Search
Search results for: CYSTEINA
-
Binding modes of a new epoxysuccinyl–peptide inhibitor of cysteine proteases. Where and how do cysteine proteases express their selectivity?
Publication -
Functionalization of cysteine derivatives by unsymmetrical disulfide bond formation
PublicationOpracowano metodę funkcjonalizacji pochodnych cysteiny przy pomocy tworzenia niesymetrycznego wiązania disulfidowego. Opracowana metoda okazała się bardzo łagodna, wydajna, i niewrażliwa na obecność dodatkowych grup funkcyjnych.
-
In silico approaches for better understanding cysteine cathepsin-glycosaminoglycan interactions
PublicationCysteine cathepsins constitute the largest cathepsin family, with 11 proteases in human that are present primarily within acidic endosomal and lysosomal compartments. They are involved in the turnover of intracellular and extracellular proteins. They are synthesized as inactive procathepsins that are converted to mature active forms. Cathepsins play important roles in physiological and pathological processes and, therefore, receive...
-
Substrate specificity of Staphylococcus aureus cysteine proteases – Staphopains A, B and C
Publication -
An animal model of the procognitive properties of cysteine protease inhibitor and immunomodulatory peptides based on colostrum.
Publication -
Improvement of the Rhizoremediation efficiency of PAHs contaminated soil under cysteine treatment along with modeling
Publication -
Non-ergodic fragmentation upon collision-induced activation of cysteine–water cluster cations
PublicationCysteine–water cluster cations Cys(H2O)3,6 + and Cys(H2O)3,6H+ are assembled in He droplets and probed by tandem mass spectrometry with collision-induced activation. Benchmark experimental data for this biologically important system are complemented with theory to elucidate the details of the collisioninduced activation process. Experimental energy thresholds for successive release of water are compared to water dissociation energies...
-
E2/E3‐independent ubiquitin‐like protein conjugation by Urm1 is directly coupled to cysteine persulfidation
Publication -
Novel and effective synthesis protocol of AgNPs functionalized using L-cysteine as a potential drug carrier
Publication -
The organophosphorus sulfenyl bromides as versatile reagents for cysteine derivatives functionalization by unsymmetrical disulfide bond formation
PublicationWe have developed a convenient method for the synthesis of L-cysteine unsymmetrical disulfides under mild conditions with good to excellent yields. Described method is based on the straightforward preparation of the organophosphorus sulfenyl bromide readily available from bis-(5,5-dimethyl-2-thiono-1,3,2-dioxaphosphorinanyl) disulfide. The unsymmetrical disulfides can be obtained for L-cysteine derivatives and thiols bearing neutral...
-
Reduced graphene oxide/iron(II) porphyrazine hybrids on glassy carbon electrode for amperometric detection of NADH and L-cysteine
Publication -
Stable and degradable microgels linked with cystine for storing and environmentally triggered release of drugs
PublicationEnvironmentally sensitive, degradable microgels based on poly(N-isopropylacrylamide) (pNIPA) crosslinked with the diacryloyl derivative of cystine (BISS) were synthesized by applying surfactant-free emulsion polymerization. pNIPA contributed the sensitivity to temperature to the microgels and the cross-linker made them degradable and sensitive to pH. The morphology of the microgels was investigated by using scanning and transmission...
-
N-acetyl cysteine does not modify the sensitization of the rewarding effect of amphetamine as assessed with frequency-modulated 50-kHz vocalization in the rat
Publication -
Simultaneous determination of individual isothiocyanates in plant samples by HPLC-DAD-MS following SPE and derivatization with N-acetyl-l-cysteine
PublicationThe procedure for the isothiocyanates (ITCs) determination that involves derivatization with N-acetyl-l-cysteine (NAC) and separation by HPLC was developed. Prior to derivatization, plant ITCs were isolated and purified using solid-phase extraction (SPE). The optimum conditions of derivatization are: 500 μL of isopropanolic eluate obtained by SPE combined with 500 μL of derivatizing reagent (0.2 M NAC and 0.2 M NaHCO3 in water)...
