Wyniki wyszukiwania dla: DRAD PROTEIN

• A surface-exposed DraD protein of uropathogenic Escherichia coli bearing Dr fimbriae may be expressed and secreted independently from DraC usher and DraE adhesin

  Publikacja

  • B. Zalewska-Piątek
  • R. Piątek
  • K. Bury
  • A. Samet
  • B. J. Nowicki
  • S. Nowicki
  • J. Kur

  - Rok 2005

  Operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ odpowiedzialny jest za proces bakteryjnej adhezji i inwazji. Operon dra kodujący fimbrie Dr zawiera sześć otwartych ramek odczytu - draA, draB, draC, draD, draP oraz draE. Fimbrie Dr zlokalizowane na powierzchni komórki bakteryjnej, zbudowane są z podjednostek białka DraE. Niewiele wiadomo na temat powierzchniowej ekspresji białka DraD oraz jego roli w procesie biogenezy fimbrii...

• PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION

  Czasopisma

  ISSN: 1046-5928 , eISSN: 1096-0279

• Molecular aspects of biogenesis of Escherichia coli Dr Fimbriae: characterization of DraB-DraE complexes

  Publikacja

  • R. Piątek
  • B. Zalewska-Piątek
  • O. Kolaj
  • M. Ferens
  • B. J. Nowicki
  • J. Kur

  - Rok 2005

  Hemaglutynina Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jest fimbrialnym homopolimerem zbudowanym z podjednostek białkowych DraE kodowanych przez operon dra. Operon dra zawiera geny draB i draC, kodujące białka homologiczne do białek (białko opiekuńcze-białko kanałotwórcze) zaangażowanych w procesie biogenezy struktur polimerycznych eksprymowanych powierzchniowo. Białko DraB jest jednym z białek periplazmatycznych, należącym...

• Role of the disulfide bond in stabilizing and folding of the fimbrial protein DraE from uropathogenic Escherichia coli

  Publikacja

  • J. Pilipczuk
  • B. Zalewska-Piątek
  • P. Bruździak
  • J. Czub
  • M. Wieczór
  • M. Olszewski
  • M. Wanarska
  • B. Nowicki
  • D. Augustin-Nowacka
  • R. Piątek

  - JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY - Rok 2017

  Dr fimbriae are homopolymeric adhesive organelles of uropathogenic Escherichia coli composed of DraE subunits, responsible for the attachment to host cells. These structures are characterized by enormously high stability resulting from the structural properties of an Ig-like fold of DraE. One feature of DraE and other fimbrial subunits that makes them peculiar among Ig-like domain-containing proteins is a conserved disulfide bond...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Function and Frustration of Multi-Drug ABC Exporter Protein and Design of Model Proteins for Drug Delivery Using Protein Hydration Thermodynamics

  Publikacja

  • D. Urry
  • K. Urry
  • W. Szaflarski
  • M. Nowicki
  • M. Zabel

  - CURRENT PHARMACEUTICAL DESIGN - Rok 2009

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Elastic-contractile model proteins: Physical chemistry, protein function and drug design and delivery

  Publikacja

  • D. Urry
  • K. Urry
  • W. Szaflarski
  • M. Nowicki

  - ADVANCED DRUG DELIVERY REVIEWS - Rok 2010

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Protein & Cell

  Czasopisma

  ISSN: 1674-800X , eISSN: 1674-8018

• PROTEIN JOURNAL

  Czasopisma

  ISSN: 1572-3887 , eISSN: 1573-4943

• How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1

  Publikacja

  • M. Wieczór
  • J. Czub

  - NUCLEIC ACIDS RESEARCH - Rok 2017

  Target search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains

  Publikacja

  • B. M. Zalewska-Piątek
  • S. I. Wilkanowicz
  • R. Piątek
  • J. Kur

  - Polish Journal of Microbiology - Rok 2009

  Infekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Extension of the Unres Package for Physics-Based Coarse-Grained Simulations of Proteins and Protein Complexes to Very Large Systems

  Publikacja

  • A. Sieradzan
  • C. Czaplewski
  • E. Lubecka
  • A. Lipska
  • A. Karczynska
  • A. Gieldon
  • R. Slusarz
  • M. Makowski
  • P. Krupa
  • M. Kogut... i 5 innych

