Search results for: BIOSYNTEZA AMINOKWASÓW
-
Spektrometria mas jako narzędzie umożliwiające poznanie metabolomu-główne strategie i wyzwania
PublicationBadania z zakresu metabolomiki ukierunkowane są na wykrywanie i oznaczanie endogennych związków małocząsteczkowych o masie <1000 Da (np. aminokwasy, cukry, lipidy) w próbkach biologicznych takich jak płyny biologiczne (głównie krew i mocz) oraz kondensaty wydychanego powietrza. Ze względu na szerokie spektrum występowania i niskie poziomy stężeń metabolitów w próbkach, analizy metabolomiczne wymagają stosowania technik o wysokiej...
-
Amphotericin B derivatives: novel strategy for the development of non-toxic, broad spectrum, fungicidal and overcoming multidrug resistance antifungal agents.
PublicationZaprezentowano porównawczą charakterystykę działania amfoterycyny B (AmB) oraz jej pochodnych o różnym stopniu selektywnej toksyczności na szczepy grzybów reperezentujących różne mechanizmy oporności. Były to mutanty C. albicans posiadające defekt w szlaku biosyntezy ergosterolu oraz wielolekooporne szczepy S. cerevisiae wyposażone w pompy eksportujące typu ABC i MFS. Badania obejmowały: 1)porównanie aktywności przeciwgrzybowej...
-
Enzymes of the L-methionine biosynthetic pathway as novel molecular targets for antifungal chemotherapy
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry according to UMO-2020/39/B/NZ7/01519 agreement from 2021-07-08
-
Niebiałkowe związki azotowe
PublicationNiebiałkowe związki azotowe (NPN - non protein nitrogen) są grupą składników wchodzących w skład produktów żywnościowych ważną nie tylko z punktu widzenia producentów żywności, ale także dla specjalistów do spraw żywienia. Do grupy tej należą przede wszystkim wolne aminokwasy i krótkie peptydy, aminy, kwasy nukleinowe i nukleotydy oraz inne mało cząsteczkowe składniki zawierające azot (glikozydy cyjanogenne, alkaloidy, tiazole,...
-
Niebiałkowe związki azotowe
PublicationNiebiałkowe związki azotowe (ang. non protein nitrogen, NPN) są grupą składników wchodzących w skład produktów żywnościowych ważną nie tylko z punktu widzenia producentów żywności, lecz także dla specjalistów do spraw żywienia. Do tej grupy należą przede wszystkim wolne aminokwasy i oligopeptydy, aminy, kwasy nukleinowe i nukleotydy oraz inne mało cząsteczkowe składniki zawierające azot (glikozydy cyjanogenne, alkaloidy, tiazole,...
-
Regulacja aktywności syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans – badania metodami obliczeniowymi
PublicationNiniejsza praca przedstawia wyniki badań, prowadzonych metodami obliczeniowymi, poświęconych enzymowi syntazie GlcN-6-P pochodzącemu z drożdży C. albicans. Enzym ten odpowiedzialny jest między innymi za biosyntezę kluczowych składników ściany komórkowej grzybów i bakterii, ma również wpływ na regulację metabolizmu glukozy. Przedstawione badania stanowią jeden z etapów poszukiwania molekularnego mechanizmu inhibicji, której eukariotyczna...
-
Oznaczanie neurotoksyny, β-N-metylamino-L-alaniny (BMAA), w materiale biologicznym
Publicationβ-N-metylamino-L-alaniny (BMAA) jest naturalnie występującym niebiałkowym aminokwasem. W strukturze związku występuje grupa karboksylowa o pKa1 2,1 , pierwszorzędowa grupa aminowa o pKa2 6,5 i drugorzędowa grupa aminowa o pKa3 9,8. Przy fizjologicznych wartościach pH (7,4), w obecności CO2/HCo3-, BMAA tworzy węglanowe addukty (BMAA-α - NCO2 i BMAA-β-NCO2) o działaniu agonistycznym względem receptorów glumatinianu. Efektem jest...
