Search
Filters
total: 952
-
Catalog
- Publications 789 available results
- Journals 12 available results
- Conferences 1 available results
- People 22 available results
- Inventions 11 available results
- Projects 11 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 2 available results
- e-Learning Courses 22 available results
- Open Research Data 81 available results
Search results for: DNA
-
Neuroendocrine carcinoma, NOS - Male, 81 - Tissue image [5300730025891301]
Open Research DataThis is the histopathological image of STOMACH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Polyp of stomach and duodenum - Female, 50 - Tissue image [9230729557256121]
Open Research DataThis is the histopathological image of STOMACH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Neuroendocrine carcinoma, NOS - Male, 81 - Tissue image [5300730025892911]
Open Research DataThis is the histopathological image of STOMACH tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Topographic AFM imaging of the leaf surface with magnification of details of its morphological structure
Open Research DataTopographic imaging of the leaf surface with magnification of details of its morphological structure. Measurements in semi-contact mode. NTEGRA Prima (NT-MDT) device. NSG 01 probe.
-
PARP inhibition potentiates the cytotoxic activity of C-1305, a selective inhibitor of topoisomerase II, in human BRCA1-positive breast cancer cells
PublicationTwo cellular proteins encoded by the breast and ovarian cancer type 1 susceptibility (BRCA1 and BRCA2) tumor suppressor genes are essential for DNA integrity and the maintenance of genomic stability.Approximately 5-10% of breast and ovarian cancers result from inherited alterations or mutations in these genes.Remarkably, BRCA1/BRCA2-deficient cells are hypersensitive to selective inhibition of poly(ADPribose) polymerase 1 (PARP-1),...
-
Certain family of analytical solutions of nonlinear von Neumann equations
PublicationIn this paper we present a slight generalization of certain type of Darboux transformation, that may be used sub-sequently in a convenient way. This method allows to obtain families of solutions of nonlinear von Neumann equations, that are used in particular in DNA modeling.
-
Targeting shelterin proteins for cancer therapy.
PublicationAs a global health challenge, cancer prompts continuous exploration for innovative therapies that are also based on new targets. One promising avenue is targeting the shelterin protein complex, a safeguard for telomeres crucial in preventing DNA damage. The role of shelterin in modulating ataxia- telangiectasia mutated (ATM) and ataxia-telangiectasia and Rad3-related (ATR) kinases, key players in the DNA damage response (DDR),...
-
Typing of Candida isolates from patients with invasive infection and concomitant colonization
PublicationWe investigated the relationship between colonizing and invasive isolates from patients with candidaemia. Molecular typing was performed using random amplification of polymorphic DNA (RAPD) and multilocus sequence typing (MLST). We found MLST to be sufficient for typing Candida isolates, and that surveillance cultures are helpful in predicting concomitant invasive isolates, but not necessarily the pathogen involved in subsequent...
-
Zakażenia bakteryjne w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego - ocena przydatności diagnostyki molekularnej opartej o technikę PCR. Bacterial infection in chronic otitis media - assessment of usefulness of molecular diagnostic based in PCR method.
PublicationIdentyfikacja zakażeń w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego jest trudna, o czym świadczą wysokie odsetki ujemnych wyników badań bakteriologicznych. Przyczyną tego jest trudność w uzyskiwaniu wiarygodnego materiału do badań oraz stosunkowo niska czułość klasycznych metod diagnostycznych. Amplifikacja bakteryjnego DNA techniką PCR jest badaniem, które może przyczynić się do zwiększenia efektywności i czułości badań bakteriologicznych....
-
ZzP - Biotechnologia wokól nas - Spotkanie Akademickie 17.04.2021 r.
e-Learning CoursesSpotkanie akademickie poświęcone będzie mikroorganizmom, które tak naprawdę są wszędzie. Nie widzimy ich gołym okiem, ale nawet bez oglądania możemy poznać ich niektóre, ważne dla nas cechy. Musimy tylko umieć je wyhodować, co wbrew pozorom, w przypadku większości gatunków mikroorganizmów, nie jest łatwe. Jednym z istotniejszych etapów pracy biologa molekularnego jest możliwość izolacji DNA danego organizmu, dlatego podczas zajęć...
