Filters
total: 5548
-
Catalog
- Publications 3163 available results
- Journals 52 available results
- Conferences 3 available results
- Publishing Houses 4 available results
- People 69 available results
- Inventions 6 available results
- Projects 6 available results
- Laboratories 3 available results
- Research Equipment 1 available results
- e-Learning Courses 443 available results
- Events 15 available results
- Open Research Data 1783 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: c++/mpi
-
Checkpointing of Parallel MPI Applications using MPI One-sided API with Support for Byte-addressable Non-volatile RAM
PublicationThe increasing size of computational clusters results in an increasing probability of failures, which in turn requires application checkpointing in order to survive those failures. Traditional checkpointing requires data to be copied from application memory into persistent storage medium, which increases application execution time as it is usually done in a separate step. In this paper we propose to use emerging byte-addressable...
-
Object serialization and remote exception pattern for distributed C++/MPI application
PublicationMPI is commonly used standard in development of scientific applications. It focuses on interlanguage operability and is not very well object oriented. The paper proposes a general pattern enabling design of distributed and object oriented applications. It also presents its sample implementations and performance tests.
-
Journal of Physical Chemistry C
Journals -
Efektywna warstwa pośrednicząca dla obliczeń typu master-slave w środowisku C++/MPI
PublicationPokazano, jak dla wysokowydajnościowego algorytmu pisanego w modelu master-slave w języku C++ i spełniającego pewne ograniczenia można napisać i wykorzystać warstwę komunikacyjną zupełnie oddzielającą kod odpowiedzialny za komunikację od kodu odpowiedzialnego za dzie-dzinę problemową. Przedstawiona zostaje specyfkacja wymagań, jakie powinien spełniać hipotetyczny system rozproszony oraz warstwa komunikacyjna, a także wymagania...
-
BC-MPI: running an mpi application on multiple clusters with beesycluster connectivity
PublicationW artykule zaproponowano nowy pakiet BC-MPI, który umożliwiauruchomienie aplikacji MPI na wielu klastrach z różnymi implementacjami MPI. Wykorzystuje dedykowane implementacje MPIdo komunikacji wewnątrz klastrów oraz tryb MPI THREAD MULTIPLE dokomunikacji pomiędzy klastrami w dodatkowych wątkach aplikacji MPI. Ponadto, aplikacja BC-MPI może być automatycznie skompilowanai uruchomiona przez warstwę pośrednią BeesyCluster. BeesyClusterumożliwia...
-
PHYSICA C-SUPERCONDUCTIVITY AND ITS APPLICATIONS
Journals -
Journal of Materials Chemistry C
Journals -
Performance and Power-Aware Modeling of MPI Applications for Cluster Computing
PublicationThe paper presents modeling of performance and power consumption when running parallel applications on modern cluster-based systems. The model includes basic so-called blocks representing either computations or communication. The latter includes both point-to-point and collective communication. Real measurements were performed using MPI applications and routines run on three different clusters with both Infiniband and Gigabit Ethernet...
-
Towards Easy-to-Use Checkpointing of MPI Applications within CLUSTERIX.
PublicationW literaturze wymienia się wiele bibliotek/systemów zarówno poziomu jądra jak i użytkownika, które wspomagają zapisywanie i odtwarzanie stanu procesów. W odniesieniu do aplikacji równoległych, jest to jednak zadanie cały czas trudne. Praca prezentuje nasze podejście do zapisywania/odtwarzania stanu aplikacji MPI wspomagane przez programistę, które wykorzystane będzie w środowisku projektu CLUSTERIX tj. zintegrowanej grupie klastrów...
-
New user-guided and ckpt-based checkpointing libraries for parallel MPI applications
PublicationPraca prezentuje szczególy projektowe i implementacyjne jak również wyniki wydajnościowe dwóch nowych bibliotek checkpointingu opracowanych przez autorów dla równoległych aplikacji MPI. Pierwsz biblioteka, tzw. user-guided wymaga od programisty dostarczenia funkcji pakujących i rozpakowujących stan procesu, ale dostarcza łatwego w użyciu API z wykorzystaniem stałych MPI. Wykorzystuje funkcje I/O MPI-2 lub dedykowany proces master...
-
A Solution to Image Processing with Parallel MPI I/O and Distributed NVRAM Cache
PublicationThe paper presents a new approach to parallel image processing using byte addressable, non-volatile memory (NVRAM). We show that our custom built MPI I/O implementation of selected functions that use a distributed cache that incorporates NVRAMs located in cluster nodes can be used for efficient processing of large images. We demonstrate performance benefits of such a solution compared to a traditional implementation without NVRAM...
-
MAI Journal
Journals -
Wyznaczenie charakterystyk eksploatacyjnych siłowni turbinowej z reaktorem wysokotemperaturowym w zmiennych warunkach pracy dla parametrów 28 MPa/550/580 °C.
