Filters
total: 947
filtered: 789
-
Catalog
- Publications 789 available results
- Journals 12 available results
- Conferences 1 available results
- People 22 available results
- Inventions 11 available results
- Projects 11 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 2 available results
- e-Learning Courses 20 available results
- Open Research Data 78 available results
Chosen catalog filters
Search results for: DNA MISMATCH REPAI
-
Wiązanie się do DNA pochodnych 4-metylo-1-nitroakrydyny wykazujących właś-ciwości przeciwnowotworowe.**2003, 116 s. 23 rys. 12 tab. bibliogr. 163 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /09.05.2003/ P. Gdań. Wydz. Chem. Promotor: prof. dr hab. inż. J. Konopa.
Publication.
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pasteurianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pastuerianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Multisine impedimetric probing of biocatalytic reactions for label-free detection of DEFB1 gene: How to verify that your dog is not human?
PublicationAlbert is a dog (Canis familiaris), but he does not realize this. Albert loves human food (and beer), watching movies on the internet, sleeping in bed, and more. But he should not do all these things. To convince him that, we have desinged a test procedure. The DEFB1 gene is unique to human species. Detecting its presence from saliva and in short periods may offer an advantage in the field of forensic medicine, and influence Albert’s...
-
A 1-nS 1-V Sub-1-µW Linear CMOS OTA with Rail-to-Rail Input for Hz-Band Sensory Interfaces
PublicationThe paper presents an operational transconductance amplifier (OTA) with low transconductance (0.62–6.28 nS) and low power consumption (28–270 nW) for the low-frequency analog front-ends in biomedical sensor interfaces. The proposed OTA implements an innovative, highly linear voltage-to-current converter based on the channel-length-modulation effect, which can be rail-to-rail driven. At 1-V supply and 1-Vpp asymmetrical input driving,...
-
Assessment of E-government inclusion policies toward seniors: A framework and case study
PublicationDigital exclusion of seniors covers both social and technical drivers that affect the magnitude of this phenomenon. It arises from the fear of technology, reduced manual and mental abilities, socio-economic status, and also the mismatch between the technological environment and the needs of the elderly. The consideration of the needs of seniors are mainly implemented through social policies while the provision of government services...
-
Real-Time PCR: molecular technique of many applications
PublicationReal-Time PCR is a sensitive DNA amplification technique initially applied in genetics and molecular biology. It enables in vivo copying of the selected DNA fragment (flanked by two primers) by the thermostable polymerase (in the presence of magnesium ions and deoxynucleotide triphosphates) and simultaneous measurement of the fluorescence. For one or more specific sequences in a DNA sample, real-time PCR enables both detection...
-
Spectroelectroanalytical properties of antitumor agent C1311
PublicationZastosowano kilka metod woltamperometrycznych dla charakterystyki właściwości elektrochemicznych przeciwnowotworowej pochodnej imidazoakrydonu o symbolu C-1311. Wyniki wskazały, że możliwym będzie zastosowanie metod elektrochemicznych do badania oddziaływań badanego związku z DNA. Badania spektroelektrochemiczne ujawniły, że oscylacyjne zmiany absorbcji związku obserwowane po cyklicznej polaryzacji elektrody. Oscylacje te znikały...
-
ALIS-FLP: amplified ligation selected fragment-length polymorphism method for microbial genotyping
PublicationA DNA fingerprinting method known as ALIS-FLP (amplified ligation selected fragment-length polymorphism) has been developed for selective and specific amplification of restriction fragments from TspRI restriction endonuclease digested genomic DNA. The method is similar to AFLP, but differs in that only one specific restriction enzyme (TspRI) is used. The cohesive ends of the DNA fragments are ligated with two types of oligonucleotide....
-
The role of epigenetics in regeneration
PublicationComplex changes in chromatin structure and at the transcriptional level occur from the creation of a single parental gamete throughout fertilization, embryo development and the life of an adult organism. Epigenetic changes, such as methylation and hydroxymethylation of DNA or histone methylation and acetylation, are an important part of these processes. Epigenetic regulation has an essential influence on gene expression level. DNA...
-
Instalacja i wstępna analiza danych batymetrycznych pochodzących z echosondy wielowiązkowej
PublicationW akustycznym telemonitoringu środowiska morskiego stosowane są dwa rodzaje sonarów, a mianowicie: sonary boczne i echosondy wielowiązkowe. Oba systemy dostarczają danych zarówno dla batymetrii, jak i dla akustycznego obrazowania dna morskiego. Echosondy wielowiązkowe są zaawansowanymi technologicznie urządzeniami, które dzięki wielokierunkowej obserwacji szerokokątnej dna, przy jednoczesnym utrzymaniu wysokiej rozdzielczości kątowej,...
