Filters
total: 714
-
Catalog
Search results for: REGULATORY PEPTIDES
-
Zastosowanie algorytmu ewolucyjnego do uczenia neuronowego regulatora napięcia generatora synchronicznego. Evolutionary algorithm for training a neural network of synchronous generator voltage controller
PublicationNajpopularniejsza metoda uczenia wielowarstwowych sieci neuronowych -metoda wstecznej propagacji błędu - charakteryzuje się słabą efektywnością. Z tego względu podejmowane są próby stosowania innych metod do uczenia sieci. W pracy przedstawiono wyniki uczenia sieci realizującej regulator neuronowy, za pomocą algorytmu ewolucyjnego. Obliczenia symulacyjne potwierdziły dobrą zbieżność algorytmu ewolucyjnego w tym zastosowaniu.
-
Relative quantification of pork and beef in meat products using global and species-specific peptide markers for the authentication of meat composition
PublicationWe used global and species-specific peptide markers for a relative quantitative determination of pork and beef in raw and processed meat products made of the two meat species. Four groups of products were prepared (i.e., minced raw meats, sausages, raw and fried burgers) in order to represent products with different extents of food processing. In each group, the products varied in the pork/beef proportions. All products were analysed...
-
Least Squares Estimators of Peptide Species Concentrations Based on Gaussian Mixture Decompositions of Protein Mass Spectra
Publication -
Molecular dynamics study of a gelsolin-derived peptide binding to a lipid bilayer containing phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate
Publication -
UNRES-Dock—protein–protein and peptide–protein docking by coarse-grained replica-exchange MD simulations
Publication -
Renal Regulation of Potassium Homeostasis in Calves in the First Week of Life Including the Role of Atrial Natriuretic Peptide
Publication -
Investigation of Serine‐Proteinase‐Catalyzed Peptide Splicing in Analogues of Sunflower Trypsin Inhibitor 1 (SFTI‐1)
Publication -
99mTc-Galacto-RGD2: A Novel 99mTc-Labeled Cyclic RGD Peptide Dimer Useful for Tumor Imaging
PublicationThis study sought to evaluate [99mTc(HYNIC-Galacto-RGD2)-(tricine)(TPPTS)] (99mTc-Galacto-RGD2: HYNIC = 6-hydrazinonicotinyl; Galacto-RGD2 = Glu[cyclo[Arg-Gly-Asp-D-Phe-Lys(SAA-PEG2-(1,2,3-triazole)-1-yl-4-ethylamide)]]2 (SAA = 7-amino-L-glycero-L-galacto-2,6-anhydro-7-eoxyheptanamide, and PEG2 = 3,6-dioxaoctanoic acid); and TPPTS = trisodium triphenylphosphine-3,3',3''-trisulfonate) as a new radiotracer for tumor imaging. Galacto-RGD2...
-
Generation and Characterization of a DNA-GCN4 Oligonucleotide-Peptide Conjugate: The Impact DNA/Protein Interactions on the Sensitization of DNA
PublicationRadiotherapy, the most common therapy for the treatment of solid tumors, exerts its effects by inducing DNA damage. To fully understand the extent and nature of this damage, DNA models that mimic the in vivo situation should be utilized. In a cellular context, genomic DNA constantly interacts with proteins and these interactions could influence both the primary radical processes (triggered by ionizing radiation) and secondary reactions,...
-
Synthesis, Chemical Characterization and Multiscale Biological Evaluation of a dimericcRGD Peptide for Targeted Imaging of αVβ3 Integrin Activity
PublicationCyclic peptides containing the Arg-Gly-Asp (RGD) sequence have been shown to specifically bind the angiogenesis biomarker α V β3 integrin. We report the synthesis, chemical characterization, and biological evaluation of two novel dimeric cyclic RGD-based molecular probes for the targeted imaging of α V β3 activity (a radiolabeled version, 64Cu-NOTA-PEG4-cRGD2, for PET imaging, and a fluorescent version, FITC-PEG4-cRGD2, for in...
-
Krzysztof Lipiński dr hab. inż.
People -
Combined Effect of Sonication and Acid Whey on Antioxidant and Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitory Activities of Peptides Obtained from Dry-Cured Pork Loin
Publication -
Influence of amino acid sequence on the interaction of short peptides containing 3-[2-(9-anthryl)benzoxazol-5-yl]-alanine with β-cyclodextrin
Publication -
Application of safirinium N-hydroxysuccinimide esters to derivatization of peptides for high-resolution mass spectrometry, tandem mass spectrometry, and fluorescent labeling of bacterial cells
PublicationMass spectrometry methods are commonly used in the identification of peptides and biomarkers. Due to a relatively low abundance of proteins in biological samples, there is a need for the development of novel derivatization methods that would improve MS detection limits. Hence, novel fluorescent N-hydroxysuccinimide esters of dihydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-2-ium carboxylates (Safirinium P dyes) have been synthesized. The...
