Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 19768
wybranych: 12780
-
Katalog
- Publikacje 12780 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 119 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 7 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 796 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 113 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 419 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 20 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 50 wyników po odfiltrowaniu
- Aparatura Badawcza 11 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 3180 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 645 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 1627 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: DNA MISMATCH
-
Biomedical, Artificial Intelligence, and DNA Computing Photonics Applications and Web Engineering, Wilga, May 2012
Publikacja -
ppGpp-Dependent Negative Control of DNA Replication of Shiga Toxin-Converting Bacteriophages in Escherichia coli
Publikacja -
Selective Cytostatic and Cytotoxic Anticancer Effects of Bisfunctional Agents: A Strategy for the Design of DNA Binding Agents
PublikacjaVarious agents have been synthesized and proved useful for the National Cancer Institute's anticancer testing as potential new drugs, but most agents suffer side effects from their limited selectivity against cancer cells over healthy ones. Therefore, this paper attempts to describe drugs in terms of the level of tumor cell selectivity which they possess to define the features of mols. that are essential for useful cytotoxicity....
-
Modulation of cellular response to anticancer treatment by caffeine:inhibition of cell cycle checkpoints, DNA repair and more
PublikacjaKofeina i inne metyloksantyny wywołują bardzo różne efekty fizjologiczne w organizmie człowieka. W pracy przedstawiamy, które z tych efektów mogą wpływać na skuteczność terapii przeciwnowotworowych. Kofeina może bezpośrednio wpływać na transport oraz aktywację metaboliczną cząsteczek leków do komórki, poprzez tworzenie kompleksów z lekami zawierającymi układy poliaromatyczne. Kofeina hamuje aktywność kinaz ATM/ATR co prowadzi do...
-
Bulky DNA adducts in human sperm: relationship with fertility, semen quality, smoking, and environmental factors
Publikacja -
Establishing the background level of base oxidation in human lymphocyte DNA: results of an interlaboratory validation study
Publikacja -
Critical factors for the performance of chip array-based electrical detection of DNA for analysis of pathogenic bacteria
Publikacja -
Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publikacja -
DNA methylation analysis of benign and atypical meningiomas: correlation between RUNX3 methylation and WHO grade
Publikacja -
The Degree of Global DNA Hypomethylation in Peripheral Blood Correlates with That in Matched Tumor Tissues in Several Neoplasia
Publikacja -
Prolonged Quercetin Administration Diminishes the Etoposide-Induced DNA Damage in Bone Marrow Cells of Rats
Publikacja -
Urinary Measurement of 8-OxodG, 8-OxoGua, and 5HMUra: A Noninvasive Assessment of Oxidative Damage to DNA
Publikacja -
Mass spectrometry reveals the presence of specific set of epigenetic DNA modifications in the Norway spruce genome
Publikacja -
Buserelin Acetate Reduces Mortality and DNA Defragmentation of Bovine Sperm Cells Exposed to Oxidative Stress
Publikacja -
Influence of addition of cobalamin to the extender on the post-thaw motility, viability, and DNA integrity of bovine ejaculate
Publikacja -
Serial depletion of Baltic herring since the Viking Age revealed by ancient DNA and population genomics
Publikacja -
On the Trail of the Oldest Domestic Cat in Poland. An Insight from Morphometry, Ancient DNA and Radiocarbon Dating
Publikacja -
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublikacjaW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublikacjaOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
-
Increased resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA in proximity to metallic silver particles.
PublikacjaZbadano wpływ nanocząstek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donor (pochodna kumaryny) i akceptor (Cy3) umieszczono na przeciwległych końcach DNA o strukturze podwójnej helisy i o 23 parach bazowych. W nieobecności cząstek srebra wydajność przekazywania energii w tym układzie wynosiła ok. 9%, zaś po umieszczeniu go między kwarcowymi płytkami pokrytymi filmem wysepek...
