultural practice, pollution caused by domesticated and wild animals as well as with septic tank failures. Identification of fecal contamination sources seems to be crucial in order to effectively estimate the inherent risk. In this study, the phylogenetic relationship of 30 isolates of E. coli, originated from surface water, was estimated by employing...
-
CFD COUPLING OF VOF MODEL WITH ARRHENIUS EQUATION FOR ANALYSIS OF LASER-INDUCED THERMAL DEACTIVATION OF E. COLI
PublicationUnderstanding bacterial deactivation at the micro-scale, particularly with E. coli, is crucial for advancing microbiology and has promising applications in biomedical research. In this research contribution, we investigate the thermal inactivation of E. coli bacteria using gold nanoparticles irradiated by a green 1-W laser within a microfluidic chamber. The microfluidic device comprises a fluidic chamber filled with a thin film...
-
The cell surface protein Ag43 facilitates phage infection of Escherichia coli in the presence of bile salts and carbohydrates
Publication -
Analysis of the Link between the Redox State and Enzymatic Activity of the HtrA (DegP) Protein from Escherichia coli
Publication -
Genetic response to metabolic fluctuations: correlation between central carbon metabolism and DNA replication in Escherichia coli
Publication -
Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital
PublicationZakażenia układu moczowego (UTIs - ang. urinary track infections) są jedną z najczęstszy infekcji, za które w 85% przypadków odpowiedzialne są bakterie Escherichia coli. Infekcje układu moczowego mogą prowadzić do groźnych powikłań m. in. odmiedniczkowego zapalenia nerek. Śmiertelność wśród tej grupy pacjentów wynosi 1-3%. Zakażenia układu moczowego występują również u ok. 7% kobiet ciężarnych. W pracy przebadano 82 szczepy E....
-
Increased Levels of (p)ppGpp Correlate with Virulence and Biofilm Formation, but Not with Growth, in Strains of Uropathogenic Escherichia coli
Publication -
Tetracycline and ampicillin resistance of Escherichia coli strains of surface water origin: the potential for horizontal transfer of resistance genes = Oporność na tetracyklinę i ampicylinę szczepów Escherichia Coli wyizolowanych z wody powierzchniowej : możliwość horyzontalnego przenoszenia genów oporności
PublicationThe aim of this preliminary study was to assess the occurrence and molecular diversity of tetracycline and ampicillin resistance genes carried by Escherichia coli present in surface water. Bacterial strains were isolated from two watercourses (the Reda River and the Oliwski Stream) that influence the quality of coastal waters in the Gdańsk Bay (Northern Poland) by direct discharge. The bacterial drug susceptibility, tested against...
-
A freeze-thaw method for desintegration of Escherichia coli cells producing T7 lysozyme used in pBAD expression systems
PublicationPlazmid pLysN zawierający gen kodujący lizozym T7 pod kontrolą promotora lac został skonstruowany w celu ułatwienia dezintegracji komórek po ekspresji rekombinantowych białek w systemach ekspresji indukowanych arabinozą. Użyteczność plazmidu została przetestowana w komórkach Escherichia coli TOP10 i E. coli LMG194, niosących plazmid pBADMHADgeSSB, zawierający gen kodujący białko SSB Deinococcus geothermalis pod kontrolą promotora...
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublicationWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
Hydrolytic and transgalactosylation activities of immobilized Escherichia coli cells transformed by β-galactosidase gene from Pyrococcus woesei
PublicationPrzedstawiono wyniki badań dotyczących skuteczności transformacji laktozy katalizowanej immobilizowanymi w żelu alginianowym rekombinantowymi komórkami Escherichia coli, transformowanymi genem b-galaktozydazy z Pyrococcus woesei. Wykazano, że aktywność hydrolityczna rekombinantowych komórek wzrasta o 35% po permeabilizacji w środowisku 40% etanolu. Optymalna temperatura i pH katalizowanej reakcji wynosiły odpowiednio 98C i 5,4....
-
The role of uropathogenic Escherichia coli adhesive molecules in inflammatory response- comparative study on immunocompetent hosts and kidney recipients
Publication -
High yield expression and single step purification of Toxoplasma gondii SAG1, GRA1, GRA7 antigens in Escherichia coli.
PublicationPraca przedstawia metodę uzyskiwania antygenów rekombinowanych Toxoplasmagondii o wysokiej czystości, które można zastosować w immunodiagnostyce. Antygeny T. gondii eksprymowane w komórkach E. coli zawierały polihistydynowedomeny fuzyjne na końcu N i C białka. Pozwalało to na jednoetapowe oczyszczanie białek metodą chromatografii metalopowinowactwa na złożu Ni2+ -IDA-Sepharose. Immunoreaktywność antygenów rekombinowanych...
