Search
Filters
total: 2039
-
Catalog
- Publications 1727 available results
- Journals 13 available results
- Conferences 1 available results
- People 74 available results
- Inventions 14 available results
- Projects 38 available results
- Laboratories 3 available results
- Research Teams 7 available results
- e-Learning Courses 76 available results
- Events 4 available results
- Open Research Data 82 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: WIĄZANIE ZWIĄZKÓW Z DNA
-
Effects of metallic silver particles on resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA.
PublicationZbadano wpływ filmów wysepek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donorem i akceptorem były odpowiednio 4´,6 diamidyno-2-fenylindon i jodek propydyny. Zmierzone dla tego układu czasy zaniku i widma fluorescencji pokazują, że sąsiedztwo cząstek srebra dramatycznie zwiększa promień Forstera, a tym samym i przekazywanie energii w znakowanym DNA.
-
Synteza i badania strukturalne związków kompleksowych miedzi(I) i rtęci(II) z wybranymi ligandami tioamidowymi
PublicationPrzedstawiona rozprawa doktorska poświęcona jest związkom tiokarbonylowym (wybranym tioamidom i tiomocznikom) oraz ich połączeniom kompleksowym z halogenkami miedzi(I) i rtęci(II). Istota i cel takich badań przedstawione są we wstępie pracy. W części teoretycznej opisane zostały kluczowe pierwiastki wchodzące w skład syntezowanych związków kompleksowych (siarka, miedź i rtęć), jak również tioamidy i tiomoczniki. Szczególna uwaga...
-
Two-photon induced fluorescence of Cy5-DNA in buffer solution and on silver island film
PublicationOpisano fluorescencję barwnika CY5 połączonego z DNA w roztworze buforowym na wysepkach srebrowych.
-
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublicationA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
Kinetyka przemian związków azotu w obiektach hydrofitowych z poziomym i pionowym przepływem ścieków.
PublicationW pracy przedstawiono charakterystykę usuwania związków azotu w systemach złożonych ze złóż hydrofitowych z poziomym i pionowym przepływem ścieków.Wyznaczono stałe szybkości usuwania azotu ogólnego oraz mineralizacji azotu amonowego dla złóż z pionowym i poziomym przepływem ścieków oraz określono wydajność procesu amonifikacji, nitryfikacji i denitryfikacji.M.in.wykazano,że stała szybkość reakcji usuwania azotu ogólnego...
-
DNA and its Metaphors
Publication -
UDP-glukuronylotranferazy w metabolizmie detoksykacyjnym i aktywacyjnym związków endogennych oraz ksenobiotyków
PublicationGlukuronidacja jest główną drogą koniugacji w szlakach metabolizmu i wydalania związków endogennych oraz ksenobiotyków. Reakcja ta jest katalizowana przez UDP-glukuronylotransferazy, UGT, dla których substratami są bilirubina, hormony steroidowe, tyroidowe i kwasy żółciowe, oraz związki egzogenne, w tym leki, związki kancerogenne, chemiczne zanieczyszczenia środowiska i składniki żywności. Z terapeutycznego punktu widzenia szczególnie...
-
Zastosowanie technik dwuwymiarowych w analizie frakcji lotnej i oznaczaniu związków bioaktywynych owoców jagody kamczackiej
PublicationDotychczasowe doniesienia literaturowe wskazują, że owoce strefy borealnej, do których należy popularna w Polsce aronia, są źródłem cennych składników odżywczych i prozdrowotnych. Podobnie jagoda kamczacka, należąca do tej grupy owoców, może stanowić źródło substancji istotnych dla ludzkiej diety. Jednakże aktualny stan wiedzy o składzie chemicznym owoców jagody kamczackiej ogranicza się głównie do informacji dotyczących całkowitej...
-
Increased concentration of Taq DNA polymerase as a solution for GC-rich templates from clinical and environmental samples
PublicationDNA polymerase is an enzyme which plays crucial role in replication and DNA repair. It found application in PCR (polymerase chain reaction) where catalyses process of in vitro DNA synthesis. To meet the demands posed by mod- ern diagnostic, molecular biology or genetic engineering it is necessary to improve DNA polymerases to obtain new or better features useful in these fields. So far implemented modifications in majority are...
