prof. dr hab. inż. Jan Mazerski
Zatrudnienie
Publikacje
Filtry
wszystkich: 51
Katalog Publikacji
-
Svalbard reindeer as an indicator of ecosystem changes in the Arctic terrestrial ecosystem
PublikacjaOver the years, noticeable effort has been directed towards contaminant determination in multiple biotic samples collected from the inhabitants of the Arctic. Little consideration has been given to polar herbivores, however, especially those from the European parts of the Arctic. To provide a broader perspective, we aimed to decipher trace element concentration in hairs of the key species in the Arctic, namely the Svalbard reindeer...
-
Biological responses to environmental contamination. How can metal pollution impact signal honesty in avian species?
PublikacjaEnvironmental pollution, for example with metals, can significantly affect the ecosystem balance leading to severe changes. Biologically active pigments are relevant for the appearance and condition of birds. Melanin and carotenoid particles are the most frequently deposited pigments in avian integument. They are responsible for the majority of colors of bird plumage. The phenotypic expression can be affected by metal contamination....
-
Intercalation complex of imidazoacridinone C-1311, a potential anticancer drug, with DNA helix d(CGATCG)2: stereostructural studies by 2D NMR spectroscopy.
PublikacjaImidazoacridinone C-1311 (Symadex®) is a powerful antitumor agent, which successfully made its way through the Phase I clinical trials and has been recommended for Phase II few a years ago. It has been shown experimentally that during the initial stage of its action C-1311 forms a relatively stable intercalation complex with DNA, yet it has shown no base-sequence specificity while binding to DNA. In this paper, the d(CGATCG)2:C-1311...
-
Molecular basis of the low activity of antitumor anthracenediones, mitoxantrone and ametantrone, in oxygen radical generation catalyzed by NADH dehydrogenase. Enzymatic and molecular modelling studies
PublikacjaSyntetyczne antracenodionowe leki przeciwnowotworowe, w przeciwieństwie do antybiotyków antracyklinowych, charakteryzują się słabym wytwarzaniem wolnych rodników w układach z dehydrogenazą NADH. Wyniki prezentowane w artykule wskazują, że ani potencjał redukcyjny, ani konformacja łańcuchów bocznych, ani energie orbitali granicznych (LUMO i HOMO) nie determinują zdolności antracenedionów do stymulacji wytwarzania reaktywnych form...
-
Solvation of N-methylformamide by ethanol: a comparison of molecular dynamics calculations with the experimental data
PublikacjaWykonano obliczenia metodami dynamiki molekularnej dla tytułowego układu. Rezultaty porównano z uzyskanymi wcześniej wynikami pomiarów termodynamicznych oraz wnioskami z nich wyciągniętymi.
-
C-1311 (Symadex), a potential anti-cancer drug, intercalates into DNA between A and G moieties. NMR-derived and MD-refined stereostructure of the d(GAGGCCTC) 2 :C-1311 complex
PublikacjaImidazoacridinone C-1311 (Symadex®) is an antitumor agent which has been recommended for Phase II clinical trials a few years ago. Previously, it was shown experimentally that during the initial stage of its action C-1311 forms stable intercalation complexes with DNA duplexes. Herein, a NMR-derived stereostructure of d(GAGGCCTC)2:C-1311 complex was reported. The ligand was found locating itself between A and G moieties, forming...
-
A strong preference for the TA/TA dinucleotide step discovered for an acridine-based, potent antitumor dsDNA intercalator, C-1305: NMR-driven structural and sequence-specificity studies
PublikacjaTriazoloacridinone C-1305, a potent antitumor agent recommended for Phase I clinical trials, exhibits high activity towards a wide range of experimental colon carcinomas, in many cases associated with complete tumor regression. C-1305 is a well-established dsDNA intercalator, yet no information on its mode of binding into DNA is available to date. Herein, we present the NMR-driven and MD-refined reconstruction of the 3D structures...
-
Comparative molecular modelling of biologically active sterols
PublikacjaMembrane sterols are targets for a clinically important antifungal agent – amphotericin B. The relatively specific antifungal action of the drug is based on a stronger interaction of amphotericin B with fungal ergosterol than with mammalian cholesterol. Conformational space occupied by six sterols has been defined using the molecular dynamics method to establish if the conformational features correspond to the preferential interaction...
-
Spectrofotometric titration of dsDNA by nitroacridines - chemometrics approach
PublikacjaW pracy zastosowano podejście chemometryczne do analizy zestawów widm absorpcyjnych w obszarze widzialnym, uzyskanych podczas miareczkowania spektrofotometrycznego nitroakrydyn o potencjalnej aktywności przeciwnowotworowej przy pomocy DNA.Zastosowanie analizy głównych składowych (PCA) wykazało, że podczas miareczkowania 1-nitroakrydyn powstają dwa typy kompleksów, podczas gdy w przypadku 3-nitroakrydyn tylko jeden. Iteracyjna procedura...
-
Introduction to chemometrics
PublikacjaW pracy przedstawiono definicję chemometrii oraz zakres jej zastosowań. Przedstawiono ponadto podstawowe metody chemometryczne oraz ich zalety i ograniczenia. Szczególny nacisk położono na przygotowanie i kontrolę danych oraz właściwy dobór metod analizy danych.
-
Chemometric analysis of UV-Vis spektra of associated forms of Amphotericin B and its derivatives
PublikacjaPrzedmiotem badań był proces agregacji nowych pochodnych antybiotyku polienowego Amfoterycyny B. Do śledzenia procesu agregacji wykorzystano spektroskopię absorpcyjną w zakresie widzialnym i bliskiego nadfioletu. Zastosowanie zaawansowanych technik chemometrycznych pozwoliło na dogłębną analizę agregacji tych pochodnych, co pozwoliło na wyciągniecie następujacych wniosków: i) w przypadku wszystkich pochodnych przy stężeniach poniżej...
