Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 1892
-
Katalog
- Publikacje 1639 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 15 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 30 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 11 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 12 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 2 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 22 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 159 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: dna oxidative damage
-
Electron-Induced Decomposition of 5-Bromo-4-thiouracil and 5-Bromo-4-thio-2′-deoxyuridine: The Effect of the Deoxyribose Moiety on Dissociative Electron Attachment
PublikacjaWhen modified uridine derivatives are incorporated into DNA, radical species may form that cause DNA damage. This category of molecules has been proposed as radiosensitizers and is currently being researched. Here, we study electron attachment to 5-bromo-4-thiouracil (BrSU), a uracil derivative, and 5-bromo-4-thio-20 -deoxyuridine (BrSdU), with an attached deoxyribose moiety via the N-glycosidic (N1-C) bond. Quadrupole mass spectrometry...
-
Electron-Induced Decomposition of Uracil-5-yl O-(N,N-dimethylsulfamate): Role of Methylation in Molecular Stability
PublikacjaThe incorporation of modified uracil derivatives into DNA leads to the formation of radical species that induce DNA damage. Molecules of this class have been suggested as radiosensitizers and are still under investigation. In this study, we present the results of dissociative electron attachment to uracil-5-yl O-(N,N-dimethylsulfamate) in the gas phase. We observed the formation of 10 fragment anions in the studied range of electron...
-
The Caucasian flora: a still-to-be-discovered rich source of antioxidants
PublikacjaCellular redox homeostasis is a state of balance between the formation of Usually Reactive Oxygen and / or Nitrogen Species (ROS/RNS), endogenous antioxidant defence systems, and exogenous dietary antioxidants. The disturbance of redox homeostasis, by the overproduction of endogenous ROS/RNS, may increase the risk of development of so-called civilisation diseases. The solution seems to be either the increased production of endogenous...
-
Localization and Orientation of Xanthophylls in a Lipid Bilayer
PublikacjaXanthophylls (polar carotenoids) play diverse biological roles, among which are modulation of the physical properties of lipid membranes and protection of biomembranes against oxidative damage. Molecular mechanisms underlying these functions are intimately related to the localization and orientation of xanthophyll molecules in lipid membranes. In the present work, we address the problem of localization and orientation of two xanthophylls...
-
A new division of bacterial UvrA homologues
PublikacjaThe UvrA protein is a DNA-binding and damage-recognition enzyme which participates in the prokaryotic type nucleotide excision repair (NER) pathway. It has recently been noted that some bacterial genomes comprise additional uvrA genes which encode five distinct types of UvrA homologue. We investigated the sequences of over 2400 bacterial genomes and found 130 examples of bacteria containing uvrA 2 genes. The sequence analyses conducted...
-
Novel fused pyran derivatives induce apoptosis and target cell cycle progression in anticancer efficacy against multiple cell lines.
PublikacjaNitrogen-based heterocycles such as pyrazole, imidazole, 1,2,4-triazole, benzimidazole, and benzotriazole substituted fused pyran derivatives (6a–e, 8a–e, 10a–e, 12a–e,&14a–e) have been synthesized and tested for their in vitro anticancer efficacies against MCF7, A549, and HCT116 cancer cell lines. Among the compounds, 6e, 14b, and 8c were identified as the most potent against MCF7, A549, and HCT116, with IC50 values of 12.46 2.72...
-
The role of the sawage treatment plant in the removal of genotoxic compounds from the environment
PublikacjaOne reason for increased incidence of various types of cancer are environmental pollutants particularly of anthropogenic origin. All human activities may pollute the environment, but some have significant impact, just to mention energy industry, mining, transportation, chemical and petrochemical industries and housing. Environmental pollutants are a large group of compounds in terms of their physicochemical properties, some of...
-
Cell-penetrating peptides – mechanism of transduction and synthesis – short review
PublikacjaPotential antimicrobial agents may be effective if they are delivered efficiently to their site of action. In many cases, lack of permeability through the cell membrane is the main problem. One of the possible solutions could be a novel intracellular delivery system involving cell-penetrating peptides (CPPs), which may improve the efficiency of many new biophar-maceuticals. Among other things, CPPs are capable of trans-porting...
