Search results for: GRAM UJEMNE BAKTERIE
-
Development of Safirinium dyes for new applications: fluorescent staining of bacteria, human kidney cells, and the horny layer of the epidermis
PublicationLow-molecular synthetic fluorophores are convenient tools in bioimaging applications. Several derivatives of Safirinium dyes as well as their reactive N-hydroxysuccinimide (NHS) esters bearing diverse substituents were synthesized and evaluated experimentally in terms of their lipophilicity by means of reverse-phase and immobilized artificial membrane high-performance liquid chromatography. Subsequently, the selected compounds...
-
Bioactive and biodegradable cotton fabrics produced via synergic effect of plant extracts and essential oils in chitosan coating system
PublicationFunctional antibacterial textile materials are in great demand in the medical sector. In this paper, we propose a facile, eco-friendly approach to the design of antibacterial biodegradable cotton fabrics. Cotton fiber fabrics were enhanced with a chitosan coating loaded with plant extracts and essential oils. We employed Fourier-transform infrared (FTIR) and X-ray photoelectron spectroscopy (XPS), UV–Vis spectrophotometry, optical...
-
Prozdrowotne właściwości fermentowanych napojów aroniowych i aroniowo-herbacianych
PublicationKombucha to lekko kwaśny, orzeźwiający napój otrzymywany w wyniku fermentacji słodkiej herbaty przez żyjące w konsorcjach bakterie octowe oraz osmofilne drożdże, tzw. grzybek herbaciany. Drobnoustroje te próbuje się wykorzystać również do produkcji funkcjonalnych napojów na bazie surowców innych niż herbata. Celem pracy było otrzymanie fermentowanych napojów z ekstraktu z wytłoków z aronii z lub bez dodatku naparu z zielonej herbaty...
-
Role of size scale of ZnO nanoparticles and microparticles on toxicity toward bacteria and osteoblast cancer cells
PublicationThe specific role of size scale, surface capping, and aspect ratio of zinc oxide (ZnO) particles on toxicity toward prokaryotic and eukaryotic cells was investigated. ZnO nano and microparticles of controlled size and mor- phology were synthesized by wet chemical methods. Cytotoxicity toward mammalian cells was studied using a human osteoblast cancer cell line and antibacterial activity using Gram-negative bacteria (Escherichia...
-
Inhibitory and antimicrobial activities of OGTI and HV-BBI peptides, fragments and analogs derived from amphibian skin
PublicationA series of linear and cyclic fragments and analogs of two peptides (OGTI and HV-BBI) isolated from skin secretions of frogs were synthesized by the solid-phase method. Their inhibitory activity against several serine proteinases: bovine beta-trypsin, bovine alpha-chymotypsin, human leukocyte elastase and cathepsin G from human neutrophils, was investigated together with evaluation of their antimicrobial activities against Gram-negative...
-
Intensification of fire-fighting wastewater biotreatment
PublicationDuża ilość ścieków pożarniczych powstała w trakcie akcji gaśniczej w jednej z rafinerii w północnej Polsce w 2003 roku. Bakterie wyizolowane ze ścieków pożarniczych dodano do osadu czynnego w celu zintensyfikowania procesów biologicznych. Zbadano efektywność biologicznego oczyszczania tychże ścieków, uwzględniając nitryfikację, w laboratoryjnym reaktorze z osadem czynnym. Ok. 50 % lepszy efekt redukcji ChZT oraz ok. 40 % zmniejszenie...
-
Microbial risks in mild hot smoking of fish
PublicationGorące wędzenie ryb w łagodnych warunkach, w temperaturze nie przekraczającej 65 stopni Celsjusza wewnątrz ryby i przy niskiej zawartości soli w mięsie tylko częściowo inaktywuje bakterie chorobotwórcze oraz w niewystarczającym stopniu hamuje wzrost drobnoustrojów podczas przechowywania produktu. Wymagane bezpieczeństwo można osiągnąć tylko w przypadku bardzo świeżego surowca i wysokiej higieny podczas jego przetwarzania oraz przechowywania...
-
Hanna Staroszczyk dr hab. inż.
PeopleAbsolwentka Wydziału Inżynierii i Technologii Chemicznej Politechniki Krakowskiej, od 2007 roku pracuje w Katedrze Chemii, Technologii i Biotechnologii Żywności Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej. Pracowała w Politechnice Krakowskiej, Akademii Rolniczej w Krakowie, Institute of Food Research w Norwich, Academia Sinica w Tajpej oraz University of Arkansas w Fayetteville. W 2013 roku uzyskała stopień doktora habilitowanego...