-
Klasyfikacja dna morskiego na podstawie kątowej zależności cech echa z sonaru wielowiązkowego
PublicationPrzedstawiono metodę rozpoznawania i klasyfikacji rodzaju dna morskiego opartą na przetwarzaniu echa z sonaru wielowiązkowego. Metoda ta polega na obliczaniu zbioru parametrów obwiedni ech dla poszczególnych wiązek, podobnie jak w metodach wykorzystujących echosondy jednowiązkowe. Następnie estymowana jest zależność wartości poszczególnych parametrów od kąta wiązki oraz badane jest powiązanie otrzymanej zależności z rodzajem dna...
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublicationAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublicationTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
Przegląd, analiza działania i ocena algorytmów sterowania stężeniem tlenu z wykorzystaniem pomiarów związków azotu
PublicationOczyszczalnia ścieków jest złożonym przemysłowym systemem sterowania. Stężenie tlenu jest podstawowym parametrem wpływającym na efektywność zachodzenia procesów biologicznych w oczyszczalni ścieków. W artykule dokonano przeglądu podstawowych algorytmów sterowania stężeniem tlenu z użyciem dodatkowych pomiarów wybranych związków azotu. Przedstawiono prace badawcze z ostatnich kilkunastu lat i dokonano ich oceny.
-
WPŁYW WEWNĘTRZNYCH ŹRÓDEŁ WĘGLA ORGANICZNEGO NA EFEKTYWNOŚĆ USUWANIA ZWIĄZKÓW BIOGENNYCH METODĄ OSADU CZYNNEGO
PublicationWpływ wewnętrznych źródeł węgla organicznego w formie koloidalnej i zawiesinowej na efektywność usuwania związków biogennych metodą osadu czynnego określono na podstawie badań szybkości denitryfikacji (z ang. NUR) oraz uwalniania i anoksycznego poboru fosforanów (z ang. PRR/PUR). Doświadczenia przeprowadzono z użyciem dwóch równoległych reaktorów nieprzepływowych ze ściekami oczyszczonymi mechanicznie (bez podczyszczania i podczyszczonymi...
-
The influence of the substrate temperature on the preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublicationPrzeanalizowano wpływ temperatury na formowanie warstw DNA. Sprawdzono wpływ stabilizatorów na jakość otrzymanych próbek. Stwierdzono, że optymalnymi warunkami przygotowywania filmów do badań w warunkach próżniowych jest - 10 st. C przy minimalnej zawartości NaOH.
-
Photostability pf Cy3 and Cy5-labeled DNA in the presence of metallic silver particles
PublicationZbadano wpływ cząstek metalicznego srebra na fotostabilność oligomerów DNA kowalencyjnie związanych z Cy3 lub Cy5. Zbliżenie fluoroforów do cząstek srebra powodowało zwiększenie intensywności fluorescencji i pojawienie się frakcji emisji bardziej odpornej na wybielanie.
-
Elektroniczne papierosy –(nie)bezpieczne palenie? Cz.2 Metody oznaczania związków obecnych w płynie i aerozolu
PublicationWzrost zainteresowania nad stosowaniem elektronicznych papierosów wymaga opracowania nowych procedur analitycznych, które pozwolą na prowadzenie kontroli jakości tych wyrobów. Brak jest miarodajnych wyników badań umożliwiających kompleksową analizę składu jakościowego i ilościowego płynu jak i aerozolu. Sytuacja ta budzi wiele obaw, ponieważ niemożliwa jest realna ocena zagrożenia na jakie narażony jest użytkownik elektronicznego...
-
Materiały wewnętrzne jako źródło lotnych związków organicznych w powietrzu wewnętrznym = Indoor building materials as source of volatile organic compound
PublicationW pracy przedstawiono źródła lotnych związków organicznych w powietrzu wewnętrznym, ze szczególnym uwzględnieniem materiałów budowlanych i materiałów wykorzystywanych jako elementy wyposażenia pomieszczeń. Omówiono sposób prowadzenia badań przesiewowych oraz badań z zastosowaniem komory testowej, które pozwoliły na ocenę natężenia strumienia emisji lotnych związków organicznych z materiałów wewnętrznych.