-
VUV photofragmentation of the six-membered heterocyclic molecules containing oxygen
PublikacjaCancer is a significant public health concern worldwide, which results in millions of deaths each year. The standard cure routine for cancer is surgery, and nowadays, radiotherapy or a hadrontherapy. Depending on the type of cancer, patients may undergo additional treatment, including targeted therapy. A combination of radio- or hadron-therapy with proper drug treatment can inhibit the proliferation of cancer cells and thus can...
-
Degradable poly(ester-ether) urethanes of improved surface calcium deposition developed as novel biomaterials
PublikacjaBones, which are considered as hard tissues, work as scaffold for human body. They provide physical support for muscles and protect intestinal organs. Percentage of hard tissues in human body depends on age, weight, and gender. Human skeleton consists of 206 connected bones. Therefore, it is natural that the hard-tissue damage such as fractures, osteoporosis, and congenital lack of bone may appear. The innovative way of bone healing...
-
Interactions of antitumor triazoloacridinones with DNA
PublikacjaW niniejszej pracy zbadano oddziaływanie sześciu wybranych pochodnych triazoloakrydonu z DNA. Analiza wiskozymetryczna pokazała, że związki te interkalują do DNA. Jednocześnie dalsze badania wykazały, że proces interkalacji nie jest istotny aktywności cytotoksycznej tej grupy związków. Badania z wykorzystaniem fibroblastów dowiodły, że jedna z pochodnych triazoloakrydonu, związek C-1305, po uprzedniej metabolicznej aktywacji indukuje...
-
The comparison of cytotoxic and genotoxic activities of glucosinolates, isothiocyanates, and indoles
PublikacjaChemopreventive properties of Brassica vegetables are attributed mainly to their characteristic compounds—glucosinolates (GLs) and their main hydrolysis products—isothiocyanates (ITCs) and indoles. In this study, we compared antiproliferative activity (MTT test in HT29 cells) and genotoxic effects (comet assay in HT29 cells and restriction analysis in a cell-free system) of three GLs (sinigrin (SIN), glucotropaeolin (GTL), and...
-
Abstract DNA-type systems
PublikacjaAbstrakcyjny system typu DNA jest definiowany przez zestaw nieliniowych kinetycznych równań z wielomianowymi nieliniowościami, które przyjmują rozwiązania solitonowe związane z geometrią helis. Zestaw równań pozwala na dwie różne reprezentacje Laxa: forma von Neumanna i Darboux-kowariantna para Laxa. Wyjaśniamy dlaczego nie-Kolmogorowskie modele prawdopodobieństwa pojawiające się w kinetyce solitonowej są naturalnie związane z...
-
The influence of global climate change on the environmental fate of anthropogenic pollution released from the permafrost
PublikacjaThis article presents a review of information related to the influence of potential permafrost degradation on the environmental fate of chemical species which are relased and stored, classified as potential influence in future Antarctic environment. Considering all data regarding climate change prediction, this topic may prove important issue for the future state of the Antarctic environment. A detailed survey on soil and permafrost...
-
9,10-Dioxoanthracenyldithiocarbamates effectively inhibit the proliferation of non-small cell lung cancer by targeting multiple protein tyrosine kinases
PublikacjaAnthraquinones have attracted considerable interest in the realm of cancer treatment owing to their potent anticancer properties. This study evaluates the potential of a series of new anthraquinone derivatives as anticancer agents for non-small-cell lung cancer (NSCLC). The compounds were subjected to a range of tests to assess their cytotoxic and apoptotic properties, ability to inhibit colony formation, pro-DNA damage functions,...
-
Structure, Physicochemical and Biological Properties of an Aqua (2,2′,2′′-Nitrilotriacetato)-oxidovanadium(IV) Salt with 4-Methylpyridinium Cation
PublikacjaThe crystal structure of a nitrilotriacetate (nta) oxidovanadi-um(IV) salt with 4-methylpyridinium cation, [4-Me(Py)H]+, of [4-Me(Py)H][VO(nta)(H2O)] stoichiometry was determined. The com-plex comprises a discrete mononuclear [VO(nta)(H2O)]–coordinationentity that can be rarely found among other known compounds con-taining nitrilotriacetate oxidovanadium(IV) moieties. The complex wascharacterized by spectroscopic (IR and EPR) methods,...
