Publications
Filters
total: 455
Catalog Publications
-
Solvent influence on the crystal structures of new cadmium tri-tert -butoxysilanethiolate complexes with 1,4-bis(3-aminopropyl)piperazine: luminescence and antifungal activity
PublicationMonocrystals of dinuclear -1,4-bis(3-aminopropyl)piperazine-4N1,N10:N4,N40-bis[bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-S)cadmium(II)], [Cd2(C12H27O3SSi)4(C10-H24N4)] or [Cd2{SSi(OtBu)3}4(-BAPP)], 1, and polynuclear catena-poly[[bis-(tri-tert-butoxysilanethiolato-S)cadmium(II)]--1,4-bis(3-aminopropyl)piperazine-2N10:N40], [Cd(C12H27O3SSi)2(C10H24N4)]n or [Cd{SSi(OtBu)3}2(-BAPP)]n,2, with 1,4-bis(3-aminopropyl)piperazine (BAPP)...
-
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
PublicationBadano przydatność techniki PCR MP w efektywnym typowaniu szczepów w badaniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych. Technika oparta jest na użyciu niskiej temperatury denaturacji podczas LM PCR. Badaniu zostały poddane izolaty Escherichia coli pochodzące od pacjentów Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że technika jest szybka, o wysokim potencjale różnicującym i bardzo dobrej powtarzalności i może być zastosowana w badaniach...
-
INVESTIGATION OF THE EFFECT OF THE ROCKET'S SUBORBITAL FLIGHT ON BIOFILM, ENZYMES AND BIOSYNTHESIS ON AUTONOMOUS, MODULAR AND SCALABLE PLATFORM FOR CONDUCTING EXPERIMENTS OF AN ASTROBIOTECHNOLOGICAL NATURE
PublicationWith new incentives for human space exploration, biotechnological experiments in orbit became imperative.Answering this need, we build an autonomous, modular, and scalable platform that enables those experiments onrockets. We called it AMBER. The aim of the payload of the R6 suborbital rocket is to perform an experiment tostudy the influence of rocket flights on biofilm, molecular...
-
Fungal Typin Methods
PublicationThe broad application of the molecular techniques in mycoses diagnosis is related to increase of infections caused by fungi in many countries. The oldest typing methods relaying on fenotypic observation, physiological and biochemical examination have had very limited importance from decades. Novadays, the molecular biology methods took their place. Most of the genotyping methods have been devoleped to be applied for typing of bacteria...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublicationSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNA insequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination. Although there are differences in amino...
-
Ligation Mediated PCR methods, their possibilities and limitations
PublicationThe application of molecular diagnostics for bacterial strain typing or identifying bacteria at the strain level is of particular importance at present. However, among the many genotyping methods that are currently available, no single one is universally ideal. In this article, we thus review the Ligation Mediated PCR group methods as prospects from which to choose. We discuss different strategies for selecting the amplified PCR...
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pastuerianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Leukemia and risk of recurrent Escherichia coli bacteremia: genotyping implicates E. coli translocation from the colon to the bloodstream.
PublicationIn patients with leukemia, the portal(s) and reasons for the persistence of an Escherichia coli recurrent bacteremia remain unclear. Adult Hematology Clinic (AHC) databases at the State Clinical Hospital in Gdańsk were reviewed to evaluate the frequency of E. coli bacteremia between 2002 and 2005. Blood and bowel E. coli strains were obtained and the genetic relatedness of the strains was analyzed. The rate of E. coli bacteremia...
-
Biochemical characteristic of biofilm of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains.
PublicationUrinary tract infections caused by Escherichia coli are very common health problem in the developed countries. The virulence of the uropathogenic E. coli Dr+ IH11128 is determined by Dr fimbriae, which are homopolymeric structures composed of DraE subunits with the DraD protein capping the fiber. In this study, we have analyzed the structural and biochemical properties of biofilms developed by E. coli strains expressing Dr fimbriae...
-
Diagnostyka toksoplazmozy u kobiety ciężarnej, płodu i noworodka — stan obecny i nowe możliwości
PublicationW artykule opisano problem toksoplazmozy, skutki oraz obecną diagnostykę. Przedstawiono metody serologiczne pozwalające wykryć pierwotne zarażenie T. gondii u kobiet ciężarnych oraz szereg technik pośrednich i bezpośrednich wykorzystywanych w celu potwierdzenia bądź wykluczenia toksoplazmozy wrodzonej u noworodka. Ponadto wskazano potencjalne możliwości w diagnostyce toksoplazmozy, jakie niosą za sobą nowe techniki (np. 2D Western-blotting),...
-
Epidemiological study of Toxoplasma gondii infection among cattle in Northern Poland
PublicationToxoplasmosis, caused by Toxoplasma gondii, is a significant disease in livestock and humans. Because of medical and veterinary importance it is essential to study the prevalence of T. gondii infection among human and animals in various parts of the word. In this study, 4033 cattle from eight provinces of Northern Poland (belonging to 190 herds) were tested for IgG antibodies against T. gondii by an in-house ELISA technique based...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublicationSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNAinsequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination.Although there are differences in amino acid...
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pasteurianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Bacterial consortium an axenic cultures isolated from activated sewage sludge for biodegradation of imidazolium-based ionic liquid
PublicationExtensive research and increasing number of potential industrial applications made ionic liquids (ILs) important materials in design of new, cleaner technologies. Together with the technological applicability, the environmental fate of these chemicals is considered and significant efforts are being made in designing strategies to mitigate their potential negative impacts. Many ILs are proven to be poorly biodegradable and relatively...