PublicationW referacie przedstawiono obliczenia dotyczące charakterystyk siłowni turbinowej posiadającej reaktor wysokotemperaturowy. Oceniono je w zmiennych warunkach pracy, zmienność ta dotyczyła różnej masy i zmiany pracy skraplacza. Parametry pracy obiegu potrzebne do wyznaczenia charakterystyk były wyznaczone programem DIAGAR.
-
Contribution of UDP-glucuronosyltransferases (UGTs) in metabolism of acridinone antitumor agents, C-1311, C-1305, and their less active structural analogues, C-1330 and C-1299
PublicationCelem prowadzonych badań było określenie roli UDP-glukuronylotransferaz, uważanych za najważniejsze enzymy detoksykujące, w metabolizmie pochodnych imidazo- i triazoloakrydonu. Wykazano, że najbardziej aktywne przeciwnowotworowo związki z obu grup, tj. C-1311 i C-1305 są transformowane do O-glukuronidów, w przeciwieństwie do ich metoksylowych analogów, odpowiednio związku C-1330 i C-1299. Analiza składu mieszanin reakcyjnych zawierających...
-
Materials Science & Engineering C-Materials for Biological Applications
Journals -
Portable parallel simulator using MPI for 2D and 3D domains: design and performance testing
PublicationW artykule prezentujemy szczegóły projektowo-implementacyjne naszego modularnego kodu symulacyjnego z wykorzystaniem MPI, w tym nakładaniem obliczeń i komunikacji. Podkreślamy modularność naszej implementacji pozwalającą na łatwą adaptację kodu dla innych zasotosowań. Prezentujemy związek pomiędzy przyspieszeniem obliczeń, rozmiarem i kształtami trójwymiarowych domen z różnymi stosunkami liczby węzłów aktualizowanych przez procesor...
-
Three levels of fail-safe mode in MPI I/O NVRAM distributed cache
PublicationThe paper presents architecture and design of three versions for fail-safe data storage in a distributed cache using NVRAM in cluster nodes. In the first one, cache consistency is assured through additional buffering write requests. The second one is based on additional write log managers running on different nodes. The third one benefits from synchronization with a Parallel File System (PFS) for saving data into a new file which...
-
Węzły grupy C
PublicationDrogi ogólnodostępne, zazwyczaj dwupasmowe dwukierunkowe, stanowią w Polsce ponad 95% łącznej długości dróg publicznych i ogromna większość punktów przecięć tych dróg to skrzyżowania zwykłe lub skanalizowane. Jednakże niektóre z nich są projektowane jako węzły. Najprostszym i najtańszym rozwiązaniem jest wybudowanie węzła grupy C. Są to takie węzły których główne potoki krzyżują się między sobą bezkolizyjnie, a na każdej z krzyżujących...
-
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION C-CRYSTAL STRUCTURE COMMUNICATIONS
Journals -
Chinese Physics C
Journals -
PHYSICAL REVIEW C
Journals -
Performance Assessment of Using Docker for Selected MPI Applications in a Parallel Environment Based on Commodity Hardware
PublicationIn the paper, we perform detailed performance analysis of three parallel MPI applications run in a parallel environment based on commodity hardware, using Docker and bare-metal configurations. The testbed applications are representative of the most typical parallel processing paradigms: master–slave, geometric Single Program Multiple Data (SPMD) as well as divide-and-conquer and feature characteristic computational and communication...
-
Investigation into MPI All-Reduce Performance in a Distributed Cluster with Consideration of Imbalanced Process Arrival Patterns
PublicationThe paper presents an evaluation of all-reduce collective MPI algorithms for an environment based on a geographically-distributed compute cluster. The testbed was split into two sites: CI TASK in Gdansk University of Technology and ICM in University of Warsaw, located about 300 km from each other, both connected by a fast optical fiber Ethernet-based 100 Gbps network (900 km part of the PIONIER backbone). Each site hosted a set...
-
Demonstrator technologii C-IED
PublicationArtykuł przedstawia budowę i działanie opracowanego na Politechnice Gdańskiej demonstratora technologicznego systemu AEGIS, przeznaczonego do przeciwdziałania atakom z wykorzystaniem prowizorycznych urządzeń wybuchowych detonowanych drogą radiową (RCIED — Radio Controlled Improvised Explosive Devices). Przedstawiono zaimplementowaną oryginalną metodę generowania sygnału zagłuszającego o dowolnie ukształtowanym widmie częstotliwościowym,...
