Search
Filters
total: 2038
-
Catalog
- Publications 1715 available results
- Journals 13 available results
- Conferences 1 available results
- People 74 available results
- Inventions 14 available results
- Projects 52 available results
- Laboratories 3 available results
- Research Teams 7 available results
- e-Learning Courses 74 available results
- Events 4 available results
- Open Research Data 81 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: WIĄZANIE ZWIĄZKÓW Z DNA
-
Mitochondrial DNA
Journals -
Metylacja DNA w rozwoju, diagnostyce i terapii nowotworów
PublicationDotychczas kowalencyjna modyfikacja DNA, jaką jest zarówno naturalna metylacja DNA, jak i addukty DNA egzogennych niskocząsteczkowych związków chemicznych, były ropatrywane z punktu widzenia genomu. W świetle obecnej wiedzy dotyczącej epigenomu można sądzić, że stosunkowo niewielkie modyfikacje czy to w postaci metylacji cytozyny, czy adduktu DNA mogą mieć znaczący wpływ na działanie komórki, a co za tym idzie także jej transformację...
-
Binding free energy of selected anticancer compounds to DNA - theoreticalcalculations
PublicationPraca dotyczy swobodnej energii wiązania z DNA trzech związków o działaniu przeciwnowotworowym (mitoksantronu i dwóch pochodnych pirymidoakrydyny). Obliczenia wykorzystywały metody Poissona-Boltzmanna (udział elektrostatyczny) i metody SASA (udział nieelektrostatyczny). W wyniku badań zaproponowano struktury kompleksów jakie tworzą badane ligandy z DNA.
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublicationW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Folding‐upon‐repair DNA nanoswitches for monitoring DNA repair enzymes activity
PublicationWe demonstrate here a new class of DNA‐based nanoswitches that, upon enzymatic repair, could undergo a conformational change mechanism leading to a change in fluorescent signal. Such folding‐upon‐repair DNA nanoswitches are synthetic DNA sequences containing O6‐methyl‐guanine (O6‐MeG) nucleobases and labelled with a fluorophore/quencher optical pair. The nanoswitches are rationally designed so that only upon enzymatic demethylation...
-
Chromatograficzne metody rozdzielania związków optycznie czynnych.
PublicationPraca stanowi przegląd nowoczesnych metod i technik stosowanych w rozdzielaniu związków optycznie czynnych. Omówiono oraz porównano wszystkie typy chiralnych faz stacjonarnych dostępnych w handlu ze szczególnym uwzględnienniem mechanizmów ich działania.
-
Bożena Zabiegała prof. dr hab. inż.
PeopleGłówne zainteresowania badawcze prof. Bożeny Zabiegały obejmują problemy analityki zanieczyszczeń środowiska ze szczególnym uwzględnieniem środowiska wewnętrznego (powietrza wewnętrznego), wykorzystania technik pasywnych pobierania próbek w analityce środowiskowej, chemia środowiskowa, badania oraz projektowania nowoczesnych narzędzi do oceny emisji związków z grupy VOC i SVOC, badania składu olejków eterycznych i ocena ich...
-
Towards neural knowledge DNA
PublicationIn this paper, we propose the Neural Knowledge DNA, a framework that tailors the ideas underlying the success of neural networks to the scope of knowledge representation. Knowledge representation is a fundamental field that dedicates to representing information about the world in a form that computer systems can utilize to solve complex tasks. The proposed Neural Knowledge DNA is designed to support discovering, storing, reusing,...
-
Przemysłowe syntezy związków organicznych
e-Learning Courses -
Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi
PublicationZidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....
-
Taq DNA polymerase fused with DNA binding protein with increased resistance to inhibitors from clinical samples
PublicationNowadays PCR method is commonly used in molecular diagnostic. However, in many cases PCR is limited, by the presence of inhibitory substances in biological, soil or food samples Efficiency and fidelity of amplification is strongly connected with DNA polymerase and reaction conditions. To meet the requirements of modern diagnostic methods it is essential to seeking for new DNA polymerases with better properties useful in these field....
