Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 2239
wybranych: 1665
-
Katalog
- Publikacje 1665 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 22 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 2 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 295 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 9 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 7 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 2 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 1 wyników po odfiltrowaniu
- Aparatura Badawcza 6 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 29 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 40 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 160 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: DSB PROTEINS
-
The Characteristics of New SSB Proteins from Metagenomic Libraries and Their Use in Biotech Applications
Publikacja -
DSC and electrophoretic studies on protein denaturation of Anodonta woodiana (Lea, 1834)
Publikacja -
Function and Frustration of Multi-Drug ABC Exporter Protein and Design of Model Proteins for Drug Delivery Using Protein Hydration Thermodynamics
Publikacja -
Elastic-contractile model proteins: Physical chemistry, protein function and drug design and delivery
Publikacja -
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublikacjaWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublikacjaW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide
PublikacjaDsb proteins control the formation and rearrangement of disulfide bonds during the folding of secreted and membrane proteins in bacteria. DsbG, a member of this family, has disulfide bond isomerase and chaperone activity. Here, we present two crystal structures of DsbG at 1.7- and 2.0-Angstrom resolution that are meant to represent the reduced and oxidized forms, respectively. The oxidized structure, however, reveals a mixture...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublikacjaTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublikacjaW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
Extension of the Unres Package for Physics-Based Coarse-Grained Simulations of Proteins and Protein Complexes to Very Large Systems
Publikacja -
Impact of selected amino acids of HP0377 (Helicobacter pylori thiol oxidoreductase) on its functioning as a CcmG (cytochrome c maturation) protein and Dsb (disulfide bond) isomerase
Publikacja -
Proteins
PublikacjaStruktura białek wpływa na ich wartość odżywczą, właściwości funkcjonalne wżywności oraz reakcje w surowcach i produktach żywnościowych. Warunki prze-chowywania oraz obróbki w przemyśle i w czasie przygotowywania kulinarnegowywołują przemiany białek istotne dla jakości żywności. Przez celowe, enzy-matyczne i chemiczne modyfikowanie składu i struktury białek można wpływaćna ich właściwości funkcjonalne w żywności i wartość...
-
Application of SSB-like protein from Thermus aquaticus in multiplex PCR of human Y-STR markers identification
PublikacjaW tej publikacji prezentujemy zastosowanie białka SSB-podobnego Thermus aquaticus (TaqSSB) w reakcji multiplex PCR w celu identyfikacji markerów ludzkiego Y-STR. Wykorzystanie termostabilnego białka TaqSSB chroni lub redukuje tworzenie przez startery struktur dimerycznych, które powodują hamowanie hybrydyzacji starterów do badanego DNA i redukują ilość starterów dostępnych w reakcji PCR.
-
Metoda obliczania skutków wdrożenia strategii zarządzania popytem na energię elektryczną (DSM/DSR) w systemach elektroenergetycznych
PublikacjaW niniejszej rozprawie poruszono zagadnienie strategii zarządzania popytem na energię elektryczną (DSM/DSR) i sposobów obliczania efektów ich wdrożenia. W związku z tym opisano oczekiwane efekty wdrożenia tych rozwiązań oraz ich zalety i wady. Zaprezentowano i przeanalizowano istniejące już metody obliczania skutków wdrożenia DSM/DSR. Zaproponowano nową metodę, która poprzez formę algorytmu uporządkowuje proces obliczania i oceny...
-
A DSC and NMR-Relaxation study of the molecular mobility of water protons interacting with chemically modified starches
PublikacjaChanges in the mobility of water protons in the chemically modified starches (CMS)–water system are studied by differential scanning calorimetry and NMR relaxation. The amounts of unfrozen water at negative temperatures and additional (after gelation) unfrozen for CMS are lower than those for native starch. The proton spin–spin relaxation time T2 for CMS samples, conventionally attributed to the water fraction in starch granules,...
-
Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi
PublikacjaZidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....
-
Molecular mobility of water protons under interaction with chemically modified starches. DSC and HMR-relaxation investigations
PublikacjaThe change of water protons mobility in the system chemically modified starches – water were investigated by DSC and NMR-relaxation methods. The amount of unfrozen water at subzero temperature as well as additional unfrozen water which appears after gelatinization have lower values for chemically modified starches in comparison with the native starch. The proton spin-spin relaxation time Т2 for chemically modified starch samples,...
-
The Role of Proteins in Food
PublikacjaThis chapter describes the effect of proteins on the sensory attributes and the biological value and safety of foods. The role of proteins depends on their amino acid composition and structure, on changes due to storage and processing, as well as on interactions with other food components. The effect on the sensory quality of foods is brought about by hydrophobicity, solubility, water holding capacity, gelling, film formation,...
-
DAB vs DAB+ Radio Broadcasting: a Subjective Comparative Study
PublikacjaIn the age of digital media, delivering high quality content to consumers is one of the most demanding tasks. There exist numerous broadcasting standards, with different pros and cons, and the DAB/DAB (Digital Audio Broadcasting) system is one of the most popular among them. From an engineer’s perspective, efficient resource management under limited bandwidth conditions has always been a challenge. In this paper a subjective quality...
