Filters
total: 2380
filtered: 1262
-
Catalog
- Publications 1262 available results
- Journals 45 available results
- Conferences 1 available results
- Publishing Houses 1 available results
- People 45 available results
- Inventions 1 available results
- Projects 21 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 1 available results
- e-Learning Courses 30 available results
- Events 1 available results
- Open Research Data 971 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: MRL/MPJ
-
Epigenetic Basis of Regeneration: Analysis of Genomic DNA Methylation Profiles in the MRL/MpJ Mouse
PublicationEpigenetic regulation plays essential role in cell differentiation and dedifferentiation, which are the intrinsic processes involved in regeneration. To investigate the epigenetic basis of regeneration capacity, we choose DNA methylation as one of the most important epigenetic mechanisms and the MRL/MpJ mouse as a model of mammalian regeneration known to exhibit enhanced regeneration response in different organs. We report the...
-
Genome-wide DNA methylation profiling of the regenerative MRL/MpJ mouse and two normal strains
PublicationAims We aimed to identify the pivotal differences in the DNA methylation profiles between the regeneration capable MRL/MpJ mouse and reference mouse strains. Materials and Methods Global DNA methylation profiling was performed in ear pinnae, bone marrow, spleen, liver, heart from uninjured adult females of the MRL/MpJ and C57BL/6J and BALB/c. Results and conclusion A number of differentially methylated regions distinguishing between...
-
Transcriptome profiling reveals distinctive traits of retinol metabolism and neonatal parallels in the MRL/MpJ mouse
PublicationBackground: The MRL/MpJ mouse is a laboratory inbred strain known for regenerative abilities which are manifested by scarless closure of ear pinna punch holes. Enhanced healing responses have been reported in other organs. A remarkable feature of the strain is that the adult MRL/MpJ mouse retains several embryonic biochemical characteristics, including increased expression of stem cell markers. Results: We explored the transcriptome...
-
Sequence variants of p21 gene of the MRL/MpJ mouse: a possible association with the deficit of p21 protein and regenerative phenotype.
PublicationThe MRL/MpJ mouse is known for its enhanced regeneration abilities that manifested themselves by scarless ear-hole wound closure. The deficit of p21 found in the MRL is associated with the regenerative capacity as the p21 gene knockout in a mouse strain unrelated to the MRL mouse results in an ear-hole closure effect, similar to that observed in the MRL mouse. Cdkn1a gene encodes p21 protein, a cyclin-dependent kinase inhibitor,...
-
Epigenetyczne i transkryptomiczne podstawy potencjału regeneracyjnego ssaków. Badania na modelach skóry płodowej i dorosłej myszy MRL/MpJ
PublicationRegeneracja jest to zdolność do odbudowy uszkodzonych lub utraconych tkanek, kończyn oraz narządów. Efektywne procesy regeneracji obserwowane są u prymitywnych kręgowców, u których mogą przejawiać się w tak spektakularnych zjawiskach jak odtworzenie całych kończyn po ich amputacji. U wyższych kręgowców zdolności regeneracyjne są znacznie bardziej ograniczone. Rozwój metod umożliwiających badanie globalnych profili ekspresji i metylacji...
-
Regulacja epigenetyczna a potencjał regeneracyjny ssaków. Badania globalnych profili metylacji w tkankach dorosłej myszy MRL/MpJ i w sercach noworodków myszy C57BL/6J.
PublicationW pracy tej otrzymano genomowe profile metylacji DNA dla dwóch modeli regeneracji u ssaków: (i) dorosłej myszy MRL/MpJ, która jest zdolna do zamykania otworów w małżowinie usznej oraz wykazuje podwyższone zdolności regeneracyjne w wielu innych narządach oraz (ii) sercach noworodków myszy, u których zachodzi regeneracja rozległych uszkodzeń lewej komory serca. Zidentyfikowano szereg odmiennie metylowanych regionów DNA, regionów DMR,...