-
ECHINOKANDYNY - MECHANIZM DZIAŁANIA ORAZ WYSTĘPOWANIE OPORNOŚCI U GRZYBÓW Z RODZAJU CANDIDA
PublicationEchinokandyny to lipopeptydowe leki przeciwgrzybicze, które są inhibitorami syntazy β-1,3-D-glukanowej. W praktyce klinicznej wykazano ich skuteczność wobec pleśni oraz grzybów drożdżopodobnych oraz minimalne efekty uboczne. Jednakże w ostatnich latach obserwuje się wzrastającą oporność na echinokandyny wśród klinicznych izolatów Candida spp. Przede wszystkim jest ona powiązana z występowaniem mutacji w obszarze genów fks, kodujących...
-
BUDOWA I AKTYWNOŚĆ BIAŁEK NALEŻĄCYCH DO RODZINY TET
PublicationBiałka należące do rodziny TET (Tet1, Tet2, Tet3) są enzymami wykazującymi aktywność względem 5-metylocytozyny, która jest ważnym markerem epigenetycznym odgrywającym kluczową rolę w trakcie rozwoju organizmu i mającym istotny wpływ na poziom ekspresji genów. Białka TET przekształcają 5-metylocytozynę do 5-hydroksymetylocytozyny, 5-formylocytozyny i 5-karboksylocytozyny w trakcie następujących po sobie trzech reakcji utleniania....
-
NASBA – IZOTERMICZNA AMPLIFIKACJA RNA
PublicationNASBA (ang. Nucleic Acid Sequence-Based Amplification) jest skuteczną i czułą techniką izotermicznej amplifikacji opartej na transkrypcji, służąca głównie do detekcji cząsteczek RNA. Znalazła ona zastosowanie do wykrywania RNA wirusowego, bakteryjnego i grzybiczego w próbkach klinicznych oraz żywości.
-
Evaluation of possibilities in identification and susceptibility testing for Candida glabrata clinical isolates with the Integral System Yeast Plus (ISYP)
PublicationThe aim of this study was to evaluate possibilities of correct identification and susceptibility testing of C. glabrata clinical isolates with Integral System Yeast Plus (ISYP). For species identification, as the reference method, API Candida test and species-specific PCR reactions were used. The potential of antifungal susceptibility testing by the ISYP test was compared with the Sensititre Yeast One. Whilst the reference methods...
-
Budowa biofilmu chorobotwórczych drożdży i jego wpływ na oporność
PublicationBiofilm jest najpowszechniej występującą formą wzrostu mikroorganizmów w naturze. Ze względu na wysoką oporność na antybiotyki, jest on istotnym czynnikiem przewlekłych i nawracających zakażeń grzybiczych. Struktura biofilmu umożliwia dostarczenie składników odżywczych do głębszych warstw komórek i odprowadzenie metabolitów. Macierz zewnątrzkomórkowa pełni funkcję ochronne przed niekorzystnymi warunkami środowiska, a także utrudnia...
-
ROLA SYGNALIZACJI KWASEM RETINOWYM W PROCESACH REGENERACJI I ROZWOJU ORGANIZMU
PublicationKwas retinowy jest cząsteczką sygnalną, odgrywającą kluczową rolę w trakcie rozwoju organizmu, która aktywuje różnicowanie wielu typów komórek. Zaburzenie sygnalizacji kwasem retinowym w okresie prenatalnym jest związany z poważnymi zaburzeniami rozwojowymi płodu, które mogą skutkować jego śmiercią. Wykazano także pozytywny wpływ sygnalizacji kwasem retinowym na zdolność do regeneracji uszkodzonych kończyn i tkanek u niektórych...
-
Ogólna charakterystyka biofilmu drożdży z rodzaju Candida
PublicationDrożdże z rodzaju Candida to naturalne symbionty, które w przypadku obniżenia odporności organizmu mogą powodować grzybice. Właściwości chorobotwórcze związane są także z czynnikami wirulencji danego patogena. Oporność mikroorganizmów na leki stanowi poważny problem współczesnej medycyny. Grzyby posiadają wiele mechanizmów warunkujących lekooporność. Jednym z nich jest wytwarzanie biofilmu. Na powstawanie i rozwój biofilmu w znacznym...
-
Toksoplazmoza ludzi i zwierząt Cz. I. Zasadnicze elementy etiopatogenezy i epidemiologii
PublicationPrzedstawiono obecny stan wiedzy na temat etiopatologii i epidemiologii zarażeń pierwotniakiem Toxoplasma gondii u ludzi i zwierząt.
-
Szczepionki przeciw toksoplazmozie - aktualny stan badań
PublicationArtykuł prezentuje współczesną wiedzę na temat opracowywania skutecznej szczepionki przeciwko toksoplazmozie. W publikacji zebrane zostały informacje dotyczące nowych strategii w konstruowaniu efektywnych szczepionek opartych na antygenach natywnych, rekombinantowych, DNA lub RNA pasożyta.
-
Diagnostyka molekularna w zakażeniach szpitalnych
PublicationOpisano najczęściej wykorzystywane techniki genotypowania w badaniach zakażeń szpitalnych z uwzględnieniem ich powtarzalności i potencjału różnicującego oraz problemów technicznych i ponoszonych kosztów. Makrorestrykcyjna analiza genomowego DNA z wykorzystaniem PFGE (ang. Pulsed Field Gel Electrophoresis)jest uważana za ''złoty standard'' w typowaniu molekularnym. Jednak jest ona czasochłonna, pracochłonna i dlatego nie nadaje...
-
Detection of Blastocystis hominis in unpreserved stool specimens byusing polymerase chain reaction
PublicationBlastocystis hominis jest pasożytem występującym na całym świecie. Patogenność tego pasożyta nie jest jeszcze w pełni udowodniona, aczkolwiek opisanych jest wiele przypadków, sugerujących, że B. hominis może wywoływać objawy żołądkowo-jelitowe. Wykrywanie tego pasożyta opiera się na bezpośredniej obserwacji mikroskopowej rozmazów i zagęszczonych próbek kału lub rozmazów utrwalonych, jednakże w pewnych przypadkach nie jest to możliwe.Celem...
