Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 25859
wybranych: 20643
-
Katalog
- Publikacje 20643 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 51 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 3 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 5 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 727 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 102 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 199 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 18 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 43 wyników po odfiltrowaniu
- Aparatura Badawcza 8 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 2035 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 667 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 1358 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: Ribosomal RNA
-
Identification of evolutionary conserved DNA sequence and corresponding S21 ribosomal protein region for diagnostic purposes of all Borrelia spirochetes
PublikacjaIt is still under investigation, whether all Borrelia sp. causing Lyme borreliosis and other diseases are already identified and properly classified as human pathogens. For this reason, it is of great importance to develop a diagnostic ELISA test that detects all Borrelia sp. The aim of this study was to identify conserved DNA and protein regions present in all currently known Borrelia sp. In experimental studies 31 available Borrelia...
-
Photodynamic therapy of cancer with liposomal photosensitizers
Publikacja -
Current status of liposomal porphyrinoid photosensitizers
Publikacja -
Ribosomal intergenic spacer analysis as a tool for monitoring methanogenic archaea changes in an anaerobic digester
PublikacjaThe applicability of a newly-designed PCR primer pair in examination of methanogenic Archaea in a digester treating plant biomass was evaluated by Ribosmal Intergenic Spacer Analysis (RISA). To find a suitable approach, three variants of RISA were tested: (1) standard, polyacrylamide gel-based, (2) automated, utilized capillary electrophoresis (GA-ARISA), and (3) automated microfluidics-based (MF-ARISA). All three techniques yielded...
-
Non-ribosomal peptides produced by Planktothrix agardhii from Siemianówka Dam Reservoir SDR (northeast Poland)
Publikacja -
Cyclosporine CsA—The Physicochemical Characterization of Liposomal and Colloidal Systems
Publikacja -
Novel primosomal protein B from Clostridium pastuerianum
PublikacjaPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pasteurianum
PublikacjaPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Functional similarities and differences among subunits of the nascent polypeptide-associated complex (NAC) of Saccharomyces cerevisiae
PublikacjaProtein factors bind ribosomes near the tunnel exit, facilitating protein trafficking and folding. In eukaryotes, the heterodimeric nascent polypeptide-associated complex (NAC) is the most abundant - equimolar to ribosomes. Saccharomyces cerevisiae has a minor β-type subunit (Nacβ2) in addition to abundant Nacβ1, and therefore two NAC heterodimers, α/β1 and α/β12. The additional beta NAC gene arose at the time of the whole genome...
-
Novel primosomal protein B from thermophilic bacterium Thermoanerobacter tengcongensis
PublikacjaWe report the identification and characterization of theprimosomal protein B (PriB) from thermophilic bacteriumThermoanerobacter tengcongensis (TtePriB). It is the largestknown bacterial PriB protein consisting 216 amino acidresidues with a calculated molecular mass of 25 kDa. Surprisingly,it is functional as monomer containing two single-stranded DNA binding domain (OB-fold) and it is thecompletely new kind structure of SSB protein....
-
Liposomal Nanoformulation as a Carrier for Curcumin and pEGCG—Study on Stability and Anticancer Potential
Publikacja -
Central nervous system prophylaxis with intrathecal liposomal cytarabine in diffuse large B‑cell lymphomas
Publikacja -
A cryptic ribosome binding site, false signals in reporter systems and avoidance of protein translation chaos
PublikacjaThe expression of reporter gene may be induced by activation of cryptic signalling sequences, as we found while constructing the mutS-lacZ fusion gene. We cloned the Escherichia coli lacZ gene encoding beta-galactosidase into a plasmid vector carrying the Thermus thermophilus mutS gene. The clones expected to produce beta-galactosidase as the C-terminal fusion were selected for the complementation of beta-galactosidase activity...
-
Diazepinoporphyrazines Containing Peripheral Styryl Substituents and Their Promising Nanomolar Photodynamic Activity against Oral Cancer Cells in Liposomal Formulations
Publikacja -
Liposomal cytarabine in the prophylaxis and treatment of CNS lymphoma: toxicity analysis in a retrospective case series study conducted at Polish Lymphoma Research Group Centers
Publikacja -
Ecotoxicological equilibria of triclosan inMicrotox, XenoScreen YES/YAS, Caco2, HEPG2 and liposomal systems are affected by the occurrence of other pharmaceutical and personal care emerging contaminants
PublikacjaContaminants of emerging concernmay be considered as any chemicals or factorswhose unintended continuous release and persistence in the environmentmay lead to any observable undesirable response of living beings. Still not much is known on reciprocal toxicological impact of given chemicals when present in binary or more complex mixtures. In thiswork, an attemptwas thus undertaken to study the impact of butylparaben,methylparaben and...
