Filtry
wszystkich: 2866
-
Katalog
- Publikacje 2264 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 23 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 3 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 74 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 24 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 13 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 5 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 126 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 12 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 320 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: dnak/j
-
ppGpp-Dependent Negative Control of DNA Replication of Shiga Toxin-Converting Bacteriophages in Escherichia coli
Publikacja -
Selective Cytostatic and Cytotoxic Anticancer Effects of Bisfunctional Agents: A Strategy for the Design of DNA Binding Agents
PublikacjaVarious agents have been synthesized and proved useful for the National Cancer Institute's anticancer testing as potential new drugs, but most agents suffer side effects from their limited selectivity against cancer cells over healthy ones. Therefore, this paper attempts to describe drugs in terms of the level of tumor cell selectivity which they possess to define the features of mols. that are essential for useful cytotoxicity....
-
Biomedical, Artificial Intelligence, and DNA Computing Photonics Applications and Web Engineering, Wilga, May 2012
Publikacja -
Bulky DNA adducts in human sperm: relationship with fertility, semen quality, smoking, and environmental factors
Publikacja -
Establishing the background level of base oxidation in human lymphocyte DNA: results of an interlaboratory validation study
Publikacja -
Urinary Measurement of 8-OxodG, 8-OxoGua, and 5HMUra: A Noninvasive Assessment of Oxidative Damage to DNA
Publikacja -
Mass spectrometry reveals the presence of specific set of epigenetic DNA modifications in the Norway spruce genome
Publikacja -
Critical factors for the performance of chip array-based electrical detection of DNA for analysis of pathogenic bacteria
Publikacja -
Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publikacja -
DNA methylation analysis of benign and atypical meningiomas: correlation between RUNX3 methylation and WHO grade
Publikacja -
The Degree of Global DNA Hypomethylation in Peripheral Blood Correlates with That in Matched Tumor Tissues in Several Neoplasia
Publikacja -
Prolonged Quercetin Administration Diminishes the Etoposide-Induced DNA Damage in Bone Marrow Cells of Rats
Publikacja -
Buserelin Acetate Reduces Mortality and DNA Defragmentation of Bovine Sperm Cells Exposed to Oxidative Stress
Publikacja -
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublikacjaOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
-
Increased resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA in proximity to metallic silver particles.
PublikacjaZbadano wpływ nanocząstek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donor (pochodna kumaryny) i akceptor (Cy3) umieszczono na przeciwległych końcach DNA o strukturze podwójnej helisy i o 23 parach bazowych. W nieobecności cząstek srebra wydajność przekazywania energii w tym układzie wynosiła ok. 9%, zaś po umieszczeniu go między kwarcowymi płytkami pokrytymi filmem wysepek...
-
Decisional DNA (DDNA) Based Machine Monitoring and Total Productive Maintenance in Industry 4.0 Framework
PublikacjaThe entire manufacturing spectrum is transforming with the advent of Industry 4.0. The features of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA) were utilized for developing Virtual Engineering Objects (VEO), Virtual Engineering Process (VEP) and Virtual Engineering Factory (VEF), which in turn facilitate the creation of smart factories. In this study, DDNA based Machine Monitoring for Total Maintenance...
-
Sequence-dependent structural properties of B-DNA: what have we learned in 40 years?
PublikacjaThe structure of B-DNA, the physiological form of the DNA molecule, has been a central topic in biology, chemistry and physics. Far from uniform and rigid, the double helix was revealed as a flexible and structurally polymorphic molecule. Conformational changes that lead to local and global changes in the helix geometry are mediated by a complex choreography of base and backbone rearrangements affecting the ability of the B-DNA...