-
Viability of decisional DNA in robotics
PublicationThe Decisional DNA is an artificial intelligence system that uses prior experiences to shape future decisions. Decisional DNA is written in the Set Of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and is capable of capturing and reusing a broad range of data. Decisional DNA has been implemented in several fields including Alzheimer’s diagnosis, geothermal energy and smart TV. Decisional DNA is well suited to use in robotics due to the...
-
Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting
PublicationPCR has become an essential tool in biological science. However, researchers often encounter problems with difficult targets, inhibitors accompanying the samples, or PCR trouble related to DNA polymerase. Therefore, PCR optimization is necessary to obtain better results. One solution is using modified DNA polymerases with desirable properties for the experiments. In this article, PCR troubleshooting, depending on the DNA polymerase...
-
Fusion of Taq DNA polymerase with single-stranded DNA binding-like protein of Nanoarchaeum equitans—Expression and characterization
PublicationDNA polymerases are present in all organisms and are important enzymes that synthesise DNA molecules. They are used in various fields of science, predominantly as essential components for in vitro DNA syntheses, known as PCR. Modern diagnostics, molecular biology and genetic engineering need DNA polymerases which demonstrate improved performance. This study was aimed at obtaining a new NeqSSB-TaqS fusion DNA polymerase from the...
-
SAFE - technika izolacji związków zapachowych z próbek żywności
PublicationOznaczanie składników odpowiedzialnych za zapach produktów żywnościowych dokonywane za pomocą technik chromatograficznych obejmuje dwa zasadnicze etapy: przygotowanie próbki i identyfikację (rozdzielenie połączone z odpowiednią metodą detekcji). Ze względu na skomplikowaną matrycę, specyfikę związków zapachowych - samoistne ich uwalnianie z matrycy, jak i możliwość zachodzenia przemian, kluczowym elementem analizy żywności jest...
-
Adding Interpretability to Neural Knowledge DNA
PublicationThis paper proposes a novel approach that adds the interpretability to Neural Knowledge DNA (NK-DNA) via generating a decision tree. The NK-DNA is a promising knowledge representation approach for acquiring, storing, sharing, and reusing knowledge among machines and computing systems. We introduce the decision tree-based generative method for knowledge extraction and representation to make the NK-DNA more explainable. We examine...
-
Metody Badań Structuralnych związków organicznych CH sem VI
e-Learning CoursesW ramach przedmiotu zostaną przedstawione spektroskopie NMR, IR, UV-vis oraz spektrometria mas jako metody analizy strukturalnej. Znaczny nacisk zostanie położony na interpretację widm oraz formułowanie wniosków o strukturze związków w oparciu o widma.
-
2023/24 Metody Badań Strukturalnych Związków Organicznych
e-Learning CoursesW ramach przedmiotu zostaną przedstawione zagadnie z podstaw spektroskopii m. in. pojęcia promieniowania elektromagnetycznego, poziomów energetycznych w cząsteczce, absorpcji promieniowania, zastosowanie transformacji Fouriera w spektroskopii. Ponadto zostaną omówione podstawy spektroskopii magnetycznego rezonansu jąder 1H, 13C i19F oraz spektroskopii w podczerwieni i elektronowej, a także spektrometrii mas. Dla wszystkich w/w...
-
Los związków z grupy BTEX w powietrzu atmosferycznym
PublicationPostępująca industrializacja i urbanizacja świata pociąga za sobą wzrost intensywności antropresji, co z kolei skutkuje pojawianiem się niekiedy bardzo niekorzystnych zmian zarówno w części ożywionej jak i w części nieożywionej środowiska.Jedną z wielu konsekwencji takiego stanu rzeczy jest wzrost intensywności emisji do atmosfery lotnych związków organiczny, w tym również związków z grupy BTEX. W pracy przedstawiono informacje...
-
Dual inhibition of PI3K/Akt signaling and the DNA damage checkpoint in p53-deficient cells with strong survival signaling: implications for cancer therapy
PublicationOporność komórek nowotworowych na leki uszkadzjące DNA związana jest ściśle ze zdolnością do utrzymywania blok z fazie G2 cyklu komórkowego. Blok ten regulowany jest przez mechanizmy punktu kontrolnego G2/M oraz szlaki przeżycia komórkowego. W pracy badaliśmy rolę szlaku kinazy PI3K/Akt w funkcjonowaniu punktu kontrolnego cyklu komórkowego i wpływ na przeżycie komórek traktowanych lekiem przeciwnowotworowym - cisplatyną. Nasze...
