Search
Search results for: d-glukitolo-6-fosforan
-
N-Alkylation of D-glucosamine and 2-amino-2-deoxy-D-glucitol-6-phosphate
PublicationTematem pracy była synteza N-alkilowych pochodnych D-glukosaminy i 2-amino-2-deoxy-D-glukitolo-6-fosforanu
-
Facilitated diffusion of glucosamine-6-phosphate synthase inhibitors enhances their antifungal activity
PublicationKwas N-3(4-metoksyfumaroilo)-L-2,3-diaminopropanowy (FMDP) i 2-amino-2-deo-ksy-D-glucitolo-6-fosforan (ADGP) są silnymi inhibitorami syntazy glukoza-mino-6-fosforanu, istotnego enzymu grzybowego, jednak ich aktywność przeciwgrzybowa jest słaba, ze względu na powolną penetrację tych związków przez błonę cytoplazmatyczną. W tej pracy badaliśmy możliwość poprawy działania przeciwgrzybowego ADGP i FMDP poprzez zwiększenie ich własności...
-
Glucosamine-6-phosphate synthase - the multi-facets enzyme
PublicationAmidotransferaza L-glutamina: D-frukozo-6-fosforan, nazywana zwyczajowo syntazą glukozamino-6-fosforanu, jako jedyny enzym należący do grupy amidotransferaz, nie wykazuje aktywności amoniakozależnej. Enzym ten, katalizujący pierwszy wyjątkowy etap w szlaku metabolicznym prowadzącym do ostatecznego wytworzenia 5´difosfourydyno-N-acetylo-D-glukozaminy (UDG-GlcNAc) stanowi ważny punkt kontroli metabolicznej biosyntezy makromolekuł...
-
Synthesis and antimicrobial activity of 6-sulfo-6-deoxy-D-glucosamine and its derivatives
Publication6-Sulfo-6-deoxy-D-glucosamine (GlcN6S), 6-sulfo-6-deoxy-D-glucosaminitol (ADGS) and their N-acetyl and methyl ester derivatives have been synthesized and tested as inhibitors of enzymes catalyzing reactions of the UDP-GlcNAc pathway in bacteria and yeasts. GlcN6S and ADGS at micromolar concentrations inhibited glucosamine-6-phosphate (GlcN6P) synthase of microbial origin. The former was also inhibitory towards fungal GlcN6P N-acetyl...
-
Synthesis of 2-amino-2,6-dideoxy-D-glucitol-6-sulfonic acid as a potential antifungal agent.
PublicationGlucosamine-6P (GlcN-6P) synthase catalyzes the first committed step in the biosynthetic pathway leading to the formation of UDP-GlcNAc, a sugar nucleotide precursor providing D-glucosamine for the formation of chitin and manoproteins. 2-Amino-2,6-dideoxy-D-glucitol-6-sulfonic acid is an analog of 2-amino-2-deoxy-D-glucitol 6-phosphate (GlcN-ol-6-P), a known inhibitor of GlcN-6-P synthase, in which the phosphate group of the latter...
-
Hydrophobic derivatives of 2-amino-2-deoxy-D-glucitol-6-phosphate: a newtype of D-glucosamine-6-phosphate synthase inhibitors with antifungal action.
PublicationDokonano syntezy szeregu N-acylowych i estrowych pochodnych 2-amino-2-deok-sy-glucitolo-6-fosforanu (ADGP) i zbadano ich aktywność przeciwgrzybową oraz wobec enzymów zaangażowanych we wczesne etapy biosyntezy chityny w komórkach grzybów. Wszystkie badane pochodne okazały się słabszymi inhibitorami enzymu syntezy GlcN-6-P aniżeli ADGP, ale niektóre z nich wykazywały znacznie wyższą aktywność przeciwgrzybową niż związek macierzysty....
-
Synthesis, the crystal structure, and high-resolution NMR spectroscopy of methyl 4-O-acetyl-3-azido-2,3,6-trideoxy-6-iodo-ŕ-D-arabino-hexopyranoside
PublicationW wyniku wieloetapowej syntezy otrzymano glikozyd metylowy 4-O-acetylo-3-azydo-2,3,6-trideoksy-6-jodo-ŕ-D-arabino-heksopyranozy. Związek wykazuje konformację 4C1, co wykazano na podstawie wysokorozdzielczej spektroskopii1H i 13C NMR oraz rentgenowskiej analizy strukturalnej monokryształu. W pracy scharakteryzowano również 7 nowych związków otrzymanych jako produkty pośrednie i uboczne.
