Filtry
wszystkich: 3400
-
Katalog
- Publikacje 2844 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 28 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 71 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 1 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 2 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 18 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 5 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 431 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: folded proteins
-
MP3vec: A Reusable Machine-Constructed Feature Representation for Protein Sequences
Publikacja—Machine Learning (ML) methods have been used with varying degrees of success on protein prediction tasks, with two inherent limitations. First, prediction performance often depends upon the features extracted from the proteins. Second, experimental data may be insufficient to construct reliable ML models. Here we introduce MP3vec, a transferable representation for protein sequences that is designed to be used specifically for sequence-to-sequence...
-
X-ray and UV Radiation Damage of dsDNA/Protein Complexes
PublikacjaRadiation and photodynamic therapies are used for cancer treatment by targeting DNA. However, efficiency is limited due to physico-chemical processes and the insensitivity of native nucleobases to damage. Thus, incorporation of radio- and photosensitizers into these therapies should increase both efficacy and the yield of DNA damage. To date, studies of sensitization processes have been performed on simple model systems, e.g.,...
-
Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14‐CAPRI experiment
PublikacjaWe present the results for CAPRI Round 50, the 4th joint CASP-CAPRI protein assembly prediction challenge. The Round comprised a total of 12 targets, including 6 dimers, 3 trimers, and 3 higher-order oligomers. Four of these were easy targets, for which good structural templates were available either for the full assembly, or for the main interfaces (of the higher-order oligomers). Eight were difficult targets for which only distantly...
-
Molecular targets for antifungals in amino acid and protein biosynthetic pathways
PublikacjaFungi cause death of over 1.5 million people every year, while cutaneous mycoses are among the most common infections in the world. Mycoses vary greatly in severity, there are long-term skin (ringworm), nail or hair infections (tinea capitis), recurrent like vaginal candidiasis or severe, life-threatening systemic, multiorgan infections. In the last few years, increasing importance is attached to the health and economic problems...
-
Mechanism of antifreeze protein functioning and the “anchored clathrate water” concept
PublikacjaIn liquid water, there is a natural tendency to form aggregates that consist of water molecules linked by hydrogen bonds. Such spontaneously formed aggregates are surrounded by a "sea" of disordered water molecules, with both forms remaining in equilibrium. The process of creating water aggregates also takes place in the solvation water of proteins, but in this case the interactions of water molecules with the protein surface shift...
-
Data on solutions of Hes1 system
Dane BadawczeHes1 protein (hairy and enhancer of split 1) belongs to the helix-loop-helix (bHLH) family of transcription proteins, i.e. DNA-binding proteins in the promoter region or in another region where regulation of transcription processes occurs. The database collects data on solutions of the Hes1 systems with multiple binding sites and the dimer formation...
-
Lapping flat surfaces with forced dosing of abrasive suspension
PublikacjaPrzedstawiono zbudowane stanowisko do badań wymuszonego dawkowania zawiesiny ściernej w procesie jednostronnego docierania powierzchni płaskich. Podano przyjęty program badań oraz sposób opracowania wyników realizowanych eksperymentów.
-
Lapping flat surfaces with forced dosing of abrasive suspension
PublikacjaPrzedstawiono zbudowane stanowisko badawcze umożliwiające wymuszone dozowanie zawiesiny ściernej w operacji docierania jednotarczowego powierzchni płaskich. Podano program badań własnych oraz sposób opracowania otrzymanych wyników realizowanych eksperymentów.
-
Innovative Cold-formed GEB Section under Bending
PublikacjaThis paper is concerned with the numerical bending capacity study of the innovative cold-formed GEB sections. Both linear buckling analysis and non-linear static analysis incorporating geometric and material nonlinearity were carried out employing a shell structural model. The magnitudes of buckling load and limit load with respect to GEB section depth and thickness were obtained. The opened cold-formed section was tested assuming...
-
Why is the cubic structure preferred in newly formed ice?
PublikacjaMolecular dynamics was employed to explain the preference for the cubic structure in newly formed crystals of ice. The results showed that in supercooled liquid water the molecules connected by hydrogen bonds are more likely to adopt relative orientations similar to the ones characteristic for cubic ice. The observed preference for certain relative orientations of molecules in the hydrogen-bonded pairs results in the higher probability...