-
Mysz MRL - nowy model regeneracji
PublicationRegeneracja jest to zdolność do odtwarzania utraconych lub uszkodzonych kończyn, narządów i tkanek. Regeneracja wydaje się zdolnością niezbędną do życia, ale możliwości regeneracyjne są bardzo zróżnicowane w zależności od organizmu..Podczas gdy robaki płaskie są w stanie odtworzyć cały organizm z dowolnego jeog fragmentu, płazy regenerują utracone kończyny, przecięty.rdzeń kręgowy i poważne uszkodzenia serca, to zdolnosci regeneracyjne...
-
Cardinal regenerative features of the MRL mouse
PublicationIn this review, we discuss recent studies relating to major features of adult MRL mouse biology that contribute to the regenerative responses seen. These include an increased inflammatory cell profile, a unique glycolytic metabolic state typically found during embryogenesis, and a cell cycle phenotype of DNA damage and G2/M arrest. These traits have been found in other mammalian and non-mammalian regenerative systems. How these...
-
CARDINAL REGENERATIVE FEATURES OF THE MRL MOUSE — AN UPDATE
Publication -
Naturally occurring mitochondrial DNA heteroplasmy in the MRL mouse
PublicationThe MRL/MpJ mouse is an inbred laboratory strain of Mus musculus, known to exhibit enhanced autoimmunity, increased wound healing, and increased regeneration properties. We report the full-length mitochondrial DNA (mtDNA) sequence of the MRL mouse (Accession # EU450583), and characterize the discovery of two naturally occurring heteroplasmic sites. The first is a T3900C substitution in the TpsiCloop of the tRNA methionine gene...
-
Retained features of embryonic metabolism in the adult MRL mouse
PublicationThe MRL mouse is an inbred laboratory strain that was derived by selective breeding in 1960 from the rapidly growing LG/J (Large) strain. MRL mice grow to nearly twice the size of other commonly used mouse strains, display uncommonly robust healing and regeneration properties, and express later onset autoimmune traits similar to Systemic Lupus Erythematosis. The regeneration trait (heal) in the MRL mouse maps to 14-20 quantitative...
-
Innowacyjne zastosowanie betonu jamistego PERVIA, jako warstwy odsączającej w tunelu na węźle MPL Okęcie w Warszawie
PublicationChoć beton jamisty jest stosowany w budownictwie od wielu lat, to mimo swoich wyjątkowych właściwości filtracyjnych jest często niedocenianym elementem budowlanym. Wynika to z jego niewystarczającej wytrzymałości, która spowodowana jest brakiem frakcji piaskowej. Patrząc na problem z drugiej strony, właściwe odwodnienie nawierzchni komunikacyjnych jest podstawowym zadaniem, które musi rozwiązać projektant. Szybkie odprowadzenie...
-
BC-MPI: running an mpi application on multiple clusters with beesycluster connectivity
PublicationW artykule zaproponowano nowy pakiet BC-MPI, który umożliwiauruchomienie aplikacji MPI na wielu klastrach z różnymi implementacjami MPI. Wykorzystuje dedykowane implementacje MPIdo komunikacji wewnątrz klastrów oraz tryb MPI THREAD MULTIPLE dokomunikacji pomiędzy klastrami w dodatkowych wątkach aplikacji MPI. Ponadto, aplikacja BC-MPI może być automatycznie skompilowanai uruchomiona przez warstwę pośrednią BeesyCluster. BeesyClusterumożliwia...
-
Epigenetic regulation and regeneration: the search for differentially methylated genes in the MRL mouse
PublicationThe MRL mouse is an inbred laboratory strain, which was developed in the 60’s of the 20th century and has been extensively used as a model of lupus erythematosus. The regenerative abilities of the strain were discovered in the 90' when the MRL mouse was shown to close 2 mm hole punches made in the ear pinnae four weeks after injury without scarring. The phenomenon has not been observed in other mouse strains, where the holes...
-
To nie mój obraz
Publication -
Status of the MPD Experiment at JINR
Publication -
Synteza aminokwasowych pochodnych MPA
PublicationKwas mykofenolowy (MPA) jest związkiem o działaniu immunosupresyjnym i ma zastosowaniu w zapobieganiu odrzucania przeszczepów narządów. Zaprezentowano nowe pochodne MPA, które posiadają przyłączony do grupy karboksylowej fragment aminokwasowy. Celem tych badań jest określenie wpływu konfiguracji na chiralnym atomie węgla oraz podstawnika w reszcie aminokwasowej na aktywność immunosupresyjną.
