Search
Filters
total: 1790
-
Catalog
displaying 1000 best results Help
Search results for: CHAPERONE-USHER PATHWA
-
The chaperone-usher pathway of bacterial adhesin biogenesis - from molecular mechanism to strategies of anti-bacterial prevention and modern vaccine design
PublicationSystem chaperone-usher (białko opiekuńcze-białko kanałotwórcze) warunkuje biogenezę powierzchniowych struktur adhezyjnych, odpowiedzialnych za wirulencję wielu bakterii gram-ujemnych. Powyższy mechanizm został zbadany na poziomie strukturalnym w przypadku różnych gatunków bakterii patogennych. Celem powyższej pracy było przedstawienie molekularnego mechanizmu biogenezy struktur adhezyjnych na bazie systemu chaperone-usher. Otrzymane...
-
Urinary Tract Infections of Escherichia coli Strains of Chaperone-Usher System
PublicationZakażenia dróg moczowych stanowią bardzo poważny problem zdrowotny i ekonomiczny dotyczący milionów ludzi, każdego roku na całym świecie. Najbardziej rozpowszechnionym czynnikiem etiologicznym tego typu infekcji bakteryjnych, obejmujących górne i dolne drogi moczowe, są szczepy E. coli, reprezentujące około 80% przypadków. Uropatogenne szczepy E. coli produkują kilka czynników urowirulentncyh, które można podzielić na dwa główne...
-
Pilicides effectively hinder chaperone-usher interactions in all Gram-negative bacteria
PublicationThe chaperone-usher pathway of adhesive structures biogenesis is highly conserved in all Gram-negative bacteria. Pili are polymers of thousands protein subunits that possess conserved immunoglobuline-like structure denoted by lack of the seventh G strand. The effect of this structural defect is a hydrophobic acceptor cleft. The folding of protein subunits is strictly dependent on the action of specific periplasmic chaperone protein...
-
Analysis of the unique structural and physicochemical properties of the DraD/AfaD invasin in the context of its belonging to the family of chaperone/usher type fimbrial subunits
PublicationInwazyna DraD kodowana przez operon dra posiada strukturę charakterystyczną dla białek podjednostkowych fimbrii typu chaperone-usher. Fold-Ig białka DraD posiada dwie charakterystyczne cechy wyróżniające je z pośród rodziny fimbrialnych białek podjednostkowych: 1) zaburzenie struktury beta-beczki w rejonie szczeliny akceptorowej objawiające się układem wiązań wodorowych głównego łańcucha polipeptydowego oraz 2) nietypowo usytuowany...
-
Conformational stability of the full-atom hexameric model of the ClpB chaperone fromEscherichia coli
Publication -
Simulation of the Opening and Closing of Hsp70 Chaperones by Coarse-Grained Molecular Dynamics
Publication -
USER MODELING AND USER-ADAPTED INTERACTION
Journals -
Structure and evolution of the 4-helix bundle domain of Zuotin, a J-domain protein co-chaperone of Hsp70
PublicationThe J-domain protein Zuotin is a multi-domain eukaryotic Hsp70 co-chaperone. Though it is primarily ribosome-associated, positioned at the exit of the 60S subunit tunnel where it promotes folding of nascent polypeptide chains, Zuotin also has off-ribosome functions. Domains of Zuotin needed for 60S association and interaction with Hsp70 are conserved in eukaryotes. However, whether the 4-helix bundle (4HB) domain is conserved remains...
-
Literature review of user needs, toward user requirements
PublicationThis report has been developed in the frame of the IEA SHC Task 61 Subtask A “User requirements”. The main objective was to rethink and reformulate user requirements to lighting (daylighting and electric lighting) in public buildings on the basis of a thorough literature study. The work is a joint effort of a number of scientists and represents collective knowledge in this topic. The concept of Lighting quality is the one, among...
-
Improving web user experience with caching user interface
PublicationOften, Web technologies are used to operate or to configure network-enabled equipment, to configure and administer modular applications, or as teaching environments. The comfort of human work requires a similar response time in these applications as in the Internet. To improve response time, various forms of caching at different levels are employed. To improve the user experience in regard to response time when performing specific...
