Filtry
wszystkich: 21314
wybranych: 13650
-
Katalog
- Publikacje 13650 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 50 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 8 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 226 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 8 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 29 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 9 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 11 wyników po odfiltrowaniu
- Aparatura Badawcza 50 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 1847 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 59 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 5366 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: casp, covid, ema, model accuracy, protein structure prediction, sars-cov-2
-
(2-Ethylimidazole-κN)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)zinc(II) propan-2-ol solvate
PublikacjaW publikowanym związku [Zn(C12H27O3SSi)2(C5H8N2)]*C3H8O, atom Zn(II) jest koordynowany przez atom azotu 2-etyloimidazolu, dwa atomy siarki i dwa atomy tlenu pochodzące od reszt tri-tert-butoksysilanotiolanowych, a geometria na atomie cynku(II) jest typu trygonalnej bipiramidy. Grupa hydroksylowa cząsteczki rozpuszczalnika 2-propanolu tworzy dwa wiązania wodorowe typu N-H - O i O-H - S z sąsiednią czasteczkĄ kompleksu, przez co...
-
Understanding the interactions between protein stabilizers and the peptide bond through the analysis of the volumetric and compressibility properties for the model systems
PublikacjaThis work confirms our earlier supposition, that volumetric and acoustic parameters for simple model proposed by us are directly related to stabilizing/destabilizing effect of osmolytes on proteins structure. The apparent molar volumes, V and the apparent molar isentropic compressions, KS,, of glycine and N,N,N –trimethylglycine (betaine) were determined from densities and speed of sound measurements in aqueous solution of N-methylacetamide...
-
Bis(2-methylquinolinium) tetrachloroferrate(III) chloride
PublikacjaW krysztale współkrystalizują tetrachlorożelazian i chlorek 2-metylochinoliny. Anion tetrachlorożelazianowy wykazuje nieuporządkowanie. W strukturze występują wiązania wodorowe N-H...Cl oraz oddziaływania Fe-Cl...π oraz π...π.
-
Structure of solvation water around the active and inactive regions of a type III antifreeze protein and its mutants of lowered activity
PublikacjaWater molecules from the solvation shell of the ice-binding surface are considered important for the antifreeze proteins to perform their function properly. Herein, we discuss the problem whether the extent of changes of the mean properties of solvation water can be connected with the antifreeze activity of the protein. To this aim, the structure of solvation water of a type III antifreeze protein from Macrozoarces americanus (eel...
-
The first manganese trialkoxysilanethiolates: formation, properties and structure of solvent ligated complexes - [Mn{SSi(OBut)3}2(MeCN)] and [Mn{SSi(OBut)3}2(MeOH)4]
PublikacjaW pracy przedstawiono otrzymywanie i strukturę pierwszych trialkoksysilanotiolanowych kompleksów manganu(II). Syntezy prowadzone były reakcji 2≡SiSH+ MnCl2 + 2Et3N = (≡SiS)2Mn + 2Et3N.HCl doprowadziły do otrzymania nowych kompleksów: [Mn{SSi(OBut)3}2(MeOH)4] (gdy jako rozpuszczalnik zastosowano MeOH) oraz [Mn{SSi(OBut)3}2(NCCH3)], gdy w badaniach posłużono się acetonitrylem.
-
Impact of the Finite Element Mesh Structure on the Solution Accuracy of a Two-Dimensional Kinematic Wave Equation
PublikacjaThe paper presents the influence of the finite element mesh structure on the accuracy of the numerical solution of a two-dimensional linear kinematic wave equation. This equation was solved using a two-level scheme for time integration and a modified finite element method with triangular elements for space discretization. The accuracy analysis of the applied scheme was performed using a modified equation method for three different...
-
Correction to: Two years later: Is the SARS-CoV-2 pandemic still having an impact on emergency surgery? An international cross-sectional survey among WSES members
Publikacja -
NUMERICAL MODEL QUALITY ASSESSMENT OF OFFSHORE WIND TURBINE SUPPORTING STRUCTURE BASED ON EXPERIMENTAL DATA
PublikacjaAs a structure degrades some changes in its dynamical behavior can be observed, and inversely, observation and evaluation of these dynamical changes of the structure can provide information of structural state of the object. Testing of the real structure, besides of being costly, can cover only limited working states. It is particularly considerable in case of hardly accessible, and randomly/severely dynamically loaded offshore...