-
Synteza i badania biologiczne nowych analogów kwasu mykofenolowego z pochodnymi adenozyny jako potencjalnych leków immunosupresyjnych
PublicationPrzedstawiona praca doktorska pt. „Synteza i badania biologiczne nowych analogów kwasu mykofenolowego z pochodnymi adenozyny jako potencjalnych leków immunosupresyjnych” poświęcona jest związkom immunosupresyjnym opartym o cząsteczkę kwasu mykofenolowego oraz pochodnych adenozyny. Z medycznego punktu widzenia, gdy długotrwała choroba lub nagły przypadek powoduje nieodwracalny uraz tkanek, komórek lub niewydolność organu i żadna...
-
Rola rodników, utleniaczy i przeciwutleniaczy w żywności
PublicationLiczne procesy, chemiczne, enzymatyczne i mikrobiologiczne zachodzące podczas przechowywania i przetwarzania, mają wpływ na kształtowanie jakości żywności. Istotne znaczenie ma utlenianie przy udziale wolnych rodników i reaktywnych form tlenu (RFT). Zmiany powodowane utlenianiem m.in. pogarszają sensoryczne właściwości i wartość odżywczą żywności oraz mogą wywoływać zagrożenia zdrowotne wynikające ze szkodliwości niektórych produktów...
-
Piotr Skurski prof. dr hab.
PeoplePiotr Stanisław Skurski (ur. 25 sierpnia 1969 w Gdańsku) – polski chemik specjalizujący się w chemii kwantowej i fizycznej, profesor nauk chemicznych, profesor zwyczajny Wydziału Chemii Uniwersytetu Gdańskiego, kierownik Katedry Chemii Teoretycznej i Pracowni Chemii Kwantowej na tym wydziale, a także Professor of Chemistry w Henry Eyring Center for Theoretical Chemistry na Uniwersytecie Utah w Stanach Zjednoczonych. W latach 2011-2016 członek...
-
Pochodne amfoterycyny B z zawadą przestrzenną - nowa grupa antymykotyków o niskiej toksyczności i aktywnych względem szczepów z opornością wielolekową. Badanie natury i mechanizmów ich właściwości fizykochemicznych i biologicznych
PublicationBadania prezentowane w ramach niniejszej rozprawy koncentrują się na poznaniu i wyjaśnieniu molekularnych mechanizmów leżących u podstaw poprawy selektywnej toksyczności pochodnych amfoterycyny B z zawadą przestrzenną jak również ich aktywności względem opornych szczepów grzybowych. Kluczowe wnioski wynikające z pracy są następujące: i) mutanty drożdżaków z defektem biosyntezy ergosterolu zachowują wrażliwość na badane związki...
-
Paweł Filipkowski dr inż.
PeoplePaweł Filipkowski Ph.D. Biotechnology Department of Chemistry, Technology and Biotechnology of Food Faculty of Chemistry Gdansk University of Technology Narutowicza 11/12 80-233 Gdansk, Poland Tel: +48 58 3472456 e-mail: pawel.filipkowskiATpg.edu.pl Current position: Assistant Professor/Senior Lecturer*(from Jan.2019) of Biotechnology, Department of Chemistry, Technology and Biotechnology of Food, Gdansk University of Technology. Education: Eng....
-
Analiza in silico bioaktywnych peptydów pochodzących z keratyny z piór drobiowych
PublicationKeratyna należy do najbardziej powszechnie występujących białek strukturalnych pochodzenia zwierzęcego. Stanowi ok. 90% masy piór wytwarzanych w dużych ilościach przez przemysł drobiarski. Ten odpadowy produkt pozostaje w dużym stopniu niezagospodarowany. Celem pracy była analiza bioinformatyczna pierwszorzędowej struktury keratyny z piór kurzych pod kątem występowania w niej peptydów bioaktywnych....
