Filters
total: 25483
-
Catalog
- Publications 20470 available results
- Journals 51 available results
- Conferences 3 available results
- Publishing Houses 5 available results
- People 719 available results
- Inventions 102 available results
- Projects 286 available results
- Laboratories 18 available results
- Research Teams 43 available results
- Research Equipment 8 available results
- e-Learning Courses 1813 available results
- Events 601 available results
- Open Research Data 1364 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: NONCODING RNA
-
Wykorzystanie platform roboczych w konstrukcjach trwałych na przykładzie podbudowy pod zbiorniki na olej napędowy
PublicationPlatformy robocze są to konstrukcje tymczasowe, które umożliwiają wjazd i pracę ciężkiego sprzętu budowlanego na słabym podłożu. Mogą również pełnić w późniejszym czasie funkcję trwałej podbudowy. W niniejszym artykule opisano przypadek platformy roboczej wykorzystanej przy wykonywaniu kolumn żwirowych KSS pod fundament pierścieniowy zbiorników na olej napędowy. Platforma robocza została wcielona w konstrukcję trwałą jako podbudowa...
-
Wpływ poliuretanu szczepionego na kopolimerze styren/kwas styrenosulfonowy na morfologię różnych typów mieszanin polimerowych
PublicationZbadano wpływ dodania poliuretanu szczepionego na kopolimerze styren/kwas styrenosulfonowy na morfologię różnych typów mieszanin polimerowych. Przedmiotem badań były mieszaniny wykonane z polistyrenu, termoplastycznego poliuretanu, terpolimeru ABS. W celu oceny morfologii wykorzystano dane z badań za pomocą mikroskopii elektronowej i analizy termicznej.
-
Skład warstwy pasywnej wytworzonej na stali odpornej na korozję w chlorowanej, bałtyckiej wodzie morskiej.
PublicationStwierdzono, że w warstwie pasywnej wytworzonej w wodzie chlorowanej wzrasta stężenie Cr i Ni, jak również grubośc warstw pasywnych. Wartośc potencjału korozyjnego wzrasta z zawartością crhomu w warstwie pasywnej. Nieznacznie wzrasta potencjał korozji wżerowej.
-
Peptide Permeases in Candida albicans
PublicationAims: The aim of this work was to characterize oligopeptide uptake in Candida albicans mutants in which the genes encoding putative peptide permeases were selectively disrupted. Initial velocities of transport of model oligopeptides, (Ala)2, (Ala)3, (Ala)4, and sensitivity of mutants to antifungal oligopeptides containing N3-(4-methoxyfumaroyl)-L-2,3-diaminopropanoic acid (FMDP) were determined and compared to those of the wild-type...
-
Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor
PublicationRolling circle amplification (RCA) of DNA can be considered as a great alternative to the gold standard polymerase chain reaction (PCR), especially during this pandemic period, where rapid, sensitive, and reliable test results for hundreds of thousands of samples are required daily. This work presents the first research to date on direct, real-time and label-free isothermal DNA amplification monitoring using a microcavity in-line...
-
Support Product Development Framework by Means of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA
PublicationIn this paper, we propose a framework to support product development activi-ties by utilizing Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). This idea will provide a new direction to researchers working on product development, especially designers and manufacturers. They will be working on the same platform and this will be reducing their communication gap. Once the final idea is perceived about product...
-
DNA Methylation Changes Induced by Redox-Active Compounds—Choosing the Right PCR-Based Method
PublicationThe impact of catechins on the expression profile of redox-related genes in HT29 cell line has been studied recently by our group using Oxidative Stress RT2 Profiler PCR Array. Within the examined panel of 84 genes, the down-regulation of SRXN1 gene was unique among other up-regulated genes. We hypothesized that the observed down-regulation resulted from DNA methylation and have exploited this observation to choose the proper strategy...
-
Defining a novel domain that provides an essential contribution to site-specific interaction of Rep protein with DNA
PublicationAn essential feature of replication initiation proteins is their ability to bind to DNA. In this work, we describe a new domain that contributes to a replication initiator sequence-specific interaction with DNA. Applying biochemical assays and structure prediction methods coupled with DNA–protein crosslinking, mass spectrometry, and construction and analysis of mutant proteins, we identified that the replication initiator of the...
-
Mitochondrial DNA copy number and trimethylamine levels in the blood: New insights on cardiovascular disease biomarkers
PublicationAmong cardiovascular disease (CVD) biomarkers, the mitochondrial DNA copy number (mtDNAcn) is a promising candidate. A growing attention has been also dedicated to trimethylamine-N-oxide (TMAO), an oxidative derivative of the gut metabolite trimethylamine (TMA). With the aim to identify biomarkers predictive of CVD, we investigated TMA, TMAO, and mtDNAcn in a population of 389 coronary artery disease...
-
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublicationThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
Modulation of cellular response to anticancer treatment by caffeine:inhibition of cell cycle checkpoints, DNA repair and more
PublicationKofeina i inne metyloksantyny wywołują bardzo różne efekty fizjologiczne w organizmie człowieka. W pracy przedstawiamy, które z tych efektów mogą wpływać na skuteczność terapii przeciwnowotworowych. Kofeina może bezpośrednio wpływać na transport oraz aktywację metaboliczną cząsteczek leków do komórki, poprzez tworzenie kompleksów z lekami zawierającymi układy poliaromatyczne. Kofeina hamuje aktywność kinaz ATM/ATR co prowadzi do...