-
Dimeric structure of the N-terminal domain of PriB protein from Thermoanaerobacter tengcongensis solved ab initio
PublikacjaPriB is one of the components of the bacterial primosome, which catalyzes the reactivation of stalled replication forks at sites of DNA damage. The N-terminal domain of the PriB protein from the thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis (TtePriB) was expressed and its crystal structure was solved at the atomic resolution of 1.09 Å by direct methods. The protein chain, which encompasses the first 104 residues of the...
-
Prediction of protein structure using a knowledge-based off-lattice united-residue force field and global optimization methods
Publikacja -
Reduced model of gyroscopic system
PublikacjaThe paper presents the method of model reduction for the system with gyroscopic interactions. Two methods were used to obtain the approximate discrete models of the continuous structure: the modal decomposition method and the rigid finite element method. The first approach is used for this part of a system for which it is easy to formulate orthogonality conditions, meanwhile the second one is used for other part. The method enables...
-
A CNN based coronavirus disease prediction system for chest X-rays
PublikacjaCoronavirus disease (COVID-19) proliferated globally in early 2020, causing existential dread in the whole world. Radiography is crucial in the clinical staging and diagnosis of COVID-19 and offers high potential to improve healthcare plans for tackling the pandemic. However high variations in infection characteristics and low contrast between normal and infected regions pose great challenges in preparing radiological reports....
-
Neural Network Subgraphs Correlation with Trained Model Accuracy
PublikacjaNeural Architecture Search (NAS) is a computationally demanding process of finding optimal neural network architecture for a given task. Conceptually, NAS comprises applying a search strategy on a predefined search space accompanied by a performance evaluation method. The design of search space alone is expected to substantially impact NAS efficiency. We consider neural networks as graphs and find a correlation between the presence...
-
Authors’ response to Dr Finsterer's comment “Exclude differentials before diagnosing SARS-CoV-2-associated acute hemorrhagic necrotizing encephalitis” (THEIJID-D-22-00008)
Publikacja -
Study of the selection mechanism of heavy metal (Pb 2+, Cu 2+, Ni 2+ and Cd2+) adsorption on clinoptilite
PublikacjaBadano proces adsorpcji jonów metali ciężkich (w warunkach statycznych) z wodnych roztworów jednoskładnikowych i wieloskładnikowych na klinoptylolicie zarówno surowym jak i po wstępnej obróbce. Proces sorpcji ma charakter procesu jonowymiennego i składa sie z trzech etapów:- adsorpcji na powierzchni mikokryształów,- inwersji,- adsorpcji wewnątrz mikrokryształów.Proces sorpcji może być dobrze opisany zarówno za pomocą modelu Frendlicha...
-
Numerical investigation on dynamic performance of a multi-storey steel structure model and comparison with experimental results
PublikacjaShaking table testing is the most commonly adopted method to simulate earthquake forces. This approach allows us to analyze the dynamic performance and provides a valuable insight into the dynamics of building structures, which helps to improve their future safety and reliability. The present study aims to conduct a numerical evaluation of dynamic response of a multi-storey steel structure model, which was previously examined during...
-
Numerical Investigation on Dynamic Performance of a Multi-storey Steel Structure Model and Comparison with Experimental Results
PublikacjaShaking table testing is the most commonly adopted method to simulate earthquake forces. This approach allows us to analyze the dynamic performance and provides a valuable insight into the dynamics of building structures, which helps to improve their future safety and reliability. The present study aims to conduct a numerical evaluation of dynamic response of a multi-storey steel structure model, which was previously examined during...
-
Sensitivity of the Baltic Sea level prediction to spatial model resolution
Publikacjahe three-dimensional hydrodynamic model of the Baltic Sea (M3D) and...
-
Use of Restraints from Consensus Fragments of Multiple Server Models To Enhance Protein-Structure Prediction Capability of the UNRES Force Field
Publikacja -
Protein structure prediction with the UNRES force-field using Replica-Exchange Monte Carlo-with-Minimization; Comparison with MCM, CSA, and CFMC
Publikacja -
Physics-based protein-structure prediction using a hierarchical protocol based on the UNRES force field: Assessment in two blind tests
Publikacja -
MP3vec: A Reusable Machine-Constructed Feature Representation for Protein Sequences
Publikacja—Machine Learning (ML) methods have been used with varying degrees of success on protein prediction tasks, with two inherent limitations. First, prediction performance often depends upon the features extracted from the proteins. Second, experimental data may be insufficient to construct reliable ML models. Here we introduce MP3vec, a transferable representation for protein sequences that is designed to be used specifically for sequence-to-sequence...
