Wyniki wyszukiwania dla: DSB PROTEINS

• The Characteristics of New SSB Proteins from Metagenomic Libraries and Their Use in Biotech Applications

  Publikacja

  • O. Werbowy
  • A. Stefańska-Kaźmierczak
  • A. Jurczak-Kurek
  • K. Kwiatkowska-Semrau
  • A. Kaczorowska
  • M. Płotka
  • O. Fridjonsson
  • G. Hreggvidsson
  • S. Dąbrowski
  • T. Kaczorowski

  - Rok 2020

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION

  Czasopisma

  ISSN: 1046-5928 , eISSN: 1096-0279

• DSC and electrophoretic studies on protein denaturation of Anodonta woodiana (Lea, 1834)

  Publikacja

  • P. Konieczny
  • J. Tomaszewska-Gras
  • W. Andrzejewski
  • B. Mikołajczak
  • M. Urbańska
  • J. Mazurkiewicz
  • J. Stangierski

  - JOURNAL OF THERMAL ANALYSIS AND CALORIMETRY - Rok 2016

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Function and Frustration of Multi-Drug ABC Exporter Protein and Design of Model Proteins for Drug Delivery Using Protein Hydration Thermodynamics

  Publikacja

  • D. Urry
  • K. Urry
  • W. Szaflarski
  • M. Nowicki
  • M. Zabel

  - CURRENT PHARMACEUTICAL DESIGN - Rok 2009

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS

  Czasopisma

  ISSN: 0887-3585 , eISSN: 1097-0134

• Elastic-contractile model proteins: Physical chemistry, protein function and drug design and delivery

  Publikacja

  • D. Urry
  • K. Urry
  • W. Szaflarski
  • M. Nowicki

  - ADVANCED DRUG DELIVERY REVIEWS - Rok 2010

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic

  Publikacja

  • P. Filipkowski
  • J. Kur
  • A. Duraj-Thatte
  • A. Dibowska
  • M. Durajczyk
  • M. Koziatek
  • N. Żołądkowicz

  - JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY - Rok 2007

  Większość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)

  Publikacja

  • P. Filipkowski
  • J. Kur

  - Acta Biochimica Polonica - Rok 2007

  W celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide

  Publikacja

  • B. Heras
  • M. A. Edeling
  • H. J. Schirra
  • S. Raina
  • J. L. Martin

  - PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA - Rok 2004

  Dsb proteins control the formation and rearrangement of disulfide bonds during the folding of secreted and membrane proteins in bacteria. DsbG, a member of this family, has disulfide bond isomerase and chaperone activity. Here, we present two crystal structures of DsbG at 1.7- and 2.0-Angstrom resolution that are meant to represent the reduced and oxidized forms, respectively. The oxidized structure, however, reveals a mixture...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1

  Publikacja

  • M. Wieczór
  • J. Czub

  - NUCLEIC ACIDS RESEARCH - Rok 2017

  Target search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis

  Publikacja

  • P. Filipkowski
  • A. Duraj-Thatte
  • J. Kur

  - ARCHIVES OF MICROBIOLOGY - Rok 2006

  W celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Probiotics and Antimicrobial Proteins

  Czasopisma

  ISSN: 1867-1306 , eISSN: 1867-1314

• Extension of the Unres Package for Physics-Based Coarse-Grained Simulations of Proteins and Protein Complexes to Very Large Systems

  Publikacja

  • A. Sieradzan
  • C. Czaplewski
  • E. Lubecka
  • A. Lipska
  • A. Karczynska
  • A. Gieldon
  • R. Slusarz
  • M. Makowski
  • P. Krupa
  • M. Kogut... i 5 innych

  - Biophysical Journal - Rok 2021

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Impact of selected amino acids of HP0377 (Helicobacter pylori thiol oxidoreductase) on its functioning as a CcmG (cytochrome c maturation) protein and Dsb (disulfide bond) isomerase

  Publikacja

  • M. Grzeszczuk
  • A. Bąk
  • A. Banaś
  • P. Urbanowicz
  • S. Dunin-Horkawicz
  • A. Gieldon
  • C. Czaplewski
  • A. Liwo
  • E. Jagusztyn-Krynicka

  - PLOS ONE - Rok 2018

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Proteins

  Publikacja

  • Z. Sikorski

  - Rok 2002

  Struktura białek wpływa na ich wartość odżywczą, właściwości funkcjonalne wżywności oraz reakcje w surowcach i produktach żywnościowych. Warunki prze-chowywania oraz obróbki w przemyśle i w czasie przygotowywania kulinarnegowywołują przemiany białek istotne dla jakości żywności. Przez celowe, enzy-matyczne i chemiczne modyfikowanie składu i struktury białek można wpływaćna ich właściwości funkcjonalne w żywności i wartość...