-
Improving web user experience with caching user interface
PublicationIn human-computer interaction, response time is assumed generally not to exceed significantly 1-2 seconds. While the natural competition in the Internet public Web serving ensures adhering widely to such limits, some Web environments are less competitive and offer much worse user experience in terms of response time. This paper describes a solution to significantly improve user experience in terms of response time with only modification...
-
Complementation studies of the DnaK–DnaJ–GrpE chaperone machineries from Vibrio harveyi and Escherichia coli, both in vivo and in vitro
Publication -
Pathways in Mathematics
Journals -
A mobile loop order–disorder transition modulates the speed of chaperonin cycling
PublicationMolecular machines order and disorder polypeptides as they form and dissolve large intermolecular interfaces, but the biological significance of coupled ordering and binding has been established in few, if any, macromolecular systems. The ordering and binding of GroES co-chaperonin mobile loops accompany an ATP-dependent conformational change in the GroEL chaperonin that promotes client protein folding. Following ATP hydrolysis,...
-
k-Penalty: A Novel Approach to Find k-Disjoint Paths with Differentiated Path Costs
PublicationW artykule rozpatrywany jest problem ochrony dedykowanej na wypadek awarii wielokrotnej elementów sieci teleinformatycznej. Wspomniana ochrona jest możliwa do zapewnienia poprzez wyznaczenie i zainstalowanie zbioru k rozłącznych ścieżek dla każdego żądania. W szczególności rozpatrywany jest problem wyznaczenia k rozłącznych ścieżek w sieciach typu ''multi-cost'', w przypadku których koszt dowolnego łącza może być różny dla każdej...
-
User satisfaction model
PublicationRaport techniczny - opis metody ''User Satisfaction Methods'' wykorzystywanej w projektowaniu komunikacji człowiek-komputer oraz doskonaleniu interfejsu użytkownika.
-
User experience and user interface (UX/UI) design of Greencoin mobile application.
PublicationThe aim of the Greencoin mobile application is to encourage its users to change their behavior and to act pro-ecologically. The pilot version of the application will operate within the city of Gdańsk. To keep the app’s user base as large as possible, the graphical user interface should be attractive to the broadest possible audience, and the application itself should be easy and fun to use. This work is a continuation of studies...
-
Iron–Sulfur Cluster Biogenesis Chaperones: Evidence for Emergence of Mutational Robustness of a Highly Specific Protein–Protein Interaction
PublicationBiogenesis of iron–sulfur clusters (FeS) is a highly conserved process involving Hsp70 and J-protein chaperones. However, Hsp70 specialization differs among species. In most eukaryotes, including Schizosaccharomyces pombe, FeS biogenesis involves interaction between the J-protein Jac1 and the multifunctional Hsp70 Ssc1. But, in Saccharomyces cerevisiae and closely related species, Jac1 interacts with the specialized Hsp70 Ssq1,...
-
The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains
PublicationBiogeneza fimbrii Dr kodowanych przez operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli (infekcje górnych dróg moczowych) odbywa się na bazie zakonserwowanego systemu sekrecji typu chaperone-usher. Funkcjonowanie powyższego systemu sekrecji opiera się na dwóch komponentach białkowych, periplazmatycznym chaperonie DraB i zewnątrzbłonowym kanale DraC. Białko DraB kontroluje proces składania podjednostek fimbrialnych DraE, natomiast...
-
Enzymes of the lysine biosynthetic pathway as targets for antifungals ?
PublicationSystemic infections caused by human pathogenic fungi in immunocompromized patients continue to be one of the important clinical problems. Limited availability of safe and efficacious antifungal chemotherapeutics and emerging resistance to existing drugs stimulates search for novel molecular targets for antifungals. The α-aminoadipate pathway (AAP) of L-lysine biosynthesis is unique in fungi and thus has been so far considered...
-
HCI and the economics of user experience
PublicationRodział przezentuje możliwości rozwinięcia zakresu tradycyjnych badań HCI (Human-Computer Interaction) o zagadnienia ekonomiczne, związane z jakością usług on-line, postrzeganą przez użytkownika/klienta. Praca zawiera modele jakości usług on-line oparte na elementach marketingu relacji i na wykorzystaniu ekonomicznych determinant zachowań konsumenckich w usługach on-line. Rozdział prezentuje modele projektowania i rozwoju przykładowych...