-
Algorytm automatycznego strojenia regulatorów PI serwonapędów w maszynie frezującej CNC z wykorzystaniem metody optymalizacji rojem cząstek
PublicationPublikacja traktuje o zagadnieniu automatycznego strojenia przemysłowych regulatorów liniowych. Przedstawiono proces projektowania i implementacji systemu zarówno w środowisku symulacyjnym, jak i rzeczywistym. Przeanalizowano wyniki badań porównujących jakość działania układu sterowania przy zestawach parametrów regulatorów otrzymanych różnymi metodami. Jako metodę służącą poszukiwaniu odpowienich nastaw regulatorów wykorzystano...
-
Optimal linear control theory in power system application
PublicationPrzedstawiono syntezę stabilizatora systemowego przy wykorzystaniu metodyki Hinf. Zaprojektowany regulator umożliwia uzyskanie lepszych rezultatów w porównaniu z regulatorem odniesienia w szerokim zakresie zmian punktu pracy.
-
Cyclic Dipeptides as Building Units of Nano- and Microdevices: Synthesis, Properties, and Structural Studies
Publication -
Multicopy Suppressor Analysis of Strains Lacking Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerases Identifies Three New PPIase Activities in Escherichia coli That Includes the DksA Transcription Factor
PublicationConsistent with a role in catalyzing rate-limiting step of protein folding, removal of genes encoding cytoplasmic protein folding catalysts belonging to the family of peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs) in Escherichia coli confers conditional lethality. To address the molecular basis of the essentiality of PPIs, a multicopy suppressor approach revealed that overexpression of genes encoding chaperones (DnaK/J and GroL/S),...
-
Wpływ obecnie stosowanych układów regulacji generatorów na możliwości pogłębienia awarii napięciowej
PublicationArtykuł przedstawia badania symulacyjne pracy generatora synchronicznego wyposażonego w wieloparametrowy regulator generatora o strukturach spotykanych obecnie w KSE. W pracy analizowano wpływu struktury i nastawień regulatora generatora synchronicznego na pracę systemu elektroenergetycznego w warunkach awarii napięciowej
-
Adenylate Kinase 4—A Key Regulator of Proliferation and Metabolic Shift in Human Pulmonary Arterial Smooth Muscle Cells via Akt and HIF-1α Signaling Pathways
Publication -
Cis/trans conformational equilibrium across the N-methylphenylalanine2- N-methylphenylalanine3 peptide bond of arginine vasopressin analogs
Publication -
Peptide splicing in a double‐sequence analogue of trypsin inhibitor SFTI‐1 substituted in the P1 positions by peptoid monomers
Publication -
Structural changes of a simple peptide—Trpzip-1—in aqueous solutions and the corresponding hydration phenomena under the influence of temperature
PublicationTrpzip-1, a simple β-hairpin, is a rare example of peptide with stable secondary structure and can be a convenient model to study temperature-related processes that potential prion or amyloid proteins undergo. Although its sequence is simple, the exact processes which the peptide undergoes in aqueous solutions are quite complex and not well understood. The selection of well-established experimental (DSC, FTIR) and theoretical methods...
-
Understanding the interactions between protein stabilizers and the peptide bond through the analysis of the volumetric and compressibility properties for the model systems
PublicationThis work confirms our earlier supposition, that volumetric and acoustic parameters for simple model proposed by us are directly related to stabilizing/destabilizing effect of osmolytes on proteins structure. The apparent molar volumes, V and the apparent molar isentropic compressions, KS,, of glycine and N,N,N –trimethylglycine (betaine) were determined from densities and speed of sound measurements in aqueous solution of N-methylacetamide...
-
Results on parametrical robustifiction of CGPC systems.
PublicationPrzedmiotem pracy jest stochastyczno-deterministyczny algorytm iteracyjny uodparniający układ sterowania predykcyjnego CGPC na parametryczną niepewność modelu sterowanego obiektu. Niezależnie od wybranej metody projektowania regulatora CGPC, nie ma gwarancji że projektowany regulator utworzy wraz z obiektem odporny układ sterowania.
-
Copper(II) coordination properties of GxG peptides: Key role of side chains of central residues on coordination of formed systems; combined potentiometric and ITC studies
Publication -
Influence of Dimerization of Lipopeptide Laur-Orn-Orn-Cys–NH2 and an N-terminal Peptide of Human Lactoferricin on Biological Activity
Publication -
Binding modes of a new epoxysuccinyl–peptide inhibitor of cysteine proteases. Where and how do cysteine proteases express their selectivity?
