Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 5159
wybranych: 464
-
Katalog
- Publikacje 464 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 5 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 2 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 3910 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 6 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 1 wyników po odfiltrowaniu
- Aparatura Badawcza 1 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 574 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 146 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 49 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
Wyniki wyszukiwania dla: DR-PCR/RFLP
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublikacjaW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera
PublikacjaFungi of the Scopulariopsis genus, commonly found in the environment, are opportunistic pathogens that can cause various types of human infections. So far, no efficient molecular method has been developed for species differentiation among Scopulariopsis and related genera. In order to advance this field, we have evaluated performance of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays, based...
-
Różnicowanie C. albicans i C. dubliniensis w oparciu o polimorfizm genu syntazy homocytrynianowej z wykorzystaniem metody PCR RFLP
PublikacjaNajczęstszym czynnikiem etiologicznym zakażeń wywołanych przez drożdżaki z rodzaju Candida jest C. albicans. Gatunek ten posiada bardzo zbliżone cechy fenotypowe do C. dubliniensis co często wiąże się z błędną identyfikacją. Skutkuje to wtórnym zakażeniem wywołanym przez współwystepujący gatunek C. dubliniensis, który nabywa oporność na flikonazol stosowany w terapii C. albicans. Celem badań była konstrukcja układu diagnostycznego...
-
Novel application of terminal restriction fragments length polymorphism method (t-RFLP) for identification of six clinically important Candida sp.
PublikacjaTerminal restriction fragments length polymorphism method (t-RFLP) is a modified classical RFLP method. The main difference is based on carrying out PCR using a fluorescently labeled primer or primers. The result of such modification is that after digestion of amplicons only terminal fragments of PCR product (containing fluorescent dye) are visualized. T-RFLP method has found application in environmental microbiology and epidemiology....
-
Identification of anisakid nematodes from the Southern Baltic Sea usingPCR-based methods
PublikacjaZaproponowano metodę identyfikacji nicieni gatunków Anisakis, Hysterothyla-cium, Contracaecum przy użyciu techniki PCR/RFLP.
-
Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences
PublikacjaZaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...
-
Fatal sepsis in a pregnant woman with pyelonephritis caused by Escherichia coli bearing Dr and P adhesins: diagnosis based on postmortem strain genotyping
PublikacjaW pracy został opisany pierwszy śmiertelny przypadek młodej kobiety w ciąży z powodu przewlekłego zapalenia odmiedniczkowego nerek spowodowany przez szczepy E. coli z fimbriami typu Dr + i P. Badania pośmiertne wykazały, że śmierć nastąpiła z powodu posocznicy do której doszło na skutek zakażenia szczepami E. coli Dr + . Odmiedniczkowe zapalenie nerek w ciąży jest związane z wieloma powikłaniami, w tym ograniczeniem wzrostu płodu,...
-
Emerging linezolid-resistant, vancomycin resistant Enterococcus faecium from a patient of a haematological unit in Poland.
PublikacjaOksazolidynowy antybiotyk, linezolid, jest stosowany w terapii infekcji powodowanych przez różne Gram-dodatnie bakterie, włączając w to vankomycyno-oporne enterokoki (VRE). Praca pokazuje po raz pierwszy w Polsce izolację szczepu Enterococcus faecium (LRVREF)opornego na linezolid oraz vankomycynę. Stosując techniki PCR-RFLP regionu rDNA i allelo specyficzny PCR domeny V regionu 23S rDNA wykazano obecność mutacji G2576U, identyfikowanej...
-
New Approaches for Escherichia coli Genotyping
PublikacjaEasy-to-perform, fast, and inexpensive methods of differentiation of Escherichia coli strains beyond the species level are highly required. Herein two new, original tools for genotyping of E. coli isolates are proposed. The first of the developed method, a PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism) test uses a highly variable fliC gene, encoding the H antigen as a molecular target. The designing...
-
Molecular identification and genotyping of Staphylococci: genus, species, strains, colnes, lineages, and interspecies exchanges
PublikacjaStaphylococci are increasingly recognized as etiological agents of many opportunistic human and animal infections, emphasizing the need for a rapid and accurate identification, even to a genotypical level of these bacteria. In the recent years, there has been a significant progress in typing and phylogenetic study of Staphylococcus species. Here, we describe molecular methods used in taxonomy as well as staphylococci characterization....