-
Comparative in vitro studies on liposomal formulations of amphotericin Band its derivative, N-methyl-N-D-fructosyl amphotericin B methyl ester (MFAME)
PublikacjaMFAME, ester metylowy N-metylo-N-D-fruktozylo amfoterycyny B jest półsyntetyczną pochodną antybiotyku przeciwgrzybowego amfoterycyny B (AMB). W przeciwieństwie do wyjściowego antybiotyku pochodna ta jest nietoksyczna dla komórek zwierzęcych oraz tworzy rozpuszczalne sole rozpuszczalne w wodzie. Przeprowadzono badania porównawcze aktywności biologicznej wolnego antybiotyku i wolnej pochodnej oraz ich preparatów liposomalnych. Stosowano...
-
Cross section calculations for electron scattering from DNA and RNA bases.
PublikacjaPoliczono różniczkowy i scałkowany przekrój czynny na rozproszenie sprężyste elektronów (w przybliżeniu atomów niezależnych) na uracylu, cytozynie, guaninie, adeninie i tyminie w zakresie energii od 50-4000 eV. W przybliżeniu modelu BEB policzono również przekroje czynne na jonizację tych molekuł.
-
Cross sections for electron scattering from selected components of DNA and RNA
PublikacjaWykorzystując metodę atomów niezależnych obliczono różniczkowe i całkowite przekroje czynne na sprężyste rozproszenie elektronów na wybranych drobinach, będących analogami składników DNA i RNA. Przekroje te obliczono w zakresie energii zderzenia od 50eV do 200 eV dla następujących drobin: C4H8O, C4H8O2, C5H10O2 oraz H3PO4. Przy użyciu metody BEB (binary-ecounter Bethe method) dla powyższych związków obliczono również przekroje...
-
Copper(i) complexes with phosphine derived from sparfloxacin. Part III: multifaceted cell death and preliminary study of liposomal formulation of selected copper(i) complexes
Publikacja -
A vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins for novel biomaterials, biomedical and industrial applications
PublikacjaA DNA fragment amplification/expression technology for the production of new generation biomaterials for scientific, industrial and biomedical applications is described. The technology enables the formation of artificial Open Reading Frames (ORFs) encoding concatemeric RNAs and proteins. It recruits the Type IIS SapI restriction endonuclease (REase) for an assembling of DNA fragments in an ordered head-to-tail-orientation. The...
-
An integrated DNA and RNA variant detector identifies a highly conserved three base exon in the MAP4K5 kinase locus
Publikacja -
Mechanism of reaction of RNA-dependent RNA polymerase from SARS-CoV-2
PublikacjaWe combine molecular dynamics, statistical mechanics, and hybrid quantum mechanics/molecular mechanics simulations to describe mechanistically the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). Our study analyzes the binding mode of both natural triphosphate substrates as well as remdesivir triphosphate (the active form of drug), which is bound preferentially over ATP by RdRp while...
-
The hypoxia‐induced changes in miRNA‐mRNA in RNA ‐induced silencing complexes and HIF ‐2 induced miRNAs in human endothelial cells
Publikacja -
Homocitrate synthase gene as a new molecular target in diagnostics of Candida spp. infections
PublikacjaNew potential molecular target which will be investigated during this research (homocitrate synthase gen) is the innovative target other than ribosomal DNA. This gene encodes enzyme present only in fungi and some Archaea what significantly increases specificity. It also reduces risk of contamination or influence of other factors (reaction with other DNA present in sample derived from bacteria or host cells) what excludes false...
-
NASBA – IZOTERMICZNA AMPLIFIKACJA RNA
PublikacjaNASBA (ang. Nucleic Acid Sequence-Based Amplification) jest skuteczną i czułą techniką izotermicznej amplifikacji opartej na transkrypcji, służąca głównie do detekcji cząsteczek RNA. Znalazła ona zastosowanie do wykrywania RNA wirusowego, bakteryjnego i grzybiczego w próbkach klinicznych oraz żywości.
-
Whole-genome sequencing and antimicrobial potential of bacteria isolated from Polish honey
PublikacjaThe aim of this study was the whole-genome analysis and assessment of the antimicrobial potential of bacterial isolates from honey harvested in one geographical location—the north of Poland. In total, 132 strains were derived from three honey samples, and the antimicrobial activity of CFAM (cell-free after-culture medium) was used as a criterion for strain selection and detailed genomic investigation. Two of the tested isolates...
-
Data regarding a new, vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for the construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins, as well as biological effects of selected polypeptides obtained using this method
PublikacjaApplications of bioactive peptides and polypeptides are emerging in areas such as drug development and drug delivery systems. These compounds are bioactive, biocompatible and represent a wide range of chemical properties, enabling further adjustments of obtained biomaterials. However, delivering large quantities of peptide derivatives is still challenging. Several methods have been developed for the production of concatemers –...