-
Structural Factors Affecting Cytotoxic Activity of (E)-1-(Benzo[d ][1,3]oxathiol-6-yl)-3-phenylprop-2-en-1-one Derivatives
PublicationDerivatives of (E)-1-(5-alkoxybenzo[d][1,3]oxathiol-6-yl)-3-phenylprop-2-en-1-one (1) demonstrated exceptionally high in vitro cytotoxic activity, with IC50 values of the most active derivatives in the nanomolar range. To identify structural fragments necessary for the activity, several analogs deprived of selected fragments were prepared, and their cytotoxic activity was tested. It was found that the activity depends on combined effects...
-
Geometrically nonlinear FEM analysis of 6-parameter resultant shell theory based on 2-D Cosserat constitutive model
PublicationWe develop the elastic constitutive law for the resultant statically and kinematically exact, nonlinear, 6-parameter shell theory. The Cosserat plane stress equations are integrated through-the- thickness under assumption of the Reissner-Mindlin kinematics. The resulting constitutive equations for stress resultant and couple resultants are expressed in terms of two micropolar constants: the micropolar modulus Gc and the micropolar...
-
Informatyka II sem C1 D. Zalewska 6
e-Learning Courses -
WCH 6 sem B2 D. Zalewska 8
e-Learning Courses -
D. Horowska, WILiŚ, IŚ (6), st. I, sem. 6, 23/24 l
e-Learning Courses -
Krzysztof Nyka dr hab. inż.
PeopleKrzysztof Nyka, received MSc (1986) PhD (2002) and DSc (2020) degrees in telecommunication and electrical engineering from the Faculty of Electronics, Telecommunications and Informatics (ETI) of Gdańsk University of Technology (GUT), Poland. He is currently an Associate Professor at the Department of Microwaves and Antenna Engineering, Faculty of ETI, GUT. Before his academic career, he worked for the electronic industry (1984-1986). Research...
-
Marek Czachor prof. dr hab.
People -
WETI - EiT gr 6, 7 - Matematyka - sem 1- 2022/23 (D. Grott)
e-Learning Courses -
D. Horowska, WCH, CH+TCH, st. I, sem. 6, 20/21 l
e-Learning Courses -
WETI - EiT gr 4, 5, 6 - Matematyka - sem 1 - 2023/24 (D. Grott)
e-Learning Courses -
D. Horowska, WCH, CH+TCH+I.MAT, st. I, sem. 6, 23/24 l
e-Learning Courses -
Paweł Możejko dr hab.
People -
Maciej Niedostatkiewicz dr hab. inż.
People -
Paweł Czarnul dr hab. inż.
PeoplePaweł Czarnul obtained a D.Sc. degree in computer science in 2015, a Ph.D. in computer science granted by a council at the Faculty of Electronics, Telecommunications and Informatics, Gdansk University of Technology in 2003. His research interests include:parallel and distributed processing including clusters, accelerators, coprocessors; distributed information systems; architectures of distributed systems; programming mobile devices....
-
Leszek Ziemczonek dr
PeopleUniversity education 1973-1978 – Nicolaus Copernicus University in Toruń, University of Gdańsk in Gdańsk, Mathematical Physics, M. Sc. 1979 – Diploma of Postgraduate Studies, Pedagogics 1989 – Institute of Physics, Polish Academy of Sciences in Warsaw, Theoretical Physics, Ph. D. 2010-2012 – Diploma of Postgraduate Studies, Mathematics Training: · 09.1983 – Trieste (Italy) – International Centre for Theoretical Physics...
-
Karol Daliga dr inż.
PeopleIn 2005, he graduated from a mathematics and physics class and passed his secondary school-leaving examination at 1st Secondary School named after Władysław Gebik, former Polish grammar school in Kwidzyn. In the years 2005-2010 he completed master's studies at Faculty of Applied Physics and Mathematics of Gdańsk University of Technology, and in 2008-2012 he completed engineering studies at Faculty of Civil and Environmental Engineering...
-
Jerzy Konorski dr hab. inż.
PeopleJerzy Konorski received his M. Sc. degree in telecommunications from Gdansk University of Technology, Poland, and his Ph. D. degree in computer science from the Polish Academy of Sciences, Warsaw, Poland. In 2007, he defended his D. Sc. thesis at the Faculty of Electronics, Telecommunications and Informatics, Gdansk University of Technology. He has authored over 150 papers, led scientific projects funded by the European Union,...