-
Activity-based protein profiling guided identification of urine proteinase 3 activity in subclinical rejection after renal transplantation
Publikacja -
Conservation and diversity of MutS proteins
PublikacjaThe homologues of MutS, mismatch repair protein, exist in all prokaryotes, with the exception of Actinobacteria, Mollicutes and part of the Archaea. Multiple alignments of 316 MutS amino acid sequences from 169 species revealed conserved residues and sequence motifs distinguishing MutS homologues. All MutS homologues show high conservation within the ATPase domain. MutS1, the homologue responsible for DNA mismatch recognition,...
-
Concentration of proteins in the whey stream
PublikacjaZastosowano metodę separacji pianowej do odzyskiwania białka z serwatki. Wykazano silny wpływ prędkości powietrza w kolumnie, początkowego stężenia białka w serwatce i pH roztworu na przebieg i skuteczność flotacji. Współczynnik wzbogacenia maleje ze wzrostem prędkości przepływu powietrza oraz ze wzrostem początkowego stężenia białka serwatkowego. Najwyższą wartość współczynnika wzbogacenia uzyskano dla pH naturalnej serwatki.
-
Conserved motifs of MutL proteins
PublikacjatThe MutL protein is best known for its function in DNA mismatch repair (MMR). However, there isevidence to suggest that MutL is not only the linker connecting the functions of MutS and MutH in MMR,but that it also participates in other repair systems, such as Very Short Patch (VSP), Base Excision (BER)and Nucleotide Excision Repair (NER). This study set out to identify the most highly conserved aminoacid sequence motifs in MutL...
-
Diagnostyka obiektów przemysłowych z wykorzystaniem wspólnej magistrali usług DIAGNOSTIC SERVICE BUS DSB
PublikacjaKorzystając ze znanego pojęcia magistrali, w pracy przedstawia się sposób przystosowania i wykorzystania magistrali usług w systemie diagnostyki obiektów przemysłowych. Koncepcja takiego środka komunikacyjnego opiera się na architekturze SOA (z architekturą zorientowanej na usługi). Koncepcja ta stanowi metodę rozwiązania problemów wydajnościowych rozwijanego projektu pt. "Sieciowy Monitor Obiektu" (SMO). Wspólna szyna danych zwiększa...
-
UNRES-Dock—protein–protein and peptide–protein docking by coarse-grained replica-exchange MD simulations
Publikacja -
BADANIE JAKOŚCI TRANSMISJI W SYSTEMACH RADIOFONII CYFROWEJ DAB I DAB+
PublikacjaW dobie mediów cyfrowych kluczowym elementem jest dostarczanie treści wysokiej jakości. Wśród systemów radiofonii cyfrowej do najpopularniejszych należą standardy DAB i DAB+ (Digital Audio Broadcasting). Przy konfiguracji multipleksu ważne jest właściwe zarządzanie zasobami w ramach pojedynczego kanału radiowego. W artykule przedstawiono wyniki badań subiektywnych, dotyczących jakości transmisji w systemach DAB i DAB+, przeprowadzonych...
-
Antioxidants and proteins in ethylene-treated kiwifruits
PublikacjaW pracy porównano właściwości przeciwutleniające i profil białek owoców kiwi poddanych działaniu etylenu i powietrza. Wysokie współczynniki korelacji między całkowitą zawartością fenoli i właściwościami przeciwutleniającymi uzyskano dla trzech metod określania właściwości przeciwutleniających: ABTS, TEAC i CUPRAC. W paśmie białek owoców kiwi rozdzielonych za pomocą elektroforezy stwierdzono różnice w paśmie siarczanu dodecylu sodu...
-
The role of proteins in food. Chapter 6
PublikacjaStruktura i konformacja wpływają na biologiczne oraz funkcjonalne właściwości białek i na ich rolę w tworzeniu pożądanych cech produktów żywnościowych. Właściwości funkcjonalne to rozpuszczalność w środowisku wodnym o różnej sile jonowej, wodochłonność oraz zdolność żelowania, tworzenia błon, emulgowania lipidów i pienienia się. Białka mięsa, ryb, mleka, jaj, nasion roślin strączkowych, nasion zbóż oraz drobnoustrojów różnią się...
-
Molecular Dynamics Studies on Amyloidogenic Proteins
Publikacja -
Molecular Dynamics Studies on Amyloidogenic Proteins
Publikacja -
Targeting shelterin proteins for cancer therapy.
PublikacjaAs a global health challenge, cancer prompts continuous exploration for innovative therapies that are also based on new targets. One promising avenue is targeting the shelterin protein complex, a safeguard for telomeres crucial in preventing DNA damage. The role of shelterin in modulating ataxia- telangiectasia mutated (ATM) and ataxia-telangiectasia and Rad3-related (ATR) kinases, key players in the DNA damage response (DDR),...