-
POLDER AND CITY: SUSTAINING WATER LANDSCAPES ON AN URBAN EDGE
PublikacjaThe question investigated in this paper is how to maintain the environmental quality of the polder landscape encompassing the city in the condition of urban pressure on this landscape. On the basis of theoretical approaches, historical surveys and introductory study models new ideas are tested on the case study of Gdansk, a city located in the Vistula River delta in northern Poland. Research shows that the city was created as a...
-
COLD CRACKING OF S460N STEEL WELDED IN WATER ENVIRONMENT
PublikacjaThis paper shows results of weldability testing of fine-grained high -strength low- alloy S460N steel welded in water environment by covered electrodes. The tests were carried out by using the CTS test specimens with fillet welds. Four specimens were welded under water and one specimen in air. Welded joints were subjected to non-destructive visual and penetration tests. The accepted joints were then subjected to macroscopic and...
-
Environmental costs for exploitation variants of Racibórz dry polder
Publikacja -
Conversion of Potato Industry Waste into Fodder Yeast Biomass
Publikacja -
Heat tint colours on stainless steel and welded joints
PublikacjaSurface layer condition of stainless steels and welded joints influences strongly their corrosion resistance. This problem seems to be underestimated. This current study explains the phenomenon of heat tint forming on welds, the methods of its removal, inspection procedures after heat tint removing and post weld finishing
-
Partially prestressed concrete beams with bonded and unbonded strands
PublikacjaThis article relate the tests of partially prestressed concrete beams. There is presented the research programme - geometry of elements, method of loading, the materials and variables. There have been shown preliminary test results of prestressed concrete elements with bonded and unbonded strands, and compared to the test results of R.C. beam.
-
Bolted Joint Monitoring Using the Elastic Wave Propagation
Publikacja -
Emulsion-Based Gel Loaded with Ibuprofen and Its Derivatives
Publikacja -
Determination of toluene formed during fermentation of sewage sludge
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki oznaczeń toluenu w próbkach osadów ściekowych przy wykorzystaniu techniki wypłukiwania i jednoczesnego wychwytywania analitów (PT). Badania procesu feremntacji osadów ściekowych doprowadziły do stwierdzenia, że w trakcie tego procesu powstaje toluen. Stwierdzono wzrost stężenia toluenu od poziomu 3 mg/l do ponad 24 mg/l dla próbek osadów ściekowych z Oczyszczalni Gdańsk -Wschód oraz od poziomu 0,6 mg/l...
-
Mechanical properties of dissimilar welded joints for chemical tankers
PublikacjaArtykuł przedstawia właściwości mechaniczne złączy różnoimiennych stali typu duplex oraz austenitycznej typu 316L otrzymanych za pomocą spawania automatycznego łukiem krytym. Wykazano możliwość wykorzystania wysokowydajnej metody SAW w miejsce dotychczas stosowanych metod GTAW i GMAW do spawania blach zbiorników statków do przewozu chemikaliów. Pomimo obawy uzyskania nieodpowiednich struktur złączy okazało się, że spawanie stali...
-
Propagation in Rectangular Waveguides Periodically Loaded with Cylindrical Posts.
PublikacjaAnaliza rozchodzenie się fali elektromagnetycznej w falowodach prostokątnych z okresowo rozmieszczonymi cylindrycznymi obiektami. Wynikiem analizy są stałych rozprzestrzeniania rodzajów Floquet, które uzyskuje się z rozwiązania równania własnego. W artykule przeprowadzone zostało badanie teoretyczne i eksperymentalne struktur prawie-okresowych i ich macierzy rozproszenia. Pokazano również istnienie pasm przewodzących i zaporowych,...
-
Fatigue properties of laser welded steel sandwich panel.
PublikacjaPrzedstawiono wyniki badań laboratoryjnych paneli SANDWICH, prowadzonych w Kat. TOiOO Wydz. OiO na konstrukcjach w skali rzeczywistej. Przedstawiono program badań, omówiono założenia procedur badawczych i konstrukcję stanowisk testowych. Dokonano porównania uzyskanych rezultatów z wynikami prezentowanymi w literaturze. Przedstawiono propozycję algorytmu szacowania trwałości zmęczeniowej konstrukcji spawanych laserowo.
