Search results for: PEPTYDO-AKRYDYNY
-
Peptide conjugates of lactoferricin analogues and antimicrobials—Design, chemical synthesis, evaluation of antimicrobial activity and mammalian cytotoxicity
PublicationEight new peptide conjugates composed of modified bovine lactoferricin truncated analogues (LFcinB) and oneof the three antimicrobials — ciprofloxacin (CIP), levofloxacin (LVX), and fluconazole (FLC) — were synthesized. Four different linkers were applied to connect a peptide and an antimicrobial agent. The FLC-containing peptidic conjugates were synthesized using the “click chemistry” method. This novel approach is reported here...
-
99mTc-Galacto-RGD2: A Novel 99mTc-Labeled Cyclic RGD Peptide Dimer Useful for Tumor Imaging
PublicationThis study sought to evaluate [99mTc(HYNIC-Galacto-RGD2)-(tricine)(TPPTS)] (99mTc-Galacto-RGD2: HYNIC = 6-hydrazinonicotinyl; Galacto-RGD2 = Glu[cyclo[Arg-Gly-Asp-D-Phe-Lys(SAA-PEG2-(1,2,3-triazole)-1-yl-4-ethylamide)]]2 (SAA = 7-amino-L-glycero-L-galacto-2,6-anhydro-7-eoxyheptanamide, and PEG2 = 3,6-dioxaoctanoic acid); and TPPTS = trisodium triphenylphosphine-3,3',3''-trisulfonate) as a new radiotracer for tumor imaging. Galacto-RGD2...
-
Generation and Characterization of a DNA-GCN4 Oligonucleotide-Peptide Conjugate: The Impact DNA/Protein Interactions on the Sensitization of DNA
PublicationRadiotherapy, the most common therapy for the treatment of solid tumors, exerts its effects by inducing DNA damage. To fully understand the extent and nature of this damage, DNA models that mimic the in vivo situation should be utilized. In a cellular context, genomic DNA constantly interacts with proteins and these interactions could influence both the primary radical processes (triggered by ionizing radiation) and secondary reactions,...
-
Determination of long-chain aldehydes using a novel quartz crystal microbalance sensor based on a biomimetic peptide
PublicationThere is an increasingly popular trend aimed at improvement of fundamental metrological parameters of sensors via implementation of materials mimicking biological olfactory systems. This study presents investigation on usefulness of the peptide mimicking HarmOBP7 region as a receptor element of the piezoelectric sensor for selective analysis of long-chain aldehydes. Identification of odorant binding proteins creates new possibilities...
-
Cis/trans conformational equilibrium across the N-methylphenylalanine2- N-methylphenylalanine3 peptide bond of arginine vasopressin analogs
Publication -
Peptide splicing in a double‐sequence analogue of trypsin inhibitor SFTI‐1 substituted in the P1 positions by peptoid monomers
Publication -
Structural changes of a simple peptide—Trpzip-1—in aqueous solutions and the corresponding hydration phenomena under the influence of temperature
PublicationTrpzip-1, a simple β-hairpin, is a rare example of peptide with stable secondary structure and can be a convenient model to study temperature-related processes that potential prion or amyloid proteins undergo. Although its sequence is simple, the exact processes which the peptide undergoes in aqueous solutions are quite complex and not well understood. The selection of well-established experimental (DSC, FTIR) and theoretical methods...
-
Understanding the interactions between protein stabilizers and the peptide bond through the analysis of the volumetric and compressibility properties for the model systems
PublicationThis work confirms our earlier supposition, that volumetric and acoustic parameters for simple model proposed by us are directly related to stabilizing/destabilizing effect of osmolytes on proteins structure. The apparent molar volumes, V and the apparent molar isentropic compressions, KS,, of glycine and N,N,N –trimethylglycine (betaine) were determined from densities and speed of sound measurements in aqueous solution of N-methylacetamide...
-
Comparison of the ability to induce apoptosis by acridine derivatives in solid tumor and leukemia cells
PublicationW pracy wykazano różną wrażliwość komórek nowotworowych do ulegania apoptozie pod wpływem pochodnych akrydyny.