• Application of SSB-like protein from Thermus aquaticus in multiplex PCR of human Y-STR markers identification

  Publikacja

  • M. Olszewski
  • K. Rębała
  • Z. Szczerkowska
  • J. Kur

  - Rok 2005

  W tej publikacji prezentujemy zastosowanie białka SSB-podobnego Thermus aquaticus (TaqSSB) w reakcji multiplex PCR w celu identyfikacji markerów ludzkiego Y-STR. Wykorzystanie termostabilnego białka TaqSSB chroni lub redukuje tworzenie przez startery struktur dimerycznych, które powodują hamowanie hybrydyzacji starterów do badanego DNA i redukują ilość starterów dostępnych w reakcji PCR.

• Metoda obliczania skutków wdrożenia strategii zarządzania popytem na energię elektryczną (DSM/DSR) w systemach elektroenergetycznych

  Publikacja

  • W. Stahl

  - Rok 2023

  W niniejszej rozprawie poruszono zagadnienie strategii zarządzania popytem na energię elektryczną (DSM/DSR) i sposobów obliczania efektów ich wdrożenia. W związku z tym opisano oczekiwane efekty wdrożenia tych rozwiązań oraz ich zalety i wady. Zaprezentowano i przeanalizowano istniejące już metody obliczania skutków wdrożenia DSM/DSR. Zaproponowano nową metodę, która poprzez formę algorytmu uporządkowuje proces obliczania i oceny...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• A DSC and NMR-Relaxation study of the molecular mobility of water protons interacting with chemically modified starches

  Publikacja

  • A. Sergeev
  • N. Shilkina
  • L. Wasserman
  • S. Shilov
  • H. Staroszczyk

  - Russian Journal of Physical Chemistry B - Rok 2017

  Changes in the mobility of water protons in the chemically modified starches (CMS)–water system are studied by differential scanning calorimetry and NMR relaxation. The amounts of unfrozen water at negative temperatures and additional (after gelation) unfrozen for CMS are lower than those for native starch. The proton spin–spin relaxation time T2 for CMS samples, conventionally attributed to the water fraction in starch granules,...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Protein & Cell

  Czasopisma

  ISSN: 1674-800X , eISSN: 1674-8018

• PROTEIN JOURNAL

  Czasopisma

  ISSN: 1572-3887 , eISSN: 1573-4943

• Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi

  Publikacja

  • P. Filipkowski
  • A. Duraj-Thatte
  • J. Kur

  - PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION - Rok 2007

  Zidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• PROTEUS

  Czasopisma

  ISSN: 0889-6348

• Molecular mobility of water protons under interaction with chemically modified starches. DSC and HMR-relaxation investigations

  Publikacja

  • A. Sergeev
  • N. Szilkina
  • L. Wasserman
  • C. Szilow
  • H. Staroszczyk

  - Fizyka Chemiczna [czas. rosyjskojęzyczne] - Rok 2017

  The change of water protons mobility in the system chemically modified starches – water were investigated by DSC and NMR-relaxation methods. The amount of unfrozen water at subzero temperature as well as additional unfrozen water which appears after gelatinization have lower values for chemically modified starches in comparison with the native starch. The proton spin-spin relaxation time Т2 for chemically modified starch samples,...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• The Role of Proteins in Food

  Publikacja

  • Z. Sikorski
  • I. Sinkiewicz

  - Rok 2023

  This chapter describes the effect of proteins on the sensory attributes and the biological value and safety of foods. The role of proteins depends on their amino acid composition and structure, on changes due to storage and processing, as well as on interactions with other food components. The effect on the sensory quality of foods is brought about by hydrophobicity, solubility, water holding capacity, gelling, film formation,...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• PROTEIN SCIENCE

  Czasopisma

  ISSN: 0961-8368 , eISSN: 1469-896X

• DAB vs DAB+ Radio Broadcasting: a Subjective Comparative Study

  Publikacja

  • P. Falkowski-Gilski

  - Archives of Acoustics - Rok 2017

  In the age of digital media, delivering high quality content to consumers is one of the most demanding tasks. There exist numerous broadcasting standards, with different pros and cons, and the DAB/DAB (Digital Audio Broadcasting) system is one of the most popular among them. From an engineer’s perspective, efficient resource management under limited bandwidth conditions has always been a challenge. In this paper a subjective quality...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Activity-based protein profiling guided identification of urine proteinase 3 activity in subclinical rejection after renal transplantation

  Publikacja

  • M. Navarrete
  • B. Korkmaz
  • C. Guarino
  • A. Lesner
  • Y. Lao
  • J. Ho
  • P. Nickerson
  • J. Wilkins

  - Clinical Proteomics - Rok 2020

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Conservation and diversity of MutS proteins