-
Excess Electron Attachment to Disulfide-Bridged l,l-Cystine. An ab Initio Study
Publication -
An enhanced electrochemical nanohybrid sensing platform consisting of reduced graphene oxide and sulfanyl metalloporphyrazines for sensitive determination of hydrogen peroxide and l -cysteine
Publication -
Biological and Physico-Chemical Characteristics of Arginine-Rich Peptide Gemini Surfactants with Lysine and Cystine Spacers
Publication -
Jacek Krenz dr hab. inż. arch.
PeopleJacek Krenz, born in 1948 in Poznań, Poland, is an academic architect and painter. He is a professor at Gdańsk University of Technology, Faculty of Architecture, taught also at University of Fine Arts in Poznań – both in Poland – and at Universidade da Beira Interior in Covilhã, Portugal. Charter member of The Polish Watercolour Society. He is a co-founder of the Wdzydze Artists’ Village in Kaszuby, Poland, where he works in his...
-
Effect of MgSO4 nutrition on Theobroma cacao L. susceptibility to Phytophthora megakarya infection
PublicationA new strategy to reduce the severity of black pod disease (BPD) in T. cacao plants using MgSO4 nutrition was investigated. The dynamics of the tolerance to BPD of 18 susceptible T. cacao plantlets coming from the cross (♀SNK64 × ♂UPA14) was monitored during weekly (8 weeks) supply of MgSO4 into the soil. Prior to MgSO4 application, disease scores of the 18 plantlets (in six sets of three plantlets per set) were varying between...
-
Novel and Efficient Synthesis of Unsymmetrical Trisulfides
PublicationWe have developed a convenient method for the synthesis of unsymmetrical trisulfides under mild conditions in very good yields. The designed method is based on the straightforward preparation of 1-[(5,5-dimethyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorinan-2-yl)trisulfanyl]dodecane from readily available 5,5-dimethyl-2-sulfanyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorinane, sulfur dichloride (SCl2) and dodecane-1-thiol. The unsymmetrical trisulfides can...
-
TBAF Promoted Formation of Symmetrical Trisulfides
PublicationWe have developed a new method for the synthesis of functionalized symmetrical trisulfides based on (5,5-dimethyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorin-2-yl)disulfanyl derivatives prepared from readily available 5,5-dimethyl-2-sul-fanyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorinane or bis(5,5-dimethyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorinan-2-yl) disulfide. The symmetrical trisulfides can be obtained from aliphatic and aromatic thiols andL-cysteine derivatives...
-
Novel and Efficient Methods for the Synthesis of Symmetrical Trisulfides
PublicationWe have developed a convenient methods for the synthesis of symmetrical trisulfides under mild conditions in very good yields. The described methods are based on the straightforward preparation of 5,5-dimethyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorinane-2-disulfanyl derivatives from readily available 5,5-dimethyl-2-sulfanyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorinane or bis(5,5-dimethyl-2-thioxo-1,3,2-dioxaphosphorinan-2-yl) disulfide. The symmetrical...
-
Oxidative stress induced by 4-methyl-1-nitroacridine derivative C-1748 (Capridine B) in human colon cancer cells
PublicationZbadano wpływ pochodnej C-1748 (Capridine B) na indukcję stresu oksydacyjnego w komórkach ludzkich raków jelita grubego HCT-8 i HT29. W tym celu wykorzystano technikę cytometrii przepływowej z zastosowaniem barwników fluorescencyjnych H2DCFDA i DHR 123. W komórkach traktowanych pochodną C-1748 dochodziło do generowania reaktywnych form tlenu. Ponadto, pochodna C-1748 nie indukowała znaczącego spadku zawartości zredukowanej formy...
-
Imidazolium silanethiolates relevant to the active site of cysteineproteases. A cooperative effect in a chain of NH(+)...S(-) hydrogenbonds
PublicationThree imidazolium silanethiolates relevant to the active site of cysteine proteases have been synthesized and investigated by X-ray diffraction, IR spectroscopy and computational methods. As indicated by crystallographic and FT-IR data in the solid state, the transfer of proton from thiol to imidazole takes place and a thiolato-imidazolium ion pair is formed. The FT-IR spectra of crystalline imidazolium silanethiolates exhibit...
-
The effect of transglutaminase on the properties of salmon skin-gelatin films
PublicationCelem pracy była enzymatyczna modyfikacja folii otrzymanych z żelatyny rybnej. Źródłem żelatyny były surowe i wędzone skóry łososia. Stwierdzono, że czas żelowania roztworu żelatyny ulegał skróceniu w obecności transglutaminazy w badanym zakresie 0,1-0,2 mg/ml. Enzymatyczne modyfikacje prowadziły do obniżenia rozpuszczalności folii, jednakże w różnym stopniu zależnym od źródła białka. Obecność DTT lub cysteiny w mieszaninie reakcyjnej...
