Filters
total: 3267
filtered: 1555
-
Catalog
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: P53 PROTEIN
-
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein
Publication -
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactosidase
Publication -
The protein folding problem: global optimization of force fields
Publication -
Lipid-protein interactions in membranes: a molecular modelling study
Publication -
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactoside
PublicationPraca pokazuje konstrukcję DNA plazmidowego kodującego bifunkcjonalne białko chimeryczne złożone z MutS Thermus thermophilus i beta-galaktozydazy E.coli, optymalizację jego ekspresji i oczyszczania. Białko to testowano w metodzie wykrywania mutacji punktowych, wykorzystując kolorymetryczne mierzenie aktywności domeny reporterowej beta galaktozydazy.
-
The SERRATE protein is involved in alternative splicing in Arabidopsis thaliana
Publication -
The SERRATE protein is involved in alternative splicing in Arabidopsis thaliana
Publication -
Role of Oligosaccharide Chain Polarity in Protein–Glycosaminoglycan Interactions
Publication -
Novel primosomal protein B from Clostridium pastuerianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pasteurianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Copper containing protein sites - structure, properties and models
PublicationEnzymy organizmów żywych katalizują wiele reakcji stosowanych w przemyśle chemicznym. Przykładem potencjalnego zastosowania enzymu w produkcji jest synteza L-Dopy przy udziale tyrozynazy. Ze względu na możliwe praktyczne zastosowanie w katalizie, otrzymano i opisano wiele prostych modeli miejsc aktywnych enzymów. W artykule opisano niektóre modele białek zawierających miedź.
-
Electrosynthesis of potato starch–whey protein isolate complexes
Publication -
Effect of increased protein intake on the risk of female infertility
Publication -
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein.
PublicationGen mutS z termofilnej bakterii Thermus thermophilus zamplifikowano przy użyciu PCR, sklonowano i przeprowadzono jego ekspresję w E. coli. Rekombinantowe białko MutS zawierające oligohistydynową domenę na N-końcu oczyszczono w jednoetapowej procedurze przy wykorzystaniu chromatografii powinowactwaNi(2+). Zdolność do rozpoznania niekomplementarności białka his(6)-MutS potwierdzono w eksperymentach ochrony DNA przed trawieniem...
-
Concentration of proteins in the whey stream
PublicationZastosowano metodę separacji pianowej do odzyskiwania białka z serwatki. Wykazano silny wpływ prędkości powietrza w kolumnie, początkowego stężenia białka w serwatce i pH roztworu na przebieg i skuteczność flotacji. Współczynnik wzbogacenia maleje ze wzrostem prędkości przepływu powietrza oraz ze wzrostem początkowego stężenia białka serwatkowego. Najwyższą wartość współczynnika wzbogacenia uzyskano dla pH naturalnej serwatki.
-
Conserved motifs of MutL proteins
PublicationtThe MutL protein is best known for its function in DNA mismatch repair (MMR). However, there isevidence to suggest that MutL is not only the linker connecting the functions of MutS and MutH in MMR,but that it also participates in other repair systems, such as Very Short Patch (VSP), Base Excision (BER)and Nucleotide Excision Repair (NER). This study set out to identify the most highly conserved aminoacid sequence motifs in MutL...
-
Conservation and diversity of MutS proteins
PublicationThe homologues of MutS, mismatch repair protein, exist in all prokaryotes, with the exception of Actinobacteria, Mollicutes and part of the Archaea. Multiple alignments of 316 MutS amino acid sequences from 169 species revealed conserved residues and sequence motifs distinguishing MutS homologues. All MutS homologues show high conservation within the ATPase domain. MutS1, the homologue responsible for DNA mismatch recognition,...
-
Dual inhibition of PI3K/Akt signaling and the DNA damage checkpoint in p53-deficient cells with strong survival signaling: implications for cancer therapy
PublicationOporność komórek nowotworowych na leki uszkadzjące DNA związana jest ściśle ze zdolnością do utrzymywania blok z fazie G2 cyklu komórkowego. Blok ten regulowany jest przez mechanizmy punktu kontrolnego G2/M oraz szlaki przeżycia komórkowego. W pracy badaliśmy rolę szlaku kinazy PI3K/Akt w funkcjonowaniu punktu kontrolnego cyklu komórkowego i wpływ na przeżycie komórek traktowanych lekiem przeciwnowotworowym - cisplatyną. Nasze...