-
ZzP - Mikroorganizmy wśród nas - Spotkanie Akademickie 14.11.2020 r.
e-Learning CoursesSpotkanie akademickie poświęcone będzie mikroorganizmom, które tak naprawdę są wszędzie. Nie widzimy ich gołym okiem, ale nawet bez oglądania możemy poznać ich niektóre, ważne dla nas cechy. Musimy tylko umieć je wyhodować, co wbrew pozorom, w przypadku większości gatunków mikroorganizmów, nie jest łatwe. Jednym z istotniejszych etapów pracy biologa molekularnego jest możliwość izolacji DNA danego organizmu, dlatego podczas zajęć...
-
Badania skuteczności ochrony katodowej nóg platformy wydobywczej
PublicationWykonano badania potencjałowe parametrów ochrony platformy wydobywczej Baltic Beta. Stwierdzono występowanie pełnej ochrony katodowej w rejonie dna. Stan techniczny anod wykazuje znaczne zużycie, jednakże w dalszym ciągu realizują proces ochorny
-
Dissociative Electron Attachment to 5-Iodo-4-thio-2′-deoxyuridine: A Potential Radiosensitizer of Hypoxic Cells
PublicationIn the search for effective radiosensitizers for tumor cells, halogenated uracils have attracted more attention due to their large cross section for dissociation upon the attachment of low-energy electrons. In this study, we investigated dissociative electron attachment (DEA) to 5-iodo-4-thio-2'-deoxyuridine, a potential radiosensitizer using a crossed electron-molecule beam experiment coupled with quadrupole mass spectrometry....
-
New, fast and cheap prediction tests for BRCA1 gene mutations identification in clinical samples.
PublicationDespite significant progress in cancer therapy, cancer is still the second cause of mortality in the world. The necessity to make quick therapeutic decisions forces the development of procedures allowing to obtain a reliable result in a quick and unambiguous manner. Currently, detecting predictive mutations, including BRCA1, is the basis for effectively treating advanced breast cancer. Here, we present new insight on gene mutation...
-
Biochemical, Structural Analysis, and Docking Studies of Spiropyrazoline Derivatives
PublicationIn this study, we evaluated the antiproliferative potential, DNA damage, crystal struc‐ tures, and docking calculation of two spiropyrazoline derivatives. The main focus of the research was to evaluate the antiproliferative potential of synthesized compounds towards eight cancer cell lines. Compound I demonstrated promising antiproliferative properties, especially toward the HL60 cell line, for which IC50 was equal to 9.4 μM/L....
-
Molecular Strategy for Survival at a Critical High Temperature in Eschierichia coli
PublicationThe molecular mechanism supporting survival at a critical high temperature (CHT) in Escherichia coli was investigated. Genome-wide screening with a single-gene knockout library provided a list of genes indispensable for growth at 47°C, called thermotolerant genes. Genes for which expression was affected by exposure to CHT were identified by DNA chip analysis. Unexpectedly, the former contents did not overlap with the latter except...
-
Szczepionki przeciw toksoplazmozie - aktualny stan badań
PublicationArtykuł prezentuje współczesną wiedzę na temat opracowywania skutecznej szczepionki przeciwko toksoplazmozie. W publikacji zebrane zostały informacje dotyczące nowych strategii w konstruowaniu efektywnych szczepionek opartych na antygenach natywnych, rekombinantowych, DNA lub RNA pasożyta.
-
Jacek Chróścielewski prof. dr hab. inż.
People -
The influence of fresh cabbage and sauerkraut juices on the activity of protective enzymes in human cell lines
PublicationMechanizmami przeciwrakotwórczego działania związków zawartych w kapuście jest m.in. metaboliczna aktywacja enzymów II fazy detoksykacji, indukcja enzymów naprawczych DNA oraz aktywnośc przeciwutleniająca. Do enzymów II fazy odtruwania należą m.in. S-transferazy glutationowe (GST) oraz oksydoreduktaza chinonowa NQO1 zwana też DT-diaforazą. GST katalizują reakcję sprzęgania glutationu z wieloma różnymi typami ksenobiotyków, ułatwiając...