-
Assessment of chemical‐crosslink‐assisted protein structure modeling in CASP13
Publikacja -
TaRh 2 B 2 and NbRh 2 B 2 : Superconductors with a chiral noncentrosymmetric crystal structure
PublikacjaIt is a fundamental truth in solid compounds that the physical properties follow the symmetry of the crystal structure. Nowhere is the effect of symmetry more pronounced than in the electronic and magnetic properties of materials—even the projection of the bulk crystal symmetry onto different crystal faces is known to have a substantial impact on the surface electronic states. The effect of bulk crystal symmetry on the properties...
-
Mechatronic approach to the design of 2-wheel mobile platform
PublikacjaW pracy przedstawiono podejście mechatroniczne do projektowania 2-kołowego robota mobilnego przeznaczonego do testowania algorytmu nadzorowania za pomocą sterowania optymalnego przy energetycznym wskaźniku jakości. Badany robot jest skrępowany więzami nieholonomicznymi. Model matematyczny 2-kołowej platformy mobilnej jest opisany za pomocą skończonej liczby nieliniowych równań różniczkowych.
-
ANALYSIS OF THE p53 PROTEIN GENE EXPRESSION MODEL
PublikacjaWe study the asymptotic behaviour of the solutions of the p53-Mdm2 model proposed by Monk (2003). The p53 gene is crucial for cellular inhibition of the angiogenesis process, while Mdm2 is a negative regulator of the p53 tumor-suppressor. We investigate the stability of the positive steady state and perform some numerical experiments.
-
Numerical Evaluation of Dynamic Response of a Steel Structure Model under Various Seismic Excitations
PublikacjaThe present paper reports the results of the study, which was designed to perform a numerical evaluation of dynamic response of a single-storey steel structure model. The experimental model was previously subjected to a number of different earthquake ground motions during an extensive shaking table investigation. The analyzed structure model was considered as a 1-DOF system with lumped parameters, which were determined by conducting...
-
A subdomain model for armature reaction field and open‐circuit field prediction in consequent pole permanent magnet machines
PublikacjaIn this paper, the machine quantity, such as electromagnetic torque, self and mutual inductances, and electromotive force, is analytically calculated for non-overlapping winding consequent pole slotted machine for open-circuit field and armature reaction. The sub-domain approach of (2-D) analytical model is developed using Maxwell's equations and divide the problem into slots, slot-openings, airgap and magnets region, the magnet...
-
Reliability model of the crankshaft-piston assembly
PublikacjaThe laws that govern the durability of crankshaft-piston assembly friction nodes can be proved or at least derived or justified in an intuitive way. Operation of all the friction nodes is disturbed by external factors occurring with randomly changing intensity and also appearing at random. As the crankshaft-piston assembly friction nodes have a series structure and effects of those disturbances accumulate, their fitness for use...
-
Electromagnetic interference frequencies prediction model of flyback converter for snubber design
PublikacjaSnubber design for flyback converters usually requires experimental prototype measurements or simulation based on accurate and complex models. In this study simplified circuit modelling of a flyback converter has been described to dimension snubbers in early stage of design process. Simulation based prediction of the transistor and diode ringing frequencies has been validated by measurements in a prototype setup. In that way obtained...
-
(Cyclopentadienyl){(N,N-dimethylaminoethyl)cyclopentadienyl} complexes of zirconium: Crystal structure of [(η5-C5H5)(η5-C5H4CH2CH2NHMe2)ZrCl2]2[ZrCl6]
Publikacja(C5H5)ZrCl3 reaguje z [C5H4-CH2CH2NMe2]Li dając polimer koordynacyjny {(C5H5)(C5H4-CH2CH2NMe2)ZrCl2}n, który z kolei w reakcji z HCl daje żółtozielone kryształy [(η5-C5H5)(η5-C5H4CH2CH2NHMe2)ZrCl2]2[ZrCl6]. Ten ostatni związek został scharakteryzowany za pomocą widm NMR oraz przy użyciu rentgenowskiej analizy strukturalnej. Utworzenie w/w związku wskazuje na oderwanie grup C5H5 oraz C5H4-CH2CH2NMe2 od centrum metalicznego Zr(IV).