-
Efficacy of high-dose corticosteroid-based treatment for chronic lymphocytic leukemia patients with p53 abnormalities in the era of B-cell receptor inhibitors
Publication -
Triazoloacridone C-1305 abrogates the restriction checkpoint in cells lacking functional p53 and promotes their accumulation in the G2/M phase of the cell cycle
PublicationTriazoloakrydon C-1305, nowy inhibitor topoizomerazy II, wykazuje wysoką aktywość cytotoksyczną wobec komórek wielu typów nowotworów. Komórki mysie pozbawione genu PARP-1 wykazywały nadwrażliwość na działanie tego związku. W pracy testowaliśmy działanie związku wobec dwóch różnych komóek nowotworowych różniących się statusem p53: komórkami białaczki myelocytarnej HL-60 i raka sutka MCF-7. Wykazaliśmy, że inkubacja ze związkiem...
-
Monocyte Chemoattractant Protein-Induced Protein 1 (MCPIP1) Enhances Angiogenic and Cardiomyogenic Potential of Murine Bone Marrow-Derived Mesenchymal Stem Cells
Publication -
High pressure luminescence of Y V O4:Pr3+
Publication -
Luminescence and Luminescence Kinetics of Gd3Ga5O12Polycrystals Doped with Cr3+and Pr3+
Publication -
New Pr3+ site in β-SiAlON red phosphor
Publication -
Impedance analysis of Portevin-Le Chatelier effect on aluminium alloy
PublicationW niniejszej pracy przeprowadzono badania elektrochemiczne powierzchniowego efektu PLC, związanego z nierównomiernym procesem płynięcia plastycznego stopów aluminium zawierających magnez. Występujący efekt PLC w postaci serration wywołuje niehomogeniczny proces zmian zewnętrznej powierzchni rozciąganej próbki. Wykonano badania metodą Dynamicznej Spektroskopii Impedancyjnej w warunkach dynamicznych prowadzenia procesu rozciągania....
-
The cellular response of human colon carcinoma HCT116 cells to 4-methyl-1-nitroacridine derivative C-1748 treatment depending on p53 status
PublicationWykazano, że pochodna C-1748 indukuje apoptozę w komórkach linii ludzkich raków jelita grubego HCT116 p53+/+ i p53-/- w sposób zależny od czasu inkubacji i stężenia związku. Wskazują na to: pojawienie się frakcji komórek sub-G1, charakterystyczne zmiany w morfologii jąder komórkowych, zmiany w strukturze błony plazmatycznej. Ponadto, pod wpływem badanego związku komórki HCT116 p53+/+ wykazują większą podatność do ulegania apoptozie...
-
Study of Bioreductive Anticancer Agent RH-1-Induced Signals Leading the Wild-Type p53-Bearing Lung Cancer A549 Cells to Apoptosis
Publication -
Imidazoacridinone derivative C-1311 (SymadexTM) induces apoptosis, mitotic catastrophe or senescence in human colon carcinoma HCT116 cells depending on p53 status
PublicationPrzeprowadziliśmy badania zmierzające do wyjaśnienia odpowiedzi komórek ludzkiego raka jelita grubego HCT116 traktowanych C-1311 w zależności od statusu białka p53. Wykazaliśmy, że pochodna imidazoakrydonu C-1311 w stężeniach biologicznie istotnych indukuje przejściowy blok w fazie G2M komórek HCT116 p53-/- oraz blok w fazie G1 i G2M komórek HCT116 p53+/+. W komórkach z niefunkcjonalnym białkiem p53 imidazoakrydon indukował katastrofę...
-
Mechanism of antifreeze protein functioning and the “anchored clathrate water” concept
PublicationIn liquid water, there is a natural tendency to form aggregates that consist of water molecules linked by hydrogen bonds. Such spontaneously formed aggregates are surrounded by a "sea" of disordered water molecules, with both forms remaining in equilibrium. The process of creating water aggregates also takes place in the solvation water of proteins, but in this case the interactions of water molecules with the protein surface shift...
-
The Unfolded Protein Response: A Double-Edged Sword for Brain Health
PublicationEfficient brain function requires as much as 20% of the total oxygen intake to support normal neuronal cell function. This level of oxygen usage, however, leads to the generation of free radicals, and thus can lead to oxidative stress and potentially to age-related cognitive decay and even neurodegenerative diseases. The regulation of this system requires a complex monitoring network to maintain proper oxygen homeostasis. Furthermore,...
-
MP3vec: A Reusable Machine-Constructed Feature Representation for Protein Sequences
Publication—Machine Learning (ML) methods have been used with varying degrees of success on protein prediction tasks, with two inherent limitations. First, prediction performance often depends upon the features extracted from the proteins. Second, experimental data may be insufficient to construct reliable ML models. Here we introduce MP3vec, a transferable representation for protein sequences that is designed to be used specifically for sequence-to-sequence...
