Filters
total: 374
-
Catalog
- Publications 230 available results
- Journals 1 available results
- Publishing Houses 2 available results
- People 31 available results
- Projects 22 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 3 available results
- e-Learning Courses 67 available results
- Events 4 available results
- Open Research Data 13 available results
Search results for: typowanie molekularne
-
Ilona Kołodziejska prof. dr hab. inż.
People -
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
Long-working-distance Raman system for monitoring of uPA ECR CVD process of thin diamond/DLC layers growth
PublicationW artykule przedstawiono konstrucję systemu optoelektronicznego do monitoringu ramanowskiego in-situ procesu μPA ECR CVD (ang.: Microwave Plasma Assisted Electron Cyclotron Resonance Chemical Vapour Deposition), stosowanego do osadzania cienkich warstw diamentowych i diamentopodobnych DLC. System ma budowę modułową i wyposażony jest w dedykowane sondy optyczne. Przedstawiono wyniki pomiarów testowych, potwierdzjące, że system posiada...
-
Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.
PublicationStruktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...
-
Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase
PublicationCentra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...
-
Maria Jolanta Milewska prof. dr hab. inż.
PeopleMaria Jolanta Milewska, po ukończeniu Technikum Chemiczno-Mechanicznego w Wąbrzeźnie (specjalizacja: przetwórstwo tworzyw sztucznych) kontynuowała naukę na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej. W 1979 r. zdobywa tytuł mgr inżyniera na kierunku Chemia, o specjalizacji Lekka Synteza Organiczna. Studium Doktoranckie PG ukończyła w 1984 r. W 1983 r została zatrudniona na macierzystym wydziale w Katedrze Chemii Organicznej, początkowo...
-
Barbara Becker prof. dr hab. inż.
People -
Early stage of critical clusters growth in phenomenological and Molecular Dynamic simulation models.
PublicationOpisano proces kondensacji pary wodnej w ujĘciu fenomenologicznymi dynamiczno-molekularnym. Wczesne fazy wzrostu klastra opisano w ramach klasycznej teorii Hertza-Knudsena. Obszernie przedstawiono wyniki symulacji dynamiczno-molekularnych zjawiska kondensacji pary wodnej z jednorodnej fazy gazowej (przebieg powstawania małych klastrów H2O i szybkość wzrostu klastrów ponadkrytycznych).
-
Tranzystory organiczne
PublicationW artykule przedstawiono budowę, zasady działania i niektóre podstawowe charakterystyki organicznych tranzystorów polowych w oparciu o przegląd najnowszych publikacji naukowych dotyczących tematu. Omówiono tranzystory cienkowarstwowe TFT i typu SIT wykonane uproszczoną technologią z elastycznych i częściowo uporządkowanych materiałów organicznych. Zwrócono uwagę na koncepcję tranzystora molekularnego.
-
Organiczne baterie słoneczne ze zdyspergowanym złączem na bazie polimerów półprzewodnikowych o wąskiej przerwie energetycznej
PublicationPrzeprowadzono badania nad zwiększeniem wydajności prądowej organicznych baterii słonecznych ze złączem objętościowym, zbudowanych z syntetycznych polimerów półprzewodnikowych, posiadających rozległe wiązania π-sprzężone i charakteryzujących się długofalową granicą absorpcji optycznej. Przeanalizowano wpływ domieszek typu n i zmiany materiału katody na molekularny proces transferu nośników ładunku w złączu. Przeprowadzono pomiary...
-
Maritime awareness and emergency management real time system using remotely accessible GIS technology
PublicationPrzedstawiono koncepcję oraz prototyp morskiego GIS do zdalnego monitorowania w czasie rzeczywistym zanieczyszczeń środowiska morskiego. System pozwala na gromadzenie i integrowanie różnych typów danych dotyczących zanieczyszczeń, pozyskiwanych na bieżąco za pomocą wielorakiego rodzaju sensorów, w tym akustycznych (echosondy jednowiązkowe i wielowiązkowe). Zadaniem systemu jest wizualizacja oraz mapowanie zanieczyszczeń, takich...
-
Toward Mechanosynthesis of Diamondoid Structures: VI. Quantum-Chemical Molecular Dynamics Comparison of Conditions for the STM Tip Driven Mechanosynthesis on Hydrogenated Si(111), Si(110) and Si(100) Surfaces.
