Filtry
wszystkich: 1144
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: protein-ligand binding
-
Modulation of immune response to Toxoplasma gondii in sheep by immunization with a DNA vaccine encoding ROP1 antigen as a fusion protein with ovine CD154
Publikacja -
Effect of protein-xanthophylls (PX) concentrate of alfalfa supplementation on physico-chemical properties of turkey breast and thigh muscles during ageing
Publikacja -
Nanostructured polyethersulfone nanocomposite membranes for dual protein and dye separation: Lower antifouling with lanthanum (III) vanadate nanosheets as a novel nanofiller
Publikacja -
Interplay between Structure and Charge as a Key to Allosteric Modulation of Human 20S Proteasome by the Basic Fragment of HIV-1 Tat Protein
Publikacja -
Use of Restraints from Consensus Fragments of Multiple Server Models To Enhance Protein-Structure Prediction Capability of the UNRES Force Field
Publikacja -
Protein structure prediction with the UNRES force-field using Replica-Exchange Monte Carlo-with-Minimization; Comparison with MCM, CSA, and CFMC
Publikacja -
Physics-based protein-structure prediction using a hierarchical protocol based on the UNRES force field: Assessment in two blind tests
Publikacja -
Structural elucidation of transmembrane transporter protein bilitranslocase: Conformational analysis of the second transmembrane region TM2 by molecular dynamics and NMR spectroscopy
Publikacja -
Molecular typing of Staphylococcus aureus isolated from cows with mastitis in the east of Poland on the basis of polymorphism of genes coding protein A and coagulase
PublikacjaPolimorfizm genów kodujących białko A i koagulazę wykorzystano do badania zmienności genetycznej bakterii Staphylococcus aureus wyizolowanych z gruczołów mlekowych krów u których stwierdzono stan zapalny. W badanej grupie 82 szczepów wyróżniono 24 genotypy.
-
Diverse behavioral, monoaminergic and Fos protein responses to opioids in Warsaw high-alcohol preferring and Warsaw low-alcohol preferring rats
Publikacja -
Changes in Gene and Protein Expression of Metalloproteinase-2 and -9 and Their Inhibitors TIMP2 and TIMP3 in Different Parts of Fluoride-Exposed Rat Brain
Publikacja -
Characteristics of hydration water around hen egg lysozyme as the protein model in aqueous solution. FTIR spectroscopy and molecular dynamics simulation
PublikacjaW niniejszej pracy przedstawiono wyniki badań dotyczące hydratacji białka modelowego - lizozymu z jaja kurzego w roztworze wodnym. Wiodącą techniką stosowaną w badaniach była spektroskopia oscylacyjna FTIR z zastosowaniem techniki rozcieńczenia izotopowego wody półciężkiej HDO w roztworze wody zwykłej. Analiza widma HDO przy pomocy "metody widm zaburzonych" pozwoliła na wyizolowanie widma wody zaburzonej przez lizozym, a tym samym...
-
Modulation of immune response to Toxoplasma gondii in sheep by immunization with a DNA vaccine encoding ROP1 antigen as a fusion protein with ovine CD154
PublikacjaNiniejszy artykuł prezentuje porównanie skuteczności działania w immunizacji owiec dwóch antytoksoplazmozowych szczepionek DNA: kodującej białko ROP1 Toxoplasma gondii oraz kodującej w/w antygen i owczą cząsteczkę CD154 lokalizowaną na powierzchni aktywowanych komórek T. Otrzymane wyniki badań pokazały, iż domięśniowe podanie szczepionki DNA zawierającej gen kodujący ROP1 i CD154 znacząco wzmacnia odpowiedź immunologiczną szczepionych...
-
C-Reactive Protein and White Blood Cell Count in Non-Infective Acute Ischemic Stroke Patients Treated with Intravenous Thrombolysis
Publikacja -
Correlation between the Reactivity and Spectroscopic Properties of N-Substituted Secondary Thioamides. New Intramolecular N• •H+• •N Binding Approach and Proton Complexes Based on Thioamide Ligation
PublikacjaFrom a comparison of chem. shifts and wavenumbers of several secondary thioamides and amides having monocationic substituents attached to thiocarbamoyl or carbamoyl groups by a polymethylene chain, new intramol. unconventional N···H+···N H bonding effects were discovered. It is argued that the CH2-N rotation is hindered and two +H···NHMe nonequiv. protons occur in a proton spectrum of hydrochloride RCH2C(S)NH(CH2)3NHMe-HCl...