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublicationW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Metoda głównych składowych w analizie wyników otrzymanych za pomocą dynamiki molekularnej
PublicationMetoda głównych składowych (ang. principal component analysis, PCA) jest jednym z najpopularniejszych statystycznych narzędzi do wielowymiarowej analizy dużego zestawu danych. Pozwala ona na przekształcenie danego zbioru wzajemnie skorelowanych cech (zmiennych) w nowy układ cech wzajemnie nieskorelowanych (tzw. głównych składowych), który jest porównywalny z układem pierwotnym - zastosowanie PCA upraszcza więc w znaczny sposób...
-
- An unique fungal lysine biosynthesis enzymes: new targets for antifungal agents?
ProjectsProject realized in Faculty of Chemistry according to POMOST/2010-2/4 agreement from 2011-05-17
-
Stabilizing agents and protein stability
PublicationBiałka są kluczowymi elementami żywych organizmów, jak również efektywnymi katalizatorami w biotechnologii i medycynie. Szybki rozwój wielu gałęzi biotechnologii wiąże się z coraz większym zapotrzebowaniem na produkty białkowe charakteryzujące się wysoką stabilnością. Jednym ze sposobów osiągnięcia większej stabilności białek jest wykorzystanie małych związków organicznych, tzw. osmolitów. Do tej grupy związków należą aminokwasy,...
-
Kapusta - głowa…pełna
PublicationKapusta biała jest jednym z najpopularniejszych przedstawicieli rodziny warzyw krzyżowych uprawianych w Polsce. Wśród głównych cech kapusty jako gatunku należy przede wszystkim wymienić:• zdolność do bioakumulacji zanieczyszczeń środowiskowych (w szczególności metali ciężkich, trwałych związków organicznych),• wytwarzanie wysokiej ilości związków siarkoorganicznych - fitozwiązków (glukozynolanów (GLS), indolowych pochodnych ich...
-
The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains
PublicationBiogeneza fimbrii Dr kodowanych przez operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli (infekcje górnych dróg moczowych) odbywa się na bazie zakonserwowanego systemu sekrecji typu chaperone-usher. Funkcjonowanie powyższego systemu sekrecji opiera się na dwóch komponentach białkowych, periplazmatycznym chaperonie DraB i zewnątrzbłonowym kanale DraC. Białko DraB kontroluje proces składania podjednostek fimbrialnych DraE, natomiast...
-
ZzP - Biotechnologia wokól nas - Spotkanie Akademickie 17.04.2021 r.
e-Learning CoursesSpotkanie akademickie poświęcone będzie mikroorganizmom, które tak naprawdę są wszędzie. Nie widzimy ich gołym okiem, ale nawet bez oglądania możemy poznać ich niektóre, ważne dla nas cechy. Musimy tylko umieć je wyhodować, co wbrew pozorom, w przypadku większości gatunków mikroorganizmów, nie jest łatwe. Jednym z istotniejszych etapów pracy biologa molekularnego jest możliwość izolacji DNA danego organizmu, dlatego podczas zajęć...
-
ZzP - Mikroorganizmy wśród nas - Spotkanie Akademickie 14.11.2020 r.
e-Learning CoursesSpotkanie akademickie poświęcone będzie mikroorganizmom, które tak naprawdę są wszędzie. Nie widzimy ich gołym okiem, ale nawet bez oglądania możemy poznać ich niektóre, ważne dla nas cechy. Musimy tylko umieć je wyhodować, co wbrew pozorom, w przypadku większości gatunków mikroorganizmów, nie jest łatwe. Jednym z istotniejszych etapów pracy biologa molekularnego jest możliwość izolacji DNA danego organizmu, dlatego podczas zajęć...
-
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublicationAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...
-
Ćwiczenia audytoryjne z Chemii Organicznej 2021/2022
e-Learning CoursesNa ćwiczeniach z Chemii Organicznej przerabiany będzie materiał zaprezentowany na wykładzie obejmujący: alkany i cykloalkany (nazewnictwo, konformacje, reakcje chemiczne), izomeria w związkach organicznych (strukturalna, geometryczna i optyczna), alkeny, alkiny i dieny (nazewnictwo, reakcje chemiczne, otrzymywanie, izomeria cis-trans, reakcje addycji, reguła Markownikowa, przykłady reakcji polimeryzacji, reakcje Dielsa-Aldera),...