-
Agregacja amfoterycyny B i wybranych pochodnych - chemometryczna analiza widm UV-Vis
PublikacjaPrezentowane badania miały na celu poznanie procesu agregacji nowej generacji pochodnych polienowego antybiotyku przeciwgrzybowego - amfoterycyny B. Przebieg procesu agregacji w roztworach wodnych o różnym składzie monitorowano przy pomocy absorpcyjnej spektroskopii UV-Vis. Otrzymane zestawy widm analizowano z zastosowaniem zaawansowanych technik chemometrycznych (PCA, NSD), co pozwoliło na określenie liczby, typu i ilości form...
-
Chemometric methods for determination of mechanisms of action of anticancer compounds
PublikacjaW 1990 amerykański Narodowy Instytut Raka (NCI) wprowadził szeroki test przesiewowy in vitro mający na celu poszukiwanie nowych związków przeciwnowotworowych. Test został wdrożony po przebadaniu 171 standardowych związków przeciwnowotworowych. Przedmiotem niniejszej pracy jest próba stworzenia reguł klasyfikacji związków standardowych ze względu na ich mechanizm działania przeciwnowotworowego na podstawie wyników z testu NCI. Potwierdzono...
-
Chemometria praktyczna : zinterpretuj wyniki swoich pomiarów / J. Mazerski.
PublikacjaWbrew swojej nazwie chemometria nie zajmuje się sposobami i teorią wykonywania pomiarów wielkości chemicznych ani nie ogranicza się tylko do chemii, nawet szeroko pojętej. Chemometria jest dziedziną nauki i techniki zajmującą się wydobywaniem użytecznej informacji z wielowymiarowych danych pomiarowych, wykorzystującą metody statystyki i matematyki.Chemometria różni się od statystyki nie tylko charakterem zestawu analizowanych danych,...
-
Zastosowanie techniki NIR w analizie jakościowej surowców kosmetycznych i farmaceutycznych
PublikacjaW ramach współpracy pomiedzy Katedrą Technologii Leków i Biochemii Wydziału Chemicznego PG, a zakładem produkcji kosmetyków i farmaceutyków Ziaja Ltd. podjęto prace badawcze nad opracowaniem nowych metod analitycznych stosując spektroskopię w bliskiej podczerwieni (NIR). Metoda ta wykorzystuje absorpcję promieniowania elektromagnetycznego w zakresie 12 000 - 4 000 cm-1 (780-2500 nm). Absorpcja w zakresie NIR pochodzi głównie nod...
-
Molecular modeling of amphotericin B - ergosterol primary complex in water II
PublikacjaPrezentowane badania dotyczą oddziaływania antybiotyku polienowego anfoterycyny B (AmB) i ergosterolu (ERG) (typowego sterolu błonowego komórek grzybowych) na poziomie molekularnym. W odróżnieniu od badanego poprzednio kompleksu binarnego analizowany obecnie kompleks AnB/ERG/AmB charakteryzuje się zdecydowanie wiekszą stabilnością i wzglednie sztywną, sandwiczową geometrią. Za trwałość i geometrie kompleksu odpowiedzialne są oddziaływania...
-
PCBs in fish from southern Baltic Sea: Levels, bioaccumulation features and temporal trends during the 1997-2006 period
PublikacjaW próbkach 5 gatunków ryb bałtyckich pobranych w latach 1997-2006 oznaczono zawartość 7 wskaźnikowych polichlorowanych bifenyli. Zaobserwowano wyraźny trend spadku zawartości cięższych kongenerów w latach 1997-2001 dla różnych gatunków ryb za wyjątkiem dorsza. W próbkach szprota i śledzia stwierdzona statystycznie istotny spadek zawartości PCB 101, 118, 153, 138 i 180. Stwierdzono występowanie gatunkowospecyficznej bioakumulacji...
-
Organochlorine pesticides in fish from the southern Baltic Sea: levels, bioaccumulation features and temporal trends during the 1995-2006 period
PublikacjaW próbkach pięciu gatunków ryb bałtyckich pobranych w latach 1995-2006 oznaczono zawartość heksachlorocykloheksanu (HCH), heksachlorobenzenu (HCB) oraz DDT i jego pochodnych. Dzięki zastosowaniu szeregu metod chemometrycznych a w szczególności analizy głównych składowych (PCA) zaobserwowano szereg istotnych zależności. Nie stwierdzono wpływu miejsca połowu na poziom analizowanych pestycydów w ciałach ryb. Zaobserwowano statystycznie...
-
Chemometria z lotu ptaka
PublikacjaRozwój technik pomiarowych i komputeryzacja przyrządów pomiarowych doprowadziły do ogromnego wzrostu ilości gromadzonych danych pomiarowych. We wszystkich sferach działalności badawczej zbierane są dane, które - nie poddane odpowiedniej analizie - jawią się jako niewiele mówiący chaos zalegający w elektronicznych nosnikach pamięci.Jednocześnie z tym procesem trwa rozwój metod analizy danych i wydobywania z nich użytecznej informacji....
-
Termodynamiczne aspekty oddziaływania niskocząsteczkowych ligandów z DNA
PublikacjaKwasy nukleinowe są celem biologicznym dla wielu antybiotyków oraz leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych. Dlatego podczas tworzenia nowych farmaceutyków ważna jest dokładna wiedza na temat sposobu wiązania się leku do DNA.Oddziaływanie ligand-DNA można podzielić na dwie grupy: 1. wiązanie kowalencyjne, które często prowadzi do utworzenie trwałych wiązań pomiędzy nićmi DNA, 2. fizykochemiczne wiązanie, które może być podzielone...
wyświetlono 1983 razy