-
Konwersje związków azotu w hybrydowym systemie hydrofitowym
PublicationCelem pracy było porównanie skuteczności usuwania związków azotu z warunkami w jakich ono zachodziło m.in: ładunek hydrauliczny i ładunek substancji organicznej oraz azotu, stężenia tlenu, potencjał utleniająco-redukujacych, dostępność łatwo-rozkładalnej substancji organicznej (źródło węgla). Ocena wyżej wymienionych parametrów może w sposób pośredni wykazać, które procesy są odpowiedzialne za usuwanie azotu w analizowanym HSH.Niespodziewanie...
-
Retencja i usuwanie związków azotu w hybrydowych systemach hydrofitowych
PublicationHybrydowe systemy hydrofitowe (ze zmiennym poziomym i pionowym przepływem ścieków) łączą zalety i eliminują wady układów bez zmiennego przepływu ścieków, co w rezultacie prowadzi do skutecznego i stabilnego w czasie usuwania substancji organicznej i związków azotu. Na podstawie analizy przeprowadzonych badań w pracy przedstawiono ilościowe i jakościowe przemiany substancji organicznej i związków azotu. Podano skuteczność usuwania...
-
Mitochondrial DNA Part A
Journals -
The development of Decisional DNA digital TV
PublicationZaproponowano koncepcje opartej na wiedzy i doswiadczeniu telewizji cyfrowej z wbudowanym decyzyjnym DNA.
-
Gentiana asclepiadea exerts antioxidant activity and enhances DNA repair of hydrogen peroxide- and silver nanoparticles-induced DNA damage
PublicationExposure to high levels of different environmental pollutants is known to be associated with induction of DNA damage in humans. Thus DNA repair is of great importance in preventing mutations and contributes crucially to the prevention of cancer. In our study we have focused on quantitative analysis of Gentiana asclepiadea aqueous or methanolic extracts obtained from flower and haulm, their antioxidant potency in ABTS post-column...
-
2023 Modyfikacje związków wielkocząsteczkowych (PG_00038551)
e-Learning Courses -
Decisional DNA applied to digital TV
PublicationPrzedstawiono nowoczesną koncepcje integracji decyzyjnego DNA z telewizją cyfrową w celu pozyskiwania wiedzy o oglądalności poszczególnych programów.
-
Fusion of DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase with TaqStoffel DNA polymerase as a useful tool in PCR with difficult targets
PublicationThe DNA coding sequence of TaqStoffel polymer- ase was fused with the DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase. The resulting novel recombinant gene was cloned and expressed in E. coli. The recombinant enzyme was purified and its enzymatic features were studied. The fusion protein (PfuDBDlig-TaqS) was found to have enhanced processivity as a result of the conversion of the Taq DNA polymerase from a relatively low processive...
-
Testing the usability of decisional DNA in robotics
PublicationW pracy poddano dyskusji i nalizie obszary mozliwych zastowac reprezentacji wiedzy zwanej Decisional DNA w zagadnieniach zwiazanych z robotyka.
-
Preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublicationExperiments were carried out to determine the optimum conditions required for the preparation of uniform films of supercoiled plasmid DNA to be used in irradiation experiments under high vacuum conditions. Investigations reveal that significant damage to the DNA molecules occurs due to the evacuation process when films were formed from DNA samples in ultra high purity water only. A variety of bases were tested for their possible...
-
Thermodynamics aspects of interactions between acridine derivatives and DNA
PublicationDNA is a molecular target for many anticancer and antiviral drugs. Therefore, a clear understanding of the interaction of small molecules with DNA is important in the rational design of ligands that can bind to DNA with high affinity and selectivity. There are several methods to investigate interactions between drug and DNA. Some of them measure changing into DNA structures, such as lengthening and untwisting of helix of DNA. Other...
-
Early models of DNA damage formation
PublicationPrzeanalizowano jedne z pierwszych modeli opisujących uszkodzenia nici DNA. Przeanalizowano uszkodzenia powstające w pojedynczych i podwójnych niciach, pod wpływem czynników fizycznych i chemicznych.