-
Nawpa Pacha
Journals -
Critical Pathways in Cardiology
Journals -
From user satisfaction to customer loyalty: addressing economic values in user-centered design of on-line services
Publicationartykuł omawia czynniki ekonomiczne wpływające na satysfakcję użytkownika w usługach on-line, a zwłaszcza te, które wpłacają w dłuższej perspektywie na kształtowanie lojalności klienta w stosunku do dostawcy określonych usług on-line. Przeprowadzono oceny eksperckie oraz badania z udziałem użytkowników, które pozwoliły na wskazanie preferencji użytkowników odnośnie czynników ekonomicznych. wykazano, że czynnikiem krytycznych dla...
-
Alternative Lactose Catabolic Pathway in Lactococcus lactis IL1403
Publication -
Glucosylceramide Mimics: Highly Potent GCase Inhibitors and Selective Pharmacological Chaperones for Mutations Associated with Types 1 and 2 Gaucher Disease
Publication -
Geo-location of the commune of an IP user
PublicationThis paper describes a system of geo-location of an IP user that would enable VoIP users to call 112. Basic requirement is fast (under 50ms) determination of the commune of the subscriber. To obtain as accurate information as possible aggregation of several methods was proposed: using a database of locations of IP ranges created by specialized companies, traceroute using history of user locations to assume his current one.It is...
-
User-System Interaction Design in IT Projects
PublicationMonografia omawia główne wymagania dla interfejsu użytkownika oraz przedstawia przegląd metod przydatnych do projektowania interakcji użytkownik-system, jak i do organizowania współpracy z użytkownikami w projektach informatycznych. Znaczną część monografii poświęcono zagadnieniom projektowania koncepcyjnego oraz testowania i oceny powstających rozwiązań. Szczególne miejsce zajmują różne techniki prototypownia oraz zasady prowadzenia...
-
Automated Reasoning Based User Interface
PublicationMotivation: The ability to directly trace how requirements are implemented in a software system is crucial in domains that require a high level of trust (e.g. medicine, law, crisis management). This paper describes an approach that allows a high level of traceability to be achieved with model-driven engineering supported by automated reasoning. The paper gives an introduction to the novel, automated user interface synthesis in...
-
Evolution of End-User Participation in IT Projects.
PublicationThis chapter is aimed at presenting a review of evolutionary design paradigms which determine the end-user’s role in IT (Information Technology) projects across recent decades. This review covers different perspectives starting from technology-oriented sequential software development lifecycles, through user-centred approaches, ending finally in contemporary service design approaches supported by e-business and social media. Finally,...
-
Nitrogen pathways in the environment.
PublicationPraca stanowi wprowadzenie do zbioru artykułów poświęconych wielorakim aspektom badań nad ścieżkami przenoszenia związków azotu, zagrożeniami z tego wynikającymi oraz metodami przeciwdziałania tym zagrożeniom. Przedstawiono w niej bardzo problematykę obiegu kołowego azotu w przyrodzie, zwracając szczególną uwagę na zakłócenia w tym obiegu, będące rezultatem różnorodnej działalności człowieka. Na tle aktualnego stanu wiedzy, krótko...
-
Journal on Multimodal User Interfaces
Journals -
REFERENCE & USER SERVICES QUARTERLY
Journals -
Notch signalling pathway as an oncogenic factor involved in cancer development
Publication -
Verification of the fit to user profiles for UML tools
PublicationDopasowanie do profilu użytkownika ma wpływ na efektywność pracy użytkownika. W referacie postawiono pytanie, czy narzędzia UML rzeczywiście wspomagają pracę konkretnych ról w procesie wytwarzania oprogramowania. W ramach prac wykonano następujace zadania: opisano profile użytkowników narzędzi UML; wyodrębniono cechy narzędzi UML, które mają wpływ na dopasowanie do profili użytkowników; zaprojektowano model pokazujący związek pomiędzy...
-
Clustering Context Items into User Trust Levels
PublicationAn innovative trust-based security model for Internet systems is proposed. The TCoRBAC model operates on user profiles built on the history of user with system interaction in conjunction with multi-dimensional context information. There is proposed a method of transforming the high number of possible context value variants into several user trust levels. The transformation implements Hierarchical Agglomerative Clustering strategy....
