Search results for: SPD-L1 PROTEIN
-
Pro-apoptotic action of protein-carbohydrate fraction isolated from coelomic fluid of the earthworm Dendrobaena veneta against human colon adenocarcinoma cells
Publication -
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublicationTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Ultrasound assisted synthesis of 3-alkynyl substituted 2-chloroquinoxaline derivatives: their in silico assessment as potential ligands for N-protein of SARS-CoV-2
Publication -
Physics-Based Potentials for the Coupling between Backbone- and Side-Chain-Local Conformational States in the United Residue (UNRES) Force Field for Protein Simulations
Publication -
Parametrization of Backbone−Electrostatic and Multibody Contributions to the UNRES Force Field for Protein-Structure Prediction from Ab Initio Energy Surfaces of Model Systems
Publication -
Prime-Boost Vaccination with Toxoplasma Lysate Antigen, but Not with a Mixture of Recombinant Protein Antigens, Leads to Reduction of Brain Cyst Formation in BALB/c Mice
PublicationIntroduction Infection with the ubiquitous parasite Toxoplasma gondii is a threat for immunocompro- mised patients and pregnant women and effective immune-prophylaxis is still lacking. Methods Here we tested a mixture of recombinant T . gondii antigens expressed in different develop- mental stages, i.e., SAG1, MAG1 and GRA7 (SMG), and a lysate derived from T . gondii tachyzoites (TLA) for prophylactic vaccination against cyst formation....
-
Isolation of the GFA1 gene encoding glucosamine-6-phosphate synthase of Sporothrix schenckii and its expression in Saccharomyces cerevisiae
PublicationGlucosamine-6-phosphate synthase (GlcN-6-P synthase) is an essential enzyme involved in cell wall biogenesis that has been proposed as a strategic target for antifungal chemotherapy. Here we describe the cloning and functional characterization of Sporothrix schenckii GFA1 gene which was isolated from a genomic library of the fungus. The gene encodes a predicted protein of 708 amino acids that is homologous to GlcN-6-P synthases...
-
A Hierarchical Multiscale Approach to Protein Structure Prediction: Production of Low‐Resolution Packing Arrangements of Helices and Refinement of the Best Models with a United‐Residue Force Field
Publication -
A surface-exposed DraD protein of uropathogenic Escherichia coli bearing Dr fimbriae may be expressed and secreted independently from DraC usher and DraE adhesin
PublicationOperon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ odpowiedzialny jest za proces bakteryjnej adhezji i inwazji. Operon dra kodujący fimbrie Dr zawiera sześć otwartych ramek odczytu - draA, draB, draC, draD, draP oraz draE. Fimbrie Dr zlokalizowane na powierzchni komórki bakteryjnej, zbudowane są z podjednostek białka DraE. Niewiele wiadomo na temat powierzchniowej ekspresji białka DraD oraz jego roli w procesie biogenezy fimbrii...
-
Aberration of the enzymatic activity of Fhit tumor suppressor protein enhances cancer cell death upon photodynamic therapy similarly to that driven by wild-type Fhit
Publication -
Synthesis and characterization of ruthenium and rhenium dyes with phosphonate anchoring groups
PublicationRe(L1)–Re(L3), a series of rhenium(I) tricarbonyl chloride complexes with bpy-R2 derivatives L1–L3 (bpy = 2,2′-bipyridine, R represents the substitution at the 4- and 4′-positions), and their corresponding trishomoleptic Ru(L1)3–Ru(L3)3 as well as heteroleptic ruthenium(II) complexes Ru(tbbpy)2(L1) and Ru(tbbpy)2(L2) have been synthesized and characterized. Their applicability as immobilizable metal–organic chromophores in solar...
-
Cu(II) complexes with peptides from FomA protein containing -His-Xaa-Yaa-Zaa-His and -His-His-motifs. ROS generation and DNA degradation
Publication -
Impact of selected amino acids of HP0377 (Helicobacter pylori thiol oxidoreductase) on its functioning as a CcmG (cytochrome c maturation) protein and Dsb (disulfide bond) isomerase
Publication -
Adolfo Poma
PeopleI am the group leader of the computational modelling of biomolecules divison at the institute of Fundamental Technological Research Polish Academy of Sciences in Poland. My group was hosted between 2021-2022 by International Centre for Research on Innovative Bio-based Materials (ICRI-BioM). In 2008, I got a Master degree in computational physics from the State University of Campinas, Brazil. Then I moved to Germany and under the...