-
Antygeny rekombinantowe Toxoplasma gondii jako narzędzie w diagnostyce toksoplazmozy
Publication -
Konstrukcja i wstępna ocena użyteczności szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na chimerycznych fimbriach Escherichia coli typu Dr z epitopami antygenów SAG1, GRA1 lub MAG1
Publication -
Five-hour diagnosis of dermatophyte nail infections with specific detection of Trichophyton rubrum
PublicationW publikacji przedstawiono szybką dwuetapową metodę oczyszczania DNA oraz opartą na technice multiplex PCR metodę wykrywania grzybów z rodzaju dermatofitów oraz gatunku Trichophyton rubrum z hodowli grzybów oraz bezpośrednio ze zmienionych chorobowo paznokci. Testy stu osiemnastu próbek z użyciem zaprojektowanej reakcji multiplex PCR i dwóch kolejnych (jedna wykrywająca grzyby z rodzaju dermatofitów, druga wykrywająca gatunek T....
-
Opracowanie zestawu diagnostycznego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych metodą PCR MP
PublicationOmówiono etapy tworzenia zestawu diagnostycznego przeznaczonego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych wykorzystującego procedurę PCR MP (PCR Melting Profiles). Dokonano optymalizacji warunków i walidacji metody w celu przystosowania jej do potrzeb epidemiologicznej oceny zakażeń szpitalnych. Opracowany zestaw stwarza możliwości zastosowania go w laboratoriach prowadzących rutynowo badania diagnostyczne.
-
ALIS-FLP: amplified ligation selected fragment-length polymorphism method for microbial genotyping
PublicationA DNA fingerprinting method known as ALIS-FLP (amplified ligation selected fragment-length polymorphism) has been developed for selective and specific amplification of restriction fragments from TspRI restriction endonuclease digested genomic DNA. The method is similar to AFLP, but differs in that only one specific restriction enzyme (TspRI) is used. The cohesive ends of the DNA fragments are ligated with two types of oligonucleotide....
-
Wykorzystanie reakcji PCR do badania charakterystycznych obszarów genomu
PublicationW pracy zostały opisane metody wykorzystujące technię PCR do długo- i krótkoterminowych badań epidemiologicznych. Typowanie szczepów oparte jest na analizie fragmentów genów, bądź całego genomu w zależności od potrzeby posiadania potencjału różnicującego metody. Przez ostatnie 30 lat rozwijały się nie tylko metody badawcze, doszło również do rozwoju międzynarodowych baz danych i przepływu informacji o obecnych sytuacjach epidemiologicznych...
-
Drożdżowe systemy ekspresyjne jako narzędzie nowoczesnej mikrobiologii przemysłowej
PublicationDrożdże łączą zalety prokariotycznych i eukariotycznych systemów ekspresyjnych. Charakteryzuje je szybki wzrost, osiągają też znacznie większą biomasę w porównaniu z bakteriami. W odróżnieniu od bakterii, drożdże zdolne są do przeprowadzania modyfikacji posttranslacyjnych białek. Kolejną zaletą drożdżowych systemów ekspresyjnych jest zdolność komórek drożdżowych do sekrecji białek do pożywki hodowlanej. W laboratoriach naukowych...
-
Metody molekularne w dochodzeniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych
PublicationW dochodzeniu epidemiologicznym wykorzystuje się zmienność genetyczną mikroorganizmów do tzw. typowania genetycznego drobnoustrojów. W pracy omówiono metody genotypowe wykorzystujące podstawowe narzędzia molekularne, ukazano możliwości wykorzystania typowania drobnoustrojów w różnych aspektach badań mikrobiologicznych.
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublicationW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
Białko DraD uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ - mechanizm transportu na powierzchnię komórki i rola w procesie polimeryzacji struktur fimbrialnych
Publication -
Adaptowana do zimna esteraza Pseudoalteromonas sp. 643A - produkcja w systemach ekspresyjnych Escherichia coli, oczyszczanie i charakterystyka
Publication -
Występowanie oraz charakterystyka molekularna oporności na azole wśród klinicznych i środowiskowych izolatów Aspergillus fumigatus
PublicationCelem badań prowadzonych w ramach niniejszej pracy doktorskiej było sprawdzenie występowania oporności na azole grzybów A. fumigatus pochodzących z Polski oraz jej molekularna charakterystyka. W toku badań utworzono kolekcję 200 izolatów A. fumigatus pochodzących z różnych miejsc Polski. W skład kolekcji wchodziły izolaty kliniczne, środowiskowe i weterynaryjne. Przynależność gatunkową badanych grzybów potwierdzono metodami diagnostyki...
-
WIELOLEKOOPORNE ZAKAŻENIA CANDIDA - PROBLEM XXI WIEKU!
PublicationW ostatnich latach obserwuje się dramatyczny wzrost zakażeń grzybiczych, których przyczyną są grzyby z rodzaju Candida (C). Większość zakażeń wywoływana jest przez C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis i C. tropicalis. Dotychczas najczęściej stosowanymi lekami przeciwko Candida spp były azole, jednakże ze względu na występowanie naturalnej oporności na te antybiotyki (C. glabrata i C. krusei) coraz częściej azole...
-
Immunogenic and protective activity of recombinant chimeric Toxoplasma gondii proteins
PublicationToxoplasmosis, one of the most common parasitic invasions worldwide, may pose a great threat for individuals with weakened immune system. The parasite also causes considerable economic losses due to infection of livestock. To date there is no efficient immunoprophylaxis for humans and animals, which would provide long-lasting protection against T. gondii invasion. Chimeric proteins, containing several selected fragments of parasite...
