Filters
total: 3882
-
Catalog
- Publications 2709 available results
- Journals 12 available results
- Conferences 1 available results
- People 94 available results
- Inventions 30 available results
- Projects 27 available results
- Laboratories 3 available results
- Research Teams 9 available results
- Research Equipment 1 available results
- e-Learning Courses 95 available results
- Events 6 available results
- Open Research Data 895 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: ROZPOZNAWANIE TYPU DNA
-
Internetowe systemy przetwarzania rozproszonego typu grid w zastosowaniach biznesowych
PublicationSkoncentrowano się na możliwościach wykorzystania oraz integracji rozproszonych mocy obliczeniowych komputerów Internautów w globalnej sieci www. Zaprezentowano paradygmaty sieciowego przetwarzania typu grid computing oraz volunteer computing. Podkreślono istotność tego typu przetwarzania w zagadnieniach wymagających bardzo dużych mocy obliczeniowych. Zaprezentowano przykłady rozwiązań systemowych tego typu: system BOINC, będący...
-
The influence of the substrate temperature on the preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublicationExperiments were carried out to determine the dependence of the physical form of supercoiled DNA films on the initial temperature of the substrate. Such films are often used in irradiation experiments involving low energy particles, like electrons or photons. In order to obtain absolute values for cross sections for such experiments, the spatial distribution of the sample in the film has to be well estimated. These investigations...
-
Quantitative fluorescent determination of DNA – Ochratoxin a interactions supported by nitrogen-vacancy rich nanodiamonds
PublicationOchratoxin A (OTA) is a hazardous contaminant of a large variety of plant and animal originated food. Herein, we report an interaction of OTA with calf thymus DNA (ct DNA) on the nanodiamond surface. We employed multispectroscopic techniques to elucidate the binding mechanism of OTA with ct DNA. The fluorescence and UV–Vis spectroscopy results show that OTA binds to ds ct DNA and forms complexes. We obtained the binding constants...
-
Problemy modelowania własności wytrzymałościowych stalowych konstrukcji typu ''sandwich''
PublicationW pracy omówiono wyniki badań zmęczeniowych stalowych, laserowo spawanych konstrukcji typu sandwich. Na ich tle uogólniono mechanizmy niszczenia takich konstrukcji. Dla wybranego modelu niszczenia przedstawiono wyniki badań elementarnego połączenia spawanego laserowo.
-
Ekstrakcja z wykorzystaniem ruchomego elementu sorpcyjnego typu TwisterTM (SBSE)
PublicationW ostatnich latach coraz większy nacisk kładzie się na techniki ekstrakcyjne, których praktyczne wykorzystanie nie jest związane ze stosowaniem rozpuszczalników organicznych na etapie przygotowania próbek do analizy. Typowym przykładem takiej bezrozpuszczalnikowej techniki przygotowania próbek do analizy jest ekstrakcja z wykorzystaniem ruchomego elementu sorpcyjnego typu TwisterTM. W pracy przedstawiono podstawowe informacje na...
-
DNA restriction analysis as a supportive tool in mechanistic studies carried out by 32P-postlabelling
PublicationNumerous antitumor and carcinogenic compounds are able to modify DNA by forming covalent bonds with its constituents, while some anticarcinogenic compounds are known to prevent such a modification. All these processes are of vital biological import_ance, though deeper inside into factors influencing formation of DNA adducts is difficult due to the low level of their occurrence. 32P-Postlabelling approach ensures very sensitive...
-
Radio- and photosensitization of DNA with compounds containing platinum and bromine atoms
Publication. Irradiations of plasmid DNA by both X-rays and UV light in the presence and absence of compounds containing platinum and bromine atoms were performed in order to asses the sensitization potential of these compounds. Plasmid DNA pBR322 was incubated with platinum (II) bromide, hydrogen hexabromoplatinate (IV), hydrogen hexahydroxyplatinate (IV) and sodium hexahydroxyplatinate (IV). Incubation was followed by X-ray or UV irradiations....
-
Toward Intelligent Vehicle Intrusion Detection Using the Neural Knowledge DNA
PublicationIn this paper, we propose a novel intrusion detection approach using past driving experience and the neural knowledge DNA for in-vehicle information system security. The neural knowledge DNA is a novel knowledge representation method designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing systems. We examine our approach for classifying malicious vehicle control commands...
-
Analiza danych typu Big Data 2023/24 KOPIA
e-Learning CoursesThe aim of the course is to familiarize students with the methods of storing and analysis of big data. Practical tools for these tasks are presented.
