Filters
total: 25029
-
Catalog
- Publications 20170 available results
- Journals 38 available results
- Conferences 1 available results
- Publishing Houses 5 available results
- People 708 available results
- Inventions 98 available results
- Projects 276 available results
- Laboratories 18 available results
- Research Teams 43 available results
- Research Equipment 8 available results
- e-Learning Courses 1710 available results
- Events 598 available results
- Open Research Data 1356 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: xna
-
Buserelin Acetate Reduces Mortality and DNA Defragmentation of Bovine Sperm Cells Exposed to Oxidative Stress
Publication -
Critical factors for the performance of chip array-based electrical detection of DNA for analysis of pathogenic bacteria
Publication -
The Escherichia coli RNA polymerase alpha subunit and transcriptional activation by bacteriophage lambda CII protein.
Publication -
Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publication -
DNA methylation analysis of benign and atypical meningiomas: correlation between RUNX3 methylation and WHO grade
Publication -
The Degree of Global DNA Hypomethylation in Peripheral Blood Correlates with That in Matched Tumor Tissues in Several Neoplasia
Publication -
Prolonged Quercetin Administration Diminishes the Etoposide-Induced DNA Damage in Bone Marrow Cells of Rats
Publication -
Hyponastic Leaves 1 Interacts with RNA Pol II to Ensure Proper Transcription of MicroRNA Genes
Publication -
Biomedical, Artificial Intelligence, and DNA Computing Photonics Applications and Web Engineering, Wilga, May 2012
Publication -
ppGpp-Dependent Negative Control of DNA Replication of Shiga Toxin-Converting Bacteriophages in Escherichia coli
Publication -
Defects in RNA polyadenylation impair both lysogenization by and lytic development of Shiga toxin-converting bacteriophages
Publication -
Trichrome Mallory's stain may indicate differential rates of RNA synthesis in eutopic and ectopic endometrium.
Publication -
Selective Cytostatic and Cytotoxic Anticancer Effects of Bisfunctional Agents: A Strategy for the Design of DNA Binding Agents
PublicationVarious agents have been synthesized and proved useful for the National Cancer Institute's anticancer testing as potential new drugs, but most agents suffer side effects from their limited selectivity against cancer cells over healthy ones. Therefore, this paper attempts to describe drugs in terms of the level of tumor cell selectivity which they possess to define the features of mols. that are essential for useful cytotoxicity....
-
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublicationThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
Modulation of cellular response to anticancer treatment by caffeine:inhibition of cell cycle checkpoints, DNA repair and more
PublicationKofeina i inne metyloksantyny wywołują bardzo różne efekty fizjologiczne w organizmie człowieka. W pracy przedstawiamy, które z tych efektów mogą wpływać na skuteczność terapii przeciwnowotworowych. Kofeina może bezpośrednio wpływać na transport oraz aktywację metaboliczną cząsteczek leków do komórki, poprzez tworzenie kompleksów z lekami zawierającymi układy poliaromatyczne. Kofeina hamuje aktywność kinaz ATM/ATR co prowadzi do...
-
Bulky DNA adducts in human sperm: relationship with fertility, semen quality, smoking, and environmental factors
Publication -
Establishing the background level of base oxidation in human lymphocyte DNA: results of an interlaboratory validation study
Publication -
Urinary Measurement of 8-OxodG, 8-OxoGua, and 5HMUra: A Noninvasive Assessment of Oxidative Damage to DNA
Publication -
Mass spectrometry reveals the presence of specific set of epigenetic DNA modifications in the Norway spruce genome
Publication -
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublicationW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Emplying set of experience knowledge structure and decisional DNA to enhance industrial design: conceptual approach
PublicationZaprezentowano koncepcje wspomagania projektowania przemyslowego przy pomocy nowoczenego podejscia do reprezentacji wiedzy w postaci SOEKS oraz Decyzyjnego DNA
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublicationAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
Genome-wide DNA methylation profiling of the regenerative MRL/MpJ mouse and two normal strains
PublicationAims We aimed to identify the pivotal differences in the DNA methylation profiles between the regeneration capable MRL/MpJ mouse and reference mouse strains. Materials and Methods Global DNA methylation profiling was performed in ear pinnae, bone marrow, spleen, liver, heart from uninjured adult females of the MRL/MpJ and C57BL/6J and BALB/c. Results and conclusion A number of differentially methylated regions distinguishing between...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublicationTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
Publicationnthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another...
-
Decisional DNA (DDNA) Based Machine Monitoring and Total Productive Maintenance in Industry 4.0 Framework
PublicationThe entire manufacturing spectrum is transforming with the advent of Industry 4.0. The features of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA) were utilized for developing Virtual Engineering Objects (VEO), Virtual Engineering Process (VEP) and Virtual Engineering Factory (VEF), which in turn facilitate the creation of smart factories. In this study, DDNA based Machine Monitoring for Total Maintenance...
