Search results for: PEPTYDY TRANSPORTUJĄCE
-
Maria Szpakowska prof. dr hab. inż.
PeopleProf. dr hab. inż. Maria Jolanta Szpakowska jest absolwentką Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej, na którym uzyskała stopnie i tytuły naukowe. W latach 1969–1995 pracowała w Zakładzie Chemii Fizycznej a w latach 1995 – 2022 na Wydziale Zarządzania i Ekonomii (WZiE). Pełniła kolejno funkcję kierownika Pracowni, Zakładu Towaroznawstwa a następnie Katedry Zarządzania Jakością i Towaroznawstwa. W latach 2008-2010 była prodziekanem...
-
Sławomir Milewski prof. dr hab. inż.
PeopleSławomir Milewski, born in 1955 in Puck, Poland, graduated in 1979 in Chemistry from the Faculty of Chemistry, Gdańsk University of Technology (GUT). In 1984 was employed at the Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry. In 1985 he got his PhD, in 1994 became a DSc (habilitation) and in 2002 got the professorship in chemical sciences. Currently he is a full professor and Head of the Department of Pharmaceutical Technology...
-
Wpływ rodzaju kwasu jako dodatku do eluentu na parametry rozdzielania polifenoli techniką chromatografii cieczowej w odwróconych układach faz (RP-HPLC)
PublicationChromatografia cieczowa jest jedną z technik wykorzystywanych w badaniach składu mieszanin, a także do wydzielania czystych składników z mieszanin w postaci frakcji eluatu. Z punktu widzenia współczesnej chemii, farmakologii, a także medycyny, czy biotechnologii, chromatografia pełni ważną rolę, w zakresie analityki jakościowej i ilościowej. Dzięki możliwości otrzymywania naturalnych składników biologicznie czynnych w czystej...
-
Niebiałkowe związki azotowe. Rozdział 8
PublicationAzot związków niebiałkowych stanowi od kilku do kilkudziesięciu procent ogólnej ilości azotu w różnych surowcach żywnościowych. Wskutek enzymatycznych i chemicznych przemian w czasie przechowywania i przetwarzania zmienia się udział i skład tych związków. Niebiałkowe związki azotowe uczestniczą w tworzeniu zapachu i smaku produktów żywnościowych, niektóre z nich, np. histamina są szkodliwe dla zdrowia, inne np N-nitrozoaminy lub...
-
Effect of ectoine on hydration spheres of peptides–spectroscopic studies
PublicationIn this paper, we use FTIR spectroscopy to characterize the hydration water of ectoine, its interactions with two peptides–diglycine and NAGMA, and the properties of water molecules in the hydration spheres of both peptides changed by the presence of the osmolyte. We found that the interaction of ectoine with the peptide hydration shells had no effect on its own hydration sphere. However, the enhanced hydration layer of the osmolyte...
-
Phage-Directed Synthesis of Photoluminescent Zinc Oxide Nanoparticles under Benign Conditions
PublicationBiological systems, especially bacteriophages and peptides, are an attractive green alternative to other known methods of nanoparticle synthesis. In this work, for the first time, bacteriophages were employed to synthesize a specific peptide, capable of producing nanoparticles (NPs). Derivatives of M13 bacteriophage exposing a ZnO-binding peptide (TMGA-LGLKWPV) on either pIII or pVIII phage coat protein were constructed and used...
-
Molecular basis and quantitative assessment of TRF1 and TRF2 protein interactions with TIN2 and Apollo peptides
PublicationShelterin is a six-protein complex (TRF1, TRF2, POT1, RAP1, TIN2, and TPP1) that also functions in smaller subsets in regulation and protection of human telomeres. Two closely related proteins, TRF1 and TRF2, make high-affinity contact directly with double-stranded telomeric DNA and serve as a molecular platform. Protein TIN2 binds to TRF1 and TRF2 dimer-forming domains, whereas Apollo makes interaction only with TRF2. To elucidate...