-
Katechol - najważniejszy produkt pośredni szlaków biodegradacji węglowodorów aromatycznych
PublicationWęglowodory aromatyczne to grupa toksycznych związków organicznych zdolnych do akumulacji w glebie i wodach gruntowych. Bardzo istotnym związkiem, ze względu na jego toksyczność oraz kluczowy udział w szlakach biodegradacji toksycznych węglowodorów aromatycznych, jest katechol. Katechol jest głównym intermediatem w szlakach biodegradacji węglowodorów monoaromatycznych. Pierścień katecholu ulega rozszczepieniu między dwiema grupami...
-
Mikroorganizmy w degradacji celulozy
PublicationCeluloza jest podstawowym składnikiem komórek roślinnych. Włókna celulozowe są bardzo ciasno upakowane w ścianach komórek, przez co utrudniają dostęp enzymom celulolitycznym oraz cząsteczkom wody. Najważniejszą rolę w procesie rozkładu celulozy pełnią celulazy, które należą do rodziny hydrolaz glikozydowych. Zdolność do hydrolizy celulozy i hemicelulozy wykazują mikroorganizmy celulolityczne. Prezentują one dwa różne mechanizmy...
-
Regulacja epigenetyczna a potencjał regeneracyjny ssaków. Badania globalnych profili metylacji w tkankach dorosłej myszy MRL/MpJ i w sercach noworodków myszy C57BL/6J.
PublicationW pracy tej otrzymano genomowe profile metylacji DNA dla dwóch modeli regeneracji u ssaków: (i) dorosłej myszy MRL/MpJ, która jest zdolna do zamykania otworów w małżowinie usznej oraz wykazuje podwyższone zdolności regeneracyjne w wielu innych narządach oraz (ii) sercach noworodków myszy, u których zachodzi regeneracja rozległych uszkodzeń lewej komory serca. Zidentyfikowano szereg odmiennie metylowanych regionów DNA, regionów DMR,...
-
Epigenetyczne i transkryptomiczne podstawy potencjału regeneracyjnego ssaków. Badania na modelach skóry płodowej i dorosłej myszy MRL/MpJ
PublicationRegeneracja jest to zdolność do odbudowy uszkodzonych lub utraconych tkanek, kończyn oraz narządów. Efektywne procesy regeneracji obserwowane są u prymitywnych kręgowców, u których mogą przejawiać się w tak spektakularnych zjawiskach jak odtworzenie całych kończyn po ich amputacji. U wyższych kręgowców zdolności regeneracyjne są znacznie bardziej ograniczone. Rozwój metod umożliwiających badanie globalnych profili ekspresji i metylacji...
-
Modyfikacje polimeraz DNA jako rozwiązania problemów w reakcjach PCR
PublicationReakcja PCR już od wielu lat jest podstawowym narzędziem stosowanym w biotechnologii molekularnej. Nadal napotykamy jednak liczne problemy podczas jej przeprowadzania związane z trudnymi matrycami, obecnością inhibitorów itp. Optymalizacja reakcji PCR jest więc niezbędna w celu poprawy wyników. Jednym z rozwiązań tych problemów może być modyfikowanie polimeraz DNA. W powyższym artykule opisano problemy i rozwiązania zależne polimerazy...
-
Zastosowanie immobilizowanego białka MutS do wychwytywania fragmentów DNA zawierających niesparowane zasady
PublicationBiałko MutS wiąże DNA zawierające błędnie sparowane oraz niesparowane zasady w DNA. Podjęto szereg prób wykorzystania tego białka jako narzędzia do detekcji nieznanych mutacji lub zagęszczania frakcji DNA z niesparowaną zasadą. Dotychczas żadna z metod oparta na użyciu białka MutS nie została wdrożona powszechnie do praktyki laboratoryjnej. Głównym powodem takiego stanu rzeczy jest stosunkowo silne powinowactwo MutS do DNA w pełni...
-
A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms
PublicationABSTRACT Background. As the currently known diagnostic DNA targets amplified in the PCR assays for detection of poisonous mushrooms have their counterparts in edible species, there is a need to design PCR primers specific to the genes encoding amanitins and phallotoxins, which occur only in poisonous mushrooms. Objective. The aim of the study was testing of PCR-based method for detection of all genes encoding hepatotoxic cyclic...
-
Identyfikacja 20 nowych rejonów zmiennych w genomach Staphylococcus aureus przydatnych do genotypowania koagulazo-dodatnich gronkowców
PublicationW pracy zidentyfikowano 20 nowych rejonów zmiennych w genomach gronkowca złocistego przydatnych do badań epidemiologicznych metodą PCR. Teoretyczna analiza 35 genomów metodą PCR z udziałem 20 nowych regionów zmiennych pozwoliła na uzyskanie większej liczby genotypów w porównaniu do dwóch metod referencyjnych: REA-PFGE z udziałem endonukleazy SmaI oraz metody MLVA z udziałem 16 rejonów zmiennych.
-
Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi
PublicationZidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....
-
Technika PCR MP (PCR Melting Profile) - możliwości zastosowania w badaniach epidemiologicznych
PublicationUżyteczność PCR MP (ang. PCR Melting Profile), stosunkowo nowej techniki różnicowania genetycznego szczepów mikroorganizmów, pokazano na przykładach badań epidemiologicznych, dotyczących wykrywania zakażeń szpitalnych, analizy sytuacji epidemiologicznej i identyfikacji transmisji bakteryjnej u poszczególnych pacjentów. Technikę PCR MP charakteryzuje prostota, niskie koszty wykonania oraz potencjał różnicujący porównywalny do metody...
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Genetyczne metody różnicowania mikroorganizmów
PublicationPrzedstawiono przegląd i porównanie kilku najczęściej stosowanych technik różnicowania genetycznego mikroorganizmów, uwzględniając molekularne podstawy metod, ich powtarzalność, siłę dyskryminacji, łatwość i koszt użycia, aby dać czytelnikowi pogląd na możliwości klinicznego zastosowania dostępnych aktualnie narzędzi molekularnego różnicowania mikroorganizmów.