-
Discrimination of hospital isolates of Acinetobacter baumannii using repeated sequences and whole genome alignment differential analysis
PublicationAn optimized method for bacterial strain differentiation, based on combination of Repeated Sequences and Whole Genome Alignment Differential Analysis (RS&WGADA), is presented in this report. In this analysis, 51 Acinetobacter baumannii multidrug-resistance strains from one hospital environment and patients from 14 hospital wards were classified on the basis of polymorphisms of repeated sequences located in CRISPR region, variation...
-
Adaptive neuro fuzzy and fuzzy decision tree classifiers as applied to sea floor characterization.
PublicationPrzedstawiono wyniki badań wpływu różnych parametrów echa odbitego od dna morskiego na dokładność klasyfikacji typu dna przy pomocy sieci neuronowej z logiką rozmytą i przy pomocy drzew decyzyjnych. W szczególności uwzględniono takie parametry echa jak: energia, amplituda i nachylenie opadającego zbocza, wzbogacone o współczynniki falkowe otrzymane z dyskretnej transformacji falkowej (DWT).
-
Two-state dynamics for replicating two-strand systems
PublicationDynamika dwustanowa została zastosowana do opisów układów dwuniciowych, analogicznych do DNA.
-
Homocitrate synthase gene as a new molecular target in diagnostics of Candida spp. infections
PublicationNew potential molecular target which will be investigated during this research (homocitrate synthase gen) is the innovative target other than ribosomal DNA. This gene encodes enzyme present only in fungi and some Archaea what significantly increases specificity. It also reduces risk of contamination or influence of other factors (reaction with other DNA present in sample derived from bacteria or host cells) what excludes false...
-
Evaluation and cellular responses of modulators of TRF1/TRF2 protein’s function as potential anticancer drugs interfering with telomeric shelterin’s function
PublicationA number of proteins that interact with telomeres have been identified in human cells, indicating the high plasticity of human nucleoprotein complex organization. The most important complex is the "shelterin" complex, which consists of six proteins: TRF1, TRF2, TIN2, POT1, TPP1. The TRF1 and TRF2 directly bind to telomeric double-stranded DNA and the TIN2 protein. The TIN2 protein also binds to the TPP1 protein, stabilizing the...
-
System do diagnostyki dermatofitowych zakażeń powierzchniowych oparty na technice Real-Time PCR
PublicationDermatofity należą do blisko spokrewnionej grupy grzybów, które wykazują wysokie powinowactwo do skeratynizowanych tkanek. Cecha ta czyni je odpowiedzialnymi za powierzchniowe grzybice skóry, paznokci oraz włosów. Szacuje się, iż nawet do 20% ludzi na całym świecie dotkniętych jest infekcjami powodowanymi przez dermatofity. Ich leczenie wymaga długotrwałego zastosowania leków przeciwgrzybiczych. W celu dobrania odpowiedniego leczenia...
-
Selected results of the parametric sounding of the Gdansk Bay
PublicationW pracy przedstawiono metodykę i wyniki sondowania dna Zatoki Gdańskiej echosondą parametryczną.
-
Light-Modulated Sunscreen Mechanism in the Retina of the Human Eye
PublicationThe functioning of the human eye in the extreme range of light intensity requires a combination of the high sensitivity of photoreceptors with their photostability. Here, we identify a regulatory mechanism based on dynamic modulation of light absorption by xanthophylls in the retina, realized by reorientation of pigment molecules induced by trans–cis photoisomerization. We explore this photochemically switchable system using chromatographic...
-
Experience Based Clinical Decision Support Systems: An Overview and Case Studies
PublicationThis chapter briefly overviews the evolution of the application of the Decisional DNA and the Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) in the medical domain and in particular in the specific case of the experience-based decision support systems. Decisional DNA, as a knowledge representation structure, offers great possibilities on gathering explicit knowledge of formal decision events as well as a tool for decision making...
-
Immunological response of sheep to injections of plasmids encoding Toxoplasma gondii SAG1 and ROP1 genes
PublicationInfection with the intracellular protozoan parasite Toxo¬plasma gondii (T. gondii) causes health problems to both humans and livestock and has a large economic impact worldwide. The immune response in sheep following infection with T. gondii was evaluated using six different combinations of plasmid DNA, recombinant antigen and adjuvant. Sheep were generally vaccinated twice by intramuscular injection with plasmid DNA containing...