-
Bulky DNA adducts in human sperm: relationship with fertility, semen quality, smoking, and environmental factors
Publication -
Establishing the background level of base oxidation in human lymphocyte DNA: results of an interlaboratory validation study
Publication -
Urinary Measurement of 8-OxodG, 8-OxoGua, and 5HMUra: A Noninvasive Assessment of Oxidative Damage to DNA
Publication -
Mass spectrometry reveals the presence of specific set of epigenetic DNA modifications in the Norway spruce genome
Publication -
SOCS3 and SOCS5 mRNA expressions may predict initial steroid response in nephrotic syndrome children
Publication -
Buserelin Acetate Reduces Mortality and DNA Defragmentation of Bovine Sperm Cells Exposed to Oxidative Stress
Publication -
Influence of addition of cobalamin to the extender on the post-thaw motility, viability, and DNA integrity of bovine ejaculate
Publication -
Serial depletion of Baltic herring since the Viking Age revealed by ancient DNA and population genomics
Publication -
On the Trail of the Oldest Domestic Cat in Poland. An Insight from Morphometry, Ancient DNA and Radiocarbon Dating
Publication -
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublicationW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Biomedical, Artificial Intelligence, and DNA Computing Photonics Applications and Web Engineering, Wilga, May 2012
Publication -
ppGpp-Dependent Negative Control of DNA Replication of Shiga Toxin-Converting Bacteriophages in Escherichia coli
Publication -
Selective Cytostatic and Cytotoxic Anticancer Effects of Bisfunctional Agents: A Strategy for the Design of DNA Binding Agents
PublicationVarious agents have been synthesized and proved useful for the National Cancer Institute's anticancer testing as potential new drugs, but most agents suffer side effects from their limited selectivity against cancer cells over healthy ones. Therefore, this paper attempts to describe drugs in terms of the level of tumor cell selectivity which they possess to define the features of mols. that are essential for useful cytotoxicity....
-
Critical factors for the performance of chip array-based electrical detection of DNA for analysis of pathogenic bacteria
Publication -
Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publication -
DNA methylation analysis of benign and atypical meningiomas: correlation between RUNX3 methylation and WHO grade
Publication -
The Degree of Global DNA Hypomethylation in Peripheral Blood Correlates with That in Matched Tumor Tissues in Several Neoplasia
Publication -
Prolonged Quercetin Administration Diminishes the Etoposide-Induced DNA Damage in Bone Marrow Cells of Rats
Publication -
When Neural Networks Meet Decisional DNA: A Promising New Perspective for Knowledge Representation and Sharing
PublicationABSTRACT In this article, we introduce a novel concept combining neural network technology and Decisional DNA for knowledge representation and sharing. Instead of using traditional machine learning and knowledge discovery methods, this approach explores the way of knowledge extraction through deep learning processes based on a domain’s past decisional events captured by Decisional DNA. We compare our approach with kNN (k-nearest...
-
Genome-wide DNA methylation profiling of the regenerative MRL/MpJ mouse and two normal strains
PublicationAims We aimed to identify the pivotal differences in the DNA methylation profiles between the regeneration capable MRL/MpJ mouse and reference mouse strains. Materials and Methods Global DNA methylation profiling was performed in ear pinnae, bone marrow, spleen, liver, heart from uninjured adult females of the MRL/MpJ and C57BL/6J and BALB/c. Results and conclusion A number of differentially methylated regions distinguishing between...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublicationTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
Publicationnthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another...
-
Emplying set of experience knowledge structure and decisional DNA to enhance industrial design: conceptual approach
PublicationZaprezentowano koncepcje wspomagania projektowania przemyslowego przy pomocy nowoczenego podejscia do reprezentacji wiedzy w postaci SOEKS oraz Decyzyjnego DNA
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublicationAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
Decisional DNA (DDNA) Based Machine Monitoring and Total Productive Maintenance in Industry 4.0 Framework
PublicationThe entire manufacturing spectrum is transforming with the advent of Industry 4.0. The features of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA) were utilized for developing Virtual Engineering Objects (VEO), Virtual Engineering Process (VEP) and Virtual Engineering Factory (VEF), which in turn facilitate the creation of smart factories. In this study, DDNA based Machine Monitoring for Total Maintenance...
-
Sequence-dependent structural properties of B-DNA: what have we learned in 40 years?
PublicationThe structure of B-DNA, the physiological form of the DNA molecule, has been a central topic in biology, chemistry and physics. Far from uniform and rigid, the double helix was revealed as a flexible and structurally polymorphic molecule. Conformational changes that lead to local and global changes in the helix geometry are mediated by a complex choreography of base and backbone rearrangements affecting the ability of the B-DNA...
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublicationMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
Increased resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA in proximity to metallic silver particles.