-
Production activity control in a flexible machining cell considering part measuring condition. W: Computer integrated manufacturing. Advanced design and management. Ed.: B. Skołud, D. Krenczyk. Warszawa: Wydaw. Nauk.-Tech. **2003 s. 494-501, 6 rys. 1 tabl. bibliogr. 9 poz. Sterowanie procesu produkcyjnego w elastycznym gnieździe obróbkowym z uwzg- lędnieniem funkcji kontroli wytwarzanych przedmiotów.
PublicationPrzedstawiono modele struktur organizacyjnych przebiegu procesu organizacyj-nego w rzeczywistym zrobotyzowanym elastycznym gnieździe obróbki (EGO) z udziałem współrzędnościowej maszyny pomiarowej CNC. Badano eksperymentalnie występujące współzależności pomiędzy analizowanymi planami kontroli przed-miotów wytwarzanych i strategiami szeregowania operacji procesu technologi-cznego obróbki, z wykorzystaniem zintegrowanych modeli...
-
Synthesis of phosphono and phosphate derivatives of hydroxyimino-D-alditols as new potential antifungal agents
PublicationIn search for new effective we antyfungals we focus on two enzymes involved in biosynthesis of the fungal cell wall. The first enzyme is glucosamine-6-phosphate (GlmS), which catalyzes transformation of D-fructose-6-phosphate (Fru-6P) to D-glucosamine-6-phodphate (GlcN-6P) in the chitin biosynthesis pathway. The second enzyme is phosphomannose isomerase (PMI) repored to play a crucial role in biosynthesis of many mannosylated structures,...
-
Pochodne fosforylowanych cukrów jako inhibitory syntazy glcn-6-p
PublicationW artykule został opisany mechanizm działania syntazy glukozamino-6-fosforanu i syntezy wybranych analogów blokujących domenę wiążących D-fruktozo-6-fosforanu, którym jest cis-enolamina.
-
Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.
PublicationStruktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...
-
New class of quaternary ammonium salts, derivatives of methyl D-glucopyranosides.
PublicationReakcja zasad azotowych z 6-O-p-tozylo-alfa-D-glukopiranozydem metylu lub 6-O-tozylo-beta-D-glukopiranozydem metylu (prowadzona w skali mikro) dając odpowiednie sole amoniowe. Jako zasady azotowe użyto pirydyny, 2-metylopirydyny i trimetyloaminy. Produkty zostały przebadane przy użyciu spektroskopii 1H, 13C NMR, spektroskopii mas oraz analizy elementarnej a budowa jednego z nich została dodatkowo potwierdzona za pomocą rentgenowskiej...
-
Synthesis of conjugates of muramyl dipeptide and nor-muramyl dipeptide derivatives with adenosine as potential immunosuppressant
PublicationZaprezentowano syntezę koniugatów adenozyny z pochodnymi muramylo- i nor-muramylodipeptydów zawierających w części peptydowej D-aminokwasy (D-Ala, D-Val, D-Ser, D-Pro, D-2-ABA). Jako substrat zastosowano rybozyd 6-chloropuryny, który łączono poprzez 1,2-diaminoetan z odpowiednimi pochodnymi MDP lub nor-MDP w obecności EDCI i HOBt. Struktury otrzymanych związków zostały potwierdzone widmami 1H i 13C NMR (500 MHz), widmami MS oraz...
-
Synthesis of conjugates of muramyl dipeptide and nor-muramyl dipeptide derivatives with adenosine as potential immunosuppressants
PublicationPrzedstawiono syntezę koniugatów pochodnych muramylodipeptydu (MDP) i nor-MDP z adenozyną jako potencjalnych związków o działaniu immunosupresyjnym. Jako substrat zastosowano rybozyd 6-chloropuryny, który łączonp poprzez 1,2-diaminoetan z pochodną MDP lub nor-MDP. Do syntezy wykorzystano pochodne MDP zawierające w części peptydowej D-aminokwasy (D-Ala, D-Val, D-Ser, D-Pro, D-2-ABA). Jako odczynniki sprzęgające zastosowano EDCI...
-
Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution
PublicationSprawdzono zdolność modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM) do przewidywania wartości pKa w roztworze wodnym dla O-fosfoseryny (P-Ser). Obliczenia przeprowadzono w ramach teorii funkcjonału gęstości (DFT) przy użyciu funkcjonałów B3LYP i M06-2X oraz baz 6-31+G(d) and 6-31+G(d,p). Obliczenia na poziomie B3LYP/6-31+G(d,p) przy użyciu modelu solwatacji SMD zapewniają doskonałą zgodność z doświadczeniem, pod warunkiem uwzględnienia...
-
Marek Biziuk prof. dr hab. inż.
