Filters
total: 14184
-
Catalog
- Publications 10573 available results
- Journals 426 available results
- Conferences 19 available results
- People 279 available results
- Projects 10 available results
- Laboratories 1 available results
- e-Learning Courses 158 available results
- Events 9 available results
- Open Research Data 2709 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: PROTEIN STRUCTURE PREDICTION, MULTISCALE MODELING, UNRES FORCE FIELD, FREE AND BIOINFORMATICS-ASSISTED MODELING, REPLICA-EXCHANGE MOLECULAR DYNAMICS
-
Periodic and chaotic dynamics in a map‐based neuron model
PublicationMap-based neuron models are an important tool in modeling neural dynamics and sometimes can be considered as an alternative to usually computationally costlier models based on continuous or hybrid dynamical systems. However, due to their discrete nature, rigorous mathematical analysis might be challenging. We study a discrete model of neuronal dynamics introduced by Chialvo in 1995. In particular, we show that its reduced one-dimensional...
-
Numerical Estimation of Hull Hydrodynamic Derivatives in Ship Maneuvering Prediction
PublicationPrediction of the maneuvering characteristics of the ship at the design stage can be done by means of model tests, computational simulations or a combination of both. The model tests can be realized as direct simulation of the standard maneuvers with the free running model, which gives the most accurate results, but is also the least affordable as it requires very large tank or natural lake, as well as complex equipment of the...
-
Quest for the Molecular Basis of Improved Selective Toxicity of All-Trans Isomers of Aromatic Heptaene Macrolide Antifungal Antibiotics
PublicationThree aromatic heptaene macrolide antifungal antibiotics, Candicidin D, Partricin A (Gedamycin) and Partricin B (Vacidin) were subjected to controlled cis-trans to all trans photochemical isomerization. The obtained all-trans isomers demonstrated substantially improved in vitro selective toxicity in the Candida albicans cells: human erythrocytes model. This effect was mainly due to the diminished hemotoxicity. The molecular modeling...
-
Atomic-Scale Finite-Element Modeling of Elastic Mechanical Anisotropy in Finite-Sized Strained Phosphorene Nanoribbons
PublicationNanoribbons are crucial nanostructures due to their superior mechanical and electrical properties. This paper is devoted to hybrid studies of the elastic mechanical anisotropy of phosphorene nanoribbons whose edges connect the terminals of devices such as bridges. Fundamental mechanical properties, including Young’s modulus, Poisson’s ratio, and density, were estimated from first-principles calculations for 1-layer, 3-layer, and...
-
POM/EVA Blends with Future Utility in Fused Deposition Modeling
PublicationPolyoxymethylene (POM) is one of the most popular thermoplastic polymers used in the industry. Therefore, the interest in its potential applications in rapid prototyping is understandable. Nevertheless, its low dimensional stability causes the warping of 3D prints, limiting its applications. This research aimed to evaluate the effects of POM modification with ethylene-vinyl acetate (EVA) (2.5, 5.0, and 7.5 wt.%) on its processing...
-
Towards the Application of Structure-Property Relationship Modeling in Materials Science: Predicting the Seebeck Coefficient for Ionic Liquid/Redox Couple Systems
PublicationThis work focuses on determining the influence of both ionic liquid (IL) type and redox couple concentration on Seebeck coefficient values of such a system. The quantitative structure property relationship (QSPR) and read-across techniques are proposed as methods to identify structural features of ILs (mixed with LiI/I2 redox couple), which have the most influence on the Seebeck coefficient (Se) values of the system. ILs consisting...
-
Elimination of Impulsive Disturbances From Stereo Audio Recordings Using Vector Autoregressive Modeling and Variable-order Kalman Filtering
PublicationThis paper presents a new approach to elimination of impulsive disturbances from stereo audio recordings. The proposed solution is based on vector autoregressive modeling of audio signals. Online tracking of signal model parameters is performed using the exponential ly weighted least squares algo- rithm. Detection of noise pulses an d model-based interpolation of the irrevocably distorted sampl es is realized using an adaptive, variable-order...