PublicationZbadano wpływ nanocząstek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donor (pochodna kumaryny) i akceptor (Cy3) umieszczono na przeciwległych końcach DNA o strukturze podwójnej helisy i o 23 parach bazowych. W nieobecności cząstek srebra wydajność przekazywania energii w tym układzie wynosiła ok. 9%, zaś po umieszczeniu go między kwarcowymi płytkami pokrytymi filmem wysepek...
-
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublicationOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
-
RNS reverse high-speed converter with quasi-regular structure based on the Chinese Remainder Theorem
PublicationPrzedstawiono dwie nowe architektury szybkiego konwertera z systemuresztowego do systemu binarnego oparte o chińskie tw. o resztach. Zastosowano nowe struktury 4-operandowych sumatorów modulo 2M. Pierwsza ze struktur oparta jest o wstępne sumowanie najstarszych bitów wektorów sumy i przeniesienia na wyjściu sumatora CSA, natomiast druga o bezpośrednie wykrywanie przekroczenia 2M. Konwerter wykorzystujący drugą ze struktur charakteryzuje...
-
Novel DNA-binding protein from Nanoarchaeum equitans Kin4-M binds all kinds of nucleic acids
PublicationNanoarchaeum equitans is the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota and stands out as one of the tiniest known living organism. What is more it has smallest genome, which is only 490.885 base pairs long. It is also one of the most compact genomes. According to predictions about 95% of the DNA encodes proteins or stable RNA. Nanoarchaeum equitans lacks genes for most vital metabolic pathways including lipid, cofactor,...
-
PCR and real-time PCR approaches to the identification of Arthroderma otae species Microsporum canis and Microsporum audouinii/Microsporum ferrugineum
PublicationObjectives The identification of species in the Arthroderma otae complex is essential to determine the origin of infection and to eliminate the risk of transmission. Microsporum canis is a zoophilic species, whereas Microsporum audouinii and Microsporum ferrugineum are anthropophilic species. In this paper, we propose alternative methods that permit species-specific identification of both anthropophilic and zoophilic members of...
-
Piotr Iwicki dr hab. inż.
People -
Application of potential theory in calculating wave-induced vertical forces on horizontal cylinders near a plane boundary
PublicationHydrodynamiczne obciażenia wywołane falowaniem morskim działajace na poziomo ułożoną przy dnie rurę, rozpatrywane są w ujęciu dyfrakcyjnym przy założeniu istnienia funkcji potencjału. Potencjał zdefiniowano jako superpozycję potencjału fali inicjującej oraz potencjału perturbacji spowodowanej istnieniem obiektu przy dnie. Wyniki rozwiązań teoretycznych porównano z wynikami doswiadczeń przeprowadzonych w Wielkim Kanale falowym w...
-
Studia i Materiały do Badań nad Neolitem i Wczesną Epoką Brązu na Mazowszu i Podlasiu
Journals -
Jak wiele wiedzy warto zdobyć na studiach? Strategie studiowania na przykładzie studentów zarządzania Politechniki Gdańskiej
PublicationDane statystyczne dotyczące obiektywnej sytuacji osób kończących studia na uczelni wyższej (np. łatwość znalezienia pracy, początkowe zarobki) wskazują na racjonalność podjęcia decyzji o studiowaniu. Jednocześnie w obliczu głosów krytykujących system kształcenia wyższego, dla studentów najistotniejszym profitem osiąganym w wyniku studiów może stawać się dyplom ich ukończenia. W artykule opisane są przeprowadzone przez autorów badania...
-
Badanie przyczyn korozji zbiorników magazynowych na paliwa na terenie stacji benzynowej grupy Lotos w Pruszkowie
PublicationPrzedstawiono wyniki oględzin zbiornika na olej napędowy eksploatowany na stacji benzynowej w Pruszkowie. Przedstawiono możliwe przyczyny powstania zniszczeń korozyjnych w dolnej części zbiornika.
-
Analiza wpływu parametrów budynku i źródeł ciepła na zapotrzebowanie na energię pierwotną budynku mieszkalnego wielorodzinnego
PublicationW publikacji przedstawiono analizę parametrów, które mogą wpływać na charakterystykę energetyczną budynków mieszkalnych wielorodzinnych. Analizą objęto stopień ochrony cieplnej budynku, rodzaj źródła ciepła oraz wyposażenie lokali mieszkalnych określające wymagane strumienie powietrza wentylacyjnego. Wskazane zostały uwarunkowania uzyskania wartości wskaźnika EP budynku poniżej wartości granicznych, określonych w przepisach techniczno-budowlanych.
-
Wpływ drogi skrawania i zużycia narzędzia na strukturę geometryczną powierzchni przedmiotu przy toczeniu na twardo
PublicationWpływ drogi skrawania i zużycia narzędzia na strukturę geometryczną powierzchni przedmiotu przy toczeniu na twardo za pomocą ostrzy z polikrystalicznego regularnego azotku boru. Otrzymane wyniki badań prowadzonych w warunkach przemysłowych wykazały wpływ zużycia ostrza na zmianę parametru horyzontalnego RSm w funkcji spiralnej drogi skrawania, pomimo niezauważalnych zmian parametru chropowatości Ra.