-
A proposal for knowledge sharing in the e-Decisional community using Decisional DNA
PublicationZaproponowano model platformy wspomagającej wymianę wiedzy w społeczeństwie decyzyjnym opartym na decyzyjnym DNA.
-
Smart innovation process enhancement using SOEKS and decisional DNA
PublicationProduct innovation always requires a foundation based on both knowledge and experience. The production and innovation process of products is very similar to the evolution process of humans. The genetic information of humans is stored in genes, chromosomes and DNA. Similarly, the information about the products can be stored in a system having virtual genes, chromosomes and decisional DNA (DDNA). The present paper proposes...
-
POMIAROWE BADANIA PROPAGACYJNE W SIECIACH WBAN TYPU BODY-TO-BODY
PublicationW referacie zaprezentowano pomiary tłumienia propagacyjnego w sieciach WBAN typu body-to-body, pracujących przy częstotliwości 2,45 GHz, dla zróżnicowanych scenariuszy i środowisk badawczych. Wstępna analiza wyników pomiarów, bazująca na wartości średniej i odchyleniu standardowym tłumienia propagacyjnego wykazała, że wartości te są zależne od wzajemnego położenia anteny nadawczej i odbiorczej, a także od typu scenariusza dynamicznego...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublicationSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNA insequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination. Although there are differences in amino...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublicationSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNAinsequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination.Although there are differences in amino acid...
-
The interaction of antitumor 1-nitroacridines with DNA in cell-free systems
PublicationUzyskano nowe pochodne 1-nitro i 3-nitroakrydyny wykazujące zdolność do specyficznego cięcia DNA w miejscach bezzasadowych. Z użyciem oligonukleotydu z indukowanym miejscem bezzasadowym potwierdzono taką aktywność u obu otrzymanych pochodnych.
-
Zaawansowane rozwiązania projektowe aplikacji typu Rich Internet Application
PublicationRich Internet Application (RIA) jest modelem aplikacji internetowych zyskującym w ostatnim czasie coraz większą popularność. Jednym ze sposobów jego realizacji jest paradygmat AJAX. Stosowane w nowatorski sposób, istniejące od wielu lat technologie pozwalają osiągnąć niespotykane dotąd możliwości. Wieloletnie doświadczenia programistów powodują jednak, że w aplikacjach tego typu stosuje się często rozwiązania projektowe przeznaczone...
-
Zastosowanie immobilizowanego białka MutS do wychwytywania fragmentów DNA zawierających niesparowane zasady
PublicationBiałko MutS wiąże DNA zawierające błędnie sparowane oraz niesparowane zasady w DNA. Podjęto szereg prób wykorzystania tego białka jako narzędzia do detekcji nieznanych mutacji lub zagęszczania frakcji DNA z niesparowaną zasadą. Dotychczas żadna z metod oparta na użyciu białka MutS nie została wdrożona powszechnie do praktyki laboratoryjnej. Głównym powodem takiego stanu rzeczy jest stosunkowo silne powinowactwo MutS do DNA w pełni...
-
Robot typu Micromouse – wykonanie, sterowanie i optymalizacja
PublicationW ostatnich latach obserwuje się intensywny rozwój robotyki. Roboty znajdują zastosowanie w różnych gałęziach przemysłu i życiu codziennym. Ich projektowanie wymaga interdyscyplinarnej wiedzy obejmującej obszary mechaniki, elektroniki, metrologii, automatyki i informatyki. W artykule przedstawiono poszczególne etapy wykonania robota typu Micromouse. Jest to specyficzne urządzenie, którego zadaniem jest zbadanie labiryntu, dotarcie...
-
Wczesne wykrywanie spoofingu GNSS typu carry-off
PublicationW referacie przedstawiono klasyfikację ataków typu spoofing ukierunkowanych na odbiorniki satelitarnych systemów nawigacyjnych GNSS. W szczególności opisano zaawansowaną formę spoofingu w wariancie tzw. carry-off, polegającym na płynnym przejęciu kontroli nad blokami śledzenia sygnałów w zakłócanym odbiorniku. Sposób realizacji takiego ataku istotnie utrudnia jego wykrycie z użyciem metod dotychczas proponowanych w literaturze....
-
Badania eksperymentalne stalowych łączników balkonowych typu podwójnego
PublicationArtykuł stanowi prezentację wyników badań eksperymentalnych przeprowadzonych na czterech pełnowymiarowych prefabrykowanych zestawach balkonowych o wymiarach (szerokość × długość × wysokość): 2,0 m × 2,78 m × 0,186 m (w spadku do 0,17 m). Zestawy składały się z żelbetowych płyt (balkonowej oraz stropowej), połączonych ze sobą łącznikami balkonowymi typu podwójnego (łącznik składający się z dwóch prętów rozciąganych oraz dwóch blach...