-
Molecular and structural basis of inner core lipopolysaccharide alterations in Escherichia coli: incorporation of glucuronic acid and phosphoethanolamine in the heptose region.
PublicationIt is well established that lipopolysaccharide (LPS) often carries nonstoichiometric substitutions in lipid A and in the inner core. In this work, the molecular basis of inner core alterations and their physiological significance are addressed. A new inner core modification of LPS is described, which arises due to the addition of glucuronic acid on the third heptose with a concomitant loss of phosphate on the second heptose. This...
-
Identification of antigen Ag43 in uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains and defining its role in the pathogenesis of urinary tract infections
PublicationUrinary tract infections (UTIs) caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC) are among the most common bacterial infectious diseases in the developed world. The urovirulence of UPEC is mainly associated with the surface-exposed fimbrial adhesins and adhesins of the autotransporter (AT) family. The best studied of theses proteins is antigen 43 (Ag43) mediating cell aggregation, adhesion and biofilm development as the causes of...
-
Complementation studies of the DnaK–DnaJ–GrpE chaperone machineries from Vibrio harveyi and Escherichia coli, both in vivo and in vitro
Publication -
Functional Similarities and Differences of an Archaeal Hsp70(DnaK) Stress Protein Compared with its Homologue from the Bacterium Escherichia coli
Publication -
Construction, purification, and functional characterization of His-tagged Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase expressed in Escherichia coli
Publication -
Excess production of phage λ delayed early proteins under conditions supporting high Escherichia coli growth rates
Publication -
The LD loop as an important structural element required for transmission of the allosteric signal in the HtrA (DegP) protease from Escherichia coli
Publication -
Escherichia coli lipopolysaccharide may affect the endothelial barrier and IL‐10 expression of apolipoprotein B100‐pulsed dendritic cells
Publication -
Synthesis and transport studies of model dipeptides with modified n-terminal amino groups into e. coli k12 mutant strains
Publicationotrzymano na drodze syntezy chemicznej kilka modelowych dipeptydów zawierających n-terminalna guanidynę oraz betainę. zbadano transport tych peptydów do komorek e. coli k12, posiadających zróżnicowane systemy transportowe. wyniki badań potwierdziły brak transportu do komórek bakteryjnych z wykorzystaniem permeaz peptydowych. dodatnio naładowana i silnie polarna grupa aminowa uniemożliwia efektywny transport tych związków do komórek...
-
Wykorzystanie komórek Escherichia coli transformowanych genem termostabilnej beta-galaktozydazy z Pyrococcus woesei do wytwarzania galaktozylofruktozy
PublicationKomórki rekombinantowej Escherichia coli transformowane genem beta-galaktozydazy z Pyrococcus woesei wykorzystano jako biokatalizator syntezy galaktozylofruktozy. Największą aktywność syntezy wymienionego prebiotyku (7,6 g/L x godz)uzyskano w 80C przy pH 5,4, stosując jako substrat roztwór zawierający 10% laktozy i 20% fruktozy. Aktywność transgalaktozylacji nie ulegała istotnym zmianom podczas sześciu kolejnych szarż produkcyjnych.
-
Antibiotic resistance, virulence, and phylogenetic analysis of Escherichia coli strains isolated from free-living birds in human habitats
PublicationWild birds can be colonized by bacteria, which are often resistant to antibiotics and have various virulence profiles. The aim of this study was to analyze antibiotic resistance mechanisms and virulence profiles in relation to the phylogenetic group of E. coli strains that were isolated from the GI tract of wildfowl. Out of 241 faecal samples, presence of E. coli resistant to a cephalosporin (ESBL/AmpC) was estimated for 33 isolates...
-
Aktywność amylolityczna ciałek inkluzyjnych izolowanych z Escherichia coli BL21(DE3)pLysS transformowanej plazmidem pTYB2alfa-Amyl.
PublicationBadania ekspresji rekombinantowej alfa-amylazy izolowanej z Escherichia coli BL21(DE3)pLysS transformowanej plazmidem pTYB2alfa-Amyl wykazały, że około 49 % wytwarzanego enzymu występuje w postaci ciałek inkluzyjnych. Źródłem genu termostabilnej alfa-amylazy był szczep Pyrococcus woesei (DSM 3773). W celu uzyskania aktywnych białek z ciałek inkluzyjnych odwirowane komórki bakterii inkubowano w roztworze CaCl2 i po trawieniu lizozymem...
-
Letter to the Editor: Complete resonance assignments of the 'donor-strand' AfaD: The afimbrial invasin from Diffusely Adherent E. coli.