-
Structures for parameterization, meshing and data exchange of topologically related surfaces of a ship hull
PublicationThis paper presents proposal of data structures for storage and processing of a parametric three-dimensional model of a midship hull sections. The model consists of coarse surfaces like: decks, frames, girders, stiffeners, brackets, partitions etc. bounded by topological relations. All workshop details are omitted as the model is intended for numeric calculations. Proposed data structures are prepared to facilitate changes in the...
-
Modeling, simulation, and validation of a TB41 crash test of the H2/W5/B concrete vehicle restraint system
PublicationThe paper addresses numerical simulations of a concrete vehicle restraint system. The model is described in detail. The advanced material law of the continuous surface cap model was used to analyze the damage locations in concrete barrier segments. The results were validated against the TB41 full-scale crash test. The test was conducted in compliance with European standard EN 1317, and the validation was performed in accordance...
-
CFD-based evaluation of current-carrying capacity of power cables installed in free air
PublicationEvaluation of current-carrying capacity of power cables and selection of cross-sectional area of their conductors are mainly performed in accordance with requirements of EN, IEC or IEEE standards. However, these standards do not provide all methods of cables installation and location which occur in practice. Thus, in some cases, performance of advanced modeling of various thermal phenomena, affecting power cables current-carrying...
-
Modeling the photodynamic effect in 2D versus 3D cell culture under normoxic and hypoxic conditions
Publication -
Modeling hydrolysis of slowly biodegradable organic compounds in biological nutrient removal activated sludge systems
PublicationHydrolysis is an important process in biological wastewater treatment and is known to be the ratelimiting step in organic carbon removal from municipal or industrial wastewater. The influence of the readily biodegradable chemical oxygen demand fraction in biological wastewater treatment systems has been extensively investigated, but little is known about the effects of slowly biodegradable substrate (XS) on denitrification and...
-
Interpretation and modeling of emotions in the management of autonomous robots using a control paradigm based on a scheduling variable
PublicationThe paper presents a technical introduction to psychological theories of emotions. It highlights a usable ideaimplemented in a number of recently developed computational systems of emotions, and the hypothesis thatemotion can play the role of a scheduling variable in controlling autonomous robots. In the main part ofthis study, we outline our own computational system of emotion – xEmotion – designed as a key structuralelement in...
-
AFM-assisted investigation of conformal coatings in electronics
PublicationPurpose – This paper aims to presents a new method of investigation of local properties of conformal coatings utilized in microelectronics. Design/methodology/approach – It is based on atomic force microscopy (AFM) technique supplemented with the ability of local electrical measurements, which apart from topography acquisition allows recording of local impedance spectra, impedance imaging and dc current mapping. Potentialities...
-
Adolfo Poma
PeopleI am the group leader of the computational modelling of biomolecules divison at the institute of Fundamental Technological Research Polish Academy of Sciences in Poland. My group was hosted between 2021-2022 by International Centre for Research on Innovative Bio-based Materials (ICRI-BioM). In 2008, I got a Master degree in computational physics from the State University of Campinas, Brazil. Then I moved to Germany and under the...
-
Machine learning-based prediction of seismic limit-state capacity of steel moment-resisting frames considering soil-structure interaction
PublicationRegarding the unpredictable and complex nature of seismic excitations, there is a need for vulnerability assessment of newly constructed or existing structures. Predicting the seismic limit-state capacity of steel Moment-Resisting Frames (MRFs) can help designers to have a preliminary estimation and improve their views about the seismic performance of the designed structure. This study improved data-driven decision techniques in...
-
5G/6G optical fronthaul modeling: cost and energy consumption assessment
PublicationIn fifth generation (5G) and the future beyond 5G (6G) radio access networks (RANs), the cost of fronthaul deployment is a main challenge for mobile network operators. Depending on different constraints, there are various solutions to deploy an efficient fronthaul. Fiber-optic-based fronthaul offers long-term support with regard to a rapid increase in capacity demands. When fiber connections, either point-to-point (P2P) or point-to-multipoint...
