Filters
total: 25348
filtered: 20425
-
Catalog
- Publications 20425 available results
- Journals 51 available results
- Conferences 3 available results
- Publishing Houses 5 available results
- People 715 available results
- Inventions 102 available results
- Projects 277 available results
- Laboratories 18 available results
- Research Teams 43 available results
- Research Equipment 8 available results
- e-Learning Courses 1751 available results
- Events 593 available results
- Open Research Data 1357 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: RNA SEQUENCING
-
Substituent effect in theoretical ROA spectra
Publication -
Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting
PublicationPCR has become an essential tool in biological science. However, researchers often encounter problems with difficult targets, inhibitors accompanying the samples, or PCR trouble related to DNA polymerase. Therefore, PCR optimization is necessary to obtain better results. One solution is using modified DNA polymerases with desirable properties for the experiments. In this article, PCR troubleshooting, depending on the DNA polymerase...
-
Testing the usability of decisional DNA in robotics
PublicationW pracy poddano dyskusji i nalizie obszary mozliwych zastowac reprezentacji wiedzy zwanej Decisional DNA w zagadnieniach zwiazanych z robotyka.
-
The development of Decisional DNA digital TV
PublicationZaproponowano koncepcje opartej na wiedzy i doswiadczeniu telewizji cyfrowej z wbudowanym decyzyjnym DNA.
-
Decisional DNA applied to digital TV
PublicationPrzedstawiono nowoczesną koncepcje integracji decyzyjnego DNA z telewizją cyfrową w celu pozyskiwania wiedzy o oglądalności poszczególnych programów.
-
Early models of DNA damage formation
PublicationPrzeanalizowano jedne z pierwszych modeli opisujących uszkodzenia nici DNA. Przeanalizowano uszkodzenia powstające w pojedynczych i podwójnych niciach, pod wpływem czynników fizycznych i chemicznych.
-
Adding Interpretability to Neural Knowledge DNA
PublicationThis paper proposes a novel approach that adds the interpretability to Neural Knowledge DNA (NK-DNA) via generating a decision tree. The NK-DNA is a promising knowledge representation approach for acquiring, storing, sharing, and reusing knowledge among machines and computing systems. We introduce the decision tree-based generative method for knowledge extraction and representation to make the NK-DNA more explainable. We examine...
-
Rapid Assays for Specific Detection of Fungi of Scopulariopsis and Microascus Genera and Scopulariopsis brevicaulis Species
PublicationPurpose Fungi of Scopulariopsis and Microascus genera cause a wide range of infections, with S. brevicaulis being the most prevalent aetiological agent of mould onychomycosis. Proper identification of these pathogens requires sporulating culture, which considerably delays the diagnosis. So far, sequencing of rDNA regions of clinical isolates has produced ambiguous results due to the lack of reference sequences in publicly available...
-
Analysis the Parameters of the Adaptive Controller for Quality Control of Dissolved Oxygen Concentration
PublicationThe wastewater treatment plant can be considered a dynamic large scale complex system, in which the most important control parameter is the dissolved oxygen concentration in the aerobic zone. The air is supplied to this zone by the aeration system. In the paper, both the sequencing batch reactor and the aeration system are modelled and used as plant of control performed by the cascade nonlinear adaptive control system extended...
-
Processing of 1-nitroacridine-induced DNA-DNA cross-links by topoisomerase I is associated with enhanced cellular survival: a possible role of topoisomerase I in the removal of DNA cross-links
PublicationW tej pracy wykazujemy, że modyfikacje plazmidu indukowane przez wzrastające dawki 1-nitroakrydyn (nitracrine i związek C-857) prowadzą do zahamowania aktywności katalitycznej topoizomerazy I. Hamowanie to związane jest z pojawieniem się pojedynczoniciowych uszkodzeń DNA i tworzeniem kowalencyjnych kompleksów topoizomeraza I-DNA. Nie obserwowano takich efektów dla topoizomerazy typu II.Dalsze badania wykazały, że jedna z 1-nitroakrydyn...
-
“Positive Regulation of RNA Metabolic Process” Ontology Group Highly Regulated in Porcine Oocytes Matured In Vitro: A Microarray Approach
Publication -
Ocena wpływu pokarmowych kwasów nukleinowych i ich komponentów na replikacyjną i naprawczą syntezę DNA w modelach komórek ludzkiego układu pokarmowego
PublicationKwasy nukleinowe, do których należą DNA i RNA, są podstawowymi elementami każdej komórki niezbędnymi do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Pomimo, że cząsteczki te stanowią również nieodłączne składniki produktów żywnościowych spożywanych przez człowieka, to badania na temat ich zawartości w żywności oraz wartości odżywczej są ograniczone. Wyniki uzyskane w niniejszej pracy doktorskiej pokazały istotne różnice w ilości, wielkości...