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublikacjaMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublikacjaW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Modulation of cellular response to anticancer treatment by caffeine:inhibition of cell cycle checkpoints, DNA repair and more
PublikacjaKofeina i inne metyloksantyny wywołują bardzo różne efekty fizjologiczne w organizmie człowieka. W pracy przedstawiamy, które z tych efektów mogą wpływać na skuteczność terapii przeciwnowotworowych. Kofeina może bezpośrednio wpływać na transport oraz aktywację metaboliczną cząsteczek leków do komórki, poprzez tworzenie kompleksów z lekami zawierającymi układy poliaromatyczne. Kofeina hamuje aktywność kinaz ATM/ATR co prowadzi do...
-
Emplying set of experience knowledge structure and decisional DNA to enhance industrial design: conceptual approach
PublikacjaZaprezentowano koncepcje wspomagania projektowania przemyslowego przy pomocy nowoczenego podejscia do reprezentacji wiedzy w postaci SOEKS oraz Decyzyjnego DNA
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublikacjaAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
Defining a novel domain that provides an essential contribution to site-specific interaction of Rep protein with DNA
PublikacjaAn essential feature of replication initiation proteins is their ability to bind to DNA. In this work, we describe a new domain that contributes to a replication initiator sequence-specific interaction with DNA. Applying biochemical assays and structure prediction methods coupled with DNA–protein crosslinking, mass spectrometry, and construction and analysis of mutant proteins, we identified that the replication initiator of the...
-
Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor
PublikacjaRolling circle amplification (RCA) of DNA can be considered as a great alternative to the gold standard polymerase chain reaction (PCR), especially during this pandemic period, where rapid, sensitive, and reliable test results for hundreds of thousands of samples are required daily. This work presents the first research to date on direct, real-time and label-free isothermal DNA amplification monitoring using a microcavity in-line...
-
When Neural Networks Meet Decisional DNA: A Promising New Perspective for Knowledge Representation and Sharing
PublikacjaABSTRACT In this article, we introduce a novel concept combining neural network technology and Decisional DNA for knowledge representation and sharing. Instead of using traditional machine learning and knowledge discovery methods, this approach explores the way of knowledge extraction through deep learning processes based on a domain’s past decisional events captured by Decisional DNA. We compare our approach with kNN (k-nearest...
-
Mitochondrial DNA copy number and trimethylamine levels in the blood: New insights on cardiovascular disease biomarkers
PublikacjaAmong cardiovascular disease (CVD) biomarkers, the mitochondrial DNA copy number (mtDNAcn) is a promising candidate. A growing attention has been also dedicated to trimethylamine-N-oxide (TMAO), an oxidative derivative of the gut metabolite trimethylamine (TMA). With the aim to identify biomarkers predictive of CVD, we investigated TMA, TMAO, and mtDNAcn in a population of 389 coronary artery disease...
-
DNA Methylation Changes Induced by Redox-Active Compounds—Choosing the Right PCR-Based Method
PublikacjaThe impact of catechins on the expression profile of redox-related genes in HT29 cell line has been studied recently by our group using Oxidative Stress RT2 Profiler PCR Array. Within the examined panel of 84 genes, the down-regulation of SRXN1 gene was unique among other up-regulated genes. We hypothesized that the observed down-regulation resulted from DNA methylation and have exploited this observation to choose the proper strategy...
-
Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
Publikacjanthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another...
-
Support Product Development Framework by Means of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA
PublikacjaIn this paper, we propose a framework to support product development activi-ties by utilizing Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). This idea will provide a new direction to researchers working on product development, especially designers and manufacturers. They will be working on the same platform and this will be reducing their communication gap. Once the final idea is perceived about product...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublikacjaTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
Wpływ warunków naturalnych na zobrazowanie dna Zatoki Gdańskiej przy użyciu sonaru bocznego
PublikacjaGłównym celem artykułu jest przedstawienie wpływu warunków środowiskowych na dokładność zobrazowania dna morza za pomocą systemów hydroakustycznych. Czynniki naturalne, przede wszystkim falowanie powierzchni morza i niejednorodny rozkład prędkości dźwięku w wodzie, mają wpływ na zmianę toru promieni akustycznych. Choć w obu przypadkach mechanizm zjawisk jest zupełnie odmienny, odgrywają one decydującą rolę w odwzorowaniu dna i...