-
Evaluation of ferrofluid-coated rotating magnetic field-assisted bioreactor for biomass production
Publication -
Are stabilizing osmolytes preferentially excluded from the protein surface? FTIR and MD studies
PublicationInteractions between osmolytes and hen egg white lysozyme in aqueous solutions were studied by means of FTIR spectroscopy and molecular dynamics. A combination of difference spectra method and chemometric analysis of spectroscopic data was used to determine the number of osmolyte molecules interacting with the protein, and the preferential interaction coefficient in presented systems. Both osmolytes – L-proline and trimethylamine-N-oxide...
-
Design-oriented modeling of antenna structures by means of two-level kriging with explicit dimensionality reduction
PublicationThe employment of full-wave electromagnetic (EM) analysis is a practical necessity in the design of contemporary antenna structures. This is because simpler models are generally not available or of limited accuracy. At the same time, EM-based design is computationally expensive. Consequently, the ways of accelerating tasks such as parametric optimization or uncertainty quantification have to be sought. A possible workaround that...
-
A unified coarse-grained model of biological macromolecules based on mean-field multipole–multipole interactions
Publication -
ELECTIVE PROJECT II _sem 5_Green Story - Free Time Space
e-Learning CoursesThe topic of the course - Green Story - Free Time Space, joins green architecture and a place to spend free time - inside and outside – to read, to eat, to relax. The idea is to design green – to give back the greenery to the public square – to make a city space more friendly for users and more friendly to the environment. You can design a story, to make a space more attractive. You can design a Green Story, to make people more...
-
Biopolyols obtained via microwave-assisted liquefaction of lignin: structure, rheological, physical and thermal properties
PublicationThe present study examined the application of polyols obtained via microwave-assisted liquefaction of lignin in the production of rigid polyurethane foam. Lignin was liquefed in crude glycerol and 1,4-butanediol at diferent temperatures (130–170 °C), without a catalyst and using various biomass concentrations (15 and 30 wt%). The physicochemical properties, process yield, and FTIR-based identifcation of the obtained polyols were...
-
Characterization of a single-stranded DNA-binding-like Protein from Nanoarchaeum equitans - a nucleic acid binding protein with broad substrate specificity
PublicationBackground SSB (single-stranded DNA-binding) proteins play an essential role in all living cells and viruses, as they are involved in processes connected with ssDNA metabolism. There has recently been an increasing interest in SSBs, since they can be applied in molecular biology techniques and analytical methods. Nanoarchaeum equitans, the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota, is a hyperthermophilic, nanosized,...
-
Knowledge Exchange Between KIBS Firms and Their Clients: Case Study Analysis
PublicationPurpose: This paper aims to analyse knowledge exchange between KIBS firms and their clients, and their potential determinants (e.g. client’s education, type of the service offered, channel of the knowledge exchange, and willingness of the customer to accept the knowledge). The paper is based on a literature analysis and a case study research, examining 5 KIBS firms located in the Pomeranian region in Poland. Methodology: On the...
-
Structure and evolution of the 4-helix bundle domain of Zuotin, a J-domain protein co-chaperone of Hsp70
PublicationThe J-domain protein Zuotin is a multi-domain eukaryotic Hsp70 co-chaperone. Though it is primarily ribosome-associated, positioned at the exit of the 60S subunit tunnel where it promotes folding of nascent polypeptide chains, Zuotin also has off-ribosome functions. Domains of Zuotin needed for 60S association and interaction with Hsp70 are conserved in eukaryotes. However, whether the 4-helix bundle (4HB) domain is conserved remains...