-
Isoform-specific inhibition of DNA topoisomerase II as the mechanism of action of novel anticancer agent C-1305
Publication -
Współczynniki podziału lotnych związków organicznych w amoniowych cieczach jonowych
PublicationZastosowanie cieczy jonowych jako absorbentów dla lotnych związków organicznych staje się w ostatnich latach obiecującą alternatywą dla tradycyjnych rozpuszczalników stosowanych w tych procesach. W porównaniu z konwencjonalnymi rozpuszczalnikami, ciecze jonowe wykazują szereg zalet, jak rozpuszczają szerokie spectrum związków, posiadają znikomą prężności par, są stabilne termicznie a także istnieje możliwość poprawy ich zdolności...
-
Rola związków znaczonych izotopowo w analityce środowiskowej
PublicationEtap pobierania próbki oraz przygotowania jej do analizy często stanowią najtrudniejsze zadanie analityczne, które może być przyczyną niekontrolowanych strat analitów, a zatem i wzrostu niepewności oznaczania zawartości analitu. Dlatego wymagane jest kontrolowanie strat analitów na wszystkich etapach przygotowania próbki do analizy. Nie jest to jednak proste zadanie. Powszechnie stosowane techniki ekstrakcji analitów z próbek środowiskowych...
-
Phylogenetic trees of genus Oncidium Sw. based on analysis of DNA sequences
Open Research DataGenus Oncidium Sw. is widely regarded as a polyphiletic, and the taxonomic boundaries between him and such genera as Odontoglossum Kunth. or Miltonia Lindley remain blurred. The goal of the study was to determine the phylogenetic relationships within the genus Oncidium s.lato based on the DNA sequences analysis. The correlation between molecular data...
-
Toward Intelligent Recommendations Using the Neural Knowledge DNA
PublicationIn this paper we propose a novel recommendation approach using past news click data and the Neural Knowledge DNA (NK-DNA). The Neural Knowledge DNA is a novel knowledge representation method designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing systems. We examine our approach for news recommendation tasks on the MIND benchmark dataset. By taking advantages of NK-DNA, deep...
-
An insight into the mixed quantum mechanical-molecular dynamics simulation of a ZnII-Curcumin complex with a chosen DNA sequence that supports experimental DNA binding investigations
PublicationAn important aspect of research pertaining to Curcumin (HCur) is the need to arrest its degradation in aqueous solution and in biological milieu. This may be achieved through complex formation with metal ions. For this reason, a complex of HCur was prepared with ZnII, that is not likely to be active in redox pathways, minimizing further complications. The complex is monomeric, tetrahedral, with one HCur, an acetate and a molecule...
-
The Decisional DNA-Based Smart Bike for Internet of Things
PublicationIn this paper, we introduce a novel application of the Internet of Things, the Decisional DNAbased Smart Bike. The Decisional DNA is a domain-independent, flexible and standard knowledge representation structure; it allows its domains to acquire and store experiential knowledge and formal decision events in an explicit way. By using Decisional DNA, the sensor-equipped bicycle is able to learn its user’s weight, riding habits, etc....
-
Measuring the density of DNA films using ultraviolet-visible interferometry
PublicationIn order to determine a proper value for the density of dry DNA films we have used a method based upon the measurement of interference effects in transmission spectra of thin DNA layers. Our results show that the methodology is effective and the density of DNA in this state, 1.407 g/cm3, is much lower than the commonly used 1.7 g/cm3. Obtaining accurate values for the DNA film density will allow the optical constants for DNA to...
-
Fotoprzewodnictwo elektroluminezujących związków organicznych
Publication.
-
Analityka specjacyjna związków metaloorganicznych
PublicationOmówiono ogólne założenia i problemy chemicznej analityki specjacyjnej zwią-zków metaloorganicznych. Przedstawiono zagadnienia związane z definicją celuanalizy, pobieraniem, konserwacją, przechowywaniem, przygotowaniem próbek,rozdzielaniem analitów oraz ich końcowym oznaczeniem. Opisano najczęściejwykorzystywane procedury analityki specjacyjnej i rodzaje stosowanych detek-torów.