-
Release systems based on self-assembling RADA16-I hydrogels with a signal sequence which improves wound healing processes
PublicationSelf-assembling peptides can be used for the regeneration of severely damaged skin. They can act as scaffolds for skin cells and as a reservoir of active compounds, to accelerate scarless wound healing. To overcome repeated administration of peptides which accelerate healing, we report development of three new peptide biomaterials based on the RADA16-I hydrogel functionalized with a sequence (AAPV) cleaved by human neutrophil elastase...
-
Fatty acyl benzamido antibacterials based on inhibition of DnaK-catalyzed protein folding
PublicationWe have reported that the hsp70 chaperone DnaK from Escherichia coli might assist protein folding by catalyzing the cis/trans isomerization of secondary amide peptide bonds in unfolded or partially folded proteins. In this study a series of fatty acylated benzamido inhibitors of the cis/trans isomerase activity of DnaK was developed and tested for antibacterial effects in E. coli MC4100 cells. Nα-[Tetradecanoyl-(4-aminomethylbenzoyl)]-l-asparagine...
-
Beata Zalewska-Piątek dr hab.
People -
Synthesis of conjugates of muramyl dipeptide and nor-muramyl dipeptide with retro-tuftsin (Arg-Pro-Lys-ThrOMe) as potential immunostimulants.
PublicationOpisano syntezę nowych koniugatów muramylodipeptydu i nor-muramylo-dipeptydu z estrem metylowym tuftsyny o odwróconej sekwencji (Arg-Pro-Lys-Thr-OMe)jako potencjalnych immunostymulantów. Synteza tych połączeń została przeprowadzona zgodnie z zasadami chemii peptydów.
-
Butyrylcholinesterase signal sequence self-aggregates and enhances amyloid fibril formation in vitro
PublicationAlzheimer’s disease (AD) pathogenesis has been attributed to extracellular aggregates of amyloid β (Aβ) plaques and neurofibrillary tangles in the human brain. It has been reported that butyrylcholinesterase (BChE) also accumulates in the brain Aβ plaques in AD. We have previously found that the BChE substitution in 5′UTR caused an in-frame N-terminal extension of 41 amino acids of the BChE signal peptide. The resultant variant...
-
Technologie informacyjne i komunikacyjne w Polsce : stan obecny i perspektywy rozwoju
PublicationNowoczesne technologie informacyjne i komunikacyjne (icts - information and communication technologies) to jeden z najważniejszych elementów, który stanowi o stanie krajowej - jak i światowej - gospodarki. w literaturze można spotkać się z pew-ną dychotomią pojęciową icts. z jednej strony icts są traktowane jako sektor gospodarki, który dostarcza dóbr i usług it, przyczyniając się do wzrostu go-spodarczego i zmieniając strukturę...
-
Gracjana Klein-Raina dr hab.
People -
Structural properties of hydration shell around various conformations of simple polypeptides
PublicationIn this paper we investigate structural properties of water within the solvation shell around the peptide core created by a well-defined conformation of polypeptide chain. The following secondary structures are investigated: linear (straight chain), and three helices PII (polyproline-like), 310, and α. We propose using the two-particle contribution to entropy as a rational measure of the water structural ordering within the solvation...
-
The immunological properties, cytotoxic effect and antimicrobial activities of novel analogues of edeine antibiotics
PublicationOpisano syntezę kilku nowych analogów edein a i d z zastosowaniem klasycznych metod syntezy peptydów w roztworze oraz przedstawiono wyniki badań cytotoksycznych na kilku liniach komórek ludzkich oraz wyniki badań mikrobiologicznych w stosunku do bakterii gramododatnich i gramoujemnych. Opisano również wyniki badań immunologicznych na modelu myszy.
-
Solid Phase Synthesis and Biological Activity of Tuftsin Conjugates
PublicationNew tuftsin/retro-tuftsin conjugates were designed and synthesized using a classical fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) solid phase procedure. All the peptide conjugates were divided into three series: 1,4-dihydroxyanthraquinone (type A), 1-nitroacridine (type B), and 4-carboxyacridone (type C) derivatives. In type A conjugates, the N-terminal group of the peptide chain is directly connected to the anthraquinone ring at C1 (Scheme...