-
Fusion of Taq DNA polymerase with single-stranded DNA binding-like protein of Nanoarchaeum equitans—Expression and characterization
PublicationDNA polymerases are present in all organisms and are important enzymes that synthesise DNA molecules. They are used in various fields of science, predominantly as essential components for in vitro DNA syntheses, known as PCR. Modern diagnostics, molecular biology and genetic engineering need DNA polymerases which demonstrate improved performance. This study was aimed at obtaining a new NeqSSB-TaqS fusion DNA polymerase from the...
-
Zastosowanie metod termograficznych w ocenie obrzęku limfatycznego kończyny górnej u chorych po amputacji piersi z powodu raka
PublicationObrzęk limfatyczny kończyny górnej jest bardzo uciążliwym powikłaniem po leczeniu raka piersi. Jest bezpośrednio związany z rodzajem zastosowanego leczenia chirurgicznego raka piersi i koniecznoącią przeprowadzenia uzupełniającej radioterapii. Wykorzystując metodt termografii statycznej (TS) i dynamicznej (ADT), podjęto próbę oceny ustępowania obrzęku
-
Zastosowanie metabolomiki jako przyszłego narzędzia w szybkiej diagnostyce ran przewlekłych
Publication -
Epigenetic Basis of Regeneration: Analysis of Genomic DNA Methylation Profiles in the MRL/MpJ Mouse
PublicationEpigenetic regulation plays essential role in cell differentiation and dedifferentiation, which are the intrinsic processes involved in regeneration. To investigate the epigenetic basis of regeneration capacity, we choose DNA methylation as one of the most important epigenetic mechanisms and the MRL/MpJ mouse as a model of mammalian regeneration known to exhibit enhanced regeneration response in different organs. We report the...
-
Opinia na temat wpływu projektowanego mostu przez Wisłę w Kiezmarku na kształtowanie hydrodynamiki przepływu wód, powstanie lokalnych rozmyć dna, powstanie zjawisk lodowych i ruch rumowiska w rejonie podpór nurtowych
PublicationZgodnie z tytułem opracowania, celem pracy jest wykonanie przekrojowych obliczeń hydraulicznych i hydrologicznych sprawdzających wpływ umieszczenia w korycie głównym Wisły podpór nurtowych nr 10 i 11 realizowanego w Kiezmarku mostu drogowego w dwóch wariantach projektowych. W ramach opracowania zrealizowano następujący zakres prac. 1) Zebranie, selekcja i analiza niezbędnych danych hydrologicznych i hydrometrycznych na badanym...
-
Metody metagenomiczne w badaniu mikrobiomu jelitowego człowieka
PublicationMikroorganizmy zamieszkujące ciało człowieka to nie tylko komensale i groźne patogeny, ale także organizmy symbiotyczne pełniące kluczową rolę w zachowaniu homeostazy gospodarza. Badania metagenomiczne wykorzystujące techniki sekwen-cjonowania nowej generacji i metody bioinformatyczne pozwalają na dogłębne po-znanie mikrobiomu ludzkiego i poszukiwanie jego związku ze stanem zdrowia czło-wieka. Celem pracy jest omówienie różnych...
-
Influence of Polymorphisms in DNA Repair GenesXPD, XRCC1andMGMTon DNA Damage Induced by Gamma Radiation and its Repair in LymphocytesIn Vitro
Publication -
Gentiana asclepiadea exerts antioxidant activity and enhances DNA repair of hydrogen peroxide- and silver nanoparticles-induced DNA damage
PublicationExposure to high levels of different environmental pollutants is known to be associated with induction of DNA damage in humans. Thus DNA repair is of great importance in preventing mutations and contributes crucially to the prevention of cancer. In our study we have focused on quantitative analysis of Gentiana asclepiadea aqueous or methanolic extracts obtained from flower and haulm, their antioxidant potency in ABTS post-column...
-
Fusion of DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase with TaqStoffel DNA polymerase as a useful tool in PCR with difficult targets
PublicationThe DNA coding sequence of TaqStoffel polymer- ase was fused with the DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase. The resulting novel recombinant gene was cloned and expressed in E. coli. The recombinant enzyme was purified and its enzymatic features were studied. The fusion protein (PfuDBDlig-TaqS) was found to have enhanced processivity as a result of the conversion of the Taq DNA polymerase from a relatively low processive...