-
The Influence of Input Data Standardization Method on Prediction Accuracy of Artificial Neural Networks
Publikacja -
Specific Binding of Cholesterol to the Amyloid Precursor Protein: Structure of the Complex and Driving Forces Characterized in Molecular Detail
PublikacjaC99 is the C-terminal membrane-bound fragment of the amyloid precursor protein that is cleaved by γ-secretase to release Aβ peptides, the hallmark of Alzheimer’s disease (AD). Specific interactions of C99 with cholesterol have been proposed to underlie the recognized role of cholesterol in promoting amyloidogenesis. By using molecular dynamics simulations, we studied cholesterol binding to C99 in a lipid bilayer. We determined...
-
Crystal Growth, Structure, and Magnetism of the 2D Spin 1/2 Triangular Lattice Material Rb3Yb(PO4)2
PublikacjaThe single-crystal growth, crystal structure, heat capacity, and anisotropic magnetization characterization of Rb3Yb- (PO4)2, a Yb-based triangular lattice material, are presented. Single-crystal X-ray diffraction shows that Rb3Yb(PO4)2 exhibits [Yb(PO4)]∞ layers, with the Yb in an ordered plane of equilateral triangles. One phosphate group oxygen that is not a near neighbor of the magnetic Yb displays positional disorder. The...
-
Machine learning-based prediction of seismic limit-state capacity of steel moment-resisting frames considering soil-structure interaction
PublikacjaRegarding the unpredictable and complex nature of seismic excitations, there is a need for vulnerability assessment of newly constructed or existing structures. Predicting the seismic limit-state capacity of steel Moment-Resisting Frames (MRFs) can help designers to have a preliminary estimation and improve their views about the seismic performance of the designed structure. This study improved data-driven decision techniques in...
-
The 2:1 cocrystal of benzamide and pentafluororbenzoic acid
PublikacjaKrystaliczna struktura centrosymetrycznej supermolekuły składa się z czterech cząsteczek benzamidu oraz dwóch kwasu karboksylowego, które powiązane są ze sobą za pomocą wiązań wodorowych typu O-H...O oraz N-H...O.
-
User satisfaction model
PublikacjaRaport techniczny - opis metody ''User Satisfaction Methods'' wykorzystywanej w projektowaniu komunikacji człowiek-komputer oraz doskonaleniu interfejsu użytkownika.
-
Rating Prediction with Contextual Conditional Preferences
PublikacjaExploiting contextual information is considered a good solution to improve the quality of recommendations, aiming at suggesting more relevant items for a specific context. On the other hand, recommender systems research still strive for solving the cold-start problem, namely where not enough information about users and their ratings is available. In this paper we propose a new rating prediction algorithm to face the cold-start...
-
Effect of temperature and composition on physical properties of deep eutectic solvents based on 2-(methylamino)ethanol – measurement and prediction
PublikacjaNovel deep eutectic solvents were synthesized using 2-(methylamino)ethanol as hydrogen bond donor with tetrabutylammonium bromide or tetrabutylammonium chloride or tetraethylammonium chloride as hydrogen bond acceptors. Mixtures were prepared at different molar ratios of 1:6, 1:8 and 1:10 salt to alkanolamine and then Fourier Transform Infrared Spectroscopy measurements were performed to confirm hydrogen bonds interactions between...
-
A Hierarchical Multiscale Approach to Protein Structure Prediction: Production of Low‐Resolution Packing Arrangements of Helices and Refinement of the Best Models with a United‐Residue Force Field
Publikacja -
A simple model of circular hydraulic pump
PublikacjaRozpatrzono warunki powstawania osiowosymetrycznego uskoku hydraulicznego. Przedstawiono model, w którym rozpatrzono obecność dodatkowych strat w równaniu Bernoulliego. Przyczyniają się one do powstawania dodatkowego wiru w miejscu uskoku. Porównanie z wynikami badań eksperymentalnych potwierdza słuszność przyjętych tez.
