Search
Katedra Biotechnologii i Mikrobiologii
Publications
Filters
total: 529
Catalog Publications
Year 2010
-
Application of recombinant antigens in serodiagnosis of swine toxoplasmosis and prevalence of Toxoplasma gondii infection among pigs in Poland
PublicationNiniejsza praca przedstawia częstość występowania toksoplazmozy w populacji świń obejmującej 1754 osobników pochodzących z różnych regionów Polski, która określona została z wykorzystaniem testu IgG ELISA opartego na antygenie natywnym pasożyta. Specyficzne przeciwciała anty-T. gondii klasy IgG zostały wykryte u 19,2% zwierząt z testowanej grupy. Ponadto w pracy oszacowano użyteczność diagnostyczną w rozpoznawaniu toksoplazmozy...
-
Changes in rheological properties during anaerobic digestion of activated sludge
PublicationWykonane pomiary właściwości reologicznych osadwo nadmiernych poddawanych procesowi dezintegracji mechanicznej wskazują na znaczny spadek lepkości sięgający 60%. Wraz ze stopniem dezintegracji rosły również właściwości pseudoplastyczne oraz malała granica płynięcia. Podobnie istotne zmiany właściwosci reologicznych nastepowały w osadach poddawanych fermentacji metanowej.
-
Colloidal aspects of protein digestion
Publication.
-
Conservation and diversity of MutS proteins
PublicationThe homologues of MutS, mismatch repair protein, exist in all prokaryotes, with the exception of Actinobacteria, Mollicutes and part of the Archaea. Multiple alignments of 316 MutS amino acid sequences from 169 species revealed conserved residues and sequence motifs distinguishing MutS homologues. All MutS homologues show high conservation within the ATPase domain. MutS1, the homologue responsible for DNA mismatch recognition,...
-
Decomposition of xenobiotics in wastewater treatment
PublicationCiecze jonowe ze względu na rozpuszczalność w wodzie mogą przyczynić się do jej zanieczyszczenia. Możliwość ich biodegradacji nie jest dokładnie zbadana. W niniejszej pracy podjęto próbę sprawdzenie, jak na proces biodegradacji cieczy jonowych wpłynie obecność innych, łatwiej dostępnych dla osadu czynnego, źródeł węgla i azotu. Ponadto podjęto próbę ustalenia górnej granicy stężeń dla biodegradowalności chlorku 1-metylo-3-oktyloimidazolu
-
Diagnostic PCR tests for Microsporum audouinii, M. canis and Trichophyton infections
PublicationSince traditional diagnosis of dermatophyte infections is slow, we present a rapid new pcr test for detection of trichophyton spp., microsporum canis and m. audouinii infections. the performance of the test was evaluated with: 58 dermatophyte isolates; 10 yeast, mould and human dna control samples; 25 routine specimens from patients suspected of having dermatophytosis; 10 hair specimens from guinea pigs experimentally infected...
-
Effect of neoteric solvents on the activated sewage sludge activity
PublicationCiecze jonowe (ILs) cieszą sie rosnącym zainteresowaniem z uwagi na fakt, iż znajdują coraz więcej zastosowań jako alternatywa dla rozpuszczalników organicznych. W związku z zaistnieniem możliwości zastosowania ILs w nowych czystych technologiach nastała potrzeba zbadania ich toksyczności w stosunku do organizmów żywych i środowiska. Celem badań było oszacowanie wpływu cieczy jonowych na wyselekcjonowane mikroorganizmy osadu czynnego....
-
Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale
PublicationW celu identyfikacji źródła infekcji spowodowanych przez dermatofity, jak i drogi ich transmisji, istnieje potrzeba szukania nowych metod, które pozwolą na głębokie zróżnicowanie genetyczne szczepów w obrębie rodzaju. W pracy po raz pierwszy pokazano zastosowanie techniki PCR MP opartej o adaptory oligonukleotydowe i różnice w temperaturze topnienia fragmentów restrykcyjnych DNA w reakcji PCR do wewnątrzgatunkowego typowania dermatofitów....
-
Experimental study of the variations of the freezing points of ionic liquids in water
PublicationTemperatura zamarzania czystych soli alkiloimidazoliowych zawiera się w przedziale od - 70ºC do - 90ºC zależnie od długości podstawinika alkilowego oraz od rodzaju anionu. Celem niniejszej pracy jest znalezienie odpowiedniej metody pomiaru zmian temperatury zamarzania chlorku 1-metylo-3-oktyloimidazolu w wodzie. Wynik przeprowadzonych badań pozwolił na sporządzenie fragmentu diagramu fazowego dla wodnego roztworu chlorku...
