Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 28
Wyniki wyszukiwania dla: TUBULINA
-
Properties of water in the region between a tubulin dimer and a single motor head of kinesin
PublikacjaA kinesin is a molecular motor that can perform movement on a microtubule track in a stepping-like manner. This motion is connected with processes of association and dissociation of kinesin and tubulin. Water is an important participant in these kinds of molecular interactions. This is why we have decided to investigate the dynamical and structural properties of water in the region between the kinesin catalytic domain and the tubulin...
-
Structural factors affecting affinity of cytotoxic oxathiole-fused chalcones toward tubulin
PublikacjaSynthesis, in vitro cytotoxic activity, and interaction with tubulin of (E)-1-(6-alkoxybenzo[d][1,3]oxathiol- 5-yl)-3-phenylprop-2-en-1-one derivatives (2) are described. Some of the compounds demonstrated cytotoxic activity at submicromolar concentrations, and the activity could be related to interaction with tubulin at the colchicine binding site. Interaction of selected derivatives with tubulinwas evaluated using molecular modeling,...
-
INNOWACYJNE ROZWIĄZANIA SZANSĄ ROZWOJU SYSTEMÓW TRANSPORTU TROLEJBUSOWEGO NA PRZYKŁADZIE GDYNI I LUBLINA
PublikacjaHistoria miejskiej trakcji elektrycznej sięga lat osiemdziesiątych XIX w. i jej początki związane są z transportem tramwajowym, który na przełomie wieków XIX i XX stał się elementem krajobrazu wielu miast. Początek XX w. przyniósł popularyzację komunikacji trolejbusowej. Współcześnie nowym środkiem transportu miejskiego stał się autobus elektryczny. W opracowaniu przedstawiono dwa środki zelektryfikowanego transportu miejskiego: trolejbus...
-
Konferencja naukowa Dziedzictwo archiwalne Lublina i Lubelszczyzny. Ludzie, instytucje, dokumentacja, Lublin, 2–3 grudnia 2021 r.
PublikacjaSprawozdanie z konferencji naukowej pt. Dziedzictwo archiwalne Lublina i Lubelszczyzny. Ludzie, instytucje, dokumentacja, Lublin, 2–3 grudnia 2021 r.
-
Influence of S-Oxidation on Cytotoxic Activity of Oxathiole-Fused Chalcones
PublikacjaSynthesis, in vitro cytotoxic activity, and interaction with tubulin of oxidized, isomeric 1-(5-alkoxybenzo[d] [1,3]oxathiol-6-yl)-3-phenylprop-2-en-1-ones and 1-(6- alkoxybenzo[d][1,3]oxathiol-5-yl)-3-phenylprop-2-en-1- ones are described. Most of the compounds demonstrated cytotoxic activity at submicromolar concentrations. It was found that oxidation of sulfur atom of the oxathiole-fused chalcones strongly influenced activity...
-
Hydratacja domeny katalitycznej kinezyny
PublikacjaKinezyna należy do białek zwanych motorami molekularnymi, które są zdolne do wykonywania pracy mechanicznej. Konwencjonalna kinezyna wyposażona jest w dwie domeny motoryczne. Potrafi ona poruszać się w uporządkowany sposób przemieszczając się po szlakach wyznaczanych przez tzw. mikrotubule, które tworzone są przez białko tubulinę. Jej rola polega m.in. na transporcie białek i organelli komórkowych. Naturalnym środowiskiem działania...
-
PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera
PublikacjaFungi of the Scopulariopsis genus, commonly found in the environment, are opportunistic pathogens that can cause various types of human infections. So far, no efficient molecular method has been developed for species differentiation among Scopulariopsis and related genera. In order to advance this field, we have evaluated performance of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays, based...
-
Multi-GPU-powered UNRES package for physics-based coarse-grained simulations of structure, dynamics, and thermodynamics of protein systems at biological size- and timescales
PublikacjaCoarse-grained models are nowadays extensively used in biomolecular simulations owing to the tremendous extension of size- and time-scale of simulations. The physics-based UNRES (UNited RESidue) model of proteins developed in our laboratory has only two interaction sites per amino-acid residue (united peptide groups and united side chains) and implicit solvent. However, owing to rigorous physics-based derivation, which enabled...
-
Water-mediated long-range interactions between the internal vibrations of remote proteins
PublikacjaIt is generally acknowledged that the mobility of protein atoms and the mobility of water molecules in the solvation layer are connected. In this article, we answer the question whether a similar interdependence exists between the motions of atoms of proteins separated by the hydration layers of variable thickness. The system consisted of a kinesin catalytic domain and a tubulin dimer. It was studied using molecular dynamics simulations....