-
Investigation of mechanism of desmopressin binding in vasopressin V2 receptor versus vasopressin V1a and oxytocin receptors: Molecular dynamics simulation of the agonist-bound state in the membrane–aqueous system
Publikacja -
Biotransformation of Modified Benzylisoquinoline Alkaloids: Boldine and Berberine and In Silico Molecular Docking Studies of Metabolites on Telomerase and Human Protein Tyrosine Phosphatase 1B
Publikacja -
Determination of BRAF V600E (VE1) protein expression and BRAF gene mutation status in codon 600 in borderline and low-grade ovarian cancers
Publikacja -
Discovery and characterization of RecA protein of thermophilic bacterium Thermus thermophilus MAT72 phage Tt72 that increases specificity of a PCR-based DNA amplification
Publikacja -
New plasma preparation approach to enrich metabolome coverage in untargeted metabolomics: plasma protein bound hydrophobic metabolite release with proteinase K
Publikacja -
Expression of Estrogen Receptor Coactivator Proline-, Glutamic Acid- and Leucine-Rich Protein 1 within Paraspinal Muscles in Adolescents with Idiopathic Scoliosis
Publikacja -
Investigation of the Effects of Primary Structure Modifications within the RRE Motif on the Conformation of Synthetic Bovine Herpesvirus 1‐Encoded UL49.5 Protein Fragments
Publikacja -
Optimization of the UNRES Force Field by Hierarchical Design of the Potential-Energy Landscape. 1. Tests of the Approach Using Simple Lattice Protein Models
Publikacja -
Prediction of protein structure with the coarse-grained UNRES force field assisted by small X-ray scattering data and knowledge-based information
Publikacja -
P.0253 Two-week lithium treatment modulates translocator protein expression in brain regions in the animal models of acute bipolar episodes
Publikacja -
Morphine and methadone pre-exposures differently modify brain regional Fos protein expression and locomotor activity responses to morphine challenge in the rat
Publikacja -
Modulation of mRNA and protein levels of CYP1A1, 1A2, and 1B1 in nontumorigenic breast epithelial cells (MCF10A) by cabbage juice and its active components
PublikacjaZbadano wpływ soków z kapusty oraz występujących w nich pochodnych indolowych i sulforafanu na poziom ekspresji enzymów odpowiedzialnych za metabolizm ksenobiotyków w tym estrogenów. Wykazano, że soki z kapusty i izolowane substancje mają podobny wpływ na poziom mRNA i białek enzymatycznych.
-
Lower rim substituted tert-butylcalix[4]arenes (II). Complexing ability of5,11,17,23-tetra-tert-butyl-25,26,27,28-tetrakis-O-(piperidinylcarbonyl)me- thylenecalix[4]arene. The crystal structures of the ligand and its sodium complex
PublikacjaSyntezowano kompleksy wymienionego w tytule liganda z chlorkiem sodu i azotanami itru(III), lantanu(III), samaru(III) i gadolinu(III) w reakcji liganda i odpowiedniej soli, które charakteryzowano za pomocą widm IR, UV-vis,1H NMR, FAB-MS, a także za pomocą analizy elementarnej. W reakcji wymiany z kompleksu z sodem otrzymywano kompleksy z lantanowcami. Określono strukturę krystaliczną wolnego liganda i jego kompleksu z sodem za...
-
Application of Alanine Scanning to Determination of Amino Acids Essential for Peptide Adsorption at the Solid/Solution Interface and Binding to the Receptor: Surface-Enhanced Raman/Infrared Spectroscopy versus Bioactivity Assays
Publikacja -
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublikacjaTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Ultrasound assisted synthesis of 3-alkynyl substituted 2-chloroquinoxaline derivatives: their in silico assessment as potential ligands for N-protein of SARS-CoV-2
Publikacja -
Physics-Based Potentials for the Coupling between Backbone- and Side-Chain-Local Conformational States in the United Residue (UNRES) Force Field for Protein Simulations
Publikacja -
Parametrization of Backbone−Electrostatic and Multibody Contributions to the UNRES Force Field for Protein-Structure Prediction from Ab Initio Energy Surfaces of Model Systems
Publikacja -
Pro-apoptotic action of protein-carbohydrate fraction isolated from coelomic fluid of the earthworm Dendrobaena veneta against human colon adenocarcinoma cells
Publikacja -
Funkcjonalne właściwości preparatu białek mięśniowych z kręgosłupów dorsza bałtyckiego = Functional properties of a muscle protein preparation from Baltic cod spine
Publikacja -
Prime-Boost Vaccination with Toxoplasma Lysate Antigen, but Not with a Mixture of Recombinant Protein Antigens, Leads to Reduction of Brain Cyst Formation in BALB/c Mice
PublikacjaIntroduction Infection with the ubiquitous parasite Toxoplasma gondii is a threat for immunocompro- mised patients and pregnant women and effective immune-prophylaxis is still lacking. Methods Here we tested a mixture of recombinant T . gondii antigens expressed in different develop- mental stages, i.e., SAG1, MAG1 and GRA7 (SMG), and a lysate derived from T . gondii tachyzoites (TLA) for prophylactic vaccination against cyst formation....