-
PCA based Fault Tolerant MPC
PublicationThis chapter presents a Fault Tolerant - Model Predictive Control (FT-MPC) schemes for sensor faults accommodation. A Fault Detection and Isolation (FDI) Unit, which is an integral part of FT-MPC system, is based on the Principal Component Analysis (PCA) method. Introduced approach enables efficient bias and drift faults accommodation in single, as well as simultaneous faults case. Simple simulation exercise is presented.Rozdział...
-
Checkpointing of Parallel MPI Applications using MPI One-sided API with Support for Byte-addressable Non-volatile RAM
PublicationThe increasing size of computational clusters results in an increasing probability of failures, which in turn requires application checkpointing in order to survive those failures. Traditional checkpointing requires data to be copied from application memory into persistent storage medium, which increases application execution time as it is usually done in a separate step. In this paper we propose to use emerging byte-addressable...
-
Event driven MPC for networked control systems
PublicationBecause of variable delays and stochastic data packets loss networked control systems require suitable algorithms to ensure stability of the control system and guarantee desired control performance. This paper presents the idea of an event driven approach with MPC controller. In opposition to network compensation, where standard regulators are used, the presented solution integrates network with plant. A MPC based controller is...
-
MCORD: MPD cosmic ray detector for NICA
Publication -
Janusz Osicki Malarstwo – Przypadek mój sojusznik
PublicationDruk towarzyszący wystawie, która odbyła się w Galerii od czasu do czasu w Gdyni w 2013 roku. Publikacja liczy 4 strony i zawiera 4 reprodukcje prac i notę biograficzną w języku polskim.
-
Verification and Benchmarking in MPA Coprocessor Design Process
PublicationThis paper presents verification and benchmarking required for the development of a coprocessor digital circuit for integer multiple-precision arithmetic (MPA). Its code is developed, with the use of very high speed integrated circuit hardware description language (VHDL), as an intellectual property core. Therefore, it can be used by a final user within their own computing system based on field-programmable gate arrays (FPGAs)....
-
Nie taki szary PRL.
PublicationRecenzja książki: M. Kochanowski, Karnawał 1956-1968.
-
Softly switched robustly feasible mpc for constrained linear systems under set bounded uncertainty- LQ-MPC with IC action
PublicationNie jest możliwe efektywne sterowanie procesem w szerokim zakresie zmian warunków operacyjnych przy użyciu jednego uniwersalnego regulatora. W pracy zaproponowano koncepcję sposobu regulacji polegającego na przełączaniu wielu regulatorów uzależnionego od stanu operacyjnego systemu. Często twarde przełączanie regulatorów nie jest pożądane lub wręcz możliwe, alternatywą jest ich miękkie przełączanie. W pracy rozważany jest problem...
-
MCORD - MPD Cosmic Ray Detector a new features
Publication -
Registration and normalization of MRI/PET images
PublicationW artykule przedstawiono technikę rejestracji i normalizacji obrazów MRI/PET. Zawiera on porównanie sztywnej i elastycznej transformacji gemotrycznej. Porownano w nim rowniez manualne i proponowane automatyczne podejscie do problemu rejestracji i normalizacji obrazow.
-
GBTX Emulation for BM@N/MPD Data Acquisition Systems
Publication -
Conceptual design report of the MPD Cosmic Ray Detector (MCORD)
Publication -
Towards Easy-to-Use Checkpointing of MPI Applications within CLUSTERIX.
PublicationW literaturze wymienia się wiele bibliotek/systemów zarówno poziomu jądra jak i użytkownika, które wspomagają zapisywanie i odtwarzanie stanu procesów. W odniesieniu do aplikacji równoległych, jest to jednak zadanie cały czas trudne. Praca prezentuje nasze podejście do zapisywania/odtwarzania stanu aplikacji MPI wspomagane przez programistę, które wykorzystane będzie w środowisku projektu CLUSTERIX tj. zintegrowanej grupie klastrów...