-
Toward Smart Innovation Engineering: Decisional DNA-Based Conceptual Approach
PublicationABSTRACT Knowledge and experience are essential requirements for product innovation. The presented paper proposes a systematic approach for product innovation support using a Smart Knowledge Management System comprising a Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). This proposed system is dynamic in nature because it updates itself every time a new decision related to innovation is made. Through this...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł edycji chromatogramu
PublicationModuł edycji chromatogramu jest częścią większej aplikacji, służącej do wspomagania przetwarzania danych pochodzących z sekwencjonowania DNA. Aplikacja skonstruowana jest z odrębnych, samodzielnych programów, które współpracują dwiema drogami - poprzez popularne formaty plików, co umożliwia wprowadzenie do modułów danych opracowanych częściowo w aplikacjach zewnętrznych, oraz poprzez przesyłanie danych pomiędzy modułami, co usprawnia...
-
Decisional-DNA Based Smart Production Performance Analysis Model
Publicationn order to allocate resources effectively according to the production plan and to reduce disturbances, a framework for smart production performance analysis is proposed in this article. Decisional DNA based knowledge models of engineering objects, processes and factory are developed within the proposed framework. These models are the virtual representation of manufacturing resources, and with help of Internet of Things, are capable...
-
DNA methylation in cancer development, diagnosis and therapy-multiple opportunities for genotoxic agents to act as methylome disruptors or remediators
PublicationThe role of DNA methylation and recently discovered hydroxymethylation in the function of the human epigenome is currently one of the hottest topics in the life sciences. Progress in this field of research has been further accelerated by the discovery that alterations in the methylome are not only associated with key functions of cells and organisms, such as development, differentiation and gene expression, but may underlie a number...
-
From Individual to Collective: Intelligence Amplification with Bio-Inspired Decisional DNA and its Extensions
PublicationIn nature, deoxyribonucleic acid (DNA) contains the genetic instructions used in the development and functioning of all known living organisms. The idea behind our vision is to develop an artificial system, an architecture that would support discovering, adding, storing, improving and sharing information and knowledge among agents and organizations through experience. We propose a novel Knowledge Representation (KR) approach in...
-
Total DNA Methylation Changes Reflect Random Oxidative DNA Damage in Gliomas
Publication -
Total DNA methylation as a biomarker of DNA damage and tumor malignancy in intracranial meningiomas
Publication -
Zastosowanie chromatografii gazowej do rozdzielania i oznaczania lotnych związków azoto – organicznych (LZN) w próbkach wody i ścieków.
PublicationW pracy dokonano przeglądu i porównania metod opartych na chromatografii gazowej do oznaczania lotnych związków azoto-organicznych (LZN) w próbkach wody i ścieków. Przedstawione zostały metodyki analityczne wykorzystujące zarówno detektory selektywne tj. detektor azotowo-fosforowy (NPD), detektor powierzchniowej jonizacji (SID), detektor chemiluminescencyjny azotu (CLND), detektor wychwytu elektronów (ECD) jak i detektorów uniwersalnych...
-
Otrzymywanie, właściwości i struktura w ciele stałym tiosiarczanów amoniowych oraz związków pokrewnych
PublicationW pracy doktorskiej otrzymywano tiosiarczany amoniowe i związki pokrewne, takie jak politioniany amoniowe czy S-alkilotiosiarczany oraz scharakteryzowano otrzymane związki. Praca o charakterze podstawowym ma na celu systematyczne przebadanie tytułowych soli, co umożliwi znalezienie szerszego zastosowania dla tej grupy związków. W części literaturowej opisano siarkę oraz jej znane związki tlenowe, a w szczególności tiosiarczany,...
-
Wpływ warunków naturalnych na zobrazowanie dna Zatoki Gdańskiej przy użyciu sonaru bocznego
PublicationGłównym celem artykułu jest przedstawienie wpływu warunków środowiskowych na dokładność zobrazowania dna morza za pomocą systemów hydroakustycznych. Czynniki naturalne, przede wszystkim falowanie powierzchni morza i niejednorodny rozkład prędkości dźwięku w wodzie, mają wpływ na zmianę toru promieni akustycznych. Choć w obu przypadkach mechanizm zjawisk jest zupełnie odmienny, odgrywają one decydującą rolę w odwzorowaniu dna i...