-
Investigations of welded joints of dissimilar heat resistant steels.
PublikacjaPrzeprowadzono badania metalograficzne połączeń spawanych różnorodnych stali żarowytrzymałych rur o przekroju 31,8x7,1 mm ze stali 10H2M z blachą ze stali 20H23N18. Badania makro- i mikrostruktury złączy spawanych wykazały, że istotnym czynnikiem wpływającym na właściwości mechaniczne złącza jest obecność wad takich jak pory lub wtrącenia żużla. Te nieciągłości w materiale powodują koncentrację naprężeń i powstawanie mikropęknięć.
-
On forced vibrations of piezo-flexomagnetic nano-actuator beams
PublikacjaThe effect of excitation frequency on the piezomagnetic Euler-Bernoulli nanobeam taking the flexomagnetic material phenomenon into consideration is investigated in this chapter. The magnetization with strain gradients creates flexomagneticity. We couple simultaneously the piezomagnetic and flexomagnetic properties in an inverse magnetization. Resemble the flexoelectricity, the flexomagneticity is also size-dependent. So, it has...
-
APPLICATION POSSIBILITIES OF THE S960 STEEL IN UNDERWATER WELDED STRUCTURES
PublikacjaIn this paper, the application possibilities of the ultra-high strength (UHSS). Domex 960 steel in the underwater welded structures are analyzed. In the research, the investigated material has been tested in bead-on-plate wet welding conditions with the usage of different heat input values, namely 0.63 kJ/mm, 0.72 kJ/mm and 0.93 kJ/mm. Specimens were performed by the manual metal arc (MMA) welding method with the usage of rutile...
-
Antibacterial Porous Systems Based on Polylactide Loaded with Amikacin
PublikacjaThree porous matrices based on poly(lactic acid) are proposed herein for the controlled release of amikacin. The materials were fabricated by the method of spraying a surface liquid. Description is given as to the possibility of employing a modifier, such as a silica nanocarrier, for prolonging the release of amikacin, in addition to using chitosan to improve the properties of the materials, e.g., stability and sorption capacity....
-
Iron filled carbon nanostructures from different precursors
Publikacja -
Preparation, characterization and photocatalytic activity of metal-loaded NaNbO3
Publikacja -
Synthesis and characterization of iron-filled multi-walled nanotubes
Publikacja -
Use of X-ray radiography in the diagnosis of bonded anchors
PublikacjaKotwy wklejane należą do najbardziej popularnych metod montażu elementów konstrukcyjnych. Promieniowanie rentgenowskie częściowo umożliwia diagnostykę zespolenia lepiszcza z podłożem. W pracy przedstawiono wyniki analizy wpływu parametrów technicznych aparatów rentgenowskich na sposób i dokładność wykonania zdjęć diagnostycznych osadzenia kotew stalowych przy zastosowaniu lepiszcza syntetycznego
-
Innovative cold-formed GEB section under compression
PublikacjaCold-formed steel sections extensively affect the modern steel construction industry. Not only are they used as secondary elements like purlins or sheeting, but also they can serve as primary load-bearing members in fabricated steel panels and trusses. A new cross-section called shortly a GEB may serve as that member. However, its existence of the metal building structures industry depends on the exact, optimal dimensional parameters...
-
Possibilities for assesment of the angular distortion in Welded T-joint
PublikacjaSpawanie jest podstawową techniką łączenia elementów konstrukcji kadłuba statku. Procesowi temu towarzyszą odkształcenia spawalnicze, co przysparza dużo problemów wykonawczych. W pracy przedstawiono wpływ przewymiarowania spoiny pachwinowej na wielkość kątowych odkształceń złącza. Dokonano porównania wartości określonych na podstawie inżynierskich hipotez z wynikami otrzymanymi podczas prób laboratoryjnych.
-
Acoustic heating produced in resonators filled by a newtonian fluid
PublikacjaAcoustic heating in resonators is studied. The governing equation of acoustic heating is derived by means of the special linear combination of conservation equations in differential form, allowing the reduction of all acoustic terms in the linear part of the final equation, but preserving terms belonging to the thermal mode responsible for heating. This equation is instantaneous and includes nonlinear acoustic terms that form a...