-
Genetic and lifestyle variables associated with homocysteine concentrations and the distribution of folate derivatives in healthy premenopausal women
Publication -
Introduction to Green Chemistry, by Albert Matlack
PublicationTemat tzw. ''zielonej chemii'' zyskuje coraz większą uwagę dlatego też wiekszośc uczelni skupia się na jego znaczeniu. Media coraz częściej podejmują ten temat i dzięki temu następuje powolny ale stopniowy wzrost świadomości społeczeństwa dlatego też skomentowana ksiązka wypełnia pustkę w klasycznej literaturze chemicznej.
-
Ionic liquids - greener solvents or environmental threat?
PublicationZe względu na niemierzalnie niską prężność par ciecze jonowe były uważane za 'zielone rozpuszczalniki'. Ich zastosowanie w technologiach (bio)chemicznych przynosi korzyści nie tylko ekologiczne ale również ekonomiczne. Niemniej jednak zanieczyszczenie środowiska poprzez przedostanie się cieczy jonowych do gleb i wód gruntowych wraz ze ściekami/odciekami przemysłowymi lub w wyniku przypadkowych rozlewów stanowi realne zagrożenie....
-
Materials for potentiometric electrochemical gas sensors
PublicationPublikacja przeglądowa na temat zasady działania oraz rodzajów czujników elektrochemicznych gazów.
-
Nano - and microcrystals of doped niobates
PublicationPublikacja przedstawia wyniki analizy pomiarów wysokotemperaturowej rentgenografii strukturalnej niobanu lantanu domieszkowanego magnezem.
-
Prawidłowe rozpoznanie toksoplazmozy u kobiet ciężarnych - ważność badań diagnostycznych oraz nowe możliwości
PublicationArtykuł opisuje problem toksoplazmozy, kliniczne objawy choroby, leczenie, aktualną diagnostykę oraz nowe możliwości testów diagnostycznych. Ponadto, przedstawiono istotne zagadnienia obejmujące aktualnie prowadzone badania naukowe, które dotyczą zastosowania nowych narzędzi diagnostycznych (rekombinantowych antygenów T. gondii) w serodiagnostyce toksoplazmozy.
-
Rapid test for ionic liquids toxicity evaluation
PublicationW literaturze przedmiotu dostępne są dane na temat toksyczności cieczy jonowych, szczególności tych mających zastosowanie przemysłowe, gdzie toksyczność wyrażana jest jako EC50 mierzone względem konkretnego organizmu np. Vibrio fischeri, Daphnia magna itp. Z uwagi na taksonomiczne zróżnicowanie osadu czynnego nie jest możliwe bezpośrednie wnioskowanie na temat toksyczności cieczy jonowych w stosunku do osadu czynnego na podstawie...
-
Review on electrolyte ceramic materials for fuel cells
PublicationPublikacja stanowi przegląd materiałów wykorzystywanych w tlenkowych ogniwach paliwowych ze szczególnym uwzględnieniem materiałów elektrolitowych.
-
Structure and electric properties of double magnesium zirconium orthophosphate
PublicationPublikacja przedstawia wyniki pomiarów elektrycznych i strukturalnych ortofosforanu magnezowo-cyrkonowego.
-
Structure and electrical properties of ceramic proton conductors obtained with molten-salt and solid-state synthesis methods
PublicationPublikacja omawia wyniki badań niobanu lantanu domieszkowanego akceptorowo pod kątem właściwości elektrycznych i strukturalnych.
-
Structure modification of acridine antitumor agents results in changes of enzymatic activity and gene expression of CYP3A4 isoenzyme in HepG2 cells.
PublicationEkspresja izoenzymu CYP3A4, który zaangażowany jest w metabolizm ok. 60% leków stosowanych klinicznie, może być modulowana przez takie czynniki jak: polimorfizm, czynniki transkrypcyjne oraz obecność ksenobiotyków. Przykładem induktorów genów kodujących izoenzym CYP3A4 jest fenobarbital i rifampicyna, których obecność w organizmie przyspiesza metabolizm innych leków stosowanych jednocześnie, które są substratami dla CYP3A4. Dlatego...