-
Ion Chromatography with Pulsed Amperometric Detection for Determining Cyanide in Urine and Meconium Samples
PublicationThe parents’ addictions and eating habits have a significant influence on the child’s growth. The first stool of a newborn baby provides a large amount of information about xenobiotics transmitted by the mother’s body. The analytical technique used in the study is ion chromatography with pulsed amperometric detection (IC-PAD). The biological samples, which were obtained from women staying in a maternity ward and their partners,...
-
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Protein Structure and Molecular Enzymology
Journals -
Identification of X-DING-CD4, a new member of human DING protein family that is secreted by HIV-1 resistant CD4+ T cells and has anti-viral activity
Publication -
Fatty Acid-Binding Protein 7 (FABP-7), Glutamic Acid and Neurofilament Light Chain (NFL) as Potential Markers of Neurodegenerative Disorders in Psoriatic Patients—A Pilot Study
Publication -
Implementation of Molecular Dynamics and Its Extensions with the Coarse-Grained UNRES Force Field on Massively Parallel Systems: Toward Millisecond-Scale Simulations of Protein Structure, Dynamics, and Thermodynamics
Publication -
Effect of Manual Therapy Compared to Ibuprofen on Primary Dysmenorrhea in Young Women—Concentration Assessment of C-Reactive Protein, Vascular Endothelial Growth Factor, Prostaglandins and Sex Hormones
Publication -
Ionophores in polymeric membranes for selective ion recognition; impedance studies
PublicationBadania impedancyjne membran zawierających jonofory selektywne na kation Na+ (L1) i Cs+(L2) wykazały, ze stala dielektryczna materiału membrany zależy od typu uzytego plastyfikatora i zmienia się w zakresie od 28 do 60. Rezystancja membran zawierających ligand L1 i L2 wynosi 0.15 -1.4 Mohm w zależności od stężenia elektrolitu zewnnetrznego. Testowona dwa typy elektrod jonoselektywnych: elektrody typu ASS z polimerem przewodzącym...
-
Anna Brillowska-Dąbrowska dr hab. inż.
PeopleAnna Brillowska-Dąbrowska, born in 1971 in Gdańsk, Poland, graduated in 1996 in Biotechnology from the Faculty of Chemistry, Gdańsk University of Technology (GUT). In 2001 she got her PhD, in 2013 became a DSc (habilitation). She was employed in 2004 as a researcher in Statens Serum Institut in Denmark. Currently she is an Associate Professor (adiunkt) in the Department of Molecular Biotechnology and Microbiology and Vice-dean...
-
Adam Macierzanka dr hab. inż.
People2015-presentHead of Department, Associate ProfessorDepartment of Colloid and Lipid Science, Faculty of Chemistry, Gdansk University of Technology, Gdansk, Poland 2019-2020Visiting Professor, Food Science and NutritionRiddet Institute, Massey University, Palmerston North, New Zealand 2014-2015Research LeaderColloid Science, Food & Health Research ProgrammeInstitute of Food Research, Norwich, United Kingdom 2012-2014Full Professor,...
-
Andrzej Składanowski prof. dr hab. inż.
People -
Short-term Cultivation of Porcine Cumulus Cells Influences the Cyclin-dependent Kinase 4 (Cdk4) and Connexin 43 (Cx43) Protein Expression—A Real-time Cell Proliferation Approach
Publication -
The activity of latent benzoperimidine esters to inhibit P-glycoprotein and multidrug resistance-associated protein 1 dependent efflux of pirarubicin from several lines of multidrug resistant tumor cells.
PublicationZaprezentowano wyniki badań biologicznych przeprowadzonych dla nowej grupy związków: estrów benzoperymidyny z zastosowaniem wybranych linii komórek nowotworowych: wrażliwych i opornych o oporności P-gp-zależnej, MRP1-zależnej i o oporności związanej z nadekspresją białek MRP1/LRP. Metodą spektrofluorymetryczną zbadano zdolność estrów benzoperymidyny do hamowania eksportu aktywnego pirarubicyny z komórek opornych. Estry benzoperymidyny...
-
Ageing-Time Dependent Changes of Angiotensin I-Converting Enzyme-Inhibiting Activity of Protein Hydrolysates Obtained from Dry-Cured Pork Loins Inoculated with Probiotic Lactic Acid Bacteria
Publication -
Ionophores in polymeric membranes for selective ion recognition:impedance studies
PublicationW pracy badano dwa typy elektrod: membranowe elektrody jonoselektywne (ISE) oraz elektrody nowego typu all-solid-state (AAS). Elektrody AAS zawierają przewodzącą warstwę polimerową na węglu szklistym lub platynie, na który nałożona jest membrana zawierająca jonofor. Do badań użyto dwa jonofory: p-tert-butylokaliks[4]aren-korona-4 (L1) selektywnie kompleksująca jony Na+ oraz kaliks[4]aren-korona-6 (L2) selektywnie kompleksująca...