-
Interactions of dissolved dsDNA with intercalating drug by anodic voltammetry and spectroscopy. Influence of pH
PublicationOddziaływanie związku przeciwnowotworowego C-1305 z DNA było badane przy pomocy impulsowej voltametrii różnicowej oraz spektroskopii UV/Vis. Triazoloakrydon C-1305 oddziałuje z DNA na dwóch drogach: przez interkalacje pomiedzy pary zasad oraz przez wiązanie sie w małym rowku helisy. W fizjologicznym pH (7,4) stałe wiązania wynoszą: K1=3,36E+5 i K2=0,18E+5 [1/M] a wielkość miejsca wiązania: n1=2,5 i n2=4,0, odpowiednio dla pierwszego...
-
The use of a one-step PCR method for the identification of Microsporum canis and Trichophyton mentagrophytes infection of pets
PublicationIntroduction: Dermatophytes are a closely related group of keratinophilic fungi. They encompass important etiological agents of superficial fungal infections. These fungi are able to invade keratinized tissues of humans and animals, causing dermatophytosis (ringworm) of hair, nails or skin. The aim: Traditional diagnostics of ringworm is based on morphological identification of cultured fungi and is time-consuming. Materials and methods:...
-
Numeryczny model terenu dla studium wykonalności inwestycji
PublicationAutorzy prezentują możliwość pozyskania numerycznego modelu terenu (lądu i dna morskiego) w oparciu o korelację pomiarów fotogrametrycznych i batymetrycznych. Prezentują autorskie opracowanie geoinformatyczne połączone z wdrożeniem na przykładzie wybranej inwestycji w strefie brzegowej Morza Bałtyckiego.
-
MutS3: a MutS homologue of unknown biological function
PublicationThe homologues of MutS proteins are widespread among both Prokaryotes and Eukaryotes. MutS designated as MutS1 is a part of MMR (mismatch repair) system which is responsible for removal of mispaired bases and small insertion/deletion loops in DNA. Initially, the only MutS homologues known were those engaged in mismatch repair and these were later designated as MutS1. Subsequently, the MutS2 homologue was distinguished. MutS2 does...
-
Wymiarowanie wzdłużnych wiązań kadłuba statku.
PublicationOpisano sposób prognozowania długoterminowego naprężeń we wzdłużnych wiązarach kadłuba statku metodą opracowaną w Polskim Rejestrze Statków (PRS). Przedstawiono koncepcję zastosowania współczynników jednoczesności naprężeń i podano przykładowe wartości tych współczynników, obliczone dla wzdłużników dna masowca wielkości panamax.
-
The role of the sawage treatment plant in the removal of genotoxic compounds from the environment
PublicationOne reason for increased incidence of various types of cancer are environmental pollutants particularly of anthropogenic origin. All human activities may pollute the environment, but some have significant impact, just to mention energy industry, mining, transportation, chemical and petrochemical industries and housing. Environmental pollutants are a large group of compounds in terms of their physicochemical properties, some of...
-
Establishing the allosteric mechanism in CRISPR‐Cas9
PublicationAllostery is a fundamental property of proteins, which regulates biochemical information transfer between spatially distant sites. Here, we report on the critical role of molecular dynamics (MD) simulations in discovering the mechanism of allosteric communication within CRISPR‐Cas9, a leading genome editing machinery with enormous promises for medicine and biotechnology. MD revealed how allostery intervenes during at least three...
-
Charakterystyka osadu dennego z basenu pływackiego
PublicationScharakteryzowano próbki osadu z dna basenu pływackiego - zebrane za pomocą odkurzacza wodnego - pod względem rozkładu wielkości cząstek, fizykochemii powierzchni oraz udziału w nim frakcji nieorganicznej oraz organicznej. Szukano korelacji składu i właściwości osadu z liczbą użytkowników basenu.