  - Biophysical Journal - Rok 2021

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• PROTEIN SCIENCE

  Czasopisma

  ISSN: 0961-8368 , eISSN: 1469-896X

• ADVANCES IN PROTEIN CHEMISTRY

  Czasopisma

  ISSN: 0065-3233

• JOURNAL OF PROTEIN CHEMISTRY

  Czasopisma

  ISSN: 0277-8033

• PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS

  Czasopisma

  ISSN: 0887-3585 , eISSN: 1097-0134

• UNRES-Dock—protein–protein and peptide–protein docking by coarse-grained replica-exchange MD simulations

  Publikacja

  • P. Krupa
  • A. Karczyńska
  • M. Mozolewska
  • A. Liwo
  • C. Czaplewski

  - BIOINFORMATICS - Rok 2021

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• PROTEUS

  Czasopisma

  ISSN: 0889-6348

• Probiotics and Antimicrobial Proteins

  Czasopisma

  ISSN: 1867-1306 , eISSN: 1867-1314

• The Protein Folding Problem

  Publikacja

  • H. Scheraga
  • A. Liwo
  • S. Oldziej
  • C. Czaplewski
  • J. Pillardy
  • J. Lee
  • D. Ripoll
  • J. Vila
  • R. Kazmierkiewicz
  • J. Saunders... i 12 innych

  - Rok 2006

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Dead Sea Discoveries

  Czasopisma

  ISSN: 0929-0761 , eISSN: 1568-5179

• PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS

  Czasopisma

  ISSN: 0929-8665 , eISSN: 1875-5305

• CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE

  Czasopisma

  ISSN: 1389-2037 , eISSN: 1875-5550

• Current Protocols in Protein Science

  Czasopisma

  ISSN: 1934-3655

• Influence of Osmolytes on Protein and Water Structure: A Step To Understanding the Mechanism of Protein Stabilization

  Publikacja

  • P. Bruździak
  • A. Panuszko
  • J. Stangret

  - JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B - Rok 2013

  Results concerning the thermostability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions with stabilizing osmolytes, trimethylamine-N-oxide (TMAO), glycine (Gly), and its N-methyl derivatives, N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), and N,N,N-trimethylglycine (betaine, TMG), have been presented. The combination of spectroscopic (IR) and calorimetric (DSC) data allowed us to establish a link between osmolytes’ influence on...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Proteins

  Publikacja

  • Z. Sikorski

  - Rok 2002

  Struktura białek wpływa na ich wartość odżywczą, właściwości funkcjonalne wżywności oraz reakcje w surowcach i produktach żywnościowych. Warunki prze-chowywania oraz obróbki w przemyśle i w czasie przygotowywania kulinarnegowywołują przemiany białek istotne dla jakości żywności. Przez celowe, enzy-matyczne i chemiczne modyfikowanie składu i struktury białek można wpływaćna ich właściwości funkcjonalne w żywności i wartość...

• The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains

  Publikacja

  • B. Zalewska-Piątek
  • M. Kur
  • S. Wilkanowicz
  • R. Piątek
  • J. Kur

  - ARCHIVES OF MICROBIOLOGY - Rok 2010

  Biogeneza fimbrii Dr kodowanych przez operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli (infekcje górnych dróg moczowych) odbywa się na bazie zakonserwowanego systemu sekrecji typu chaperone-usher. Funkcjonowanie powyższego systemu sekrecji opiera się na dwóch komponentach białkowych, periplazmatycznym chaperonie DraB i zewnątrzbłonowym kanale DraC. Białko DraB kontroluje proces składania podjednostek fimbrialnych DraE, natomiast...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Biochemical characteristic of biofilm of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains.

  Publikacja

  • B. Zalewska-Piątek
  • S. Wilkanowicz
  • P. Bruździak
  • R. Piątek
  • J. Kur

  - MICROBIOLOGICAL RESEARCH - Rok 2013

  Urinary tract infections caused by Escherichia coli are very common health problem in the developed countries. The virulence of the uropathogenic E. coli Dr+ IH11128 is determined by Dr fimbriae, which are homopolymeric structures composed of DraE subunits with the DraD protein capping the fiber. In this study, we have analyzed the structural and biochemical properties of biofilms developed by E. coli strains expressing Dr fimbriae...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Stabilizing agents and protein stability

  Publikacja

  • P. Bruździak
  • A. Panuszko
  • J. Stangret

  - Acta Biochimica Polonica - Rok 2011

  Białka są kluczowymi elementami żywych organizmów, jak również efektywnymi katalizatorami w biotechnologii i medycynie. Szybki rozwój wielu gałęzi biotechnologii wiąże się z coraz większym zapotrzebowaniem na produkty białkowe charakteryzujące się wysoką stabilnością. Jednym ze sposobów osiągnięcia większej stabilności białek jest wykorzystanie małych związków organicznych, tzw. osmolitów. Do tej grupy związków należą aminokwasy,...