-
Mitochondrial DNA Part B-Resources
Journals -
Recent Advances in DNA and Gene Sequences
Journals -
Badania właściwości przeciwutleniających związków pochodzących z najczęściej spożywanych owoców i warzyw
PublicationW obronie przed reaktywnymi formami tlenu organizm wykorzystuje kilka systemów enzymatycznych oraz przeciwutleniacze endogenne. Dodatkowy mechanizm wzmacniający naturalną obronę ustroju stanowią przeciwutleniacze obecne w żywności, których szczególnie bogatym źródłem są owoce i warzywa. Najbardziej znanymi grupami związków o właściwościach przeciwutleniających, występującymi w roślinach jadalnych są przede wszystkim witaminy przeciwutleniające,...
-
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublicationZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
Typing of Scopulariopsis and Microascus fungi by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
PublicationOBJECTIVES Scopulariopsis species and their teleomorphs of the genus Microascus are commonly isolated from soil, decaying plant material and indoor environments. Moreover, certain Scopulariopsis and Microascus species are recognised as opportunistic human pathogens. Although most species can be identified by detailed morphological study, phenotypic characters appear to overlap in several cases and morphology seems to be insufficient...
-
New matrix-free reference materials of volatile compounds - application of glass fibres as support materials for surface compounds
PublicationTechnika termicznego rozkładu związków powierzchniowych, znana od ponad dziesięciu lat, ulega ciągłym udoskonaleniom w celu otrzymywania coraz szerszej gamy wzorców analitycznych występujących na coraz niższych poziomach stężeń. Początkowo w roli nośnika stosowano żel krzemionkowy, który w trakcie dalszych faz rozwoju tej techniki zastąpiono kolejno szkłem porowatym, a następnie włóknem szklanym. W ostatnim czasie uproszczono układ...
-
Low-energy positron scattering from DNA nucleobases: the effects from permanent dipoles
PublicationAb initio quantum calculations for low-energy positron scattering from gas-phase isolated molecular nucleobases which are part of the DNA structure are presented and discussed over the range of 1 eV to 25 eV. The calculations report the integral cross sections (ICSs) and the momentum-transfer cross sections (MTCSs) for Adenine, Guanine, Thymine and Cytosine. The calculations show very clearly the important role of the dominant...
-
Oznaczanie poziomów stężeń związków z grupy BTEX w powietrzu atmosferycznym na terenie Tczewa w roku 2012
PublicationOdnosząc się do danych opublikowanych w literaturze światowej, można odnotować fakt, że na wielu obszarach zurbanizowanych od kilkunastu lat prowadzi się systematyczny monitoring jakości powietrza atmosferycznego ukierunkowany na identyfikację oraz oznaczenie ilościowe związków z grupy BTEX (benzen, toluen, etylobenzen, ksyleny). W pracy przedstawiono wyniki badan monitoringowych przeprowadzonych w roku 2012, dotyczących oceny...
-
32P-postabeling detection of DNA adducts formed by 4-methyl-1-nitro-9-aminoacridine C-1748
PublicationWykazano zdolność do tworzenia przez nową pochodną 1-nitroakrydyny o symbolu C-1748, adduktów z DNA komórek nowotworowych oraz z DNA w systemie bezkomórkowym.
-
DNA G-quadruplex structures obtained through MD-based folding procedure
Open Research DataThe dataset contains structures of DNA G-quadruplexes (G4s), obtained through steered molecular dynamics simulations, for 128 oligonucleotides capable of forming 3- and 2-tetrad G4s. The general sequence of the oligonucleotides is GxTiGxTjGxTkGx, where x = 3 or 2 for 3- and 2-tetrad G4s, respectively, while i, j, and k vary independently from 1 to 4,...
-
Chemometric methods for determination of mechanisms of action of anticancer compounds
PublicationW 1990 amerykański Narodowy Instytut Raka (NCI) wprowadził szeroki test przesiewowy in vitro mający na celu poszukiwanie nowych związków przeciwnowotworowych. Test został wdrożony po przebadaniu 171 standardowych związków przeciwnowotworowych. Przedmiotem niniejszej pracy jest próba stworzenia reguł klasyfikacji związków standardowych ze względu na ich mechanizm działania przeciwnowotworowego na podstawie wyników z testu NCI. Potwierdzono...
-
A Framework for Enhancing Supplier Selection Process by Using SOEKS and Decisional DNA
PublicationAbstract. Supplier selection process is one of the significant stages in supply chain management for industrial manufactured products. It plays an integral role in the success of any manufacturing organization and is an important part starting right from selecting raw material to dispatch of finished products. This paper contributes to enhance the supplier selection process by proposing a multi-criteria decision making framework...