-
New plasma preparation approach to enrich metabolome coverage in untargeted metabolomics: plasma protein bound hydrophobic metabolite release with proteinase K
Publikacja -
Characterization of a single-stranded DNA-binding-like Protein from Nanoarchaeum equitans - a nucleic acid binding protein with broad substrate specificity
PublikacjaBackground SSB (single-stranded DNA-binding) proteins play an essential role in all living cells and viruses, as they are involved in processes connected with ssDNA metabolism. There has recently been an increasing interest in SSBs, since they can be applied in molecular biology techniques and analytical methods. Nanoarchaeum equitans, the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota, is a hyperthermophilic, nanosized,...
-
Novel DNA-binding protein from Nanoarchaeum equitans Kin4-M binds all kinds of nucleic acids
PublikacjaNanoarchaeum equitans is the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota and stands out as one of the tiniest known living organism. What is more it has smallest genome, which is only 490.885 base pairs long. It is also one of the most compact genomes. According to predictions about 95% of the DNA encodes proteins or stable RNA. Nanoarchaeum equitans lacks genes for most vital metabolic pathways including lipid, cofactor,...
-
The Protein Folding Problem
Publikacja -
The measurement of conformational stability of proteins adsorbed on siloxanes
Publikacja -
Molecular basis of TRF proteins and their interactions with peptides
Publikacja -
1.21 Computation of Structure, Dynamics, and Thermodynamics of Proteins
Publikacja -
Coarse-Grained Models of Proteins: Theory and Applications
Publikacja -
Computational techniques for efficient conformational sampling of proteins
Publikacja -
Influence of Osmolytes on Protein and Water Structure: A Step To Understanding the Mechanism of Protein Stabilization
PublikacjaResults concerning the thermostability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions with stabilizing osmolytes, trimethylamine-N-oxide (TMAO), glycine (Gly), and its N-methyl derivatives, N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), and N,N,N-trimethylglycine (betaine, TMG), have been presented. The combination of spectroscopic (IR) and calorimetric (DSC) data allowed us to establish a link between osmolytes’ influence on...
-
DSP techniques for determining ''Wow'' distortions
PublikacjaArtykuł przedstawia opis algorytmów do wyznaczania charakterystyki zniekształceń kołysania dźwięku. Są to algorytmy: śledzenia przydźwięku sieciowego, śledzenia pozostałości magnetycznej prądu podkładu wielkich częstotliwości, adaptacyjnej analizy środka ciężkości widma dla wybranej części zniekształconego sygnału. Przedstawione algorytmy pozwalają na implementację programową i sprzętową.
-
Towards a precise model of DSM economics
PublikacjaRozdział podejmuje zagadnienia związane z opłacalnością zastosowania metod dziedzinowych (ang. Domain-Specific Modeling). Omówiono cechy charakterystyczne metod dziedzinowych i powiązanej z nimi technologii. Przedstawiono model kosztów pokrywający koszty początkowe, koszty utrzymania oraz koszty i zyski powiązane z fazą wytwarzania z zastosowaniem automatyzacji. Zaprezentowano model referencyjny kosztów przy tradycyjnym wytwarzaniu...
-
RESOURCE ALLOCATION IN DAB+ BROADCASTING SYSTEM
PublikacjaWith over two billion receivers operating worldwide, radio transmission is by far the most accessible medium. It has been a part of our lives since the 1920’s and has become one of the most trusted and friendly mass media. Today, its popularity is still strong, despite the outcome of many electronic media. In order to transform the radio into a viable medium of the 21st century, it will have to migrate from analogue to digital...
-
DSP techniques in wow defect evaluation
PublikacjaReferat przedstawia dwie metody określania przebiegu pasożytniczego drżenia dźwięku. Obie wykorzystują analizę pasożytniczych artefaktów. Wybrane artefakty to: przydźwięk sieciowy i wysokoczęstotliwościowy prąd podkładu. Precyzyjny przebieg zniekształcenia kołysania oblicza się wykorzystując informacje zawarte w widmie sygnałów, a uzyskane poprzez STFT lub modelowanie AR. Referat zawiera opis eksperymentów i uzyskane wyniki.
-
miRNAs in Signal Transduction of SMAD Proteins in Breast Cancer
Publikacja -
Denaturation of proteins by surfactants studied by the Taylor dispersion analysis
Publikacja -
The construction of bifunctional fusion proteins consisting of MutS and GFP
Publikacja -
Molecular Recognition in Complexes of TRF Proteins with Telomeric DNA
PublikacjaTelomeres are specialized nucleoprotein assemblies that protect the ends of linear chromosomes. In humans and many other species, telomeres consist of tandem TTAGGG repeats bound by a protein complex known as shelterin that remodels telomeric DNA into a protective loop structure and regulates telomere homeostasis. Shelterin recognizes telomeric repeats through its two major components known as Telomere Repeat-Binding Factors, TRF1...
-
Recent Developments in Data-Assisted Modeling of Flexible Proteins
PublikacjaMany proteins can fold into well-defined conformations. However, intrinsically-disordered proteins (IDPs) do not possess a defined structure. Moreover, folded multi-domain proteins often digress into alternative conformations. Collectively, the conformational dynamics enables these proteins to fulfill specific functions. Thus, most experimental observables are averaged over the conformations that constitute an ensemble. In this...