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublikacjaMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
When Neural Networks Meet Decisional DNA: A Promising New Perspective for Knowledge Representation and Sharing
PublikacjaABSTRACT In this article, we introduce a novel concept combining neural network technology and Decisional DNA for knowledge representation and sharing. Instead of using traditional machine learning and knowledge discovery methods, this approach explores the way of knowledge extraction through deep learning processes based on a domain’s past decisional events captured by Decisional DNA. We compare our approach with kNN (k-nearest...
-
DNA Methylation Changes Induced by Redox-Active Compounds—Choosing the Right PCR-Based Method
PublikacjaThe impact of catechins on the expression profile of redox-related genes in HT29 cell line has been studied recently by our group using Oxidative Stress RT2 Profiler PCR Array. Within the examined panel of 84 genes, the down-regulation of SRXN1 gene was unique among other up-regulated genes. We hypothesized that the observed down-regulation resulted from DNA methylation and have exploited this observation to choose the proper strategy...
-
Genome-wide DNA methylation profiling of the regenerative MRL/MpJ mouse and two normal strains
PublikacjaAims We aimed to identify the pivotal differences in the DNA methylation profiles between the regeneration capable MRL/MpJ mouse and reference mouse strains. Materials and Methods Global DNA methylation profiling was performed in ear pinnae, bone marrow, spleen, liver, heart from uninjured adult females of the MRL/MpJ and C57BL/6J and BALB/c. Results and conclusion A number of differentially methylated regions distinguishing between...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublikacjaTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
Publikacjanthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another...
-
Support Product Development Framework by Means of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA
PublikacjaIn this paper, we propose a framework to support product development activi-ties by utilizing Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). This idea will provide a new direction to researchers working on product development, especially designers and manufacturers. They will be working on the same platform and this will be reducing their communication gap. Once the final idea is perceived about product...
-
Emplying set of experience knowledge structure and decisional DNA to enhance industrial design: conceptual approach
PublikacjaZaprezentowano koncepcje wspomagania projektowania przemyslowego przy pomocy nowoczenego podejscia do reprezentacji wiedzy w postaci SOEKS oraz Decyzyjnego DNA
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublikacjaAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
Defining a novel domain that provides an essential contribution to site-specific interaction of Rep protein with DNA
PublikacjaAn essential feature of replication initiation proteins is their ability to bind to DNA. In this work, we describe a new domain that contributes to a replication initiator sequence-specific interaction with DNA. Applying biochemical assays and structure prediction methods coupled with DNA–protein crosslinking, mass spectrometry, and construction and analysis of mutant proteins, we identified that the replication initiator of the...
-
Sequence-dependent structural properties of B-DNA: what have we learned in 40 years?
PublikacjaThe structure of B-DNA, the physiological form of the DNA molecule, has been a central topic in biology, chemistry and physics. Far from uniform and rigid, the double helix was revealed as a flexible and structurally polymorphic molecule. Conformational changes that lead to local and global changes in the helix geometry are mediated by a complex choreography of base and backbone rearrangements affecting the ability of the B-DNA...
-
Mitochondrial DNA copy number and trimethylamine levels in the blood: New insights on cardiovascular disease biomarkers
PublikacjaAmong cardiovascular disease (CVD) biomarkers, the mitochondrial DNA copy number (mtDNAcn) is a promising candidate. A growing attention has been also dedicated to trimethylamine-N-oxide (TMAO), an oxidative derivative of the gut metabolite trimethylamine (TMA). With the aim to identify biomarkers predictive of CVD, we investigated TMA, TMAO, and mtDNAcn in a population of 389 coronary artery disease...
-
Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor
PublikacjaRolling circle amplification (RCA) of DNA can be considered as a great alternative to the gold standard polymerase chain reaction (PCR), especially during this pandemic period, where rapid, sensitive, and reliable test results for hundreds of thousands of samples are required daily. This work presents the first research to date on direct, real-time and label-free isothermal DNA amplification monitoring using a microcavity in-line...