Publicationmożliwość prototypowania przejściowych generacji nano-urządzeń otrzymanych drogą pozycjonowanej mechanosyntezy za pomocą stm wyposażonego w ostrze typu swcnt są analizowane metodą kwantowo-chemicznej dynamiki molekularnej. proponowana strategia syntezy polega na insercji atomów si oraz cząsteczek sih2 we wiązania si-h na uwodornionej powierzchni si(111), si(110) oraz si(100) kryształu krzemu. rezultaty modelowania sugerują, że...
-
Pre-clinical evaluation of 1-nitroacridine derived chemotherapeutic agent that has preferential cytotoxic activity towards prostate cancer
PublicationPraca zawiera wyniki badań przedklinicznych pochodnej 1-nitroakrydyny C-1748 wobec komórek ludzkiego raka prostaty CaP in vitro, jak i przeszczepialnego na zwierzęta. W oparciu o fosforylację histonu H2AX jako markera podwójnych cięć DNA wykazano, że C-1748 jest bardziej aktywny w komórkach CaP niż HL60. Zidentyfikowano poza tym receptor androgenny (AR) jako cel molekularny badanego związku. W doświadczeniach na zwierzętach stwierdzono...
-
Lucyna Holec-Gąsior dr hab. inż.
People -
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublicationW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
Fizyka molekularna dla IBM 2022/23
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z podstawowymi zagadnieniami fizyki oraz biofizyki molekularnej. Kurs przeznaczony jest dla studentów studiów II stopnia kierunku Inżynieria Biomedyczna.
-
Diagnostyka biochemiczna i molekularna chorób tarczycy
e-Learning Courses -
Fotofizyka i podstawy spektroskopii molekularnej 2023
e-Learning CoursesKurs wspierający zajęcia z przedmiotu "Fotofizyka i podstawy spektroskopii molekularnej", który realizowany jest ze studentami I stopnia kierunku Nanotechnologia, sem. 7.
-
Fizyka molekularna dla IBM 2023/24
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z podstawowymi zagadnieniami fizyki oraz biofizyki molekularnej. Kurs przeznaczony jest dla studentów studiów II stopnia kierunku Inżynieria Biomedyczna.
-
Mykologia i parazytologia molekularna 2023/2024
e-Learning Courses -
Elektronika molekularna dla IM 2022/23
e-Learning CoursesKurs jest przeznaczony dla studentów studiów stacjonarnych II stopnia sem.2, kierunku Inżynieria Materiałowa. Tematyka kursu dotyczy podstawowych zagadnień elektroniki molekularnej. Kurs zawiera prezentacje do wykładu oraz materiały uzupełniające.
-
(3,5-Dimethylpyridine)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato)cadmium(II)
PublicationTytułowy związek jest molekularnym, heteroleptycznym tiolanem kadmu zawierającym jako dodatkowy ligand 3,5-dimetylopirydynę. Jon kadmu(II) znajduje się w centrum bipiramidy o podstawie trójkątnej, utworzonej przez 5 atomów - 2 atomy siarki, 2 atomy tlenu i jeden atom azotu. Między cząsteczkami kompleksu upakowanymi w krysztale nie ma oddziaływań innych niż oddziaływania van der Waalsa.
-
Voriconazole and multidrug resistance in Candida albicans
PublicationPorównano aktywność grzybostatyczną in vitro worikonazolu, flukonazolu, ketokonazolu i klotrimazolu wobec opornych na flukonazol szczepów klinicznych Candida albicans oraz rekombinowanych szczepów Saccharomyces cerevisiae eksprymujących jeden z genów kodujących białka oporności wielolekowej (MDR) C. albicans: Cdr1p. Cdr2p lub CaMdr1p. Stwierdzono, że nadekspresja genów MDR czyni komórki drożdżaków mniej wrażliwymi na działanie...
-
Komputerowy model 3D stawu biodrowego
PublicationW pracy przedstawiono stworzony w programie ANSYS komputerowy model 3D stawu biodrowego. Model wykonano w oparciu o budowę anatomiczną oraz zebrane dane dotyczące stałych materiałowych kości i elementów chrzęstnych. Analiza i porównanie modelu biochemicznego, lepkosprężystego, mieszanego oraz molekularno – agregacyjnego służy ułatwieniu stworzenia modelu najbliższego rzeczywistości, który można by wykorzystać w projektowaniu endoprotez...
-
Inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase as potential antifungal drugs.