PeopleCURRICULUM VITAE Marek BIZIUK Born 1947 MSc 1969 GUT PhD 1977 GUT DSc 1994 GUT Professor 2001 Membership of scientific society - Gdansk Scientific Society - Romanian Society of Analytical Chemistry - Engineers and Techniques of...
-
Characterization of Mesorhizobium huakuii lipid A containing bothD-galacturonic acid and phosphate residues.
PublicationLipid A jest mieszaniną co najmniej 6 związków, różniących się stopniem fosforylacji i strukturą kwasów tłuszczowych przyłączonych do szkieletu polisacharydowego. Szkielet cukrowy zawiera beta(1'->6)połączone dwie cząsteczki 2,3-diamino-2,3-dideoksyglucosy (DAG)oraz aglikon kwas alfa-D-galaktouronowy.
-
The Influence of Sulfate on Anaerobic Ammonium Oxidation in a Sequencing Batch Reactor
PublicationAnaerobic ammonia-oxidizing bacteria have a more comprehensive metabolism than expected - there may be other electron acceptors that oxidize ammonium nitrogen under anaerobic conditions, in addition to the well-known nitrite nitrogen, one of which is sulfate in the sulfammox process. Sulfate-containing compounds are part of the medium for the anammox process, but their concentrations are not particularly high (0.2 g MgSO4 ∙ 7H2O/dm3...
-
Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase
PublicationCentra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...
-
Wytwarzanie biogazu z kiszonki Sucrosorgo 506
PublicationW pracy przeprowadzono badania eksperymentalne nad fermentacją metanową kiszonki sorgo cukrowego Sucrosorgo 506 (Sorghum saccharatum) metodą mokrą. Doświadczenie prowadzono w skali laboratoryjnym w reaktorze o objętości czynnej 6 dm3. Hydrauliczny czas zatrzymania wsadu surowcowego (HRT) oraz obciążenie ładunkiem organicznym (OLR) wynosiły odpowiednio 60 d i 1,31±0,10 kg s.m.o/m3·d. Temperatura fermentacji wynosiła 39C. W oparciu...
-
Amygdalin: Toxicity, Anticancer Activity and Analytical Procedures for Its Determination in Plant Seeds
PublicationAmygdalin (D-Mandelonitrile 6-O--D-glucosido--D-glucoside) is a natural cyanogenic glycoside occurring in the seeds of some edible plants, such as bitter almonds and peaches. It is a medically interesting but controversial compound as it has anticancer activity on one hand and can be toxic via enzymatic degradation and production of hydrogen cyanide on the other hand. Despite numerous contributions on cancer cell lines, the clinical...
-
Leszek Jarzębowicz dr hab. inż.
PeopleLeszek Jarzebowicz received the M.Sc., Ph.D. and D.Sc. degrees from Gdansk University of Technology (GUT), Poland, in 2005, 2010 and 2019, respectively. His research areas include control and modeling of electric drives, diagnostics of railway vehicles, analysis of energy efficiency in electrified transport, and microprocessor implementation of control algorithms. His teaching interests focus on electric vehicles, electrical engineering...
-
Heterogeneity of quaternary structure of glucosamine-6-phosphate deaminase from Giardia lamblia
PublicationThe oligoHis-tagged versions of glucosamine-6- phosphate deaminase from Giardia lamblia (GlmNagB-HisN, GlmNagB-HisC) were constructed and purified to hear homogeneity, and their kinetic and structural properties were compared to those of the wild-type enzyme (GlmNagB). Introduction of the oligoHis tag at the GlmNagB C-terminus resulted in almost complete loss of the catalytic activity, while the catalytic properties of GlmNagB-HisN...
-
The first compound with an unusual type of anion, [Li(SR)2]-:bis(µ2-aqua-d2)tetrakis(aqua-d2)]dilithium(I)bis[bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-k2O,S)lithate(I)]dihydrate-d2
PublicationTytułowy związek [Li2(D2O)6][Li(C9H27SSiO3)2]2*2D2O, jest pierwszym związkiem z wiązaniem S-M (M-metal alkaliczny), zawierającym niespotykany typ anionu litanowego: [Li(SR)2]-,gdzie R=Si{OC{CH3)3}3. Centrum symetrii związku znajduję się pośrodku pierścienia Li2O2 wchodzącego w skład kationu. Wszystkie atomy litu budujące rdzenie kationów - LiO4 i anionów - LiO2S2, są czterokoordynacyjne. Jednoujemne aniony [Li(SR)2]- są dobrze...