-
Genome-wide DNA methylation profiling of the regenerative MRL/MpJ mouse and two normal strains
PublikacjaAims We aimed to identify the pivotal differences in the DNA methylation profiles between the regeneration capable MRL/MpJ mouse and reference mouse strains. Materials and Methods Global DNA methylation profiling was performed in ear pinnae, bone marrow, spleen, liver, heart from uninjured adult females of the MRL/MpJ and C57BL/6J and BALB/c. Results and conclusion A number of differentially methylated regions distinguishing between...
-
Magdalena Knak
Osoby -
Jerzy Konorski dr hab. inż.
OsobyJerzy Konorski otrzymał tytuł mgr inż. telekomunikacji na Poitechnice Gdańskiej, zaś stopień doktora n.t. w dyscyplinie informatyka w Instytucie Podstaw Informatyki PAN. W r. 2007 obronił rozprawę habilitacyjną na Wydziale Elektroniki, Telekomnikacji i Informatyki PG. Jest autorem ponad 150 publikacji naukowych, prowadził projekty naukowo-badawcze finansowane ze środków Komitetu Badań Naukowych, UE, US Air Force Office of Scientific...
-
Entropy of water calculated from harmonic approximation: estimation of the accuracy of method
PublikacjaSome molecular dynamics simulations were performed for liquid TIP4P and SPC water at a constant density (1.00 g/cm(3)) and within the temperature range of 5-90 degrees C. By using harmonic approximation, both the entropy of water S-H and the specific heat c(v) were calculated, and the results were compared to literature data. It was found that harmonic approximation overestimates absolute entropy of TIP4P water by 5.6 J/mol K (similar...
-
Piotr Szczuko dr hab. inż.
OsobyDr hab. inż. Piotr Szczuko w 2002 roku ukończył studia na Wydziale Elektroniki, Telekomunikacji i Informatyki Politechniki Gdańskiej zdobywając tytuł magistra inżyniera. Tematem pracy dyplomowej było badanie zjawisk jednoczesnej percepcji obrazu cyfrowego i dźwięku dookólnego. W roku 2008 obronił rozprawę doktorską zatytułowaną "Zastosowanie reguł rozmytych w komputerowej animacji postaci", za którą otrzymał nagrodę Prezesa Rady...
-
Całkowanie nieliniowych dynamicznych równań ruchu w mechanice konstrukcji.Dynamika powłok sprężystych.**2002, 142 s. 56 rys. 4 tab. bibliogr. 102 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /17.06.2002/. P. Gdań., Wydz. Inżynierii Lądowej. Promotor: dr hab. inż. J. Chróścielewski, prof. nadzw PG.
Publikacja.
-
Sterowanie zbiornikiem retencyjnym w celu uzyskania pożądanych warunków przepływu na odcinku cieku.**2002, 132 s. 62 rys. 34 tab. bibliogr. 87 poz. Rozprawa doktorska /20.12.2002/ Wydz. Bud. Wod. Inż. Środ. Promotor: prof. dr hab. inż. Jarosław J. Napiórkowski.
Publikacja.
-
The use of a one-step PCR method for the identification of Microsporum canis and Trichophyton mentagrophytes infection of pets
PublikacjaIntroduction: Dermatophytes are a closely related group of keratinophilic fungi. They encompass important etiological agents of superficial fungal infections. These fungi are able to invade keratinized tissues of humans and animals, causing dermatophytosis (ringworm) of hair, nails or skin. The aim: Traditional diagnostics of ringworm is based on morphological identification of cultured fungi and is time-consuming. Materials and methods:...