-
The Toolbox of Methods for Multidirectional Characterization of Dietary Nucleic Acids; Verification for Raw and Processed Food Products
PublicationCurrently, the nutritional value of food is associated mainly with components such as proteins, carbohydrates, and lipids. However, another important macromolecules present in many foods are dietary nucleic acids (dietNA), i.e., DNA as well as both coding and non-coding RNAs. In the context of food chemistry and nutrition, dietNA are nowadays vastly neglected. In consequence, there are no dedicated methodologies to characterize...
-
Developing an Ontology from Set of Experience KnowledgeStructure
PublicationWhen referring to knowledge forms,collecting for all decision eventsin a knowledge-explicit way becomes a significant ask for any company. Set of experience knowledge structure can assis in accomplishing this purpose.However,after collecting,distributing and sharing that knowledge as adecisional DNA is even a more important advance.Distributing and sharing companies' decisional DNA through an efficient development of Ontologies...
-
Badania zespołów przekazujących małe ryby z urządzenia pozycjonującego do zespołu obróbczego
PublicationW pracy przedstawiono badania oraz ich wyniki, przekazywania szprota w kanałach o oryginalnej schodkowej konstrukcji dna.
-
Genotoxic properties of glucosinolates and isothiocyanates present in Brassica vegetables
PublicationThe bioactive phytochemicals found in Brassica vegetables, in this number glucosinolates (GLS), as well as products of their degradation such as isothiocyanates (ITC) and indoles, are regarded as the most promising chemopreventive compounds. These secondary metabolites display stron antibiological activity and constitute defence system preventing the development of agrophages attacking Brassica plants. Such properties suggest...
-
Experience based knowledge representation for Internet of Things and Cyber Physical Systems with case studies
PublicationCyber Physical Systems and Internet of Things have grown significant attention from industry and academia during the past decade. The main reason behind this interest is the capabilities of such technologies to revolutionize human life since they appear as seamlessly integrating classical networks, networked objects and people to create more efficient environments. However, enhancing these technologies with intelligent skills becomes...
-
On long-term prediction of stresses in principal members of ship hull structures.
PublicationOpisano krytycznie wymagania towarzystw klasyfikacyjnych dotyczące oceny wytrzymałości wzdłużnych wiązarów i wzdłużnych usztywnień poszycia kadłuba statku. Przedstawiono sposób prognozowania długoterminowego dynamicznych składowych tych naprężeń oraz zaproponowano sposób składania charakterystycznych wartości poszczególnych składowych naprężeń do zastosowania w przepisach Polskiego Rejestru Statków. Sposób ten bazuje na koncepcji...
-
KEMR-Net: A Knowledge-Enhanced Mask Refinement Network for Chromosome Instance Segmentation
PublicationThis article proposes a mask refinement method for chromosome instance segmentation. The proposed method exploits the knowledge representation capability of Neural Knowledge DNA (NK-DNA) to capture the semantics of the chromosome’s shape, texture, and key points, and then it uses the captured knowledge to improve the accuracy and smoothness of the masks. We validate the method’s effectiveness on our latest high-resolution chromosome...
-
Localization and Orientation of Xanthophylls in a Lipid Bilayer
PublicationXanthophylls (polar carotenoids) play diverse biological roles, among which are modulation of the physical properties of lipid membranes and protection of biomembranes against oxidative damage. Molecular mechanisms underlying these functions are intimately related to the localization and orientation of xanthophyll molecules in lipid membranes. In the present work, we address the problem of localization and orientation of two xanthophylls...
-
Integrating Experience-Based Knowledge Representation and Machine Learning for Efficient Virtual Engineering Object Performance
PublicationMachine learning and Artificial Intelligence have grown significant attention from industry and academia during the past decade. The key reason behind interest is such technologies capabilities to revolutionize human life since they seamlessly integrate classical networks, networked objects and people to create more efficient environments. In this paper, the Knowledge Representation technique of Set of Experience...
-
Making digital TV smarter: capturing and resusing experience in digital TV
PublicationZaproponowano inteligentny system wspomagania funkcjonowania telewizji cyfrowej opraty na decyzyjnym DNA oraz formalizacji wiedzy w postaci zbioru doswiadczen.
-
On the time behaviour of Okazaki fragments
PublicationW pracy wyprowadzono wzory na prawdopodobieństwo, że podczas procesu replikacji DNA w chwili t pojawi się n fragmentów Okazaki.