-
Molecular differences in mitochondrial DNA (mtDNA) genomes of dogs with malignant mammary tumours
Open Research DataThe aim of this study was to determine molecular defects in mitochondrial DNA with the use of large-scale genome analysis in malignant canine mammary gland tumours and indicate whether these changes were linked with the carcinogenesis process. With the use of the NGS technology, we sequenced 27 samples of mtDNA isolated from blood and tumours obtained...
-
Laboratoryjny przetwornik a/c typu "floating-point" na bazie karty DAQ
PublicationW artykule przedstawiono zrealizowany przetwornik a/c typu "floating-point" na bazie karty akwizycji danych typu PCI-6221 uzupełnionej o wzmacniacz wejściowy o programowanym wzmocnieniu. Opisywany przetwornik jest podstawą ćwiczenia w laboratorium studenckim. W skład ćwiczenia wchodzą dodatkowo program symulacyjny pozwalający zapoznać się z ideą pracy przetworników typu "floating-point", a następnie przejść do realizacji przetwornika...
-
Badania in situ i analizy numeryczne mostu typu extradosed w Gdańsku
PublicationJednym z najnowszych typów konstrukcji wśród obiektów mostowych są mosty typu extradosed. Pierwsze konstrukcje tego typu powstały w latach 70-tych XX wieku. Stanowią one hybrydę pomiędzy sprężonym mostem belkowym, a mostem podwieszonym. W pracy przedstawiono analizy numeryczne oraz przeprowadzone badania in situ dla mostu typu extradoes w Gdańsku .Przedstawiono założenia, wyniki oraz wnioski z przeprowadzonych badań oraz analiz...
-
Preparation of DNA films for studies under vacuum conditions. The influence of cations in buffer solutions
PublicationBadania zostały przeprowadzone w celu określenia optymalnych warunków wymaganych do przygotowania jednolitych filmów superskręconego plazmidowego DNA do wykorzystania w doświadczeniach napromieniowania w warunkach wysokiej próżni. Badania pokazują, że znaczne szkody w DNA powstają w wyniku odpompowywania filmów DNA z roztworów zawierających jedynie czysta wodę.
-
Charakterystyka pęknięć w szynach typu head check
PublicationZmęczenie kontaktowe powierzchni tocznej szyny (RCF) jest jedną z waznych przyczyn jej uszkodzenia i ma obecnie duże znaczenie w utrzymaniu nawierzchni kolejowej w odpowiednim stanie niezawodności oraz wpływa na trwałość szyn. W wyniku dużych oddziaływań dynamicznych na powierzchni szyny powstają poziome małe pęknięcia, które w dalszej fazie rozwoju przechodzą pionowo przez krawędź główki szyny powodując powstawanie mikroszczelin....
-
ZARZADZANIE ORGANIZACJĄ TYPU SMART
PublicationZaprezentowano organizacji, w której charakterystykę wpisano następujące cechy: strategiczne uwarunkowanie, maksymalną innowacyjność, atrakcyjność dla interesariuszy, rozwijanie osobowości pracowników oraz twórczość w działaniu. Te atrybuty, tworzą koncepcję organizacji SMART (akronim od pierwszych liter powyższych cech), która wyróżnia się dodatkowo strukturą opartą o dynamicznie kreowane zespoły oraz skutecznym wspomaganiem...
-
Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) - sources and applicationsin molecular biology
PublicationBiałka wiążące się do jednoniciowego DNA (SSB) odgrywają ważną rolę w replikacji, rekombinacji i naprawie DNA u bakterii, archea i eukariota. Ostatnio wzrosło zainteresowanie białkami SSB jako przydatnymi narzędziami w metodach badawczych biologii molekularnej, analitycznych i diagnostycznych. Większość znanych prokariotycznych białek SSB zbudowanych jest z czterech podjednostek (homotetramer) z jedną domeną wiążąca (OB) jednoniciowe...
-
Teloxantron inhibits the processivity of telomerase with preferential DNA damage on telomeres
PublicationTelomerase reactivation is one of the hallmarks of cancer, which plays an important role in cellular immortalization and the development and progression of the tumor. Chemical telomerase inhibitors have been shown to trigger replicative senescence and apoptotic cell death both in vitro and in vivo. Due to its upregulation in various cancers, telomerase is considered a potential target in cancer therapy. In this study, we identified...