-
Investigation of properties of swimming pool water treatment sediments
PublicationDwa rodzaje osadów pochodzących z instalacji basenowych zostały scharakteryzowane i otrzymane wyniki przedyskutowane, w szczególności flokuły, które zatrzymały się na filtrze piaskowo-żwirowym i następnie zostały usunięte w płukaniu zwrotnym oraz osady z dna niecki basenowej zebrane tzw. odkurzaczem wodnym. Lepsze zrozumienie struktury i właściwości osadów powinno usprawnić usuwanie cyst Cryptosporidium z basenów i w efekcie podnieść...
-
Przetwarzanie i analiza danych z wykorzystaniem metod geodezyjnych na potrzeby opisu środowiska wodnego
PublicationMonografia traktuje o możliwości wykorzystania analiz obrazowych i przestrzennych w dokonywaniu oceny środowiska wodnego przy zastosowaniu geodezyjnych (w tym teledetekcyjnych) metod pomiarowych. W rozdziale pierwszym dokonano wyznaczenia zasięgu stref zalewowych w zlewni Potoku Strzyża w Gdańsku na skutek opadów nawalnych na odcinku od wypływu cieku ze zbiornika „Srebrniki” do al. Hallera.W rozdziale drugim przedstawiono graficzne...
-
PCR and real-time PCR approaches to the identification of Arthroderma otae species Microsporum canis and Microsporum audouinii/Microsporum ferrugineum
PublicationObjectives The identification of species in the Arthroderma otae complex is essential to determine the origin of infection and to eliminate the risk of transmission. Microsporum canis is a zoophilic species, whereas Microsporum audouinii and Microsporum ferrugineum are anthropophilic species. In this paper, we propose alternative methods that permit species-specific identification of both anthropophilic and zoophilic members of...
-
Diagnozowanie stanu retinopatii cukrzycowej przy pomocy głębokich sieci neuronowych
PublicationW referacie opisano problem wykrywania oraz klasyfikacji stanu retinopatii cukrzycowej ze zdjęć dna oka przy pomocy głębokich sieci neuronowych. Retinopatia cukrzycowa jest chorobą oczu często występującą u osób z cukrzycą. Nieleczona prowadzi do uszkodzenia wzroku, a nawet ślepoty. W pracy badawczej opracowano system wykrywania retinopatii cukrzycowej na podstawie zdjęć dna oka. Opracowana sieć neuronowa przypisuje stan choroby...
-
Zdolni z Pomorza 2019/20 - Genetyka dla wszystkich
e-Learning CoursesCel kursu: Celem kursu jest zapoznanie się z podstawowymi pojęciami z zakresu genetyki człowieka i biologi molekularnej. Uczniowie poznają świat DNA, genów i białek, który rządzi procesami zachodzącymi w naszych organizmach. Opis kursu: W trakcie kursu uczniowie zrozumieją jak zbudowany jest kwas deoksyrybonukleinowy (DNA), jak oddziałuje z białkami i gdzie się znajduje. Przedstawione zostaną podstawowe zagadnienia związane z pojęciem...
-
Kalman filtering for 3d real time data visualisation of multibeam sonar records.
PublicationPrzedstawiono zastosowanie filtracji Kalmana do korekcji błędów systematycznych występujących w danych pochodzących z systemu wielozwiązkowego. Zaproponowano dwuetapową filtrację danych dla każdego wachlarza danych, która realizowana jest w czasie rzeczywistym. Zaprezentowano rezultaty wizualizacji dna morskiego przed i po filtracji.
-
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactoside
PublicationPraca pokazuje konstrukcję DNA plazmidowego kodującego bifunkcjonalne białko chimeryczne złożone z MutS Thermus thermophilus i beta-galaktozydazy E.coli, optymalizację jego ekspresji i oczyszczania. Białko to testowano w metodzie wykrywania mutacji punktowych, wykorzystując kolorymetryczne mierzenie aktywności domeny reporterowej beta galaktozydazy.
-
Koncepcja wytwarzania chłodu, jako dodatkowej funkcji komunalnej źródeł ciepła, na przykładzie elektrociepłowni we Władysławowie.