-
Other cystitis - Male, 36 - Tissue image [9200729571533911]
Open Research DataThis is the histopathological image of BLADDER tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Influence of transglutaminase or 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide (EDC) on the properties of fish-skin gelatin films
PublicationBadano wpływ sieciowania żelatyny przy użyciu transglutaminazy (TG) lub EDC na rozpuszczalność oraz mechaniczne i barierowe właściwości wytworzonych folii. Rozpuszczalność sieciowanych enzymatycznie folii w buforach o pH 3 i 6 obniżyła się ze 100% do 30%, a folii modyfikowanych TG w obecności ditiotreitolu lub cysteiny, odpowiednio, do 5 i 15%. Rozpuszczalność folii modyfikowanych EDC wynosiła 10%. Sieciowanie enzymatyczne nie...
-
Tri-tert-butoksysilanotiolanowe kompleksy cynku(II), kadmu(II) i kobaltu(II) jako modele koordynacji jonu cynku w miejscu aktywnym dehydrogenazy alkoholowej i niektórych innych enzymów
PublicationDehydrogenaza alkoholowa (ADH) katalizuje odwracalne utlenienie alkoholi do aldehydów przy użyciu NAD+ co można podsumować równaniem:R1R2CHOH + NAD+ = R1R2CO + NADH + H+. Geometria koordynacyjna cynku w miejscu aktywnym ADH opisywana jest na ogół jako tetraedryczna jednak istnieją również przesłanki wskazujące na poszerzanie sfery koordynacyjnej metalu w cyklu katalitycznym do LK=5. W pracy przeglądowej opisano badania nad syntetycznymi,...
-
Molecular docking studies towards development of novel Gly-Phe analogs for potential inhibition of Cathepsin C (dipeptidyl peptidase I).
PublicationCathepsin C is a cysteine protease required for activation of various pro-inflammatory serine proteases and, essentially, is of interest as a therapeutic target. Cathepsin C coordinate system was employed as a model to study the interaction of some already available inhibitors of Cathepsin C. Compounds containing Gly-Phe fragment with functional groups at its ends were designed by knowledge based approach. Using AutoDock and...
-
Effect of Amino Acids and Sodium Chloride on d-Sorbitol in Aqueous Solutions at Different Temperatures: Volumetric and Acoustic Approach
PublicationApparent molar volumes and apparent molar compressibilities for d-sorbitol in (0.05, 0.1, 0.2 and 0.3) mol·kg−1 aqueous solutions of l-alanine, l-cysteine and l-histidine and NaCl have been determined from measurements of solution density at T = (288.15, 298.15, 308.15 and 318.15) K and sound velocity at T = 298.15 K, as a function of the concentration of the sugar alcohol. The data were used to obtain the limiting apparent molar...
-
Correction to: Serialization for Property Graphs
Publication -
Serialization for Property Graphs
Publication -
Albuminy 2S - roślinne białka zapasowe o właściwościach alergennych
PublicationRoślinne albuminy 2S są znane jako białka zapasowe obecne w nasionach niektórych roślin jadalnych, takich jak: soja, słonecznik, gorczyca i orzech brazylijski. Białka te posiadają niezwykłą strukturę drugorzędową, będącą wynikiem obecności bogatych w cysteinę motywów C-Xn-CXn-CC-Xn-CXC-Xn-C-Xn-C oraz czterech wiązań disiarczkowych. Dzięki tej strukturze, albuminy 2S są odporne na obróbkę termiczną i proteolizę. Niektóre z tych...
-
Assay of Cystathionine-γ-synthase (CaStr2p) activity determination.
Open Research DataThe study aimed to obtain conditions optimal for the activity of Candida albicans cystathionine-γ-synthase (CaStr2p) determination. The selection of appropriate reaction conditions included the identification of the reaction buffer and its pH, substrate, and enzyme concentrations. The activity of Str2p was measured by the detection of decrease of the...