-
Fragmentomic analysis of biopeptides in silico released from milk proteins
PublicationThe fragmentomic-assisted method was employed to predict the biological potential of peptides derived from milk proteins hydrolyzed by papain and bromelain. Firstly, protein sequences were acquired from the BIOPEP-UWM database and then hydrolyzed by the above enzymes using a BIOPEP-UWM tool called “Enzyme(s) action”. The released peptides were defined as parent peptides and further analyzed for the presence of shorter peptidic...
-
N-acylpeptides with glucosamine-6-phosphate synthase inhibitors - synthesisand antifungal activity
PublicationOpracowano syntezę kilku peptydów (di i tripeptydów) zawierających inhibitory syntazy glukozamino-6-fosforanu oraz przeprowadzono je w N-acylopochodne (acetylowe, heksanoilowe, dekanoilowe) oraz zbadano ich aktywność przeciwgrzybową w stosunku do szczepów Candida albicans z opornością wielolekową. Stwierdzono, że N-acylopeptydy wykazują aktywność przeciwgrzybową oraz określono wartości MIC.
-
Synthesis and structure analysis of ferrocene‐containing pseudopeptides
Publication -
Niebiałkowe związki azotowe
PublicationNiebiałkowe związki azotowe (NPN - non protein nitrogen) są grupą składników wchodzących w skład produktów żywnościowych ważną nie tylko z punktu widzenia producentów żywności, ale także dla specjalistów do spraw żywienia. Do grupy tej należą przede wszystkim wolne aminokwasy i krótkie peptydy, aminy, kwasy nukleinowe i nukleotydy oraz inne mało cząsteczkowe składniki zawierające azot (glikozydy cyjanogenne, alkaloidy, tiazole,...
-
Strategia analizy niecelowanej w metabolomice i lipidomice. Cz. 1. Aspekty praktyczne
PublicationStrategia analizy niecelowanej jest powszechnie wykorzystywana do analizy różnego rodzaju próbek biologicznych, takich jak tkanki czy płyny ustrojowe, w celu otrzymania „odcisku palca” oraz określenia różnic w składzie jakościowym oraz ilościowym pomiędzy badanymi próbkami. Wskazanie różnic w zawartości różnych biocząsteczek (peptydy, metabolity, lipidy) pozwala na uzyskanie informacji na temat powiązania składu biochemicznego...
-
Ryszard Andruszkiewicz prof. dr hab. inż.
People -
Synthesis and transport studies of model dipeptides with modified n-terminal amino groups into e. coli k12 mutant strains
Publicationotrzymano na drodze syntezy chemicznej kilka modelowych dipeptydów zawierających n-terminalna guanidynę oraz betainę. zbadano transport tych peptydów do komorek e. coli k12, posiadających zróżnicowane systemy transportowe. wyniki badań potwierdziły brak transportu do komórek bakteryjnych z wykorzystaniem permeaz peptydowych. dodatnio naładowana i silnie polarna grupa aminowa uniemożliwia efektywny transport tych związków do komórek...
-
Glutamine analogues containing a keto function - novel inhibitors of fungal glucosamine-6-phosphate synthase
PublicationW publikacji przedstawiono syntezę nowych pochodnych kwasu (S)-2,3-diaminopropanowego, zawierających reszty kwasów z funkcją ketonową. Dla otrzymanych związków zbadano właściwości inhibicyjne w stosunku do grzybowej syntazy glukozamino-6-fosforanu, ustalono właściwości lipofilowe otrzymanych związków a także aktywność przeciwgrzybową. Dla kilku wybranych pochodnych otrzymano ich dipeptydy, zbadano także ich aktywność przeciwgrzybową...
-
Cyanobacterial toxins in fresh and brackish waters of Pomorskie Province (Northern Poland)
PublicationPraca dotyczy oznaczania toksyn należących do grupy hepatotoksycznych peptydów cyklicznych oraz neurotoksycznych alkaloidów. Są one odpowiedzialne za uszkodzenia ryb i ptaków, które powstają w wyniku zakwitu glonów. Badano zakwity w wodach słodkich Pomorza. Oznaczano hepatoksyny, mikrocysty oraz nodularynę. Opracowano w tym celu warunki analityczne przy zastosowaniu techniki HPLC-DAD. Do identyfikacji anatoksyny-A użyto techniki...
