Filters
total: 640
Search results for: IMMOBILIZOWANE ENZYMY
-
The Role of Electrostatics in Enzymes: Do Biomolecular Force Fields Reflect Protein Electric Fields?
PublicationPreorganization of large, directionally oriented, electric fields inside protein active sites has been proposed as a crucial contributor to catalytic mechanism in many enzymes, and it may be efficiently investigated at the atomistic level with molecular dynamics simulations. Here, we evaluate the ability of the AMOEBA polarizable force field, as well as the additive Amber ff14SB and Charmm C36m models, to describe the electric...
-
Anna Zielińska-Jurek prof. dr hab. inż.
People2018 DSc in technical sciences in the field of chemical technology Chemical Faculty, Gdansk University of Technology, Title: “Functionalized titanium(IV) oxide as a photocatalyst for environmental purification” 2011 Ph. D. in technical sciences in the field of chemical technology Chemical Faculty, Gdansk University of Technology, Title of the dissertation:...
-
Two small RNAs conserved in Enterobacteriaceae provide intrinsic resistance to antibiotics targeting the cell wall biosynthesis enzyme glucosamine-6-phosphate synthase
PublicationFormation of glucosamine-6-phosphate GlcN6P) by enzyme GlcN6P synthase (GlmS) represents the first step in bacterial cell envelope synthesis. In Escherichia coli, expression of glmS is controlled by small RNAs (sRNAs) GlmY and GlmZ. GlmZ activates the glmS mRNA by base-pairing. When not required, GlmZ is bound by adapter protein RapZ and recruited to cleavage by RNase E inactivating the sRNA. The homologous sRNA GlmY activates...
-
Możliwości zastosowań, potencjalne źródła oraz ewolucja technologiczna sposobu otrzymywania trehalozy ze szczególnym uwzględnieniem enzymu syntazy trehalozy [EC 5.4.99.16]
PublicationJedna z wiodących gałęzi współczesnej biotechnologii opiera się na produkcji białek – przede wszystkim enzymów. Są one powszechnie wykorzystywane: od przemysłu chemicznego poprzez przemysł spożywczy aż po medycynę i życie codzienne (czy ktoś wyobraża sobie w dzisiejszych czasach proszek do prania „bez enzymu”). Przed rozwojem nowoczesnych metod biologii molekularnej i inżynierii genetycznej pozyskiwano interesujące substancje z...
-
Combined Effect of Sonication and Acid Whey on Antioxidant and Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitory Activities of Peptides Obtained from Dry-Cured Pork Loin
Publication -
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublicationTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Highly Specific Substrates of Proteinase 3 Containing 3-(2-Benzoxazol-5-yl)-l-alanine and Their Application for Detection of This Enzyme in Human Serum
Publication -
Źródła, otrzymywanie i przydatność niektórych termostabilnych enzymów w przetwórstwie skrobi i mleka
PublicationPrezentowane wyniki wskazują na możliwość usprawnienia produkcji syropów skrobiowych przez zastosowanie rekombinantowej alfa-amylazy z Pyrococcus woesei i termostabilnej alfa-glukozydazy z Thermus thermophilus. Wykazano także przydatność rekombinantowej, termosta-bilnej beta-galaktozydazy z Pyrococcus woesei do wytwarzania bez-laktozowego mleka i serwatki. Enzym ten wykazuje dużą termostabil-ność i znaczną aktywność w szerokim...
-
Melatonin stimulates the activity of protective antioxidative enzymes in myocardial cells of rats in the course of doxorubicin intoxication
Publication -
Genistein inhibits activities of methylenetetrahydrofolate reductase and lactate dehydrogenase, enzymes which use NADH as a substrate
Publication -
Antioxidative enzymes and expression of rbcL gene as tools to monitor heavy metal-related stress in plants
Publication -
Krzysztof Formela dr inż.
People -
Flavin monooxygenases, FMO1 and FMO3, not cytochrome p450 isoenzymes, contribute to metabolism of anti-tumour triazoloacridinone, C-1305, in liver microsomes and HepG2 cells.
PublicationCelem pracy było określenie roli wybranych enzymów frakcji mikrosomalnej komórek wątroby w metabolizmie pochodnej triazoloakrydonu, związku C-1305. Wykazano, że badana pochodna ulega transformacji wobec frakcji enzymów izolowanych z hepatocytów szczurzych i ludzkich oraz jest metabolizowana przez komórki linii HepG2. Badania wykazały ponadto, że enzymami odpowiedzialnymi za obserwowane przemiany były monooksygenazy flawinowe, FMO1...