-
Sequence-dependent structural properties of B-DNA: what have we learned in 40 years?
PublicationThe structure of B-DNA, the physiological form of the DNA molecule, has been a central topic in biology, chemistry and physics. Far from uniform and rigid, the double helix was revealed as a flexible and structurally polymorphic molecule. Conformational changes that lead to local and global changes in the helix geometry are mediated by a complex choreography of base and backbone rearrangements affecting the ability of the B-DNA...
-
imPlatelet classifier: image‐converted RNA biomarker profiles enable blood‐based cancer diagnostics
PublicationLiquid biopsies offer a minimally invasive sample collection, outperforming traditional biopsies employed for cancer evaluation. The widely used material is blood, which is the source of tumor-educated platelets. Here, we developed the imPlatelet classifier, which converts RNA-sequenced platelet data into images in which each pixel corresponds to the expression level of a certain gene. Biological knowledge from the Kyoto Encyclopedia...
-
Mitochondrial DNA copy number and trimethylamine levels in the blood: New insights on cardiovascular disease biomarkers
PublicationAmong cardiovascular disease (CVD) biomarkers, the mitochondrial DNA copy number (mtDNAcn) is a promising candidate. A growing attention has been also dedicated to trimethylamine-N-oxide (TMAO), an oxidative derivative of the gut metabolite trimethylamine (TMA). With the aim to identify biomarkers predictive of CVD, we investigated TMA, TMAO, and mtDNAcn in a population of 389 coronary artery disease...
-
Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor
PublicationRolling circle amplification (RCA) of DNA can be considered as a great alternative to the gold standard polymerase chain reaction (PCR), especially during this pandemic period, where rapid, sensitive, and reliable test results for hundreds of thousands of samples are required daily. This work presents the first research to date on direct, real-time and label-free isothermal DNA amplification monitoring using a microcavity in-line...
-
Increased resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA in proximity to metallic silver particles.
PublicationZbadano wpływ nanocząstek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donor (pochodna kumaryny) i akceptor (Cy3) umieszczono na przeciwległych końcach DNA o strukturze podwójnej helisy i o 23 parach bazowych. W nieobecności cząstek srebra wydajność przekazywania energii w tym układzie wynosiła ok. 9%, zaś po umieszczeniu go między kwarcowymi płytkami pokrytymi filmem wysepek...
-
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublicationOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
-
When Neural Networks Meet Decisional DNA: A Promising New Perspective for Knowledge Representation and Sharing
PublicationABSTRACT In this article, we introduce a novel concept combining neural network technology and Decisional DNA for knowledge representation and sharing. Instead of using traditional machine learning and knowledge discovery methods, this approach explores the way of knowledge extraction through deep learning processes based on a domain’s past decisional events captured by Decisional DNA. We compare our approach with kNN (k-nearest...
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublicationMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
Defining a novel domain that provides an essential contribution to site-specific interaction of Rep protein with DNA
PublicationAn essential feature of replication initiation proteins is their ability to bind to DNA. In this work, we describe a new domain that contributes to a replication initiator sequence-specific interaction with DNA. Applying biochemical assays and structure prediction methods coupled with DNA–protein crosslinking, mass spectrometry, and construction and analysis of mutant proteins, we identified that the replication initiator of the...
-
Application of potential theory in calculating wave-induced vertical forces on horizontal cylinders near a plane boundary
PublicationHydrodynamiczne obciażenia wywołane falowaniem morskim działajace na poziomo ułożoną przy dnie rurę, rozpatrywane są w ujęciu dyfrakcyjnym przy założeniu istnienia funkcji potencjału. Potencjał zdefiniowano jako superpozycję potencjału fali inicjującej oraz potencjału perturbacji spowodowanej istnieniem obiektu przy dnie. Wyniki rozwiązań teoretycznych porównano z wynikami doswiadczeń przeprowadzonych w Wielkim Kanale falowym w...
-
Piotr Iwicki dr hab. inż.
People -
Studia i Materiały do Badań nad Neolitem i Wczesną Epoką Brązu na Mazowszu i Podlasiu
Journals -
Grzegorz Boczkaj dr hab. inż.
People -
Absolwent uczelni technicznej na rynku pracy - na przykładzie badań absolwentów Politechniki Gdańskiej z rocznika 2010
Publication...
-
Wpływ metody obliczania intensywności wymiany powietrza w budynku na dokładność prognozowania jego zapotrzebowania na energię
PublicationW artykule poddano analizie dwie odmienne metody służące do symulacji zużycia energii do ogrzewania i wentylacji w budynku. Pierwsza części artykułu porównuje pod względem matematycznym, dwa modele energetyczne budynku, wykorzystujące odmienne podejścia do modelowania przepływu powietrza w pomieszczeniach. Natomiast w drugiej części artykułu zostaną porównane wyniki obliczeń numerycznych z wynikami pomiarów rzeczywistych wartości...