-
Na skrzyżowaniu, czy na rondzie
PublicationOd pewnego czasu obserwuję polaryzację poglądów na temat roli uniwersytetu. Jest ona widoczna zarówno w środowisku akademickim, jak i w jego otoczeniu. Oto kilka przykładów: Wyznawcy krajowych ram kwalifikacji (krk) okopali się na swoich stanowiskach i nie przyjmują do wiadomości opinii znaczącej części środowiska akademickiego, która widzi w krk wyłącznie biurokratyczne uciążliwości. Na szczęście ci pierwsi dostrzegli już pewne...
-
Mechanism for Damage to DNA by Low-Energy Electrons
Publication -
Fast RNS combinational multipliers for small moduli
Publicationzaprezentowano nowe struktury mnożników modulo m oraz mnożników modulom przez stałą dla modułów 5-bitowych. w zaproponowanym algorytmie projektowania zastosowano kolejno redukcję modulo m potęg liczby 2, sumowanie binarne otrzymanych reszt, redukcję modulo do zakresu 2m oraz dwuoperandowe dodawanie modulo m. mnożnik resztowy w proponowanej strukturze posiada mniejsze opóźnienie niż inne znane mnożniki modulo i porównywalny iloczyn...
-
Decisional DNA: the concept and its implementation platforms
PublicationOmowiono kopncepcje zarzadzania wiedza oparta na decyzyjnym DNA gdzie wiedza jest reprezentowana poprzez zbiory doswiadczen. Przedstawiono obecne oraz przyszle zastosowania omawianej koncepcji.
-
Application of decisional DNA in web data mining
PublicationPrzedstawiono pilotową koncepcję i aplikację integracji reprezentacji wiedzy opartej na decyzyjnym DNA oraz systemów pozyskiwania wiedzy i danych z Internetu. Wskazano na zalety proponowanej integracji oraz przedstawiono kierunki przyszłych badań w tym zakresie.
-
A case study of constructing decisional DNA on finanse
PublicationPrzedstawiono koncepcję i rozwiązanie analityczne opisu rynku finansowego przy pomocy reprezentacji wiedzy zwanej ''decyzyjne DNA''.
-
L'Europa alla ricerca di una identità
PublicationIl capitolo tratta dell'economia europea dopo la riunficazione tedesca,, della nascita dell'Euro e delle cosneguenbze per il Continente della crisi economica e finanziaria
-
Targeting DNA Topoisomerase II in Antifungal Chemotherapy.
PublicationTopoisomerase inhibitors have been in use clinically for the treatment of several diseases for decades. Although those enzymes are significant molecular targets in antibacterial and anticancer chemotherapy very little is known about the possibilities to target fungal topoisomerase II (topo II). Raising concern for the fungal infections, lack of effective drugs and a phenomenon of multidrug resistance underlie a strong need to expand...
-
Triazoloacridone C-1305 impairs XBP1 splicing by acting as a potential IRE1α endoribonuclease inhibitor
PublicationInositol requiring enzyme 1 alpha (IRE1α) is one of three signaling sensors in the unfolding protein response (UPR) that alleviates endoplasmic reticulum (ER) stress in cells and functions to promote cell survival. During conditions of irrevocable stress, proapoptotic gene expression is induced to promote cell death. One of the three signaling stressors, IRE1α is an serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease (RNase) that...
-
Przydział narzędzi obróbkowych a efektywność szeregowania zadań produkcyjnych
PublicationThe paper addresses issues concerning the analysis of tool flow within a multi-machine machining cell, designated to small batch manufacturing a definite spectrum of prismatic parts. The approach utilises a method for job and tool allocation to work centres with limited number of machines and capacity of tool resources, based on the analysis of formalised relations: job - tool sets required. Selected allocation strategies are considered...
-
A mechanistic model for fate and removal of estrogens in biological nutrient removal activated sludge systems
PublicationTwo estrogen fate and transformation models were integrated with a comprehensive activated sludge model (ASM) to predict estrogen removal based on biomass and solids production. Model predictions were evaluated against published full-scale plant data as well as results from a laboratory-scale sequencing batch reactor (SBR) fed synthetic wastewater. The estrogen fate model relating the rate of total estrogen degradation to soluble...
-
Therapeutic intervention by the simultaneous inhibition of DNA repair and type I or type II DNA topoisomerases: one strategy, many outcomes
PublicationMany anticancer drugs reduce the integrity of DNA, forming strand breaks. This can cause mutations and cancer or cell death if the lesions are not repaired. Interestingly, DNA repair-deficient cancer cells (e.g., those with BRCA1/2 mutations) have been shown to exhibit increased sensitivity to chemotherapy. Based on this observation, a new therapeutic approach termed 'synthetic lethality' has been developed, in which radiation...