PublicationPrzedstawiono nowo zrealizowaną lądową elektrociepłownię gazową, zasilaną gazem ziemnym, towarzyszącym wydobywanej z dna morskiego ropie naftowej. Wskazano na możliwość wykorzystania nadmiarowej mocy grzejnej do zasilania w gorącą wodę, jako nośnika napędowego dla absorpcyjnego urządzenia chłodniczego nieodległej chłodni rybnej
-
Koncepcja wytwarzania chłodu jako dodatkowej funkcji komunalnych źródeł ciepła.
PublicationPrzedstawiono nowo zrealizowaną lądową elektrociepłownię gazową, zasilaną gazem ziemnym, towarzyszącym wydobywanej z dna morskiego ropie naftowej. Wsakazano na możliwość wykorzystania nadmiarowej mocy grzejnej źródła do zasilania w gorącą wodę jako nośnika napędowego dla absorpcyjnego urządzenia chłodniczego nieodległej chłodni rybnej.
-
Koncepcja wytwarzania chłodu jako dodatkowej funkcji komunalnych źródeł ciepła.
PublicationPrzedstawiono nowo zrealizowaną lądową elektrociepłownię gazową zasilaną gazem ziemnym towarzyszącemu wydobywanej z dna morskiego ropie naftowej.Wskazano na mozliwość wykorzystania nadmiarowej mocy grzejnej tego źródła do zasilania w gorącą wodę, jako nosnika napędowego dla absorpcyjnego urządzenia chłodniczego nieodległej chłodni rybnej.
-
Regulacja epigenetyczna a potencjał regeneracyjny ssaków. Badania globalnych profili metylacji w tkankach dorosłej myszy MRL/MpJ i w sercach noworodków myszy C57BL/6J.
PublicationW pracy tej otrzymano genomowe profile metylacji DNA dla dwóch modeli regeneracji u ssaków: (i) dorosłej myszy MRL/MpJ, która jest zdolna do zamykania otworów w małżowinie usznej oraz wykazuje podwyższone zdolności regeneracyjne w wielu innych narządach oraz (ii) sercach noworodków myszy, u których zachodzi regeneracja rozległych uszkodzeń lewej komory serca. Zidentyfikowano szereg odmiennie metylowanych regionów DNA, regionów DMR,...
-
Peptydowe koniugaty antrachinonów i ich aktywność biologiczna = Peptidyl anthraquinone conjugates and its biological activity
PublicationW artykule opisano syntezę i aktywność biologiczną peptydowych koniugatów antrachinonów. Koniugaty takie są nie tylko potencjalnymi chemoterapeutykami, ale także odgrywają rolę barwnych ligandów w metodach oczyszczania białek, technikach histochemicznych i badaniu helikalnej struktury DNA z zastosowaniem spektroskopii UV i UV-Vis.
-
Naprężenia w strefie włazu wyczystkowego w stalowym pionowymzbiorniku walcowym
PublicationPrzeprowadzono analizę stanu naprężeń w rejonie włazu wyczystkowego zbiornika na ropę naftową. Włazy takie, niezbędne do usuwania osadów z dna zbiornika muszą być zlokalizowane w polączeniu walcowego płaszcza z płaskim dnem zbiornika a więc w strefie największych zaburzeń błonowej pracy konstrukcji
-
Electron-Induced Decomposition of Uracil-5-yl O-(N,N-dimethylsulfamate): Role of Methylation in Molecular Stability
PublicationThe incorporation of modified uracil derivatives into DNA leads to the formation of radical species that induce DNA damage. Molecules of this class have been suggested as radiosensitizers and are still under investigation. In this study, we present the results of dissociative electron attachment to uracil-5-yl O-(N,N-dimethylsulfamate) in the gas phase. We observed the formation of 10 fragment anions in the studied range of electron...
-
Electron-Induced Decomposition of 5-Bromo-4-thiouracil and 5-Bromo-4-thio-2′-deoxyuridine: The Effect of the Deoxyribose Moiety on Dissociative Electron Attachment
PublicationWhen modified uridine derivatives are incorporated into DNA, radical species may form that cause DNA damage. This category of molecules has been proposed as radiosensitizers and is currently being researched. Here, we study electron attachment to 5-bromo-4-thiouracil (BrSU), a uracil derivative, and 5-bromo-4-thio-20 -deoxyuridine (BrSdU), with an attached deoxyribose moiety via the N-glycosidic (N1-C) bond. Quadrupole mass spectrometry...