-
Introducing the concept of Decisional DNA-Based web content mining
PublicationPrzedstawiono koncepcje zastosowania struktury reprezentacji wiedzy opartej na decyzyjnym DNA w procesie wyszukiwania informacji w internecie. Dokonano analizy eksperymentow tak wspomaganego wyszukiwania oraz sformulowano wnioski na temat przyszlych badan prowadzacych do dalszej integracji procesu wyszukiwania z doswiadczeniami zdobytymi w trakcie tego wyszukiwania.
-
Rozpoznawanie statycznych i dynamicznych gestów dłoni z zastosowaniem adaptacyjnego czujnika optycznego
PublicationBezdotykowe interfejsy urządzeń stacjonarnych oraz urządzeń mobilnych są ważne zwłaszcza w ochronie zdrowia (np. przeciwdziałanie roznoszeniu bakterii i wirusów, wsparcie chirurga w trakcie przeprowadzania operacji itp.). W ramach rozprawy doktorskiej zaprojektowano i wykonano oszczędny energetycznie czujnik gestów o budowie liniowej, złożony z fotodiod i diod LED, wraz z dedykowanym mu...
-
Szerokopasmowy, zminiaturyzowany, wielodrożny dzielnik mocy typu 1:6
PublicationW referacie zaprezentowano metodykę projektowania szerokopasmowego, wielodrożnego dzielnika mocy typu 1:6 wykonanego w technologii niesymetrycznych linii paskowych. Zaburzenie ciągłości metalizacji paska sygnałowego poprzez implementację struktur PBG (ang. Photonic Bandgap) umożliwiło osiągnięcie zarówno 15% miniaturyzacji, jak i poszerzenia pasma pracy do 141% dla częstotliwości f=4 [GHz]. Wyniki eksperymentu wykazujące dużą zgodność...
-
Genome-Wide DNA Methylation and Gene Expression in Patients with Indolent Systemic Mastocytosis
PublicationMastocytosis is a clinically heterogenous, usually acquired disease of the mast cells with a survival time that depends on the time of onset. It ranges from skin-limited to systemic disease, including indolent and more aggressive variants. The presence of the oncogenic KIT p. D816V gene somatic mutation is a crucial element in the pathogenesis. However, further epigenetic regulation may also affect the expression of genes that...
-
Sequence-dependent structural properties of B-DNA: what have we learned in 40 years?
PublicationThe structure of B-DNA, the physiological form of the DNA molecule, has been a central topic in biology, chemistry and physics. Far from uniform and rigid, the double helix was revealed as a flexible and structurally polymorphic molecule. Conformational changes that lead to local and global changes in the helix geometry are mediated by a complex choreography of base and backbone rearrangements affecting the ability of the B-DNA...
-
Logistyka składowania odpadów w procesie produkcyjnym statków typu offshore
PublicationW niniejszym artykule autor przedstawił najistotniejsze problemy dotyczące logistyki odpadów, z którymi na co dzień boryka się jedna z polskich stoczni, podczas produkcji statków typu offshore - wraz z możliwymi rozwiązaniami
-
Covalent DNA modification by products of myrosinase catalysed glucosinolate degradation in cell-free system
PublicationThe bioactive phytochemicals found in Brassica vegetables belonging to glucosinolates (GLS) and especially the products of their degradation isothiocyanates (ITC) and indoles are regarded as the most promising cancer chemopreventive compounds. These secondary metabolites constitute defence system repelling or preventing the development of agrophages attacking brassica plants. The antibiological properties of these compounds suggest...
-
Defining a novel domain that provides an essential contribution to site-specific interaction of Rep protein with DNA
PublicationAn essential feature of replication initiation proteins is their ability to bind to DNA. In this work, we describe a new domain that contributes to a replication initiator sequence-specific interaction with DNA. Applying biochemical assays and structure prediction methods coupled with DNA–protein crosslinking, mass spectrometry, and construction and analysis of mutant proteins, we identified that the replication initiator of the...
-
Set of Experience and Decisional DNA: Toward Brains for Cyber-physical Systems and Industry of the Future
PublicationThe concept of Decisional DNA is decade old. This article introduces the initial idea of Set of Experience Knowledge Structure, its advancement into Decisional DNA, and its potential for real life applications in divers domains. The most current and future research steps into Industry 4.0 are also presented and discussed
-
Prediction based on integration of Decisional DNA and a feature selection algorithm Relief-F
PublicationThe paper presents prediction model based on Decisional DNA and Set of experienced integrated with Relief_F algorithm for feature selection
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublicationMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor
PublicationRolling circle amplification (RCA) of DNA can be considered as a great alternative to the gold standard polymerase chain reaction (PCR), especially during this pandemic period, where rapid, sensitive, and reliable test results for hundreds of thousands of samples are required daily. This work presents the first research to date on direct, real-time and label-free isothermal DNA amplification monitoring using a microcavity in-line...