PublicationUstalono strukturę NMR rekombiantowego białka AfaD-dsc. Uzyskane wyniki są podstawą do badań rentgenograficznych struktury białek AfaD/DraD.
-
Dissection of σE‐dependent cell lysis in Escherichia coli: roles of RpoE regulators RseA, RseB and periplasmic folding catalyst PpiD
PublicationTo understand the mechanism of sigma(E)-dependent cell lysis, we examined the consequences of deletion derivatives of rpoE regulators rseA, rseB and rseC on sigma(E) transcription, on levels of free versus membrane-bound sigma(E) and on OMP-biogenesis limiting factor(s) that could impact cell lysis. RT-PCR showed that individual nonpolar DeltarseA and DeltarseB increased the rpoE expression to varying extents, with pronounced induction...
-
Drastically decreased transcription from CII-activated promoters is responsible for impaired lysogenization of the Escherichia coli rpoA341 mutant by bacteriophage λ
Publication -
Extracellular secretion of Pseudoalteromonas sp. cold-adapted esterase in Escherichia coli in the presence of Pseudoalteromonas sp. components of ABC transport system
PublicationEnzymy lipolityczne, głównie lipazy i esterazy, stanowią cenną grupę biokatalizatorów wykorzystywanych w przemyśle. Coraz większe zainteresowanie tą klasą enzymów sprawiło, że poszukuje się alternatywnych źródeł ich pozyskiwania. W celu zbadania wpływu białek transportu ABC Pseudoalteromonas sp. 643A na ekspresję genu, sekrecję i aktywność esterazy EstA z tego mikroorganizmu w systemie ekspresyjnym E. coli skonstruowano układ do...
-
Adaptowana do zimna esteraza Pseudoalteromonas sp. 643A - produkcja w systemach ekspresyjnych Escherichia coli, oczyszczanie i charakterystyka
Publication -
In vitro affinity of Deinococcus radiodurans MutS towards mismatched DNA exceeds that of its orthologues from Escherichia coli and Thermus thermophilus
PublicationThe mismatch binding protein MutS is responsible for the recognition of mispaired and unpaired bases, which is the initial step in DNA repair. Among the MutS proteins most extensively studied in vitro are those derived from Thermus thermophilus, Thermus aquaticus and Escherichia coli. Here, we present the first report on the in vitro examination of DNA mismatch binding activity of MutS protein from Deinococcus radiodurans and confront...
-
Structure-function analysis of decay-accelerating factor: identification ofresidues important for binding of the Escherichia coli Dr adhesin and complement regulation
PublicationZidentyfikowano ważne dla wiązania adhezyny Dr uropatogennych Escherichiacoli reszty aminokwasowe w ludzkim receptorze DAF SCR-3.
-
A five-year retrospective study shows increasing rates of antimicrobial drug resistance in Cabo Verde for both Staphylococcus aureus and Escherichia coli
Publication -
Escherichia coli Strains with Virulent Factors Typical for Uropathogens were Isolated from Sinuses from Patients with Chronic Rhinosinusitis—Case Report
Publication -
Fatal sepsis in a pregnant woman with pyelonephritis caused by Escherichia coli bearing Dr and P adhesins: diagnosis based on postmortem strain genotyping
PublicationW pracy został opisany pierwszy śmiertelny przypadek młodej kobiety w ciąży z powodu przewlekłego zapalenia odmiedniczkowego nerek spowodowany przez szczepy E. coli z fimbriami typu Dr + i P. Badania pośmiertne wykazały, że śmierć nastąpiła z powodu posocznicy do której doszło na skutek zakażenia szczepami E. coli Dr + . Odmiedniczkowe zapalenie nerek w ciąży jest związane z wieloma powikłaniami, w tym ograniczeniem wzrostu płodu,...
-
Multiple transcriptional factors regulate transcription of the rpoE gene in Escherichia coli under different growth conditions and when the lipopolysaccharide biosynthesis is defective.
PublicationThe RpoE sigma factor is essential for the viability of Escherichia coli. RpoE regulates extracytoplasmic functions including lipopolysaccharide (LPS) translocation and some of its non-stoichiometric modifications. Transcription of the rpoE gene is positively autoregulated by EσE and by unknown mechanisms that control the expression of its distally located promoter(s). Mapping of 5′ ends of rpoE mRNA identified five new transcriptional...
-
Biofilm bakteryjny uropatogennych szczepów E. coli Dr+ jako czynnik indukujący przewlekłość zakażeń dróg moczowych ograniczający ich leczenie
PublicationZakażenia dróg moczowych (ZUM) stanowią jedne z najczęściej występujących infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku miliony osób na świecie. Problematyka tych zakażeń wynika z ich przewlekłości i nawrotów, pomimo stosowania terapii antybiotykowej oraz ciągle wzrastającej lekooporności uropatogenów je wywołujących. Dominującym czynnikiem etiologicznym ZUM są uropatogenne szczepy E. coli (UPECs), wykazujące zdolność do adhezji,...