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Optymalizacja i walidacja metody ADSRRS-fingerprinting - konstrukcja zestawu diagnostycznego do różnicowania genetycznego drobnoustrojów
PublicationSpośród wszystkich metod typowania mikroorganizmów na szczególną uwagę zasługują metody oparte na analizie całego materiału genetycznego zawartego w komórce. Jedną z nich jest stosunkowo nowa technika ADSRRS-fingerprinting (ang. Amplification of DNA Fragments Surrounding Rare Restriction Sites). Na podstawie naszych badań można stwierdzić, iż charakteryzuje się ona wysokim potencjałem różnicującym, wiarygodnością, powtarzalnością...
-
PCR Melting Profile method for genotyping analysis of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from Hematological Unit patients
PublicationW ostatnich latach znacząco wzrasta liczba szczepów Enterococcus opornych na wankomycynę. Stwarzają one problemy medyczne u pacjentów skolonizowanych czy zainfekowanych tymi drobnoustrojami. W przedstawionych badaniach, określiliśmy genetyczne podobieństwo pomiędzy izolatami E. faecium VRE, pozyskiwanymi w okresie od kwietnia 2003 do kwietnia 2005 od pojedynczych pacjentów oddziału Hematologicznego Specjalistycznego Publicznego...
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublicationW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublicationWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
-
A cold-adapted esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. strain 643A
PublicationDzięki zastosowaniu lipaz możliwa jest biotechnologiczna produkcja m.in. biodegradowalnych biopolimerów, biopaliw (tzw. biodiesel), wielu terapeutyków, herbicydów, pestycydów, kosmetyków, substancji smakowych, serów i in. Szczególnie interesującą grupę stanowią enzymy lipolityczne, pochodzące z organizmów psychrofilnych i psychrotrofowych, ze względu na zdolność do wydajnego katalizowania reakcji w temperaturach rzędu 10-20 ºC....
-
DAF - and collagen-binding properties of chimeric Dr fimbriae
PublicationEkspozycja białek heterologicznych na powierzchni mikroorganizmów jest jedną z nowych strategii stosowanych w mikrobiologii, biotechnologii oraz projektowaniu nowoczesnych szczepionek. W niniejszej pracy zbadano możliwość wykorzystania białka podjednostkowego DraE fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jako nośnika heterologicznych sekwencji. W rejon odpowiadający N-terminalnej domenie 2 białka DraE wprowadzono epitopową...
-
A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins
PublicationPraca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...
-
Immobilized preparation of cold-adapted and halotolerant Antarctic β-galactosidase as a highly stable catalyst in lactose hydrolysis
PublicationZimnolubna rekombinowana beta-galaktozydaza antarktycznej morskiej bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b została immobilizowana na chitozanie za pomocą aldehydu glutarowego. Preparat immobilizowanego enzymu w przeciwieństwie do preparatu enzymu w buforze reakcyjnym nie był inhibowany przez glukozę. Immobilizacja enzymu wpłynęła na podwyższenie o 10°C optymalnej temperatury aktywności względem jego nieimmobilizowanego odpowiednika...
-
A freeze-thaw method for desintegration of Escherichia coli cells producing T7 lysozyme used in pBAD expression systems
PublicationPlazmid pLysN zawierający gen kodujący lizozym T7 pod kontrolą promotora lac został skonstruowany w celu ułatwienia dezintegracji komórek po ekspresji rekombinantowych białek w systemach ekspresji indukowanych arabinozą. Użyteczność plazmidu została przetestowana w komórkach Escherichia coli TOP10 i E. coli LMG194, niosących plazmid pBADMHADgeSSB, zawierający gen kodujący białko SSB Deinococcus geothermalis pod kontrolą promotora...
-
Toksoplazmoza ludzi i zwierząt Cz. II. Zasadnicze elementy diagnostyki oraz terapii i profilaktyki
PublicationPrzedstawiono aktualny stan wiedzy na temat diagnostyki, terapii i profilaktyki zarażenia Toxoplasma gondii u ludzi i zwierząt.
-
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactoside
PublicationPraca pokazuje konstrukcję DNA plazmidowego kodującego bifunkcjonalne białko chimeryczne złożone z MutS Thermus thermophilus i beta-galaktozydazy E.coli, optymalizację jego ekspresji i oczyszczania. Białko to testowano w metodzie wykrywania mutacji punktowych, wykorzystując kolorymetryczne mierzenie aktywności domeny reporterowej beta galaktozydazy.
-
Peptidoglycan hydrolases - potential weapons against Staphylococcus aureus
PublicationBacteria of the genus Staphylococcus are common pathogens responsible for a broad spectrum of human and animal infections and belong to most important etiological factors causing food poisoning. Because of rapid increase in prevalence of isolation of staphylococci resistant to many antibiotics, there is an urgent need for development of new alternative chemotherapeutics. A number of studies have recently demonstrated the strong...
-
Investigation of interaction between xanthene dye rhodamine B and metagenomic-derivated methylthioadenosine phosphorylase RSFP
PublicationIn the previous study we found that the expression of the metagenomic - derived methylthioadenosine phosphorylase gene (rsfp) in E. coli cells and the presence of rhodamine B in the growth medium were crucial for the pink fluorescence of one E. coli colony from Antarctic soil metagenomic library (Cieśliński et al., 2009). In this study, rsfp gene expression was induced by an arabinose promoter in an LMG194 E. coli strain and the...