-
Structuring of Emulsions by Tailoring the Composition of Crystalline Emulsifier
Publication -
The antitumor derivative, C-1748, affects CYP3A4: crosstalk between drug metabolism, CYP3A4 expression and enzymatic activity
PublicationJedną z głównych przeszkód w przewidywaniu wyników terapii u pacjentów z nowotworem jest indywidualny przebieg metabolizmu stosowanych leków wynikający z polimorfizmu genów enzymów metabolizujących, jak również duża zmienność farmakokinetyki leków obserwowana u różnych pacjentów podczas trwania chemioterapii. Z powodu tzw. ''wąskiego okna terapeutycznego'' występującego w przypadku terapii lekami przeciwnowotworowymi, małe zmiany...
-
The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains
PublicationBiogeneza fimbrii Dr kodowanych przez operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli (infekcje górnych dróg moczowych) odbywa się na bazie zakonserwowanego systemu sekrecji typu chaperone-usher. Funkcjonowanie powyższego systemu sekrecji opiera się na dwóch komponentach białkowych, periplazmatycznym chaperonie DraB i zewnątrzbłonowym kanale DraC. Białko DraB kontroluje proces składania podjednostek fimbrialnych DraE, natomiast...
-
The immune responses of sheep after DNA immunization with Toxoplasma gondii MAG1 antigen - with and without co-expression of ovine interleukin 6
PublicationW niniejszej pracy porównano odpowiedź immunologiczną owiec, którym podano domięśniowo plazmid DNA zawierający gen kodujący białko macierzy cyst tkankowych (MAG1) Toxoplasma gondii - pojedynczo bądź z DNA plazmidu kodującego owczą interleukinę 6 (IL-6). Dzięki wykorzystaniu plazmidu zawierającego gen mag1 odnotowano podwyższony poziom przeciwciał IgG1 oraz IgG2 w surowicach szczepionych zwierząt.
-
The immune responses of sheep after DNA immunization with, Toxoplasma gondii MAG1 antigen—with and without co-expression of ovine interleukin 6
Publication -
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublicationAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...
-
The transcobalamin (TCN2) 776C>G polymorphism affects homocysteine concentrations among subjects with low vitamin B12 status
Publication -
Toxoplasma gondii: Recombinant GRA5 antigen for detection of immunoglobulin G antibodies using enzyme-linked immunosorbent assay
PublicationW publikacji po raz pierwszy oszacowano przydatność diagnostyczną antygenu rekombinantowego GRA5 Toxoplasma gondii do serodiagnostyki toksoplazmozy u ludzi. Do celu wykorzystano pulę surowic pochodzącą od 189 pacjentów chorych na toksoplazmozę wczesną, podostrą i przewlekłą oraz od 31 pacjentów zdrowych , które testowano z wykorzystaniem metody ELISA. Specyficzne przeciwciała anty-GRA5 klasy IgG wykryto w 70,9% surowic seropozytywnych....
-
Toxoplasma gondii: Usefulness of ROP1 recombinant antigen in an immunoglobulin G avidity assay for diagnosis of acute toxoplasmosis in humans
PublicationWyniki zawarte w niniejszej pracy pokazują, iż antygen rekombinantowy ROP1 Toxoplasma gondii może być użyteczny w wykrywaniu wczesnej fazy toksoplazmozy z zastosowaniem testu oznaczania awidności przeciwciał klasy IgG. W przeprowadzonych badaniach wykazano, że specyficzne przeciwciała o niskiej awidności były wykrywane w surowicach pacjentów z wczesną fazą choroby, natomiast przeciwciała o wysokiej awidności lub ich brak notowano...
-
Typing of Candida isolates from patients with invasive infection and concomitant colonization
PublicationWe investigated the relationship between colonizing and invasive isolates from patients with candidaemia. Molecular typing was performed using random amplification of polymorphic DNA (RAPD) and multilocus sequence typing (MLST). We found MLST to be sufficient for typing Candida isolates, and that surveillance cultures are helpful in predicting concomitant invasive isolates, but not necessarily the pathogen involved in subsequent...
-
Wpływ metody syntezy na właściwości wybranych przewodników jonowych
PublicationPublikacja przedstawia wyniki pomiarów przewodników jonowych syntezowanych różnymi metodami.