-
Antibacterial properties of laser-encapsulated titanium oxide nanotubes decorated with nanosilver and covered with chitosan/Eudragit polymers
PublicationTo provide antibacterial properties, the titanium samples were subjected to electrochemical oxidation in the fluoride-containing diethylene glycol-based electrolyte to create a titanium oxide nanotubular surface. Afterward, the surface was covered by sputtering with silver 5 nm film, and the tops of the nanotubes were capped using laser treatment, resulting in an appearance of silver nanoparticles (AgNPs) of around 30 nm in diameter...
-
Clay-filled starch films. Part I: Effect of clay kind and glycerol concentration on functional properties of composites
PublicationThe aim of this work was to improve the mechanical and water barrier properties of composite filmsprepared from starch and clays, plasticized with glycerol at different concentrations. The effects ofhydrophilic Closite Naþand Nanomer PGV were compared with that exerted by organicallymodifiedmorehydrophobicNanofil2 and NanoBent ZR-1. The antimicrobial activity of compositescontaining hydrophobic clays was also investigated. The hydrophilic...
-
Oxolane Ammonium Salts (Muscarine-Like)—Synthesis and Microbiological Activity
PublicationCommercially available 2-deoxy-D-ribose was used to synthesize the appropriate oxolane derivative—(2R,3S)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol—by reduction and dehydration/cyclization in an acidic aqueous solution. Its monotosyl derivative, as a result of the quaternization reaction, allowed us to obtain eight new muscarine-type derivatives containing a quaternary nitrogen atom and a hydroxyl group linked to the oxolane ring. Their structure...
-
Evaluation of antimicrobial activity of porous composites based on chitosan/poly (vinyl alcohol)
Open Research DataThe dataset contains the results of microbiological tests of composite porous materials whose activity was assessed for their ability to reduce the number of Escherichia coli and Staphylococcus aureus strain, representing the Gram (-) and Gram (+) bacteria, respectively.
-
The first Polish interlaboratory comparision of the luminescent bacteria bioasssay with three standard toxicants
PublicationBadania biegłości laboratoriów z zastosowaniem odpowiednich materiałów referencyjnych powinny być regularnie wykonywane dla potwierdzenia jakości stosowanej procedury. W pracy zaprezentowano rezultaty pierwszych badań przeprowadzonych dla 9 polskich laboratoriów w zakresie oznaczania toksyczności z zastosowaniem bakterii Vibrio fischeri.Wyniki pokazują, że pierwsze polskie porównania międzylaboratoryjne biotestu opartego o bakterie...
-
Sulphate reducing bacteria in groundwater intakes in Gdańsk Region.
PublicationPraca przedstawia wyniki badań określające występowanie bakterii redukujących siarczany w wodach podziemnych ujmowanych z utworów kredowych oraz z utworów czwartorzędowych w regionie gdańskim. Bakterie te okresowo znajdują odpowiednie warunki do wzrostu w środowisku wód podziemnych i w wyniku procesów metabolizmu produkują siarkowodór pogarszający cechy organoleptyczne wody. W celu ograniczenia niekorzystnych zmian jakości wody...
-
Paenibacillus alvei MP1 as a Producer of the Proteinaceous Compound with Activity against Important Human Pathogens, Including Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes
PublicationAn emerging need for new classes of antibiotics is, on the one hand, evident as antimicrobial resistance continues to rise. On the other hand, the awareness of the pros and cons of chemically synthesized compounds’ extensive use leads to a search for new metabolites in already known reservoirs. Previous research showed that Paenibacillus strain (P. alvei MP1) recovered from a buckwheat honey sample presented a wide spectrum of...
-
Wspólna lokalizacja jako katalizator i inhibitor rozwoju klastrów
PublicationStreszczenie: Głównym problemem badawczym poruszonym w artykule są zalety i wady wspólnej lokalizacji. Celem artykułu był przegląd koncepcji teoretycznych poświęconych konsekwencjom umiejscowienia podmiotów gospodarczych w konkretnych warunkach geograficznych i społecznych. Większość omawianych koncepcji została zaprezentowana w kontekście struktur klastrowych, dla których kwestia zakotwiczenia na określonym obszarze jest jedną...