-
Dimeric structure of the N-terminal domain of PriB protein from Thermoanaerobacter tengcongensis solved ab initio
PublicationPriB is one of the components of the bacterial primosome, which catalyzes the reactivation of stalled replication forks at sites of DNA damage. The N-terminal domain of the PriB protein from the thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis (TtePriB) was expressed and its crystal structure was solved at the atomic resolution of 1.09 Å by direct methods. The protein chain, which encompasses the first 104 residues of the...
-
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublicationZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
PCR test for Microsporum canis identification
PublicationMicrosporum canis, for which the natural hosts are cats and dogs, is the most prevalent zoophilic agent causing tinea capitis and tinea corporis in humans. We present here a diagnostic PCR test for M. canis, since its detection and species identification is relevant to the choice of treatment and to the understanding of a probable source of infection. An M. canis-specific PCR was evaluated using 130 clinical isolates of dermatophytes...
-
New PCR test for detection of Candida glabrata based on the molecular target chosen by the RAPD technique
PublicationRapid, reliable diagnosis is a necessary condition for the successful treatment of infections. Such diagnostic assays are continually being developed. #e paper presents a method for selecting the molecular target for PCR-based diagnostics based on the comparison of RAPD patterns. A sequence encoding Candida glabrata CBS138 hypothetical protein was selected. The limit of detection for PCR and real-time PCR reactions with DNA extracted...
-
Recombinant !ermostable AP Exonuclease from Thermoanaerobacter tengcongensis: Cloning, Expression, Purification, Properties and PCR Application
PublicationApurinic/apyrimidinic (AP) sites in DNA are considered to be highly mutagenic and must be corrected to preserve genetic integrity, especially at high temperatures. !e gene encoding a homologue of AP exonuclease was cloned from the thermophilic anaerobic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis and transformed into Escherichia coli. The protein product showed high identity (80%) to human Ape1 nuclease, whereas to E. coli exonuclease...
-
Wybrane metody badania poziomu metylacji DNA w komórkach eukariotycznych
PublicationMetylacja regionów promotorowych jest jednym z głównych mechanizmów regulacji transkrypcji genów u eukariota. W komórkach ssaczych metylacja DNA zachodzi głównie na reszcie cytozyny występującej w dinukleotydach CpG i jest katalizowana przez metylotransferazy DNA (DNMT1, DNMT3A i DNMT3B) (Turek Plewa, Jagodziński 2005). Mapowanie 5 metylocytozyny w DNA genomowym jest jednym z narzędzi do badania wpływu metylacji na tkankowo-specyficzną...
-
The usefulness of Toxoplasma gondii MIC1-MAG1-SAG1 chimeric antigen in the serodiagnosis of ovine toxoplasmosis
PublicationToxoplasmosis is a zoonotic disease caused by the protozoan Toxoplasma gondii, which infects humans and most warm-blooded animals throughout the world. Although human toxoplasmosis in healthy adults is usually asymptomatic, a serious disease can occur in the case of congenital infection and immunocompromised individuals. Among food animals, sheep, along with goats and pigs, possess the highest incidence of T. gondii cysts in meat,...
-
THE GENE CLONING, OVEREXPRESSION, PURIFICATION AND BIOCHEMICAL CHARACTERISATION OF A NEW COLD-ADAPTED β–GALACTOSIDASE FROM ARTHROBACTER SP. VII-4
PublicationINTRODUCTION. β-Galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It is commercially used in dairy industry for the production of milk with reduced lactose content. Potentially, the best method for lactose removal under cooling conditions should be carried out with a cold-adapted enzyme. AIM. The aim of this study was to determine the taxonomic affiliation of the isolate...
-
Insight into heart regeneration
PublicationThe mammalian heart is thought to be incapable of regeneration because of the limited ability of cardiomyocytes. to proliferate. However, it has been recently shown that the neonatal murine heart is able to restore its normal function after coronary artery ligation or even partial resection. Unfortunately, this feature is lost in a few days after birth, although lower vertebrates as zebrafish or newt, retain this ability until adulthood. Therefore,...
-
BIODIVERSITY OF YEASTS ISOLATED FROM CAVES OF THE POLISH TATRA MOUNTAINS, AND ITS BIOTECHNOLOGICAL POTENTIAL
PublicationMost of the Earth’s biosphere is permanently or periodically exposed to temperatures below 5°C. Cold habitats harbor a wide diversity of psychrophiles. For many years Antarctica has been the geographic area preferred for studying the diversity and properties of cold-adapted microorganisms. However, the non-Antarctic habitats like Himalayas or Alps are also extensively explored. The Tatra Mountains are Europe’s second-highest massif...
-
Beta-Galactosidases of Pseudoalteromonas sp. – Characteristics and application for lactose hydrolysis and galactopyranosides synthesis
PublicationBeta-galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It has biotechnological applications in the dairy industry for the production of milk with a low content of lactose and galactooligosacharides for use in healthy food. The transgalactosylation activity of beta-galactosidase can be used in the synthesis of alkyl galactopyranosides. Due to the fact that conditions of...
-
Białka prokariotycznego systemu MMR: rola oraz interakcje
PublicationUszkodzenia komórkowego DNA w postaci błędnie sparowanych lub niesparowanych zasad azotowych są wynikiem niewłaściwie zachodzących procesów metabolizmu DNA, takich jak replikacja, rekombinacja oraz naprawa DNA. Utrwalenie tego rodzaju zmian prowadzi do powstania mutacji. System MMR (ang. DNA mismatch repair) usuwa te uszkodzenia przyczyniając się do zwiększenia wierności replikacji DNA oraz utrzymania stabilności genomu komórki....
-
Mysz MRL - nowy model regeneracji
PublicationRegeneracja jest to zdolność do odtwarzania utraconych lub uszkodzonych kończyn, narządów i tkanek. Regeneracja wydaje się zdolnością niezbędną do życia, ale możliwości regeneracyjne są bardzo zróżnicowane w zależności od organizmu..Podczas gdy robaki płaskie są w stanie odtworzyć cały organizm z dowolnego jeog fragmentu, płazy regenerują utracone kończyny, przecięty.rdzeń kręgowy i poważne uszkodzenia serca, to zdolnosci regeneracyjne...