-
The circular chromatic index of some class 2 graphs
PublikacjaW artykule został wyznaczony cyrkularny indeks chromatyczny dla dwóch rodzin grafów klasy 2. Co więcej, podano nie trywialne oszacowania tego parametru dla snarków Isaacsa i Goldberga. Na koniec artykułu rozważana jest złożoność obliczeniowa problemów związanych z cyrkularnym kolorowaniem krawędzi.
-
Wood structure constraints on sawing accuracy with narrow-kerf saws
PublikacjaW pracy przedstawiono analizę przyczyn i przykłady niedokładności przecinania wynikających z lokalnych zmian struktury drewna.
-
On the Origin of Protein Superfamilies and Superfolds
PublikacjaDistributions of protein families and folds in genomes are highly skewed, having a small number of prevalent superfamiles/superfolds and a large number of families/folds of a small size. Why are the distributions of protein families and folds skewed? Why are there only a limited number of protein families? Here, we employ an information theoretic approach to investigate the protein sequence-structure relationship that leads to...
-
Copper containing protein sites - structure, properties and models
PublikacjaEnzymy organizmów żywych katalizują wiele reakcji stosowanych w przemyśle chemicznym. Przykładem potencjalnego zastosowania enzymu w produkcji jest synteza L-Dopy przy udziale tyrozynazy. Ze względu na możliwe praktyczne zastosowanie w katalizie, otrzymano i opisano wiele prostych modeli miejsc aktywnych enzymów. W artykule opisano niektóre modele białek zawierających miedź.
-
Działania antykryzysowe w obszarze kultury w trakcie pandemii SARS-CoV-2. Stan obecny i wnioski de lege ferenda w zakresie zwiększenia partycypacji obywatelskiej oraz instytucjonalnej
PublikacjaCelem artykułu jest analiza różnych rozwiązań prawnych w zakresie wsparcia instytucji kultury w trakcie stanu epidemii. Przeprowadzono przegląd działań Ministerstwa Kultury i Dziedzictwa Narodowego wspierających instytucje kultury w Polsce w czasie epidemii według stanu na maj 2020 r. Na podstawie analizy wskazano wnioski de lege ferenda co do nowych możliwości finansowania działań takich instytucji. Autorzy prezentują rozwiązania...
-
Polysaccharide–Protein Complexes in a Coarse-Grained Model
Publikacja -
Reactions of R2P-P(SiMe3)2 with [(R'3P)2PtCl2]. Syntheses and Structures of [μ2-(1,2:2-η-P2){Pt(PEt3)2}2{Pt(PEt3)2Cl}]+Cl-, [{(Et2PhP)2Pt}2P2], [{(p-Tol3P)2Pt}2P2] and [(p-Tol3P)ClPt(μ-PPh2)2Pt(p-Tol3P)Cl]
PublikacjaReakcje difosfanów R2P-P(SiMe3)2 z [(R'3P)2PtCl2] są bardzo złożone. Główną ścieżką reakcji jest rozszczepienie wiązania P-P w startowym R2P-P(SiMe3)2, po czym następuje utworzenie kompleksu zawierającego P2: [{(R'3P)2Pt}2P2] oraz difosfanu R2P-PR2. Produkty reakcji (zarówno główne jak i uboczne), zostały scharakteryzowane na podstawie spektroskopii 31P NMR. Dla czterech tytułowych związków wykonano rentgenowską analizę strukturalną...
-
Spirometry measurement model - the diagnostic purpose support
Publikacjathe paper presents a new model of respiratory mechanism based on the spirometry measurements. the spirometry test assesses the efficiency of the lung ventilation. the respiratory system functioning is based on the ventilation mechanism. thus the quality of the lung depends on the quality of lung ventilation. modelling of the respiratory system supports a diagnostic process. the model parameter estimates are obtained on the basis...
-
Delay induced oscillations in gene expression of Hes1 protein model
PublikacjaW pracy został omówiony model produkcji białka Hes1. Stężenie Hes1 jest kontrolowane przez ujemne sprzężenie zwrotne wbudowane w białko i jego mRNA. Przeprowadzona analiza potwierdziła znane wyniki numeryczne, że oscylacje wywołane są przez opóźnienie. Pokazaliśmy również, że jeśli współczynnik Hilla jest większy niż 1, to istnieje krytyczna wartość opóźnienia, dla której ma miejsce bifurkacja Hopfa i pojawiają się rozwiązania...