PublicationPrzedstawiono stan obecny i perspektywy zastosowania inhibitorów enzymu syntazy GlcN-6-P jako leków skutecznych w leczeniu grzybic układowych. Używając metod modelowania molekularnego zaprojektowano struktury inhibitorów enzymu należących do dwóch grup strukturalnych: analogów glutaminy oraz analogów stanu przejściowego reakcji katalizowanej przez enzym. Opracowano metody syntezy pochodnych zoptymalizowanych inhibitorów, wykazujących...
-
Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period.
PublicationAnaliza genetyki populacji i określenie powiązań filogenetycznych pomiędzy szczepami może być niezwykle użytecznym podejściem w określaniu rozprzestrzeniania się wzorów genetycznych różnych gatunków bakterii na potrzeby epidemiologiczne. Nie ma danych, które opisywałyby długoterminowe sytuacje epidemiologiczne powodowane przez wielolekooporne, oportunistyczne szczepy Klebsiella oxytoca metodami molekularnymi. Celem przedstawionych...
-
Modyfikacje polimeraz DNA jako rozwiązania problemów w reakcjach PCR
PublicationReakcja PCR już od wielu lat jest podstawowym narzędziem stosowanym w biotechnologii molekularnej. Nadal napotykamy jednak liczne problemy podczas jej przeprowadzania związane z trudnymi matrycami, obecnością inhibitorów itp. Optymalizacja reakcji PCR jest więc niezbędna w celu poprawy wyników. Jednym z rozwiązań tych problemów może być modyfikowanie polimeraz DNA. W powyższym artykule opisano problemy i rozwiązania zależne polimerazy...
-
Analysis of mixing rules for the Stillinger-Weber potential: a case study of Ge-Si interactions in the liquid phase
PublicationCiekły stop Ge_{0.25}Si_{0.75} symulowano metodą dynamiki molekularnej, przy użyciu potencjału Stillingera-Webera. Badano wpływ parametryzacji członu potencjału odpowiedzialnego za oddziaływania trójciałowe w trójkach nieidentycznych atomów na strukturę symulowanego stopu. Wpływ ten okazał się być znaczący.Zmiany w parametrach rzędu kilku procent skutkowały istotnymi różnicami w parowych funkcjach rozkładu, kątowych funkcjach rozkładu...
-
Raman system for on-line monitoring and optimisation of hybrid polymer gelation
PublicationW artykule przedstawiono system do monitorowania ramanowskiego reakcji żelowania w procesie zol-żel syntezy organiczno-nieorganicznych polimerów hybrydowych. System pomiarowy umożliwił wykonywanie pomiarów zdalnych, bez wkonieczności wprowadzania jego elementów do wnętrza komory reakcyjnej. Konstrukcja systemu zapewniła szeroki zakres pomiarowy od 200 do 3500 cm-1, przy odpowiednio wysokiej czułości i wyeliminowniu wpływu fluorescencji....
-
Crystal and molecular structure of lithium iodide complex of 13-membered azoxycrown ether
PublicationPublikacja zawiera uzupełniające informacje do znalezionej wcześniej korelacji między typem kationu, rozmiarem makrocyklu i cechami struktury krystalicznej kompleksów a selektywnością elektrod membranowych dotowanych odpowiednimi azo- lub azoksykoronami. Ustalono strukturę krystaliczną i molekularną kompleksu 13-członowej azoksykorony (L13-O) z jodkiem litu. Stechiometria kompleksu jest 1:1. Kryształ zbudowany jest z hydratowanych...
-
Chemical reactivity and antimicrobial activity of N-substituted maleimides
PublicationZsyntezowano kilkanaście N-podstawionych maleimidów, zawierających w swojej strukturze podstawniki o różnej wielkości i polarności.Maleimidy o charakterze obojętnym wykazywały silny efekt przeciwgrzybowy; ich aktywność przeciwbakteryjna była zróżnicowana. Niską aktywność przeciwbakteryjną, ale wysoką aktywność cytostatyczną stwierdzono dla maleimidów o charakterze zasadowym. Reaktywność chemiczna i lipofilowość miały wpływ na aktywność...
-
Praktyczne Podstawy Modelowania Molekularnego - 2022
e-Learning CoursesPodstawowy kurs z modelowania molekularnego dla studentów biotechnologii obejmujący zarówno wykład jak i zajęcia laboratoryjne.
-
Praktyczne Podstawy Modelowania Molekularnego - 2023
e-Learning CoursesPodstawowy kurs z modelowania molekularnego dla studentów biotechnologii obejmujący zarówno wykład jak i zajęcia laboratoryjne.