-
PCR and real-time PCR approaches to the identification of Arthroderma otae species Microsporum canis and Microsporum audouinii/Microsporum ferrugineum
PublikacjaObjectives The identification of species in the Arthroderma otae complex is essential to determine the origin of infection and to eliminate the risk of transmission. Microsporum canis is a zoophilic species, whereas Microsporum audouinii and Microsporum ferrugineum are anthropophilic species. In this paper, we propose alternative methods that permit species-specific identification of both anthropophilic and zoophilic members of...
-
Synthesis of Combretastatin A-4 Analogs and their Biological Activities
PublikacjaCombretastatin A-4 (CA-4) is a natural product, which consists of two phenyl rings, linked by an ethylene bridge. CA-4, inhibitor of polymerization of tubulin to microtubules, possesses a strong antitumor and anti-vascular properties both in vitro and in vivo. Previous studies showed that disodium phosphate salt of CA-4, a water-soluble prodrug is well tolerated at therapeutically useful doses. However, it should be noted that...
-
The significance of the properties of water for the working cycle of the kinesin molecular motor
PublikacjaExplicit solvent molecular dynamics simulations were performed in this study to investigate and discuss several aspects of the influence of the properties of water on the working cycle of a molecular motor from the kinesin superfamily. The main objects of attention were: the binding of the neck linker and the association of the kinesin and the tubulin. The docking of the neck linker is considered a crucial event during the working...
-
Novel chalcone-derived pyrazoles as potential therapeutic agents for the treatment of non-small cell lung cancer
PublikacjaLung cancer is considered to account for approximately one-fifth of all malignant tumor-related deaths worldwide and is therefore one of the most lethal malignancies. Pyrazole scaffold possesses a wide range of biological and pharmacological activities, which play important roles in medicinal chemistry. The present study reports the synthesis and in vitro biological characterization of nine pyrazoles derived from chalcones as potential...
-
Kinezyna w ruchu względem tubuliny - właściwości wody solwatacyjnej i oddziaływania pomiędzy białkami
ProjektyProjekt realizowany w Katedra Chemii Fizycznej zgodnie z porozumieniem UMO-2013/09/D/NZ1/01087 z dnia 2014-02-10
-
Specific detection of Alternaria alternata by PCR and real-time PCR
PublikacjaFungi of Alternaria genus are cosmopolitan organisms, which spores can be found in the air, soil, water, clothing and food. They commonly occur as saprotrophs on the plant remains, contributing to the decomposition of organic matter. Additionally, they are components of the normal human and animal skin flora. Alternaria spp. are also known human allergens, causing hay fever and allergic reactions that can lead to the development...
-
PCR and real-time PCR assays to detect fungi of Alternaria alternata species
PublikacjaFungi of the Alternaria genus are mostly associated with allergic diseases. However, with a growing number of immunocompromised patients, these fungi, with A. alternata being the most prevalent one, are increasingly recognized as etiological agents of infections (phaeohyphomycoses) in humans. Nowadays, identification of Alternaria spp. requires their pure culture and is solely based on morphological criteria. Clinically, Alternaria...
-
Combretastatin A-4 (CA-4) and its analogues. Synthesis and biological activity
PublikacjaSpośród wielu związków przeciwnowotworowych otrzymanych w ostatnich dwóch dekadach, na szczególną uwagę zasługują te, które powodują reorganizację mikrotubul. Jedną z takich substancji jest opisana w artykule kombretastatyna A-4 (CA-4), związek który indukuje apoptozęproliferujących komórek śródbłonka naczyń guza nowotworowego. Hamuje on polimeryzację tubuliny, prowadząc do rozpadu mikrotubul. CA-4 wyizolowana została z kory wierzby...
-
Miasto jako marka – analiza wybranych działań marketingowych miasta Lublin
PublikacjaW niniejszej pracy przedstawiono mechanizmy i proces kształtowania się miasta jako marki. Celem przeprowadzonych badań była analiza wybranych działań marketingowych Lublina od 2007 r. do 2014 r. Zbadano strategię tworzenia się marki „Lublin Miasto Inspiracji” oraz przedstawiono wybrane kampanie promocyjne. Stwierdzono, że dzięki narzędziu Brand Foundations możliwe było skuteczne stworzenie i wprowadzenie marki miasta na rynek....