-
Modeling changes of the ionospheric potential due to lightning and sprites
Publication -
Quantum chemical modeling of electrochromism of tungsten oxide films
Publication -
Design and modeling of switched reluctance motor for scooter application
Publication -
Modeling Online Buyers’ Preferences Related to Webpages Layout
Publication -
<title>Control system modeling for superconducting accelerator</title>
Publication -
Diffusion process modeling by using fractional-order models
Publication -
Modeling and Simulation of Electric Motors Using Lightweight Materials
Publication -
EFFECTS OF BOUNDARY CONDITION EVALUATION ON DESIGN WAVE MODELING
Publication -
Modeling of behavior of organic pollutants in aquatic and related ecosystems
PublicationW pracy omówiono możliwości wykorzystania różnych modeli do opisu zjawisk migracji oraz przemian w środowisku wodnym ksenobiotyków z grupy trwałych zanieczyszczeń organicznych (TZO). Przedstawiono charakterystykę zarówno modeli otwartych, jak i zamkniętych w warunkach ustalonych, jak i w warunkach nierównowagowych.
-
Modeling organic nitrogen conversions in activated sludge bioreactors
PublicationOpracowano model przemian azotu organicznego (Norg)jako rozszerzenie Modelu Osadu Czynnego Nr 2d (ASM2d). Nowy model zawiera trzy frakcje Norg: rozpuszczoą, koloidalną i zawesinową. Każda frakcja została podzielona na dwie podfrakcje - rozkładalną i nierozkładalną. Model został zweryfikowany w oparciu o wyniki badań eksperymentalnych w oczyszczalni ścieków Gdańsk-Wschód.
-
Artificial Neural Networks in Microwave Components and Circuits Modeling
PublicationArtykuł dotyczy wykorzystania sztucznych sieci neuronowych (SNN) w projektowaniu i optymalizacji układów mikrofalowych.Zaprezentowano podstawowe zasady i założenia modelowania z użyciem SNN. Możliwości opisywanej metody opisano wykorzystując przykładowyprojekt anteny łatowej. Przedstawiono różne strategie modelowania układów, które wykorzystują możliwości opisywanej metody w połączeniu zwiedzą mikrofalową. Porównano również dokładność...
-
Modeling of the acoustic waves propagation in non-homogeneous medium
PublicationRozważano zagadnienie propagacji fal w ośrodku niejednorodnym. Przedstawiono model matematyczny i przykładowe wyniki badań numerycznych. Model matematyczny zbudowano w oparciu o równanie KZK. Do rozwiązania zagadnienia zastosowano metodę różnic skończonych. Badano zmiany ciśnienia i zmiany widma odpowiednio w ośrodku jednorodnym i niejednorodnym.
-
Numerical modeling in open channel hydraulics / R. Szymkiewicz
Publicationksiążka poświęcona jest zagadnieniom modelowania matematycznego przepływów w kanałach otwartych.oprócz wyprowadzenia podstawowych równań przepływów oraz transportu masy i energii, w książce omówiono metody numeryczne użyteczne w hydraulice kanałów.przedstawiono liczne przykłady ich aplikacji do rozwiązania równań przepływu ustalonego i nieustalonego. opisowi metod rozwiązania towarzyszą analizy dokładności oraz stabilności numerycznej.
-
M-Split Estimation in Laser Scanning Data Modeling
PublicationPublikacja traktuje o wykorzystaniu estymacji M-Split do modelowania danych pozyskanych w wyniku skaningu laserowego. Autorzy prezentują rozwiązanie w oparciu o detekcję krawędzi dwóch płaszczyzn.
-
AAM toolkit: a system for visual object appearance modeling
PublicationAktywne modele wyglądu (AAM) mogą być traktowane jako zaawansowana metoda analizy informacji multimedialnych, pozwalająca na lokalizowanie i rozpoznawanie obiektów w obrazach statycznych i sekwencjach wideo. Pomimo tego że ukazało się wiele publikacji dotyczących AAM, przejście od koncepcji teoretycznych do działającej implementacji stanowi nadal duże wyzwanie. W pracy przedstawiono przygotowany przez autorów pakiet oprogramowania...
-
Modeling of unsaturated water flow in highly heterogeneous soils.
PublicationTematem pracy jest modelowanie przepływu wody w gruntach nienasyconych o podwójnej porowatości, które charakteryzują się obecnością dwóch podobszarów porowatych o skontrastowanych parametrach hydraulicznych. Jako punkt wyjścia przyjęto, że w skali lokalnej przepływ w obu podobszarach jest opisany równaniem Richardsa. Przedstawiono wyprowadzenie dwóch modeli przepływu w skali makroskopowej przy użyciu metody homogenizacji asymptotycznej....