-
Structural Analysis of a Peptide Fragment of Transmembrane Transporter Protein Bilitranslocase
Publication -
Molecular targets for antifungals in amino acid and protein biosynthetic pathways
PublicationFungi cause death of over 1.5 million people every year, while cutaneous mycoses are among the most common infections in the world. Mycoses vary greatly in severity, there are long-term skin (ringworm), nail or hair infections (tinea capitis), recurrent like vaginal candidiasis or severe, life-threatening systemic, multiorgan infections. In the last few years, increasing importance is attached to the health and economic problems...
-
X-ray and UV Radiation Damage of dsDNA/Protein Complexes
PublicationRadiation and photodynamic therapies are used for cancer treatment by targeting DNA. However, efficiency is limited due to physico-chemical processes and the insensitivity of native nucleobases to damage. Thus, incorporation of radio- and photosensitizers into these therapies should increase both efficacy and the yield of DNA damage. To date, studies of sensitization processes have been performed on simple model systems, e.g.,...
-
Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14‐CAPRI experiment
PublicationWe present the results for CAPRI Round 50, the 4th joint CASP-CAPRI protein assembly prediction challenge. The Round comprised a total of 12 targets, including 6 dimers, 3 trimers, and 3 higher-order oligomers. Four of these were easy targets, for which good structural templates were available either for the full assembly, or for the main interfaces (of the higher-order oligomers). Eight were difficult targets for which only distantly...
-
Software tools for identification, visualization and analysis of protein tunnels and channels
Publication -
C-reactive Protein as a Diagnostic and Prognostic Factor of Endometrial Cancer
Publication -
Assessment of chemical‐crosslink‐assisted protein structure modeling in CASP13
Publication -
C-reactive protein as a diagnostic and prognostic factor of endometrial cancer
Publication -
Delay induced oscillations in gene expression of Hes1 protein model
PublicationW pracy został omówiony model produkcji białka Hes1. Stężenie Hes1 jest kontrolowane przez ujemne sprzężenie zwrotne wbudowane w białko i jego mRNA. Przeprowadzona analiza potwierdziła znane wyniki numeryczne, że oscylacje wywołane są przez opóźnienie. Pokazaliśmy również, że jeśli współczynnik Hilla jest większy niż 1, to istnieje krytyczna wartość opóźnienia, dla której ma miejsce bifurkacja Hopfa i pojawiają się rozwiązania...
-
Nutritional value, protein and peptide composition of edible cricket powders
Publication -
MutL protein as a constituent of vsp, ner and mmr repair systems
PublicationMutS and MutL proteins are renowned mostly for their functions in well-characterized, post-DNA replication mis- match repair system (MMR). However, there is growing evidence that MMR system is not the only field of action for these pro- teins. Moreover, the participation in MMR does not even have to be their primary function. There are some reports indicat- ing involvement of MutL in BER, NER and VSP (very short patch repair)....
-
Quantitative determination of mechanical stability in the novel coronavirus spike protein
Publication -
Molecular Dynamics Studies on Amyloidogenic Proteins
Publication -
Molecular Dynamics Studies on Amyloidogenic Proteins
Publication -
Antioxidants and proteins in ethylene-treated kiwifruits
PublicationW pracy porównano właściwości przeciwutleniające i profil białek owoców kiwi poddanych działaniu etylenu i powietrza. Wysokie współczynniki korelacji między całkowitą zawartością fenoli i właściwościami przeciwutleniającymi uzyskano dla trzech metod określania właściwości przeciwutleniających: ABTS, TEAC i CUPRAC. W paśmie białek owoców kiwi rozdzielonych za pomocą elektroforezy stwierdzono różnice w paśmie siarczanu dodecylu sodu...
-
The role of proteins in food. Chapter 6
PublicationStruktura i konformacja wpływają na biologiczne oraz funkcjonalne właściwości białek i na ich rolę w tworzeniu pożądanych cech produktów żywnościowych. Właściwości funkcjonalne to rozpuszczalność w środowisku wodnym o różnej sile jonowej, wodochłonność oraz zdolność żelowania, tworzenia błon, emulgowania lipidów i pienienia się. Białka mięsa, ryb, mleka, jaj, nasion roślin strączkowych, nasion zbóż oraz drobnoustrojów różnią się...
-
Targeting shelterin proteins for cancer therapy.
PublicationAs a global health challenge, cancer prompts continuous exploration for innovative therapies that are also based on new targets. One promising avenue is targeting the shelterin protein complex, a safeguard for telomeres crucial in preventing DNA damage. The role of shelterin in modulating ataxia- telangiectasia mutated (ATM) and ataxia-telangiectasia and Rad3-related (ATR) kinases, key players in the DNA damage response (DDR),...
-
High pressure luminescence and time resolved spectra of La2Be2O5:Pr3+
Publication -
High pressure luminescence and time resolved spectra of LiNbO3:Pr3+
Publication