Publication -
Lipidated Analogs of the LL-37-Derived Peptide Fragment KR12—Structural Analysis, Surface-Active Properties and Antimicrobial Activity
Publication -
Inhibitory activity of double‐sequence analogues of trypsin inhibitor SFTI‐1 from sunflower seeds: an example of peptide splicing
Publication -
Peptide bond modification. I. Simple and efficient method of Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH synthesis.
PublicationZaprezentowano prostą i efektywną metodę syntezy obu enancjomerów t-butoksykarbonylo chronionego pseudo dipeptydu (R) oraz (S)-Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH.
-
Development of a Peptide Derived from Platelet-Derived Growth Factor (PDGF-BB) into a Potential Drug Candidate for the Treatment of Wounds
PublicationObjective: This study evaluated the use of novel peptides derived from platelet-derived growth factor (PDGF-BB) as potential wound healing stimulants. One of the compounds (named PDGF2) was subjected for further research after cytotoxicity and proliferation assays on human skin cells. Further investigation included evaluation of: migration and chemotaxis of skin cells, immunological and allergic safety, the transcriptional analyses...
-
Cu(II) complexes with peptides from FomA protein containing -His-Xaa-Yaa-Zaa-His and -His-His-motifs. ROS generation and DNA degradation
Publication -
Wpływ struktury, algorytmów działania oraz nastawień układów regulatorów transformatorów 110/SN na możliwość powstania i przebieg awarii napięciowej
PublicationReferat przedstawia zagadnienia związane z możliwością pogłębienia deficytu mocy biernej w wyniku działania regulatorów transformatorów 110kV/SN. Rozważania teoretyczne rozszerzono o wyniki pomiarów oraz badania symulacyjne. Wnioski przedstawione w końcowej części referatu powstały w wyniku krytycznej analizy stanu obecnego pracy układów regulacji stacji 110kV/SN.
-
Analiza sterowania ułamkowego PIλDμ mocą reaktora jądrowego
PublicationW artykule przedstawiono syntezę regulatora PIλDμ niecałkowitego rzędu dla potrzeb sterowania mocą reaktora jądrowego lekko wodnego określanego, jako typu PWR (Pressurized Water Reactor). W tym celu wykorzystano nieliniowy model matematyczny reaktora PWR o parametrach skupionych obejmujący procesy generacji i wymiany ciepła oraz termicznych efektów reaktywnościowych. Nastawy regulatora PIλDμ niecałkowitego rzędu dobrano w sposób...
-
Nowy algorytm regulacji transformatorów zasilających sieć rozdzielczą
PublicationW niniejszym artykule opisano przykład nowego inteligentnegoalgorytmu regulatora transformatora. Układregulacji transformatorów 110/SN, z proponowanym algorytmemdziałania, umożliwia automatyczne dostosowaniealgorytmu działania regulatorów do aktualnych stanówsystemu elektroenergetycznego (np. lawina napięcia)i w ten sposób może wpłynąć na wzrost bezpieczeństwaelektroenergetycznego.
-
Data regarding a new, vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for the construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins, as well as biological effects of selected polypeptides obtained using this method
PublicationApplications of bioactive peptides and polypeptides are emerging in areas such as drug development and drug delivery systems. These compounds are bioactive, biocompatible and represent a wide range of chemical properties, enabling further adjustments of obtained biomaterials. However, delivering large quantities of peptide derivatives is still challenging. Several methods have been developed for the production of concatemers –...
-
Comparative study of learning methods for artificial network
PublicationW artykule przedstawiono wyniki badań porównawczych metod uczenia sieci neuronowych takich jak: metoda propagacji wstecznej błędów, rekurencyjna metoda najmniejszych kwadratów, metoda Zangwill'a, metoda algorytmów ewolucyjnych. Celem tych badań jest dobieranie najefektywniejszej metody uczenia do projektowania adaptacyjnego neuronowego regulatora napięcia generatora synchronicznego.metody uczenia, sieć neuronowa, neuronowy regulator...
-
Free-surface elevation in open vortex flow controls
PublicationRotational form of fluid motion is complex, but very important in science and technology. The paper is devoted to the hydraulic mechanism of flow in open vortex flow controls, or regulators. The velocity field was described by the kinematic model, and intensity of rotation - by means of the energy balance between the input and dissipation. In consequence some algebraic expresions were obtained, which can be useful in approximated...
-
Identification of Substrates of Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl Cis/Trans Isomerases and Their Collective Essentiality in Escherichia Coli
PublicationProtein folding often requires molecular chaperones and folding catalysts, such as peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs). The Escherichia coli cytoplasm contains six well-known PPIs, although a requirement of their PPIase activity, the identity of their substrates and relative enzymatic contribution is unknown. Thus, strains lacking all periplasmic and one of the cytoplasmic PPIs were constructed. Measurement of their PPIase...