-
Anthra[1,2-d][1,2,3]triazine-4,7,12(3H)-triones as a New Class of Antistaphylococcal Agents: Synthesis and Biological Evaluation
PublicationThe development and spread of resistance of human pathogenic bacteria to the action of commonly used antibacterial drugs is one of the key problems in modern medicine. One of the especially dangerous and easily developing antibiotic resistant bacterial species is Staphylococcus aureus. Anthra[1,2-d][1,2,3]triazine-4,7,12(3H)-triones 22–38 have been developed as novel effective antistaphylococcal agents. These compounds have been...
-
Badania bioaktywności modyfikowanego cementu kostnego – przegląd literaturowy
PublicationCelem pracy jest przybliżenie aspektów związanych z modyfikowaniem cementu kostnego w celu nadania mu właściwości bioaktywnych. Przedstawiono obecnie stosowane bioaktywne modyfikacje, które mają charakter profilaktyczny (zapobiegają infekcjom), terapeutyczny (zwalczają bakterie) oraz pobudzający osteointegrację. Ukazano metody oceny modyfikacji bioaktywnych i zreferowano ich procedury, m.in. badania mikroskopowe, starzenie w roztworze...
-
Józef Kur prof. dr hab.
People -
Organizmy obecne w osadzie dennym basenów kąpielowych
PublicationMonitorowanie parametrów wody basenowej jest istotne z uwagi na zdrowie osób korzystających z basenu jak i pracowników obsługi. Istnieją trzy źródła materii organicznej: woda dostarczona do basenu, pasywne zanieczyszczenia wnoszone przez osoby kąpiące się oraz zanieczyszczenia organiczne w postaci moczu i kału. Jakość wody w basenach powinna być porównywalna do jakości wody pitnej. Jakość mikrobiologiczna opiera się na tradycyjnych...
-
Ocena wrażliwości na fluorochinolony drobnoustrojów izolowanych od pacjentów z zakażeniami układu moczowego leczonych w warunkach ambulatoryjnych
PublicationWykazano, że drobnoustroje powodujące zakażenia układu moczowego u pacjentów ambulatoryjnych są nadal wrażliwe na fluorochinolony; dotyczy to jednak drobnoustrojów z rodziny Enterobacteriacae. Natomiast w przypadku zakażeń drobnoustrojami Gram-dodatnimi leki te mogą okazać się nieskuteczne. Stwierdzono silne działanie bakteriobójcze preparatu Betadine na wszystkie badane izolaty. Uzyskano redukcję liczby żywych bakterii w zawiesinie...
-
Escherichia coli - zapomniany patogen posocznic
PublicationPrzedstawiono próbę retrospektywnej analizy częstości występowania bakteriemii Gram-ujemnych, wywołanych przez E. coli u chorych hospitalizowanych w ośmiu grupach oddziałów klinicznych SPSK1 ACK AM w Gdańsku w latach 2002-2004. Dokonano oceny częstości występowania bakteriemii o etologii E. coli, liczby zgonów związanych bezpośrednio z posocznicą, analizy potencjalnych wrót zakażenia oraz analizy lekowrażliwości szczepów E. coli...
-
KOSZTY NIEWYKORZYSTANYCH ZASOBÓW NA ODDZIALE SZPITALNYM
PublicationZadaniem podmiotów leczniczych jest poprawa zdrowia osób zgłaszających się po pomoc medyczną. Usługi zdrowotne tym różnią się od pozostałych, że oprócz planowanych przyjęć i zabiegów istnieją przypadki wymagające nagłej i szybkiej interwencji medycznej. Zakłady opieki zdrowotnej zobligowane są do utrzymywania określonego poziomu zdolności usługowych. Konsekwencją są koszty niewykorzystanych zasobów. Celem artykułu jest zaprezentowanie...
-
Matematyczny świat wirusów i bakterii
PublicationKiedyś, mówiąc o zastosowaniach matematyki, przychodziła nam na myśl głównie fizyka. Dziś wiemy, że matematyka ma ważne zastosowania również w biologii i medycynie. To, jak szybko rozwijają się bakterie i wirusy oraz jak szybko odpowiada na ich obecność nasz układ odpornościowy, można opisać językiem matematyki. Głównym narzędziem służącym do opisu tempa zmiany interesującej nas wielkości jest pochodna. Dzięki pochodnej możemy przewidzieć...