-
CLASSIFICATION OF RESTRAINTS IN THE OPTIMIZATION PROBLEM OF A COLD-FORMED PROFILE
PublikacjaThis work describes the restraints in the optimization problem. This is an important and complicated issue because it requires taking into account a vast range of information related to the design and production. In order to describe the relations of a specific optimization problem, it is essential to adopt appropriate criteria and to collect information on all kinds of restraints, i.e. boundary conditions. The following paper...
-
A large family of filled skutterudites stabilized by electron count
PublikacjaThe Zintl concept is important in solid-state chemistry to explain how some compounds that combine electropositive and main group elements can be stable at formulas that at their simplest level do not make any sense. The electronegative elements in such compounds form a polyatomic electron-accepting molecule inside the solid, a ‘polyanion’, that fills its available energy states with electrons from the electropositive elements...
-
The Immunogenic and Immunoprotective Activities of Recombinant Chimeric T. gondii Proteins Containing AMA1 Antigen Fragments
PublikacjaToxoplasmosis, one of the most common parasitoses worldwide, is potentially dangerous for individuals with a weakened immune system, but specific immunoprophylaxis intended for humans is still lacking. Thus, efforts have been made to create an efficient universal vaccine for both animals and humans to overcome the shortcomings of currently used treatment methods and protect all hosts against toxoplasmosis. The current work represents...
-
Protective Effect of Black Tea Against Ethanol-Induced Oxidative Modifications of Liver Proteins and Lipids
Publikacja -
Discrimination of normal oral mucosa from oral cancer by mass spectrometry imaging of proteins and lipids
Publikacja -
Extracellular Matrix Proteins Expression Profiling in Chemoresistant Variants of the A2780 Ovarian Cancer Cell Line
Publikacja -
Prediction of the structures of proteins with the UNRES force field, including dynamic formation and breaking of disulfide bonds
Publikacja -
Efficient removal of dyes and proteins by nitrogen-doped porous graphene blended polyethersulfone nanocomposite membranes
Publikacja -
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublikacjaThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublikacjaW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublikacjaWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
-
Investigations of changes in the arabinogalactan proteins (AGPs) structure, size and composition during the fruit ripening process
Publikacja -
Ovocystatin Induced Changes in Expression of Alzheimer’s Disease Relevant Proteins in APP/PS1 Transgenic Mice
Publikacja -
Novel thermostable ssDNA-binding proteins from Thermus thermophilus and T. aquaticus - expression and purification
PublikacjaBiałka SSB są niezbędne do życia każdemu organizmowi. W tej pracy prezentujemy wyniki otrzymania i oczyszczania białek SSB Thermus thermophilus i T. aquaticus. Dotąd były znane białka SSB jedynie o budowie homotetrameru lub heterotrimeru. Białka SSB Thermus thermophilus i T. aquaticus stanowią nową klasę białek SSB - białek homodimerycznych. Ponadto dowiedziono, iż białka te są użyteczne w reakcji PCR.
-
Relationship between seawater pollution and qualitative changes in the extracted proteins from mussels Mytilus galloprovincialis
PublikacjaCelem badań było znalezienie wiarygodnego bioznacznika dla oceny poziomu zanieczyszczenia wody morskiej. W tym celu porównano:-zawartość żelaza (Fe) oraz miedzi (Cu)-białek-poziomu aktywności przeciwutleniającejmałży (Mytilus galloprovincialis)zebranych z rejonów zanieczyszczonych i niezanieczyszczonych bułgarskiej strefy ekonomicznej Morza Czarnego.W badanich wykorzystano takie techniki analityczne jak: -spektroskopia w podczerwieni...
-
Novel thermostable ssDNA-binding proteins from Thermus thermophilus and T. aquaticus-expression and purification
PublikacjaSklonowano w system ekspresyjny pET-30LIC Escherichia coli gen kodujący białka SSB-podobne Thermus thermophilus i T. aquaticus. Oczyszczono do homogenności białka SSB-podobne, a uzyskane preparaty umożliwiają wykonanie badań strukturalnych w/w białek.
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublikacjaMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...