-
Isolation of the GFA1 gene encoding glucosamine-6-phosphate synthase of Sporothrix schenckii and its expression in Saccharomyces cerevisiae
PublikacjaGlucosamine-6-phosphate synthase (GlcN-6-P synthase) is an essential enzyme involved in cell wall biogenesis that has been proposed as a strategic target for antifungal chemotherapy. Here we describe the cloning and functional characterization of Sporothrix schenckii GFA1 gene which was isolated from a genomic library of the fungus. The gene encodes a predicted protein of 708 amino acids that is homologous to GlcN-6-P synthases...
-
A Hierarchical Multiscale Approach to Protein Structure Prediction: Production of Low‐Resolution Packing Arrangements of Helices and Refinement of the Best Models with a United‐Residue Force Field
Publikacja -
Aberration of the enzymatic activity of Fhit tumor suppressor protein enhances cancer cell death upon photodynamic therapy similarly to that driven by wild-type Fhit
Publikacja -
A surface-exposed DraD protein of uropathogenic Escherichia coli bearing Dr fimbriae may be expressed and secreted independently from DraC usher and DraE adhesin
PublikacjaOperon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ odpowiedzialny jest za proces bakteryjnej adhezji i inwazji. Operon dra kodujący fimbrie Dr zawiera sześć otwartych ramek odczytu - draA, draB, draC, draD, draP oraz draE. Fimbrie Dr zlokalizowane na powierzchni komórki bakteryjnej, zbudowane są z podjednostek białka DraE. Niewiele wiadomo na temat powierzchniowej ekspresji białka DraD oraz jego roli w procesie biogenezy fimbrii...
-
Modeling of the alcohol dehydrogenase active site. Two different modes of alcohol binding in crystals of zinc and cadmium tri-tert-butoxysilanethiolates evidenced by X-ray diffraction and solid state vibrational spectroscopy
PublikacjaOpisano syntezę, struktury cząsteczkowe oraz widma FT-IR, 1H. 13C, 29Si, 113Cd NMR dziesięciu nowych, mieszanoligandowych kompleksów cynku i kadmu z ligandem tri-tert-butoksysilanotiolanowym i pochodnymi imidazolu. Za pomocą rentgenowskiej analizy strukturalnej i spektroskopii w podczerwieni udokumentowano dwa różne sposoby wiązania etanolu i metanolu w kryształach tych związków. Opisane kompleksy stanowią modele miejsca aktywnego...
-
Cu(II) complexes with peptides from FomA protein containing -His-Xaa-Yaa-Zaa-His and -His-His-motifs. ROS generation and DNA degradation
Publikacja -
Impact of selected amino acids of HP0377 (Helicobacter pylori thiol oxidoreductase) on its functioning as a CcmG (cytochrome c maturation) protein and Dsb (disulfide bond) isomerase
Publikacja -
Adolfo Poma
OsobyDr. Adolfo Poma (see my biosketch) is the group leader of the Multiscale Modelling of Complex Systems divison. In 2008, he got a MSc. degree in computational physics from the State University of Campinas (Brazil). Then he moved to Germany and under the supervision of Prof. Kurt Kremer (head of the polymer theory group, Max Planck Institute for Polymer Research) and Prof. Luigi Delle Site (Frei University of Berlin) got a PhD degree...
-
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Protein Structure and Molecular Enzymology
Czasopisma -
Anna Brillowska-Dąbrowska dr hab. inż.
OsobyAnna Brillowska-Dąbrowska, urodzona w 1971 r. w Gdańsku, ukończyła w 1996 r. studia magisterskie na kierunku Biotechnologia, na Wydziale Chemicznym PG. Stopień doktora uzyskała po ukończeniu Studium Doktoranckiego przy Wydziale Chemicznym PG w 2001 r. W 2013 r. uzyskała stopień doktora habilitowanego. W 2004 r. została zatrudniona na stanowisku naukowiec w Statens Serum Institut w Danii w Jednostce Mikologii i Parazytologii. W...
-
Implementation of Molecular Dynamics and Its Extensions with the Coarse-Grained UNRES Force Field on Massively Parallel Systems: Toward Millisecond-Scale Simulations of Protein Structure, Dynamics, and Thermodynamics
Publikacja -
Identification of X-DING-CD4, a new member of human DING protein family that is secreted by HIV-1 resistant CD4+ T cells and has anti-viral activity
Publikacja -
Effect of Manual Therapy Compared to Ibuprofen on Primary Dysmenorrhea in Young Women—Concentration Assessment of C-Reactive Protein, Vascular Endothelial Growth Factor, Prostaglandins and Sex Hormones
Publikacja -
Adam Macierzanka dr hab. inż.
Osoby2015-presentHead of Department, Associate ProfessorDepartment of Colloid and Lipid Science, Faculty of Chemistry, Gdansk University of Technology, Gdansk, Poland 2019-2020Visiting Professor, Food Science and NutritionRiddet Institute, Massey University, Palmerston North, New Zealand 2014-2015Research LeaderColloid Science, Food & Health Research ProgrammeInstitute of Food Research, Norwich, United Kingdom 2012-2014Full Professor,...