-
The possibility of use keratin products in various branches of industry
PublicationBird's feather, the main by-product of the poultry industry, are not enough utilized and negatively influencing the environment. They contain large amount of keratin, the protein with high cystine content. The aim of our work was to obtain hydrolysates and isolates of keratin, which can be used in various areas of food, cosmetics, pharmaceutical industry and as animal feed. Keratin can be hydrolyzed and extracted from feather after...
-
Inactivation of glucosamine-6-phosphate synthase by N3-oxoacyl derivatives of L-2,3-diaminopropanoic acid
PublicationN3-oksoacylowe pochodne kwasu l-2,3-diaminopropanowego zawierające ugrupowanie epoksydowe lub układ sprzężonych wiązań podwójnych inaktywują syntaze glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P) z S. cerevisiae. Wyniki badań kinetycznych inaktywacji enzymu wskazują na dwuetapowy przebieg tej reakcji, przy czym tworzenie kompleksu enzym:ligand poprzedza nieodwracalną modyfikację enzymu. Badane związki różniły się powinowactwem do centrum aktywnego...
-
Cancer-selective, single agent chemoradiosensitising gold nanoparticles
PublicationTwo nanometre gold nanoparticles (AuNPs), bearing sugar moieties and/or thiol-polyethylene glycol-amine (PEG-amine), were synthesised and evaluated for their in vitro toxicity and ability to radiosensitise cells with 220 kV and 6 MV X-rays, using four cell lines representing normal and cancerous skin and breast tissues. Acute 3 h exposure of cells to AuNPs, bearing PEG-amine only or a 50:50 ratio of alpha-galactose derivative and...
-
Implication of the disulfide bridge in trypsin inhibitor SFTI-1 in its interaction with serine proteinases
PublicationFourteen monocyclic analogues of trypsin inhibitor SFTI-1 isolated from sunflower seeds were synthesized by the solid-phase method. The purpose of this work was to establish the role of a disulfide bridge present in inhibitor's side chains of Cys3 and Cys11 in association with serine proteinases. This cyclic fragment was replaced by the disulfide bridges formed by L-pencillamine (Pen), homo-L-cysteine (Hcy), N-sulfanylethylglycine...
-
Uszkodzenia korozyjne betonowego podtorzą zlokalizowanego na terenie zakładu przemysłowego
PublicationW artykule opisano uszkodzenia betonowego podtorza w miejscu rozładunku produktów ropopochodnych na tere-nie zakładu przemysłowego. Beton płyty podtorza uległ degradacji w wyniki wieloletniej eksploatacji polegającej między innymi na jego cyklicznym zalewaniu produktami ropopochodnymi w trakcie rozładunku i załadunku cystern kolejowych. Przeprowadzone w okresie wcześniejszym prace naprawcze polegające na reprofilacji wierzchniej...
-
Charakterystyka izolatów keratyny z piór drobiowych w aspekcie produkcji biopeptydów i biodegradowalnych opakowań
PublicationPióra stanowią uciążliwy, masowo produkowany odpad przemysłu spożywczego, który zalega na wysypiskach ze względu na powolne tempo biodegradacji. Składają się one w ok. 90% z keratyny, włóknistego białka, stabilizowanego licznymi wiązaniami disulfidowymi i wodorowymi. Celem niniejszych badań było opracowanie metod przetwarzania keratyny z piór drobiowych z zamiarem otrzymania rozpuszczalnych preparatów białkowych, przeznaczonych...
-
Optimization of vortex-assisted supramolecular solvent-based liquid liquid microextraction for the determination of mercury in real water and food samples
PublicationA novel method was developed for sample preparation for spectrophotometric determination of Hg(II) in water and food samples. The method was based on vortex-assisted supramolecular solvent-assisted liquid-liquid microextraction (VA-SUPRASs-LLME). Analytical parameters such as pH, chelating agent, solvent type and volume, vortex time and salting out effect were optimized. Surface and normal probability plots were drawn for the variables...
-
The influence of selenium addition during seeds' germination on the biological properties of obtained sprouts
PublicationSelenium plays a vital role in human body, because in the form of aminoacids (Se-methionine, Se-cysteine) it is found in the active centres of over 25 enzymes, including those regarded as 'cytoprotective'. Unfortunatelly, its daily intake in Poland and other European countries is lower than predicted by dietary recommendations. The consequences of selenium deficiency in diet might be severe, including higher susceptibility to cardio-vascular...