-
Beta-galactosidases from a psychrotolerant Arthrobacter isolates and their potential use
PublicationEnzymes from extremophiles, especially psychrophiles and psychrotolerant microorganisms are currently intensively studied because of their unusual structural and functional properties. One of these enzymes is a cold-adapted - galactosidase (EC 3.2.1.23) which catalyzes the hydrolysis of - 1,4-glycosidic bonds in -galactosides. The most common - galactoside is lactose, a disaccharide which makes up 2-7% of milk. The majority of...
-
MutS3: a MutS homologue of unknown biological function
PublicationThe homologues of MutS proteins are widespread among both Prokaryotes and Eukaryotes. MutS designated as MutS1 is a part of MMR (mismatch repair) system which is responsible for removal of mispaired bases and small insertion/deletion loops in DNA. Initially, the only MutS homologues known were those engaged in mismatch repair and these were later designated as MutS1. Subsequently, the MutS2 homologue was distinguished. MutS2 does...
-
Zakażenia o etiologii Candida spp. - epidemiologia, leczenie, diagnostyka
PublicationInfekcje wywoływane przez grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. LIczba zakażeń szpitalnych spowodowanych przez te drobnoustroje wzrosła dziesięciokrotnie w przeciągu ostatnich 20 lat. Spowodowane jest to poprzez coraz częstsze wystawianie populacji na działanie czynników spprzyjających rozwojowi tego typu infekcji. Wśród nich znajduje się leczenie: antybiotykami, steroidami, cytostatykami oraz lekami immunosupresyjnymi....
-
B-GALACTOSIDASE ARTHROBACTER SP. 32cB - OBTAINING THE GENE SEQUENCE, CONSTRUCTION OF THE EXPRESSION SYSTEM, BIOSYNTHESIS AND BIOCHEMICAL CHARACTERIZATION OF THE ENZYME
PublicationINTRODUCTION: β-Galactosidase is an enzyme which catalyzes the hydrolysis of O glycosidic bond in β-galactosides. Another activity of β galactosidase is a transglycosylation activity. The main industrial use of this protein is the hydrolysis of lactose in milk in a cooling conditions. Synthesis of galactooligosaccharides, which are mostly used as a prebiotics added to some foods or available as dietary supplements, is only one...
-
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) as a diagnostic tool in detection of infectious diseases
PublicationLoop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a gene amplification method which amplifies DNA with high specificity and efficiency under isothermal conditions. Because of its rapidity and simplicity, it is a valuable diagnostic tool in the early detection and identification of infectious diseases. LAMP method is based on the use of a set of four to six specially designed primers spanning six to eight distinct sequences on the...
-
Epigenetic regulation and regeneration: the search for differentially methylated genes in the MRL mouse
PublicationThe MRL mouse is an inbred laboratory strain, which was developed in the 60’s of the 20th century and has been extensively used as a model of lupus erythematosus. The regenerative abilities of the strain were discovered in the 90' when the MRL mouse was shown to close 2 mm hole punches made in the ear pinnae four weeks after injury without scarring. The phenomenon has not been observed in other mouse strains, where the holes...
-
MutL protein as a constituent of vsp, ner and mmr repair systems
PublicationMutS and MutL proteins are renowned mostly for their functions in well-characterized, post-DNA replication mis- match repair system (MMR). However, there is growing evidence that MMR system is not the only field of action for these pro- teins. Moreover, the participation in MMR does not even have to be their primary function. There are some reports indicat- ing involvement of MutL in BER, NER and VSP (very short patch repair)....
-
Wytyczne dotyczące diagnostyki inwazyjnych zakażeń grzybiczych u pacjentów hematologicznych i onkologicznych
PublicationInwazyjne zakażenia grzybicze (ang. invasive fungal diseases - IFD) są główną przyczyną zachorowań i śmiertelności, szczególnie u pacjentów z nowotworami hematologicznymi. Grzyby, które są najczęstszymi przyczynami schorzeń u tego typu pacjentów to Aspergillus spp. oraz Candida albicans. Gatunki Candida nie-albicans oraz rosnąca liczba innych grzybów (np. Zygomycetes, Trichosporon, Fusarium spp.) są także coraz częściej wykrywane....
-
Sequence variants of p21 gene of the MRL/MpJ mouse: a possible association with the deficit of p21 protein and regenerative phenotype.
PublicationThe MRL/MpJ mouse is known for its enhanced regeneration abilities that manifested themselves by scarless ear-hole wound closure. The deficit of p21 found in the MRL is associated with the regenerative capacity as the p21 gene knockout in a mouse strain unrelated to the MRL mouse results in an ear-hole closure effect, similar to that observed in the MRL mouse. Cdkn1a gene encodes p21 protein, a cyclin-dependent kinase inhibitor,...
-
Różnicowanie C. albicans i C. dubliniensis w oparciu o polimorfizm genu syntazy homocytrynianowej z wykorzystaniem metody PCR RFLP
PublicationNajczęstszym czynnikiem etiologicznym zakażeń wywołanych przez drożdżaki z rodzaju Candida jest C. albicans. Gatunek ten posiada bardzo zbliżone cechy fenotypowe do C. dubliniensis co często wiąże się z błędną identyfikacją. Skutkuje to wtórnym zakażeniem wywołanym przez współwystepujący gatunek C. dubliniensis, który nabywa oporność na flikonazol stosowany w terapii C. albicans. Celem badań była konstrukcja układu diagnostycznego...