-
Bee Bread Exhibits Higher Antimicrobial Potential Compared to Bee Pollen
PublicationThis study aimed at investigation of the antimicrobial potential of ethanolic extracts of bee bread (BB) and bee pollen (BP) and suspensions of these products in MHB (Mueller Hinton Broth). We covered 30 samples of BP and 19 samples of BB harvested in Polish apiaries. Slightly lower activity was observed against Gram-negative bacteria compared to Gram-positive staphylococci. BB extracts exhibited higher inhibitory potential with...
-
A Novel Cryptic Clostridial Peptide That Kills Bacteria by a Cell Membrane Permeabilization Mechanism
PublicationThis work reports detailed characteristics of the antimicrobial peptide Intestinalin (P30), which is derived from the LysC enzyme of Clostridium intestinale strain URNW. The peptide shows a broader antibacterial spectrum than the parental enzyme, showing potent antimicrobial activity against clinical strains of Gram-positive staphylococci and Gram-negative pathogens and causing between 3.04 ± 0.12 log kill for Pseudomonas aeruginosa...
-
Multidirectional Characterization of Phytochemical Profile and Health-Promoting Effects of Ziziphora bungeana Juz. Extracts
PublicationZiziphora species (Lamiaceae) have been used in traditional medicine as sedatives, anti-septics, carminatives, or expectorants. Despite their common applications in phytotherapy, there is still lack of evidence about the composition of their extracts and its impact on biological properties of the plants. The aim of this study was to evaluate the content of Ziziphora bungeana, a less studied species growing in Kazakhstan, using...
-
Successive cytotoxicity control by evolutionary surface decorated electronic push-pull green ZnCr-LDH nanostructures: Drug delivery enlargement for targeted breast cancer chemotherapy
PublicationThe reason for the increasing bioavailability and biocompatibility of the porous nanomaterials in the presence of different (bio)molecules is still unknown. The role of difference functional groups and their interactions with the potential bioavailability and biocompatibility is of great importance. To investigate the potential contribution of the electronic effects (especially on the surface of the porous nanomaterials) on their...
-
Osteoblast and bacterial cell response on RGD peptide‐functionalized chitosan coatings electrophoretically deposited from different suspensions on Ti13Nb13Zr alloy
PublicationMetallic materials for long-term load-bearing implants still do not provide high antimicrobial activity while maintaining strong compatibility with bone cells. This study aimed to modify the surface of Ti13Nb13Zr alloy by electrophoretic deposition of a chitosan coating with a covalently attached Arg-Gly-Asp (RGD) peptide. The suspensions for coating deposition were prepared in two different ways either using hydroxyacetic acid...
-
Cytocompatibility, antibacterial, and corrosion properties of chitosan/polymethacrylates and chitosan/poly(4‐vinylpyridine) smart coatings, electrophoretically deposited on nanosilver‐decorated titania nanotubes
PublicationThe development of novel implants subjected to surface modification to achieve high osteointegration properties at simultaneous antimicrobial activity is a highly current problem. This study involved different surface treatments of titanium surface, mainly by electrochemical oxidation to produce a nanotubular oxide layer (TNTs), a subsequent electrochemical reduction of silver nitrate and decoration of a nanotubular surface with...
-
Elucidation of chemical compounds in different extracts of two Lavandula taxa and their biological potentials: Walking with versatile agents on the road from nature to functional applications
PublicationDue to their health-promoting and nutraceutical properties, lavenders are frequently employed in the food and pharmaceutical industries. Here, we focused on investigate the chemical profile of hexane, MeOH, and water extracts of leaf, flower, and root of L. pedunculata and L. stoechas and to assess their antioxidant, enzyme inhibitory, and antibacterial properties. The highest total polyphenolic and flavonoids contents were recorded...
-
Estymacja respiracji wykorzystująca pomiar stężenia tlenu w SBR
PublicationBiologiczna oczyszczalnia ścieków jest złożonym nieliniowym systemem przemysłowym. Jednym z istotnych i kosztownych procesów tam zachodzących jest napowietrzanie ścieków. Z procesem tym związana jest respiracja, czyli szybkość zużywania tlenu przez bakterie oczyszczające ścieki. Jest to jeden z najważniejszych parametrów, decydujący o efektywności oczyszczania ścieków. Niestety koszt zakupu urządzeń do pomiaru respiracji – respirometrów...