-
The effects of RNA editing in cancer tissue at different stages in carcinogenesis
Publikacja -
Regulacja topologii DNA przez topoizomerazę typu II, czyli jak struktura DNA wpływa na funkcjonowanie genów
PublikacjaW wielu ważnych procesach jakie zachodzą w komórce zmienia się topologia DNA i struktura chromatyny. Enzym, topoizomeraza typu II, jest jednym z ważnych czynników, który reguluje zmiany topologiczne i strukturalne w jądrze, przez co ma bezpośredni lub pośredni wpływ na takie procesy jak uporządkowanie struktury chromatyny poprzez wiązanie pętli chromatyny do szkieletu jądrowego, transkrypcję i replikację DNA, reperację uszkodzeń...
-
Obliczenia numeryczne konstrukcji dna jachtu podczas wejścia na mieliznę
PublikacjaPozytywne zmiany w dostępie do żeglarstwa, które dokonały się w ostatnim dziesięcioleciu spowodowały wzrost liczby osób uprawiających ten sport. Przepisy, wg których projektowane są jachty nie stawiają żadnych wymagań wytrzymałości konstrukcji na wypadek kolizji jednostki z dnem. Z doświadczenia wiadomo, że wejście jachtu na piaszczystą mieliznę nie musi powodować uszkodzeń, jednak kolizja z podwodną skałą w szkierach szwedzkich...
-
Wpływ dodatku kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) na właściwości mechaniczne żeli żelatynowych
PublikacjaKwasy nukleinowe cieszą się coraz większym zainteresowaniem pod względem zastosowania ich w przemyśle farmaceutycznym, kosmetycznym oraz żywnościowym. Określono wpływ dodatku długo- i krótkołańcuchowych kwasów nukleinowych na właściwości mechaniczne żeli żelatynowych. Badania wykazały występowanie specyficznych interakcji pomiędzy żelatyną a kwasami nukleinowymi oraz pozwoliły na ocenę wpływu tych oddziaływań na twardość, kohezyjność,...
-
SERRATE: a key factor in coordinated RNA processing in plants
Publikacja -
The structure and role of mammalian sperm RNA: a review
Publikacja -
Early Stages of RNA-Mediated Conversion of Human Prions
PublikacjaPrion diseases are characterized by the conversion of prion proteins from a PrPC fold into a disease-causing PrPSC form that is self-replicating. A possible agent to trigger this conversion is polyadenosine RNA, but both mechanism and pathways of the conversion are poorly understood. Using coarse-grained molecular dynamic simulations we study the time evolution of PrPC over 600 μs. We find that both the D178N mutation and interacting...
-
Numeryczna analiza wpływu budowy podpory mostu na rzece Wiśle na przepływ i rozmycie dna koryta rzeki
PublikacjaW artykule opisano wyniki hydraulicznej analizy wpływu jednego z filarów mostu w Kwidzynie na zmianę pola prędkości przepływu i warunków transportu rumowiska w rzece Wiśle, powodujących lokalne rozmywanie dna koryta rzeki w rejonie filara zlokalizowanego w nurcie rzeki. Bezpośrednią przyczyną podjęcia badań były zaobserwowane podczas budowy mostu lokalne rozmycia dna w sąsiedztwie podpory nr 24.
-
Novel Nuclear Functions of Arabidopsis ARGONAUTE1: Beyond RNA Interference
Publikacja -
EASY ACCESS TOOL FOR SMALL INTERFERING RNA (siRNA) DATA
PublikacjaFor many decades it was an accepted dogma of molecular genetics that the expression of genes is a “one-way-road” leading only in one direction from DNA to RNA to proteins. Recent discoveries in modern molecular genetics have challenged this dogma showing that specific RNA molecules play a central role in controlling the activity of genes by changing the structure of DNA sequences, targeting other RNAs for degradation or blocking...
-
SiMiSnoRNA: Collection of siRNA, miRNA, and snoRNA database for RNA Interference
PublikacjaObjective:The discovery of sequence specific gene silencing which occurs due to the presence of double-stranded RNAs has considerable impact on biology, revealing an unknown level of regulation of gene expression. This process is known as RNA interference (RNAi) or RNA silencing in which RNA molecules inhibit gene expression, typically by causing the destruction of specific mRNA molecule. Two types of small RNA molecules - small...
-
Platelet RNA Sequencing Data Through the Lens of Machine Learning
PublikacjaLiquid biopsies offer minimally invasive diagnosis and monitoring of cancer disease. This biosource is often analyzed using sequencing, which generates highly complex data that can be used using machine learning tools. Nevertheless, validating the clinical applications of such methods is challenging. It requires: (a) using data from many patients; (b) verifying potential bias concerning sample collection; and (c) adding interpretability...
-
Reusable Biosensor for Easy RNA Detection from Unfiltered Saliva
PublikacjaBiosensors are transforming point-of-care diagnostics by simplifying the detection process and enabling rapid, accurate testing. This study introduces a novel, reusable biosensor designed for direct viral RNA detection from unfiltered saliva, targeting SARS-CoV-2. Unlike conventional methods requiring filtration, our biosensor leverages a unique electrode design that prevents interference from saliva debris, allowing precise measurements....
-
Klasyfikacja dna morskiego na podstawie kątowej zależności cech echa z sonaru wielowiązkowego
PublikacjaPrzedstawiono metodę rozpoznawania i klasyfikacji rodzaju dna morskiego opartą na przetwarzaniu echa z sonaru wielowiązkowego. Metoda ta polega na obliczaniu zbioru parametrów obwiedni ech dla poszczególnych wiązek, podobnie jak w metodach wykorzystujących echosondy jednowiązkowe. Następnie estymowana jest zależność wartości poszczególnych parametrów od kąta wiązki oraz badane jest powiązanie otrzymanej zależności z rodzajem dna...
-
Wpływ warunków naturalnych na zobrazowanie dna Zatoki Gdańskiej przy użyciu sonaru bocznego
PublikacjaGłównym celem artykułu jest przedstawienie wpływu warunków środowiskowych na dokładność zobrazowania dna morza za pomocą systemów hydroakustycznych. Czynniki naturalne, przede wszystkim falowanie powierzchni morza i niejednorodny rozkład prędkości dźwięku w wodzie, mają wpływ na zmianę toru promieni akustycznych. Choć w obu przypadkach mechanizm zjawisk jest zupełnie odmienny, odgrywają one decydującą rolę w odwzorowaniu dna i...
-
Structure and evolution of the 4-helix bundle domain of Zuotin, a J-domain protein co-chaperone of Hsp70
PublikacjaThe J-domain protein Zuotin is a multi-domain eukaryotic Hsp70 co-chaperone. Though it is primarily ribosome-associated, positioned at the exit of the 60S subunit tunnel where it promotes folding of nascent polypeptide chains, Zuotin also has off-ribosome functions. Domains of Zuotin needed for 60S association and interaction with Hsp70 are conserved in eukaryotes. However, whether the 4-helix bundle (4HB) domain is conserved remains...
-
Study on the role of podoplanin in papillary thyroid carcinoma using rna sequencing
Publikacja -
Opinia na temat wpływu budowanego w ciągu drogi S7 mostu przez Wisłę w Kiezmarku na kształtowanie hydrodynamiki przepływu wód i rozmycia dna w warunkach umocnienia dna w rejonie podpór nurtowych
PublikacjaCelem pracy było wykonanie obliczeń hydraulicznych i hydrologicznych sprawdzających wpływ budowy w korycie głównym Wisły podpór nurtowych nr 10 i 11 wraz z wariantowymi umocnieniami dna i filarów mostu drogowego budowanego w Kiezmarku na dynamikę przepływu wody w rzece i erozję dna Wisły w przekroju mostowym.
-
Triplet–Triplet Annihilation Upconverting Liposomes: Mechanistic Insights into the Role of Membranes in Two-Dimensional TTA-UC
PublikacjaTriplet−triplet annihilation upconversion (TTA-UC) implemented in nanoparticle assemblies is of emerging interest in biomedical applications, including in drug delivery and imaging. As it is a bimolecular process, ensuring sufficient mobility of the sensitizer and annihilator to facilitate effective collision in the nanoparticle is key. Liposomes can provide the benefits of two-dimensional confinement and condensed concentration...
-
Bayesian multilevel model of micro RNA levels in ovarian-cancer and healthy subjects
Publikacja -
Optimized Protocol for RNA Isolation from Penicillium spp. and Aspergillus fumigatus Strains
PublikacjaEfficient RNA isolation from filamentous fungi is crucial for gene expression studies, but it poses significant technical challenges due to the robust cell walls and susceptibility of RNA to degradation by ribonucleases. This study presents the effectiveness of two RNA isolation protocols for four species of filamentous fungi: Penicillium crustosum, Penicillium rubens, Penicillium griseofulvum, and Aspergillus fumigatus. Both protocols...
-
Generation and Characterization of a DNA-GCN4 Oligonucleotide-Peptide Conjugate: The Impact DNA/Protein Interactions on the Sensitization of DNA
PublikacjaRadiotherapy, the most common therapy for the treatment of solid tumors, exerts its effects by inducing DNA damage. To fully understand the extent and nature of this damage, DNA models that mimic the in vivo situation should be utilized. In a cellular context, genomic DNA constantly interacts with proteins and these interactions could influence both the primary radical processes (triggered by ionizing radiation) and secondary reactions,...