-
Modeling of cut layer's thickness for circular saw blade
PublicationW pracy omówiono sposób modelowania grubości warstwy skrawanej na podstawie wyprowadzonych zależności matematycznych.
-
Modeling of substrate noise block properties for early rediction.
PublicationZaproponowano nowe podejscie do modelowania zakłóceń podłozowych we wczesnym etapie projektowania systemów na wspólnym podłożu krzemowym. Modelowanie zakłóceń oparto na założeniu, że głównym źródłem zakłóceń podłożowych jest sieć zasilająca. W oparciu o przeprowadzone symulacjie wykazano słusznosć takiej metody.
-
Substrate noise modeling in early floorplanning of MS-SOCs.
PublicationW pracy zaproponowano model częstotliwościowy bloków analogowych wrażliwych na zakłócenia oraz bloków cyfrowych generujących zakłócenia w systemach mieszanych realizowanych na wspólnym podłożu krzemowym. Zaproponowane modele zostały wykorzystane w oprogramowaniu optymalizującym rozmieszczenie bloków funkcjonalnych na struktórze krzemowej. Dzieki użyciu procedur optymalizacyjnych uzyskano znaczącą redukcje poziomu zakłóceń przy...
-
Modeling of damage in a circular plate subjected to dynamic excitation
PublicationSzereg różnych dziedzin nauki zajmuje się problemem zniszczenia ciśnieniowych metalowych zbiorników (mechanika, termodynamika, mechanika płynów). Tylko niektóre prace ujmują wszystkie aspekty analizy. W prezentowanej pracy przedstawiono numeryczna analizę metalowej płyty poddanej obciążeniu dynamicznemu, aż do momentu zniszczenia. Do analizy zastosowano program MSC.Marc, element powłokowy, i prawo sprężysto lekoplastyczne uwzględniające...
-
Computer modeling of perceptual masking and its audiology applications
PublicationW referacie zaprezentowano podstawy perceptualne słyszenia pozwalające na stworzenie nowych modeli kodowania dźwięku, w szczególności do zastosowania w protezach słuchu.
-
Modeling of flow phenomena associated with polymer injection into a mold
PublicationPodczas wtrysku tworzywa do formy w strefie tworzywo-ścianka formy występują zjawiska, które są źródłem zwiększonej chropowatości powierzchni i wad wypraski. W pracy pisano powyższe zjawiska oraz zaprezentowano model numeryczny, umożliwiający symulację tych zjawisk. Symulację komputerową wykonano w CI TASK stosując program FIDAP. Wyniki badań symulacyjnych zweryfikowano badaniami doświadczalnymi, wykonując fotografie i profilogramy...
-
Temperature modeling in activated sludge systems: a case study
PublicationPrzedstawiono model dynamiki temperatury jako część ogólnego modelu komory osadu czynnego. Transport ciepła opisano za pomocą jednowymiarowego równania adwekcyjno-dyspersyjnego z członem źródłowym opisującym teoretyczny bilans ciepła dla komory. Model został zweryfikowany w oczyszczalni ścieków Rock Creek w stanie Oregon (USA) w oparciu o dane eksploatacyjne oraz pomiary meteorologiczne z pobliskiej stacji meteorologicznej. Wyniki...
-
Numerical modeling of ice jam formation in the Włocławek reservoir
PublicationArtykuł opisuje zjawisko powstawania zatoru lodowego w zbiorniku przepływowym przy użyciu dwuwymiarowego modelu DynaRICE. Analizowany proces został przeanalizowany na przykładzie zatoru lodowego, który utworzył się na zbiorniku Włocławek w syczniu 1982 roku. Przeprowadzone obliczenia pokazały, że zator utworzyła się z lodu powierzchniowego. Efekt termiczny i tworzenie się śryżu w zbiorniku został pominięty jako drugorzędny. Wyniki...