-
Będąc dla Boga - być dla innych. O Johnie Henrym Newmanie
Publikacja -
"istota zamieszkiwania: refleksje wpasowane [bio]morficznie. DWA PARKI | DWA ŚWIATY"
PublikacjaMyśląc o zamieszkiwaniu poruszam się w nurcie filozofii przyrody. Park Schopenhauera jest punktem odniesienia dla uwolnienia refleksji dotykającej ludzkich schronień. Domy, ich postaci kompletne są celem procesu, którego etapem jest tworzenie rzeźb zaprezentowanych w otwartej przestrzeni przyrodniczo-kulturowej. W Oliwie, pośród drzew, wzdłuż Potoku Oliwskiego umieszczony został cykl rzeźb zatytułowanych „istota zamieszkiwania:...
-
Mechanism of reaction of RNA-dependent RNA polymerase from SARS-CoV-2
PublikacjaWe combine molecular dynamics, statistical mechanics, and hybrid quantum mechanics/molecular mechanics simulations to describe mechanistically the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). Our study analyzes the binding mode of both natural triphosphate substrates as well as remdesivir triphosphate (the active form of drug), which is bound preferentially over ATP by RdRp while...
-
Badania symulacyjne wpływu modulacji prądu na przebieg mocy chwilowej pobieranej przez silnik indukcyjny dla celów diagnostyki łożysk
PublikacjaW referacie przedstawiono wyniki badań symulacyjnych wpływu modulacji prądu na prze-bieg mocy chwilowej pobieranej przez silnik indukcyjny. Na prostym modelu zmiennej w czasie indukcyjności, zasymulowanym w PSpice, wyjaśniono uproszczony model zjawisk bę-dących źródłem modulacji prądu i mocy chwilowej. Następnie zaprezentowano wyniki symu-lacji uzyskanych za pomocą przygotowanego w LabVIEW programu dla celów określenia wpływu kąta...
-
Metoda określania zapotrzebowania na energię elektryczną w typowych stanach eksploatacji statków towarowych dla potrzeb wstępnego doboru elektrowni
PublikacjaPrzedstawiono metodę określania zapotrzebowania na energię elektryczną w typowych stanach eksploatacji statków towarowych, celem doboru wielkości i ilości źródeł energii elektrycznej. Metoda pozwala na określanie zapotrzebowania na energię wytypowanych grup odbiorników przy znajomości ich mocy zainstalowanych oraz współczynników wykorzystania.
-
Modelowanie wymiany wody w zbiornikach hodowlanych przy użyciu zmodyfikowanego modelu tłokowego na przykładzie basenów hodowlanych dla fok
PublikacjaNiniejszy artykuł opisuje sposób prostego modelowania wymiany wody w basenach hodowlanych fokarium Stacji Morskiej Instytutu Oceanografii Uniwersytetu Gdańskiego. W celu rozpoznania warunków wymiany wody oraz udziału stref zastoiskowych w basenach posłużono się dwiema uzupełniającymi się metodami. Były to badania traserowe z wykorzystaniem znacznika fluororescencyjnego oraz komputerowe obliczenia rozkładu linii prądu z użyciem...
-
Wykorzystanie związków powierzchniowo czynnych na etapie przygotowania próbek do analizy jako zielona alternatywa dla konwencjonalnych technik ekstrakcyjnych
PublikacjaZwiązki powierzchniowo czynne stanowią doskonałą alternatywę dla rutynowo stosowanych, zazwyczaj żmudnych i czasochłonnych, technik przygotowania próbek, do przeprowadzenia których nierzadko wykorzystuje się duże ilości odczynników chemicznych.