-
Escherichia coli Strains with Virulent Factors Typical for Uropathogens were Isolated from Sinuses from Patients with Chronic Rhinosinusitis—Case Report
PublicationEscherichia coli were isolated from three patients with chronic rhinosinusitis (CRS) by intraoperative sinus tissue biopsy. Taking into account the unusual replicative niche and previous treatment failures, it was decided to focus on the virulence and drug resistance of these bacteria. The strains turned out to be multi-sensitive, but the rich virulence factors profile of bacteria typical for phylogenetic group B2 deserved attention....
-
A five-year retrospective study shows increasing rates of antimicrobial drug resistance in Cabo Verde for both Staphylococcus aureus and Escherichia coli
PublicationObjectives Data on baseline drug resistance is important in informing future antimicrobial stewardship programs. So far, no data on the antimicrobial drug resistance of clinical isolates was available for the African archipelago of Cabo Verde. Methods We have performed a retrospective analysis over five-years (2013-17) of the antimicrombial drug susceptibility profiles of clinical isolates in the two main hospitals of Cabo Verde....
-
Intra-operative biopsy in chronic sinusitis detects pathogenic Escherichia coli that carry fimG/H, fyuA and agn43 genes coding biofilm formation
PublicationThe aim of this study was to investigate whether or not surgical biopsy of sinus tissue in chronic sinusitis, not responsive to treatment, would detect E. coli. We intended to evaluate E. coli virulence genes, therefore dispute the causal role of such an unusual microorganism in chronic sinusitis, as well as consider effective pathogen-targeted therapy. Patients with E. coli isolated by intra-operative puncture biopsy were included...
-
Discriminating macromolecular interactions based on an impedimetric fingerprint supported by multivariate data analysis for rapid and label-free Escherichia coli recognition in human urine
PublicationThis manuscript presents a novel approach to address the challenges of electrode fouling and highly complex electrode nanoarchitecture, which are primary concerns for biosensors operating in real environments. The proposed approach utilizes multiparametric impedance discriminant analysis (MIDA) to obtain a fingerprint of the macromolecular interactions on flat glassy carbon surfaces, achieved through self-organized, drop-cast,...
-
A Comparative Study on the Toxicity of Chlorides and Tri-tert-butoxysilanethiolates of Zinc(II), Cadmium(II) and Mercury(II) Towards Candida albicans and Escherichia coli.
PublicationMetale przejściowe, czyli cynk, kadm i rtęć należą do XII grupy układu okresowego. Cynk jako element strukturalny białek odgrywa zróżnicowaną rolę biologiczną i jest pierwiastkiem niezbędnym do zachowania funkcji życiowych. W odróżnieniu od niego kadm i rtęć są metalami wykazującymi działanie toksyczne i podejrzanymi o działanie rakotwórcze. Kadm w szkodliwy sposób wpływa na uprawy oraz organizm ludzki. Toksyczne działanie rtęci...
-
The combined effect of moderate pressure and chitosan on Escherichia coli and Staphylococcus aureus cells suspended in a buffer and on natural microflora of apple juice and minced pork
PublicationW pracy określono przeżywalność bakterii Escherichia coli i Staphylococcus aureus oraz naturalnej mikroflory soku jabłkowego i rozdrobnionego mięsa świńskiego po działaniu ciśnienia 193 MPa w temp. -20 C w obecności chitozanu. Stwierdzono, że traktowanie mikroorganizmów ciśnieniem w obecności chitozanu pozwala na przedłużenie trwałości badanych produktów przechowywanych w temperaturze chłodniczej o około 8-10 dni.
-
Molecular basis of essentiality of early critical steps in the lipopolysaccharide biogenesis in Escherichia coli K-12: requirement of MsbA, cardiolipin, LpxL, LpxM and GcvB
PublicationTo identify the physiological factors that limit the growth of Escherichia coli K-12 strains synthesizing minimal lipopolysaccharide (LPS), we describe the first construction of strains devoid of the entire waa locus and concomitantly lacking all three acyltransferases (LpxL/LpxM/LpxP), synthesizing minimal lipid IVA derivatives with a restricted ability to grow at around 21 °C. Suppressors restoring growth up to 37 °C of Δ(gmhD-waaA)...
-
Zimnolubna β-D-galaktozydaza Pseudoalteromonas sp. 22b - identyfikacja genu, klonowanie, ekspresja w komórkach Escherichia coli, oczyszczanie i charakterystyka.
Publication.