• Colloidal aspects of protein digestion

  Publikacja

  • A. Mackie
  • A. Macierzanka

  - CURRENT OPINION IN COLLOID & INTERFACE SCIENCE - Rok 2010

  .

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Alternative and New Protein Sources

  Publikacja

  • B. Sawicka
  • K. Umachandran
  • N. Nasir
  • D. Skiba

  - Rok 2020

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• On the Origin of Protein Superfamilies and Superfolds

  Publikacja

  • A. Magner
  • W. Szpankowski
  • D. Kihara

  - Scientific Reports - Rok 2015

  Distributions of protein families and folds in genomes are highly skewed, having a small number of prevalent superfamiles/superfolds and a large number of families/folds of a small size. Why are the distributions of protein families and folds skewed? Why are there only a limited number of protein families? Here, we employ an information theoretic approach to investigate the protein sequence-structure relationship that leads to...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain

  Publikacja

  • B. Zalewska-Piątek
  • K. Bury
  • R. Piątek
  • P. Bruździak
  • J. Kur

  - JOURNAL OF BACTERIOLOGY - Rok 2008

  Właściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Lessons learned during SRAD hybrid motor development

  Publikacja

  • M. Czapski
  • N. Szulc
  • J. Godlewska
  • W. Lachowski
  • N. Balogh
  • W. Deszczyński
  • K. Hucik
  • K. Zieliński
  • D. Kardaś
  • A. Rusin... i 2 innych

  - Rok 2022

  Student Researched and Developed (SRAD) hybrid rocket motor H-15 with total impulse of 15 $kNs$ was built. First version of the engine has average thrust of 3 $kN$, the second, improved one is prepared with an aim to have average thrust of 5 $kN$. Engine development was started from scratch and went through phases of: definition of design assumptions and constraints, numerical modelling to predict engine performance, CAD and CAM...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Endocrine responses following exhaustive strength exercise with and without the use of protein and protein-carbohydrate supplements

  Publikacja

  • M. Wilk
  • M. Michalczyk
  • A. Gołaś
  • M. Krzysztofik
  • A. Maszczyk
  • A. Zając

  - Biology of Sport - Rok 2018

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• The importance of the shape of the protein-water interface of a kinesin motor domain for dynamics of the surface atoms of the protein

  Publikacja

  • A. Kuffel
  • J. Zielkiewicz

  - PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS - Rok 2012

  Single kinesin motor domain immersed in water has been investigated using molecular dynamics. It has been found that local properties of water in solvation shell change along with the nature of neighboring protein surface. However, a detailed analysis leads to the conclusion that the geometrical features of hydrogen bonds and overall structure of kinesin hydration water is not very different from bulk water. The local values of...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• The importance of the shape of the protein–water interface of a kinesin motor domain for dynamics of the surface atoms of the protein

  Publikacja

  • A. Kuffel
  • J. Zielkiewicz

  - PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS - Rok 2012

  A single kinesin motor domain immersed in water has been investigated using molecular dynamics. It has been found that local properties of water in the solvation shell change along with the nature of the neighboring protein surface. However, a detailed analysis leads to the conclusion that the geometrical features of hydrogen bonds and overall structure of kinesin hydration water are not very different from bulk water. The local...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Occlusion phenomenon of redox probe by protein as a way of voltammetric detection of non-electroactive C-reactive protein

  Publikacja

  • A. Kowalczyk
  • J. Sęk
  • A. Kasprzak
  • M. Poplawska
  • I. Grudzinski
  • A. Nowicka

  - BIOSENSORS & BIOELECTRONICS - Rok 2018

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Control of voltage source inverter without dead-time effects.