-
Acridinone antitumor agents: C-1311, C-1330 and C-1305 are metabolized by flavin-containing monooxygenase isoenzymes: FMO1, FMO3 and FMO5 with different rates
PublicationRekombinantowe ludzkie monooksygenazy flawinowe: FMO1, FMO3, FMO5 indukują przemiany metaboliczne wybranych do badań pochodnych akrydonu. Biotransformacja związków C-1311, C-1330 i C-1305 przez FMO prowadzi do jednego produktu o strukturze N-tlenku. Wyniki badań wskazują, że najbardziej podatna na przemiany wobec FMO jest pochodna triazoloakrydonu C-1305. Wydaje się więc, że głównymi enzymami pierwszej fazy przemian metabolicznych...
-
A Fail-Safe NVRAM Based Mechanism for Efficient Creation and Recovery of Data Copies in Parallel MPI Applications
PublicationThe paper presents a fail-safe NVRAM based mechanism for creation and recovery of data copies during parallel MPI application runtime. Specifically, we target a cluster environment in which each node has an NVRAM installed in it. Our previously developed extension to the MPI I/O API can take advantage of NVRAM regions in order to provide an NVRAM based cache like mechanism to significantly speed up I/O operations and allow to preload...
-
A Parallel MPI I/O Solution Supported by Byte-addressable Non-volatile RAM Distributed Cache
PublicationWhile many scientific, large-scale applications are data-intensive, fast and efficient I/O operations have become of key importance for HPC environments. We propose an MPI I/O extension based on in-system distributed cache with data located in Non-volatile Random Access Memory (NVRAM) available in each cluster node. The presented architecture makes effective use of NVRAM properties such as persistence and byte-level access behind...
-
Status of the MPD Experiment at JINR
Publication -
Synteza aminokwasowych pochodnych MPA
PublicationKwas mykofenolowy (MPA) jest związkiem o działaniu immunosupresyjnym i ma zastosowaniu w zapobieganiu odrzucania przeszczepów narządów. Zaprezentowano nowe pochodne MPA, które posiadają przyłączony do grupy karboksylowej fragment aminokwasowy. Celem tych badań jest określenie wpływu konfiguracji na chiralnym atomie węgla oraz podstawnika w reszcie aminokwasowej na aktywność immunosupresyjną.
-
AEGIS — demonstrator technologii C-IED
PublicationW artykule przedstawiono budowę i działanie opracowanego na Politechnice Gdańskiej demonstratora technologicznego systemu AEGIS, przeznaczonego do przeciwdziałania atakom z wykorzystaniem prowizorycznych urządzeń wybuchowych detonowanych drogą radiową (RCIED — Radio Controlled Improvised Explosive Devices). Przedstawiono zaimplementowaną oryginalną metodę generowania sygnału zagłuszającego o dowolnie ukształtowanym widmie częstotliwościowym,...
-
AEGIS - demonstrator technologii C-IED
PublicationW referacie przedstawiono budowę i działanie opracowanego w Politechnice Gdańskiej demonstratora technologicznego systemu AEGIS, przeznaczonego do przeciwdziałania atakom z wykorzystaniem prowizorycznych urządzeń wybuchowych detonowanych drogą radiową (RCIED - Radio Controlled Improvised Explosive Devices). Przedstawiono zaimplementowaną oryginalną metodę generowania sygnału zagłuszającego o dowolnie ukształtowanym widmie częstotliwościowym,...
-
On performance of MAC-c/sh in UMTS.
PublicationPrzeanalizowano efektywność działania warstwy MAC-c/sh w warstwie drugiej stosu protokołów radiowych systemu UMTS. Omówiono wpływ parametrów stosu oraz rodzaju używanych algorytmów na działanie MAC-c/sh.Zaproponowano efektywny algorytm zarządzania kolejkami priorytetowymi, oparty na dyscyplinie kolejkowej WRR, przy multipleksowaniu ruchu na kanale transportowym FACH. Przedstawiono również nowy algorytm sterowania natężeniem ruchu...
-
Amplification of c-myc gene and overexpression of c-Myc protein in breast cancer and adjacent non-neoplastic tissue
Publication -
Electrochemical simulation of metabolic reduction and conjugation reactions of unsymmetrical bisacridine antitumor agents, C-2028 and C-2053
PublicationElectrochemistry (EC) coupled with analysis techniques such as liquid chromatography (LC) and mass spectrometry (MS) has been developed as a powerful tool for drug metabolism simulation. The application of EC in metabolic studies is particularly favourable due to the low matrix contribution compared to in vitro or in vivo biological models. In this paper, the EC(/LC)/MS system was applied to simulate phase I metabolism of the representative...