-
Decisional DNA based intelligent knowledge model for flexible manufacturing system
PublicationModeling an effective mechanism for design and control strategies for the implementation of a flexible manufacturing system (FMS) has been a challenge. Consequently, to overcome this issue various techniques have applied in the past but most of these models are effective only for some specific situation or an element of FMS. In this study, the knowledge representation technique of Decisional DNA (DDNA) is applied to FMS to develop...
-
Problematyka zarządzania wiedzą w systemach typu e-health.
PublicationW rozdziale przedstawiono koncepcję systemu zarządzania wiedzą w ogólnodostępnym, wielofunkcyjnym systemie ukierunkowanym na różnorodne zastosowania związane z ochroną zdrowia. Koncepcja ta jest realizowana w zintegrowanym projekcie objętym 6. Programem Ramowym Unii Europejskiej. Zaprezentowano: miejsce zarządzania wiedzą w stosunku do innych części systemu, architekturę podsystemu zarządzania wiedzą oraz szczegółowo omówiono funkcje...
-
Optymalizacja procesów biologicznych w oczyszczalni ścieków typu SBR
Publicationiologiczna oczyszczalnia ścieków jest skomplikowanym systemem sterowania. Jednym z istotnych i kosztownych procesów tam zachodzących jest napowietrzanie ścieków. Prawidłowy jego przebieg ma decydujący wpływ na stopień oczyszczenia ścieków i koszty operacyjne pracy oczyszczalni. W związku z tym prowadzone są prace badawcze nad optymalizacją procesów biologicznych, pozwalającą redukować koszty, np. zużycie energii. W artykule opracowano...
-
Termodynamika oddziaływań i przejść strukturalnych DNA w układach wodnych na podstawie symulacji metodą dynamiki molekularnej
PublicationKwas deoksyrybonukleinowy jest jednym z najistotniejszych elementów każdej żywej komórki ze względu na rolę głównego nośnika informacji genetycznej. Posiada on instrukcje potrzebne do wzrostu, budowy, funkcjonowania oraz namnażania się wielu żywych organizmów, w tym także wirusów. Okazuje się, że w zależności od warunków środowiskowych, DNA może przyjmować wiele różnych struktur drugorzędowych, z których większość stanowi formy...
-
Ergodic type theorems for Gaussian systemstwierdzenia typu ergodycznego dla układów gaussowskich
PublicationUdowodniono twierdzenie typu ergodycznego dla zmiennych losowych będących złożeniem zmiennych losowych gaussowskich z funkcjami z odpowiedniej klasy.
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublicationBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
Dominant Pathways of Adenosyl Radical-Induced DNA Damage Revealed by QM/MM Metadynamics
PublicationBrominated nucleobases sensitize double stranded DNA to hydrated electrons, one of the dominant genotoxic species produced in hypoxic cancer cells during radiotherapy. Such radiosensitizers can therefore be administered locally to enhance treatment efficiency within the solid tumor while protecting the neighboring tissue. When a solvated electron attaches to 8-bromoadenosine, a potential sensitizer, the dissociation of bromide...
-
Model dynamicznego balastowania małego morskiego obiektu typu stealth
PublicationW artykule przedstawiono podstawowe problemy związane z modelowaniem głównych cech decydujących o trudno-wykrywalności małego obiektu na etapie projektu koncepcyjnego. Metoda badawcza oparta jest na ocenie zachowania się obiektu i ocenie ryzyka wypadku. W artykule skupiono się głównie na przedstawieniu modelu matematycznego opisującego model dynamicznego balastowania małego morskiego obiektu typu stealth. Przedstawione w artykule...
-
Rewitalizacja posadzek betonowych typu lastrico w obiektach zabytkowych. Część 1
PublicationW artykule przedstawiono zagadnienia materiałowe i technologiczne dotyczące posadzek typu lastrico w aspekcie oceny ich stanu technicznegooraz sposobów naprawy i rewitalizacji.
-
Decisional DNA with embedded Relief-F linear regression for knowledge and experience management
PublicationOmowiono zastowania Decyzyjnego DNA, regresji liniowej oraz funkcji RELIEF-F w procesach formalnego modelowania i wspomagania zarzadzania wiedza oraz zarzadzania doswiadczeniem.