-
Rational design, synthesis and biological evaluation of thiadiazinoacridines: a new class of antitumor agents.
PublicationZsyntetyzowano serię związków o potencjalnej zdolności do wiązania się z DNA z grupy tiadiazinoakrydyn poprzez cyklizację odpowiednich pochodnych 9-imino-4-nitro-9,10-dihydroakrydyny. Zbadano ich zdolność do wiązania się z DNA oraz cytotoksyczność względem kilku linii komórek nowotworwych. Badania aktywności przeciwnowotworowej wobec białaczki P388 wskazały na zgodność tych wyników z wynikami cytotoksyczności in vitro. Wykazano,...
-
Catalytic topoisomerase II inhibitors in cancer therapy.
PublicationDNA topoizomeraza II jest jednym z głównych celów molekularnych dla leków stosowanych w terapii przeciwnowotworowej. Wszystkie inhibitory tego enzymu są zdolne do zakłócania w jeden z etapów cyklu katalitycznego topoizomerazy II. Związki, które stabilizują kowalencyjny kompleks DNa i topoizomerazy II (znany jako kompleks rozszczepialny) są nazywane truciznami topoizomerazy, inne związki, które hamują aktywność enzymu na innych...
-
Experience oriented enhancement of smartness for Internet of Things
PublicationIn this paper, we propose a novel approach, the Experience-Oriented Smart Things that allows experiential knowledge discovery, storage, involving, and sharing for Internet of Things. The main features, architecture, and initial experiments of this approach are introduced. Rather than take all the data produced by Internet of Things, this approach focuses on acquiring only interesting data for its knowledge discovery process. By...
-
Przyczynek do zagadnienia zaburzeń brzegowych w połączeniu płaszcza z dnem stalowego zbiornika walcowego
PublicationOmowiono wpływ sprężystości podłoża gruntowego i wielkości wysięgu obwodu dna poza płaszcz na wartość zaburzeń brzegowych w połączeniu płaszcza z dnem.
-
Real-time PCR approach in dermatophyte detection and Trichophyton rubrum identification
PublicationDermatophytes are keratinophilic molds that infect human hair, nails and skin. Diagnosis of dermatophytosis is based on morphological, serological and biochemical features. However, identification is difficult and laborious due to similarities between microorganisms. Thus, there is considerable interest to develop mycological diagnostic procedures based on molecular biology methods. In this study, fast, two-step DNA extraction...
-
Application of CDMA modulated signals in seafloor remote sensing
PublicationW artykule omowiono zastosowanie modulacji CDMA w procesie detekcji echa od dna. Wyniki badan przedstawone zostaly dla symulacji z wykorzystaniem symulatora BORIS.
-
Elektrociepłownia gazowa we Władysławowie
PublicationPrzedstawiono bliżej układ technologiczny elektrociepłowni we Władysławowie opartej na działaniu turbin gazowych zasilanych gazem odpadowym towarzyszącemu ropie naftowej wydobywanej z dna morskiego.
-
Electrical properties of Na2O-CaO-P2O5 glasses doped with SiO2 and Si3N4
PublicationSodium-calcium-phosphate glasses doped with SiO2 or Si3N4 having similar sodium ion concentrations were prepared by melt quenching. The conductivity was measured by impedance spectroscopy under nitrogen atmosphere in a wide frequency range (10 mHz–1 MHz) and wide temperature range (153–473 K). At 36.6 °C, DC conductivities of all glasses vary between 1.1 ∗ 10−12 and 8.9 ∗ 10−12 S cm−1 and have similar activation energies (between...
-
Thermal and Chemical Expansion in Proton Ceramic Electrolytes and Compatible Electrodes
PublicationThis review paper focuses on the phenomenon of thermochemical expansion of two specific categories of conducting ceramics: Proton Conducting Ceramics (PCC) and Mixed Ionic-Electronic Conductors (MIEC). The theory of thermal expansion of ceramics is underlined from microscopic to macroscopic points of view while the chemical expansion is explained based on crystallography and defect chemistry. Modelling methods are used to predict...
-
Molecular dynamics simulation and MM-PBSA analysis of Oxytricha nova TEBP ternary complex with ssDNA
PublicationPraca dotyczy badań metodami chemii obliczeniowej właściwości elektrostatycznych i termodynamicznych kompleksu telomerowego białka TEBP pochodzącego z organizmu Oxytricha z jednoniciowym telomerowym DNA (ssDNA).
-
Uszkodzenia korozyjne wewnątrz stalowych zbiorników na paliwa płynne. Co najbardziej zagraża?