  Publikacja

  • P. Sachadyn

  - MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS - Rok 2010

  The homologues of MutS, mismatch repair protein, exist in all prokaryotes, with the exception of Actinobacteria, Mollicutes and part of the Archaea. Multiple alignments of 316 MutS amino acid sequences from 169 species revealed conserved residues and sequence motifs distinguishing MutS homologues. All MutS homologues show high conservation within the ATPase domain. MutS1, the homologue responsible for DNA mismatch recognition,...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Concentration of proteins in the whey stream

  Publikacja

  • B. Kawalec-Pietrenko
  • I. Hołowacz

  - Rok 2008

  Zastosowano metodę separacji pianowej do odzyskiwania białka z serwatki. Wykazano silny wpływ prędkości powietrza w kolumnie, początkowego stężenia białka w serwatce i pH roztworu na przebieg i skuteczność flotacji. Współczynnik wzbogacenia maleje ze wzrostem prędkości przepływu powietrza oraz ze wzrostem początkowego stężenia białka serwatkowego. Najwyższą wartość współczynnika wzbogacenia uzyskano dla pH naturalnej serwatki.

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Conserved motifs of MutL proteins

  Publikacja

  • M. Banasik
  • P. Sachadyn

  - MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS - Rok 2014

  tThe MutL protein is best known for its function in DNA mismatch repair (MMR). However, there isevidence to suggest that MutL is not only the linker connecting the functions of MutS and MutH in MMR,but that it also participates in other repair systems, such as Very Short Patch (VSP), Base Excision (BER)and Nucleotide Excision Repair (NER). This study set out to identify the most highly conserved aminoacid sequence motifs in MutL...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• ADVANCES IN PROTEIN CHEMISTRY

  Czasopisma

  ISSN: 0065-3233

• JOURNAL OF PROTEIN CHEMISTRY

  Czasopisma

  ISSN: 0277-8033

• Diagnostyka obiektów przemysłowych z wykorzystaniem wspólnej magistrali usług DIAGNOSTIC SERVICE BUS DSB

  Publikacja

  • Z. Kowalczuk
  • J. Wszołek

  - Journal of Machine Construction and Maintenance - Rok 2011

  Korzystając ze znanego pojęcia magistrali, w pracy przedstawia się sposób przystosowania i wykorzystania magistrali usług w systemie diagnostyki obiektów przemysłowych. Koncepcja takiego środka komunikacyjnego opiera się na architekturze SOA (z architekturą zorientowanej na usługi). Koncepcja ta stanowi metodę rozwiązania problemów wydajnościowych rozwijanego projektu pt. "Sieciowy Monitor Obiektu" (SMO). Wspólna szyna danych zwiększa...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• UNRES-Dock—protein–protein and peptide–protein docking by coarse-grained replica-exchange MD simulations

  Publikacja

  • P. Krupa
  • A. Karczyńska
  • M. Mozolewska
  • A. Liwo
  • C. Czaplewski

  - BIOINFORMATICS - Rok 2021

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• BADANIE JAKOŚCI TRANSMISJI W SYSTEMACH RADIOFONII CYFROWEJ DAB I DAB+

  Publikacja

  • P. Falkowski-Gilski

  - Przegląd Telekomunikacyjny + Wiadomości Telekomunikacyjne - Rok 2018

  W dobie mediów cyfrowych kluczowym elementem jest dostarczanie treści wysokiej jakości. Wśród systemów radiofonii cyfrowej do najpopularniejszych należą standardy DAB i DAB+ (Digital Audio Broadcasting). Przy konfiguracji multipleksu ważne jest właściwe zarządzanie zasobami w ramach pojedynczego kanału radiowego. W artykule przedstawiono wyniki badań subiektywnych, dotyczących jakości transmisji w systemach DAB i DAB+, przeprowadzonych...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Antioxidants and proteins in ethylene-treated kiwifruits

  Publikacja

  • Y. Park
  • S. Jung
  • S. Kang
  • B. G. Heo
  • P. Arancibia-Avila
  • F. Toledo
  • J. Drzewiecki
  • J. Namieśnik
  • S. Gorinstein

  - FOOD CHEMISTRY - Rok 2008

  W pracy porównano właściwości przeciwutleniające i profil białek owoców kiwi poddanych działaniu etylenu i powietrza. Wysokie współczynniki korelacji między całkowitą zawartością fenoli i właściwościami przeciwutleniającymi uzyskano dla trzech metod określania właściwości przeciwutleniających: ABTS, TEAC i CUPRAC. W paśmie białek owoców kiwi rozdzielonych za pomocą elektroforezy stwierdzono różnice w paśmie siarczanu dodecylu sodu...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• The role of proteins in food. Chapter 6

  Publikacja

  • Z. Sikorski

  - Rok 2007

  Struktura i konformacja wpływają na biologiczne oraz funkcjonalne właściwości białek i na ich rolę w tworzeniu pożądanych cech produktów żywnościowych. Właściwości funkcjonalne to rozpuszczalność w środowisku wodnym o różnej sile jonowej, wodochłonność oraz zdolność żelowania, tworzenia błon, emulgowania lipidów i pienienia się. Białka mięsa, ryb, mleka, jaj, nasion roślin strączkowych, nasion zbóż oraz drobnoustrojów różnią się...

