Filters
total: 1326
filtered: 1032
-
Catalog
- Publications 1032 available results
- Journals 14 available results
- Conferences 1 available results
- Publishing Houses 1 available results
- People 51 available results
- Inventions 12 available results
- Projects 14 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 4 available results
- e-Learning Courses 106 available results
- Events 8 available results
- Open Research Data 82 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: KLASYFIKACJA DNA MORSKIEGO
-
Isoform-specific inhibition of DNA topoisomerase II as the mechanism of action of novel anticancer agent C-1305
Publication -
Toward Intelligent Recommendations Using the Neural Knowledge DNA
PublicationIn this paper we propose a novel recommendation approach using past news click data and the Neural Knowledge DNA (NK-DNA). The Neural Knowledge DNA is a novel knowledge representation method designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing systems. We examine our approach for news recommendation tasks on the MIND benchmark dataset. By taking advantages of NK-DNA, deep...
-
An insight into the mixed quantum mechanical-molecular dynamics simulation of a ZnII-Curcumin complex with a chosen DNA sequence that supports experimental DNA binding investigations
PublicationAn important aspect of research pertaining to Curcumin (HCur) is the need to arrest its degradation in aqueous solution and in biological milieu. This may be achieved through complex formation with metal ions. For this reason, a complex of HCur was prepared with ZnII, that is not likely to be active in redox pathways, minimizing further complications. The complex is monomeric, tetrahedral, with one HCur, an acetate and a molecule...
-
Klasyfikacja segmentów obrazu na litery i nielitery
PublicationArtykuł przedstawia metody oceny podobieństwa figur do liter opracowane dla potrzeb urządzenia do lokalizacji i odczytu napisów z przeznaczeniem dla osób niewidomych. Ocena dotyczy kształtów segmentów znajdowanych na obrazie zawierającym potencjalny tekst (np. witryna sklepu, drzwi z wizytówką, autobus z numerem linii). Celem tej oceny jest wyodrębnienie segmentów obrazu reprezentujących tekst i przekazanie ich do systemu rozpoznawania...
-
Materiały zmiennofazowe-właściwości, klasyfikacja, zalety i wady
PublicationEnergia promieniowania słonecznego jest najbardziej atrakcyjną, z punk¬tu widzenia środowiska, energią odnawialną. Wykorzystanie jej nie powoduje żadnych efektów ubocznych ani emisji szkodliwych substancji. Nie następuje zubożenie jej zasobów naturalnych. Energia promieniowania słonecznego jest energią łatwo dostępną, ale charakteryzującą się małą gęstością strumienia i dużą stochastycznością występowania.Wśród problemów praktycznego...
-
Klasyfikacja algorytmów wyboru usług w architekturze SOA
PublicationWytwarzanie aplikacji w architekturze zorientowanej na usługi wymaga zastosowania odpowiednich algorytmów wyboru usług, które będą zapewniały wytworzenie aplikacji o wymaganych parametrach jakościowych. Biorąc pod uwagę, że problem wyboru usług ma wykładniczą złożoność obliczeniową, stosowne są zarówno algorytmy dokładne jak i przybliżone. W pracy przedstawiono porównanie i analizę istniejących algorytmów wyboru usług w kompozycji...
-
Klasyfikacja wyrobów tytoniowych z wykorzystaniem elektronicznych nosów
PublicationZapobieganie nielegalnej dystrybucji wyrobów tytoniowych w Polsce stanowi poważny problem. Wyroby tytoniowe przemycane do Polski mogą charakteryzować się niższą jakością, wynikającą z wykorzystania surowców gorszego gatunku. Jednym z rozwiązań zmniejszających skalę tego problemu mogą być działania ograniczające przemyt przez granice państwa. Autorzy pracy uważają, że wykorzystanie elektronicznych nosów do rutynowych kontroli przewożonych...