-
Genetic predisposition to inflammatory bowel disease
PublikacjaInflammatory bowel disease (IBD) is a chronic, incurable inflammatory disease of the digestive system. The two main disease entities included in the IBD are ulcerative colitis and Crohn's disease. According to epidemiological studies there are more and more new cases every year. In especially among the youngest patients with symptoms of malnutrition and growth inhibition to land up in hospitalwith cancer suspected. The purpose...
-
Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital
PublikacjaZakażenia układu moczowego (UTIs - ang. urinary track infections) są jedną z najczęstszy infekcji, za które w 85% przypadków odpowiedzialne są bakterie Escherichia coli. Infekcje układu moczowego mogą prowadzić do groźnych powikłań m. in. odmiedniczkowego zapalenia nerek. Śmiertelność wśród tej grupy pacjentów wynosi 1-3%. Zakażenia układu moczowego występują również u ok. 7% kobiet ciężarnych. W pracy przebadano 82 szczepy E....
-
Fungal Typin Methods
PublikacjaThe broad application of the molecular techniques in mycoses diagnosis is related to increase of infections caused by fungi in many countries. The oldest typing methods relaying on fenotypic observation, physiological and biochemical examination have had very limited importance from decades. Novadays, the molecular biology methods took their place. Most of the genotyping methods have been devoleped to be applied for typing of bacteria...
-
Novel staphylococci nucH taxonomical marker used in identification of human-associated Staphylococcus succinus subsp. casei
PublikacjaThe aim of our study was to assess the sequencing of unique nucH gene fragment based on performed bioinformatics analysis as a novel diagnostic method for the identification of difficult to identify staphylococcal human pathogenic strains. Initially, PCR-RFLP-rrn analysis specific to the spacers between 16SrDNA and 23SrDNA followed by HhaI restriction analysis was performed. Further, sequencing of nucH and 16S rDNA genes fragments...
-
Rozdział 5. Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń grzybiczych wywoływanych przez dermatofity = Novel diagnostic methods of funfal infections caused by dermatophytes
PublikacjaDermatofity są głównym czynnikiem etiologicznym grzybic powierzchownych. Do tej klasy grzybów należą przedstawiciele trzech rodzajów: Epidermophyton, Microsporum i Trichophyton. Klasyczne metody diagnostyczne polegają na bezpośredniej ocenie mikroskopowej oraz badaniu hodowlanym. Identyfikacja gatunkowa jest możliwa na podstawie cech makroskopowych kolonii: ich struktury, koloru, kształtu, oraz obserwacji mikroskopowych (kształt...
-
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
PublikacjaBadano przydatność techniki PCR MP w efektywnym typowaniu szczepów w badaniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych. Technika oparta jest na użyciu niskiej temperatury denaturacji podczas LM PCR. Badaniu zostały poddane izolaty Escherichia coli pochodzące od pacjentów Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że technika jest szybka, o wysokim potencjale różnicującym i bardzo dobrej powtarzalności i może być zastosowana w badaniach...
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublikacjaTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublikacjaTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
DAF - and collagen-binding properties of chimeric Dr fimbriae
PublikacjaEkspozycja białek heterologicznych na powierzchni mikroorganizmów jest jedną z nowych strategii stosowanych w mikrobiologii, biotechnologii oraz projektowaniu nowoczesnych szczepionek. W niniejszej pracy zbadano możliwość wykorzystania białka podjednostkowego DraE fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jako nośnika heterologicznych sekwencji. W rejon odpowiadający N-terminalnej domenie 2 białka DraE wprowadzono epitopową...
-
ADSRRS-fingerprinting and PCR MP techniques for studies of intraspecies genetic relatedness in Staphylococcus aureus
PublikacjaW pracy pokazano użyteczność dwóch nowych metod do typowania molekularnego Staphylococcus aureus, ADSRRS-fingerprinting (Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites) i PCR MP (PCR melting profile). Przebadano 37 szczepów Staphylococcus aureus izolowanych od pacjentów z czyracznością. Jako metodę referencyjną zastosowano REA-PFGE. Okazało się, że izolaty Staphylococcus aureus z nosa od niektórych pacjentów...