-
Nowa metoda syntezy cyklicznych pseudopeptydów wykorzystująca 1,3-dioksadion jako odczynnik sprzęgający- badania rozpoznawcze
PublicationCykliczne peptydy odgrywają ważną rolę w wielu procesach biochemicznych. Do szerokiej grupy tych związków zaliczamy wiele znanych powszechnie leków m.in. wankomycynę [2] - antybiotyk glikopeptydowy o działaniu bakteriobójczym, czy też cyklosporynę [3]. Chemiczna synteza cyklicznych peptydów to proces wieloetapowy i nierzadko kłopotliwy. Spośród czynników będących powodem nieopłacalności produkcji metodą chemiczną można wymienić...
-
Influence of Dimerization of Lipopeptide Laur-Orn-Orn-Cys–NH2 and an N-terminal Peptide of Human Lactoferricin on Biological Activity
Publication -
Binding modes of a new epoxysuccinyl–peptide inhibitor of cysteine proteases. Where and how do cysteine proteases express their selectivity?
Publication -
Lipidated Analogs of the LL-37-Derived Peptide Fragment KR12—Structural Analysis, Surface-Active Properties and Antimicrobial Activity
Publication -
Inhibitory activity of double‐sequence analogues of trypsin inhibitor SFTI‐1 from sunflower seeds: an example of peptide splicing
Publication -
Peptide bond modification. I. Simple and efficient method of Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH synthesis.
PublicationZaprezentowano prostą i efektywną metodę syntezy obu enancjomerów t-butoksykarbonylo chronionego pseudo dipeptydu (R) oraz (S)-Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH.
-
Development of a Peptide Derived from Platelet-Derived Growth Factor (PDGF-BB) into a Potential Drug Candidate for the Treatment of Wounds
PublicationObjective: This study evaluated the use of novel peptides derived from platelet-derived growth factor (PDGF-BB) as potential wound healing stimulants. One of the compounds (named PDGF2) was subjected for further research after cytotoxicity and proliferation assays on human skin cells. Further investigation included evaluation of: migration and chemotaxis of skin cells, immunological and allergic safety, the transcriptional analyses...
-
Antimicrobial Activity of Chimera Peptides Composed of Human Neutrophil Peptide 1 (HNP-1) Truncated Analogues and Bovine Lactoferrampin
PublicationThree chimera peptides composed of bovine lactoferrampin and the analogue of truncated human neutrophil peptide 1 were synthesized by the solid-phase method. In two compounds peptide chains were connected via isopeptide bond, whereas in the third one disulfide bridge served as a linker. All three chimeras displayed significantly higher antimicrobial activity than the constituent peptides as well as their equimolar mixtures. The...
-
Relative quantification of pork and beef in meat products using global and species-specific peptide markers for the authentication of meat composition
PublicationWe used global and species-specific peptide markers for a relative quantitative determination of pork and beef in raw and processed meat products made of the two meat species. Four groups of products were prepared (i.e., minced raw meats, sausages, raw and fried burgers) in order to represent products with different extents of food processing. In each group, the products varied in the pork/beef proportions. All products were analysed...
-
Design, synthesis and in vitro biological evaluation of a small cyclic peptide as inhibitor of vascular endothelial growth factor binding to neuropilin-1
Publication -
Osteoblast and bacterial cell response on RGD peptide‐functionalized chitosan coatings electrophoretically deposited from different suspensions on Ti13Nb13Zr alloy
PublicationMetallic materials for long-term load-bearing implants still do not provide high antimicrobial activity while maintaining strong compatibility with bone cells. This study aimed to modify the surface of Ti13Nb13Zr alloy by electrophoretic deposition of a chitosan coating with a covalently attached Arg-Gly-Asp (RGD) peptide. The suspensions for coating deposition were prepared in two different ways either using hydroxyacetic acid...