-
A study on the protection of methionine and the reduction of methionine sulfoxide in methionine-containing analogues of the growth-modeling factor Gly-His-Lys
PublicationThe protection of methionine and the reduction of methionine sulfoxide in methionine-containing analogues of Gly-His-Lys are described. The peptides were synthesized by a solid-phase method using the standard Fmoc procedure. Simultaneous deprotection of the peptide side chain and liberation from the resin were achieved using an appropriate TFA cocktail. The TFA cocktail was selected to minimize oxidation of the methionine residue....
-
Amides as models to study the hydration of proteins and peptides — spectroscopic and theoretical approach on hydration in various temperatures
PublicationInteractions with water are one of the key factors which determine protein stability and activity in aqueous solutions. However, the protein hydration is still insufficiently understood. N-methylacetamide (NMA) is regarded as a minimal part of the peptide backbone and the relative simplicity of its structure makes it a good model for studies on protein–water interactions. In this paper, the influence of NMA and N,N-dimethylacetamide...
-
Inhibitory endopeptydazy prolinowej pochodzące z białek żywności
PublicationBioaktywne peptydy pochodzące z białek żywności mają nie tylko znaczenie żywieniowe, ale szczególnie profilaktyczne i terapeutyczne w przypadku wielu chorób. Są to małocząsteczkowe fragmenty białek, które po uwolnieniu podczas hydrolizy mogą wykazywać m.in. właściwości przeciwcukrzycowe, przeciwnadciśnieniowe, przeciwdrobnoustrojowe, przeciwutleniające, immunomodulujące...
-
Nowa strategia konstrukcji proleków przeciwgrzybowych na bazie peptydów penetrujących
ProjectsProject realized in Faculty of Chemistry according to UMO-2012/05/B/ST5/00291 agreement from 2013-01-30
-
Whole-genome sequencing and antimicrobial potential of bacteria isolated from Polish honey
PublicationThe aim of this study was the whole-genome analysis and assessment of the antimicrobial potential of bacterial isolates from honey harvested in one geographical location—the north of Poland. In total, 132 strains were derived from three honey samples, and the antimicrobial activity of CFAM (cell-free after-culture medium) was used as a criterion for strain selection and detailed genomic investigation. Two of the tested isolates...
-
Conformational latitude – activity relationship of KPPR tetrapeptide analogues toward their ability to inhibit binding of vascular endothelial growth factor 165 to neuropilin‐1
Publication -
Synthesis of analogues of anthraquinones linked to tuftsin or retro-tuftsin residues as potential topoisomerase inhibitors
PublicationZsyntetyzowano 10 nowych analogów antrachinonów z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny jako potencjalne inhibitory topoizomerazy. Substratem wyjściowym były zsyntetyzowane 1,4-, 1,5- i 1,8-bis(tosyloksy)-9,10-antrachinony oraz odpowiednio chronione pochodne tuftsyny i retro-tuftsyny, które otrzymano metodą mieszanych bezwodników z zastosowaniem chloromrówczanu izobutylu i NMM. Reakcje prowadzone były w acetonitrylu pod azotem w...
-
Synthesis of anthraquinone-tuftsin analogues as potential topoisomerase inhibitors
PublicationZaprezentowano syntezę nowych analogów antrachinonów z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny oraz wstępne badania biologiczne (aktywność cytotoksyczną na wybranych liniach nowotworowych oraz zdolność hamowania topoizomerazy I).
-
Oligopeptide antifungals are exceptionally active against multidrug-resistant yeast
PublicationPermeazy peptydowe w komórkach drożdżowych są zdolne do transportu do wnętrza komórek oligopeptydów, zawierających w swojej strukturze niebiałkowe aminokwasy o właściwościach przeciwgrzybowych. Wśród szerokiego wachlarza tego rodzaju związków przebadanych pod względem aktywności biologicznej na wielolekoopornych komórkach drożdżowych, zaobserwowano liczna grupę, wykazującą zwiększoną aktywność względem komórek eksprymujących transportery...