-
Toxoplasma gondii: Chimeric Dr fimbriae as a recombinant vaccine against toxoplasmosis
PublikacjaW publikacji przedstawiono protekcyjne i immunogenne właściowści chimerycznych fimbrii typu Dr zawierających sekwencje epitopowe antygenów SAG1, MAG1 oraz GRA1 Toxoplasma gondii. Uzyskane wyniki porównano z właściwościami immunogennymi antygenowych białek rekombinantowych oraz poliwalentnego antygenu natywnego. Antygeny rekombinantowe indukują silną odpowiedź immunologiczną i w 89% zapobiegają formowaniu się cyst w mózgu myszy....
-
PCR-ELISA: inexpensive alternative to quantitative PCR
PublikacjaPCR-ELISA (polymerase chain reaction-enzyme linked immunosorbent assay), a combination of PCR and ELISA methods, has been used since late 1980s. The technique is based on specially labelled DNA fragments which are captured by specific DNA sequences and detected by antibodies. The whole procedure of PCR-ELISA is divided into three steps: DNA extraction, PCR reaction and detection by ELISA. The method has been found as very specific...
-
Importance of biofilm formation by uropathogenic E. coli Dr+ strains in urinary tract infections
PublikacjaImportance of biofilm formation by uropathogenic E. coli Dr+ strains in urinary tract infections
-
A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins
PublikacjaPraca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...
-
Specific detection of Alternaria alternata by PCR and real-time PCR
PublikacjaFungi of Alternaria genus are cosmopolitan organisms, which spores can be found in the air, soil, water, clothing and food. They commonly occur as saprotrophs on the plant remains, contributing to the decomposition of organic matter. Additionally, they are components of the normal human and animal skin flora. Alternaria spp. are also known human allergens, causing hay fever and allergic reactions that can lead to the development...
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublikacjaWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
PCR melting profile (PCR MP) - a new tool for differentiation of Candida albicans strains
PublikacjaPo raz pierwszy przedstawiliśmy użyteczność techniki PCR MP opartej na metodzie ligacji adaptorów (LM PCR) i obniżonej temperaturze denaturacji w cyklach PCR do wewnątrzgatunkowego różnicowania szczepów Candida albicans. Przebadaliśmy 123 szczepy Candida albicans z zastosowaniem trzech metod genotypowania: PCR MP, REA-PFGE i RAPD i uzyskaliśmy odpowiednio 27, 26 i 25 unikalnych genotypów. Zaprezentowane dane pokazały, że technika...
-
Technika PCR MP (PCR Melting Profile) - możliwości zastosowania w badaniach epidemiologicznych
PublikacjaUżyteczność PCR MP (ang. PCR Melting Profile), stosunkowo nowej techniki różnicowania genetycznego szczepów mikroorganizmów, pokazano na przykładach badań epidemiologicznych, dotyczących wykrywania zakażeń szpitalnych, analizy sytuacji epidemiologicznej i identyfikacji transmisji bakteryjnej u poszczególnych pacjentów. Technikę PCR MP charakteryzuje prostota, niskie koszty wykonania oraz potencjał różnicujący porównywalny do metody...
-
PCR and real-time PCR assays to detect fungi of Alternaria alternata species
PublikacjaFungi of the Alternaria genus are mostly associated with allergic diseases. However, with a growing number of immunocompromised patients, these fungi, with A. alternata being the most prevalent one, are increasingly recognized as etiological agents of infections (phaeohyphomycoses) in humans. Nowadays, identification of Alternaria spp. requires their pure culture and is solely based on morphological criteria. Clinically, Alternaria...
-
PCR Melting Profile method for genotyping analysis of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from Hematological Unit patients
PublikacjaW ostatnich latach znacząco wzrasta liczba szczepów Enterococcus opornych na wankomycynę. Stwarzają one problemy medyczne u pacjentów skolonizowanych czy zainfekowanych tymi drobnoustrojami. W przedstawionych badaniach, określiliśmy genetyczne podobieństwo pomiędzy izolatami E. faecium VRE, pozyskiwanymi w okresie od kwietnia 2003 do kwietnia 2005 od pojedynczych pacjentów oddziału Hematologicznego Specjalistycznego Publicznego...
-
Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting
PublikacjaPCR has become an essential tool in biological science. However, researchers often encounter problems with difficult targets, inhibitors accompanying the samples, or PCR trouble related to DNA polymerase. Therefore, PCR optimization is necessary to obtain better results. One solution is using modified DNA polymerases with desirable properties for the experiments. In this article, PCR troubleshooting, depending on the DNA polymerase...