Year 2009
-
1-Methyl-3-octylimidazolium Chloride − Sorption and Primary Biodegradation Analysis in Activated Sewage Sludge
PublicationCiecze jonowe są nielotne i z tego względu nie przedostają się do atmosfery, jednakże mogą zanieczyszczać wodę i gleby. Badania sposobów redukcji stężenia cieczy jonowych w środowisku jest istotne ze względu na rosnące zapotrzebowanie na biodegradowalne związki chemiczne. Ustalono, że górny limit stężeń dla pierwotnej biodegradacji chlorku 1-metylo-3-oktyloimidazolu wynosi 0.2 mM. Powyżej tego stężenia aktywność dehydrogenaz znacząco...
-
A cryptic ribosome binding site, false signals in reporter systems and avoidance of protein translation chaos
PublicationThe expression of reporter gene may be induced by activation of cryptic signalling sequences, as we found while constructing the mutS-lacZ fusion gene. We cloned the Escherichia coli lacZ gene encoding beta-galactosidase into a plasmid vector carrying the Thermus thermophilus mutS gene. The clones expected to produce beta-galactosidase as the C-terminal fusion were selected for the complementation of beta-galactosidase activity...
-
A new B-D-galactosidase with a low temperature optimum isolated from the Antarctic Arthrobacter sp. 20B: gene cloning, purification and characterization.
PublicationA psychrotrophic bacterium producing a coldadaptedB-galactosidase upon growth at low temperatureswas classiWed as Arthrobacter sp. 20B. A genomic DNAlibrary of strain 20B introduced into Escherichia coliTOP10F' and screening on X-Gal (5-bromo-4-chloro-3-indolyl-B-D-galactopyranoside)-containing agar plates ledto the isolation of B-galactosidase gene. The B-galactosidasegene (bgaS) encoding a protein of 1,053 amino acids,with a...
-
A new cold-adapted beta-D-galactosidase from the Antarctic Arthrobacter sp. 32c - gene cloning, overexpression, purification and properties
PublicationThe development of a new cold-active β-D-galactosidases and microorganisms that efficiently ferment lactose is of high biotechnological interest, particularly for lactose removal in milk and dairy products at low temperatures and for cheese whey bioremediation processes with simultaneous bio-ethanol production. In this article, we present a new β-D-galactosidase as a candidate to be applied in the above mentioned biotechnological...
-
An MTA-phosphorylase gene discovered in the metagenomic library derived from Antarctic top soil during screening for lipolytic active clones confers strong pink fluorescence in the presence of rhodamine B.
PublicationIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichiacoli using the pUC19 vector and environmental DNA directly isolated fromAntarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. Unexpectedly, the screeningon agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one unusual pinkfluorescent clone (PINKuv) out of 85 000 clones. This clone harbored a plasmid,pPINKuv, which has an insert of 8317 bp that...
-
Badania epidemiologiczne populacji kobiet gminy Przodkowo w kierunku toksoplazmozy
PublicationW pracy przedstawiono badania dotyczące rozpowszechnienia toksoplazmozy wśród grupy kobiet w wieku 12-81 lat zamieszkujących teren typowej wiejskiej gminy Przodkowo w województwie pomorskim. Analizowano częstość występowania specyficznych przeciwciał IgG i IgM anty-Toxoplasma gondii oraz awidność przeciwciał IgG w tej grupie społecznej.
-
Badanie solubilizacji mieszanin weglowodorów jako jednego z mechanizmów remediacji zaolejonych gruntów
PublicationPrzeprowadzono badania solubilizacji mieszanin węglowodorów (dekan, dodekan, tetradekan, heksadekan; oktan, oktadekan; dodekan, toluen) w wodnych roztworach micelarnych surfaktantów niejonowych (Rokanol NL6, Triton BG10, AG 6210) oraz ich mieszanin. Solubilizacja najbardziej efektywnie zachodziła w roztworach Rokanolu NL6. Zaobserwowano dwukrotny spadek efektywności procesu solubilizacji wraz ze wzrostem długości łańcucha węglowodoru...
-
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
PublicationInfekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...
-
Characterization of a cryptic plasmid pSFKW33 from Shewanella sp. 33b
PublicationA cryptic plasmid pSFKW33 from psychrotrophic bacterium Shewanella sp. 33B, an isolate from the Gulf of Gdansk (the Baltic Sea), was sequenced and characterized. It is an 8021 bpcircular molecule with 38% GC content, which shows a distinctive nucleotide sequence without homology to other known plasmids. The nucleotide sequence analysis predicts eight open reading frames. The deduced amino acid sequence of ORF-1 shared significant...