-
Wstępna analiza potencjału przeciwgrzybowego pochodnych akrydyny i akrydonu
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry according to DEC-2019/03/X/NZ6/00895 agreement from 2019-12-04
-
Comparison of peptide cancer signatures identified by mass spectrometry in serum of patients with head and neck, lung and colorectal cancers: Association with tumor progression
Publication -
Probing the binding selected metal ions and biologically active substances to the antimicrobial peptide LL-37 using DSC, ITC measurements and calculations
Publication -
The influence of a synthetic growth hormone‐releasing hormone analogue G11 and opioid peptide biphalin on selected fibroblasts parameters relevant to wound healing
Publication -
Electrochemical detection of bacterial endotoxin lipopolysaccharide (LPS) on gold electrode modified with DAL-PEG-DK5-PEG-OH - Antimicrobial peptide conjugate
PublicationThis work describes fabrication of gold electrodes modified with peptide conjugate DAL-PEG-DK5-PEG-OH that enables ultra-sensitive detection of lipopolysaccharide (LPS) isolated from the reference strain of Escherichia coli O26:B6. The initial step of the established procedure implies immobilization of the fully protected DAL-PEG-DK5-PEG-OH peptide on the surface of the gold electrode previously modified by cysteamine. Then side...
-
Inhibition of inflammatory response in human keratinocytes by magnetic nanoparticles functionalized with PBP10 peptide derived from the PIP2-binding site of human plasma gelsolin
Publication -
The Arctic mutation alters helix length and type in the 11–28 β-amyloid peptide monomer—CD, NMR and MD studies in an SDS micelle
Publication -
Peptide dendrimers as antifungal agents and carriers for potential antifungal agent—N3‐(4‐methoxyfumaroyl)‐(S)‐2,3‐ diaminopropanoic acid—synthesis and antimicrobial activity
PublicationA series of peptide dendrimers and their conjugates with antimicrobial agent FMDP (N3‐(4‐methoxyfumaroyl)‐(S)‐2,3‐diamino‐propanoic acid) were synthesized. The obtained compounds were tested for the antibacterial and antifungal activity. All novel dendrimers displayed much better activity against the tested strains than FMDP itself. Moreover, their conjugates with FMDP also exhibited antimicrobial activity. The most promising molecules...
-
The Product of Matrix Metalloproteinase Cleavage of Doxorubicin Conjugate for Anticancer Drug Delivery: Calorimetric, Spectroscopic, and Molecular Dynamics Studies on Peptide–Doxorubicin Binding to DNA
PublicationMatrix metalloproteinases (MMPs) are extracellular matrix degradation factors, promoting cancer progression. Hence, they could provide an enzyme-assisted delivery of doxorubicin (DOX) in cancer treatment. In the current study, the intercalation process of DOX and tetrapeptide-DOX, the product of the MMPs' cleavage of carrier-linked DOX, into dsDNA was investigated using stationary and time-resolved fluorescence spectroscopy, UV-Vis...
-
Human CYP2 family of cytochrome P-450 takes part in metabolism of two acridine antitumor agents, C-1311 and C-1748, selected for I phase of clinical trials
PublicationPraca zawiera wyniki badań metabolicznej transformacji przeciwnowotworowych pochodnych akrydyny wobec zestawu 16 prób enzymów mikrosomalnych, pochodzących z wątroby 16 różnych pacjentów. Wykazano, że za metabolizm tych związków u człowieka odpowiedzialne są głównie izoenzymy z rodziny CYP2.
-
Naturalne związki organiczne.
PublicationNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowszeosiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Naturalne związki organiczne
PublicationNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówiono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowsze osiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Corrigendum to “Rapid PD-L1 detection in tumors with PET using a highly specific peptide” [Biochemical and Biophysical Research Communications 483/1 (2017) 258–263]
Publication -
Baktericyna o aktywności gronkowcobójczej wytwarzana przez Staphylococcus xylosus - identyfikacja, oczyszczanie oraz wstępna charakterystyka
PublicationCelem badań prowadzonych w ramach realizacji niniejszej pracy była identyfikacja szczepów bakterii z rodzaju Staphylococcus produkujących substancje o działaniu przeciwbakteryjnym, w tym szczególnie bakteriocyny. W trakcie badań przesiewowych, których przedmiotem było 206 szczepów z kolekcji Katedry Technologii Leków i Biochemii Politechniki Gdaoskiej z gatunków Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis oraz Staphylococcus...