-
AutoCAD: Examination of Factors Influencing User Adoption
PublicationThe primary purpose of the research is to examine and validate determinants of user intention to use AutoCAD software, utilising the constructs from prior studies in a more integrated model. The paper proposes a revised Technology Acceptance Model (TAM) for measuring the adoption of AutoCAD. In the study, a latent construct PPA (perceived physical accessibility) was added to the proposed research model as a new determinant of AutoCAD...
-
User interface prototyping. Techniques, methods and tools
PublicationCurrently, for interactive applications their usability and ergonomics of the user interface (UI) are critical factors for achieving users' acceptance.
-
Text Categorization Improvement via User Interaction
PublicationIn this paper, we propose an approach to improvement of text categorization using interaction with the user. The quality of categorization has been defined in terms of a distribution of objects related to the classes and projected on the self-organizing maps. For the experiments, we use the articles and categories from the subset of Simple Wikipedia. We test three different approaches for text representation. As a baseline we use...
-
Features of a radial user interface to search engines
PublicationThe paper is concerned with a new type of user interface to search engines. Instead of presenting search results in a form of a ranked list, the results are presented in radial arrangement. In the center of the interface the most relevant web page is presented. Other web pages are located around the central one. The location of a web page depends on two factors: its relevance to the query and its content. The relevance has influence...
-
User authentication based on keystroke dynamics analysis
PublicationW pracy przedstawiono kilka metod, które można wykorzystać do uwierzytelniania użytkowników na podstawie rytmu pisania na klawiaturze. Dwie z opisanych metod wykorzystują miarę odległości zdefiniowaną do porównywania wpisywanych tekstów, natomiast trzecia analizuje parametry rozkładów cech wydobytych z wpisywanych tekstów. Algorytmy te zostały przetestowane na dwóch zbiorach danych. Ponadto oceniona została efektywność metody powstałej...
-
Pathways and degradation of chloroorganic pesticides.
PublicationW rozdziale omówiono: źródła odpadów pestycydowych oraz depozyty pestycydowe, charakterystykę ścieków pestycydowych pochodzących z przemysłu oraz metody oczyszczania.
-
AOP173 key event associated pathway predictor – online application for the prediction of benchmark dose lower bound (BMDLs) of a transcriptomic pathway involved in MWCNTs-induced lung fibrosis
Publication -
Robustness of Pathway Enrichment Analysis to Transcriptome-Wide Gene Expression Platform
Publication -
Współprądowe zgazowanie wtórnego paliwa odpadowego, biomasy oraz mieszanek paliwa wtórnego z biomasą
PublicationPostępujący wzrost ilości ludzi, wraz ze zmianą stylu życia prowadzi do zwiększającej się konsumpcji energii, oraz produkcji odpadów komunalnych. W skład tych odpadów wchodzą, w coraz większym stopniu tworzywa sztuczne, materiały te podobnie jak odpady ligninocelulozowe, tekstylia czy makulatura są odpadami palnymi mogącymi być wykorzystanymi jako źródło enegii. Składniki te nie zostały oddzielone, jako surowce do recyklingu surowcowego,...
-
CELL STRESS & CHAPERONES
Journals -
Flexibility and user‐friendliness of Grid portals: the PROGRESS approach
Publication -
The impact of end-user participation in IT projects on product usability
PublicationMany companies implementing new IT projects encounter numerous problems with ensuring good final product usability. The strong market competition they experience often results in necessity of undertaking difficult decisions with regard to cost minimization. This may force cuts in usability expertise and consulting, most often by limiting end-user participation in the project. However, it may also result in serious consequences...
-
The Evaluation of Use of Colors in Graphical User-Interfaces in Healthcare
PublicationIn this paper, color difference/contrast measures are investigated in reference to results of experiments with the participation of average, color-normal observers and with individuals with deuteranopia. Additionally, a new method for the automatic analysis of color contrast is proposed, which supports designers of graphical user- interfaces in healthcare. The method was verified using the GUI phantom of a vital signs monitor (the...
-
User Trust Levels and Their Impact on System Security and Usability
PublicationA multilateral trust between a user and a system is considered. First of all we concentrate on user trust levels associated with the context-oriented CoRBAC model. Consequently, there were computed user profiles on the basis of its implementation in the information processing system “My GUT”. Furthermore, analysis of these profiles and the impact of user trust levels on system security and usability have been discussed.