-
Praktyczne Podstawy Modelowania Molekularnego - 2024
e-Learning CoursesPodstawowy kurs z modelowania molekularnego dla studentów biotechnologii obejmujący zarówno wykład jak i zajęcia laboratoryjne.
-
Webinarium „Drug Discovery, Development & Commercialization”
EventsCTWT PG zaprasza na webinarium „Drug Discovery, Development & Commercialization”. Spotkanie skierowane jest do osób zajmujących się zawodowo lub planujących swoją karierę w dziedzinie opracowywania i rozwoju leków.
-
Cytochrome P450 izoenzymes involved in metabolism of antitumor 9-amino-1-nitroacridine derivatives, C-857, C-1748
PublicationPraca jest częścią szerszych badań zmierzających do poznania molekularnego mechanizmu metabolicznej transformacji przeciwnowotworowych pochodnych 9-amino-1-nitroakrydyny. W naszym zespole wyselekcjonowano pochodną nowej generacji, która w porównaniu z poprzednimi wykazała znacznie obniżoną toksyczność ogólną. W wyniku przeprowadzonych badań wykazaliśmy, że nowa pochodna jest znacznie mniej podatna na metabolizm katalizowany przez...
-
Analysis of spectral data by complementary methods. Inspection of the molecular complex in N,N-dimethylformamide - methanol mixtures
PublicationDane widmowe FTIR mieszanin N,N-dimetyloformamidu z metanolem poddano anlizie faktorowej oraz analizie metodą ważonych widm różnicowych. Przydatność obu metod analizy w odniesieniu do układów z wiązaniem wodorowym poddano krytycznej dyskusji. Stwierdzono obecność kompleksu molekularnego typu 1:1 w całym zakresie składów mieszanin. Forma tego kompleksu zależy jednak od składu roztworu. Postulowano występowanie słabych wiązań wodorowych...
-
Wojciech Sadowski prof. dr hab. inż.
PeopleWojciech Sadowski (born 2 February 1954 in Ostaszewo, Poland), scientist, engineer, professor at Gdansk University of Technology, specialist in solid state body physics, nanotechnology, optoelectronics. In 1973 he completed his high school education at High School Nicolaus Copernicus in Chelmno. In 1979 he graduate from Leningrad Electrotechnical Institute in Russia (former Soviet Union) with specialism in dielectrics and semiconductors....
-
ZzP - Biotechnologia wokól nas - Spotkanie Akademickie 17.04.2021 r.
e-Learning CoursesSpotkanie akademickie poświęcone będzie mikroorganizmom, które tak naprawdę są wszędzie. Nie widzimy ich gołym okiem, ale nawet bez oglądania możemy poznać ich niektóre, ważne dla nas cechy. Musimy tylko umieć je wyhodować, co wbrew pozorom, w przypadku większości gatunków mikroorganizmów, nie jest łatwe. Jednym z istotniejszych etapów pracy biologa molekularnego jest możliwość izolacji DNA danego organizmu, dlatego podczas zajęć...
-
ZzP - Mikroorganizmy wśród nas - Spotkanie Akademickie 14.11.2020 r.
e-Learning CoursesSpotkanie akademickie poświęcone będzie mikroorganizmom, które tak naprawdę są wszędzie. Nie widzimy ich gołym okiem, ale nawet bez oglądania możemy poznać ich niektóre, ważne dla nas cechy. Musimy tylko umieć je wyhodować, co wbrew pozorom, w przypadku większości gatunków mikroorganizmów, nie jest łatwe. Jednym z istotniejszych etapów pracy biologa molekularnego jest możliwość izolacji DNA danego organizmu, dlatego podczas zajęć...
-
DEVELOPMENT OF THE ALGORITHM OF POLISH LANGUAGE FILM REVIEWS PREPROCESSING
PublicationThe algorithm and the software for conducting the procedure of Preprocessing of the reviews of films in the Polish language were developed. This algorithm contains the following steps: Text Adaptation Procedure; Procedure of Tokenization; Procedure of Transforming Words into the Byte Format; Part-of-Speech Tagging; Stemming / Lemmatization Procedure; Presentation of Documents in the Vector Form (Vector Space Model) Procedure; Forming...
-
Charakterystyka preparatów beta- galaktozydazy z Sulfolobus shibatae.