-
Komputerowo wspomagana klasyfikacja wybranych sygnałów elektromiografii powierzchniowej
PublicationWykorzystywanie sygnałów elektromiografii powierzchniowej (ang. Surface Electromyography, SEMG) w procesach sterowania systemami rehabilitacyjnymi stanowi obecnie standardową procedurę. Popularność SEMG wynika z nieinwazyjności metody oraz możliwości szybkiej i precyzyjnej identyfikacji funkcji mięśniowej. W przypadku osób małoletnich proces klasyfikacji sygnałów jest utrudniony ze względu na mniejsze rozmiary i wyższą dynamikę...
-
Klasyfikacja tekstu przy użyciu grafowych sieci neuronowych
PublicationWspółczesnym algorytmom analizy tekstu wciąż daleko do ludzkiego poziomu jego zrozumienia. Jednym z wyzwań jest znajdowanie przez maszynę związków pomiędzy odległymi fragmentami tekstu. Próbą rozwiązania tego problemu są grafowe reprezentacje tekstu, które bardzo dobrze sprawdzają się w przedstawianiu złożonych zależności. W tekście opisane zostały dwie metody grafowej reprezentacji tekstu oraz algorytm grafowych konwolucyjnych...
-
Klasyfikacja aktywności kory wzrokowej za pomocą elektroencefalografu
PublicationW niniejszej pracy została przedstawiona metodologia konstrukcji i oceny systemu cyfrowego automatycznie klasyfikującego dane pochodzące z elektroencefalografu. Opracowana procedura badawcza pozwoliła na przetestowanie rozwiązania na różnych osobach, w różnym wieku, o różnych porach dnia, z wykorzystaniem różnych konfiguracji urządzeń i modeli zjawiska. Uzyskano stuprocentową skuteczność automatycznego rozpoznania stanu spoczynkowego...
-
Klasyfikacja osadów ściekowych z Dębogórza i Swarzewa.
PublicationPrzedmiotem pracy jest analiza osadów ściekowych z oczyszczalni ścieków ze Swarzewa oraz Dębogórza. Analizy elementarne osadów na rożnym etapie przeróbki pozwoliły na znalezienie ich obrazu w systematyce Kempy, Van Krevelena oraz Jurkiewicza. W pracy zawarte zostały wyniki analiz osadów, które pozwoliły na zastosowanie klasyfikacji opracowanej przez prof. E. Kempę do osadów z obu oczyszczalni.
-
The Decisional DNA-Based Smart Bike for Internet of Things
PublicationIn this paper, we introduce a novel application of the Internet of Things, the Decisional DNAbased Smart Bike. The Decisional DNA is a domain-independent, flexible and standard knowledge representation structure; it allows its domains to acquire and store experiential knowledge and formal decision events in an explicit way. By using Decisional DNA, the sensor-equipped bicycle is able to learn its user’s weight, riding habits, etc....
-
Measuring the density of DNA films using ultraviolet-visible interferometry
PublicationIn order to determine a proper value for the density of dry DNA films we have used a method based upon the measurement of interference effects in transmission spectra of thin DNA layers. Our results show that the methodology is effective and the density of DNA in this state, 1.407 g/cm3, is much lower than the commonly used 1.7 g/cm3. Obtaining accurate values for the DNA film density will allow the optical constants for DNA to...
-
Badanie i porównanie zdolności wybranych leków i związków przeciwnowotworowych do międzyłańcuchowego sieciowania DNA mitochondrialnego i jądrowego w komórkach nowotworowych
PublicationCelem pracy było zbadanie zdolności przeciwnowotworowych związków do indukowania międzyłańcuchowych wiązań sieciujących DNA mitochondrialne w ludzkich komórkach nowotworowych oraz porównanie ze zdolnością do sieciowania DNA jądrowego. Pochodna 4-metylo-1-nitroakrydyny C-1748, Ledakrin i mitomycyna C wykazują zdolność do sieciowania mtDNA i jDNA w komórkach raka okrężnicy HCT-8 w sposób zależny od dawki; C-1748 w komórkach raka...