-
A new open-source software developed for numerical simulations usingdiscrete modeling methods
PublikacjaThe purpose of this work is to present the development of an open-source software based on a discrete description of matter applied to study the behavior of geomaterials. This software uses Object Oriented Programming techniques, and its methodology design uses three different methods, which are the Discrete Element Method (DEM) [F. Donzé, S.A. Magnier, Formulation of a three-dimensional numerical model of brittle behavior, Geophys....
-
ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA, SECTIO J: PAEDAGOGIA-PSYCHOLOGIA
Czasopisma -
Observation of sub-bottom sediment in the southern baltic by means of onlinear acoustics method
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki badań struktury osadów dennych Bałtyku Południowego metodami akustyki nieliniowej.
-
Numerical calculations of behaviour of ship double-bottom structure during grounding
PublikacjaIdeą projektu CORET jest dodanie do obecnej konstrukcji dna podwójnego statku specjalnych powłok polimerowo-betonowych w celu zwiększenia odporności na rozszczelnienie podczas kolizji, czy wejścia na mieliznę. Aby poprawnie zaprojektować te bariery ochronne konieczne jest przeprowadzenie symulacji numerycznej. Tworzenie modelu numerycznego konstrukcji podczas kolizji jest bardzo złożone i wymaga wykonania symulacji pomocniczych...
-
Badanie wrzenia w przypływie zaolejonych czynników chłodniczych w rurach orozwiniętej powierzchni wewnętrznej.**2004, 154 s. 159 rys. 6 tab. bibliogr. 155 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /24.01.2004/. P. Gdań., Wydz. Mechaniczny. Promotor: dr hab. inż. J. Cieśliński, prof. nadzw. PG.
Publikacja.
-
Badania konwekcyjnej wymiany ciepła w kanałach płaskich z mechanicznymiturbulizatorami przepływu przy użyciu termografii ciekłokrystalicznej. **2002, 160 s. 76 rys. 3 tab. bibliogr. 61 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /2002.05.14/. P. Gdań., Wydz. Mechaniczny. Promotor: prof. dr hab. inż. J. Stąsiek.
Publikacja.
-
Opracowanie nowej procedury oznaczania wybranych zanieczyszczeń organicz- nych w próbkach gleb i osadów dennych.**2002, 201 s. 63 rys. 57 tab. bib- liogr. 128 poz. maszyn. Rozprawa doktorska / 21.10.2002/, Wydz. Chem. PG Promotor: prof. dr hab. inż. J. Namieśnik.
Publikacja.
-
Comet assay-based methods for measuring DNA repair in vitro; estimates of inter- and intra-individual variation.
PublikacjaZdolność do naprawy uszkodzeń DNA jest jednym z najważniejszych wyznaczników podatności na choroby nowotworowe. Dlatego też użytecznym staje się możliwość pomiaru stopnia naprawy DNA w próbkach materiału badawczego pobranego od ochotników. Celem pracy było, po pierwsze, opracowanie w warunkach in vitro prostej metody (z wykorzystaniem techniki testu kometowego), w której naprawa DNA odbywa się poprzez wycinanie nukleotydów (NER)....
-
Szczepionki DNA i antygeny rekombinantowe w prewencji zarażeń Toxoplasma gondii - aktualny stan badań
PublikacjaToksoplazmoza wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest jedną z najbardziej rozpowszechnionych odzwierzęcych chorób na świecie o bardzo dużym znaczeniu medycznym. Stanowi ponadto bardzo poważny problem weterynaryjny, ponieważ jest główną przyczyną strat reprodukcyjnych w hodowli zwierząt (głównie owiec). Z tego względu bardzo ważne są prace dotyczące konstrukcji i opracowania nowych, skutecznych i tanich...
-
Genetic response to metabolic fluctuations: correlation between central carbon metabolism and DNA replication in Escherichia coli
Publikacja -
The Protective Effect of Dabigatran and Rivaroxaban on DNA Oxidative Changes in a Model of Vascular Endothelial Damage with Oxidized Cholesterol
Publikacja