-
Diagnostic Accuracy of Liquid Biopsy in Endometrial Cancer
PublicationBackground: Liquid biopsy is a minimally invasive collection of a patient body fluid sample. In oncology, they offer several advantages compared to traditional tissue biopsies. However, the potential of this method in endometrial cancer (EC) remains poorly explored. We studied the utility of tumor educated platelets (TEPs) and circulating tumor DNA (ctDNA) for preoperative EC diagnosis, including histology determination. Methods:...
-
Pompa na zasileniu czy na powrocie?
PublicationW artykule dokonano analizy warunków ciśnieniowych pracy zamkniętej instalacji grzewczej z pompą zainstalowaną na przewodzie zasilającym i powrotnym.
-
Fungal Typin Methods
PublicationThe broad application of the molecular techniques in mycoses diagnosis is related to increase of infections caused by fungi in many countries. The oldest typing methods relaying on fenotypic observation, physiological and biochemical examination have had very limited importance from decades. Novadays, the molecular biology methods took their place. Most of the genotyping methods have been devoleped to be applied for typing of bacteria...
-
Inhibition of the granular anammox process by the high concentration of free ammonia.
PublicationHigh concentrations of ammonia and nitrite, typical for reject water treatment in the anammox process with the use of high temperatures and pH, may cause free ammonia (FA) inhibition. In this study, the inhibitory effect of FA on anammox process rate was investigated in a bench-scale sequencing batch reactor (SBR) with granular anammox biomass. Results of the study present that the anammox process could be successfully operated...
-
Designing control strategies of aeration system in biological WWTP
PublicationThe paper presents the complete design processes of a novel aeration control systems in the SBR (Sequencing Batch Reactor) wastewater treatment plant (WWTP). Due to large energy expense and high influence on biological processes, the aeration system plays a key role in WWTP operation. The paper considers the aeration system for a biological WWTP located in the northeast of Poland. This system consists of blowers, the main collector...
-
Comparative Study of Machining Technology Selection to Manufacture Large-Size Components of Offshore Constructions
PublicationThe focus of this paper is on process planning for large parts manufacture in systems of definite process capabilities, involving the use of multi-axis machining centres. The analysis of machining heavy mechanical components used in off-shore constructions has been carried out. Setup concepts applied and operation sequences determined in related process plans underwent studies. The paper presents in particular a reasoning approach...
-
Stardust - Investigation of Microbes in the Stratosphere
PublicationThe stratospheric microbiome has been investigated several times using the methods of classical microbiology. In this experiment, we have combined them with some novel approaches including whole- metagenome amplification, Maldi TOF mass spectrometry and Sanger DNA sequencing. The results of the experiment may provide the scientists with knowledge about the mechanisms of survivability of microorganisms in stratospheric conditions...
-
Granie nie tylko na murawie! Zostań Lewandowskim pipety i termocyklera. Synergia nowoczesnych metod analitycznych opartych o wykrywanie DNA z nowymi formami nauczania (grywalizacja).
PublicationKOnkurs Innowacji Dydaktyznych PG: "Granie nie tylko na murawie! Zostań Lewandowskim pipety i termocyklera. Synergia nowoczesnych metod analitycznych opartych o wykrywanie DNA z nowymi formami nauczania (grywalizacja)."
-
The Effects of Single Nucleotide Polymorphisms in Cancer RNAi Therapies
Publication -
Global DNA methylation level in females with idiopathic scoliosis
Publication -
DNA base modifications in chromatin of human cancerous tissues
Publication -
Common variants of DNA repair genes and malignant melanoma
Publication -
Zastosowanie Grafiki 3D do wizualizacji dna morskiego
PublicationTechnologie do wytwarzanie grafiki 3D to dynamicznie rozwijająca się gałąź przemysłu informatycznego. Znajdują one zastosowanie nie tylko przy tworzeniu gier komputerowych, ale coraz częściej są wykorzystywane w systemach trjwymiarowej wizualizacji danych pomiarowych.
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublicationBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
mRNA profiling for vaginal fluid and menstrual blood identification
Publication -
Oxidative stress in humans: validation of biomarkers of DNA damage
Publication -
Problem of aggregation in dye-DNA interaction, calorimetry studies
PublicationNucleic acids are the biological target for many antimicrobial, antitumor and antiviral drugs. Ligand-DNA interactions can be classified into two major categories: 1. covalent binding, which can provide to intermolecular adducts, 2. physico-chemical interactions, which can be divided into intercalation (e.g. adriamycin) or groove binding (e.g. dystamycin). There are several methods to investigate interactions between drug and DNA....