-
A case study of constructing decisional DNA on finanse
PublicationPrzedstawiono koncepcję i rozwiązanie analityczne opisu rynku finansowego przy pomocy reprezentacji wiedzy zwanej ''decyzyjne DNA''.
-
Problem of aggregation in dye-DNA interaction, calorimetry studies
PublicationNucleic acids are the biological target for many antimicrobial, antitumor and antiviral drugs. Ligand-DNA interactions can be classified into two major categories: 1. covalent binding, which can provide to intermolecular adducts, 2. physico-chemical interactions, which can be divided into intercalation (e.g. adriamycin) or groove binding (e.g. dystamycin). There are several methods to investigate interactions between drug and DNA....
-
MODELOWANIE ZANIKÓW W ŚRODOWISKU MORSKIEGO TERMINALU KONTENEROWEGO
PublicationW referacie przedstawiono analizę zaników wolnozmiennych i szybkozmiennych w środowisku terminalu kontenerowego. Zaproponowano model analityczny parametrów rozkładów gęstości prawdopodobieństwa dla zaników, który umożliwia estymowanie wartości tych parametrów dla różnych uwarunkowań systemowych i środowiskowych. W ogólności dla zaników wolnozmiennych najlepiej dopasowany jest rozkład logarytmicznonormalny, natomiast dla zaników...
-
Termodynamika niekowalencyjnego oddziaływania małocząsteczkowych ligandów z dna
PublicationKwasy nukleinowe są jednym z głównych celów biologicznych dla wielu antybiotyków oraz leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych. Podczas tworzenia nowych farmaceutyków ważna jest dokładna wiedza na temat sposobu wiązania się leku do DNA. Oddziaływanie ligand-DNA można podzielić na dwie grupy: 1. wiązanie kowalencyjne, które często prowadzi do utworzenie trwałych wiązań pomiędzy nićmi DNA, 2. fizykochemiczne wiązanie, które...
-
Decisional DNA and Optimization Problem
PublicationMany researchers have proved that Decisional DNA (DDNA) and Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS or SOE) is a technology capable of gathering information and converting it into knowledge to help decision-makers to make precise decisions in many ways. These techniques have a feature to combine with different tools, such as data mining techniques and web crawlers, helping organization collect information from different sources...
-
Decisional DNA: the concept and its implementation platforms
PublicationOmowiono kopncepcje zarzadzania wiedza oparta na decyzyjnym DNA gdzie wiedza jest reprezentowana poprzez zbiory doswiadczen. Przedstawiono obecne oraz przyszle zastosowania omawianej koncepcji.
-
Metylacja DNA w rozwoju, diagnostyce i terapii nowotworów
PublicationDotychczas kowalencyjna modyfikacja DNA, jaką jest zarówno naturalna metylacja DNA, jak i addukty DNA egzogennych niskocząsteczkowych związków chemicznych, były ropatrywane z punktu widzenia genomu. W świetle obecnej wiedzy dotyczącej epigenomu można sądzić, że stosunkowo niewielkie modyfikacje czy to w postaci metylacji cytozyny, czy adduktu DNA mogą mieć znaczący wpływ na działanie komórki, a co za tym idzie także jej transformację...
-
Therapeutic intervention by the simultaneous inhibition of DNA repair and type I or type II DNA topoisomerases: one strategy, many outcomes
PublicationMany anticancer drugs reduce the integrity of DNA, forming strand breaks. This can cause mutations and cancer or cell death if the lesions are not repaired. Interestingly, DNA repair-deficient cancer cells (e.g., those with BRCA1/2 mutations) have been shown to exhibit increased sensitivity to chemotherapy. Based on this observation, a new therapeutic approach termed 'synthetic lethality' has been developed, in which radiation...
-
Flexibility in PAM recognition expands DNA targeting in xCas9
PublicationxCas9 is an evolved variant of the CRISPR-Cas9 genome editing system, engineered to improve specificity and reduce undesired off-target effects. How xCas9 expands the DNA targeting capability of Cas9 by recognising a series of alternative protospacer adjacent motif (PAM) sequences while ignoring others is unknown. Here, we elucidate the molecular mechanism underlying xCas9’s expanded PAM recognition and provide critical insights...