-
Effect of oxidation and in vitro intestinal hydrolysis on phospholipid toxicity towards HT29 cell line serving as a model of human intestinal epithelium
PublikacjaOxidation of food-derived phospholipids (PLs) can influence nutrient digestion and induce oxidative stress in gastrointestinal epithelium. In this study, hen egg yolk PL fraction was used to evaluate the effect of lipoxygenase (LOX)-induced PL oxidation on the rate of PL hydrolysis catalyzed by pancreatic phospholipase A2 (PLA2) in the presence of bile salts (BSs). Then, PL/BS solutions containing native or oxidized PLs were used...
-
Processing of 1-nitroacridine-induced DNA-DNA cross-links by topoisomerase I is associated with enhanced cellular survival: a possible role of topoisomerase I in the removal of DNA cross-links
PublikacjaW tej pracy wykazujemy, że modyfikacje plazmidu indukowane przez wzrastające dawki 1-nitroakrydyn (nitracrine i związek C-857) prowadzą do zahamowania aktywności katalitycznej topoizomerazy I. Hamowanie to związane jest z pojawieniem się pojedynczoniciowych uszkodzeń DNA i tworzeniem kowalencyjnych kompleksów topoizomeraza I-DNA. Nie obserwowano takich efektów dla topoizomerazy typu II.Dalsze badania wykazały, że jedna z 1-nitroakrydyn...
-
Synthesis of eosin modified TiO2 film with co-exposed {001} and {101} facets for photocatalytic degradation of para-aminobenzoic acid and solar H2 production
PublikacjaOwing to the increasing photosensitivity and DNA damage properties of para-aminobenzoic acid (PABA), concerns have been raised over the exposure of humans to PABA. Solar light-driven photocatalysis (SPC) provides a promising solution for the effective removal of organic pollutants especially when directed towards sulfate radical (SO4−) production. Herein, we have developed a sulfite-enhanced SPC using Eosin-Y sensitized TiO2/Ti...
-
Applying fuzzy logic to decisional DNA digital TV
PublikacjaWprowadzono wspomaganie oparte na logice rozmytej do modelu telewizji wykorzystujacej decyzyjny DNA.
-
Post-Effort Changes in Autophagy- and Inflammation-Related Gene Expression in White Blood Cells of Healthy Young Men
PublikacjaAcute, strenuous physical exertion requiring high levels of energy production induces the production of reactive oxygen species and metabolic disturbances that can damage the mitochondria. Thus, selective autophagic elimination of defective mitochondria may improve resistance to oxidative stress and potentially to inflammation. The main goal of this study was to evaluate the impacts of intense effort on changes in the expression...
-
Naturally occurring mitochondrial DNA heteroplasmy in the MRL mouse
PublikacjaThe MRL/MpJ mouse is an inbred laboratory strain of Mus musculus, known to exhibit enhanced autoimmunity, increased wound healing, and increased regeneration properties. We report the full-length mitochondrial DNA (mtDNA) sequence of the MRL mouse (Accession # EU450583), and characterize the discovery of two naturally occurring heteroplasmic sites. The first is a T3900C substitution in the TpsiCloop of the tRNA methionine gene...
-
Dimeric structure of the N-terminal domain of PriB protein from Thermoanaerobacter tengcongensis solved ab initio
PublikacjaPriB is one of the components of the bacterial primosome, which catalyzes the reactivation of stalled replication forks at sites of DNA damage. The N-terminal domain of the PriB protein from the thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis (TtePriB) was expressed and its crystal structure was solved at the atomic resolution of 1.09 Å by direct methods. The protein chain, which encompasses the first 104 residues of the...
-
Fuzyjne polimerazy DNA – otrzymywanie, charakterystyka i zastosowanie
PublikacjaObecnie reakcje PCR (ang. Polymerase Chain Reaction) wykazują bardzo szerokie zastosowanie w diagnostyce medycznej, biologii molekularnej czy inżynierii genetycznej. Efektywność tych reakcji rozumiana jako wydajność i wierność przeprowadzonej amplifikacji jest nieodłącznie związana ze stosowaną polimerazą DNA i warunkami prowadzenia reakcji PCR. Aby sprostać wymaganiom stawianym przez nowoczesne metody diagnostyczne oraz współczesną...