-
Genetycznie modyfikowane mikroorganizmy narzędziem służącym do usuwania metali ciężkich ze środowiska
PublicationMetale ciężkie są pierwiastkami metalicznymi i półmetalicznymi o gęstości powyżej 4,5 g•cm-3. Powodują zaburzenia w strukturze DNA, mogą być przyczyną chorób nowotworowych, układu nerwowego, pokarmowego, naczyniowego i kostnego. Wykorzystywane są w przemyśle chemicznym, elektromaszynowym, szklarskim, metalurgicznym, farbiarskim, wydobywczym, energetyce jądrowej. Wiele metali, takich jak kobalt, miedź, nikiel, stanowi mikroelementy...
-
Phase transition of a dimorphic fungus Penicillium marneffei
PublicationPenicillium marneffei is a pathogenic fungus that afflicts immunocompromised individuals who live or travel in Southeast Asia. This species is unique, because it is the only dimorphic member of the genus Penicillium. Dimorphism results from a process, termed phase transition, which is regulated by temperature of incubation. At room temperature, the fungus grows filamentously (mould phase), but at body temperature (37°C), a uninucleate...
-
Identyfikacja sekwencji markerowych w mikologicznej diagnostyce molekularnej
PublicationProcedury diagnostyki mikologicznej coraz częściej wykorzystują metody molekularne, oparte na analizie kwasów nukleinowych. Pozwala to na skrócenie czasu analizy oraz polepszenie wielu innych, istotnych dla procesu diagnostycznego parametrów takich jak: czułość, powtarzalność, specyficzność oraz potencjał różnicujący. Istotnym etapem przy projektowaniu układów do diagnostyki molekularnej grzybów jest wybór celu molekularnego. Powszechnie...
-
Cold-adapted bacterial lipolytic enzymes and their applications
PublicationLipolytic enzymes, esterases and lipases catalyze the hydrolysis and transesterification of fatty acid esters. This class of enzymes is the most important group of biocatalysts for biotechnological applications. From this perspective, coldactive lipolytic enzymes from cold adapted bacteria display attractive properties for some industrial purposes, including high catalytic activity at low temperatures and low thermostability. To...
-
The role of epigenetics in regeneration
PublicationComplex changes in chromatin structure and at the transcriptional level occur from the creation of a single parental gamete throughout fertilization, embryo development and the life of an adult organism. Epigenetic changes, such as methylation and hydroxymethylation of DNA or histone methylation and acetylation, are an important part of these processes. Epigenetic regulation has an essential influence on gene expression level. DNA...
-
Metylotransferazy ssaków – inhibitory i aktywatory
PublicationWśród metylotransferaz ssaków możemy wyróżnić metylotransferazy histonowe oraz metylotransferazy DNA. Metylacja DNA w obrębie wysp CpG oraz metylacja histonów wpływają na poziom ekspresji genów w komórkach ssaczych. Dodatkowo dzięki metylacji zapewniana jest stabilność i integralność genomu ludzkiego. Metylotransferazy DNA, będące głównym tematem tego artykułu, są często przedmiotem badań, gdyż nieprawidłowa metylacja DNA jest...
-
Rekombinowane białka fagowe - nowe narzędzie do wykrywania patogenów w żywności
PublicationArtykuł opisuje nowatorskie i rewolucyjne podejście do wykrywania patogenów w żywności, które polega na zastosowaniu w testach VIDAS specyficznych rekombinowanych białek pochodzących z bakteriofagów.
-
Immunization with an anti-idiotypic antibody against the broadly lipopolysaccharide-reactive antibody WN1 222-5 induces Escherichia coli R3-core-type specific antibodies in rabbits
PublicationThe mouse monoclonal antibody (mAb) WN1 222-5 recognizes a carbohydrate epitope in the inner core region of LPS that is shared by all strains of Escherichia coli and Salmonella enterica and is able to neutralize their endotoxic activity in vitro and in vivo. Immunization of mice with mAb WN1 222-5 yielded several anti-idiotypic mAbs one of which (mAb S81-19) competitively inhibited binding of mAb WN1 222-5 to E. coli and Salmonella...
-
Detection of Toxoplasma gondii oocysts in environmental samples
PublicationToxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite that has capacity to infect warm-blooded animals. Human toxoplasmosis is usually asymptomatic, whereas severe complications may occur in immunocompromised patients (e.g. AIDS) or in case of congenitalinfection. One of the sources of acquiring human toxoplasmosis is ingestion of T. gondii oocysts. It is known that newly infected cats can shed millions of oocysts into the environment,...
-
Novel single-stranded DNA-binding protein from psyvhrophilic bacterium Psychrobacter arcticus
PublicationTo study the biochemical properties of SSB from Psychrobacter arcticus (ParSSB), we have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed Escherichia coli overexpression systems. The gene consists of an open reading frame of 642 nucleotides encoding SSB protein of 213 amino acids with a calculated molecular mass of 22.8 kDa. The amino-acid sequence of ParSSB exhibits 49% identity and 57% similarity to Escherichia coli SSB....
-
PCR-ELISA: inexpensive alternative to quantitative PCR
PublicationPCR-ELISA (polymerase chain reaction-enzyme linked immunosorbent assay), a combination of PCR and ELISA methods, has been used since late 1980s. The technique is based on specially labelled DNA fragments which are captured by specific DNA sequences and detected by antibodies. The whole procedure of PCR-ELISA is divided into three steps: DNA extraction, PCR reaction and detection by ELISA. The method has been found as very specific...
-
Detection of Toxoplasma gondii in meat - available techniques
PublicationToxoplasma gondii, which belongs to the phylum Apicomplexa, is an absolute intercellular parasite that infects a wide range of hosts, including warm-blooded animals and humans. An infection with this parasite causes toxoplasmosis, which in most cases remains latent. However, this disease is a major threat to immunocompromised people and pregnant women. In extreme cases, it can damage nervous system or case fatal abortion. Infected...