-
Framework for Product Innovation Using SOEKS and Decisional DNA
PublicationProduct innovation always requires a foundation based on both knowledge and experience. The production and innovation process of products is very similar to the evolution process of humans. The genetic information of humans is stored in genes, chromosomes and DNA. Similarly, the information about the products can be stored in a system having virtual genes, chromosomes and decisional DNA. The present paper proposes a framework for...
-
Termodynamiczne aspekty oddziaływania niskocząsteczkowych ligandów z DNA
PublicationKwasy nukleinowe są celem biologicznym dla wielu antybiotyków oraz leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych. Dlatego podczas tworzenia nowych farmaceutyków ważna jest dokładna wiedza na temat sposobu wiązania się leku do DNA.Oddziaływanie ligand-DNA można podzielić na dwie grupy: 1. wiązanie kowalencyjne, które często prowadzi do utworzenie trwałych wiązań pomiędzy nićmi DNA, 2. fizykochemiczne wiązanie, które może być podzielone...
-
Raman spectroscopic study of Ni2+-DNA interactions in aqueous systems
PublicationMetodą ramanowskich widm różnicowych określono sposób oddziaływania jonu Ni2+ z DNA(CT) w układach wodnych. Kation Ni(II) koordynuje w pozycjach N7 guaniny (G) i adeniny (A) w powtarzających się sekwencjach GG, AA i GA cząsteczki DNA. Jednocześnie Ni2+ oddziałuje zewnątrz sferowo poprzez cząsteczki wody z grupami fosforanowymi DNA.
-
Application of decisional DNA in web data mining
PublicationPrzedstawiono pilotową koncepcję i aplikację integracji reprezentacji wiedzy opartej na decyzyjnym DNA oraz systemów pozyskiwania wiedzy i danych z Internetu. Wskazano na zalety proponowanej integracji oraz przedstawiono kierunki przyszłych badań w tym zakresie.
-
Remotely accessible Web-based GIS for real time monitoring and apping of the marine environment
PublicationPrzedstawiono internetowy GIS do integracji, przetwarzania i wizualizacji pochodzących z wielu źródeł danych o różnych komponentach środowiska morskiego, w tym o zanieczyszczeniach. Jako przykład przedstawiono wyniki trójwymiarowego modelowania rozprzestrzeniania się wylewu olejowego w morzu, a także dane pochodzące z akustycznego badania zasobów żywych w Bałtyku.
-
Adding Intelligence to Cars Using the Neural Knowledge DNA
PublicationIn this paper we propose a Neural Knowledge DNA based framework that is capable of learning from the car’s daily operation. The Neural Knowledge DNA is a novel knowledge representation and reasoning approach designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing devices. We examine our framework for drivers' classification based on their driving behaviour. The experimental...
-
Opinia tachniczna rozjazdu Nr 901 na torze dojazdowym do bocznicy kolejowej Morskiego Termonala Kontenerowego DCT w Porcie Północnym w Gdańsku
PublicationOpinia tachniczna rozjazdu Nr 901 na torze dojazdowym do bocznicy kolejowej Morskiego Termonala Kontenerowego DCT w Porcie Północnym w Gdańsku
-
Decisional DNA based embedded systems: a new perspective
PublicationOmówiono nowe kierunki i perspektywy badań w zakresie systemów podporządkowanych opartych na decyzyjnym DNA.
-
Decisional DNA digitral TV: concept and initial experiments
PublicationPrzedstawiono pierwsze wyniki eksperymentalnej integracji telewizji cyfrowej z decyzyjnym DNA reprezentujacym wiedze o odbiorcy programow.
-
VUV irradiation studies of plasmid DNA in aqueous solution
PublicationInteractions of VUV light and DNA samples in aqueous solutions are reported. The damage induced by such radiation is quantified by monitoring both loss of supercoiled DNA and formation of single and double strand breaks using agarose gel electrophoresis. Irradiations were performed using synchrotron VUV photons of 130, 150, 170 and 190 nm. VUV irradiation experiments revealed enhanced damage upon irradiation with 170 nm photons...