-
Molecular Characterization of a Novel Lytic Enzyme LysC from Clostridium intestinale URNW and Its Antibacterial Activity Mediated by Positively Charged N-Terminal Extension
Publication -
Paweł Sachadyn prof. dr hab. inż.
People -
Nanostructured biocatalysis for biotechnological applications
PublicationThe purpose immobilization process is to enhance the performance of an enzyme for commercial processes. A large number of structures have been reported in the literature to boost the effectiveness of immobilized enzymes. The nanomaterials have the optimal properties for equilibrating key parameters that govern the performance of biocatalysts, such as high enzyme loading ability, specific surface area, and mass transfer resistance....
-
Properties and applications of thermostable proteases sourced from Deinococcus geothermalis.
PublicationThe growing interest of extremophiles results from the fact that their enzymes arestable and active under harsh environment conditions. These type of biocatalysts are attractivedue to the fact that can be used in industrial processes that were previously regarded asincompatible with biological materials. Among extremozymes the largest group constitutethermozymes. Currently it is estimated that approximately 40% of enzymes used...
-
Modulation of the expression of enzymes metabolizing xenobiotics in rat liver and kidney by oral administration of cabbage and sauerkraut juice.
PublicationObydwa soki z kapusty mogą wpływać selektywnie na ekspresję genów zaangażowanych w aktywację i detoksykację kancerogenów. Efekt ten zależy od sposobu traktowania i może zależeć od rodzaju tkanki.
-
Insect cuticular compounds affect Conidiobolus coronatus (Entomopthorales) sporulation and the activity of enzymes involved in fungal infection
Publication -
Inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase as potential antifungal drugs.
PublicationPrzedstawiono stan obecny i perspektywy zastosowania inhibitorów enzymu syntazy GlcN-6-P jako leków skutecznych w leczeniu grzybic układowych. Używając metod modelowania molekularnego zaprojektowano struktury inhibitorów enzymu należących do dwóch grup strukturalnych: analogów glutaminy oraz analogów stanu przejściowego reakcji katalizowanej przez enzym. Opracowano metody syntezy pochodnych zoptymalizowanych inhibitorów, wykazujących...
-
Support Materials of Organic and Inorganic Origin as Platforms for Horseradish Peroxidase Immobilization: Comparison Study for High Stability and Activity Recovery
PublicationIn the presented study, a variety of hybrid and single nanomaterials of various origins were tested as novel platforms for horseradish peroxidase immobilization. A thorough characterization was performed to establish the suitability of the support materials for immobilization, as well as the activity and stability retention of the biocatalysts, which were analyzed and discussed. The physicochemical characterization of the obtained...
-
Selectivity Tuning by Natural Deep Eutectic Solvents (NADESs) for Extraction of Bioactive Compounds from Cytinus hypocistis—Studies of Antioxidative, Enzyme-Inhibitive Properties and LC-MS Profiles
PublicationIn the present study, the extracts of Cytinus hypocistis (L.) L using both traditional solvents (hexane, ethyl acetate, dichloromethane, ethanol, ethanol/water, and water) and natural deep eutectic solvents (NADESs) were investigated in terms of their total polyphenolic contents and antioxidant and enzyme-inhibitive properties. The extracts were found to possess total phenolic and total flavonoid contents in the ranges of 26.47–186.13...
-
Glucosamine-6-phosphate synthase,a novel target for antifungalagents.Molecular modelling studies in drug design
PublicationPraca dotyczy modelowania zarówno samych inhibitorów syntazy glukozamino-6-fosforanu jak i ich oddziaływania z obydwiema domenami tego enzymu. Enzym syntaza glukozamino-6-fosforanu został zaproponowany jako nowy cel molekularny w chemoterapii infekcji grzybowych. Zaprojektowano i zsyntezowano szereg inhibitorów tego enzymu - potencjalnych nowych leków przeciwgrzybowych. Dzięki modelowaniu molekularnemu udało się wyjaśnić mechanizm...
-
Diclofenac Degradation—Enzymes, Genetic Background and Cellular Alterations Triggered in Diclofenac-Metabolizing Strain Pseudomonas moorei KB4
Publication -
Electrochemistry meets enzymes: Investigation of the biotransformation pathway of C-1311 based on electrochemical simulation in comparison to in vitro methods.