-
Construction of glucosamine-6-phosphate synthase with an internal hexahistydyl fragment
PublicationL-Glutamine: D-fructose-6-phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.16), known also as glucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) syntase, catalyzes the first committed step in the amino sugar biosynthetic pathway in prokaryotic and eukaryotic organisms. The enzyme carries out a complex reaction involving ammonia transfer and sugar phosphate isomerization. GlcN-6-P syntase is an important point of metabolic control of amino sugar biosynthesis...
-
Glucosamine-6-phosphate synthase with an oligoHis insert
PublicationGlucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) synthase known also as L-Glutamine: D-fructose-6-phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.16), catalyzes the first committed step in the amino sugar biosynthetic pathway in prokaryotic and eukaryotic organisms. The final product of this pathway is an activated precursor of numerous macromolecules containing amino sugars, including chitin and mannproteins in fungi, peptydoglican and lipopolysaccharides...
-
Desensitization of glucosamine-6-phosphate synthase to inhibition by UDP-GlcNAc
PublicationGlucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) synthase, known also as L-Glutamine: D-fructose-6-phosphate amidotransferase, catalyzes the first committed step in the pathway leading to the ultimate formation of UDP-GlcNAc. The final product of this pathway is an activated precursor of numerous macromolecules containing amino sugars, including chitin and mannproteins in fungi, peptidoglycan and lipopolysaccharides in bacteria, and glycoproteins...
-
The crystal and solution studies of glucosamine-6-phosphate synthase from Candida albicans
PublicationOkreślono strukturę krystaliczną domeny izomerazowej syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans w stanie natywnym, oraz w kompleksie z inhibitorem allosterycznym UDP-GlcNAc, fruktozo-6-P, glukozo-6-P oraz analogiem stanu przejściowego reakcji enzymatycznej - 2-amino-2-deoksy-D-mannitolo-6-P (ADMP). Na podstawie wyników badań metodą niskokątowego rozpraszania promieni X (SAXS) wydedukowano przypuszczalną strukturę kompletnej...
-
Impact of aeration conditions on the removal of low concentrations of nitrogen in a tertiary partially aerated biological filter
PublicationA submerged biological aerated filter (BAF) partially aerated was used to study the removal of low concentrations of ammonia nitrogen (0.3 g N/m3 to 30.5 g N/m3) typically found in nutrient enriched river and lake waters, and treated effluents. Four series of experiments were performed with a synthetic wastewater at ammonia loading rates between 6 g N/m3 d and 903 g N/m3 d and C/N ratios from 2 to 20. The results showed that ammonia...
-
Influence of S-Oxidation on Cytotoxic Activity of Oxathiole-Fused Chalcones
PublicationSynthesis, in vitro cytotoxic activity, and interaction with tubulin of oxidized, isomeric 1-(5-alkoxybenzo[d] [1,3]oxathiol-6-yl)-3-phenylprop-2-en-1-ones and 1-(6- alkoxybenzo[d][1,3]oxathiol-5-yl)-3-phenylprop-2-en-1- ones are described. Most of the compounds demonstrated cytotoxic activity at submicromolar concentrations. It was found that oxidation of sulfur atom of the oxathiole-fused chalcones strongly influenced activity...
-
Sulfammox process_task 1
Open Research DataAnaerobic ammonia-oxidizing bacteria have a more comprehensive metabolism thanexpected - there may be other electron acceptors that oxidize ammonium nitrogen under anaerobicconditions, in addition to the well-known nitrite nitrogen, one of which is sulfate in the sulfammoxprocess. Sulfate-containing compounds are part of the medium for the anammox process,...
-
Structure and properties of the exopolysaccharides produced by Pseudomonas mutabilis T6 and P. mutabilis ATCC 31014
PublicationThis paper presents a study on the purification, primary structure, and rheological properties of exopolysaccharides isolated from cultures of Pseudomonas mutabilis T6 and P. mutabilis ATCC 31014. Both polymers are exopolysaccharides of D-mannose. The mannan isolated from P. mutabilis T6 contains on average about 5% of residual b-D-glucose, in contrast to the mannan from P. mutabilis ATCC 31014, which contained only trace amounts...
-
N-Alkyl Derivatives of L-Glutamine As Inhibitors of Glutamine - Utilizing Enzymes
PublicationA general facile method to synthesize the N-gamma-alkyl and N-gamma,N-gamma-dialkyl derivatives of L-glutamine (1a-d) from L-glutamic acid as a starting substrate is presented. The obtained compounds are shown to inhibit three diferent glutamine-utilizing enzymes, namely: glutaminase, gamma-glutamyl transpeptidase, and glucosamine-6-phosphate synthase, with inhibitory constants within the milimolar range.