-
Cross sections for electron scattering from selected components of DNA and RNA
PublicationWykorzystując metodę atomów niezależnych obliczono różniczkowe i całkowite przekroje czynne na sprężyste rozproszenie elektronów na wybranych drobinach, będących analogami składników DNA i RNA. Przekroje te obliczono w zakresie energii zderzenia od 50eV do 200 eV dla następujących drobin: C4H8O, C4H8O2, C5H10O2 oraz H3PO4. Przy użyciu metody BEB (binary-ecounter Bethe method) dla powyższych związków obliczono również przekroje...
-
A case study of constructing decisional DNA on finanse
PublicationPrzedstawiono koncepcję i rozwiązanie analityczne opisu rynku finansowego przy pomocy reprezentacji wiedzy zwanej ''decyzyjne DNA''.
-
Problem of aggregation in dye-DNA interaction, calorimetry studies
PublicationNucleic acids are the biological target for many antimicrobial, antitumor and antiviral drugs. Ligand-DNA interactions can be classified into two major categories: 1. covalent binding, which can provide to intermolecular adducts, 2. physico-chemical interactions, which can be divided into intercalation (e.g. adriamycin) or groove binding (e.g. dystamycin). There are several methods to investigate interactions between drug and DNA....
-
Analysis of induction of DNA DSBs on telomeres in A549 cells
Open Research DataData consist of an analysis of DNA DSBs on telomeres. A549 were treated with compounds (TXT4, MTX, DMSO) at IC90 concentration for the indicated time. Images were acquired with an LSM 800 inverted laser scanning confocal microscope (Carl Zeiss; Dresden, Germany) equipped with an Airyscan detector using a ×63 1.4 NA Plan Apochromat objective (Carl Zeiss)....
-
Wpływ obszarów wiejskich na stężenie związków biogennych w Morzu Bałtyckim
PublicationZe względu na znaczne zanieczyszczenie Bałtyku i jego podatność na eutrofizację, podejmowane są działania mające na celu ochronę jakości wód. Działania te podejmowane są na szczeblu krajowym, jak i międzynarodowym. Jednym z najbardziej istotnych porozumień podpisanych przez jedenaście państw regionu Morza Bałtyckiego jest tzw. Agenda 21 dla Bałtyku.Bardzo duży udział w ładunkach związków biogennych dopływających do Bałtyku ma gospodarka...
-
Monitorowanie lotnych związków organicznych w powietrzu atmosferycznym
PublicationObecne w powietrzu atmosferycznym lotne związki organiczne mogą wywoływać niekorzystne efekty zdrowotne u osób narażonych oraz są prekursorami fotochemicznych utleniaczy. Dążenie do uzyskania wiarygodnych informacji na temat zawartości związków z grupy LZO w powietrzu atmosferycznym spowodowało wprowadzenie do praktyki analitycznej nowych rozwiązań metodycznych oraz urządzeń kontrolno pomiarowych. Próbki powietrza mogą być pobierane...
-
Izoenzymy cytochromu P450 w metabolizmie związków endo- i egzogennych.
PublicationCytochromy P450 (CYP) należą do enzymatycznych białek hemowych występujących we wszystkich organizmach żywych. W komórkach eukariotycznych katalizują biosyntezę związków endogennych, głównie lipidów i ich pochodnych, ale także metabolizm ksenobiotyków, w tym leków. W reakcjach tych substraty ulegają C-oksydacji (hydroksylacja, epoksydacja, peroksydacja), N-oksydacji, S-oksydacji oraz oksydacyjnej O-, S-, i N-dealkilacji. W konsekwencji...
-
Prototypowy czujnik do oznaczania lotnych związków opganicznych w powietrzu
PublicationW pracy zaprezentowano prototypowy elektrochemiczny czujnik zbudowany na bazie cieczy jonowej do oznaczania związków z grupy lotnych związków organicznych (LZO). W czujniku zostały użyte komercyjne elektrody firmy DropSens. w postaci pasków z nadrukowanymi elektrodami na ceramicznym podłożu. Jako elektrolit i środowisko reakcji redox wykorzystano następujące ciecze jonowe: dicyjanoamid 1-butylo-3-metyloimidazoliowy ([BMIM][N(CN2)]),...