PublicationScharakteryzowano przyczyny korozji w poszczególnych strefach wewnętrznej powierzchni płaszcza, dna i dachu zbiornika stalowego na paliwa płynne. Scharakteryzowano uszkodzenia wywołane korozją wewnątrz zbiornika.
-
Awaria dwupłaszczowego zbiornika stalowego na gorące media
PublicationPodano przyczyny uszkodzenia dna zbiornika dwupłaszczowego przeznaczonego do magazynowania asflatu w temperaturze ok. 200 C. Wskazano na konieczność wprowadzenia zmian w konstrukcji zbiornika.
-
A strong preference for the TA/TA dinucleotide step discovered for an acridine-based, potent antitumor dsDNA intercalator, C-1305: NMR-driven structural and sequence-specificity studies
PublicationTriazoloacridinone C-1305, a potent antitumor agent recommended for Phase I clinical trials, exhibits high activity towards a wide range of experimental colon carcinomas, in many cases associated with complete tumor regression. C-1305 is a well-established dsDNA intercalator, yet no information on its mode of binding into DNA is available to date. Herein, we present the NMR-driven and MD-refined reconstruction of the 3D structures...
-
Systemowe ryzyko płynności w polskim systemie bankowym – determinanty i trendy
PublicationCelem rozprawy jest określenie metod pomiaru systemowego ryzyka płynności oraz pomiar tego ryzyka dla polskiego systemu bankowego za pomocą zaproponowanych metod, w oparciu o dostępne dane. Do celów rozprawy zaliczyć należy również przedstawienie problemu systemowego ryzyka płynności od strony jego wpływu na gospodarkę. Zgodnie z hipotezą główną, systemowe ryzyko płynności w polskim systemie bankowym w latach 1996-2012 wzrosło....
-
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein.
PublicationGen mutS z termofilnej bakterii Thermus thermophilus zamplifikowano przy użyciu PCR, sklonowano i przeprowadzono jego ekspresję w E. coli. Rekombinantowe białko MutS zawierające oligohistydynową domenę na N-końcu oczyszczono w jednoetapowej procedurze przy wykorzystaniu chromatografii powinowactwaNi(2+). Zdolność do rozpoznania niekomplementarności białka his(6)-MutS potwierdzono w eksperymentach ochrony DNA przed trawieniem...
-
Recombinant !ermostable AP Exonuclease from Thermoanaerobacter tengcongensis: Cloning, Expression, Purification, Properties and PCR Application
PublicationApurinic/apyrimidinic (AP) sites in DNA are considered to be highly mutagenic and must be corrected to preserve genetic integrity, especially at high temperatures. !e gene encoding a homologue of AP exonuclease was cloned from the thermophilic anaerobic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis and transformed into Escherichia coli. The protein product showed high identity (80%) to human Ape1 nuclease, whereas to E. coli exonuclease...
-
RecA Proteins from Deinococcus geothermalis and Deinococcus murrayi - Cloning, Purification and Biochemical Characterisation
PublicationEscherichia coli RecA plays a crucial role in recombinational processes, the induction of SOS response and mutagenic lesion bypasses. It has also been demonstrated that RecA protein is indispensable when it comes to the reassembly of shattered chromosomes in gamma-irradiated Deinococcus radiodurans, one of the most radiation-resistant organisms known. Moreover, some functional differences between E. coli and D. radiodurans RecA...
-
3d Visualization of Seabed from Multibeam Sonar Records Using TriangularIrregular Mesh. W: [CD-ROM] Forum Acusticum Sevilla 2002. 3rd European Con-gres on Acoustics. XXXIII Spanish Congress on Acoustics-TECNIACUSTICA 2002.European and Japanese Symposium on Acoustics. Sevilla, Spain 16-20 Septem- ber 2002. Madrid: Soc. Espanola de Acustica**2002 vol. 33, [6 s.] 4 rys. bibliogr. 6 poz. ISBN: 84-87985-06-8 Special Issue of the Journal Revista de Acustica, vol.33, ano 2002. Trójwym. wizual.dna mors. z danych pochodz. z echosond wielowiąz. z wykorz.niergul.siat.TIN.
PublicationPrzedstawiono sposób trójwymiarowej wizualizacji dna morskiego przy wyko-rzystaniu siatki nieregularnej (TIN) otrzymanej w wyniku triangularyzacjioraz porównano otrzymane wyniki z rzeczywistymi pomiarami batymetrycznymidna Bałtyku Południowego.