PublicationCelem pracy było zbadanie przydatności cytoplazamatycznej beta- galaktozydazy/beta- glukozydazy z hipertermofilnego archeona Sulfolobus shibatae do hydrolizy laktozy. 16-krotny stopień oczyszczenia ekstraktu bezkomórkowego,zapewniający aktywność specyficzną 29,5 U/mg białka uzyskiwano poprzez frakcjonowanie siarczanem amonu, chromatografię jonowymienną i sączenie molekularne. Otrzymany preparat wykazywał największą aktywność...
-
Eugeniusz Kozaczka prof. dr hab. inż.
People -
MYKOLOGIA I PARAZYTOLOGIA MOLEKULARNA 2022/2023(PG_00039058)
e-Learning Courses -
Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) - sources and applicationsin molecular biology
PublicationBiałka wiążące się do jednoniciowego DNA (SSB) odgrywają ważną rolę w replikacji, rekombinacji i naprawie DNA u bakterii, archea i eukariota. Ostatnio wzrosło zainteresowanie białkami SSB jako przydatnymi narzędziami w metodach badawczych biologii molekularnej, analitycznych i diagnostycznych. Większość znanych prokariotycznych białek SSB zbudowanych jest z czterech podjednostek (homotetramer) z jedną domeną wiążąca (OB) jednoniciowe...
-
Metody genetycznej identyfikacji i numerycznej oceny skutków oddziaływań antropogenicznych, na wody podziemne obszarów o rozproszonej zabudowie
PublicationWody podziemne narażone są na różnego typu zanieczyszczenia, stając się zagrożeniem dla życia i zdrowia ludzi z nich korzystających. W ostatnich latach wzrosło zainteresowanie próbami zatrzymania lub odwrócenia stale postępującej degradacji środowiska przyrodniczego, wywołanej czynnikami pochodzenia antropogenicznego. Skuteczność podjętych działań w ramach rekultywacji, zabezpieczenia i ochrony gruntów oraz zasobów naturalnych...
-
Wykorzystanie zespolonej pulsacji chwilowej do ślepej synchronizacji symbolowej sygnałów QPSK
PublicationIzochronicznie nadawane i synchronicznie odbierane sygnały QPSK (z ang. Quadrature Phase-Shift Keying) dominują w dzisiejszej radiowej i przewodowej telekomunikacji cyfrowej. Poprawne działanie odbiornika sygnałów QPSK wymaga skomplikowanego systemu synchronizacji poszczególnych etapów odbioru. W skład systemu synchronizacji odbiornika wchodzi odtwarzanie częstotliwości i fazy sinusoidy (fali) nośnej oraz wyznaczanie chwil próbkowania...
-
Protokół SOAP i jego zastosowanie.
PublicationW pracy przedstawiono zasadę działania i organizację protokołu SOAP, który w chwili obecnej może być uważany za jeden z najważniejszych standardów w systemach rozproszonych. Zaprezentowano genezę powstania protokołu i jego współczesne zastosowania ze szczególnym uwzględnieniem problemów przenośności. Ponadto opisano formaty wiadomości i modele przesyłania danych w SOAP. Protokół, podobnie jak niemal wszystkie technologie informatyczne,...
-
Ochrona metalowego podłoża ekologicznymi powłokami lakierowymi. Optymalizacja i prognozowanie składu
PublicationPrzeprowadzono badania wodnych farb antykorozyjnych zawierających nietoksyczne pigmenty i spoiwa o różnej budowie chemicznej. Badano wpływ rodzaju spoiwa, pigmentu i wypełniacza oraz poziomu pigmentacji na strukturę powłoki (porozymetria rtęciowa, DMTA) i właściwości ochronne (badania w komorach korozyjnych, EIS, SVET). Na podstawie wyników badań stwierdzono, że właściwości ochronne powłok zależą w istotny sposób od budowy chemicznej...
-
Dynamiczna spektroskopia impedancyjna w mikroskopowej analizie powierzchni metalicznych
PublicationW pracy przedstawiono możliwość zastosowania dynamicznej spektroskopii impedancyjnej do pomiaru lokalnej impedancji z wykorzystaniem mikroskopu AFM. Kontakt sondy mikroskopu z próbką jest układem dynamicznym, który ulega ciągłym zmianom. Skanowanie powierzchni, zmiana docisku sondy, czy nawet dryft skanera piezoelektrycznego powodują zmianę geometrii kontaktu sonda-próbka. W związku z tym klasyczna odmiana pomiaru impedancji...