-
Multi-GPU UNRES for scalable coarse-grained simulations of very large protein systems
PublikacjaGraphical Processor Units (GPUs) are nowadays widely used in all-atom molecular simulations because of the advantage of efficient partitioning of atom pairs between the kernels to compute the contributions to energy and forces, thus enabling the treatment of very large systems. Extension of time- and size-scale of computations is also sought through the development of coarse-grained (CG) models, in which atoms are merged into extended...
-
"Znani - Nieznani" - scanariusz gry miejskiej.
PublikacjaAutorzy publikują scenariusz autorskiej gry miejskiej, zorganizowanej w Archiwum Państwowym w Lublinie z okazji Międzynarodowego Dnia Archiwów. W przebiegu gry wykorzystane zostały nie tylko źródła archiwalne, księgozbiór biblioteki archiwalnej ale także projekty cyfrowe prezentowane w Internecie - fotoblog Galeria Jezuicka 13 czy Lubelskie Dossier - znani nieznani w materiałach archiwalnych. Scenariusz gry oparty został na...
-
System wynagradzania nauczycieli w Polsce – skutki dla lokalnych budżetów
PublikacjaArtykuł podejmuje problematykę systemu wynagradzania nauczycieli w Polsce. W pierwszej części przedstawiono oświatę jako zadanie publiczne polskich gmin, powiatów i województw oraz miast na prawach powiatu, które wypełniają zadania zarówno gmin, jak i powiatów. W kolejnej części omówiono kryteria (zwłaszcza dotyczące nauczycieli) podziału części oświatowej subwencji ogólnej z budżetu państwa pomiędzy jednostki samorządu terytorialnego....
-
Telomerase inhibition - unfulfilled hopes in the perfect molecular target
PublikacjaTelomerase plays a pivotal role in cell proliferation, homeostasis, and neoplastic transformation, making it a promising molecular target for cancer chemotherapy. Of note, although hTERT has been explored thoroughly as a target, none of the promising molecules has been approved as a drug until now. The subject of research conducted as part of my doctoral dissertation is explaining the cellular and molecular mechanism of action...
-
Relation of the polymorphism of cyp51A sequence and the susceptibility of Aspergillus fumigatus isolates to triazoles determined by commercial gradient test (Etest) and by reference methods
PublikacjaThe aim of this study was to evaluate the accuracy of commercial gradient test (Etest) in the detection of triazole resistant Aspergillus fumigatus isolates using reference microdilution methods and the analysis of sequences of the cyp 51A gene. The study was performed on twenty clinical isolates which were identified as Aspergillus fumigatus based on the DNA sequences of the ITS1-2 fragment of ribosomal DNA and the β-tubulin gene,...
-
Cmentarze w przestrzeni polskich miast
PublikacjaPrzedmiotem badań jest przedstawienie cmentarzy na terenach polskich miast: Gdańska, Krakowa, Lublina, Warszawy i Wrocławia. Na potrzeby pracy przeanalizowano położenie cmentarzy względem współczesnej i historycznej tkanki miejskiej a także względem innych nekropolii, dzięki czemu zidentyfikowano zjawisko występowania zespołów cmentarzy miejskich. Zbadano także zagadnienie likwidacji cmentarzy miejskich i odniesiono je do współczesnych...
-
Down-regulation of DNA topoisomerase IIalpha leads to prolonged cell cycle transit in G2 and early M phases and increased survival to microtubule-interacting agents
PublikacjaInhibitory polimeryzacji mikrotubul wykazują preferencyjną toksyczność wobec komórek mitotycznych. W ramach tego projektu badaliśmy czy oporność komórek ludzkich białaczek na inhibitor mikrotubul, winkrystynę, prowadzi do zmian w regulacji progresji cyklu komórkowego. Nasze wyniki wskazują, że oporności na winkrystynę towarzyszą zmiany w długości fazy G2 i M w nieobecności i obecności inhibitora wrzeciona mitotycznego, nokodazolu....
-
New Chalcones Derivatives With Potent Antitumor Activity And Their Metabolism In Vitro
PublikacjaChalcone derivatives exhibit a broad range of biological activities, with antioxidant and cytotoxic properties among the most studied. Despite numerous reports on chalcones as cytotoxic, and potentially anticancer agents, very little is know on their actual mechanism of activity. Generally, chalcones are considered as antimitotic agents, which interfere with tubulin assembly.We have recently developed a new class of chalcones with...
-
Outcomes of gynecologic cancer surgery during the COVID-19 pandemic: an international, multicenter, prospective CovidSurg-Gynecologic Oncology Cancer study
Publikacja -
Effect of COVID-19 pandemic lockdowns on planned cancer surgery for 15 tumour types in 61 countries: an international, prospective, cohort study
Publikacja