PublicationThe knowledge of the metabolic pathways and the biotransformation of new drugs is one of the major challenges in pharmaceutical research. It is crucial for elucidation of degradation routes of the new biologically active compounds, especially in the area of possible toxicity. Conventional in vitro drug metabolism studies are based on incubating drug candidate with e.g. hepatocytes or, most importantly, liver cell microsomes and...
-
DNA modification by 1-nitroacridine derivatives. Comparison of 32P-Postlabeling and restriction enzyme analysis method for the detection of DNA adducts formed by 1-nitroacridines C-1748 and C-857
Publication4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny, zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. Metoda 32P-postlabellingu wykazała, że pochodne C-1748 i C-857 tworzą od 4-6 adduktów DNA w systemie komórkowym i bezkomórkowym o innym rozkładzie plam chromatograficznych, jednakże niezależnym od zastosowanego systemu aktywacyjnego. Metoda enzymatycznej analizy restrykcyjnej pozwoliła natomiast śledzić kinetykę...
-
Quantification of Biodiversity Related to the Active Protection of Grassland Habitats in the Eastern Lublin Region of Poland Based on the Activity of Soil Enzymes
Publication -
Role of melatonin seed priming on antioxidant enzymes and biochemical responses of Carthamus tinctorius L. under drought stress conditions
Publication -
Przemiany metaboliczne in vitro przeciwnowotworowej pochodnej imidazoakrydonu, C-1311, i jej wpływ na aktywność wybranych izoenzymów cytochromu P450
PublicationPrzedmiotem badań przedstawionych w niniejszej pracy jest aktywna przeciwnowotworowo pochodna należąca do grupy imidazoakrydonów, tj. C-1311, i jej analog 8-metoksylowy, związek C-1330, zsyntetyzowane w Katedrze Technologii Leków i Biochemii Politechniki Gdańskiej. Wstępne badania wykazały brak wyraźnej reaktywności C-1311 i C-1330 wobec wybranych rekombinantowych ludzkich izoenzymów cytochromu P450,...
-
Identification and cloning of C. albicans SC5314 genes encoding L-methionine biosynthetic pathway enzymes.
Open Research DataEnzymes of fungal L-methionine biosynthetic pathway: homoserine O-acetyltransferase (Met2p), O-acetylhomoserine sulfhydrylase (Met15p) and cystathionine-γ-synthase (Str2p) could be exploited as molecular targets for antifungal chemotherapy. The goal of the study was to identify and clone genes encoding mentioned above enzymes. MET2, MET15 and STR2 genes...
-
The Development of Toxoplasma gondii Recombinant Trivalent Chimeric Proteins as an Alternative to Toxoplasma Lysate Antigen (TLA) in Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for the Detection of Immunoglobulin G (IgG) in Small Ruminants
Publication -
The Development of Toxoplasma gondii Recombinant Trivalent Chimeric Proteins as an Alternative to Toxoplasma Lysate Antigen (TLA) in Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for the Detection of Immunoglobulin G (IgG) in Small Ruminants
PublicationThis study presents an evaluation of seventeen newly produced recombinant trivalent chimeric proteins (containing the same immunodominant fragment of SAG1 and SAG2 of Toxoplasma gondii antigens, and an additional immunodominant fragment of one of the parasite antigens, such as AMA1, GRA1, GRA2, GRA5, GRA6, GRA7, GRA9, LDH2, MAG1, MIC1, MIC3, P35, and ROP1) as a potential alternative to the whole-cell tachyzoite lysate (TLA) used...
-
Ageing-Time Dependent Changes of Angiotensin I-Converting Enzyme-Inhibiting Activity of Protein Hydrolysates Obtained from Dry-Cured Pork Loins Inoculated with Probiotic Lactic Acid Bacteria
Publication -
Antarctic marine bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b as a source of cold adapted á-galaktosidase.
PublicationAntarktyczny morski szczep Pseudoalteromonas sp. 22b. jest źródłem wewnątrzkomórkowej beta-galaktozy. Enzym ten wykazuje wysoką aktywność hydrolizy laktozy w zakresie temperatur od 0 do 20 st. C oraz pH 6,0-8,0. W niniejszej pracy opisano metodykę uzyskania homogennego preparatu tego enzymu, oraz pełną charakterystykę jego własności enzymatycznych i kinetycznych.