-
Synthesis of compounds with C-P-P and C=P-P bond systems based on the phospha-Wittig reaction
PublicationA reactivity study of a β-diketiminate titanium(III) phosphanylphosphido complex [MeNacNacTi(Cl){η2-P(SiMe3)-PtBu2}] (1) towards ketones such as benzophenone, 9-fluorenone, acetophenone, cyclopentanone, cyclohexanone and cycloheptanone is reported. The reactions of 1 with aromatic ketones (without α-protons) directly lead to the Ti(III) complex [MeNacNacTi(μ2-Cl)(OSiMe3)] (5) as well as Ti(IV) complexes with the pinacol condensation...
-
PCA based Fault Tolerant MPC
PublicationThis chapter presents a Fault Tolerant - Model Predictive Control (FT-MPC) schemes for sensor faults accommodation. A Fault Detection and Isolation (FDI) Unit, which is an integral part of FT-MPC system, is based on the Principal Component Analysis (PCA) method. Introduced approach enables efficient bias and drift faults accommodation in single, as well as simultaneous faults case. Simple simulation exercise is presented.Rozdział...
-
Barometr MEMS Freescale MPL115A1 SPI
PublicationW artykule przedstawiono sposób komunikacji z czujnikiem Freescale MPL115A1 (wersja SPI) wykonanym w technologii MEMS oraz konwersji otrzymywanych z niego danych.
-
Registration and normalization of MRI/PET images
PublicationW artykule przedstawiono technikę rejestracji i normalizacji obrazów MRI/PET. Zawiera on porównanie sztywnej i elastycznej transformacji gemotrycznej. Porownano w nim rowniez manualne i proponowane automatyczne podejscie do problemu rejestracji i normalizacji obrazow.
-
Zastosowanie bajtowo adresowanej pamięci NVRAM do zwiększenia wydajności wybranych aplikacji równoległych wykorzystujących MPI I/O
PublicationObecnie wiele badań podejmuje temat rosnącego problemu wydajności operacji na plikach w środowiskach klastrowych. Jednocześnie, według ostatnich doniesień związanych z rozwojem technologii pamięci komputerowych, w najbliższej przyszłości na rynku powinny pojawić się układy trwałej pamięci o dostępie swobodnym, adresowanej bajtowo. Niniejsza rozprawa pokazuje, że przy użyciu takiej pamięci można zwiększyć wydajność wybranych...
-
EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL C
Journals -
Modelling, Measurement and Control C
Journals -
Progress In Electromagnetics Research C
Journals -
Advances in Modeling and Analysis C
Journals -
C-Journal of Carbon Research
Journals -
POLYMER SCIENCE SERIES C
Journals -
Cytochrome P450 izoenzymes involved in metabolism of antitumor 9-amino-1-nitroacridine derivatives, C-857, C-1748
PublicationPraca jest częścią szerszych badań zmierzających do poznania molekularnego mechanizmu metabolicznej transformacji przeciwnowotworowych pochodnych 9-amino-1-nitroakrydyny. W naszym zespole wyselekcjonowano pochodną nowej generacji, która w porównaniu z poprzednimi wykazała znacznie obniżoną toksyczność ogólną. W wyniku przeprowadzonych badań wykazaliśmy, że nowa pochodna jest znacznie mniej podatna na metabolizm katalizowany przez...
-
Diamond-Phase (Sp3-C) Rich Boron-Doped Carbon Nanowalls (Sp2-C): A Physico-Chemical And Electrochemical Properties
PublicationThe growth of B-CNW with different boron doping levels controlled by the [B]/[C] ratio in plasma, and the influence of boron on the obtained material’s structure, surface morphology, electrical properties and electrochemical parameters, such as -ΔE and k°, were investigated. The fabricated boron-doped carbon nanowalls exhibit activity towards ferricyanide redox couple, reaching the peak separation value of only 85 mV. The flatband...
-
Study of oxygen electrode reactions on symmetrical porous SrTi0.30Fe0.70O3-δ electrodes on Ce0.8Gd0.2O1.9 electrolyte at 800 °C–500 °C
PublicationIron doped strontium titanates (SrTi1-xFexO3-δ) are an interesting mixed ionic-electronic conductor model used to study basic oxygen reduction/oxidation reactions. In this work, we performed an impedance spectroscopy study on symmetrical porous SrTi0.30Fe0.70O3-δ (STF70) electrodes on a ceriabased electrolyte. The sample was measured in varying oxygen concentration: from 0.3% to 100% in 800 °C - 500 °C temperature range. Low polarisation...
-
Acta Crystallographica Section C-Structural Chemistry
Journals -
Modifications at the C(5) position of pyrimidine nucleosides
PublicationThis review summarizes the state of knowledge on the chemical methods of C(5)-modifications of uridine and cytidine derivatives and may serve as a useful tool for synthetic chemists to choose an appropriate reaction protocol. The synthesis of 5-substituted uracil derivatives is gaining an increasing interest because of their possible applications in medicine and pharmacy. Modifications at the C(5) position of pyrimidine nucleosides...