-
Retained features of embryonic metabolism in the adult MRL mouse
PublikacjaThe MRL mouse is an inbred laboratory strain that was derived by selective breeding in 1960 from the rapidly growing LG/J (Large) strain. MRL mice grow to nearly twice the size of other commonly used mouse strains, display uncommonly robust healing and regeneration properties, and express later onset autoimmune traits similar to Systemic Lupus Erythematosis. The regeneration trait (heal) in the MRL mouse maps to 14-20 quantitative...
-
Oxidative Medicine and Cellular Longevity
Czasopisma -
DNA modification by 1-nitroacridine derivatives. Comparison of 32P-Postlabeling and restriction enzyme analysis method for the detection of DNA adducts formed by 1-nitroacridines C-1748 and C-857
Publikacja4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny, zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. Metoda 32P-postlabellingu wykazała, że pochodne C-1748 i C-857 tworzą od 4-6 adduktów DNA w systemie komórkowym i bezkomórkowym o innym rozkładzie plam chromatograficznych, jednakże niezależnym od zastosowanego systemu aktywacyjnego. Metoda enzymatycznej analizy restrykcyjnej pozwoliła natomiast śledzić kinetykę...
-
DNA restriction analysis as a supportive tool in mechanistic studies carried out by 32P-postlabelling
PublikacjaNumerous antitumor and carcinogenic compounds are able to modify DNA by forming covalent bonds with its constituents, while some anticarcinogenic compounds are known to prevent such a modification. All these processes are of vital biological import_ance, though deeper inside into factors influencing formation of DNA adducts is difficult due to the low level of their occurrence. 32P-Postlabelling approach ensures very sensitive...
-
Interstrand crosslinking of DNA by C-1311 (Symadex) and other imidazoacridinones
PublikacjaImidazoakrydony, w tym pochodna C-1311 (Symadex) znajdująca się w pierwszej fazie badań klinicznych prowadzonych w USA, należą do grupy bardzo aktywnych związków przeciwnowotworowych zsyntetyzowanych w Katedrze Technologii Leków i Biochemii PG. Za pomocą zmodyfikowanej metody Parsons'a wykazaliśmy, że C-1311 indukuje, w sposób zależny od stężenia, międzyłańcuchowe wiązania sieciujące w komórkach różnych nowotworów ludzkiego pochodzenia...
-
Electroanalytical and spectroscopic procedures for examination of interactions between double stranded DNA and intercalating drugs
PublikacjaPrzedstawiono metodę elektrochemicznego opisu oddziaływań dsDNA ze związkiem biologicznie czynnym w warunkach, w których zarówno badany związek jak i cząsteczka DNA są w roztworze elektrolitu. Opracowano warunki pomiaru, gdzie ani związek, ani DNA nie adsorbuje na elektrodzie. Wykazano, podobnie jak podczas badania innymi metodami, że oddziaływania są dwojakiego rodzaju: elektrostatyczne i poporzez interkalację.
-
2-Methoxyestradiol and Hydrogen Peroxide as Promising Biomarkers in Parkinson’s Disease
PublikacjaEstrogens function in numerous physiological processes including controlling brain cell growth and differentiation. 2-Meth- oxestradiol (2-ME2), a 17β-estradiol (E2) metabolite, is known for its anticancer effects as observed both in vivo and in vitro. 2-ME2 affects all actively dividing cells, including neurons. The study aimed to determine whether 2-ME2 is a potentially cancer-protective or rather neurodegenerative agent in a...
-
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublikacjaThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
Interaction of antitumor triazoloacridone C-1305 and its analogs with telomeric DNA
PublikacjaBadaliśmy oddziaływanie pochodnej triazoloakrydonu C-1305 i jego bliskich analogów strukturalnych z oligonukleotydami zawierającycmi sekwencje telomerowe TTAGGG oraz oligonukleotydami sfałdowanymi w strukturę G-kwadrupleksu. Wykazaliśmy, że spośród badanych związków pochodna C-1305 wykazała największą specyficzność w stosunku do telomerowego DNA. Związek ten stabilizował także strukturę G-kwadrupleksu, podczas gdy jego analogi...
-
Influence of Diosmin Treatment on the Level of Oxidative Stress Markers in Patients with Chronic Venous Insufficiency
PublikacjaOxidative stress plays an important role in the pathophysiology of many human disorders, while antioxidants prevent the development of various adverse symptoms. Diosmin is a natural flavonoid applied in vascular system disorders, especially in chronic venous insufficiency (CVI), and it plays a significant part in the alleviation of CVI symptoms. Due to antioxidant activity, it also has the ability to scavenge the oxygen free radicals...