-
Structure-activity relationship studies on the antimicrobial activity of novel edeine a and d analogues
PublicationOpisano syntezę 4 nowych analogów peptydowego antybiotyku, edeiny a i d z wykorzystaniem klasycznej syntezy w roztworze. Stosowano metodę estrów aktywnych oraz metodę azydową do tworzenia wiązań peptydowych. Zbadano także aktywność przeciwgrzybową i przeciwbakteryjną opisanych połączeń.
-
Synthesis of conjugates of Combretastatin A-4 with tuftsin derivatives as potential anticancer agents
PublicationZaprezentowano syntezę nowych koniugatów Combretastatyny A-4 z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny, jako potencjalnych związków przeciwnowotworowych.
-
Synthesis of conjugates of MDP and nor-MDP linked to tuftsin derivatives as potential immunomodulators
PublicationZsyntetyzowano nowe koniugaty muramylodipeptydu (MDP) i nor-muramylo-dipeptydu (nor-MDP) z pochodnymi tuftsyny zawierającymi wiązanie izopeptydowe na epsilon-aminowej grupie lizyny jako potencjalne immunomodulatory. Do syntezy wykorzystano metodę mieszanych bezwodników z chloromrówczanem izobutylu i N-metylomorfoliną w bezwodnym DMF. Końcowe produkty charakteryzowno za pomocą NMR, analizy elementarnej i analizy aminokwasowej na...
-
Solid phase synthesis and biological activity of linear tuftsin and retro-tuftsin derivatives
PublicationPrzedstawiono syntezę na fazie stałej nowych pochodnych tuftsyny i retro-tuftsyny i ich mikrobiologiczne właściwości. Otrzymane pochodne zawierały wiązanie izopeptydowe między epsilon-aminową grupą lizyny a takimi aminokwasami jak: Ala, beta-Ala, Val, Ile, Gly.
-
Solid phase synthesis of conjugates of tuftsin analogues with 1-nitro-acridine derivatives
PublicationZsyntetyzowano na fazie stałej koniugaty 1-nitro-akrydyny z pochodnymi tuftsyny modyfikowanymi na grupie epsilon-aminowej lizyny prostymi aminokwasami, np. alaniną, valiną, beta-alaniną. Końcowe produkty były charakteryzowane za pomocą MS, NMR, analizy elementarnej i przekazane do badań ich aktywności przeciwnowotworowej.
-
Solid phase synthesis of 4,5,8-trihydroxy-9,10-anthraquinone-1-yl-(tuftsin or retro-tuftsin) derivatives
PublicationPrzedstawiono syntezę na fazie stałej połączeń leuko-1,4,5,8-tetra-hydroksyantrachinonów z pochodnymi tuftsyny i retro-tuftsyny zawierającymi wiązanie izopeptydowe. Do syntezy wykorzystano standardową metodę Fmoc i DIC jako odczynnik aktywujący.
-
Therapy-Related Changes in the Serum Proteome Patterns of Early Stage Breast Cancer Patients with Different Outcomes
Publication -
Molecular dynamics study of amyloid formation of two Abl-SH3 domain peptides
Publication -
Synthesis, activity on NK-3 tachykinin receptor and conformational solution studies of scyliorhinin II analogs modified at position 16
Publication -
Conformational studies of vasopressin and mesotocin using NMR spectroscopy and molecular modelling methods. Part II: studies in the SDS micelle
Publication -
Vasopressin V2 receptor/bioligand interactions
Publication -
Conformation-activity relationships ofcyclo-constrained µ/δ opioid agonists derived from theN-terminal tetrapeptide segment of dermorphin/deltorphin
Publication -
Solution conformational study of Scyliorhinin I analogues with conformational constraints by two-dimensional NMR and theoretical conformational analysis
Publication -
Computer modeling of the solution conformation of cyclic enkephalins
Publication -
Molecular Simulations of Rhodopsin Tetrameter
Publication