-
The Usefulness of Cyclic Diamidines with Different Core-substituents as Antitumor Agents
PublicationA series of related polycationic compds. has been screened for potential antitumor activity by the NCI's in vitro testing (one dose primary anticancer assay and the NCI-60 full panel screening). The GI50 values of triazines 3 and 4 are on av. 1.9 μM and 2.4 μM, resp. Furan 8 deserves mention too (1.9 μM). The biol. test results showed that carbazole 10 possessed cytotoxic activity in the nanomolar range, much better than...
-
Investigation of Microbes in the Stratosphere – Stardust Project
PublicationThe stratospheric microbiota has been investigated many times using the methods of classical microbiology. In this research a few modern methods, including NGS sequencing and multiple displacement amplification of DNA, were in use. The analysis of metagenome helped to determine the content of various species of bacteria in the sample collected in the stratosphere by a hydrogen-filled balloon holding...
-
Conserved motifs of MutL proteins
PublicationtThe MutL protein is best known for its function in DNA mismatch repair (MMR). However, there isevidence to suggest that MutL is not only the linker connecting the functions of MutS and MutH in MMR,but that it also participates in other repair systems, such as Very Short Patch (VSP), Base Excision (BER)and Nucleotide Excision Repair (NER). This study set out to identify the most highly conserved aminoacid sequence motifs in MutL...
-
Antitumor 1-nitroacridine derivative C-1748, induces apoptosis, necrosis or senescence in human colon carcinoma HCT8 and HT29 cells.
PublicationC-1748 jest związkiem oddziaływującym z DNA i potencjalnym związkiem przeciwnowotworowym szczególnie wobec nowotworów prostaty i jelita grubego przeszczepialnych na myszach.W pracy badano odpowiedź komórek nowotworowych HCT8 i HT29 na działanie pochodnej C-1748, w stężeniach biologicznie istotnych (EC90). Analiza cyklu komórkowego linii HCT8 pokazała, że związek powoduje wzrost frakcji sub-G1, świadczący o apoptozie tych komórek...
-
Synthesis, physicochemical and theoretical studies on new rhodium and ruthenium dimers. Relationship between structure and cytotoxic activity
PublicationTwo dimeric compounds of the general formulae (Et3NH)2[Rh2(μ2-L)4Cl2] (1) (where L = thiophene-2-carboxylate) and [((η6-p-cymene)Ru)2(μ-Cl)3]PF6 (2) have been synthesized using a new method. The unique anionic complex 1 (space group P bca) has octahedral coordination in which the equatorial positions are occupied by the oxygen atoms of four thiophene-2-carboxylates in a paddle wheel fashion. In complex 2 (space group ), each Ru(II)...
-
Implementing decisional trust: a first approach for smart reliable systems
PublicationIn this article, we introduce the necessary elements that must be integrated in order to achieve a decisional technology that is trustworthy. Thus, we refer to such technology as decisional trust. For us, decisional trust can be achieved through the use of elements such as the decisional DNA, reflexive ontologies, and security models; and therefore, we present in this article a framework that was used for the implementation of...
-
ALLYING SYSTEM THINKING AND SET OF EXPERIENCE KNOWLEDGE STRUCTURE
PublicationThe approach of system thinking is completely different from traditional forms of analysis. Even the ancient meaning of word analysis is “a breaking up”. Set of Experience Knowledge Structure is an atomic record of decision event that can be grouped together and form some form of decision DNA of an organization. The question that this paper is trying to answer in how those concepts can be merged.
-
Badania progu podwodnego na dnie piaszczystym w numerycznym kanale falowym
PublicationPodstawy modelowania wzajemnego oddziaływania falowania, przepuszczalnego progu podwodnego i piaszczystego dna z wykorzystaniem numerycznego kanału falowego CADMAS-SURF, rozbudowanego o równania przepływu Darcy z rozszerzeniem Brinkmanna-Frochheimera (DARCY-SURF).Zastosowanie modelu skonczonej cieczy lepkiej ze swobodna powierzchnia w obszarze falowania i progu.