-
Pattern Recognition Methods in Evaluation of the Structure of the Laboratory Data Biominerals, Antioxidant Enzymes, Selected Biochemical Parameters, and Pulmonary Function of Welders
Publication -
INVESTIGATION OF THE EFFECT OF THE ROCKET'S SUBORBITAL FLIGHT ON BIOFILM, ENZYMES AND BIOSYNTHESIS ON AUTONOMOUS, MODULAR AND SCALABLE PLATFORM FOR CONDUCTING EXPERIMENTS OF AN ASTROBIOTECHNOLOGICAL NATURE
PublicationWith new incentives for human space exploration, biotechnological experiments in orbit became imperative.Answering this need, we build an autonomous, modular, and scalable platform that enables those experiments onrockets. We called it AMBER. The aim of the payload of the R6 suborbital rocket is to perform an experiment tostudy the influence of rocket flights on biofilm, molecular...
-
Modulation of rat hepatic and kidney phase II enzymes by cabbage juices: comparison with the effects of indole-3-carbinol and phenethyl isothiocyanate
PublicationZbadano wpływ soków ze świeżej i kiszonej kapusty na ekspresję i aktywność takich enzymów II fazy jak transferazy S-glutationowe i oksydoreduktaza NQO1 w wątrobie i nerkach szczurów, którym podawano wspomniane soki doustnie. Uzyskane wyniki porównano z oznaczeniami uzyskanymi po doustnym podaniu wyizolowanych produktów degradacji glukozynolanów, indolo-3-karbinolu i izotiocyjanianu fenyloetylu. Wszystkie testowane czynniki powodowały...
-
Activity ofα1-Antitrypsin and Some Lysosomal Enzymes in the Blood Serum of Patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease after Smoking Cessation
Publication -
Investigation of the Effect of the Rocket's Suborbital Flight on Biofilm, Enzymes and Biosynthesis on Autonomous, Modular and Scalable Platforms For Conducting Experiments of an Astrobiotechnological Nature
PublicationWith new incentives for human space exploration, biotechnological experiments in orbit became imperative. Answering this need, we build an autonomous, modular, and scalable platform that enables those experiments on rockets. We called it AMBER. The aim of the payload of the R6 suborbital rocket is to perform an experiment to study the influence of rocket flights on biofilm, molecular biology enzymes and biosynthesis using our platform....
-
Unknown Enemy and Psychopathological Responses: A Cross-Sectional Nationwide Study Assessing the Knowledge About COVID-19
Publication -
Inactivation of glucosamine-6-phosphate synthase by N3-oxoacyl derivatives of L-2,3-diaminopropanoic acid
PublicationN3-oksoacylowe pochodne kwasu l-2,3-diaminopropanowego zawierające ugrupowanie epoksydowe lub układ sprzężonych wiązań podwójnych inaktywują syntaze glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P) z S. cerevisiae. Wyniki badań kinetycznych inaktywacji enzymu wskazują na dwuetapowy przebieg tej reakcji, przy czym tworzenie kompleksu enzym:ligand poprzedza nieodwracalną modyfikację enzymu. Badane związki różniły się powinowactwem do centrum aktywnego...
-
Extracellular secretion of Pseudoalteromonas sp. cold-adapted esterase in Escherichia coli in the presence of Pseudoalteromonas sp. components of ABC transport system
PublicationEnzymy lipolityczne, głównie lipazy i esterazy, stanowią cenną grupę biokatalizatorów wykorzystywanych w przemyśle. Coraz większe zainteresowanie tą klasą enzymów sprawiło, że poszukuje się alternatywnych źródeł ich pozyskiwania. W celu zbadania wpływu białek transportu ABC Pseudoalteromonas sp. 643A na ekspresję genu, sekrecję i aktywność esterazy EstA z tego mikroorganizmu w systemie ekspresyjnym E. coli skonstruowano układ do...
-
Synthesis of phosphono and phosphate derivatives of hydroxyimino-D-alditols as new potential antifungal agents
PublicationIn search for new effective we antyfungals we focus on two enzymes involved in biosynthesis of the fungal cell wall. The first enzyme is glucosamine-6-phosphate (GlmS), which catalyzes transformation of D-fructose-6-phosphate (Fru-6P) to D-glucosamine-6-phodphate (GlcN-6P) in the chitin biosynthesis pathway. The second enzyme is phosphomannose isomerase (PMI) repored to play a crucial role in biosynthesis of many mannosylated structures,...