-
Galileo satellite navigation system receiver concept
PublicationArtykuł prezentuje koncepcję odbiornika satelitarnego Galileo. Przedstawiono w nim szczegółowo tor odbiorczy odbiornika dla częstotliwości L1.
-
Reemission of inorganic pollution from permafrost? A freshwater hydrochemistry study in the lower Kolyma basin (North-East Siberia)
PublicationPermafrost regions are under particular pressure from climate change resulting in widespread landscape changes, which impact also freshwater chemistry. We investi- gated a snapshot of hydrochemistry in various freshwater environments in the lower Kolyma river basin (North-East Siberia, continuous permafrost zone) to explore the mobility of metals, metalloids and non-metals resulting from permafrost thaw. Partic- ular attention...
-
Mode shapes of a beam and plate with defects, obtained by experimental modal analysis
Open Research DataThe DataSet contains the experimental results of the first mode shape for a beam and a plate.
-
Significant Decrease in Glycated Hemoglobin, 2h-Post-Load Glucose and High-Sensitivity C-Reactive Protein Levels in Patients with Abnormal Body Mass Index after Therapy with Manual Lymphatic Drainage
Publication -
Photoresponsive Amide-Based Derivatives of Azobenzene-4,4′-Dicarboxylic Acid—Experimental and Theoretical Studies
PublicationAzobenzene derivatives are one of the most important molecular switches for biological and material science applications. Although these systems represent a well-known group of compounds, there remains a need to identify the factors influencing their photochemical properties in order to design azobenzene-based technologies in a rational way. In this contribution, we describe the synthesis and characterization of two novel amides...
-
Joanna Raczek dr inż.
PeopleEmployment 2003 -- 2019: Faculty of Applied Physics and Mathematics, Gdańsk University of Technology. 2019 - present: Faculty of Electronic, Informatics and Telecominications, Gdańsk University of Technology. Education May 2007: Doctor of Philosophy in Mathematics, University of Gdańsk. Doctoral dissertation: "Paired domination and doubly domination in graphs". Supervisor: dr hab. Jerzy Topp. 2000 -- 2004 Bachelor of Science...
-
Analysis of the Factors Affecting Static In Vitro Pepsinolysis of Food Proteins
PublicationIn this meta-analysis, we collected 58 publications spanning the last seven decades that reported static in vitro protein gastric digestion results. A number of descriptors of the pepsinolysis process were extracted, including protein type; pepsin activity and concentration; protein concentration; pH; additives; protein form (e.g., ‘native’, ‘emulsion’, ‘gel’, etc.); molecular weight of the protein; treatment; temperature; and...
-
Synthesis, structure, DNA binding and anticancer activity of mixed ligand ruthenium(II) complex
PublicationIn order to obtain a potential chemotherapeutic which is not affected on the normal BALB/3T3 cell line, a new arene ruthenium(II) complex {[RuCl(L1)(η6-p-cymene)]PF6}2 · H2O has been synthesized by a direct reaction of precursor, [{(η6-p-cymene)Ru(μ-Cl)}2Cl2], with N,N-chelating ligand (L1 - 2,2′-bis(4,5-dimethylimidazole). The compound has been fully characterized by elemental analysis, X-ray diffraction, IR, UV–Vis and 1H, 13C...
-
Biomechanics of Lumbar Spine Injury in Road Barrier Collision–Finite Element Study
PublicationLiterature and field data from CIREN database have shown that lumbar spine injuries occur during car crashes. There are multiple hypotheses regarding how they occur; however, there is no biomechanical explanation for these injuries during collisions with road safety barriers (RSBs). Therefore, the objective of this study was to investigate the mechanics of vertebral fractures during car collisions with concrete RSBs. The finite...
-
Gracjana Klein-Raina dr hab.
People -
Koncepcja nawigacyjnego odbiornika systemu Galileo
PublicationW artykule przedstawiono sposób działania odbiornika systemu nawigacyjnego Galielo. Przedstawiony został tor odbiorczy oraz model odbionik a systmu GNSS dla częstotliwości L1.Scharaektyryzowano również niektóre dostępne serwisy Galileo oraz częstotliwości służące do ich realizacji.