-
Novel single-stranded DNA-binding protein from psyvhrophilic bacterium Psychrobacter arcticus
PublicationTo study the biochemical properties of SSB from Psychrobacter arcticus (ParSSB), we have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed Escherichia coli overexpression systems. The gene consists of an open reading frame of 642 nucleotides encoding SSB protein of 213 amino acids with a calculated molecular mass of 22.8 kDa. The amino-acid sequence of ParSSB exhibits 49% identity and 57% similarity to Escherichia coli SSB....
-
Emplying set of experience knowledge structure and decisional DNA to enhance industrial design: conceptual approach
PublicationZaprezentowano koncepcje wspomagania projektowania przemyslowego przy pomocy nowoczenego podejscia do reprezentacji wiedzy w postaci SOEKS oraz Decyzyjnego DNA
-
Synteza, właściwości i struktura wybranych pochodnych tiomocznika oraz ich związków kompleksowych z kationami metali o konfiguracji d10
PublicationPrzedstawiona rozprawa doktorska poświęcona jest 1-benzoilotiomocznikom i produktom ich reakcji z halogenkami metali o konfiguracji elektronowej d10 (miedziowce na +1 stopniu utlenienia i cynkowce na +2 stopniu utlenienia) ze szczególnym nastawieniem na ich związki kompleksowe. Istota i cel takich badań przedstawione są we wstępie pracy. Na początku części teoretyczno-literaturowej opisane zostały pochodne tiomocznika ze szczególnym...
-
Experience-Based Decisional DNA (DDNA) to Support Product Development
PublicationKnowledge and experience are important requirements for product development. The aim of this paper is to propose a systematic approach for industrial product development. This approach uses smart knowledge management system comprising of Set of Experience Knowledge Structure and Decisional DNA (DDNA) along with Virtual Engineering Tools (Virtual engineering object, Virtual engineering process, and Virtual engineering factory)....
-
When Neural Networks Meet Decisional DNA: A Promising New Perspective for Knowledge Representation and Sharing
PublicationABSTRACT In this article, we introduce a novel concept combining neural network technology and Decisional DNA for knowledge representation and sharing. Instead of using traditional machine learning and knowledge discovery methods, this approach explores the way of knowledge extraction through deep learning processes based on a domain’s past decisional events captured by Decisional DNA. We compare our approach with kNN (k-nearest...
-
DNA Methylation Changes Induced by Redox-Active Compounds—Choosing the Right PCR-Based Method
PublicationThe impact of catechins on the expression profile of redox-related genes in HT29 cell line has been studied recently by our group using Oxidative Stress RT2 Profiler PCR Array. Within the examined panel of 84 genes, the down-regulation of SRXN1 gene was unique among other up-regulated genes. We hypothesized that the observed down-regulation resulted from DNA methylation and have exploited this observation to choose the proper strategy...
-
Electrochemical formation of the adduct between antitumor agent C_1311 and DNA nucleoside dG. 75.
PublicationPrzyjmuje się, że metaboliczna aktywacja przeciwnowotworowej pochodnej C_1311 jest procesem koniecznym dla jej aktywności przeciwnowotworowej. Wykazano wcześniej, że taka aktywacja prowadzi do kowalencyjnego wiązania się leku z DNA w komórce nowotworowej. Aby zbadać molekularny mechanizm powyższej reakcji metabolicznej przeprowadzono badania elektrochemicznego utleniania pochodnej C_1311. Wykazano w pracy, że dwa produkty elektrochemicznego...
-
Wykorzystanie strategii konia trojańskiego w projektowaniu związków przeciwgrzybowych
Publication...
-
Usuwanie związków azotu w oczyszczalniach hydrofitowych w Polsce.
Publication...
-
Oznaczanie wybranych związków z grupy kationowych surfaktantów w stałych próbkach z wykorzystaniem techniki chromatografii jonowej
PublicationZwiązki z grupy surfaktantów ze względu na specyficzne właściwości fizykochemiczne (m.in. amfifilowa budowa, zdolność rozpuszczania się w cieczach o różnej polarności i tworzenia micelli, zróżnicowana toksyczność) są wykorzystywane w wielu sferach działalności człowieka. Stosowanie różnego typu związków powierzchniowo-czynnych zarówno w przemyśle jak i w gospodarstwach domowych jest przyczyną emitowania do środowiska zanieczyszczeń,...