-
Analiza wpływu parametrów budynku i źródeł ciepła na zapotrzebowanie na energię pierwotną budynku mieszkalnego wielorodzinnego
PublicationW publikacji przedstawiono analizę parametrów, które mogą wpływać na charakterystykę energetyczną budynków mieszkalnych wielorodzinnych. Analizą objęto stopień ochrony cieplnej budynku, rodzaj źródła ciepła oraz wyposażenie lokali mieszkalnych określające wymagane strumienie powietrza wentylacyjnego. Wskazane zostały uwarunkowania uzyskania wartości wskaźnika EP budynku poniżej wartości granicznych, określonych w przepisach techniczno-budowlanych.
-
Opinia na temat przecieków występujących na płycie fundamentowej budynki Muzeum II Wojny Światowej w Gdańsku.
PublicationEkspertyza dotyczy określenia przyczyn przecieków w płycie fundamentowej oraz środków zaradczych.
-
Badanie przyczyn korozji zbiorników magazynowych na paliwa na terenie stacji benzynowej grupy Lotos w Pruszkowie
PublicationPrzedstawiono wyniki oględzin zbiornika na olej napędowy eksploatowany na stacji benzynowej w Pruszkowie. Przedstawiono możliwe przyczyny powstania zniszczeń korozyjnych w dolnej części zbiornika.
-
Koncepcja szacowania wpływu drgań komunikacyjnych na budynki i na ludzi przy użyciu sztucznych sieci neuronowych
PublicationKoncepcja szacowania wpływu drgań komunikacyjnych na budynki i na ludzi przy użyciu sztucznych sieci neuronowych
-
Wpływ drogi skrawania i zużycia narzędzia na strukturę geometryczną powierzchni przedmiotu przy toczeniu na twardo
PublicationWpływ drogi skrawania i zużycia narzędzia na strukturę geometryczną powierzchni przedmiotu przy toczeniu na twardo za pomocą ostrzy z polikrystalicznego regularnego azotku boru. Otrzymane wyniki badań prowadzonych w warunkach przemysłowych wykazały wpływ zużycia ostrza na zmianę parametru horyzontalnego RSm w funkcji spiralnej drogi skrawania, pomimo niezauważalnych zmian parametru chropowatości Ra.
-
System wspomagający diagnozowanie chorób na obrazach endoskopowych przy użyciu nowoczesnych algorytmów działających na platformie Kaskada
PublicationPraca ma na celu opisanie działania systemu, stworzonego w ramach projektu Mayday 2012 prowadzonego przez Politechnikę Gdańską, mającego na celu wspomaganie lekarza w badaniach endoskopowych. W pracy przedstawiono poszczególne komponenty, z których składa się system, ich wzajemne powiązania oraz sposób integracji ze środowiskiem równoległego przetwarzania KASKADA (Kontekstowa Analiza Strumieni danych z Kamer dla Aplikacji Definiujących...
-
Katastrofy i awarie stalowych wieżowych zbiorników na wodę z czaszą opartą na jednym słupie rurowym
PublicationCelem referatu jest zwrócenie uwagi polskich projektantów i wykonawców inwestycji na pozornie błache przyczyny, które mogą doprowadzić do katastrofy lub awarii wieżowego zbiornika jednego z najczęściej stosowanych typów. W referacie omówiono trzy katastrofy i jedną awarię spowodowane:a)złą koncepcją konstrukcji czaszy zbiornika złożonej z prefabrykatów łączonych śrubami. Prefabrykaty były cynkowane zanurzeniowo w wannach cynkowniczych...
-
Analizy numeryczne na podstawie różnych modeli konstytutywnych gruntu na przykładzie posadowienia pylonu mostu MA21 (A8)
PublicationPrzedstawiono rezultaty analiz numerycznych z zastosowaniem trzech różnych modeli gruntów w odniesieniu do rzeczywistego obiektu. Zamieszczono opisy wszystkich wykorzystanych modeli. Obliczenia wykonano metodą elementów skończonych na modelach w płaskim i przestrzennym stanie odkształcenia. Uzyskane wyniki porównano i opatrzono komentarzem.
-
Dobre praktyki w zarządzaniu jakością kształcenia na studiach doktoranckich uczelni technicznych - na przykładzie Politechniki Gdańskiej
PublicationW pierwszej części opracowania zaprezentowano europejskie standardy w zakresie zarządzania jakością kształcenia przyjęte przez europejskie gremia zajmujące się szkolnictwem wyższym oraz omówiono poziom zaawansowania ich implementacji w polskim systemie szkolnictwa wyższego. W części drugiej omówiono znaczenie zorientowanego procesowo systemu zarządzania dla organizacji i realizowania przez nią celów strategicznych. Rozdział trzeci...