-
REJESTRACJA, PARAMETRYZACJA I KLASYFIKACJA ALOFONÓW Z WYKORZYSTANIEM BIMODALNOŚCI
PublicationPraca dotyczy rejestracji i parametryzacji alofonów w języku angielskim z wykorzystaniem dwóch modalności. W badaniach dokonano rejestracji wypowiedzi w języku angielskim mówców, których znajomość tego języka odpowiada poziomowi rodowitego mówcy. W kolejnym etapie wyodrębnione zostały alofony z nagrań fonicznych i odpowiadające im sygnały wizyjne. W procesie tworzenia wektorów cech wykorzystano odrębne systemy parametryzacji,...
-
Klasyfikacja sygnału EKG przy użyciu konwolucyjnych sieci neuronowych
PublicationAutomation and improvement of diagnostic process is a vital element of medicine development and patient’s condition self-control. For a long time different ECG signal classification methods exist and are successfully applied, nevertheless their accuracy is not always satisfying enough. The lack of identification of an existing abnormality, which is very similar to a normal heartbeat is the biggest issue - for example premature...
-
Klasyfikacja sygnału EKG przy użyciu konwolucyjnych sieci neuronowych
PublicationAutomation and improvement of diagnostic process is a vital element of medicine development and patient’s condition self-control. For a long time different ECG signal classification methods exist and are successfully applied, nevertheless their accuracy is not always satisfying enough. The lack of identification of an existing abnormality, which is very similar to a normal heartbeat is the biggest issue - for example premature...
-
KLASYFIKACJA SYGNAŁU EKG PRZY UŻYCIU KONWOLUCYJNYCH SIECI NEURONOWYCH
PublicationPodniesienie jakości i zautomatyzowanie procesu diagnozy jest istotnym elementem rozwoju medycyny i samokontroli stanu zdrowia pacjentów. Od dłuższego czasu istnieją i są stosowane różne metody analizy i klasyfikacji sygnału EKG, jednak nie zawsze ich dokładność jest zadowalająca. Największym problemem jest trudność rozpoznania istniejącej nieprawidłowości, w przypadku gdy jej reprezentacja jest podobna do prawidłowej pracy...
-
Set of Experience and Decisional DNA: Experience-Based Knowledge Structures
PublicationThis chapter presents a description of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA), argumentation for a knowledge representation, composition, configuration and metrics. SOEKS is a combination of filtered and amalgamated information obtained from formal decision events. It facilitates effective explicit representation of decisional experience taken from different technologies. SOEKS comprises variables,...
-
Wybrane metody badania poziomu metylacji DNA w komórkach eukariotycznych
PublicationMetylacja regionów promotorowych jest jednym z głównych mechanizmów regulacji transkrypcji genów u eukariota. W komórkach ssaczych metylacja DNA zachodzi głównie na reszcie cytozyny występującej w dinukleotydach CpG i jest katalizowana przez metylotransferazy DNA (DNMT1, DNMT3A i DNMT3B) (Turek Plewa, Jagodziński 2005). Mapowanie 5 metylocytozyny w DNA genomowym jest jednym z narzędzi do badania wpływu metylacji na tkankowo-specyficzną...
-
Wybrane aspekty programu rewitalizacji Dworca Morskiego w Gdyni
Publication -
Binding free energy of selected anticancer compounds to DNA - theoreticalcalculations
PublicationPraca dotyczy swobodnej energii wiązania z DNA trzech związków o działaniu przeciwnowotworowym (mitoksantronu i dwóch pochodnych pirymidoakrydyny). Obliczenia wykorzystywały metody Poissona-Boltzmanna (udział elektrostatyczny) i metody SASA (udział nieelektrostatyczny). W wyniku badań zaproponowano struktury kompleksów jakie tworzą badane ligandy z DNA.