-
Generalized Dobrushin Coefficients on Banach Spaces
PublicationThe asymptotic behavior of iterates of bounded linear operators (not necessarily positive), acting on Banach spaces, is studied. Through the Dobrushin ergodicity coefficient, we generalize some ergodic theorems obtained earlier for classical Markov semigroups acting on L1 (or positive operators on abstract state spaces).
-
Integracja systemu zarządzania z modułem wymiarowania zasobów w Systemie IIP
PublicationCelem artykułu jest przedstawienie współpracy dwuetapowego wymiarowania z systemem zarządzania na poziomie warstw L1 i L2 architektury Systemu IIP. Omówiono zadania systemu zarządzania oraz modułu wymiarowania, zrealizowane algorytmy optymalizacyjne oraz uniwersalne styki z systemem zarządzania oraz Równoległymi Internetami.
-
Współpraca systemu zarządzania z modułem wymiarowania zasobów w Systemie IIP
PublicationCelem artykułu jest przedstawienie współpracy dwuetapowego wymiarowania z systemem zarządzania na poziomie warstw L1 i L2 architektury Systemu IIP. Omówiono zadania systemu zarządzania oraz modułu wymiarowania, zrealizowane algorytmy optymalizacji oraz uniwersalne styki z systemem zarządzania oraz Równoległymi Internetami.
-
Zastosowanie addytywów w separacji pianowej białek serwatkowych i białek mlecznych
PublicationZaproponowano proces separacji pianowej do wydzielania białek ze strumieni poprodukcyjnych przemysłu mleczarskiego Ponadto zaproponowano zastosowanie w separacji pianowej białek serwatkowych i mlecznych addytywów dopuszczonych ustawą do stosowania w żywności. Jako cel pracy przyjęto uzyskanie wyników uzasadniających wybór takich addytywów, które intensyfikują przebieg i polepszają wynik procesu separacji pianowej białek. W części...
-
Monitoring of lysozyme thermal denaturation by volumetric measurements and nanoDSF technique in the presence of N-butylurea
PublicationThe results of thermal studies of denaturation of hen egg white lysozyme (HEWL) in water and an aqueous solution of N-butylurea (BU) are presented. High-precision densimetric measurements were used to characterize and analyze the changes of the specific volume, v, during temperature elevation. The temperature of the midpoint of protein denaturation was also determined by nanoDSF technique (differential scanning fluorimetry). The...
-
Specyfikacja i implementacja modułu wymiarowania zasobów w Systemie IIP
PublicationArtykuł zawiera opis specyfikacji oraz implementacji modułu wymiarowania zasobów działającego w warstwach L1 i L2 architektury Systemu IIP. Omówiono zadania modułu wymiarowania, zdefiniowano styki z systemem zarządzania oraz Równoległymi Internetami, jak również zaproponowano algorytmy optymalizacyjne oraz przedstawiono przykładowe wyniki działania tych algorytmów.
-
Specyfikacja i implementacja modułu wymiarowania zasobów w Systemie IIP
PublicationArtykuł zawiera opis specyfikacji oraz implementacji modułu wymiarowania zasobów działającego w warstwach L1 i L2 architektury Systemu IIP. Omówiono zadania modułu wymiarowania, zdefiniowano styki z systemem zarządzania oraz Równoległymi Internetami, jak również zaproponowano algorytmy optymalizacyjne oraz przedstawiono przykładowe wyniki działania tych algorytmów.
-
Nowy model edukacji oparty na swobodnej zabawie, wielojęzyczności oraz rozwoju emocjonalnym, naukowym i sportowym
PublicationArtykuł prezentuje eksperymentalny projekt edukacyjny pod partonatem MEN, FRSE oraz Europejskiego Roku Kreatywności i Innowacyjnoscirealizowany w Gdańsku od 2009 roku. Projekt uwzględnia naukę L1, L2, L3 poprzez imersję oraz wprowadzenie elementów nauk ścisłych u dzieci w wieku od 2 do 6 lat.
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen SAG1-SAG2-AMA1F
Open Research DataThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen SAG1-SAG2-MAG1L
Open Research DataThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Robust algorithm for active feedback control of narrowband noise
PublicationThe problem of active control of narrowband acoustic noise is considered. It is shown that the proposed earlier feedback control algorithm called SONIC (self-optimizing narrowband interference canceller), based on minimization of the L2-norm performance measure, can be re-derived using the L1 approach. The resulting robust SONIC algorithm is more robust to heavy-tailed measurement noise, such as the αlpha-stable noise, than the...