-
Lipopolysaccharides: regulated biosynthesis and structural diversity
PublicationThe cell envelope of Gram-negative bacteria contains two distinct membranes, an inner (IM) and an outer (OM) membrane, separated by the periplasm, a hydrophilic compartment that includes a thin layer of peptidoglycan. The most distinguishing feature of such bacteria is the presence of an asymmetric OM with phospholipids located in the inner leaflet and lipopolysaccharides (LPSs) facing the outer leaflet. The maintenance of this...
-
Antimicrobial Activity of Chimera Peptides Composed of Human Neutrophil Peptide 1 (HNP-1) Truncated Analogues and Bovine Lactoferrampin
PublicationThree chimera peptides composed of bovine lactoferrampin and the analogue of truncated human neutrophil peptide 1 were synthesized by the solid-phase method. In two compounds peptide chains were connected via isopeptide bond, whereas in the third one disulfide bridge served as a linker. All three chimeras displayed significantly higher antimicrobial activity than the constituent peptides as well as their equimolar mixtures. The...
-
The chaperone-usher pathway of bacterial adhesin biogenesis - from molecular mechanism to strategies of anti-bacterial prevention and modern vaccine design
PublicationSystem chaperone-usher (białko opiekuńcze-białko kanałotwórcze) warunkuje biogenezę powierzchniowych struktur adhezyjnych, odpowiedzialnych za wirulencję wielu bakterii gram-ujemnych. Powyższy mechanizm został zbadany na poziomie strukturalnym w przypadku różnych gatunków bakterii patogennych. Celem powyższej pracy było przedstawienie molekularnego mechanizmu biogenezy struktur adhezyjnych na bazie systemu chaperone-usher. Otrzymane...
-
Beta-Galactosidases of Pseudoalteromonas sp. – Characteristics and application for lactose hydrolysis and galactopyranosides synthesis
PublicationBeta-galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It has biotechnological applications in the dairy industry for the production of milk with a low content of lactose and galactooligosacharides for use in healthy food. The transgalactosylation activity of beta-galactosidase can be used in the synthesis of alkyl galactopyranosides. Due to the fact that conditions of...
-
Skin, unspecified - Female, 53 - Tissue image [12010630011265571]
Open Research DataThis is the histopathological image of SKIN tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Skin, unspecified - Female, 53 - Tissue image [12010630011266661]
Open Research DataThis is the histopathological image of SKIN tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Strain sequence effect on fatigue life and fracture surface topography of 7075-T651 aluminium alloy
PublicationThe paper studies the effect of strain-loading sequence on fatigue lifetime and fracture surface topographies in 7075-T651 aluminum alloy specimens. Fatigue tests were performed in two ways: (i) constant-amplitude loading and (ii) two series of variable amplitude loading with non-zero mean strain values. The topography of the fatigue fractures was measured over their entire surfaces with the help of an optical confocal measurement...
-
Molecular modelling of a psychrophilic β-galactosidase
PublicationAntarktyczny szczep, gram-ujemnych bakterii, wyizolowanych z przewodu pokarmowego kryla z gatunku Thyssanoessa macrura, sklasyfikowany na podstawie analizy sekwencji nukleotydowej geny 16S rDNA jako Pseudoalteromonas sp. 22b jest producentem wewnątrzkomórkowej zimnolubnej beta-galaktozydazy. Ponieważ enzym ten wykazuje wysoką aktywność katalityczną w zakresie temperatur od 0 do 30 stC, stanowi on atrakcyjny biokatalizator, użyteczny...
-
Długookresowe wahania przepływów rocznych głównych rzek w Polsce i ich związek z cyrkulacją termohalinową Atlantyku Północnego
PublicationPraca dotyczy przyczyn występowania multidekadowej zmienności średnich rocznych przepływów największych rzek Polski (Wisła, Bug, Odra, Warta). Taka zmienność powoduje, że w wieloletnich przebiegach przepływów rocznych zaznaczają się zmiany znaków trendów (z dodatnich na ujemne i odwrotnie). Przyczyną jest długookresowa zmienność składowej powierzchniowej cyrkulacji termohalinowej na północnym Atlantyku (NA THC – Northern Atlantic...