  Publikacja

  • A. Lewicki
  • Z. Krzemiński

  - Rok 2004

  W artykule zaproponowano metodę dokładnego generowania wektora napięcia o małej amplitudzie w falowniku napięcia. Zaprezentowano metodę modulacji szerokości impulsów, w której wyeliminowano koniecznosć wprowadzania czasów martwych oraz kompensacji ich wpływu na napięcie wyjsciowe przekształtnika

• Compensation of Dead Time Effects for Shunt Active Power Filters

  Publikacja

  • A. Cichowski
  • W. Śleszyński
  • J. Nieznański
  • P. Szczepankowski

  - Rok 2015

  The paper presents a comprehensive approach to the compensation of the grid current distortion for shunt active power filter systems. Four different sources of current distortion are addressed: imperfect grid synchronization caused by the distortion in the grid voltages, time delays in the estimation of compensating currents and grid voltages, fluctuations of the dc bus voltage, and the distortion of inverter output voltages due...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Influence of windsurfing fin stiffness distribution on the lift-drag characteristics

  Publikacja

  • H. Pruszko
  • M. Reichel
  • T. Mikulski

  - Rok 2023

  This article addresses the problem of determining the hydromechanical loads generated by flexible hydrofoils. The research was done on the example of the composite windsurfing fin for the RS:X monotype class. Despite the assumption of fins identity, everyday practice showed that variations of mechanical properties occur and strongly affect their performance. Therefore, we decided to study the differences between the windsurfing...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• Minimum drag shape bodies moving in inviscid fluid - revisited

  Publikacja

  • K. Tesch
  • K. Kaczorowska-Ditrich

  - Transactions of the Institute of Fluid-Flow Machinery - Rok 2017

  This paper presents the classic approach to minimum drag shape body problem, moving at hypersonic speeds, leading to famous power law shapes with value of the exponent of 3/4. Two- and three-dimensional cases are considered. Furthermore, an exact pseudo solution is given and its uselessness is discussed. Two new solutions are introduced, namely an approximate solution due to form of the functional and solution by means of optimisation...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION

  Czasopisma

  ISSN: 1741-0126 , eISSN: 1741-0134

• World Research Journal of Peptide and Protein

  Czasopisma

  ISSN: 2278-4586

• Advances in Protein Chemistry and Structural Biology

  Czasopisma

  ISSN: 1876-1623

• Current Topics in Peptide and Protein Research

  Czasopisma

  ISSN: 0972-4524

• International Journal of Peptide and Protein Research

  Czasopisma

  ISSN: 0367-8377

• AMYLOID-JOURNAL OF PROTEIN FOLDING DISORDERS

  Czasopisma

  ISSN: 1350-6129 , eISSN: 1744-2818

• Iron–Sulfur Cluster Biogenesis Chaperones: Evidence for Emergence of Mutational Robustness of a Highly Specific Protein–Protein Interaction

  Publikacja

  • W. Delewski
  • B. Paterkiewicz
  • M. Manicki
  • B. Schilke
  • B. Tomiczek
  • S. Ciesielski
  • Ł. Nierzwicki
  • J. Czub
  • R. Dutkiewicz
  • E. Craig
  • J. Marszalek

  - MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION - Rok 2016

  Biogenesis of iron–sulfur clusters (FeS) is a highly conserved process involving Hsp70 and J-protein chaperones. However, Hsp70 specialization differs among species. In most eukaryotes, including Schizosaccharomyces pombe, FeS biogenesis involves interaction between the J-protein Jac1 and the multifunctional Hsp70 Ssc1. But, in Saccharomyces cerevisiae and closely related species, Jac1 interacts with the specialized Hsp70 Ssq1,...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• U-Tube Method of Identification of Drag Parameters for High Permeability Materials

  Publikacja

  • M. Kaczmarek
  • R. Drelich
  • M. Pakuła

  - Rok 2013

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Self-Tuning Dead-Time Compensation Method for Voltage-Source Inverters

  Publikacja

  • A. Cichowski
  • J. Nieznański

  - Rok 2005

  Przedstawiono nową, kompleksową metodę kompensacji zniekształceń napięcia wyjściowego falownika z modulacją szerokości impulsów. Proponowana metoda umożliwia automatyczne dopasowanie parametrów charakterystyki kompensacyjnej do aktualnej konfiguracji falownika i obciążenia, np. po zmianie przewodu łączącego falownik z obciążeniem. Adaptacja do nowych warunków polega na dostrajaniu wartości parametrów zależności opisującej napięcie...