-
Comet assay-based methods for measuring DNA repair in vitro; estimates of inter- and intra-individual variation.
PublikacjaZdolność do naprawy uszkodzeń DNA jest jednym z najważniejszych wyznaczników podatności na choroby nowotworowe. Dlatego też użytecznym staje się możliwość pomiaru stopnia naprawy DNA w próbkach materiału badawczego pobranego od ochotników. Celem pracy było, po pierwsze, opracowanie w warunkach in vitro prostej metody (z wykorzystaniem techniki testu kometowego), w której naprawa DNA odbywa się poprzez wycinanie nukleotydów (NER)....
-
Epigenetic Basis of Regeneration: Analysis of Genomic DNA Methylation Profiles in the MRL/MpJ Mouse
PublikacjaEpigenetic regulation plays essential role in cell differentiation and dedifferentiation, which are the intrinsic processes involved in regeneration. To investigate the epigenetic basis of regeneration capacity, we choose DNA methylation as one of the most important epigenetic mechanisms and the MRL/MpJ mouse as a model of mammalian regeneration known to exhibit enhanced regeneration response in different organs. We report the...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublikacjaW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
GRA1 protein vaccine confers better immune response compared to codon-optimized GRA1 DNA vaccine
PublikacjaW publikacji oszacowano immunogenność i właściwości protekcyjne szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na białku rekombinantowym GRA1 oraz dwóch rodzajach szczepionek DNA (plazmidu zawierającego gen kodujący białko GRA1 dzikiego typu oraz modyfikowanego genu kodującego białko GRA1). Uzyskane wyniki sugerują lepsze właściowści immunoprotekcyjne rekombinantowego białka antygenowego niż szczepionek DNA.
-
Geologia dna morskiego 2021/2022
Kursy OnlineKurs przeznaczony jest dla studentów I semestru studiów II stopnia kierunku Inżynieria Morska i Brzegowa na WOiO i WILIŚ. Tematyka kursu obejmuje zagadnienia geologii morza, procesów formujących dno morskie i oceaniczne a także strefę brzegową oraz skał powstających w środowisku morskim.
-
INTERNATIONAL JOURNAL OF DAMAGE MECHANICS
Czasopisma -
Interstrand crosslinking of DNA in tumor and fibroblast cells by C-1311 (Symadex) and other imidazoacridinones
PublikacjaImidazoakrydony, w tym pochodna C-1311 znajdująca się w pierwszej fazie badań klinicznych prowadzonych przez firmę Xanthus Life Sciences, należą do grupy bardzo aktywnych związków przeciwnowotworowych zsyntetyzowanych w Katedrze Technologii Leków i Biochemii PG. Za pomocą zmodyfikowanej metody Parsons'a wykazaliśmy, że C-1311 indukuje w sposób zależny od stężenia międzyłańcuchowe wiązania sieciujące w komórkach różnych nowotworów...
-
Damage Control in Warships
PublikacjaAs a result of dynamic quantitative and qualitative developments in the maritime industry its participants face harder and harder challenges pertaining to safety of ships and navigation. Practice has shown that even very well organised fleets are harassed by emergencies and accidents that can be neither predicted nor absolutely avoided. In order to counter the occuring emergencies and accidents, and to minimize their effects damage...
-
DNA REPAIR
Czasopisma -
Mobile DNA
Czasopisma -
DNA SEQUENCE
Czasopisma -
DNA Reporter
Czasopisma -
Environmental DNA
Czasopisma -
Mitochondrial DNA
Czasopisma -
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublikacjaW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Folding‐upon‐repair DNA nanoswitches for monitoring DNA repair enzymes activity
PublikacjaWe demonstrate here a new class of DNA‐based nanoswitches that, upon enzymatic repair, could undergo a conformational change mechanism leading to a change in fluorescent signal. Such folding‐upon‐repair DNA nanoswitches are synthetic DNA sequences containing O6‐methyl‐guanine (O6‐MeG) nucleobases and labelled with a fluorophore/quencher optical pair. The nanoswitches are rationally designed so that only upon enzymatic demethylation...