• Molecular Dynamics Studies on Amyloidogenic Proteins

  Publikacja

  • S. Rodziewicz-Motowidło
  • E. Sikorska
  • J. Iwaszkiewicz

  - Rok 2019

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Molecular Dynamics Studies on Amyloidogenic Proteins

  Publikacja

  • S. Rodziewicz-Motowidło
  • E. Sikorska
  • J. Iwaszkiewicz

  - Rok 2014

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Targeting shelterin proteins for cancer therapy.

  Publikacja

  • W. Brankiewicz-Kopcinska
  • A. Kallingal
  • R. Krzemieniecki
  • M. Bagiński

  - DRUG DISCOVERY TODAY - Rok 2024

  As a global health challenge, cancer prompts continuous exploration for innovative therapies that are also based on new targets. One promising avenue is targeting the shelterin protein complex, a safeguard for telomeres crucial in preventing DNA damage. The role of shelterin in modulating ataxia- telangiectasia mutated (ATM) and ataxia-telangiectasia and Rad3-related (ATR) kinases, key players in the DNA damage response (DDR),...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• New plasma preparation approach to enrich metabolome coverage in untargeted metabolomics: plasma protein bound hydrophobic metabolite release with proteinase K

  Publikacja

  • R. Wawrzyniak
  • A. Kosnowska
  • S. Macioszek
  • R. Bartoszewski
  • M. Jan

  - Scientific Reports - Rok 2018

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Characterization of a single-stranded DNA-binding-like Protein from Nanoarchaeum equitans - a nucleic acid binding protein with broad substrate specificity

  Publikacja

  • M. Olszewski
  • J. Balsewicz
  • M. Nowak
  • N. Maciejewska
  • A. Cyranka-Czaja
  • B. Zalewska-Piątek
  • R. Piątek
  • J. Kur

  - PLOS ONE - Rok 2015

  Background SSB (single-stranded DNA-binding) proteins play an essential role in all living cells and viruses, as they are involved in processes connected with ssDNA metabolism. There has recently been an increasing interest in SSBs, since they can be applied in molecular biology techniques and analytical methods. Nanoarchaeum equitans, the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota, is a hyperthermophilic, nanosized,...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• WSB Journal of Business and Finance

  Czasopisma

  eISSN: 2657-4950

• Novel DNA-binding protein from Nanoarchaeum equitans Kin4-M binds all kinds of nucleic acids

  Publikacja

  • M. (. Olszewski
  • J. Balsewicz
  • M. Nowak
  • J. Kur

  - Acta Biochimica Polonica - Rok 2011

  Nanoarchaeum equitans is the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota and stands out as one of the tiniest known living organism. What is more it has smallest genome, which is only 490.885 base pairs long. It is also one of the most compact genomes. According to predictions about 95% of the DNA encodes proteins or stable RNA. Nanoarchaeum equitans lacks genes for most vital metabolic pathways including lipid, cofactor,...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• The Protein Folding Problem

  Publikacja

  • H. Scheraga
  • A. Liwo
  • S. Oldziej
  • C. Czaplewski
  • J. Pillardy
  • J. Lee
  • D. Ripoll
  • J. Vila
  • R. Kazmierkiewicz
  • J. Saunders... i 12 innych

  - Rok 2006

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• The measurement of conformational stability of proteins adsorbed on siloxanes

  Publikacja

  • M. Prokopowicz
  • B. Banecki
  • J. Łukasiak
  • A. Przyjazny

  - JOURNAL OF BIOMATERIALS SCIENCE-POLYMER EDITION - Rok 2003

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Molecular basis of TRF proteins and their interactions with peptides

  Publikacja

  • U. Kalathiya
  • M. Padariya
  • M. Baginski

  - Acta Crystallographica A-Foundation and Advances - Rok 2017

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• 1.21 Computation of Structure, Dynamics, and Thermodynamics of Proteins

  Publikacja

  • S. OŁdziej
  • C. Czaplewski
  • A. Liwo
  • J. Vila
  • H. Scheraga
  • C. Czaplewski

  - Rok 2012

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Coarse-Grained Models of Proteins: Theory and Applications

  Publikacja

  • C. Czaplewski
  • A. Liwo
  • M. Makowski
  • S. Ołdziej
  • H. Scheraga

  - Rok 2011

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Computational techniques for efficient conformational sampling of proteins

  Publikacja

  • A. Liwo
  • C. Czaplewski
  • S. Ołdziej
  • H. Scheraga

  - CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY - Rok 2008

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym