Filters
total: 3904
filtered: 2718
-
Catalog
- Publications 2718 available results
- Journals 12 available results
- Conferences 1 available results
- People 95 available results
- Inventions 30 available results
- Projects 28 available results
- Laboratories 3 available results
- Research Teams 9 available results
- Research Equipment 1 available results
- e-Learning Courses 104 available results
- Events 6 available results
- Open Research Data 897 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: ROZPOZNAWANIE TYPU DNA
-
Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) - sources and applicationsin molecular biology
PublicationBiałka wiążące się do jednoniciowego DNA (SSB) odgrywają ważną rolę w replikacji, rekombinacji i naprawie DNA u bakterii, archea i eukariota. Ostatnio wzrosło zainteresowanie białkami SSB jako przydatnymi narzędziami w metodach badawczych biologii molekularnej, analitycznych i diagnostycznych. Większość znanych prokariotycznych białek SSB zbudowanych jest z czterech podjednostek (homotetramer) z jedną domeną wiążąca (OB) jednoniciowe...
-
Teloxantron inhibits the processivity of telomerase with preferential DNA damage on telomeres
PublicationTelomerase reactivation is one of the hallmarks of cancer, which plays an important role in cellular immortalization and the development and progression of the tumor. Chemical telomerase inhibitors have been shown to trigger replicative senescence and apoptotic cell death both in vitro and in vivo. Due to its upregulation in various cancers, telomerase is considered a potential target in cancer therapy. In this study, we identified...
-
Szerokopasmowy, zminiaturyzowany, wielodrożny dzielnik mocy typu 1:6
PublicationW referacie zaprezentowano metodykę projektowania szerokopasmowego, wielodrożnego dzielnika mocy typu 1:6 wykonanego w technologii niesymetrycznych linii paskowych. Zaburzenie ciągłości metalizacji paska sygnałowego poprzez implementację struktur PBG (ang. Photonic Bandgap) umożliwiło osiągnięcie zarówno 15% miniaturyzacji, jak i poszerzenia pasma pracy do 141% dla częstotliwości f=4 [GHz]. Wyniki eksperymentu wykazujące dużą zgodność...
-
Introducing the concept of Decisional DNA-Based web content mining
PublicationPrzedstawiono koncepcje zastosowania struktury reprezentacji wiedzy opartej na decyzyjnym DNA w procesie wyszukiwania informacji w internecie. Dokonano analizy eksperymentow tak wspomaganego wyszukiwania oraz sformulowano wnioski na temat przyszlych badan prowadzacych do dalszej integracji procesu wyszukiwania z doswiadczeniami zdobytymi w trakcie tego wyszukiwania.
-
Logistyka składowania odpadów w procesie produkcyjnym statków typu offshore
PublicationW niniejszym artykule autor przedstawił najistotniejsze problemy dotyczące logistyki odpadów, z którymi na co dzień boryka się jedna z polskich stoczni, podczas produkcji statków typu offshore - wraz z możliwymi rozwiązaniami
-
Genome-Wide DNA Methylation and Gene Expression in Patients with Indolent Systemic Mastocytosis
PublicationMastocytosis is a clinically heterogenous, usually acquired disease of the mast cells with a survival time that depends on the time of onset. It ranges from skin-limited to systemic disease, including indolent and more aggressive variants. The presence of the oncogenic KIT p. D816V gene somatic mutation is a crucial element in the pathogenesis. However, further epigenetic regulation may also affect the expression of genes that...
-
Sequence-dependent structural properties of B-DNA: what have we learned in 40 years?
PublicationThe structure of B-DNA, the physiological form of the DNA molecule, has been a central topic in biology, chemistry and physics. Far from uniform and rigid, the double helix was revealed as a flexible and structurally polymorphic molecule. Conformational changes that lead to local and global changes in the helix geometry are mediated by a complex choreography of base and backbone rearrangements affecting the ability of the B-DNA...
-
Covalent DNA modification by products of myrosinase catalysed glucosinolate degradation in cell-free system
PublicationThe bioactive phytochemicals found in Brassica vegetables belonging to glucosinolates (GLS) and especially the products of their degradation isothiocyanates (ITC) and indoles are regarded as the most promising cancer chemopreventive compounds. These secondary metabolites constitute defence system repelling or preventing the development of agrophages attacking brassica plants. The antibiological properties of these compounds suggest...
-
Defining a novel domain that provides an essential contribution to site-specific interaction of Rep protein with DNA
PublicationAn essential feature of replication initiation proteins is their ability to bind to DNA. In this work, we describe a new domain that contributes to a replication initiator sequence-specific interaction with DNA. Applying biochemical assays and structure prediction methods coupled with DNA–protein crosslinking, mass spectrometry, and construction and analysis of mutant proteins, we identified that the replication initiator of the...
-
Set of Experience and Decisional DNA: Toward Brains for Cyber-physical Systems and Industry of the Future
PublicationThe concept of Decisional DNA is decade old. This article introduces the initial idea of Set of Experience Knowledge Structure, its advancement into Decisional DNA, and its potential for real life applications in divers domains. The most current and future research steps into Industry 4.0 are also presented and discussed
-
Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor
PublicationRolling circle amplification (RCA) of DNA can be considered as a great alternative to the gold standard polymerase chain reaction (PCR), especially during this pandemic period, where rapid, sensitive, and reliable test results for hundreds of thousands of samples are required daily. This work presents the first research to date on direct, real-time and label-free isothermal DNA amplification monitoring using a microcavity in-line...
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublicationMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
Prediction based on integration of Decisional DNA and a feature selection algorithm Relief-F
PublicationThe paper presents prediction model based on Decisional DNA and Set of experienced integrated with Relief_F algorithm for feature selection
-
Decisional DNA based intelligent knowledge model for flexible manufacturing system
PublicationModeling an effective mechanism for design and control strategies for the implementation of a flexible manufacturing system (FMS) has been a challenge. Consequently, to overcome this issue various techniques have applied in the past but most of these models are effective only for some specific situation or an element of FMS. In this study, the knowledge representation technique of Decisional DNA (DDNA) is applied to FMS to develop...
-
Optymalizacja procesów biologicznych w oczyszczalni ścieków typu SBR
Publicationiologiczna oczyszczalnia ścieków jest skomplikowanym systemem sterowania. Jednym z istotnych i kosztownych procesów tam zachodzących jest napowietrzanie ścieków. Prawidłowy jego przebieg ma decydujący wpływ na stopień oczyszczenia ścieków i koszty operacyjne pracy oczyszczalni. W związku z tym prowadzone są prace badawcze nad optymalizacją procesów biologicznych, pozwalającą redukować koszty, np. zużycie energii. W artykule opracowano...
-
Problematyka zarządzania wiedzą w systemach typu e-health.
PublicationW rozdziale przedstawiono koncepcję systemu zarządzania wiedzą w ogólnodostępnym, wielofunkcyjnym systemie ukierunkowanym na różnorodne zastosowania związane z ochroną zdrowia. Koncepcja ta jest realizowana w zintegrowanym projekcie objętym 6. Programem Ramowym Unii Europejskiej. Zaprezentowano: miejsce zarządzania wiedzą w stosunku do innych części systemu, architekturę podsystemu zarządzania wiedzą oraz szczegółowo omówiono funkcje...
-
Ergodic type theorems for Gaussian systemstwierdzenia typu ergodycznego dla układów gaussowskich
PublicationUdowodniono twierdzenie typu ergodycznego dla zmiennych losowych będących złożeniem zmiennych losowych gaussowskich z funkcjami z odpowiedniej klasy.
-
Termodynamika oddziaływań i przejść strukturalnych DNA w układach wodnych na podstawie symulacji metodą dynamiki molekularnej
PublicationKwas deoksyrybonukleinowy jest jednym z najistotniejszych elementów każdej żywej komórki ze względu na rolę głównego nośnika informacji genetycznej. Posiada on instrukcje potrzebne do wzrostu, budowy, funkcjonowania oraz namnażania się wielu żywych organizmów, w tym także wirusów. Okazuje się, że w zależności od warunków środowiskowych, DNA może przyjmować wiele różnych struktur drugorzędowych, z których większość stanowi formy...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublicationBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
Dominant Pathways of Adenosyl Radical-Induced DNA Damage Revealed by QM/MM Metadynamics
PublicationBrominated nucleobases sensitize double stranded DNA to hydrated electrons, one of the dominant genotoxic species produced in hypoxic cancer cells during radiotherapy. Such radiosensitizers can therefore be administered locally to enhance treatment efficiency within the solid tumor while protecting the neighboring tissue. When a solvated electron attaches to 8-bromoadenosine, a potential sensitizer, the dissociation of bromide...
-
Model dynamicznego balastowania małego morskiego obiektu typu stealth
PublicationW artykule przedstawiono podstawowe problemy związane z modelowaniem głównych cech decydujących o trudno-wykrywalności małego obiektu na etapie projektu koncepcyjnego. Metoda badawcza oparta jest na ocenie zachowania się obiektu i ocenie ryzyka wypadku. W artykule skupiono się głównie na przedstawieniu modelu matematycznego opisującego model dynamicznego balastowania małego morskiego obiektu typu stealth. Przedstawione w artykule...
-
Rewitalizacja posadzek betonowych typu lastrico w obiektach zabytkowych. Część 1
PublicationW artykule przedstawiono zagadnienia materiałowe i technologiczne dotyczące posadzek typu lastrico w aspekcie oceny ich stanu technicznegooraz sposobów naprawy i rewitalizacji.
-
Decisional DNA with embedded Relief-F linear regression for knowledge and experience management
PublicationOmowiono zastowania Decyzyjnego DNA, regresji liniowej oraz funkcji RELIEF-F w procesach formalnego modelowania i wspomagania zarzadzania wiedza oraz zarzadzania doswiadczeniem.
-
SYSTEM POMIAROWY DO URZĄDZENIA TYPU STEPPER DEDYKOWANY DO PRÓB WYSIŁKOWYCH
PublicationW artykule przedstawiono system pomiarowy opracowany do urządzenia typu stepper, umożliwiającego przeprowadzenie próby wysiłkowej zgodnie z testem Astrand’a-Ryhminga. Budowa prototypu systemu pomiarowego wymagała modyfikacji mechanicznej urządzenia typu stepper udostępnionego przez Akademię Wychowania Fizycznego i Sportu w Gdańsku oraz doboru części sprzętowej systemu pomiarowego (czujników, mikrokontrolera). Celem projektu było...
-
Badania efektywności energetycznej pompy ciepła typu GEJZER KOMPAKT W 11
PublicationBadania eksperymentalne, analizy teoretyczne oraz weryfikacja klasy energetycznej sprężarkowej pompy ciepła woda-woda typu GEJZER KOMPAKT W 11 w świetle wymagań Dyrektywy Parlamentu Europejskiego
-
Sieciowe systemy przetwarzania rozproszonego typu GRID – rozwiązania systemowe oraz przykłady aplikacyjne
PublicationZaprezentowano możliwości wykorzystania oraz integracji rozproszonych mocy obliczeniowych komputerów Internautów w globalnej sieci www. Pokazano paradygmaty internetowego przetwarzania rozproszonego typu grid computing oraz volunteer computing. Zwrócono uwagę na istotność tego typu przetwarzania w rozwiązywaniu zagadnień wymagających bardzo dużych mocy obliczeniowych. Pokazano reprezentatywne przykłady rozwiązań systemowych tego...
-
DNA repair is responsible for the presence of oxidatively damaged DNA lesions in urine
Publication -
Low-Molecular Pyrazine-Based DNA Binders: Physicochemical and Antimicrobial Properties
PublicationPyrazine and its derivatives are a large group of compounds that exhibit broad biological activity, the changes of which can be easily detected by a substituent effect or a change in the functional group. The present studies combined theoretical research with the density functional theory (DFT) approach (B3LYP/6-311+G**) and experimental (potentiometric and spectrophotometric) analysis for a thorough understanding of the structure...
-
Elektrochemiczne magazyny energii - baterie przepływowe typu "redox flow"
PublicationRozwój i wzrost udziału energii odnawialnej, ze względu na kurczące się zasoby konwencjonalnych źródeł energii i ochronę środowiska, jest możliwy tylko dzięki współpracującym z nimi odpowiednim stacjonarnym magazynom energii. Technologia baterii przepływowych (ang. redox flow batteries, RFB) pozwala świetnie zaspokoić tego typu potrzeby ze względu na: (i) wyjątkowo dużą skalowalność układów; (ii) niezależny dobór mocy i pojemności...
-
Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
Publicationnthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another...
-
The Neural Knowledge DNA Based Smart Internet of Things
PublicationABSTRACT The Internet of Things (IoT) has gained significant attention from industry as well as academia during the past decade. Smartness, however, remains a substantial challenge for IoT applications. Recent advances in networked sensor technologies, computing, and machine learning have made it possible for building new smart IoT applications. In this paper, we propose a novel approach: the Neural Knowledge DNA based Smart Internet...
-
Decisional DNA based framework for representing Virtual Engineering Objects
PublicationIn this paper, we propose a frame-work to represent the Virtual Engineering Objects (VEO) utilizing Set of Knowledge Experience Structure (SOEKS) and Decisional DNA. A VEO will enable the discovery of new knowledge in a manufacturing unit and the generation of new rules that drive reasoning. The proposed VEO framework will not only be knowledge based representation but it will also have its associated experience embedded within...
-
How acidic amino acid residues facilitate DNA target site selection
PublicationDespite the negative charge of the DNA backbone, acidic residues (Asp/Glu) commonly participate in the base readout, with a strong preference for cytosine. In fact, in the solved DNA/protein structures, cytosine is recognized almost exclusively by Asp/Glu through a direct hydrogen bond, while at the same time, adenine, regardless of its amino group, shows no propensity for Asp/Glu. Here, we analyzed the contribution of Asp/Glu...
-
Effects of metallic silver particles on resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA.
PublicationZbadano wpływ filmów wysepek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donorem i akceptorem były odpowiednio 4´,6 diamidyno-2-fenylindon i jodek propydyny. Zmierzone dla tego układu czasy zaniku i widma fluorescencji pokazują, że sąsiedztwo cząstek srebra dramatycznie zwiększa promień Forstera, a tym samym i przekazywanie energii w znakowanym DNA.
-
Two-photon induced fluorescence of Cy5-DNA in buffer solution and on silver island film
PublicationOpisano fluorescencję barwnika CY5 połączonego z DNA w roztworze buforowym na wysepkach srebrowych.
-
Metoda diagnostyki cieplno-przepływowej umożliwiająca rozpoznawanie miejsca i stopnia degradacji turbozespołów energetycznych
PublicationPrzedyskutowano problem rozpoznawania degradacji urządzeń składowych turbozespołów energetycznych dużej mocy. Scharakteryzowano systemy DCS dużych obiektów energetycznych dostarczające dane eksperymentalne o występowaniu degradacji eksploatacyjnej urządzeń składowych tych obiektów. Zastosowano sieci neuronowe (SSN) o skokowych i ciągłych funkcjach przejścia do zbudowania relacji diagnostycznych opartych o modułowy system diagnostyczny....
-
AUTOMATYCZNE ROZPOZNAWANIE GATUNKÓW MUZYCZNYCH W APLIKACJI SYNTEZUJĄCEJ NISKIE CZĘSTOTLIWOŚCI W URZĄDZENIACH MOBILNYCH
PublicationW pracy został opisany inteligentny algorytm syntezy niskich częstotliwości w urządzeniach mobilnych (Smart VBS). Algorytm Smart VBS rozpoznaje gatunek muzyczny i w zależności od wskazania dobiera optymalne parametry syntezy niskich częstotliwości. Synteza niskich częstotliwości odbywa się z wykorzystaniem metody funkcji nieliniowych (NLD). Modyfikacji podlega wykorzystywana funkcja nieliniowa, liczba oraz poziom wzmocnienia dodawanych...
-
Rozpoznawanie dynamicznych i statycznych gestów rąk w zastosowaniu do sterowania aplikacjami komputerowymi
PublicationW referacie przedstawiono interfejs, metody oraz algorytmy sterowania komputerem za pomocą dynamicznych i statycznych gestów rąk. Komponentami opracowanego rozwiązania są komputer klasy PC wraz z opracowanym interfejsem i oprogramowaniem, kamera internetowa oraz projektor multimedialny. Gesty rozpoznawane są w procesie analizy obrazu wizyjnego pozyskanego z kamery internetowej przymocowanej do projektora oraz analizy obrazu wyświetlanego...
-
Rozpoznawanie urządzeń i wykrywanie nieautoryzowanego poboru energii elektrycznej na podstawie pomiaru napięcia
PublicationW pracy rozpatrywany jest problem wykrywania nieautoryzowanego poboru energii z sieci elektrycznej przez identyfikację podłączonych urządzeń. Estymacja stanu sieci, rozumianej jako zbiór podpiętych układów, wraz z ustaloną listą urządzeń dopuszczonych, pozwala określić, czy w danej chwili ma miejsce pobór nieautoryzowany. W celu wykrywania urządzeń, proponuje się wykorzystać prostą metodę opartą na analizie wysokoczęstotliwościowego...
-
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublicationA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
DNA and its Metaphors
Publication -
Rewitalizacja posadzek betonowych typu lastrico w obiektach zabytkowych. Część 2
PublicationW artykule przedstawiono zagadnienia materiałowe i technologiczne dotyczące posadzek typu lastrico w aspekcie oceny ich stanu technicznego oraz sposobów naprawy i rewitalizacji. Tekst stanowi kontynuacje artykułu zamieszczonego w Builder Science3 nr 9/2021
-
Wpływ nagniatania na właściwości stali austenityczno-ferrytycznych typu duplex
PublicationPrzedstawiono zastosowanie technologii mechanicznej modyfikacji warstwy wierzchniej poprzez nagniatanie wyrobów ze stali odpornych na korozję w celu zapobiegania ich przedwczesnemu niszczeniu. Badaniom poddano stal austenityczno-ferrytyczną typu duplex pod kątem poszukiwania metod zwiększenia jej odporności korozyjnej a zwłaszcza na korozję naprężeniową. Badania przeprowadzono w oparciu o próby rozciągania z małą prędkością odkształcania...
-
Charakterystyka materiałowo-technologiczna oraz proces degradacji posadzek betonowych typu lastrico
PublicationW artykule przedstawiono wybrane zagadnienia materiałowe i technologiczne dotyczące posadzek typu lastrico. Opisany został proces degradacji warstwy wierzchniej posadzki lastrico. Szczególną uwagę zwrócono na wpływ specyfiki tego rodzaju posadzki na sposób oceny ich stanu technicznego.
-
Ocena stanu technicznego ograniczników przepięć typu SBK-II 96/10.2
PublicationW ekspertyzie określono stan techniczny 7 - miu ograniczników przepięć typu SBK-II 96/10.2 na podstawie pomiarów prądu upływowego oraz napięcia odniesienia. Dodatkowo z przebiegów napięcia i prądu ogranicznika wyznaczono składową czynną i pojemnościową ograniczników przepięć.
-
Increased concentration of Taq DNA polymerase as a solution for GC-rich templates from clinical and environmental samples
PublicationDNA polymerase is an enzyme which plays crucial role in replication and DNA repair. It found application in PCR (polymerase chain reaction) where catalyses process of in vitro DNA synthesis. To meet the demands posed by mod- ern diagnostic, molecular biology or genetic engineering it is necessary to improve DNA polymerases to obtain new or better features useful in these fields. So far implemented modifications in majority are...
-
Analiza Nagrań Ruchu Drogowego w Kontekście Akustycznej Klasyfikacji Typu Pojazdu
PublicationCelem niniejszej pracy jest przeprowadzenie analizy sygnału fonicznego w kontekście klasyfikacji typu pojazdu. Część teoretyczna zawiera krytyczny przegląd systemów monitorowania ruchu drogowego, w szczególności systemów ITS (Intelginet Transport System). Część praktyczna przedstawia założenia dotyczące przygotowania bazy nagrań testowych, uwzględniających różne scenariusze ruchu drogowego. Zarejestrowane sesje nagraniowe przetworzono,...
-
Klasyfikacja dna morskiego na podstawie kątowej zależności cech echa z sonaru wielowiązkowego
PublicationPrzedstawiono metodę rozpoznawania i klasyfikacji rodzaju dna morskiego opartą na przetwarzaniu echa z sonaru wielowiązkowego. Metoda ta polega na obliczaniu zbioru parametrów obwiedni ech dla poszczególnych wiązek, podobnie jak w metodach wykorzystujących echosondy jednowiązkowe. Następnie estymowana jest zależność wartości poszczególnych parametrów od kąta wiązki oraz badane jest powiązanie otrzymanej zależności z rodzajem dna...
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublicationAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublicationTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...