-
Molecular Recognition in Complexes of TRF Proteins with Telomeric DNA
PublicationTelomeres are specialized nucleoprotein assemblies that protect the ends of linear chromosomes. In humans and many other species, telomeres consist of tandem TTAGGG repeats bound by a protein complex known as shelterin that remodels telomeric DNA into a protective loop structure and regulates telomere homeostasis. Shelterin recognizes telomeric repeats through its two major components known as Telomere Repeat-Binding Factors, TRF1...
-
H2AX phosphorylation, its role in DNA damage response and cancer therapy
PublicationDouble-strand breaks (DSBs) are the most deleterious DNA lesions, which, if left unrepaired, may have severe consequences for cell survival, as they lead to chromosome aberrations, genomic instability, or cell death. Various physical, chemical, and biological factors are involved in DSB induction. Cells respond to DNA damage by activating the so-called DNA damage response (DDR), a complex molecular mechanism developed to detect...
-
Applying Decisional DNA to Internet of Things: The Concept and Initial Case Study
PublicationIn this article, we present a novel approach utilizing Decisional DNA to help the Internet of Things capture decisional events and reuse them for decision making in future operations. The Decisional DNA is a domain-independent, standard and flexible knowledge representation structure that allows its domains to acquire, store, and share experiential knowledge and formal decision events in an explicit way. We apply this approach...
-
Principles of target DNA cleavage and the role of Mg2+ in the catalysis of CRISPR–Cas9
PublicationAt the core of the CRISPR–Cas9 genome-editing technology, the endonuclease Cas9 introduces site-specific breaks in DNA. However, precise mechanistic information to ameliorate Cas9 function is still missing. Here, multimicrosecond molecular dynamics, free energy and multiscale simulations are combined with solution NMR and DNA cleavage experiments to resolve the catalytic mechanism of target DNA cleavage. We show that the conformation...
-
Radiosensitization of DNA in presence of Pt(II)-based compounds
PublicationX-ray irradiation of plasmid DNA in presence of platinum (II)-based compounds was carried out in order to assess the radiosensitization capabilities of these drugs. In present investigations pBR322 plasmid DNA was used to monitor the effectiveness of chosen compounds in inducing strand breaks. Samples were incubated in the presence of potential radiosensitisers: platinum (II) bromide and cis-diamminedibromoplatinum (II). The results...
-
Decisional DNA, reflexive ontologies, and security: developing decisional trust
PublicationOmowiono model osiagania zaufania decyzjnego opartego na decyzyjnym DNA, refleksyjnych ontologiach oraz na bezpieczenstwie technologicznym.
-
Thermodynamic and electrostatic properties of ternary Oxytricha nova TEBP-DNA complex
PublicationZa pomocą metod chemi obliczeniowej badano właściwości molekularne kompleksu telomerowego białka TEBP z Oxytricha nova w kompleksie trójskkładnikowym z DNA o sekwencji telomerowej. Wyliczone wartości energii kompleksowania wskazują specyficznie na jedną z dróg tworzenia kompleksu, gdzie wpierw podjednostka alfa łaczy się z DNA a następnie podjednostka beta dołącza się do takiego dwuskładnikowego kompleksu. Policzone rozkłady molekularnego...
-
A Colorimetric Microplate Assay for DNA-Binding Activity of His-Tagged MutS Protein
PublicationA simple microplate method was designed for rapid testing DNA-binding activity of proteins. The principle of the assay involves binding of tested DNA by his-tagged protein immobilized on a nickel-coated ELISA plate, following colorimetric detection of biotinylated DNA with avidin conjugated to horseradish peroxidase. The method was used to compare DNA mismatch binding activities of MutS proteins from three bacterial species. The...
-
NMR-Based Structural Insight into DNA G-Quadruplex
PublicationEmerging as a promising area in anticancer research, noncanonical DNA structures such as G-quadruplexes are studied using NMR spectroscopy. NOESY spectra reveals crucial interactions between ligands and G-quadruplexes, helping to understand non-covalent binding mechanisms. This knowledge is essential for rational drug design targeting these structures.