-
Effect of in vitro gastro‐pancreatic digestion on antioxidant activity of low‐molecular‐weight (<3.5 kDa) peptides from dry‐cured pork loins with probiotic strains of LAB
Publication -
Impact of sea wave stochastic characteristics on ship propulsion control system design.
PublicationWybrano do rozważań (symulacji komputerowej) 8 rejonów morskich w 4 porach roku. Określono w nich gęstość widmową amplitudy fali morskiej. Założono, upraszczająco, regulator typu PID. Dla wybranego typu statku wykonane badania symulacyjne odnoszą się do wybranych rejonów mórz i pór roku. Okazuje się, że dobierając zarówno współczynnik wzmocnienia regulatora jak i stałą całkowania, można minimalizować wartości wariancji, na przykład,...
-
Design, synthesis and in vitro biological evaluation of a small cyclic peptide as inhibitor of vascular endothelial growth factor binding to neuropilin-1
Publication -
Osteoblast and bacterial cell response on RGD peptide‐functionalized chitosan coatings electrophoretically deposited from different suspensions on Ti13Nb13Zr alloy
PublicationMetallic materials for long-term load-bearing implants still do not provide high antimicrobial activity while maintaining strong compatibility with bone cells. This study aimed to modify the surface of Ti13Nb13Zr alloy by electrophoretic deposition of a chitosan coating with a covalently attached Arg-Gly-Asp (RGD) peptide. The suspensions for coating deposition were prepared in two different ways either using hydroxyacetic acid...
-
Phage-Directed Synthesis of Photoluminescent Zinc Oxide Nanoparticles under Benign Conditions
PublicationBiological systems, especially bacteriophages and peptides, are an attractive green alternative to other known methods of nanoparticle synthesis. In this work, for the first time, bacteriophages were employed to synthesize a specific peptide, capable of producing nanoparticles (NPs). Derivatives of M13 bacteriophage exposing a ZnO-binding peptide (TMGA-LGLKWPV) on either pIII or pVIII phage coat protein were constructed and used...
-
Implementacja algorytmu regulacji predykcyjnej MPC w sterownikach programowalnych
PublicationSterowniki programowalne PLC (ang. Programmable Logic Controllers) są główną przemysłową platformą implementacji algorytmów sterowania bezpośredniego. Standardowo producenci PLC udostępniają programistom jedynie podstawowe algorytmy sterowania. W niniejszym artykule rozważana jest implementacja w PLC zaawansowanej metody sterowania – algorytmu MAC/MPC (ang. Model Algorithmic Control/Model Predictive Control) ze względu na jego...
-
Nowy algorytm regulacji transformatorów zasilających siec rozdzielczą
PublicationW niniejszym artykule opisano przykład nowego inteligentnego algorytmu regulatora transformatora. Układ regulacji transformatorów 110/SN, z proponowanym algorytmem działania, umożliwia automatyczne dostosowanie algorytmu działania regulatorów do aktualnych stanów systemu elektroenergetycznego (np. lawina napięcia) i w ten sposób może wpłynąć na wzrost bezpieczeństwa elektroenergetycznego.
-
Adaptacyjny algorytm regulacji transformatorów zasilających sieć rozdzielczą
PublicationW niniejszym artykule opisano przykład nowego inteligentnego regulatora transformatora. Układ regulacji transformatorów 110/SN, z proponowanym algorytmem działania, umożliwia automatyczne dostosowanie algorytmu działania regulatorów do aktualnych stanów systemu elektroenergetycznego (np. lawina napięcia) i w ten sposób może wpłynąć na wzrost bezpieczeństwa elektroenergetycznego.
-
Fuzzy control of a ship propulsion system
PublicationReferat przedstawia analizę i syntezę układu sterowania napędu statku przy zastosowaniu teorii sterowania rozmytego. Układ napędowy jest układem bezpośrednim, wyposażonym w silnik spalinowy wolnoobrotowy oraz śrubę okrętową ze zmiennym skokiem. Przedstawiono także wyniki badań symulacyjnych a następnie porównano wyniki badań symulacyjnych przy zainstalowaniu regulatora rozmytego z analogicznymi wynikami, gdy zastosowano regulator...
-
Molecular basis of lipopolysaccharide heterogeneity in Escherichia coli: envelope stress-responsive regulators control the incorporation of glycoforms with a third 3-deoxy-α-D-manno-oct-2-ulosonic acid and rhamnose.
PublicationMass spectrometric analyses of lipopolysaccharide (LPS) from isogenic Escherichia coli strains with nonpolar mutations in the waa locus or overexpression of their cognate genes revealed that waaZ and waaS are the structural genes required for the incorporation of the third 3-deoxy-α-D-manno-oct-2-ulosonic acid (Kdo) linked to Kdo disaccharide and rhamnose, respectively. The incorporation of rhamnose requires prior sequential incorporation...