-
Właściwości otoczki hydratacyjnej wokół β-warstw o zróżnicowanym składzie aminokwasowym - analiza wyników dynamiki molekularnej
Publicationβ-warstwa to jedna z najczęściej spotykanych struktur drugorzędowych w białkach. Jak dotąd mechanizmy rządzące ustrukturyzowaniem wody w warstwie solwatacyjnej wokół tej struktury są słabo poznane [1]. W celu lepszego zrozumienia zjawiska hydratacji wokół struktur o konformacji β-warstwy przeprowadzono analizę wyników pochodzących z symulacji metodą dynamiki molekularnej β-warstw składających się z 8 równoległych nici o różnym...
-
Synthesis and biological activity of novel mycophenolic acid conjugates containing nitro-acridine/acridone derivatives
PublicationOpracowano warunki reakcji kwasu mykofenolowego z aminowymi pochodnymi akrydyn i akrydonów. Tak otrzymane koniugaty zostały scharakteryzowane, a następnie przebadane in vitro pod względem aktywności przeciwbiałaczkowej oraz immunosupresyjnej.
-
Application of Alanine Scanning to Determination of Amino Acids Essential for Peptide Adsorption at the Solid/Solution Interface and Binding to the Receptor: Surface-Enhanced Raman/Infrared Spectroscopy versus Bioactivity Assays
Publication -
2-Ethylphenyl acridine-9-carboxylate and 2,5-dimethylphenyl acridine-9-carboxylate
PublicationMetodą rentgenowskiej analizy strukturalnej oznaczono struktury estrów: trójskośnego 2-etylofenylowego oraz jednoskośnego 2,5-dimetylofenylowego kwasu akrydyno-9-karboksylowego. Oba związki w kryształach tworzą układy oddziaływań typu C-H...π oraz oddziaływań dyspersyjnych.
-
Synthesis and structure of selected quaternary N-(1,4-anhydro-5-deoxy-2,3-O-isopropylidene-D,L-ribitol-5-yl)ammonium salts.
PublicationOpracowano metody otrzymywania czwartorzędowych soli amoniowych, pochodnych rybitolu, zawierających reszty: pirydyny, 2-metylopirydyny, 3-karbamoilopirydyny, 4-(N,N-dimetyloamino)pirydyny, chinoliny oraz dwóch amin alifatycznych trimetyloaminy i trietyloaminy. Związki te powstają w reakcji 1,4-anhydro-2,3-O-izopropylideno-5-O-tozylo-D,L-rybitolu z odpowiednimi zasadami azotowymi.
-
Structure-activity relationship study of a small cyclic peptide H-c[Lys-Pro-Glu]-Arg-OH: a potent inhibitor of Vascular Endothelial Growth Factor interaction with Neuropilin-1
Publication -
Genotoxic effects of antitumor 1-nitroacridines C-857 and its novel analoque 4-methyl-1-nitroacridine C-1748
Publication4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. W przeprowadzonych badaniach nad pochodnymi C-1748 i C-857 zastosowano dwie metody badawcze: test kometowy oraz zmodyfikowany test mikrojąderkowy (CBMN assay). W teście kometowym wykazano wzrost uszkodzeń DNA w zależności od czasu i stężenia badanych pochodnych 1-nitroakrydyny. Badania aberracji chromosomalnych...
-
Pre-clinical toxicology and pathology of 9-(2'-hydroxyethylamino)-4-methyl-1-nitroacridine (C-1748), a novel anti-cancer agent in male Beagle dogs
PublicationPraca zawiera wyniki badań przedklinicznych i morfologicznych pochodnej akrydyny o symbolu C-1748 przeprowadzonych na psach. Wyznaczono maksymalną dawkę tolerowaną oraz przeprowadzono analizy zmiany składu krwi i morfologii jej komórek, pracy aminotransferaz, fosfokinaz, fosfataz i innych enzymów funkcjonalnych. Obserwowano też zachowanie się zwierząt. Stwierdzono, że związek ten wykazuje stosunkowo niską toksyczność, co przy obserwowanej...