-
DDLMS PCR double digestion Ligation Mediated Suppression PCR - a new technique for bacterial specific differentiation
PublikacjaA new diagnostic kit for K. oxytoca specific differentiation based on ddLMS PCR (ang. double digest ligation Mediated PCR) technique is shown. As a species-specific DNA fragment pehX gene, encoding the enzyme polygalactouronase, was chosen. The genome sequence of K. oxytoca is digested with two endonucleases: AclI and BclI which cut DNA before and after pehX gene. The polymorphic DNA fragments are ligated with AclI-end-specific...
-
Optimized 5-hour multiplex PCR test for the detection of tinea unguium: performance in a routine PCR laboratory
PublikacjaWe recently reported the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of tinea unguium and the optimization of this test by the inclusion of an inhibition control. Here we report the performance of this procedure as used in a routine clinical laboratory as compared to conventional microscopy and culture-based techniques performed in a mycology reference laboratory. We found in processing 109 samples that 22 (20.2%)...
-
PCR test for Microsporum canis identification
PublikacjaMicrosporum canis, for which the natural hosts are cats and dogs, is the most prevalent zoophilic agent causing tinea capitis and tinea corporis in humans. We present here a diagnostic PCR test for M. canis, since its detection and species identification is relevant to the choice of treatment and to the understanding of a probable source of infection. An M. canis-specific PCR was evaluated using 130 clinical isolates of dermatophytes...
-
Optimised five-hour multiplex PCR test for the detection of Tinea ungium: performance in a routine PCR laboratory
PublikacjaWe recently published the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of dermatophyte nail infection. We have optimized this test by inclusion of an inhibition control and evaluated the test in a routine laboratory when compared to the conventional microscopy and culture. A total of 109 clinical samples received at the mycology reference lab at Statens Serum Institute were included. The samples were divided equally...
-
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganisms Based on the Use of a Class IIS Restriction Enzyme and Ligation Mediated PCR
PublikacjaThis study details and examines a novel Ligation-Mediated - Polymerase Chain Reaction (LM-PCR) method. Named the LM-PCR/Shifter, it relies on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base, 5' overhangs, this being the Shifter, and the ligation of appropriate oligonucleotide adapters. A sequence of 4-base, 5' overhangs of the adapter and a 4-base sequence of the 3' end of the primer(s)...
-
PCR and real-time PCR approaches to the identification of Arthroderma otae species Microsporum canis and Microsporum audouinii/Microsporum ferrugineum
PublikacjaObjectives The identification of species in the Arthroderma otae complex is essential to determine the origin of infection and to eliminate the risk of transmission. Microsporum canis is a zoophilic species, whereas Microsporum audouinii and Microsporum ferrugineum are anthropophilic species. In this paper, we propose alternative methods that permit species-specific identification of both anthropophilic and zoophilic members of...
-
A comparative evaluation of PCR ribotyping and ERIC PCR for determining the diversity of clinical Pseudomonas aeruginosa isolates
PublikacjaW pracy porównano dwie metody stosowane do badania różnorodności genetycznej drobnoustrojów. Modelem do badań była grupa 62 klinicznych izolatów bakterii P. aeruginosa. Zdecydowanie wyższy potencjał różnicujący stwierdzono w przypadku metody ERIC PCR, której zastosowanie pozwoliło na wyodrębnienie 36 różnych genotypów. W przypadku rybotypowania wyróżniono tylko 9 genotypów.
-
PCR detection of Scopulariopsis brevicaulis
PublikacjaScopulariopsis brevicaulis is known as a most common etiological factor of the mould toenail infections. There are also reports indicating that S. brevicaulis could cause organ and disseminated infections. Nowadays microscopic observations from the direct sample and culture are crucial for the appropriate recognition of the infection. In this paper is presented a PCR-based method for S. brevicaulis detection. The specificity of...
-
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganism
PublikacjaTechniques relies on the ligation of appropriates adapters (LM-PCR) as AFLP, PCR MP and ADSRRS are successfully used for epidemiological studies for prokaryotic and eukaryotic microorganisms. In this study we propose a new method, called the LM-PCR/Shifter, based on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base 5' overhangs (Shifter) and the ligation of appropriate oligonucleotide...