-
The ability of new sugar-modified derivatives of antitumour anthracycline, daunorubicin, to stimulate NAD(P)H Oxidation in Different Cellular Oxidoreductase Systems: NADH Dehydrogenase, NADPH Cytochrome P450 Reductase, and Xanthine Oxidase.
PublicationUboczne działanie cytostatyków z grupy antracyklin prowadzi do uszkodzenia serca (kardiotoksyczność) w wyniku pośredniczenia przez te związki przeniesienia jednoelektronowego ze zredukowanych nukleotydów do tlenu i powstania reaktywnych anionorodników tlenowych. Proces ten jest katalizowany głównie przez trzy enzymy: dehydrogenazę NADH, reduktazę NADPH/cytochrom P450 oraz oksydazę ksantynową. W publikacji przedstawione są wyniki...
-
A cold-adapted esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. strain 643A
PublicationDzięki zastosowaniu lipaz możliwa jest biotechnologiczna produkcja m.in. biodegradowalnych biopolimerów, biopaliw (tzw. biodiesel), wielu terapeutyków, herbicydów, pestycydów, kosmetyków, substancji smakowych, serów i in. Szczególnie interesującą grupę stanowią enzymy lipolityczne, pochodzące z organizmów psychrofilnych i psychrotrofowych, ze względu na zdolność do wydajnego katalizowania reakcji w temperaturach rzędu 10-20 ºC....
-
Harman and norharman, metabolites of entomopathogenic fungus Conidiobolus coronatus (Entomopthorales), disorganize development of Galleria mellonella (Lepidoptera) and affect serotonin-regulating enzymes
Publication -
Siderofory bakteryjne – rola w patogenezie i potencjał wykorzystania w diagnostyce
PublicationDo prawidłowego funkcjonowania i wzrostu organizmów żywych zarówno ludzi, jak i bakterii niezbędne jest żelazo. Mikroelement ten występuje na dwóch różnych stopniach utlenienia: jako jon żelazawy (Fe2+) rozpuszczalny w roztworach fizjolo-gicznych oraz jako jon żelazowy (Fe3+), który nie tworzy roztworów wodnych [1]. Dzięki swoim właściwościom oksydo-redukcyjnym, żelazo wpływa na poprawne funkcjonowanie bardzo licznej grupy enzymów,...
-
C-1305 inactivation of recombinant human cytochrome P450, CYP1A2 and CYP3A4, is due to mechanism-based inhibition
PublicationPodjęto próbę określenia mechanizmu obserwowanej inhibicji izoenzymów CYP1A2 i CYP3A4 przez pochodną triazoloakrydonu C-1305.W pierwszym kroku stwierdzono, że hamowanie aktywnosci obu enzymów jest procesem nieodwracalnym. W kolejnych etapach badań wykazano między innymi, że obecność NADPH zwiększa istotnie stopień obserwowanej inhibicji, co wskazało, że mamy do czynienia z inhibicją samobójczą opartą na mechanizmie działania (ang....
-
In vitro enzyme kinetics and NMR-based product elucidation for glutathione S-conjugation of the anticancer unsymmetrical bisacridine C-2028 in liver microsomes and cytosol: major role of glutathione S-transferase M1-1 isoenzyme
PublicationThis work is the next step in studying the interplay between C-2028 (anticancer-active unsymmetrical bisacridine developed in our group) and the glutathione S-transferase/glutathione (GST/GSH) system. Here, we analyzed the concentration- and pH-dependent GSH conjugation of C-2028 in rat liver microsomes and cytosol. We also applied three recombinant human GST isoenzymes, which altered expression was found in various tumors. The...
-
Tunable properties of ionic liquids in supported ionic liquid membranes technology
PublicationImmobilizowane membrany ciekłe są układem, gdzie ciecz osadzona jest w porach porowatego nośnika i jest tam utrzymywana przez siły kapilarne. Takie rozwiązania wykazują wiele zalet, jak zużycie niewielkich ilości fazy membranowej, niska lotność cieczy jonowych,. Efektywność separacji związków z użyciem membran ciekłych zależy głównie od właściwości fazy membranowej. Praca opisuje modyfikacje struktury cieczy jonowych, a zatem ich...