-
Wykorzystanie analitycznych narzędzi zarządzania projektami w kształtowaniu procesów logistycznych na przykładzie działalności Lotos Kolej
PublicationCelem artykułu była analiza możliwych efektów zmian w procesie obsługi zlecenia polegającego na organizacji przewozu cystern paliwowych, realizowanego przez przedsiębiorstwo LOTOS Kolej S.A. Głównym kryteriami porównania opracowanych wariantów zmian było skrócenie czasu trwania procesu oraz, tam gdzie to możliwe, minimalizacja kosztów pracy. Do wizualizacji procesu oraz analizy danych wykorzystany został program Microsoft Project....
-
Wybrane reakcje kwasu neopentylidenofosforoditiowego oraz jego zastosowanie do otrzymywania niesymetrycznie podstawionego wiązania disulfidowego lub sulfidowego.
PublicationŁatwo dostępne mieszane bezwodniki fosforoditio-tiokarboksylowe są doskonałymi, chemoselektywnymi odczynnikami tioacylującymi azotowe lub siarkowe nukleofile w obecności grupy hydroksylowej. Takie właściwości tych bezwodników umożliwiły otrzymywanie hydroksy tioamidów, hydroksy ditioestrów i kwasów tiohydroksamowych z substratów zawierających niechronioną grupę hydroksylową. Natomiast, N,N-dipodstawione oraz N-podstawione zatłoczone...
-
Characterization of recombinant homocitrate synthase from Candida albicans
PublicationLYS21 and LYS22 genes from Candida albicans encoding isoforms of homocitrate synthase (HCS), an enzyme catalyzing the first committed step in the L-lysine biosynthetic pathway, were cloned and expressed as NoligoHistagged fusion proteins in Escherichia coli. The purified gene products revealed HCS activity, i.e. catalyzed the condensation of α-ketoglutarate with acetyl-coenzyme A to yield homocitrate. The recombinant enzymes were purified...
-
Opracowanie nowych metodyk oznaczeń ilościowych i jakościowych izotiocyjanianów oraz związków indolowych w próbkach roślin z rodziny Brassicaceae
PublicationIzotiocyjaniany (ITC) i indole powstające w wyniku hydrolizy glukozynolanów obecnych w roślinach z rodziny Brassicaceae wykazują wysoką aktywność biobójczą w stosunku do fitofagów stanowiąc alternatywę dla syntetycznych pestycydów. Zaliczane są także do najważniejszych żywieniowych substancji przeciwzapalnych i przeciwrakotwórczych. Pomimo wielu zastosowań dotychczas brakowało metod analitycznych umożliwiających ich rutynowe oznaczanie....
-
Pochodne kwasu neopentylidenofosforoditiowego jako substraty do syntezy ugrupowania trisulfidowego
PublicationBadania przeprowadzone w Katedrze Chemii Organicznej Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej na przestrzeni ostatnich kilku lat, pokazały wszechstronność pochodnych kwasu neopentylidenofosforoditiowego [32] w syntezie symetrycznie i niesymetrycznie podstawionego ugrupowania disulfidowego. Wyniki powyższych badań doprowadziły do opracowania nowej strategii syntetycznej, umożliwiającej otrzymywanie...
-
THE GENE CLONING, OVEREXPRESSION, PURIFICATION AND BIOCHEMICAL CHARACTERISATION OF A NEW COLD-ADAPTED β–GALACTOSIDASE FROM ARTHROBACTER SP. VII-4
PublicationINTRODUCTION. β-Galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It is commercially used in dairy industry for the production of milk with reduced lactose content. Potentially, the best method for lactose removal under cooling conditions should be carried out with a cold-adapted enzyme. AIM. The aim of this study was to determine the taxonomic affiliation of the isolate...
-
Chicken feather keratin as a source of bioactive peptides useful in prevention of metabolic disorders – in silico and in vitro hydrolysis
PublicationProtein derived bioactive peptides not only serve as nutrients but can also exert drug-like activity, e.g. antidiabetic, antihypertensive, or antimicrobial, to name a few. Most biopeptides have beneficial effects on health that make them attractive for nutraceutical applications. The majority of bioactive peptides have been obtained from food proteins, but protein-rich by-products generated by agriculture...
-
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublicationAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...