-
Current status of toxoplasmosis vaccine development
PublicationToksoplazmoza, choroba wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest szeroko rozpowszechniona na całym świecie. Zarażenie tym pasożytem stanowi bardzo poważny problem medyczny i weterynaryjny, ponieważ jest przyczyną ciężkiej wrodzonej postaci choroby (tzw. toksoplazmozy wrodzonej) oraz poronień, które dotyczą zarówno ludzi jak i zwierząt domowych. Toksoplazmoza może mieć także ciężki przebieg u osób upośledzoną...
-
Diagnostic PCR assay for Microsporum and Trichophyton infections
PublicationWe have previously described a highly sensitive 5-hour PCR test for the rapid diagnosis of onychomycosis which detects any dermatophyte and species-identify T. rubrum from patient specimens. We have subsequently developed and evaluated new PCR tests for detection of Trichophyton and Microsporum canis/audouinii infections.58 dermatophyte isolates (21) Microsporum spp. (4 different species), 35 Trichophyton spp (10 different species)...
-
Effect of crystalline emulsifier composition on structural transformations of water-in-oil emulsions: Emulsification and quiescent conditions
Publication -
Emulsification alters simulated gastrointestinal proteolysis of β-casein and β-lactoglobulin
PublicationWe have studied the effect of the adsorption of milk proteins at the oil-water interface on their digestibility in simulated gastrointestinal environment. The investigations aimed to characterize how both the breakdown of the adsorbed proteins and the interactions with physiological surfactants, phosphatidylcholine (PC) and bile salts (BS), influence structural transformations of model, protein-stabilized food emulsions in the...
-
Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital
PublicationZakażenia układu moczowego (UTIs - ang. urinary track infections) są jedną z najczęstszy infekcji, za które w 85% przypadków odpowiedzialne są bakterie Escherichia coli. Infekcje układu moczowego mogą prowadzić do groźnych powikłań m. in. odmiedniczkowego zapalenia nerek. Śmiertelność wśród tej grupy pacjentów wynosi 1-3%. Zakażenia układu moczowego występują również u ok. 7% kobiet ciężarnych. W pracy przebadano 82 szczepy E....
-
GRA2 and ROP1 Recombinant Antigens as Potential Markers for Detection of Toxoplasma gondii -Specific Immunoglobulin G in Humans with Acute Toxoplasmosis
Publication -
GRA2 and ROP1 recombinant antigens as potential markers for detection of Toxoplasma gondii-specific immunoglobulin G in humans with acute toxoplasmosis.
PublicationArtykuł przedstawia oszacowanie przydatności w serodiagnostyce toksoplazmozy dwóch rekombinatowych białek antygenowych GRA2 i ROP1 Toxoplasma gondii. Białka rekombinantowe otrzymano z wykorzystaniem bardzo wydajnego, bakteryjnego systemu ekspresyjnego, który pozwolił na otrzymanie miligramowych ilości antygenów z 1 litra hodowli po zastosowaniu jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa. Użyteczność diagnostyczna...
-
Identification and molecular modeling of a novel lipase from an Antarctic soil metagenomic library.
PublicationIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichia coli using pUC19 vector and environmental DNA directly isolated from Antarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. The screening on agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one clone with lipolytic activity (Lip1) out of 11,000 E. coli clones. This clone harbored a plasmid, pLip1, which has an insert of 4722 bp that has been...
-
Interaction of imidazolium type ionic liquids with the solid phase
PublicationNiektóre ciecze jonowe, w szczególności te posiadające kation organiczny podstawiony długim łańcuchem alkilowym, wykazują strukturalne podobieństwo do surfaktantów. Samoczynne formowanie się agregatów cieczy jonowych może wpływać na procesy przenoszenia masy w wielu operacjach jednostkowych jak: ekstrakcja, nanofiltracja lub kataliza oraz transport i rozmieszczenie tych związków w środowisku naturalnym. W niniejszej publikacji...
-
Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń dermatofitowych
PublicationGrzyby należące do rodzajów Microsporum, Trichophyton i Epidermophyton są główną przyczyną powierzchownych zakażeń grzybiczych. Klasyczna identyfikacja gatunkowa czynnika etiologicznego tych grzybic oparta na obserwacjach mikro- i makroskopowych możliwa jest dopiero po uzyskaniu czystej hodowli dermatofitów. W związku z powolnym tempem wzrostu jest ona możliwa po dwóch, trzech tygodniach po pobrania próbki. Molekularne metody diagnostyczne...