-
Indywidualna wystawa "Tylko ból jest mój" (1.12.2023 - 18.04.2024)
PublicationEkspozycja przygotowana przez kobiety – o kobietach. O tym, jak wyglądał ich Sybir i jak one go zapamiętały. Będzie pobudzać do refleksji nad pytaniami: Co znaczyło być kobietą na Sybirze? Jakie trudności spadały na kobiety, które znalazły się w sytuacji granicznej? Wreszcie – czy kobiecie doświadczonej przez przemoc pozostaje tylko ból?
-
Implementacja algorytmu regulacji predykcyjnej MPC w sterownikach programowalnych
PublicationSterowniki programowalne PLC (ang. Programmable Logic Controllers) są główną przemysłową platformą implementacji algorytmów sterowania bezpośredniego. Standardowo producenci PLC udostępniają programistom jedynie podstawowe algorytmy sterowania. W niniejszym artykule rozważana jest implementacja w PLC zaawansowanej metody sterowania – algorytmu MAC/MPC (ang. Model Algorithmic Control/Model Predictive Control) ze względu na jego...
-
Performance and Power-Aware Modeling of MPI Applications for Cluster Computing
PublicationThe paper presents modeling of performance and power consumption when running parallel applications on modern cluster-based systems. The model includes basic so-called blocks representing either computations or communication. The latter includes both point-to-point and collective communication. Real measurements were performed using MPI applications and routines run on three different clusters with both Infiniband and Gigabit Ethernet...
-
Update on the molecular pathogenesis and clinical treatment of Mantle Cell Lymphoma (MCL): minutes of the 9th European MCL Network conference
Publication -
Validity of MRI brain perfusion imaging method
PublicationW artykule zaprezentowano zbiór analiz dotyczących walidacji metody DSC-MRI. Zbadano wpływ rozmycia, opóźnienia, niskiego SNR bolusa oraz innych możliwych źródeł zakłócających wartość parametru perfuzji. Różne metody uzyskiwania parametrów perfuzji zostały zaprezentowane i porównane.
-
Validity of MRI brain perfusion imaging method
PublicationW artykule zaprezentowano zbiór analiz dotyczących walidacji metody DSC-MRI. Zbadano wpływ rozmycia, opóźnienia, niskiego SNR bolusa oraz innych możliwych źródeł zakłócających wartość parametru perfuzji. Różne metody uzyskiwania parametrów perfuzji zostały zaprezentowane i porównane.
-
Limitations of DSC-MRI for quantitative brain perfusion.
PublicationArtykuł przedstawia ograniczenia metody DSC-MRI w ilościowej ocenie przepływów mózgowych. W zakresie pięciu różnych grup zagadnień przeprowadzono testy symulacyjne oraz obliczenia na podstawie badań fantomowych i in-vivo. Pokazano i omówiono wyniki badań.
-
Modelowanie perfuzji mózgu w badaniach MRI.
PublicationPraca dotyczy dynamicznego badania mózgu z wykorzystaniem techniki MRI (badanie perfuzji). W rezultacie pomiarów, tj. czasowej sekwencji skanów MRI w odpowiedzi na podanie znacznika zmieniajšcego właciwoci magnetyczne tkanek, wyznaczony zostaje model procesu perfuzji. Dla badanego procesu perfuzji opracowano model nieparametryczny (odpowied aproksymowana niezupełnš funkcjš gamma o 3 parametrach) oraz dwukompartmentowy model...
-
Sterowanie produkcją z wykorzystaniem koncepcji MRP
PublicationW niniejszej publikacji zaprezentowano podstawy sterowania produkcją z wykorzystaniem koncepcji MRP jako jednej z form opartej na koncepcji push. Dokonano identyfikacji danych zewnętrzych i wewnętrznych niezbędnych do realizacji harmonogramu MRP oraz strukturę tego typu harmonogramów.
-
Object serialization and remote exception pattern for distributed C++/MPI application
PublicationMPI is commonly used standard in development of scientific applications. It focuses on interlanguage operability and is not very well object oriented. The paper proposes a general pattern enabling design of distributed and object oriented applications. It also presents its sample implementations and performance tests.