-
2,7-Dihydro-3H-pyridazino[5,4,3-kl]acridin-3-one derivatives, novel type of cytotoxic agents active on multidrug-resistant cell lines. Synthesis and biological evaluation.
PublicationOtrzymano serię pirydazyno akrydyn-3-onów w reakcji 9-okso-9,10-dihydroakrydyno-1-karboksylanu etylu z POCl3, następnie dodanie odpowiedniej alkiloaminoalkilohydrazyny. Badane związki wykazują w porównaniu z referencyjnymi cytostatykami DX, MIT niższe wartości indeksu RI, a także niższe aktywności cytotoksyczne.
-
DNA modification by 1-nitroacridine derivatives. Comparison of 32P-Postlabeling and restriction enzyme analysis method for the detection of DNA adducts formed by 1-nitroacridines C-1748 and C-857
Publication4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny, zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. Metoda 32P-postlabellingu wykazała, że pochodne C-1748 i C-857 tworzą od 4-6 adduktów DNA w systemie komórkowym i bezkomórkowym o innym rozkładzie plam chromatograficznych, jednakże niezależnym od zastosowanego systemu aktywacyjnego. Metoda enzymatycznej analizy restrykcyjnej pozwoliła natomiast śledzić kinetykę...
-
ARGENTUM DNA topoisomerase inhibitors with acridine and acridone scaffold as a novel antifungal agents
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry according to DEC-24/2020/IDUB/I.3.3 agreement from 2020-11-17
-
Acridinone antitumor agents: C-1311, C-1330 and C-1305 are metabolized by flavin-containing monooxygenase isoenzymes: FMO1, FMO3 and FMO5 with different rates
PublicationRekombinantowe ludzkie monooksygenazy flawinowe: FMO1, FMO3, FMO5 indukują przemiany metaboliczne wybranych do badań pochodnych akrydonu. Biotransformacja związków C-1311, C-1330 i C-1305 przez FMO prowadzi do jednego produktu o strukturze N-tlenku. Wyniki badań wskazują, że najbardziej podatna na przemiany wobec FMO jest pochodna triazoloakrydonu C-1305. Wydaje się więc, że głównymi enzymami pierwszej fazy przemian metabolicznych...
-
Anna Dołęga prof. dr hab. inż.
People -
The immunoregulatory effects of edeine analogues in mice
PublicationZbadano właściwości immunoregulatorowe kilku, otrzymanych na drodze syntezy, uproszczonych analogów peptydowego antybiotyku edeiny w testach in vivo i in vitro z wykorzystaniem modelu mysiego. Jako związek referencyjny zastosowano edeinę B. Otrzymane peptydy wykazywały efekt stymulacyny na proliferację splenocytów z użyciem konkawaliny, podczas gdy zastosowanie mitogenu powodowało hamowanie proliferacji splenocytów. Peptydy hamowały...
-
The structurally similar TRFH domain of TRF1 and TRF2 dimers shows distinct behaviour towards TIN2
PublicationThe telomere repeat binding-factor 1 and 2 (TRF1 and TRF2) proteins of the shelterin complex bind to duplex telomeric DNA as homodimers, and the homodimerization is mediated by their TRFH (TRF-homology) domains. We performed molecular dynamic (MD) simulations of the dimer forms of TRF1TRFH and TRF2TRFH in the presence/absence of the TIN2TBM (TIN2, TRF-interacting nuclear protein 2, TBM, TRF-binding motif) peptide. The MD results...
-
Maria Jolanta Milewska prof. dr hab. inż.
PeopleMaria Jolanta Milewska, po ukończeniu Technikum Chemiczno-Mechanicznego w Wąbrzeźnie (specjalizacja: przetwórstwo tworzyw sztucznych) kontynuowała naukę na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej. W 1979 r. zdobywa tytuł mgr inżyniera na kierunku Chemia, o specjalizacji Lekka Synteza Organiczna. Studium Doktoranckie PG ukończyła w 1984 r. W 1983 r została zatrudniona na macierzystym wydziale w Katedrze Chemii Organicznej, początkowo...