-
Diagnostic PCR assay for Microsporum and Trichophyton infections
PublikacjaWe have previously described a highly sensitive 5-hour PCR test for the rapid diagnosis of onychomycosis which detects any dermatophyte and species-identify T. rubrum from patient specimens. We have subsequently developed and evaluated new PCR tests for detection of Trichophyton and Microsporum canis/audouinii infections.58 dermatophyte isolates (21) Microsporum spp. (4 different species), 35 Trichophyton spp (10 different species)...
-
Ligation Mediated PCR methods, their possibilities and limitations
PublikacjaThe application of molecular diagnostics for bacterial strain typing or identifying bacteria at the strain level is of particular importance at present. However, among the many genotyping methods that are currently available, no single one is universally ideal. In this article, we thus review the Ligation Mediated PCR group methods as prospects from which to choose. We discuss different strategies for selecting the amplified PCR...
-
Real-Time PCR: molecular technique of many applications
PublikacjaReal-Time PCR is a sensitive DNA amplification technique initially applied in genetics and molecular biology. It enables in vivo copying of the selected DNA fragment (flanked by two primers) by the thermostable polymerase (in the presence of magnesium ions and deoxynucleotide triphosphates) and simultaneous measurement of the fluorescence. For one or more specific sequences in a DNA sample, real-time PCR enables both detection...
-
The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains
PublikacjaBiogeneza fimbrii Dr kodowanych przez operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli (infekcje górnych dróg moczowych) odbywa się na bazie zakonserwowanego systemu sekrecji typu chaperone-usher. Funkcjonowanie powyższego systemu sekrecji opiera się na dwóch komponentach białkowych, periplazmatycznym chaperonie DraB i zewnątrzbłonowym kanale DraC. Białko DraB kontroluje proces składania podjednostek fimbrialnych DraE, natomiast...
-
Detection of sulfonamide resistance genes via in situ PCR-FISH
PublikacjaDue to the rising use of antibiotics and as a consequence of their concentration in the environment an increasing number of antibiotic resistant bacteria is observed. The phenomenon has a hazardous impact on human and animal life. Sulfamethoxazole is one of the sulfonamides commonly detected in surface waters and soil. The aim of the study was to detect sulfamethoxazole resistance genes in activated sludge biocenosis by use of...
-
Biofilm bakteryjny uropatogennych szczepów E. coli Dr+ jako czynnik indukujący przewlekłość zakażeń dróg moczowych ograniczający ich leczenie
PublikacjaZakażenia dróg moczowych (ZUM) stanowią jedne z najczęściej występujących infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku miliony osób na świecie. Problematyka tych zakażeń wynika z ich przewlekłości i nawrotów, pomimo stosowania terapii antybiotykowej oraz ciągle wzrastającej lekooporności uropatogenów je wywołujących. Dominującym czynnikiem etiologicznym ZUM są uropatogenne szczepy E. coli (UPECs), wykazujące zdolność do adhezji,...
-
A simple modification of PCR thermal profile applied to evade persisting contamination
PublikacjaThe polymerase chain reaction (PCR), one of the most commonly applied methods of diagnostics and molecular biology has a frustrating downside known as the false positive signal or contamination. Several solutions to avoid and to eliminate PCR contaminations have been worked out to date but the implementation of these solutions to laboratory practice may be laborious and time consuming. A simple approach to circumvent the problem...
-
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublikacjaA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
Diagnostic PCR tests for Microsporum audouinii, M. canis and Trichophyton infections
PublikacjaSince traditional diagnosis of dermatophyte infections is slow, we present a rapid new pcr test for detection of trichophyton spp., microsporum canis and m. audouinii infections. the performance of the test was evaluated with: 58 dermatophyte isolates; 10 yeast, mould and human dna control samples; 25 routine specimens from patients suspected of having dermatophytosis; 10 hair specimens from guinea pigs experimentally infected...
-
Modyfikacje polimeraz DNA jako rozwiązania problemów w reakcjach PCR
PublikacjaReakcja PCR już od wielu lat jest podstawowym narzędziem stosowanym w biotechnologii molekularnej. Nadal napotykamy jednak liczne problemy podczas jej przeprowadzania związane z trudnymi matrycami, obecnością inhibitorów itp. Optymalizacja reakcji PCR jest więc niezbędna w celu poprawy wyników. Jednym z rozwiązań tych problemów może być modyfikowanie polimeraz DNA. W powyższym artykule opisano problemy i rozwiązania zależne polimerazy...