-
Image Segmentation of MRI image for Brain Tumor Detection
Publicationthis research work presents a new technique for brain tumor detection by the combination of Watershed algorithm with Fuzzy K-means and Fuzzy C-means (KIFCM) clustering. The MATLAB based proposed simulation model is used to improve the computational simplicity, noise sensitivities, and accuracy rate of segmentation, detection and extraction from MR...
-
Automatic synthesis of parametric images in dynamic MRI imaging
PublicationArtykuł opisuje automatyczne metody czasu dojścia kontrastu (BAT) i tętniczą funkcję wejścia (AIF). Metody te porównano dla klinicznych i symulacyjnych danych.
-
Automatic recognition of the arterial input function in MRI studies
PublicationArtykuł prezentuje opis automatycznej metody detekcji tętniczej funkcji wejście (AIF). Metoda została porównana z klinicznie pomierzonymi seriami obrazów DSC-MRI.
-
Semi-adaptive feedback active control of MRI noise
PublicationA feedback controller is proposed for cancellation of magnetic resonance imaging (MRI) noise. The design of the controller takes into account specific features of the MRI noise signal. Simulation results show that a considerable rejection rate of the MRI noise can be obtained.
-
New user-guided and ckpt-based checkpointing libraries for parallel MPI applications
PublicationPraca prezentuje szczególy projektowe i implementacyjne jak również wyniki wydajnościowe dwóch nowych bibliotek checkpointingu opracowanych przez autorów dla równoległych aplikacji MPI. Pierwsz biblioteka, tzw. user-guided wymaga od programisty dostarczenia funkcji pakujących i rozpakowujących stan procesu, ale dostarcza łatwego w użyciu API z wykorzystaniem stałych MPI. Wykorzystuje funkcje I/O MPI-2 lub dedykowany proces master...
-
Identyfikacja systemów cumowniczych MJP i konsekwencje wynikające z ich zastosowania
PublicationW pracy rozpoznano i przeanalizowano użycie najczęściej stosowanych systemów cumowniczych dla MJP. Dobór konkretnego systemu cumowniczego jest skomplikowany i wymaga przeanalizowania szeregu czynników. Najczęściej stosowanymi systemami cumowniczymi są: cumowanie do pali stalowych, cumowanie za pomocą bomów cumowniczych, cumowanie za pomocą lin (cum), cumowanie za pomocą martwych kotwic i kotwic Seaflex. Konsekwencje wynikające...
-
Ekspertyza dotycząca oszacowania wartości odtwarzacza plików mp3 w telefonie komórkowym
PublicationEkspertyza ma na celu rozstrzygnięcie kwestii czy jest możliwe ustalenie, jaką część telefonu komórkowego stanowi odtwarzacz plików w formacie mp3 i czy jest on w takim przypadku "urządzeniem w urządzeniu", czy też jest to wyłącznie aplikacja.
-
A Solution to Image Processing with Parallel MPI I/O and Distributed NVRAM Cache
PublicationThe paper presents a new approach to parallel image processing using byte addressable, non-volatile memory (NVRAM). We show that our custom built MPI I/O implementation of selected functions that use a distributed cache that incorporates NVRAMs located in cluster nodes can be used for efficient processing of large images. We demonstrate performance benefits of such a solution compared to a traditional implementation without NVRAM...
-
Direct algorithm for optimizing robust MPC of drinking water distribution systems hydraulics
PublicationModel-based predictive control is an effective method for control the large scale systems [1]–[6], [8], [16], [17]. Method is based on on-line solution of the control task over the control horizon using current and past measurements, as well as the system model. Only a first element of calculated control sequence is applied to the plant. At the next sampling instant, based on new process output measurements, control procedure is...
-
New approach for determining the QoS of MP3-coded voice signals in IP networks
PublicationPresent-day IP transport platforms being what they are, it will never be possible to rule out conflicts between the available services. The logical consequence of this assertion is the inevitable conclusion that the quality of service (QoS) must always be quantifiable no matter what. This paper focuses on one method to determine QoS. It defines an innovative, simple model that can evaluate the QoS of MP3-coded voice data transported...