-
LYMPH NODES, Lymph node, NOS - Female, 76 - Tissue image [4260730038477291]
Open Research DataThis is the histopathological image of LYMPH NODES tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 250 3DHistech slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Indole-Acrylonitrile Derivatives as Potential Antitumor and Antimicrobial Agents—Synthesis, In Vitro and In Silico Studies
PublicationA series of 2-(1H-indol-2-yl)-3-acrylonitrile derivatives, 2a–x, 3, 4a–b, 5a–d, 6a–b, and 7, were synthesized as potential antitumor and antimicrobial agents. The structures of the prepared compounds were evaluated based on elemental analysis, IR, 1H- and 13NMR, as well as MS spectra. X-ray crystal analysis of the representative 2-(1H-indol-2-yl)-3-acrylonitrile 2l showed that the acrylonitrile double bond was Z-configured. All...
-
Vehicle detector training with labels derived from background subtraction algorithms in video surveillance
PublicationVehicle detection in video from a miniature station- ary closed-circuit television (CCTV) camera is discussed in the paper. The camera provides one of components of the intelligent road sign developed in the project concerning the traffic control with the use of autonomous devices being developed. Modern Convolutional Neural Network (CNN) based detectors need big data input, usually demanding their manual labeling. In the presented...
-
Determination of carbon monoxide, methane and carbon dioxide in refinery hydrogen gases and air by gas chromatography
PublicationW pracy przedstawiono metodę oznaczania śladowych zawartości tlenku węgla, metanu oraz dwutlenku węgla w rafineryjnych gazach wodorowych oraz powietrzu; granica oznaczalności metody wynosi odpowiednio 0,15, 0,15 oraz 0,20 mikro-gram/litr. Zaprezentowano w pracy prostą modyfikację chromatografu gazowego wyposażonego w detektor płomieniowo-jonizacyjny (FID). Zastosowano kolumnę typu PorapakQ, dodatkowo połączono szeregowo z krótką...
-
Composition and antimicrobial activity of fatty acids detected in the hygroscopic secretion collected from the secretory setae of larvae of the biting midge Forcipomyia nigra (Diptera: Ceratopogonidae)
PublicationThe hygroscopic secretion produced by the secretory setae of terrestrial larvae of the biting midge Forcipomyia nigra (Winnertz) was analysed using gas chromatography coupled with mass spectrometry (GC-MS). The viscous secretion is stored at the top of each seta and absorbs water from moist air. GC-MS analyses (four independent tests) showed that the secretion contained 12 free fatty acids, the most abundant of which were oleic...
-
Fish gelatin-nanoclay films. Part I: Effect of a kind of nanoclays and glycerol concentration on mechanical and water barrier properties of nanocomposites
PublicationThe aim of work was the improvement of the mechanical and water barrier properties of nanocomposites prepared from fish gelatin and nanoclays (5–15%), plasticized with glycerol at different concentrations. The effect of hydrophilic Cloisite Na1 and Nanomer®PGV was compared with that exerted by organically modified more hydrophobic Nanofil®2 and NanoBent ZR-1. Antimicrobial activity of nanocomposites containing hydrophobic nanoclays...
-
Genre-Based Music Language Modeling with Latent Hierarchical Pitman-Yor Process Allocation
PublicationIn this work we present a new Bayesian topic model: latent hierarchical Pitman-Yor process allocation (LHPYA), which uses hierarchical Pitman-Yor pr ocess priors for both word and topic distributions, and generalizes a few of the existing topic models, including the latent Dirichlet allocation (LDA), the bi- gram topic model and the hierarchical Pitman-Yor topic model. Using such priors allows for integration of -grams with a topic...
-
Genre-Based Music Language Modeling with Latent Hierarchical Pitman-Yor Process Allocation
PublicationIn this work we present a new Bayesian topic model: latent hierarchical Pitman-Yor process allocation (LHPYA), which uses hierarchical Pitman-Yor pr ocess priors for both word and topic distributions, and generalizes a few of the existing topic models, including the latent Dirichlet allocation (LDA), the bi- gram topic model and the hierarchical Pitman-Yor topic model. Using such priors allows for integration of -grams with a topic model,...
-
Cloning, expression, and purification of a recombinant cold-adapted β-galactosidase from antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b
PublicationAntarktyczny szczep, gram-ujemnych bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b, wyizolowanych z przewodu pokarmowego kryla z gatunku Thyssanoessa macrura, jest producentem wewnątrzkomórkowej zimnolubnej beta-galaktozydazy. Białko to jest homotetramerem, w którym każda z jednostek monomeru zbudowana jest z 1028 reszt aminokwasowych. Gen kodujący ten enzym został sklonowany i eksprymowany w komórkach E. coli. Następnie z zastosowaniem procedury...