-
Bypass kolejowy dla wiaduktu łukowego i kratownicowego w ciągu modernizowanej linii kolejowej E59 na odcinku Wronki – Dobiegniew
PublikacjaW artykule przedstawiono realizacje bypassu kolejowego, zlokalizowanego nieopodal miejscowości Krzyż Wielkopolski w ciągu linii kolejowej E59 na skrzyżowaniu z linią kolejową 203. Wariantowa analiza kilku zaproponowanych rozwiązań wykazała, ze wykonstruowanie bypassu na czas prowadzenia prac modernizacyjnych pozwoli na utrzymanie ciągłości ruchu kolejowego, nie stworzy nadmiernych problemów podróżnym, a jednocześnie pozwoli na...
-
Conserved motifs of MutL proteins
PublikacjatThe MutL protein is best known for its function in DNA mismatch repair (MMR). However, there isevidence to suggest that MutL is not only the linker connecting the functions of MutS and MutH in MMR,but that it also participates in other repair systems, such as Very Short Patch (VSP), Base Excision (BER)and Nucleotide Excision Repair (NER). This study set out to identify the most highly conserved aminoacid sequence motifs in MutL...
-
Analiza oddziaływania planowanej inwestycji – wieży radiokomunikacyjnej dla systemów telefonii komórkowej i Internetu szerokopasmowego – na pracę obiektów radiokomunikacyjnych na terenie Portu Lotniczego Olsztyn Mazury w Szymanach
PublikacjaCelem niniejszego opracowania jest analiza (matematyczna) oddziaływania planowanej inwestycji w postaci wieży radiokomunikacyjnej dla systemów telefonii komórkowej i Internetu szerokopasmowego na pracę obiektów radiokomunikacyjnych na terenie Portu Lotniczego Olsztyn-Mazury w Szymanach.
-
Microstructure and Electrical Properties of Fe,Cu Substituted (Co,Mn)3O4 Thin Films
PublikacjaIn this work, thin films (~1000 nm) of a pure MnCo2O4 spinel together with its partially substituted derivatives (MnCo1.6Cu0.2Fe0.2O4, MnCo1.6Cu0.4O4, MnCo1.6Fe0.4O4) were prepared by spray pyrolysis and were evaluated for electrical conductivity. Doping by Cu increases the electrical conductivity, whereas doping by Fe decreases the conductivity. For Cu containing samples, rapid grain growth occurs and these samples develop cracks...
-
Genetic response to metabolic fluctuations: correlation between central carbon metabolism and DNA replication in Escherichia coli
Publikacja -
The Protective Effect of Dabigatran and Rivaroxaban on DNA Oxidative Changes in a Model of Vascular Endothelial Damage with Oxidized Cholesterol
Publikacja -
The protective effect of dabigatran and rivaroxaban on DNA oxidative changes in a model of vascular endothelial damage with oxidized cholesterol
Publikacja -
Comparison of antioxidant enzyme activities and DNA damage in chickpea (Cicer arietinum L.) genotypes exposed to vanadium
Publikacja -
Szczepionki DNA i antygeny rekombinantowe w prewencji zarażeń Toxoplasma gondii - aktualny stan badań
PublikacjaToksoplazmoza wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest jedną z najbardziej rozpowszechnionych odzwierzęcych chorób na świecie o bardzo dużym znaczeniu medycznym. Stanowi ponadto bardzo poważny problem weterynaryjny, ponieważ jest główną przyczyną strat reprodukcyjnych w hodowli zwierząt (głównie owiec). Z tego względu bardzo ważne są prace dotyczące konstrukcji i opracowania nowych, skutecznych i tanich...
-
Quantification of Radiation-Induced Single-Strand Breaks in Plasmid DNA using a TUNEL/ELISA-Based Assay
PublikacjaWprowadzono nową metodę służącą do oznaczania in vitro pojedynczych pęknięć nici DNA powstałych pod wpływem naświetlań. Porównano wyniki otrzymane z nowej metody z modelem teoretycznym. Porównano wyniki z szeroko używaną metodą elektroforezy żelowej. Pokazano, że poziom pojedynczych pęknięć powstających w niciach DNA pod wpływem promieniowania VUV jest wyższy niż zakładany na podstawie wyników otrzymywanych metodami standardowymi.